3L00 | Genus

Total Genus 47

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	47
sequence length	175
structure length	156
Chain Sequence	CEMKRTTLDSPLGKLELSGCEQGLHEIIFLGGGPEPLMQATAWLNAYFHQPEAIEEFPVPALHHPVFQQESFTRQVLWKLLKVVKFGEVISYSHLAALAGNPAATAAVKTALSGNPVPILIPHRVVQGDLDVGGYEGGLAVKEWLLAHEGHRLGKR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
publication title	SNAP-tag structure rcsb
molecule keywords	SNAP-tag
total genus	47
structure length	156
sequence length	175
ec nomenclature	ec 2.1.1.63: Methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase.
pdb deposition date	2009-12-09

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain	3l00A02
3.30.160.70	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Double Stranded RNA Binding Domain	Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase domain	3l00A01

1YW9A 2A3SA 1R36A 1K78B 5BQTA 3I4PA 3ECOA 1JE8A 5H6RA 1LDDA 2HQNA 2HFHA 5KVRA 3ZQ7A 1SFXA 3IWZA 1O3TA 1U8RA 2LF8A 3PQJA 2M5WA 2LKPA 1MJAA 2P4WA 2JSCA 4ENMA 3U2RA 2O03A 3I53A 5D8LB 1RI7A 4K2EA 2FQ3A 4EJWA 3DPTA 2EA4A 1YTYA 2FA5A 4MEXF 4NHJA 4A2UA 4EVIA 1E17A 2OZUA 4R8HA 2WC2A 5FD5A 1XN7A 2K7LA 3SFZA 1G6NA 2CW0F 2QYOA 3K9TA 4HZFA 4L0YB 5HDNA 5DCMA 4CXFA 2PJPA 1USSA 4L9JA 3DV8A 1FYMA 4LK1F 2EA2A 1EH6A 4CHUA 1KYZA 3LQQA 2LSOA 5D8KB 1XDSA 4AIJA 4OMZA 3RDIA 3EQLF 2O0YA 2GWRA 2MC3A 3WTUC 3MFKA 2L3DA 2OU2A 4BYYA 2XHKA 5FD6A 4OIQF 4XSXF 3T8TA 5JFRA 1AOYA 2CSOA 1X3UA 3TO7A 1DPRA 3HTSB 2FNPA 2GAUA 3E6MA 1HKQA 3Q5FA 2BE5F 3QAHA 5L3GA 4BAYA 1S3JA 2YX4A 3O2PE 4TV7A 4MTEA 3GZ5A 1G3TA 1ZYRF 2H6CA 1FBQA 4HX4A 2ZNYA 4CGZA 4CZZA 1IN4A 5HOOA 4OIOF 4HAMA 5IT3A 5D6EA 1J9IA 2XGXA 1REPC 2HKOA 4UV9A 1FSHA 1R5GA 4U7BA 2ZMEA 2FXAA 4HA8A 3KEQA 1MD0A 4G94A 4F7ZA 1FNNA 2FMLA 1XCVA 2Y75A 4KMFA 5CLSA 2HR3A 2HQRA 2RGVA 1LDKB 5LGUA 1WWXA 3E6BA 4BNCA 1TNSA 3BP8A 5CVJA 5DUKA 2CWEA 1J59A 4R1HA 3CUOA 2HTSA 5DCFA 3F6OA 5J8FA 4EGYA 3F8BA 1R22A 5DEQA 3QPTA 2VODA 5KK1A 4YG2F 1PUEE 4ETSA 4GYGA 1AWCA 2M45A 3I59A 2GXBA 3GFIA 3K0LA 3L2CA 3T1BA 1SFUA 1FBSA 1R23A 3V7RA 4KT5C 3QOPA 4XSZF 3HTUA 4LD5A 5JI6A 3MZHA 4LMYA 1CF7B 4WXHA 3VODA 1J2XA 4CYDA 3WTSC 3M7GA 5LGTA 3WGGA 2FBHA 4LGWA 4PGHA 4WF2A 1VTNC 3KEOA 4UNOA 2MLKA 4G7HF 4KN4X 4WXDA 1OMIA 4M74A 1LEAA 3I58A 3D5LA 3HSEA 1T39A 3BWGA 4O5VA 4N9HA 2VC1A 4UV8A 2VE8A 2IVMA 4IRHA 2FF4A 2FU4A 3M1EA 4M9SA 5TJJA 2BGCA 1ZH5A 4HQMA 1O3RA 2FEZA 1JGSA 1D8JA 4Y15A 2ZCWA 2QQAA 5ILUA 4XLPF 1D8KA 2Y0MA 2FBIA 3QPHA 2DK8A 1RZ4A 1I1GA 3WTWC 5D6FA 1S7AA 1J75A 2EJRA 3FX3A 2V1UA 3GZ6A 5CVIA 1YS7A 4Y13A 5JHUA 2DU9A 3REOA 1H0MA 1JXSA 1MDMB 2M30A 4RB0A 1Q1HA 4LG0A 1O3SA 1L3LA 2PQ8A 3RTRA 3QRFF 2R7DA 3FM5A 4L9VA 4EGZA 3DPLC 4L18B 2OA4A 4LJZF 4EJUA 3KCCA 1KYWA 2RN7A 5LEKA 4P55A 3WU0A 5ICCA 1DPUA 4ESBA 1U5TB 2ISZA 2HKXA 2A07F 1BOAA 1RUOA 1GHCA 1I1SA 1W7PA 2EFNA 3M9AA 2QM3A 1V4RA 2VT3A 1J5YA 5DD4A 1ZGAA 4Q48A 4S04A 4LFUA 1ZRFA 3KP4A 2V1XA 1UFMA 3GWZA 3EETA 5LHHA 4IF4A 3K1MA 2H27A 5JR3A 3BPXA 2HDCA 4EQQA 3R60A 4KIGA 1KU9A 2YPRA 4GO1A 1SFEA 3U9GA 2HZTA 1MJBA 3JSPA 3G3ZA 3L7WA 4A0YA 1H9GA 1WI9A 2MBFA 1R00A 2QWWA 3MZYA 4G6QA 1B59A 4LLNA 2ZXJA 1Z9CA 4RB2C 2XAJA 2TDXA 4PDKA 1YW8A 2HTJA 4Z2YA 4EJVA 4ENJA 3L9FA 3B73A 3DXJF 4KDPA 4AWXB 4DNCA 1U2WA 4HQEA 2L01A 1ZREA 1QPMA 1BI3A 2A5YB 3P7NA 3KLOA 4HBLA 3WTTC 2RV8A 3WTXC 3HOTA 2H94A 1T6SA 3CUQA 1DP7P 1S29A 3LFKA 1ZRDA 2YSRA 1LVAA 1IN8A 2OQGA 1OYWA 3LA3A 2OQRA 1HSTA 4N9IA 1KU3A 3IKTA 4L5JA 3ZMVA 2RVCA 3FMSA 3PQKA 3I0TA 2P8TA 2RKHA 4U88A 1EH8A 1B1BA 1O3QA 4A5MA 1KA8A 1T2KA 1BI0A 2HS5A 5CVRA 3RPQA 3V7SA 4I2OA 2IRFG 1KGSA 5ILVA 2W57A 4A12A 1O57A 3GVAA 2VXZA 2NYXA 5L3FA 2YX7A 5FFXA 3ECHA 2JPCA 3KP6A 1USTA 3KP2A 1YG2A 2VC0A 2VONA 4JK1X 3TQNA 3ZP5A 1TW2A 3BJAA 2XAFA 3J80K 2DFIA 1ON1A 1ZG3A 2BV6A 3HIFA 3GO5A 3J80Z 1TW3A 3ML6A 5ICGA 3DFGA 1WSUA 4B09A 2ZMEB 3ZMUA 1TLHB 2D1HA 2GA2A 4Q5SF 2HOEA 3IL2A 1FY7A 3VOEA 1FWZA 1H9TA 5FGMA 4G7ZF 4WWCA 2LF7A 3ISPA 3IRRA 1R58A 2E1CA 3N4MA 5HS9A 1R1TA 3RKXA 1B4AA 2RC4A 3ZMSA 3TO6A 4HLXA 4HLYA 5FLXK 4A0XA 3TOAA 4I02A 2QBYA 2WTEA 3GX4X 3QU3A 3NQOA 1P2FA 4IHTA 1S7OA 5FLXZ 4HF1A 2PBIA 1R1VA 1QQIA 1ULYA 3EDPA 1C0WA 5LGNA 4HDVA 4PZJA 1IXCA 2KIUA 2STTA 4OIPF 4ZZDA 2W84A 2XROA 3GF2A 2GXGA 3GLXA 2O8XA 4ENNA 2FMYA 4KICA 4G7OF 4WCGA 3GFMA 3GFJA 2ZNZA 2R3SA 1LJ9A 2XAGA 1Z6TA 1P6RA 2P6SA 2Q0OA 1XGOA 1MGTA 4FHTA 4KIFA 5DDGA 4CO8A 2DQRA 3H92A 2UXXA 5L3EA 3ERED 4UVBA 3RYPA 5D5UB 1ONVA 4RGRA 2ZFWA 4DQ2A 2G9WA 1Z05A 1B9MA 3DKWA 4FT8A 1DDNA 1PDNC 4ZYEA 3H3UA 2D1VA 4BHPA 3D0SA 3WG9A 3V8KA 4A6DA 2E1NA 1MZBA 3KP7A 3WE2A 2HGCA 1Z6RA 3MCZA 1ZN2A 3KZYA 1BN5A 4KIBA 2ADUA 2PMUA 3U1DA 1W4MA 4RB3C 3CO6C 1QBJA 3BOQA 1OYYA 5CVUA 1P92A 1YS6A 1ZAOA 3VEPA 4I09A 3OV8A 2XUBA 3HRSA 5F64A 1IXRC 4KYWA 4YFKF 1FSEA 3LWFA 3ROUA 2Z5UA 3V4GA 2IP2A 1QZZA 1K78A 1SD5A 4FX0A 4LG0B 4MNUA 3V8LA 1EH7A 1EV7A 2QVOA 1T0FA 4HYEA 1R5HA 1Z91A 2DW4A 3RYRA 1FOKA 4A0ZA 2VT2A 5BPDA 1U5TC 1FZPB 4D0PA 1SAXA 1XSXA 4M73A 3ZN1A 3S2WA 2DK5A 1LEBA 2IA1A 4BH9A 1WKMA 4ZZLA 3KFWX 3F8MA 1IN6A 4EV0A 3O6BB 4GYIA 1JHHA 1BI2A 5AIQA 2EFQA 1P4XA 4EM1A 1ZARA 4IJAA 4YFNF 3H3ZA 1BC8C 2UXNA 3CJNA 2K4BA 3GYHX 4ESFA 1GXPA 5J6XA 3B02A 4NQWA 3GFLA 2K4JA 5AONA 1XSDA 2F2EA 2UZKA 1MKMA 4I01A 3T8RA 3SZPA 2EV5A 1IW7F 1WRJA 5D4RA 1Z7UA 2FOKA 4I0BA 2JTVA 2QQBA 1OYIA 2G7UA 1FX7A 2PMHA 2PG4A 2XKPA 5BPIA 1SMTA 4A6EA 5H6QA 1HXDA 1SD7A 3BY6A 4Y17A 2CYYA 1XSVA 5EEGA 1TNTA 3TDUC 1IN7A 3WTVC 5LHGA 3I5UA 2BEOA 3V8JA 1PP7U 4HX8A 2A68F 5K5QA 1F9NA 2XAQA 2LDUA 2QLZA 2KJCA 3F22A 3NEUA 4WX9A 1J0RA 3FMQA 2RDPA 3W6JB 4RB1A 1IXSB 1IAWA 3WU1B 1I6XA 1GVJA 3TOBA 1LQ1A 2EK5A 2ESNA 3E6DA 3MAJA 1QGPA 3ABUA 4HV5A 3WGHA 2X0LA 5D5XB 4M72A 4G6DA 4HF2A 3VB2A 3ZMDA 3FHZA 2VE9A 4HDUA 4GXOA 2Z9OA 2F5CA 3KP3A 2AXLA 5FFZA 1FT9A 1I5ZA 3C18A 2NNNA 4BHBA 1D5VA 1CF7A 1KQ0A 1I27A 3KP5A 1F4KA 2FBKA 2P5LC 4EM0B 2PEXA 4JBAA 1ZRCA 1ON2A 5HDGA 4IXAA 3KZZA 5LRRA 2PN6A 2K27A 4BXUA 3E5QA 1UHWA 3F3XA 1DUXC 4PGGA 4CDGA 4M9XA 4QWQA 1YQAA 4M9ZA 4MGRA 2R7FA 3FF5A 4JQFA 5K5RA 5E1ZB 5BMZA 3C7JA 3RJPA 2VBWA 5DD8A 5CVVA 4MTDA 1YLFA 2STWA 2XKOA 2ACJA 2FRHA 2DPUA 3Q9VA 3DEUA 2F5EA 4P9UA 3HRMA 4PCQA 4KUMA 1K6OA 3JW4A 5K1YA 4ZYGA 1IRGA 5H20A 3TGNA 1L0OC 1MDMA 3VFZA 3OOPA 3GEZA 2NS0A 2E7XA 4RGSA 3E5UA 4GGGA 3K1NA 5DCMB 2ESHA 3HHHA 4EMSA 4ESJA 5E18F 2ZO4A 1RUNA 4LB6B 4AIKA 5J8CA 1ZLJA 2VBYA 5D4SA 1XGSA 1XGMA 2ZKZA 3E5XA 5FB2A 2FNAA 1XGNA 4LLLA 4UHTA 5EEHA 2A6EF 2COMA 1WQ2A 3G73A 2DAOA 5ERIA 3Q9SA 3BROA 1P4WA 1BM9A 3IKVA 5A2QK 2XVCA 2Z33A 3ULQB 3M8EA 2D2WA 1QZYA 1S8NA 4YIIA 4EJOA 1BC7C 2CQKA 2X4HA 4M71A 4KNYA 2P7VB 1B6AA 1UCRA 2CO5A 4U0VA 3L00A 1SD4A 2ZBKA 2JRTA 3R6SA 2DTRA 1YW7A 2IW5A 4BHCA 4KA4A 4RGXA 2V6CA 4E70A 2MD5A 4G8XA 4WK8F 1RNLA 2L4AA 2PFBA 3CDHA 1NHAA 1KQ9A 1XCBA 2FE3A 4UUVA 2L02A 1UHMA 5E17F 1XD7A 1G4DA 2MLGA 5L3BA 4U0WA 1CGPA 5LRSA 2KRFA 5L3DA 3MWMA 1FYLA 3R0AA 2MH9A 4EM2A 1YFHA 2OZ6A 2JZYA 5E8GA 1RIOH 1PP8F 1O7FA 2MA3A 3F8CA 1V3FA 3RIRA 1G3SA 2V79A 5HLIA 3IWFA 3GUDA 2GIVA 3ZMZA 2XV4S 1A04A 2E7WA 2M1BA 4L9TA 3ZN0A 3I59B 2C6YA 1W5TA 2AS5F 5TRDA 1TQMA 4IVNA 4QLCU 2Q8KA 2PLYA 5LLQA 3SZTA 3W6KB 2WV0A 1BIBA 4AIHA 3TO9A 3P9IA 2NRAC 1U3EM 2KIMA 1KU2A 3K69A 4ASNA 4HX7A 1XDUA 1FC3A 1LB2A 2Z3YA 3F8FA 4ON0A 1OKRA 3JTHA 3KLNA 2M8EA 4HW0A 1E2XA 1GXQA 2A6HF 1QNTA 3NRVA 4GCVA 3JAMK 5BOXA 5HS8A 2P5VA 2H6BA 5HVQC 3RI4A 2ZJ2A 3DQVC 5E1WA 5F1RA 1UB9A 1IF1A 3JAMZ 1P4AA 3LSTA 3JSOA 2QENA 3DF8A 2OD5A 1G3YA 5AIPA 1HW2A 4ENKA 5ICEA 3TKYA 1TQIA 2G7HA 2V9VA 4OINF 3COAC 3WTZA 3K1PA 2OAZA 3FZVA 3QP6A 4HOBA 1R1UA 1ZHFA 4U7DA 3MEXA 5LHIA 3BDDA 4R79A 4EJTA 4L9NA 5HLHA 3WTYC 5L3CA 3EUHA 4MQ9F 2M87A 3CUQC 3HSRA 3WE3A 4IRGA 4ZH4F 1F5TA 1F1ZA 3R0JA 3WODF 1HW1A 2DQLA 2D45A 2L54A 4P5OA 3F8NA 4CICA 1FP2A 3K2ZA 2QZ8A 1ZG1A 4L0ZB 2V1DA 4MQVA 2EV0A 4RS8A 2UWMA 2EFOA 5HS7A 1Y0UA 4NB5A 4HF0A 3KE2A 1ZG5A 4OU0A 3IC7A 4UXNA 2BYVE 1W5SA 2FSWA 3LAJA 2EWNA 2CGPA 4M6XA 3QP5A 3CLOA 3F72A 2HEOA 1D3YA 2HYGD 3RKWA 1O7LA 3LQRA 3DP7A 3E6CC 1W7PB 1U78A 1HSJA 2EFWA 2DLLA 4RGUA 2CFXA 1FYKA 2QUFA 4YIFA 2NAZA 3HRTA 3FWEA 4XRFA 2VOPA 1K79A 3HOSA 3FMRA 1XMKA 3LAPA 3O3KA 1FBUA 5HDKA 1JHFA 1LNWA 2P7CB 4UVCA 1STZA 2GZWA 4UVAA 5K5OA 4ZYHA 1TTYA 2WWYA 2KJBA 1LDJA 1B9NA 2IPQX 2DI3A 3P9CA 5JVTA 4XBFA 3BZ6A 1G3WA 2VBZA 5HLGA 4U0YA 2ETHA 1KU7A 1OPCA 2IJLA 4LB5A 3ELKA 2IA0A 3QU6A 2F5FA 2XRNA 3T5XA 2DO7A 2B0LA 2VBXA 3CUQB 1J7KA 3HYIA 4O3MA 3FXRA 1FLIA 3F23A 4HV6A 2EFPA 4I98B 5E8IA 1T38A 3ABTA 2H09A 2EB7A 5IT9K 3BJOA 4O6JA 2O3FA 2O6GE 2YU3A 2PI0A 3HUGA 3EYIA 4G9YA 4AD9A 2F5DA 5LEJA 1ZGJA 2EV6A 5IT9Z 3F6VA 5DV5A 2HWVA 3BPVA 1QO0D 3R61A 4M6YA 5F6FA 2XAHA 1IUYA 5ILSA 1HBXG 5LBQA 4LLGF 2CG4A 4KN7X 1YIOA 2VOOA 1ZLKA 3RKYA 1S6LA 2P6TA 3LA2A 2DT5A 2Y48A 3I71A 4N0BA 3E97A 3C3WA 3ZMTA 3M8FA 4P9FA 3SHFA 3IRQA 1KQ8A 3CO7C 3CTAA 5BS6A 4I0AA 2MH2A 1TQPA 3EYYA 1T98A 4Q47A 2P5KA 4P96A 3J81K 4YFXF 2KIFA 2J5OA 4L5IA 4IPAA 4Q4ZF 1IZ1A 3ZPLA 2O61A 3J81Z 5DYMA 2GA1A 2K86A 2A61A 2ELHA 2HYFA 3P9KA 3AAFA 3L09A 2XIGA 3SXYA 4OIRF 2RNJA 1XB4A 3T0YA 2OBPA 3J7AO 2JPBA 5DUIA 4OOIA 2GQQA 2JT1A 4LK0F 3N97A 2QBYB 3KETA 2W24A 1FP1D 5E20A 3F21A 2IA2A 4ZYDA 1XMAA 4I7HA 4BQAA 3PFIA 4FX4A 1OR7A 2K02A 3FXQA 2W85A 3SQNA 2LNBA 3MQ0A 2BBYA 4B8XA 1ODDA 2Q2EA 2DBBA 4RAYA 5CJ9A 3I64A 4A5NA 1HQCA 4XLNF 3HHGA 5FO5A 2YR2A 5D5VB 3R4KA 2NNYA 1YYVA 1SMYF 2RQPA 3FM3A 4WXCA 1YO5C 3V7CA 1BIAA 4IHSA 2L4MA 3BJ6A 1FPQA 6PAXA 1BI1A 4IRIA 1U6GA 1K7AA 1TBXA 2IT0A 2DPDA 1U5TA 3RPUA 4MHGA 3I54A 4OMYA 2ISYA 1BJAA 3JTGA 1HKTA 5A2QZ 5CYVA 4RAZA 1MJ9A 4MEYF 3TDZC 2A69F 1IN5A 2W25A 4S05A 1BBYA 4KMUX 4AVPA 1Z1DA 1SD6A 2J5PA 3FXUA 3HRUA 5E1XA 5D5WB 2Z99A 5ED4A 3E3VA 1HW5A 4KFCA 4H0EA 3GW2A 3WGIA 2XASA 3GXOA 5ICFA 2KKOA 3IHUA 3LA7A 2QQ9A 1W7PD 2VN2A 1R7JA 1IRFA 1HKSA 3C1DA 3HSFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

5M5WJ 1HNWE 5H2FC 1YW9A 2R92J 1WPKA 2A3SA 5IYCJ 3MHSC 1R36A 1K78B 1O4XA 4XNFA 2JMWA 5BQTA 1MBEA 3ECOA 3I4PA 1ENHA 1DQUA 2MSYA 1JE8A 2E19A 5H6RA 2EMHA 1LDDA 2NXNB 2HQNA 2HFHA 4D7MA 4DMIA 2Y2ZA 5KVRA 3C6MA 1JKOC 3VYYA 3OYKA 2LD5A 1Y1VJ 3ZQ7A 3JREA 1SFXA 3IWZA 3K2AA 3ZQCA 1X48A 1O3TA 2YU8A 1U8RA 1IGNA 2LF8A 3EUKL 5M5XJ 3HOWJ 3P5JA 3PQJA 2M5WA 4W97A 2LKPA 1LKXA 1X2NA 1MJAA 2P4WA 3N05A 2CQQA 2DFHA 2JSCA 3ASOH 1EKZA 1GDTA 1F43A 3WHCA 1Z21A 2V85A 1LFPA 4ENMA 2Y30A 3U2RA 2GIZA 2E72A 3Q0VA 2ODRD 2O03A 2Y0SA 4DR2E 3I53A 1U0JA 1AHDP 5D8LB 4BS9A 1RI7A 3H1CA 4HG2A 3W2WA 2P81A 4B3TE 4K2EA 2FQ3A 4EJWA 4O4KA 2R7QA 3DPTA 4UUTA 2EA4A 3OIPA 5GADJ 2EMIA 4C9YA 2WADA 4IZZA 4JI7E 5J4VA 1YTYA 4C2TA 1MW7A 2HVRA 1LFUP 2UUBE 4N4OB 3P1XA 3OSFA 2FA5A 3CCYA 4MEXF 4NHJA 4A2UA 4EVIA 3BC8A 1E17A 2E71A 2OZUA 4R8HA 4ZDPA 1MNEA 2WC2A 5FD5A 5A2QC 2CUJA 1PUFA 1ETWA 2E5NA 1XN7A 5JVGF 1JUPA 2OCCH 1DGWY 1IBKE 3H9JA 2WBMA 2K7LA 3BLYA 3SFZA 1G6NA 2CW0F 2QYOA 3K9TA 2VJ5A 4NC7A 2L2KB 4HZFA 2L2MA 4L0YB 4BQNA 2L0KA 3H3VK 5HDNA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3L00A

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Chord Diagram

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