3KH7A

Crystal structure of the periplasmic soluble domain of reduced ccmg from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
b'VPRGSHMLDPSELPSALIGKPFPAFDLPSVQDPARRLTEADLKGKPALVNVWGTWCPSCRVEHPELTRLAEQGVVIYGINYKDDNAAAIKWLNELHNPYLLSISDADGTLGLDLGVYGAPETYLIDKQGIIRHKIVGVVDQKVWREQLAPLYQQLLD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural and functional characterization of CcmG from Pseudomonas aeruginosa, a key component of the bacterial cytochrome c maturation apparatus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbE
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Oxidoreductase
total genus 47
structure length 157
sequence length 157
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3kh7A00
3US3A 2PBJA 2P5RA 1ERUA 2IWTA 4JE1A 4MF6A 1PL1A 3CYNA 5FWGA 5D93A 3QAWA 2K8SA 2X8HA 3A5WA 4I2UA 4BVXA 4F82A 3ZMKA 4PXOA 4OD7A 2VLVA 5G2ZA 2HLSA 4KNDA 5A4WA 1X9WB 5JCWA 4ZIJA 1TKDB 4K2DA 1EV9A 3FR9A 6GSSA 3QPMA 4TRXA 13GSA 4HEA2 1F2EA 1AUCA 1K0DA 1TI1A 3F9UA 1XVQA 1KNGA 4HI7A 2G0FA 4GXZA 2OADA 2WJUA 4WF4A 5AISA 1FB0A 4ECCA 2FHEA 4BPYA 3DYRA 2H72A 2YCDA 4N0ZA 5ECIB 5JCGA 2REMA 2V6KA 3VWUA 2GTUA 3PH9A 5D73A 2LJRA 1H75A 4OFNA 1K3LA 3ZRDA 2L6DA 1DSBA 1O7UA 1PX6A 1SK0A 2H1AA 1SKRB 2LQOA 4FIWA 4ECBA 1WP0A 1T8EB 1PRXA 2YP6A 1JZWA 5DDLA 4DSSB 4L8EA 3PINA 2EIOA 2IMEA 4K7NA 4L5OA 3RAZA 2OE3A 4XHMA 1K0OA 5ECRB 1TRVA 2MBTA 1GWCA 1ZL9A 4MJBA 4WETA 4MZWA 5JWOB 3RPPA 3ZIVA 1AQXA 3IC4A 3O6TA 5EL8A 2RM6A 4JEDA 1Z6MA 3F4TA 2VCTA 3GIXA 3E0UA 2MMZA 1AQVA 3CSHA 4ILFA 2O85A 2WDUA 4POLA 3DD3A 1XWKA 5AIVA 5CAXA 2OBKA 1YEPA 3L0HA 4G10A 3AY8A 4AJ7A 2LS5A 3QCPA 4IQAA 3N9JA 1J0FA 2YV9A 4POKA 3HYPA 3L9SA 1EP8A 4XS4B 5D9WA 1R26A 3JCML 1GTBA 5JCUA 4NAXA 5HFIA 2LUSA 1TRSA 1R7HA 2CZ3A 3CSIA 4KCAA 3E3EA 3LSZA 2ES7A 4MZBA 3A2VA 4TXOB 3ME8A 2OJLA 3KMNA 1O73A 4PUAA 2P5QA 3GYKA 1ZZYA 1BAYA 2YOIA 1ILOA 2NBSA 2EC4A 3L78A 3CRUA 5C04A 3W8SA 3KZQA 1T1VA 2H75A 3PGTA 4MJAA 5IQYA 3HVXA 1IYIA 5ECNB 1J08A 2NPBA 2DJ3A 5DCGA 1TTZA 2NVLA 17GSA 4CHSA 2C0DA 3WYWA 3GL5A 6GSWA 4FO5A 3TOTA 5AIXA 1GSQA 2R2JA 4ZB6A 1SKSB 2IJYA 3CMIA 5EVOA 5ELGA 1K0BA 2PVOC 4G19A 19GSA 1ZYEA 1AAZA 3NOFA 2IMDA 3RHCA 4TR1A 2WRTA 3M3MA 3SBCA 3IRAA 4BWQA 1YF1A 2IMKA 3KJYA 2QSIA 4Q5NA 1TDIA 3D21A 1A23A 2XPEA 4F03A 1BEDA 4JR4A 1HNBA 1M99A 2P0GA 1TU8A 3H79A 3UIWA 1FAAA 2C1YA 2L4CA 1XWBA 4JBBA 3GTUA 1B8XA 4MABA 4KB3A 3M0FA 3LWAA 4IN0A 1EGRA 2BJXA 4N0VA 2OKAA 2HXKA 5HFGA 4MF7A 3F6DA 3ZFLA 1A8YA 3BJ5A 4OMVA 1F3BA 1T00A 3BCKA 2V1MA 3I43A 2DIYA 2VUPA 3KEBA 4AJ8A 1GTUA 4TR0A 4YQMA 1A0FA 5DJLA 1EOGA 1QFNA 8GSSA 1EEJA 4KA0A 4IHUA 3KP9A 1M9AA 3GN3A 1HQOA 2X8GA 3GKMA 2VD0A 1WJKA 3VK9A 5J4UA 1QQ2A 2DJ0A 1QGVA 1XFLA 2HZFA 1PL2A 2FWFA 3K8NA 1GL8A 3VFIA 1ERTA 2HFDA 3FR6A 5KEJA 3FR3A 2L57A 5KN3A 1A8LA 4IELA 2GS3A 3P90A 3HVVA 5D9XA 4TVEA 3EINA 4PURA 2PUKC 4AJ6A 2PU9C 3F6FA 1RK4A 4KUNA 1FW1A 1GLQA 2AB6A 5IO0A 1V40A 3OR5A 2H0GA 5GZZB 2VL9A 1JZDA 1M2AA 4L5LA 3FZ9A 2VCQA 2A4VA 4EDZA 3IBHA 2D2ZA 2M72A 3F4SA 3I9V2 4YAPA 3J7Yb 5ECHB 2CAQA 4POMA 1GTAA 1FB6A 3RHBA 2VM1A 3TKSA 2V32A 1TP9A 3HKRA 4BL7A 1SK2A 1XVWA 3KCMA 1TI3A 3Q74A 2HSYA 3ERFA 3GSSA 5B8AA 2RUEA 2RM5A 2B1KA 3WGEA 3C7MA 3F3RA 1OVNA 2E7PA 4KW6A 1BQ7A 1WMJA 2HE3A 4EF0A 3UBLA 2DMMA 4RI7A 2FWGA 4HZ4A 2QC7A 1A0RP 4GCIA 4NV2A 2ZNMA 4G2EA 3GX8A 4BWSA 3VPTA 4MJCA 2H1BA 2B5EA 16GSA 3TUEA 5G5FA 4POBA 2RUFA 3P7XA 1F37A 1YJ6A 3EE2A 2IIYA 1JZRA 4KH7A 2YWIA 4FYBA 2LJKA 3D6IA 2LRTA 20GSA 3QFBC 4HDEA 3HJOA 2J23A 3LORA 2DJKA 5DCHA 4TR1B 1T7PB 1YF0A 2GQLA 1XXUA 1Q4JA 4GRFA 4HJ2A 3GV1A 2MMAA 2ON7A 4XIHA 1X5CA 2DJ1A 1CQHA 3NIVA 1HNAA 1GUHA 4MP4A 3FZAA 3BBYA 1FO5A 3Q6OA 4KSMA 5G1KA 5CRWA 2VD1A 1W89A 2AYTA 2FWHA 3GTUB 2K6VA 1B48A 4K6XA 2IPAA 1X9SB 3EC3A 2B6MA 5DALA 1K3YA 2CVKA 2OBIA 3GHAA 2O8VB 2HYXA 2X99A 2N5BA 2VCXA 3D22A 4PQIA 3EU3A 1NHYA 3MAKA 1NM3A 2H6XA 2AUVA 3ZVJD 3F8UA 2P31A 2PWJA 4TW5A 2CX3A 1T3BA 4WBJA 1J9BA 2GT5A 1SYRA 1OYJA 4F0CA 4PX1A 3TRXA 3UBKA 2YANA 1GP1A 9GSSA 4GTUA 1EOHA 4I5QA 3IPZA 2G2QA 3EMPA 5HFKA 4L0UA 1Z7RA 1SL2B 3UL3A 1M2DA 1K0MA 4F2IA 1M2BA 4KSOA 1JFUA 2PERA 3LYKA 5IPHA 5A4VA 2R6KA 2CX4A 3GH9A 4KDYA 4OFTA 3D4MA 4XS1A 1URMA 3HHVA 4PNGA 1E6BA 2PGTA 3L9VA 3IE3A 2XBQA 1XWGA 5IMCA 2YNXA 3H4KA 5HQPA 1PKZA 4ZL9A 3L9UA 1THXA 5ID2B 4PNFA 2JACA 2DSAA 3KD0A 4YQVA 1U88A 1GSFA 4KX4A 2M80A 1AC1A 2WZ9A 2B7JA 3GX0A 3KGKA 3GUSA 4KCEA 5KN2A 2AV4A 4X43A 1GSUA 3I6AA 3Q18A 2GSTA 4MMMA 2FA4A 1B9XC 5L71A 2C0EA 1VF2A 3GFKA 2LTKA 2C0GA 2LQQA 1XBSA 2B5XA 6GSVA 1UA5A 1JZOA 3TOUA 2VCZA 4KAEA 2TIRA 3IK9A 5IIZA 4NMUA 3ISOA 1U6TA 2MMOA 2E2MA 3EYTA 2C3QA 6GSUA 3KIJA 4ISDA 1G6WA 2F9SA 2M46A 1E2YA 2CVDA 3A2XA 2AJQB 1QMVA 4HZ2A 1KBNA 3UVHA 3RPNA 4EL1A 5B8BA 3R2QA 2H01A 3FEUA 2ON5A 4EVMA 2VL2A 5G31A 3KP8A 5DVBA 1B4QA 1PKWA 1OAZA 6GSXA 3W6GA 5B7CA 4HU7A 2V41A 1OKDA 3ZMLA 6GSTA 5IOWA 2DIZA 3D5JA 3KXOA 1YQ1A 3QAVA 3UEMA 3UAPA 1O81A 4TXVA 1OE8A 1WRYA 3ZVJA 11GSA 2H74A 4EKZA 5IO2A 4HOJA 5DBQA 4MDCA 3RDWA 2OACA 14GSA 3HA9A 1V58A 4P3YB 2HNLA 4IJ3A 1DE1A 2HSHA 5H5SA 2KUCA 2JZSA 1PQNA 4ECJA 3TJJA 4I6XA 5ECKB 4CW9A 1KTEA 5D9VA 1C72A 3M9JA 1AQWA 1O8WA 2CZ2A 4ZBBA 4IQ1A 1VRSD 1GTIA 5DALB 2L4QA 5ABRA 4TOPA 2GLRA 1BX9A 2JSZA 5GSTA 1QXHA 3FK8A 1S3CA 1SU9A 1OKTA 3RBTA 5J3RA 5DQYA 3ZITA 3QOUA 4XTSA 4K1FA 2F51A 3TKPA 1KEBA 4RUVA 2R5GA 3BCIA 1W4VA 4HU9A 5ECLB 2H0IA 5D9TA 3TGZA 3KH7A 1WE0A 5EY6A 3ZZXA 4ACSA 3CTFA 5CP1A 4ZILA 3VI7A 5H5QA 1TOFA 2VL2C 4XCSA 22GSA 3C1RA 5J41A 5DAKA 5FHIA 3HXSA 3G7YA 2VLTA 4X1UA 1GRXA 2OE1A 3F4RA 1O8XA 1F3AA 1EWXA 2R4VA 3ERGA 1YEXA 1GNEA 3CBUA 4CDOA 4AF2A 2IN3A 2O7KA 4FYUA 5IMFA 2KP1A 3UOMA 2AAWA 3FZ5A 1EV4A 2MYGA 2V6OA 5IMDA 2O89A 3IXRA 2DMLA 1BJXA 1XWCA 4K0NA 1GSEA 3TJBA 2PPTA 3MDKA 5HR2A 4GF0A 1XWAA 2VM2A 4IVFA 5GAPD 3QR6A 4N11A 3TRPA 3G9BA 4IP6A 1MD3A 1K3OA 3MWHA 3HD5A 5EPFA 2HZEA 4IGJA 2JL4A 4PQHA 1VF3A 5IM9A 3TDGA 4DEJA 3EVIA 3GRXA 1SENA 1Y25A 3F0IA 3FZ4A 3MNGA 2B7KA 2OA7A 2TRXA 1THOA 3C1SA 1PD21 2H73A 2H19A 1IYHA 2N5AA 5JWRB 2Z9SA 1YKCA 3EWLA 2L5OA 5CRDA 2L59A 4JR6A 2YWNA 2JU5A 3VWXA 4LA1A 4F0BA 2B5YA 4FH8A 2CT6A 3UVTA 1QK8A 3GKXA 2XBIA 2VCWA 2CV4A 3GA4A 3H93A 2NTOA 5E4WA 3ZLPA 3SWLA 3CXGA 3GL3A 4V1Ap 1SYXA 4HS1A 3IAM2 2NDOA 3WT2A 5G5EA 2HRNA 3HJMA 2FNOA 4V2MA 1FG4A 3C8EA 3TKQA 4GQCA 2MMNA 1TRUA 3VPQA 2R37A 5AN1A 4V2LA 3ZIJA 1U3IA 3G7JA 1LU4A 3APQA 3GKKA 3IA1A 2VL3A 4NXIA 1MEKA 4IP1A 2KP2A 1ACVA 3FY7A 1VF1A 1ST9A 1EP7A 3HVSA 2CAIA 1GSDA 3TJKA 2YJ7A 5LCZA 4KGIA 1X9MB 1HYUA 2QKEA 1NW2A 4GSSA 2FWEA 2R3XA 4K0GA 3ZL5A 3C71A 4ML6A 5F07A 1XPVA 4YH2A 1WIKA 1M7TA 1B9YC 1OE7A 2N5FA 4EE0A 2L6CA 3HJPA 1R4WA 3CTGA 4MJEA 5CO3A 2H6ZA 2LSTA 5DAKB 2H0HA 3IK7A 1SKWB 2F3MA 3GURA 2GZYA 4QQ7A 1F6MC 4J57E 1ABAA 5ENUA 3D0ZA 1SL1B 1OC3A 2DJ2A 4PUFC 4Q5QA 3KTBA 1USBA 4IKHA 4DSRA 4JZQA 4V1Ag 18GSA 4D73A 1K0NA 2I4AA 3Q19A 2VAFA 3WT1A 3P2AA 3FRCA 3WGXA 2GZPA 5F0GA 1K0AA 2H30A 1OC9A 1VF4A 4TR4A 1A2MA 3GH6A 4O32A 5D8IA 5B6MA 1V98A 1V57A 1NHOA 3LJRA 1JLVA 1XIYA 3EURA 1MDIA 1SK1A 1Z5YE 1BG5A 1FHEA 4MH3A 1GUMA 3GNJA 4NHZA 5LNKe 4DSQA 3IHQA 3C73A 3U6VA 4TKYA 3FYGA 4PQ1A 1X5EA 1I5GA 1SJ6A 3I69A 2DLXA 1ERVA 2C0FA 5IOXA 3LXZA 2LEGA 2FA8A 2HT9A 2GQMA 1V2AA 3HCZA 2ZUPA 1GULA 2WS2A 4BA7A 1PGTA 4G9HA 2A2SA 2F8AA 2FD3A 2JADA 5A4UA 1NSWA 4ZBDA 1T4YA 1X0RA 1ML6A 1ZCPA 1Z7PA 3V1WA 3EMXA 2OE0A 2C8UA 4WR4A 3EU4A 1B4PA 4IW9A 2VLUA 3DGQA 2C4JA 1EEMA 5GAND 1AW9A 3HDCA 4OCEA 4HQZA 2WFCA 2EIRA 4NHWA 4J2FA 3KMOA 3DWVA 1G7OA 2IL3A 3WGDA 4WEYA 2QGVA 4ZL7A 2I3YA 1DBYA 1M0UA 2XC2A 5F05A 3TKRA 4KDUA 4ML1A 1ERWA 4N30A 5ECOB 4N10A 1TRWA 3TJGA 2H71A 4MK3A 1HD2A 1Z6NA 4GQFA 5C00A 1YDKA 4OFMA 1TK0B 4X0XA 3TRQA 1ZOFA 4K7IA 4WKWA 2LRNA 5IMAA 2V2GA 1Z3EA 4WBRD 2BTOT 3NZNA 4JRRA 4MPFA 4XRDA 2TRCP 4QL9A 3QMXA 1XOAA 1TU7A 2MBSA 2FLSA 2KHPA 2IFQA 4EC0A 1T4ZA 3QFAC 1U87A 3DKSA 4PGTA 1AXDA 3W8JA 12GSA 5DJMA 1SL0B 2PVQA 2CVBA 1WPIA 5IMZA 3TCOA 3DEXA 2XPDA 2YJHA 3F3QA 4HUAA 2DBCA 2MZCA 3GKNA 2DJJA 2YWOA 3KH9A 4K9ZA 4E8EA 4Q5RA 3ZYWA 1JHBA 2O87A 4LL1B 2K9FA 2YPMA 5ECSA 3S9FA 5ELAA 3LQ7A 1ZYQB 5KN1A 5COHA 1XCCA 2FGXA 3QAGA 2H70A 4D73B 2GGTA 1OC9B 10GSA 1LJRA 3PR8A 3DMLA 3A2WA 2KOKA 2GVPA 3G7IA 3D4TA 3FW2A 5CREA 2WB9A 1A24A 3U5RE 4TN8A 3F63A 3VLNA 4O7HA 1HNCA 1XW6A 3CSJA 1TXXA 1YKAA 1A2JA 4RQXA 3BOAA 2I9HA 3IAS2 3APSA 1SJZA 1MD4A 3P8WA 2XHFA 4NWYA 1K0CA 1WOUA 2X8CA 1PN9A 1XW9A 3TKSE 2C3NA 1R5PA 4WR5A 3GSTA 3H8QA 4GLTA 1V9WA 4MH2A 2GSRA 4TR3A 2GT6A 1ON4A 2C80A 1SJIA 3J7Yk 3QDNA 3E9JB 5ECQB 1RW1A 3FHKA 2VIMA 4RQRA 2X64A 2ZCTA 4NPBA 2LRCA 4I8BA 1F9MA 3UARA 1N8JA 2GSQA 2HRFA 1ZGNA 4O5RA 3A3TA 4ZB9A 1GSYA 4MF5A 5INYA 2H1GA 3LXTA 3M9KA 1M9BA 1A2LA 4HQSA 4LL4B 4QL7A 2JSYA 5DQSA 2C3TA 3ZTLA 2VO4A 3KM6A 4KDXA 1YZXA 1QUWA 3IV4A 2K8VA 4ZL8A 2GDRA 5J9CA 1Y6EA 3H1NA 2YZUA 3VWWA 2JZRA 1TK5B 4WF5A 2GSSA 3DIEA 3TB2A 4XRAA 2WCIA 1XZOA 4FYCA 1Z9HA 5CRGA 1TK8B 2E0QA 1PA3A 3TJFA 4AGSA 4HJMA 1SD8A 5E59A 2I1UA 4YAVA 4I2TA 5IPGA 3DXBA 1DE2A 2H66A 3VURA 3DVWA 1FVJA 1MDKA 2IFQB 4EUYA 1GUKA 2BMXA 1CQGA 4LMVA 2PMTA 4MPGA 2YN1A 5CYYA 5CRHA 2LV3A 4ZXGA 5HR0A 3DRNA 2FY6A 4I97A 1TW9A 3M1GA 4H86A 1H4OA 2B3SA 2LNSA 4KE3A 1MTCA 1GSSA 1UC7A 1X5DA 2RIIA 2ALBA 2HI7A 4OWYA 1MDJA 2A2RA 1ZMAA 1R5AA 5KN0A 1G6YA 4ID0A 3WD6A 4GSTA 3ZFBA 1FOVA 5CNWA 3N5OA 1GH2A 3KTLA 3L4NA 2PN8A 5ID2A 4BVYA 5GSSA 1DUGA 5LD0A 4JU5A 3ED3A 3BD2A 5HR3A 4MLYA 3MSZA 2RLIA 4ZB8A 5G1LA 2CA8A 1VGLA 2AHEA 4NV5A 1O6JA 3LEFA 1I9DA 2IMIA 3ME7A 3FKFA 4ZBAA 1XOBA 4MA9A 4OO5A 1RQMA 2GZZA 2KLXA 2L5LA 4WXTA 2IMFA 4ECIA 2E2GA 4XS6A 2DC5A 1OC8A 2YWMA 1S3DA 5F8BA 1PSQA 4DSSA 1O85A 5J9BA 5G30A 1GLPA 1BYEA 1SD9A 1PMTA 2LJAA 1G0TA 3LFLA 2JZTA 3UJ1A 2GQKA 3DVXA 5H5RA 2J9HA 4YQUA 2YV7A 2K18A 2CQ9A 2FCHA 1UVZA 3M8NA 2VCVA 5F06A 4V2NA 4J56E 3LYPA 5IMVA 2H76A 4Q5FA 5ECMB 5ECPB 4E8HA 3HY2A 4L0WA 4OO4A 1N2AA 3HZ8A 1FVKA 2F8FA 2WULA 4EDYA 4IS0A 2EIQA 3VI5A 5A5KA 7GSSA 4MCUA 4IJIA 1AIUA 4XS4A 1WWJA 2LNTA 1G7EA 1U3AA 5FT3A 1S3AA 3O76A 4GSNA 2FUG2 1EGOA 3QD9A 3IDVA 1LBKA 1EZKA 3HZ4A 3ZREA 2WGRA 3O3TA 4F9ZA 2VOCA 4TXOA 1GNWA 3UMAA 5B6NA 3LG6A 2H8LA 3GMFA 3TKSC 5J5NA 1XW5A 4K7OA 4LMWA 4EXJA 1JLWA 2HZEB 3CRTA 4Z7XA 6GSYA 4K8MA 4GWRA 5HR1A 1Q98A 2B1LA 3VWVA 3ERWA 4RI6A 2H6YA 2YZHA 4DVCA 1UN2A 3LGCA 4MZCA 3IOSA 2I81A 3APOA 4LLRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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