3KN7A

Crystal structure of haemophilus influenzae y195a mutant holo ferric ion-binding protein a
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNAYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The role of vicinal tyrosine residues in the function of Haemophilus influenzae ferric binding protein A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
total genus 108
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn7A02
1HSLA 4LP2B 1DMBA 3WAFA 2GH9A 2Y7WA 3A3UA 4OFOA 4YZZA 2Q89A 1GR2A 4X9TA 1ZIUA 1A99A 4IO2A 4YKKA 4ZEIA 1MM6A 1ZKBA 4KCCA 4LQ2A 2OWTA 2DWAA 3MP1A 3CSBA 5I2KB 3K6WA 4PP0A 5FTIA 1QKAA 2FNCA 5I2NB 3HV1A 4F1YA 3MW0A 4NWDA 3W15C 3PMXA 1DTZA 3IOUA 1Z7ME 3HHFA 4YKIA 1FQFA 1B2HA 2HXWA 4FIMA 3Q26A 3D4GA 3QUFA 1TFAA 4OXVA 3HN0A 2UVIA 1P99A 2F36A 3EHSA 4OEUA 3JYRA 1H43A 1VFEA 1BP5A 1IIWA 4KHZE 4H67A 2I48A 5DT6A 5B70A 2XD2A 1XC1A 2AL5A 3T96B 1FQAA 3B6QA 1CE2A 1J1NA 4IGRA 1HSJA 4BDOA 3C33A 3KJTA 4KYSA 2ESNA 3OO7A 4DLDA 1PB8A 3RUMA 2QMXA 4GQOA 1I69A 1N76A 3IB2A 1SI0A 3OEMA 3TTNA 4G4PA 4KYDA 2F97A 2NUVA 4F3PA 2YLNA 5ELVA 5H8HA 3TCHA 4GF8A 2OCUA 4ZZEA 1LFIA 2PX1A 2H98A 2O84X 5ICTA 5H8FB 5LOMA 5IKBA 4N13A 1LAGE 3MC2A 4IGTA 1MXXA 3BBRA 4G68A 3OSRA 2Y7KA 2XXXA 5H8QB 5DVFA 3C32A 3N5LA 3USDA 3GLBA 1NNFA 1A55A 1SBPA 3PUVE 3E9XA 2F7AA 3PPOA 4ZE8A 1XS5A 3LUYA 3FJ7A 4QFKA 4WXJA 5I57A 4OETA 1MM7A 1OQHA 3UA8A 3C31A 3IORA 1SQYA 2QRYA 3SDFA 4O3BA 3LSWA 4DIGA 2PMSA 3KBRA 2O68A 4RPOA 3FJGA 4HTGA 2DXRA 2KLFA 2I3WA 1PC3A 1WODA 4H5FA 4U23A 2QL3A 3KZGA 1B40A 3WAEA 1EZOA 3OO6A 1B7ZA 4OWDA 4XKRA 1P1UA 3O6IA 5H8NA 1MQHA 3CSGA 5CMKA 1Y3PA 2HCAA 1MH3A 3PPNA 3RQTA 4EF1A 1GV8A 4C1UA 1B0LA 3UP9A 3PPPA 1LSTA 1D9YA 2P1SA 3IL1B 3K4UA 1Y3QA 4YU0A 1LB9A 4R6HA 3KN8A 1NH7A 3EHTA 4NTLA 3VE1B 4GXSB 4NF4A 1POTA 3IX1A 2DE4A 4NF5A 3MUQA 4HCYA 3KEIA 3MPLA 3IAZA 4R2BA 1A7LA 3K01A 4BDNA 1MY0A 1PBPA 3IOTA 3VVDA 2RKMA 3V5AA 4C0RA 3K1MA 2Y84A 1LAHE 5JK4A 1MRPA 1IITA 3W9WA 2YPNA 1Y3NA 5TPAB 3MZBA 4EDPA 3IOWA 1MQDA 3CIJA 3ZKKA 1PB9A 3A3CA 3C9HA 1B5JA 1FQEA 2HAVA 4OERA 2ZYMA 3T22A 3TCGA 5I84A 3ONMA 3U92A 3OMBA 1F9BA 1UQWA 4ZEKA 1SW4A 3PMVA 1ZJLA 5JEIA 4L17A 4F1VA 5FTHA 3SKPA 2ABHA 4GL0A 3KSJA 5CI5A 1IQ7A 1LAFE 4RXLA 1A8FA 4G68C 5J1DA 4NWCA 4NF6A 1B46A 3ZKLA 3IB1A 4QHQA 2DP8A 4TLMB 1EZ9A 4EF2A 1RYXA 4FE8A 3RNNA 4PFWA 4MLVA 4IO4A 4LQ5A 4NMYA 5EHMA 3HPIA 4GIZA 3MZ1A 1MY4A 2DOJA 3PPQA 2UVGA 3OELA 1ELJA 4H8IA 3T9VA 3H6WA 3THIA 5KZTA 2RF1A 1B6HA 3IK6B 4OTEA 1A54A 2PBWA 2DSFA 4JXIA 2O69A 4DXCA 2GRVA 3FUZA 1MG1A 2Q2AA 4G2ZA 1B4ZA 2FA7A 3CVGA 3E4RA 2V84A 4Z7EA 3EF7A 3Q25A 3LSXA 1MPBA 4RY1A 1D3KA 1VR5A 2O1LA 4EXKA 4AQ4A 1MDP1 2PT2A 1N7WA 3K0VA 4THIA 3LBSA 2DQVA 4JWXA 4HW8A 2HAUA 4QSCA 3IO4A 1SVXB 3GXAA 1I6QA 3BFTA 4GLIA 3SEWA 4PQJA 4JSDA 1UIVA 3KFMA 5TP9B 4FEBA 2F7BA 4DCYA 3PD8A 5KCJB 2Y7IA 4R74A 2XXRA 3FV1A 3HCQA 2XX8A 1NNKA 1YTVA 1LBCA 1A8EA 5I58B 1Y1ZA 2PYYA 1P1NA 2F7CA 3AXFA 1DSNA 1BIYA 4GD5A 1R9LA 2H9BA 4RA1A 3SESA 3EPEA 4LZ7A 4R72A 1UIUA 3C4MA 3MVWA 4DDDA 4WEDA 2HFBA 1H44A 4I62A 4EXLA 1B7UA 1ATGA 5I56B 1I6BA 2A5SA 2V93A 1QUKA 4OMBA 3PUWE 5A5XB 4GOTA 4PFUA 2DWIA 4KI0E 1S50A 4ZEDA 3ILUB 1N7XA 5FHOA 2REJA 1SI1A 5JTYA 2XX7A 4RK9A 4H1XA 1TFDA 4O3CA 4F3SA 3IO6A 2W7YA 4OFLA 5EHSA 3KOSA 1DOTA 3DP4A 5CM6A 3LC8A 2NWJA 3DP6A 3VXBA 4QFPA 2QMWA 3TZAA 4F18A 1WDNA 2DYXA 3TAJA 2UYFA 3O66A 3MP6A 4R2FA 2NVUB 4Q30B 4YB6A 2QS3A 5H8NB 2O1MA 4R6YA 2Z23A 1MPDA 3RN8A 1B32A 2O51A 4NEDA 3LR1A 4TOZA 2UVHA 4E0WA 2ZYKA 2D3IA 1JVYA 3FD3A 4GFRA 2UVJA 1JQFA 3KN3A 5AA2B 4YB5A 3F11A 4F3GA 4O3AA 4ZECA 3TKDA 1VSOA 1A40A 3O28A 4IO6A 4UA8A 2THIA 2BJJX 2DS9A 2VGQA 1OIBA 4F22A 2XD3A 3ZS6A 4QFNA 2O7IA 1BLFA 4G8MA 2Z8EA 3G3GA 3N6TA 1Y9UA 3HHGA 4I1DA 3T9UA 5CMCA 1QUJA 3VVEA 5ISUA 2X7QA 2NXOA 2ANJA 4LONB 3FATA 2QS4A 1US4A 1S9TA 3EN3A 4ELRA 2B3BA 2Q9TA 3V89B 1N3XA 1POY1 4YKPA 1LCTA 2REGA 1DPEA 2E0SA 2DVCA 1MXWA 1UTBB 3T9HB 5CBSA 3TFLA 3C34A 4BDLA 4RK2A 5AA1A 2UYEA 4X1DA 3RT8A 1FTKA 4IO3A 4PETA 3H4ZA 3RTFB 3A09A 2OLBA 1OVTA 3H6TA 4XIGQ 4F39A 2UXAA 4F3BA 1QKBA 2P0SA 2XXHA 3TTLA 3R26A 3TUSA 3LSLA 3U94A 3H06B 4QFOA 5K2YA 1IXHA 4ISUA 4IY5A 2GHAA 3FVOA 1B5IA 3MVZA 4H65A 1Z7NE 5AA4A 5TU0A 1MH4A 3KOTA 1MXYA 4U4XA 4P11A 3K1NA 1N0TA 2VHAA 1GGGA 3UN6A 3EHUA 1PB7A 1L5TA 5CMMA 3G3KA 3S9MC 2RCBA 4F2QA 2OJTA 4OENA 2Q8JA 1M5EA 5AA2D 4N07A 2QJEA 2R71A 1Y20A 3FIRA 1JNFA 1WVJA 3TCFA 3MAMA 1EZPA 4GWOA 3O9PA 2QSXA 3I3VA 2XHDA 4HCWA 1B4HA 3PU5A 1P1WA 1H3DA 5CMBA 3VXCA 3N26A 3O29A 3PGFA 3ILTB 4Z0IA 5F7VA 3VFJA 5I2NA 5AE4A 1B3HA 1FW0A 1QW0A 2XXIA 1YPNA 4NF8A 3U1OA 1B1HA 4GXAA 3U8QA 2OZZA 1LFGA 2F6GA 1R9QA 1M5CA 3FXRA 3W9VA 4TLLB 4LVQA 3SEYA 3S4UA 4POWA 3G3JA 3S9LC 2RC9A 2A5TB 4KQPA 3SERA 3MBPA 2F34A 1NNTA 1QVSA 2ALUA 2H25A 1Q1KA 1I6AA 1B5HA 1AMFA 1BKAA 1M5DA 3Q29A 1QULA 2HEUA 1SW5A 4MF3A 4OQOA 1B58A 2DWHA 2F8DA 2V3UA 1XT8A 1II5A 4R73A 1KWHA 2I4BA 3FXUA 5KDTB 3M3KA 4FEDA 1ZBMA 3VLVA 1Y1MA 1B1XA 2XXWA 2D21A 4ZEFA 2QS1A 4G8HA 3VV5A 4WKMA 3MVYA 2XXUA 3IJXB 3SETA 4IO5A 3RLFE 2VD3A 2Z8DA 1JW1A 3TDJA 5CBRA 1EH3A 4PE5B 5K2XA 4U21A 4F31B 3FVGA 2QS2A 5H8QA 1T0KA 3TTKA 3FVKA 3TPAA 1B9JA 3T66A 3O97A 4PFTA 3H6VA 1B3EA 2XXTA 1CB6A 1MXUA 5B7DA 2RC8A 4XKNA 3EQ1A 3PMWA 3DLNA 3FV2A 1LB8A 4RYAA 4YB7A 3OOAA 1OVBA 4LATA 1NFTA 3CFZA 4OZ9A 5DEXA 3K00A 1D9VA 3B6WA 1MY1A 4ELQA 2NOOA 1FTOA 1FTJA 2V25A 3FVNA 4F19A 2RCAA 4KR5A 3QXMA 4U4SA 3TTMA 4DXBA 1URGA 3VDFA 1TXFA 4ZS9A 2B3FA 2ZNSA 1D4NA 4FAJA 3TODA 3DM0A 4EUOA 1B52A 3TTRA 3ECRA 2OK2A 2PT1A 2XXYA 1AH5A 3RTWB 3QIMA 1O7TA 2I6EA 3E3KA 1S7YA 5H8HB 4H8JA 1QUIA 3N6UA 1VFDA 4HS7A 3QYTA 4ESXA 1XVYA 3G3HA 4ESWA 2YJPA 3T9XB 4G68B 4IB2A 2ZMBA 4KD5A 3L6GA 4YKJA 4G77A 3B6TA 1LCFA 4FJPA 3CFLA 4IY6A 4KYEA 1DTGA 2OBGA 3UORA 3H7MA 3JZJA 4TQUQ 3TMGA 4R75A 1URDA 5TPAA 3SEXA 2VP1A 2ZNTA 5FHNA 2R6GE 4RJZA 5ITOA 5I57B 1IUDA 3OO8A 3Q28A 5DTBA 3RGYA 5HPQA 1PDAA 4ZE9A 4DXUA 1MY3A 1MPCA 5ITPA 2ONRA 4XKQA 3PPRA 4EQBA 1TT1A 4U1ZA 3S2VA 1YAEA 3LSFB 4MFIA 1ZMGA 4OVJA 4C1TA 1USYH 2I4CA 4JBZA 4EQ9A 2I0BA 4JB7A 3H3GA 4Q8RA 1FQCA 3FJMA 4ZDMA 1IXCA 3K6VA 3R6UA 3TQWA 3SEUA 2XXPA 1FCKA 2DVZA 2Z8FA 1R1NA 2ZNUA 4I8CA 2G93A 2XXVA 3Q27A 2G29A 1LFHA 2E1SA 1RYOA 1XVXA 3T93B 4BDRA 1Y4CA 2HZKA 3V8XB 4QFLA 5F1QA 4NF4B 4NF8B 4NF5B 4H0WA 1O64A 2F6PA 3K2DA 2ZYNA 4QF9A 4FECA 3K6XA 3FZVA 2H5YA 4H6DA 1R6ZA 3H6UA 1MQJA 3O6HA 2AL4A 1IZ1A 1MY2A 4F2OA 3OD7A 2RC7A 3PV0E 1SYIA 3I6VA 2B65A 2V3QA 2Q88A 3RPWA 3C35A 5BWJA 1SDXA 5IAIA 1P1QA 1GVCA 1NKXA 3GZGA 4BDMA 4I9DA 1SD3A 4E0XA 1UTHA 4RNSA 2OWSA 4RPNA 4IO7A 3I5OA 5CRYA 5TP9A 1H76A 2CZLA 1LBBA 4XKPA 4NF6B 5ICQA 3TEPA 5KCJA 3RT6B 3GBBA 4ECFA 2DXYA 3OO9A 4AB6A 3CR9A 4KPTA 1IXIA 2DWJA 5I58A 3MVXA 3L6HA 3N94A 1N04A 1XHYA 1HSEA 1B0HA 4LZ5A 4YICA 2H4IA 2O7UA 2IA4A 2X7PA 1M5FA 3KN7A 4R6KA 1SYHA 3VVFA 3QAXA 5L9MA 5I59A 1MQIA 4R9FA 5I56A 3OXNA 1OMPA 3CG1A 5A5XA 1JVXA 1NH8A 4LZ8A 1AIVA 2DE2A 4R9GA 3FGSA 4OHNA 3U72A 1US5A 3B7DA 2Z22A 3V83A 1JEVA 1MXZA 4XXUA 1FQDA 1SW2A 3UK4A 3IOVA 5DEXB 2HZLA 4JWYA 1B3LA 2F78A 1TWYA 3E13X 3M8UA 1IXGA 4POXA 1O63A 3SEVA 4OYVA 1N84A 3UGWA 5FHMA 1B51A 5I2KA 5L8DA 4ONYA 1B3GA 4ELOA 2XX9A 4P0GA 3RY3A 3PUXE 3HSTA 2I49A 3MWBA 4G8NA 1EU8A 4ZEBA 2ZYOA 1FTMA 3BFUA 3G3FA 3OSQA 3TELA 3H03A 3GBAA 3MP8A 4MH5A 4WEPA 5AA2A 4FORA 4H5GA 4YMAA 1H45A 4MBPA 3TYHA 2FYIA 3TQLA 1BTJA 3CG3A 2H99A 1LGBC 1PEBA 1OLCA 3DELB 3DP8A 3KG2A 4OEVA 4LUBA 3MPKA 3M3FA 3ZSFA 1USYE 1B3FA 4OFJA 3PUYE 1B05A 3PUZE 5HBCA 2Y7PA 4P0IA 3IJOB 3G7WA 5M2VA 1MS7A 4Q0CA 1RKMA 5JTYB 2LAOA 2ONKE 1XOCA 1UTBA 5AA3A 2GHBA 3O6GA 5CC2A 4PFYA 2D5WA 4LA9A 1MXVA 4GL8A 1URSA 1MQGA 3S9NC 1P1OA 4ND9A 1DPPA 5H8FA 4GRKA 1NNPA 3IB0A 3KGCA 2Q2CA 3VLUA 4ELPA 4DE8A 4U1OA 2AYSA 3QK6A 1JEUA 3BKIB 3ODBA 4GVOA 1JW4A 4U22A 1ZU0A 4U2RA 4M1VA 4QSEA 3HO7A 3P7IA 4F29A 1FTLA 3S9EA 4ZZAA 2ZXTA 3IR1A 4EQ7A 4YMBA 1M5BA 1SW1A 3OENA 1FQBA 3G3IA 5H8SA 4JDFA 1ANFA 3UIFA 5DVIA 4JWOA 2VOZA 1YCJA 1MDQA 1NMUA 2QPQA 2VD2A 3R7XA 3M3LA 4X48A 1N3WA 2I3VA 2P2AA 3C36A 1ZTYA 3PD9A 1GTKA 3K1PA 4KCDA 2R9JA 2O6AA 3JV9A 4QRZA 3U93A 4JSOA 4N6PA 3QUJA 4X1BA 2Y7RA 3MJNA 2F35A 3KSXA 4MLQA 1AOVA 4DZ1A 1AL3A 4Q5TA 2IEEA 2AIXA 2V3TA 1UTHB 2WKYA 1LLSA 3CI8A 1B7HA 2HQ0A 1QJMA 3D4CA 3FXQA 5L9OA 3CFXA 1OLAA 3VLWA 4KFQA 2F5XA 4BDQA 1JETA 3KJ7A 1IEJA 2X26A 1LAXA 2DE3A 3K02A 2CMOA 5EYFA 2GFEA 2I0CA 4UACA 4XTCQ 1Q35A 1PBQA 3QSLA 5L9SA 2RINA 2PVUA 1JW5A 4AB5A 3FASA 4M4GA 3OEKA 3O2AA 3MQ9A 2A5TA 4FATA 5AA4B 2I58A 5BUUA 4YAHX 5I59B 5DYHA 1VE4A 4F1UA 4BLAA 4QSDA 1OQGA 5DVJA 1ZLQA 2XXQA 1Y4TA 1NL5A 4DCXA 2M8CA 3K6UA 5HM4B 4OESA 2ONSA 3MZ9A 4NE4A 5KDTA 4K3FA 3CRBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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