3KN7A

Crystal structure of haemophilus influenzae y195a mutant holo ferric ion-binding protein a
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNAYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The role of vicinal tyrosine residues in the function of Haemophilus influenzae ferric binding protein A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
total genus 108
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn7A02
4RNSA 4KYSA 4QFNA 1II5A 3TQWA 3WAEA 1O63A 1YAEA 1LB9A 4KI0E 3ZKLA 2VHAA 1DSNA 2QMWA 2RKMA 5KDTA 2B65A 3OEMA 2OWTA 3FGSA 3PUVE 2OWSA 4NF4B 5EHSA 3C33A 3K02A 2V3TA 1M5BA 4KQPA 4G8HA 3Q25A 5DYHA 5CC2A 1ZKBA 2RC7A 3FV2A 1IUDA 2ZNUA 4EF1A 2ANJA 1MY2A 2OCUA 1Z7NE 4F3GA 3ECRA 4YKIA 5FTIA 3B6WA 4YB6A 1Y1ZA 2G29A 2FNCA 4BDLA 4U4XA 4QSDA 4YMAA 1SW5A 1MG1A 3VE1B 5K2YA 3TKDA 1MPCA 1BTJA 3UN6A 1B58A 1MDP1 3K2DA 2XXVA 4EUOA 3K01A 1VFDA 4R6KA 5TPAA 4YMBA 2DE2A 2I48A 2ONKE 3FXQA 5FHNA 1M5EA 1PBPA 2NUVA 3IR1A 4DCYA 2UVJA 1DTZA 4Q5TA 1LFGA 2Z22A 4OEUA 4E0XA 2Z8EA 1AOVA 3U94A 2F7AA 4P0GA 2AL4A 1LSTA 1FQBA 4Q30B 4G77A 2QRYA 4JB7A 1IXIA 2F6GA 3R7XA 3KBRA 3N6TA 3S9MC 3OMBA 1ZTYA 3T22A 5AA4A 3DP6A 2HQ0A 4KYDA 3HCQA 5JK4A 1EZOA 3SEXA 3QUJA 3S9LC 5KCJA 1MY0A 3GZGA 1OLCA 4BDMA 2E0SA 3MZBA 1I6QA 4DE8A 2H4IA 1B5IA 4O3CA 4NF5B 3B6QA 1B5HA 2XHDA 3FJMA 3I3VA 3MUQA 2ZYNA 1OMPA 2DXYA 3EN3A 3RT8A 1BLFA 4IY5A 4ZEFA 1LLSA 5LOMA 1GVCA 3RGYA 5CI5A 2UYFA 5H8HA 3L6HA 4F3SA 1PB8A 1DTGA 2REJA 1QUJA 4KCDA 1LBCA 3KG2A 1ZMGA 4C0RA 4ECFA 4GFRA 3SEUA 5KZTA 1SQYA 4R9FA 3FD3A 5AA2A 3WAFA 1XVYA 2CMOA 3QIMA 1N7WA 2ALUA 2QPQA 2I0BA 2XD3A 1FQDA 2XX9A 3PMWA 3RTFB 3TPAA 3W9VA 3T9HB 2PMSA 2Q88A 3FJGA 2Q89A 4RXLA 1MH4A 3KN7A 3MVXA 3OENA 4M4GA 4WXJA 4R9GA 2DWIA 5CBRA 5F1QA 4NF4A 3MC2A 4EF2A 1UTHB 4PE5B 4U2RA 4ELOA 4F22A 4MFIA 5AA1A 1LAHE 2XXQA 4RK9A 1D3KA 4OFLA 3Q28A 3DELB 2QSXA 3H6WA 1USYE 3UORA 4M1VA 3CVGA 1FCKA 1MPBA 4NE4A 4FJPA 4AB5A 3M3LA 4KCCA 1FTJA 3RPWA 1TWYA 4QSCA 4ZEDA 1ELJA 1B5JA 3KFMA 3CFXA 2QS3A 5H8QB 1VSOA 2VD2A 1Q1KA 1M5DA 2AL5A 3IL1B 1F9BA 1N0TA 3RY3A 3OSQA 5H8NB 2I49A 2RCAA 1ZBMA 3FVGA 1IEJA 5B7DA 3EHUA 3QAXA 3VLVA 2Q2CA 3PMVA 1J1NA 4OZ9A 2I4BA 4H67A 3TUSA 2YLNA 2Y7WA 2REGA 3DLNA 2H5YA 3DP8A 4JSOA 2RF1A 3S9EA 2PT1A 4P0IA 4G68C 2HCAA 3H6UA 1OVTA 4X48A 1URSA 2KLFA 4NWCA 3MP1A 3TCFA 1KWHA 2F36A 4RY1A 4Z0IA 2BJJX 3EHTA 4I8CA 4F39A 3TCHA 1B6HA 2UXAA 2CZLA 4THIA 4NF5A 1Y3PA 3LSWA 3N26A 1LGBC 1CB6A 5H8SA 4F1VA 4LQ5A 1OLAA 3V89B 1N3XA 4GL0A 1TFAA 1RKMA 3MAMA 4GXAA 3RUMA 4F19A 3O9PA 3TDJA 1IZ1A 3THIA 5HPQA 1QJMA 3CFLA 3TODA 3Q27A 4R2FA 4U23A 3PD9A 1Y4CA 4ZZEA 5CMKA 3PGFA 2XD2A 3I5OA 1HSJA 1MQJA 2AIXA 4ZEKA 4FEDA 4FIMA 4IO4A 1MY3A 1FTMA 4F2QA 1B7ZA 4FORA 2R6GE 2ZMBA 3IOVA 1RYOA 1D4NA 4NEDA 4KPTA 3SDFA 1D9YA 4YB5A 1BP5A 1JETA 2GHBA 4OFJA 4ZECA 2O84X 3IK6B 3IO4A 4R73A 1BKAA 4XXUA 1UTHA 1AMFA 2HXWA 2F35A 2UYEA 1JQFA 2Q9TA 2IA4A 4N07A 5I59B 2O6AA 1B2HA 2HZLA 4PQJA 3PUXE 4NWDA 3R6UA 3USDA 1TFDA 4IO3A 2Y7RA 3Q29A 1NNFA 4OERA 1NKXA 1URDA 5I56B 2R9JA 3CI8A 3KGCA 4WEPA 3MP8A 3LC8A 3G3FA 2I6EA 4MLVA 1M5FA 4QFPA 5H8QA 1N84A 5F7VA 1SD3A 3O2AA 2DVCA 4GWOA 3I6VA 2RCBA 3D4CA 3LR1A 3QYTA 4OEVA 5H8NA 3TMGA 2O7UA 2DXRA 1QUIA 2ZYKA 5TU0A 2DE3A 3FJ7A 2AYSA 3TQLA 3IOWA 1HSEA 2F8DA 4EXLA 1SYHA 2XX7A 3T9VA 1YPNA 4BDOA 1YTVA 4ZE9A 1QUKA 2FYIA 4EQ7A 1XC1A 4IGTA 1QKAA 2D3IA 1FTKA 1P1WA 3MBPA 2O1MA 1SW4A 4H65A 2ABHA 3VLUA 2DE4A 1OVBA 1FQAA 4POXA 1POTA 4XKNA 1USYH 2Q2AA 1QW0A 1Y20A 5B70A 2DYXA 3TFLA 1P99A 3IOTA 3SERA 3KZGA 4ZEIA 5JTYB 4DIGA 3C31A 1B7HA 1EZ9A 4JWXA 5DVJA 3M3FA 1NL5A 4RYAA 1A55A 3E13X 4ZE8A 1NMUA 2F7CA 4LATA 2HAVA 4YAHX 4F3BA 1SYIA 1A7LA 3HHFA 3O6GA 4IB2A 1MQIA 3C35A 1I6AA 4TLLB 3FZVA 2OZZA 1D9VA 1VE4A 1Q35A 4QFLA 3U8QA 5BWJA 4LP2B 3HHGA 3ONMA 2XXWA 3E4RA 1O7TA 4ONYA 3JV9A 1B40A 3P7IA 3TCGA 2GRVA 3QK6A 1XVXA 3MVWA 4GXSB 1O64A 1WVJA 1H43A 5JEIA 3E9XA 4R6HA 4I9DA 3KOSA 3KOTA 3H7MA 4K3FA 4DCXA 1I6BA 4GQOA 2YPNA 4Z7EA 1UQWA 1AL3A 3K00A 1FTOA 2X7QA 4RK2A 1MXVA 3CG3A 3RQTA 3G3GA 2DP8A 1TT1A 4YKJA 5I59A 5M2VA 5CRYA 4QF9A 1OQGA 1LAFE 4R75A 2XXUA 3H6TA 1POY1 1PBQA 4PP0A 2XXTA 3JYRA 5I56A 4JXIA 2F6PA 2HZKA 2V3QA 3MVYA 4ND9A 3FIRA 1QKBA 5CMCA 3BFTA 2OJTA 4IO5A 4TOZA 4BLAA 3OELA 4LZ5A 4R72A 1P1OA 1MXYA 1MXZA 1B3FA 3O29A 3V83A 4QRZA 1MXXA 5I2KB 1B3HA 3W15C 3ODBA 4FECA 4KHZE 3T93B 4X1DA 3TTLA 2ONRA 3IOUA 1YCJA 3KEIA 2DWJA 3VV5A 2O51A 2P2AA 4G68B 4EXKA 2GHAA 4MBPA 4O3AA 3SEVA 4TQUQ 1B7UA 3IB0A 4XKRA 2QMXA 1XHYA 2H9BA 4U21A 2VOZA 4GOTA 3IB2A 4LZ8A 4YKKA 4LQ2A 2ONSA 3LSLA 4OESA 5JTYA 3KSJA 1URGA 1FQEA 2QJEA 5I58B 1JEVA 4Q8RA 3UGWA 3PPNA 3DP4A 2NWJA 1M5CA 1R1NA 3Q26A 2DOJA 1EU8A 3DM0A 4H0WA 4H1XA 3T96B 2ESNA 2XXXA 2O68A 4OENA 1BIYA 3C34A 3PV0E 2OLBA 4NMYA 3TTNA 1ZIUA 3LSFB 4OQOA 4ZEBA 3LUYA 3U72A 4OXVA 3R26A 5K2XA 1LBBA 1H44A 1NNPA 4XTCQ 3TTKA 1GV8A 2O1LA 1PB7A 2V93A 3GBAA 3G3KA 4YU0A 4XKQA 4I62A 3RT6B 3G3IA 4TLMB 5FHOA 4XIGQ 1VR5A 4KD5A 2D21A 4MLQA 3L6GA 4ESXA 1N7XA 2A5SA 4C1TA 3TZAA 3K1NA 4U22A 4QHQA 3RNNA 1H45A 1ATGA 2WKYA 4PETA 2OBGA 4G8MA 2Q8JA 3ZSFA 3N94A 1A8FA 1MRPA 4R74A 4NF6B 3FXRA 5I57B 4FEBA 3N6UA 1SI0A 1P1QA 4FAJA 4U1ZA 5ITPA 4X1BA 5I84A 4OFOA 3G7WA 4RA1A 3G3JA 3OEKA 3O6IA 1SI1A 2F7BA 4H5FA 1LAGE 2QS2A 3FVKA 3PPPA 2X26A 3TELA 2GFEA 1N3WA 1MQDA 3UIFA 3B7DA 4G2ZA 1LAXA 3ILUB 2PT2A 4F29A 3EQ1A 4QFKA 3OO6A 2V25A 5DEXB 2VP1A 1Y1MA 2XX8A 1MPDA 4ESWA 3RN8A 2UVIA 4H8JA 1JW5A 1MM6A 2DWHA 1NH8A 3W9WA 3BBRA 5I2KA 2RC9A 3VVFA 3H6VA 4YB7A 1AH5A 2V3UA 3S2VA 1N04A 1B0LA 4HTGA 2PX1A 5IKBA 3S9NC 3HPIA 3KJ7A 1B9JA 1GGGA 5L8DA 3CG1A 3FVNA 3H3GA 3KN3A 1IXGA 4G68A 4H5GA 4YKPA 5ISUA 1HSLA 4OTEA 3MJNA 2VD3A 3TTRA 1B3LA 2R71A 1QULA 4MF3A 4ELPA 3MVZA 1LCTA 1B3GA 1B05A 2XXRA 3AXFA 3O28A 5I58A 1Y9UA 1R9QA 3PUYE 1FW0A 4WKMA 1B4HA 3JZJA 3H4ZA 3VFJA 4F31B 3TYHA 2HEUA 3A3CA 2B3BA 1H76A 1L5TA 2IEEA 3B6TA 2W7YA 2HAUA 4ZS9A 2VGQA 3K6VA 4P11A 5BUUA 4OWDA 2XXHA 1LB8A 1LFHA 3K1MA 3U92A 1MXWA 1MDQA 3MP6A 3CRBA 3HV1A 2LAOA 4N6PA 2YJPA 1B32A 3FASA 5L9OA 4N13A 2DS9A 4HCWA 2Y7PA 5L9SA 3MZ9A 3H03A 1A8EA 4RPNA 3OD7A 1P1UA 3A09A 3C4MA 3K6XA 1IXHA 3OOAA 1NH7A 4GVOA 4QSEA 4LUBA 2F5XA 3GLBA 5AE4A 1ZJLA 3UA8A 4LA9A 3HSTA 3PU5A 1PC3A 3FVOA 3LSXA 1IITA 5ICTA 4POWA 5CMBA 4C1UA 2I3VA 1ZU0A 2G93A 5CM6A 3CR9A 3PPRA 1UIVA 1B1HA 4NF6A 1DPPA 3U1OA 4GLIA 5I57A 1OIBA 4ISUA 2Z8DA 4ZDMA 3HN0A 4IO7A 5HBCA 3EF7A 1US5A 2E1SA 2ZXTA 3BFUA 5I2NB 1OQHA 4DXUA 2H98A 4OVJA 2H99A 1FQFA 3K0VA 5DEXA 4LONB 2XXPA 1AIVA 4YZZA 2DVZA 5IAIA 1SDXA 3CIJA 4X9TA 3QUFA 1WODA 4AB6A 1S50A 3PMXA 5FHMA 1SVXB 5AA3A 3A3UA 2I4CA 1JW1A 2RINA 3O6HA 3UP9A 1JVXA 1FTLA 1UTBB 1SW2A 4KYEA 3IJOB 2P1SA 1B46A 2O69A 4ELRA 5A5XB 3VXCA 2V84A 2DWAA 1XT8A 3IAZA 3CFZA 4ZZAA 1IXCA 3VVEA 1MY1A 5H8FB 3TTMA 3FUZA 2NOOA 3OO8A 3PUWE 3V8XB 3K6UA 4F2OA 5ICQA 4H8IA 4OHNA 3EPEA 3V5AA 3OSRA 3IB1A 1JEUA 1IQ7A 4MH5A 4IGRA 2THIA 4IY6A 4R6YA 2HFBA 5DTBA 3GXAA 3K1PA 3VLWA 2A5TB 3IJXB 4GF8A 2NXOA 4L17A 1A99A 4JBZA 5HM4B 4F1YA 4JSDA 1Y4TA 4PFYA 2XXYA 3C9HA 2PVUA 3OO9A 3RTWB 4E0WA 4NF8B 4F18A 5EYFA 3MZ1A 4YICA 4PFTA 3PPQA 3S4UA 5ELVA 3T9UA 3QSLA 1WDNA 3D4GA 2RC8A 4RPOA 3ZS6A 3CSGA 3PUZE 3GBBA 4UACA 4H6DA 1PDAA 2Z23A 1MXUA 2F78A 1GTKA 3LBSA 5J1DA 1SBPA 4FE8A 1UIUA 4JWYA 3SETA 5TP9B 4PFUA 2I58A 2XXIA 3OO7A 3RLFE 1P1NA 3VVDA 3N5LA 4NTLA 1TXFA 4GL8A 4JDFA 4LZ7A 1Y3NA 4ELQA 3MPKA 4DDDA 1B52A 5FTHA 4F3PA 1ANFA 1A40A 2GH9A 5CMMA 1VFEA 3ILTB 1JW4A 4PFWA 1B4ZA 1MM7A 3QXMA 5I2NA 1PB9A 1B51A 1MS7A 4FATA 4HW8A 3SESA 4EQBA 4BDRA 5AA2D 3UK4A 2FA7A 3FATA 3BKIB 1NNKA 5L9MA 5DVFA 3SKPA 4G4PA 4GIZA 2F34A 1MQGA 3IORA 2PBWA 4G8NA 1A54A 4Q0CA 4BDNA 3PD8A 3FV1A 4LVQA 4IO2A 3MQ9A 4GD5A 2DSFA 2PYYA 5KDTB 1NNTA 2P0SA 1T0KA 3VXBA 3MW0A 3TEPA 3K6WA 1UTBA 4EQ9A 2Y7IA 1B3EA 5A5XA 2F97A 1SW1A 5EHMA 2Y84A 4KFQA 2QL3A 5H8FA 4I1DA 3H06B 1LFIA 1Z7ME 1DOTA 4OETA 1S7YA 2O7IA 3KN8A 1NFTA 2X7PA 4KR5A 1B1XA 3U93A 1RYXA 4WEDA 1GR2A 1MY4A 3CSBA 3O97A 4EDPA 2I0CA 1MQHA 3ZKKA 3FXUA 1EH3A 4F1UA 1Y3QA 2A5TA 3IO6A 2DQVA 1QVSA 5TPAB 3T9XB 3G3HA 4IO6A 1JNFA 4HS7A 3T66A 5DVIA 4RJZA 4DXCA 1B0HA 5DT6A 4U1OA 2Z8FA 4BDQA 3KJTA 4NF8A 1JVYA 3EHSA 2Y7KA 1DPEA 1DMBA 2M8CA 1MH3A 1R6ZA 1US4A 4DZ1A 2ZYMA 3SEWA 1ZLQA 3VDFA 2QS1A 1XOCA 5AA4B 4GRKA 3K4UA 1CE2A 1S9TA 3C32A 4HCYA 2QS4A 1I69A 4XKPA 2ZNSA 1IIWA 1LCFA 2NVUB 1R9LA 5KCJB 3TAJA 1XS5A 2ZYOA 3IX1A 4DXBA 4UA8A 2D5WA 2UVGA 1N76A 3KSXA 4OYVA 3E3KA 4AQ4A 1H3DA 2OK2A 4DLDA 2I3WA 4JWOA 3M8UA 2H25A 1FQCA 5TP9A 4O3BA 3OXNA 3PPOA 2UVHA 4QFOA 4OMBA 2ZNTA 1EZPA 3C36A 3HO7A 5H8HB 5CBSA 2B3FA 3O66A 1PEBA 3MWBA 3M3KA 4U4SA 4R2BA 3SEYA 3MPLA 5AA2B 3F11A 5ITOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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