3KKXA

Neutron structure of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Neutron structure of human carbonic anhydrase II: implications for proton transfer.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3kkxA00
3S77B 2CBCA 5EHEA 3SBIA 3D8WA 1BNUA 3P44A 1BNVA 2FNMA 4CA2A 4HEZA 1IF4A 3ML2A 4RH2A 5DSIA 2Q1QA 1XEVA 5DSKA 4YYTA 2CBAA 4Z1NA 3V7XA 4FIKA 1G1DA 2X7UA 3F7UA 5FLSA 1I9LA 4ZAOA 3MZCA 3M96A 4RN4A 4QIYA 3F7BA 5DSRA 5E2RA 5FNGA 3DAZA 4QJMA 5SZ7A 4Q8ZA 3RYJB 4KP5A 5JEGB 3D9ZA 1ZGEA 3IEOA 5G0BA 1Y7WA 3W6HA 1YDBA 1BNQA 2Q38A 5EHWA 5DSNA 5G0CA 3K2FA 3M04A 4QSBA 4R59A 1TB0X 3MNUA 3KNEA 4HBAA 1ZFKA 1IF9A 3BETA 3P3JA 3HKNA 4K0SA 4XE1A 5C8IA 5LMDA 4ZWIA 5A6HA 5FL5A 5EOIA 3M5TA 1G53A 4Q06A 4Q90A 1KEQA 1ZE8A 4FVOA 5FLQA 1G4OA 2FW4A 2NXSA 4KUYA 3HKTA 4RFDA 5HPJA 1CNJA 3DCCA 2CBEA 1CNBA 4M2RA 4QY3A 1FLJA 4Q99A 2FOQA 1TEUX 2FOSA 4PXXA 4K0ZA 1XEGA 2EU3A 4IDRX 2X7SA 4Z1EA 3RYVB 4LU3A 2H4NA 1CNHA 1CAIA 4Q08A 2W2JA 3DVBA 5SZ0A 3OKVA 4TWMA 5FNLA 1CALA 4HEWA 3RGEA 5CA2A 4PZHA 1G54A 1DMXA 1HVAA 1IF8A 1LG6A 4YGNA 3KOKA 3RZ5A 3ZNCA 4N0XB 1CA2A 1CVAA 1RZBA 4YWPA 5EH8A 1CCTA 3JXGA 1FQLA 3MYQA 3S75B 4MLTA 3P5AA 2GEHA 5EKHA 1FQNA 1CNWA 3RYXB 4QJWA 4QJXA 3K34A 3MHIA 4PYXA 3M5EA 4XIWA 4FL7A 5SZ5A 1ZH9A 2AW1A 4FU5A 5CACA 3S9TA 1H4NA 4R5BA 2IT4A 5SZ6A 1CNIA 3DVCA 4KUWA 3T5UA 1CNYA 3RZ1B 1CAJA 3TMJA 1ZGFA 3M14A 2FMGA 3CA2A 1F2WA 4KNMA 3M2NA 2NNOA 1UGFA 3F8EA 3MHLA 4YXUA 2FNNA 5AMGA 1AM6A 3TVNX 1I8ZA 1CIMA 1DMYA 1OKNA 4M2WA 4CQ0A 3VBDA 3M5SA 4Q7VA 1TE3X 1CVCA 4ZWZA 1I9MA 4QSAA 3P3HA 3SAPA 3M98A 3MNKA 1I9OA 4Q7WA 4HU1A 2X7TA 3UYQA 1CAHA 4L5UA 3N3JA 3N0NA 3UYNA 1Z97A 4Q83A 1CNXA 4HEYA 5JESB 2GD8A 3PJJA 4Q6DA 1ZSBA 5DRSA 3BL1A 4RIUA 3DC9A 4DZ7A 3OIMA 4QSJA 5DSLA 1THKA 4JSWA 3RLDA 1JCZA 1RJ6A 1ZFQA 3V3GB 8CA2A 4TWLA 1IF7A 3LXEA 1G0FA 2WEOA 2OSMA 4WR7A 1MUAA 2NWZA 3PYKA 4JS6A 5E2SA 4XIXA 9CA2A 5FNMA 4GL1X 4JSZA 1UGCA 4ZWYA 2EU2A 4C3TA 1CVBA 3MNHA 1DCAA 1IF5A 4Q81A 1CVDA 2WEHA 3RG3A 1V9IC 5FNIA 2HL4A 3DC3A 2NXRA 4Z1JA 5SZ1A 4Q9YA 4N16A 4Q0LA 1I9NA 3JXFA 4M2VA 3RG4A 5AMLA 5SZ2A 3RZ8A 3OYQA 4YGLA 3S72B 3KOIA 3MDZA 5JQTA 3MHMA 4Q78A 1TTMA 4ITOA 5JDVB 2NWPA 1BCDA 4XZ5A 4X5SA 4ILXA 2EZ7A 3M2XA 3HS4A 4MDGA 3NI5A 4Q87A 3DBUA 1G3ZA 3S97A 3JXHC 1I9PA 3W6IA 4RUYA 5DSPA 1RZEA 2WD3A 5DSQA 1CVFA 4PYYA 4YX4A 5E5UA 3M1QA 3FW3A 1DCBA 1HEBA 3M1KA 5BRVA 1XPZA 4HF3A 4QK1A 3R17B 2QP6A 1J9WA 5L6KA 1YO1A 4QJOA 1CINA 4KNIA 4RUZA 4JSSA 5E2MA 4K0TA 1BNTA 1BN4A 1YDCA 3MWOA 4QJPA 1HCBA 1KOQA 1RAZA 3T84A 1JD0A 1HUGA 4K13A 4Q8YA 4BF6A 3OY0A 1RZAA 5DSOA 4Y0JA 2ABEA 3S74B 3DA2A 4CNWA 1Z93A 4YVYA 1CVEA 4MLXA 1G45A 1UGEA 1LG5A 5FLOA 1TBTX 3KLDB 2FOUA 5BRUA 4HT2A 1HEDA 4Q7PA 1YDAA 5JEHB 5BRWA 4YXIA 1CNKA 4QK2A 1FQMA 2HFWA 1BV3A 1TEQX 3N4BA 5FDCA 1ZSAA 3M1WA 3MNAA 2ILIA 4PQ7A 1G52A 1Z9YA 5DVXA 2AX2A 4G7AA 4E4AA 3RYZA 4WW6A 2NNSA 2NWOA 3RJ7A 1CCUA 3MNIA 2POUA 1XQ0A 4YGFA 1CNGA 1I9QA 4XFWA 3IGPA 1I91A 3DCSA 4QTLA 5FDIA 4QSIA 3V2JA 4FPTA 5FNHA 3S73B 3D93A 4ZX1A 5EHVA 3M67A 3SBHA 1LGDA 4KP8A 3B4FA 3U3AX 2NNGA 3HKUA 5FL4A 5DSMA 3EFIA 4CACA 3QYKA 3T82A 3TVOX 1KOPA 4FRCA 4QJ0A 1G6VA 3B1BA 4HT0A 2O4ZA 3N2PA 5E5RA 3S71B 3CAJA 4KAPA 1UGAA 1AZMA 1LUGA 1IF6A 3DD0A 4LP6A 3P5LA 1BN1A 3F4XA 4E3GA 1I90A 1BN3A 2CBDA 5EIJA 5FLRA 5E2KA 4COQA 4Z1KA 3HFPA 1UGDA 1CVHA 5FNKA 3T5ZA 1URTA 3S78B 5JGSB 4QIZA 3MMFA 5JG5B 2FNKA 2QOAA 2CABA 3OILA 4M2UA 5FNJA 4YGJA 1FR7A 3OIKA 2VVAX 4E5QA 4JSAA 5L3OA 4E3DA 1FR4A 3V3JA 1CRMA 2NNVA 4MDLA 2F14A 3V5GA 1CZMA 1BICA 1CCSA 3MHOA 1CAMA 1G0EA 3R16A 2FOVA 1CNCA 1KWRA 2NN7A 1FSQA 5A25A 1MOOA 1BNNA 2POWA 2QO8A 3IBUA 1HEAA 3U47A 5DOHA 3U45X 4E3HA 1CAYA 5JG3B 3K7KA 3P58A 3HLJA 4KUVA 3S8XA 2WD2A 2NN1A 3BL0A 5BYIA 4KNNA 3D92A 4YGKA 3DVDA 4R5AA 3S76A 3FFPX 4ITPA 4CNXA 5JGTB 1CAKA 1TG9A 5FLPA 5CJFA 1JV0A 4G0CA 2Q1BA 2WEGA 1OQ5A 5EH7A 3C7PA 3EFTA 3M2ZA 1V9EA 1RZCA 1YO2A 1YO0A 3IAIA 3KKXA 5G03A 3RZ0B 1KWQA 1BNMA 4MO8A 3Q31A 4YHAA 1G48A 1OKLA 4ZWXA 1CAZA 4RUXA 5EKJA 3SAXA 4MTYA 5AMDA 3CYUA 1H9QA 3HKQA 2HNCA 5SZ3A 4BCWA 2CBBA 3U7CA 3RZ7A 3DCWA 1FQRA 7CA2A 3DD8A 4KNJA 4MDMA 5EZTX 3GZ0A 3T85A 6CA2A 3P4VA 5FLTA 1CA3A 1CRAA 2CA2A 3M2YA 4UOVA 3V3FA 3DV7A 4WUPA 4ETQC 4LHIA 1FSNA 1LZVA 5BNLA 1BZMA 2ZNCA 3OKUA 3M3XA 5IPZA 2NXTA 4WUQA 3IBLA 5EKMA 1AVNA 4WW8A 4RIVA 4CNVA 1RJ5A 1HECA 4IWZA 3V2MA 4Q09A 3IBNA 1RZDA 5EH5A 4KV0A 4FVNA 2H15A 3NJ9A 5CLUA 4ZX0A 5E2NA 2NMXA 4DZ9A 4L5WA 4QK3A 3M40A 2NWYA 1CANA 3PO6A 3KS3A 3D0NA 4Q7SA 3V3IB 1OKMA 1CILA 3FE4A 3CZVA 1TH9A 2OSFA 3M1JA 1CAOA 1G4JA 1BNWA 3T83A 4Q8XA 1EOUA 4YXOA 3MNJA 5FL6A 2FMZA 2WEJA 1TG3A 5J8ZA 2POVA 1ZSCA 5JEPB 3NB5A 2HKKA 5DSJA 3ZP9A 3ML5A 5G01A 1HUHA 1H9NA 4BF1A 4QEFA 3L14A 2HD6A 1T9NA 4E49A 1ZNCA 4K1QA 3KWAA 4Z0QA 2HOCA 12CAA 1UGGA 4E3FA 3OYSA 4CNRA 5JQ0A 3KIGA 5DOGA 1RAYA 1FSRA 5SZ4A 3MHCA 3V3HB 4L5VA 3IBIA 2FOYA 4Q49A 4Q07A 4WL4A 2VVBX 3KONA 1HCAA 3RYYA 4Q6EA 1A42A 3P55A 4E9OX 1G46A 1UGBA 5E28A 4RFCA 1YDDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3S77 B;  2CBC A;  5EHE A;  3SBI A;  3D8W A;  1BNU A;  3P44 A;  1BNV A;  2FNM A;  4CA2 A;  4HEZ A;  1IF4 A;  3ML2 A;  4RH2 A;  5DSI A;  2Q1Q A;  1XEV A;  5DSK A;  4YYT A;  2CBA A;  4Z1N A;  3V7X A;  4FIK A;  1G1D A;  2X7U A;  3F7U A;  5FLS A;  1I9L A;  4ZAO A;  3MZC A;  3M96 A;  4RN4 A;  4QIY A;  3F7B A;  5DSR A;  5E2R A;  5FNG A;  3DAZ A;  4QJM A;  5SZ7 A;  4Q8Z A;  3RYJ B;  4KP5 A;  5JEG B;  3D9Z A;  1ZGE A;  3IEO A;  5G0B A;  1Y7W A;  3W6H A;  1YDB A;  1BNQ A;  2Q38 A;  5EHW A;  5DSN A;  5G0C A;  3K2F A;  3M04 A;  4QSB A;  4R59 A;  1TB0 X;  3MNU A;  3KNE A;  4HBA A;  1ZFK A;  1IF9 A;  3BET A;  3P3J A;  3HKN A;  4K0S A;  4XE1 A;  5C8I A;  5LMD A;  4ZWI A;  5A6H A;  5FL5 A;  5EOI A;  3M5T A;  1G53 A;  4Q06 A;  4Q90 A;  1KEQ A;  1ZE8 A;  4FVO A;  5FLQ A;  1G4O A;  2FW4 A;  2NXS A;  4KUY A;  3HKT A;  4RFD A;  5HPJ A;  1CNJ A;  3DCC A;  2CBE A;  1CNB A;  4M2R A;  4QY3 A;  1FLJ A;  4Q99 A;  2FOQ A;  1TEU X;  2FOS A;  4PXX A;  4K0Z A;  1XEG A;  2EU3 A;  4IDR X;  2X7S A;  4Z1E A;  3RYV B;  4LU3 A; 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