3KAOA

Crystal structure of tagatose 1,6-diphosphate aldolase from staphylococcus aureus
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
SKSNQKIASIEQLSNNEGIISALAFDQRGALKRMMAKHQTEEPTVAQIEQLKVLVAEELTQYASSILLDPEYGLPASDARNKDCGLLLAYEKTGYDVNAKGRLPDCLVEWSAKRLKEQGANAVKFLLYYDVDDAEEINIQKKAYIERIGSECVAEDIPFFLEVLTYDDNIPDNGSVEFAKVKPRKVNEAMKLFSEPRFNVDVLKVEVPVNMKYVEGFAEGEVVYTKEEAAQHFKDQDAATHLPYIYLSAGVSAELFQETLKFAHEAGAKFNGVLCGRATWSGAVQVYIEQGEDAAREWLRTTGFKNIDDLNKVLKDTATSWKQRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus mu50
publication title Crystal structure of tagatose 1,6-diphosphate aldolase from Staphylococcus aureus
rcsb
molecule keywords Tagatose 1,6-diphosphate aldolase
total genus 123
structure length 325
sequence length 325
ec nomenclature ec 4.1.2.40: Tagatose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2009-10-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3kaoA00
3DZ1A 4OBTA 3G0UA 3ABQA 4JTGA 1OF8A 1VC4A 1FDZA 3NQ6A 4QITA 3SR7A 3NOEA 1SZGA 1DL3A 5AYZA 3ZFHA 1ICQA 2H8XA 4QAIA 5AN7A 4M7TA 3S1WA 4FNSA 2ZA1A 1PVNA 2B7QA 3GAYA 3S42A 4H4IA 3DKJA 2QJIA 2VEKA 2WJZA 1MO0A 2V5BA 4UMCA 1NF7A 1IIGA 4GC4A 3BO9A 4OV9A 5LHEA 3TQKA 3THAA 3UNDA 3LRMA 1DV7A 1R47A 4LNYA 1OFPA 3ATZA 1QOQA 3LBMA 1K02A 3G1VA 2WKJA 3GK0A 5EKYA 3DENA 3R89A 2EF9A 4DPPA 1A5BA 1QDSA 4OV4A 1ZHAA 1KFCA 1ME7A 1FWWA 2TRSA 3EXTA 1BWKA 3E96A 3W7OA 1GG0A 3W1NA 4NX5A 4JDYA 4LC6A 3C2RA 3MBDA 2FQIA 4JR5A 4LVFA 1K7EA 3RU6A 4A21A 2YCEA 3W1MA 3W87A 2A5HA 1AG1O 3C52A 1F05A 2QJHA 4BI5A 3P8IA 3E9AA 2X2GA 3QQ1A 5AHEA 3GNNA 2TYSA 4NJIA 1Z41A 5G1TA 3O8AA 3L65A 4O57A 2A7NA 2W79A 3TQVA 4E38A 5J5RA 4O1AA 1K3UA 3FLUA 1OFRA 5FEXA 1AW5A 1ONRA 3O16A 5HWJA 4HN4A 3CT7A 4ZQOA 1OX4A 1KM1A 1YXDA 1QO2A 1I2OA 5HWMA 5D2YA 3FA5A 4N9DA 2FB2A 1ZALA 1X1ZA 1IXQA 3NEVA 4NJHA 4NNAA 4RV8A 4DXVA 4C1LA 1MXSA 3N14A 2QDHA 5E93A 3LCIA 3LLDA 4QQ3A 2PRLA 1FCVA 1XM3A 1LRTA 3NNTA 1Q6QA 5FF2A 2V9DA 2VFFA 1K03A 1NAL1 3P62A 4JX4A 1FDYA 2P1FA 2NUWA 4CCCA 4JTFA 4XBKA 3PB0A 1OK4A 2RKXA 4RJEA 2ZRYA 1V5XA 2AQWA 3Q58A 1SSGA 3B04A 1S3HA 4R34A 1VHNA 1H63A 4DF1A 1TMHA 1KBIA 1TV8A 2Q3RA 4PCFA 1SSDA 2JKAA 3R12A 4BFAA 1YTDA 3QMSA 2H90A 2VC6A 1WAUA 3MHGA 5CKSA 5FF7A 3T4CA 1LM1A 3HMJG 1O60A 4EOUA 5F4XA 4LW7A 3IGXA 4UTWA 4JXCA 2GOUA 1W56A 4LTSA 2DZSA 1TREA 3NM3A 1W5PA 1KFKA 4U4MA 1TCDA 4O17A 4FIRA 4OE7A 4NJGA 4FX6M 4IMGA 4BI6A 1H1YA 1GYNA 1H7RA 1OFDA 1TYGA 1L6YA 1ZCOA 2FPTA 5K9XA 4GE8A 2VEMA 4JTLA 2XFWA 1Q6OA 4O50A 3LHYA 5I3IA 1D3HA 2TMDA 1IXNA 1LORA 3NQ2A 5CSRA 3ZS4A 4UIOA 2P0OA 3T78A 1TTJA 3B03A 3MO7A 5LGZA 1L2UA 4PL1A 3P5YA 2J6XA 3SY5A 1TPFA 4NZJA 3W2NA 4AXKA 1HO4A 3KFTA 4O11A 4HNVA 2B0MA 1A5SA 2A0NA 4B5NA 3W6YA 3WK0A 3C4UA 4JTIA 1SUXA 3QZEA 3HGOA 4JD4A 3MP5A 5LNWA 2F84A 3T7VA 2Y7EA 3LV5A 3BARA 2CU0A 1XBXA 1CW2A 2QCCA 3C56A 4WJEA 3P61A 5EY5A 4S2CA 3W7GA 5C2XA 2ZRUA 4O13A 3G1YA 4UNKA 1KM2A 3TXZA 2HSAA 2A7RA 3TROA 3DGRA 3DFNA 4UMAA 3M1ZA 4OGZA 3MP3A 3TW6A 4R7JA 4J9JA 3QMTA 1SO6A 4AH7A 3DHDA 3BLEA 3LCFA 2CZ5A 4GUFA 1YXYA 1U83A 4MIMA 4XUGA 4UTTA 2CLMA 1A5CA 5CGQA 5LKYA 3W7CA 3N73A 3KVJA 4ONVA 4Z0JA 2X16A 3N34A 1TPWA 3P8JA 5EA9A 3QC3A 1LOQA 2E5CA 2ZZ3A 1VPXA 2D73A 4NU7A 3GIYA 4DO6A 1GTEA 1WXJA 4HNUA 1CI1A 2IQTA 2Z1BA 4KWWA 1J4EA 2CFFA 1LOSA 4A22A 1XCFA 1BEUA 1ZNNA 2Y88A 3TR2A 4AHQA 4Y8FA 4LU0A 2C15A 5KITA 1FUYA 1GG1A 2YZRA 4JTUA 4AMAA 2NXHA 3PBYA 1SZEA 3O07A 3QQ0A 1OFOA 2ZRVA 2Z6IA 1ZENA 3U6WA 2FTPA 3RLVA 3A5VA 1I2NA 2NZLA 3STFA 3ZWTA 3NL3A 3NPVA 4GFSA 4LUJA 4POCA 1VHCA 2DZWA 1XDLA 4TR9A 2DP3A 2X1RA 4TO8A 3S6DA 2Y70A 3NPUA 4MUZA 4IGHA 3L2IA 1H7NA 4LC8A 3G0SA 3A5FA 1XBZA 4I7WA 1Z48A 1H7OA 3DKLA 3DI1A 4KKXA 1TB3A 1FDJA 1KM5A 2WSQA 4TMCA 5AFDA 1PV8A 3KRZA 2EPHA 3NDOA 4DELA 5ABTA 1ZFJA 4IQLA 3CEPA 5KMYA 2JKEA 3L21A 1HL2A 1RQHA 4EIVA 1FXPA 4RR4A 3BW3A 4ADSA 2YDAA 3UPWA 2VFHA 3NXFA 3F4NA 3SFKA 1CX9A 1GVQA 2Y6ZA 5DY3A 1I4NA 1XBVA 3HG2A 4Y90A 3P7YA 1GPWA 5A8GA 3PVFA 5CSSA 2DZXA 3W22A 1G67A 1KM3A 1MSSA 1SZNA 2Q3OA 3FIGA 2YPIA 3FJLA 1XDMA 4LRTA 5LZLA 1TPC1 3QPZA 3IIPA 1SR9A 4UR8A 4DQWA 3ELFA 3EX1A 5DBUA 4BWLA 1JUBA 2ZZ5A 3W1PA 1X7FA 1GOXA 1OHLA 3W2JA 5G2WA 1X1OA 3QSTA 4I9AA 3GAKA 4RZ4A 3LTYA 2I14A 3LOTA 3PB2A 5U4NA 3UQNA 3ZWSA 5LGXA 3GDMA 1QO5A 4MLJA 4ADTA 1W5OA 2ZTJA 4LVDA 3W72A 3YPIA 3W85A 1LRQA 4O28A 3TUUA 3BK0A 2GVGA 3S8HA 3G1SA 2ATSA 1QR7A 3HOJA 1DOSA 2BZNA 1P1XA 3O05A 4FIQA 1MEHA 2EKCA 4KWVA 5IM51 4WOQA 3IIXA 4ZQPA 5G2HA 2Z6JA 1Q6RA 3LHWA 2QCHA 1I2RA 1JQVA 1AL8A 3A24A 3IVUA 4CQ9A 4OT7A 4MKNA 3G8EA 3KVMA 3M7WA 2YFOA 4LT9A 2CLEA 3B8DA 3QH2A 1RV8A 4EF8A 2YW4A 3LXAA 5MHBA 3D0CA 4JY9A 1VCVA 3JR2A 3WK3A 4N2YA 1LZOA 3MHFA 3CWOX 4UTIA 5E0KA 2VOMA 1OK6A 4DO5A 5LNUA 1YPFA 3C3NA 1VYRA 3TJXA 2BTMA 3G8RA 1AW1A 2VENA 3PY2A 3JRKA 5DELA 1Q3NA 1NEYA 2QEZA 4XQ6A 4O4WA 1DBTA 2ZDRA 2ZZ6A 4QNEA 3EWXA 2TPSA 4UTJA 1S5VA 2YR1A 5EBUA 2CLIA 3DBPA 3C0JA 4BK9A 1FCQA 3L5AA 3G3MA 5GVJA 1LROA 4K8HA 3GZ3A 3QM3A 3I7QA 4MY8A 4ZZ9A 2JBMA 1QNVA 4D2JA 1JCJA 2JKPA 3M5YA 1PHWA 4MOZA 3EWYA 1LP6A 4NT0A 1JCMP 4K36A 2DZUA 3T44A 4WOZA 3KX6A 5D33A 4X2RA 1A53A 3STCA 4JIQA 2FIQA 4FO4A 2ABAA 1VRDA 5K4XA 3O06A 3UWUA 3PM6A 4XTIA 3SGUA 3GXTA 3MHUA 2VFIA 4A2RA 4DO4A 3G1XA 3UY8A 2CLLA 3S1UA 1LDCA 3BG5A 3P67A 3WK2A 1ME9A 1VCFA 2VKZG 1QAPA 3NQ7A 3Q94A 1K8XA 5D04C 3CU2A 3EWUA 1OX6A 4O15A 4KFPA 3PF3A 3NYZA 3BV4A 1O94A 3HQ1A 3G3DA 2QCDB 5F2LA 1B4EA 2GVLA 2R91A 3SI9A 1GT8A 6TIMA 3CEUA 5AOUA 2GVJA 5LNVA 1F7BA 4O52A 3L68A 5D30A 2J9ZA 2BX7A 2NWRA 1YDNA 4HIBA 3RLUA 1UUOA 5AB3A 5BRBA 1UBSA 2NXIA 4E2DA 1L9WA 1SPQA 1TPDA 2GQ9A 3HJZA 3K30A 3G1DA 5D03A 3B0PA 3OIXA 3JS3A 3ABSA 2V30A 5F2GA 4IWWA 5L6UA 3M41A 5DXXA 3NPXA 4IUOA 4Z1DA 1YLVA 3UYCA 1KFEA 4ORIA 2B7PA 3LRKA 5D2XA 2E5BA 3P80A 4PL2A 3HPXA 5EMUA 2ALDA 1LCOA 3QPYA 3LTSA 4LV4A 5HULA 1D3GA 3FYOA 3LDVA 3CWNA 5CPLA 2W6RA 3QEZA 5DY2A 3VCRA 4UTTC 1XC4A 4QJ1A 4G1KA 6ALDA 3G22A 1H7WA 1KBJA 4CNNA 3OVQA 3C6CA 2J27A 5LNSA 3NPWA 3MWAA 3O15A 1JULA 4GWEA 4XKYA 2ZQ0A 3SZ8A 5G4EA 4GRSA 5K7JA 3WJYA 3H53A 4FNQA 8TIMA 1TRIA 4JTSA 5FEPA 1W3TA 3V1PA 1VR6A 3W88A 3IGSA 1SO3A 4DF2A 1EWEA 1ICSA 3LTPA 3MUXA 4EF9A 3QJAA 3TAOA 5AYYA 1MZHA 3L0NA 3W2MA 3W71A 2E6YA 4ZVJA 4FX7A 1OF6A 5HR6A 4PA8A 3KVKA 1NVMA 3QMRA 3P60A 2PC4A 3MYOA 5KTLA 5AC7A 1KTCA 1MEIA 4K7VA 3O6CA 1RR2A 5AC6A 2NV1A 4H3DA 3GDRA 4U28A 5FEWA 1KV8A 3IIOA 3MI2A 2BWGA 1VLIA 1R2RA 4LV9A 2YGYA 1I2QA 1X8FA 4X9SA 1UCWA 3OBKA 3KAOA 5EPDA 5F1UA 1HTIA 1W5NA 5CZTA 3TAKA 3PG8A 3A23A 2QAPA 1PCKA 4MY9A 2J9XA 1J5TA 1G4EA 2FB3A 3A21A 1QOPA 3LCGA 3EWBX 3GLCA 3CM4A 3N2XA 2YFNA 1YTKA 1HO1A 5J5DA 2QCNA 4IJBA 2GPTA 2UV8G 1O95A 4UFIA 1RD5A 1C8VA 4BF9A 4N6EA 3MBFA 3PR2A 1EA0A 3N9RA 4OHQA 5HNRA 1GEQA 2QF7A 3BW4A 1T8XA 2X1UA 3EX6A 4RLIA 4RXGA 2X30A 4IMEA 1TPEA 4FX8A 1RZMA 2NX3A 1NSJA 2EAWA 1G6CA 2ZRXA 4FNUA 3PSWA 3PUOA 4DPQA 1SFJA 4RCXA 3QF0A 5DCEA 5D37A 3GXNA 3W7PA 4WUIA 4LY8A 1UUMA 1TTQA 2QUUA 3HF3A 1LLWA 1H61A 1KM0A 3L0GA 3UWWA 2AGKA 4YCOA 4O0KA 7TIMA 5H91A 1KV5A 3NL2A 2VEPA 2Y62A 1VJIA 2C18A 2OCZA 3PWAA 4M6VA 3M5XA 3NQMA 4JX6A 4QIUA 3IIVA 4FXSA 3P82A 3OVPA 3B4UA 5CPMA 3BVJA 5HMSA 3GDLA 1QPNA 4I7VA 4IMDA 2ZCGA 3HGRA 3DFQA 1OG0A 3NQDA 3W9ZA 1TJRA 3M47A 4QNWA 1RQEA 1VS1A 2FPYA 2PCQA 2QCGA 3GDTA 2ABBA 5KINA 3DH7A 2V2CA 1SW3A 3OG3A 2OT1A 2QUTA 4A2SA 1EP2A 2QR6A 4LOCA 2B7NA 1YDVA 2QDGA 2WV8A 1Q45A 5IBXA 4MY1A 5TIMA 3TSMA 3I65A 4MYAA 1UJPA 2G97A 4E2BA 4UTKA 2V5LA 2VFEA 4JY8A 2A4AA 1N7KA 3BGJA 3ABOA 3NL6A 3W23A 3PS7A 2Y89A 3WJWA 1W3NA 4UTUA 3THQA 2E09A 3EXSA 1G7VA 3M16A 2R8WA 5C55A 3NGJA 2OT0A 4IMFA 3N2MA 4WXZA 2V82A 1YXCA 1EIXA 4Q4KA 4O0ZA 3TC7A 1SW7A 4IOTA 4UCGA 4L4MA 2E6AA 3VNDA 2DORA 2H6RA 4BI7A 1OJXA 2NUXA 1EPXA 3C61A 5CZ0A 5E1QA 2XN1A 4XKYB 4N4PA 2DU2A 1XBYA 3TSBA 1KFBA 2J24A 4JGDA 4A29A 3M9YA 5KZMA 2RHGA 4IXHA 4IX2A 2ZZ4A 4GUGA 4QM1A 1AMKA 2NXGA 3P5ZA 1P4CA 1ZAHA 3IVSA 4K7YA 3S5OA 5FF0A 1AK5A 2NLIA 2RH9A 1ALDA 4LS1A 3G24A 4OQVA 3PSVA 2Q8LA 3TU9A 3TC6A 3MP4A 4AEOA 3HB9A 2PRHA 1GZGA 3LV6A 4NJKA 3MJYA 3Q2DA 1G7UA 3RF9A 2QKFA 4MZ1A 4JYDA 4Y96A 2ISVA 3ABRA 4RXFA 4Z1BA 2RDUA 5KSWA 1M7PA 4FEZA 3TX9A 4AHOA 2QUVA 3OA3A 1GQNA 3CLMA 2QCDA 4N9BA 1VH7A 4RK8A 5BNKA 1OFAA 1H50A 3BGGA 3W1UA 4O14A 2YYUA 1QWGA 1YDOA 3I68A 4Q33A 1F6PA 3N19B 4W9TA 4WXYA 1W5QA 1S5WA 1T96A 3EWZA 2WPBA 3PAJA 3W83A 5EYWA 2FLIA 1TTIA 3KVLA 4JTJA 4O4VA 1WOAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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