3L0GA

Crystal structure of nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from ehrlichia chaffeensis at 2.05a resolution
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
ISFSEIIHNALKEDLGDKGDITTNSILINEKVNFAINTRENLVVCGIPILEEVFNMNKEHVKYEIHKKDGDITGKNSTLVSGEALAIYLLPIERVILNFIQHASGIASITRQFVDEVSGTKVKIRSTRKTTPGLRMLDKYSVCIGGGESYRDNLCDGVLIKDNHIASCGSITLAIQRLRKNLKNEYIAIECDNISQVEESLSNNVDMILLDNMSISEIKKAVDIVNGKSVLEVSGCVNIRNVRNIALTGVDYISIGCITNSFQNKDIGLDIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from Ehrlichia chaffeensis at 2.05A resolution
rcsb
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
molecule tags Transferase
source organism Ehrlichia chaffeensis
total genus 97
structure length 272
sequence length 272
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2009-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3l0gA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3l0gA01
5AC6A 1G4TA 2V2DA 3W6YA 3HGJA 2CLEA 4Z1AA 4OGZA 1O60A 4NJIA 3KOFA 3DKLA 2RDUA 3W87A 1OFPA 2VEMA 2RH9A 1OFAA 1K7XA 4KFNA 4JX6A 1WBJA 5HINA 4JTLA 3VFLA 4S2CA 4NXKA 1LRTA 3SIZA 2HSAA 4WOZA 2BSLA 2ATMA 3LM7A 4O10A 5FEWA 5TQLA 3VKJA 2FJKA 1SZNA 3RU6A 4O12A 2ISWA 4ZQPA 3O05A 5F2MA 3HG5A 2CLHA 3HJZA 2OT1A 1VYRA 1G69A 4OE7A 1UB3A 3DI1A 4OQVA 1XBVA 1H7WA 4H4IA 1H51A 3BARA 2H8ZA 1NF0A 1HUVA 3NGJA 4UCGA 4M7SA 2EKCA 3ZFHA 2Y61A 2WQPA 3IVSA 1JQVA 2F7FA 2W6RA 3W74A 1LZOA 5T26A 3P8IA 1H5YA 2Y63A 4YL2A 4S1FA 2WSQA 3N9SA 3S5ZA 3LX9A 3PB2A 1AL7A 2V2CA 3L65A 4FNUA 2C15A 2E5BA 3C2VA 1OX4B 4O0KA 5KTLA 3NQGA 2CLLA 4LVGA 3G1XA 4A2RA 1A53A 2NZLA 3U2OA 5CSRA 5I3JA 2IQTA 3G0XA 3QMSA 3NVTA 1SFLA 1OJXA 3LCWA 3CB8A 5G2IA 3S5NA 5FF7A 5G1TA 4AMAA 4DPQA 4UFIA 1JJKA 1PVNA 3DXIA 2R91A 4OWGA 1TCDA 2CZDA 1H1ZA 2JK2A 3QPZA 2G96A 3BPWA 4GUIA 4JXCA 4O1DA 3S0CA 1EWEA 3CIXA 5BMWA 3FA5A 1VHCA 4XWUA 1MZHA 1XKYA 3HGSA 4IWWA 1GVOA 1FX6A 4S2BA 4TMCA 2BLEA 4N4QA 4R7JA 1R30A 4ONVA 3LHYA 3E96A 4UTMA 4GUFA 2V9DA 4WQ6A 3LTSA 5C5YA 2ATSA 1QWGA 2KZHA 2NUYA 2YYTA 3TSDA 4LS1A 1PCWA 2NV1A 4JTFA 3KFTA 1ZY9A 3QZEA 3TH6A 4WY0F 2ISSA 5D30A 1XBYA 3LHWA 4GXMA 3PVFA 3DFPA 1L6SA 1OX4A 4E38A 1G7VA 1NFBA 1ICPA 1SO3A 3PUEA 3BLIA 1R46A 3BGJA 3N19B 2ZZ4A 3M9YA 1FWTA 4O14A 1TRDA 3NQ6A 1V7YA 3W23A 4ZQNA 3TR2A 4JICA 1K7FA 2E6FA 2XN2A 5LHFA 2DORA 3SECA 2VOMA 2GQAA 2ISVA 1VCVA 1OK4A 4NJHA 5D38A 1RQEA 3LRLA 2RDTA 3OG3A 1KM1A 4UIOA 4DXVA 5C54A 4MLRA 3G3DA 5C2XA 3HGRA 3N34A 3P5YA 3M43A 4MFEA 4WY0B 3GNDA 4JY9A 4Z0SA 3CWOX 2OX1A 4PEKA 4EF8A 1XBXA 1F76A 4TR9A 1R2SA 1W5MA 5FESA 2F84A 1M7OA 1ZNNA 4AWTA 4JY8A 2GPTA 5EPDA 4JTIA 1O94A 1D9EA 1RQHA 1WA3A 4LV9A 2Z0IA 1UASA 1GWJA 5IBXA 4UUIA 2EAWA 1FY6A 3UWWA 1S3HA 4GE8A 4R53A 3P74A 3GDMA 3ABRA 5CZSA 4UMAA 3G1VA 3TFXA 3P84A 3A5VA 3GDLA 4LS0A 4O1BA 1LP6A 3FOKA 3IEBA 5AHNA 1JCXA 1AW1A 3N14A 4XTIA 3ELFA 1WX0A 3CWNA 3W2MA 1VS1A 5CZ0A 3T44A 1TPVA 4JTSA 4CNPA 3EX3A 3SSJA 4EF9A 3MYPA 1BKSA 2B7PA 3W7NA 1G67A 1YADA 2HTMA 2WNNA 2ZTKA 3BK0A 1T8XA 5IM51 1AL8A 1XDMA 2E6DA 3W2LA 4NZJA 3M41A 5K3VA 4IX2A 1NEYA 2YPIA 4WOQA 2NXHA 3UQNA 4NJGA 4WY0A 5AFDA 3DFQA 2VXNA 3A21A 1H7RA 3DFOA 4O8RA 4R34A 5AHLA 2A7RA 4JTHA 1YDVA 3CQ0A 1OF6A 2CZ5A 2GVGA 3LGEA 4NX5A 1A5CA 2R8WA 3TMQA 2G97A 1KFEA 3HOJA 3P82A 3LHZA 3W1AA 1F05A 3FJ6A 1G6CA 4LTSA 3QMTA 1FDJA 1ME8A 4XUGA 2ZA1A 4ZQCA 3IGXA 3C61A 4JTJA 4BI6A 4GWEA 4MLJA 4BFAA 1HG3A 1MEIA 1TPB1 3QSRA 5CZJA 5AC7A 2AQWA 2P0OA 1DL3A 2C0AA 4RXFA 3R8RA 2QCMA 3B04A 5FEXA 1TIMA 3EXTA 1QNVA 3TFCA 2HS8A 2QCGA 4FX8A 4YCOA 1KW1A 4GUGA 4JGDA 1MXSA 2ZBTA 4WD0A 2QUUA 4LC6A 2QCCA 5FF0A 4BWLA 2Z2UA 4UTHA 3TX9A 2FPTA 1SO6A 3HB9A 3NPUA 4ADTA 1LLWA 4QJ1A 1X1OA 2QJIA 5EY5A 1EEPA 4IMEA 4HKPA 3TDFA 1VCFA 2V8ZA 4FF7A 3EWXA 3M16A 3LLFA 4UTTA 3E9AA 4K7VA 1ZENA 4JYEA 1LYXA 1IIGA 3L9CA 1DHPA 5DCBA 4EIVA 5F4WA 1KFCA 3G1FA 3UXAA 4IQLA 3BVJA 2A2IA 1TB3A 1XXXA 4WX2A 1YYAA 3U8GA 3Q94A 2ZQ0A 5K4ZA 3WFAA 2J9XA 2NX1A 3MJYA 3M5YA 5G2HA 2X1UA 4JYFA 2ZRWA 1LBFA 2PRLA 3LHUA 3T78A 3W1XA 4X2RA 5CGQA 2VFDA 3BLFA 3S8HA 1KFBA 2YSWA 2V30A 3W1RA 5I3GA 3IIVA 3GB6A 1KM0A 3LCXA 3QF0A 5L6UA 3EWUA 3KVJA 2A7PA 3DAQA 4PCFA 1P4CA 1JQXA 4ZQOA 1W37A 3JRKA 4EVZA 4HIBA 4QM1A 3I7QA 4U28A 3UZ5A 3OIXA 3KVKA 1TRIA 3PAJA 2CLIA 2A1YA 4IMDA 1W5OA 5KZMA 3PBWA 3QW4B 1GT8A 2E5DA 5TIMA 1KA9F 1TREA 3FIGA 5E0KA 1ICSA 3PBUA 5HR6A 3NYZA 1R2RA 1MEWA 4JS3A 3MWAA 3NPVA 5AYYA 2E1DA 1KFKA 2A6NA 2DZTA 4AWSA 1OFRA 3FYPA 5EKYA 1H50A 4AVFA 3LHTA 4K6AA 3NZ1A 4NZFA 4J9JA 4L4LA 5EMUA 1KTCA 3LV6A 4ZQRA 3FYOA 1LOQA 5AB3A 3KVLA 3PUOA 4JIPA 3W7GA 1OFBA 2C3ZA 3USBA 4A21A 4AB4A 3N2MA 5G1YA 5E93A 5HULA 3HG2A 2QUVA 4LW7A 4Y6GA 1C29A 3B03A 3UZJA 2JBMA 1VHNA 4HPJA 4DF0A 3TAOA 1EP1A 1AMKA 3QEZA 5DBTA 5U4NA 3TSMA 1RD5A 1WOBA 1XDLA 2EGZA 1EWDA 2PRMA 3MP4A 1AK5A 4IXXA 4GFSA 3TQ0A 3G0UA 1A5BA 3NQDA 3GXTA 4O13A 3NL5A 1QPRA 2DJXA 2ZZ6A 3UD6A 2CFFA 2Q3RA 1DVJA 2E77A 3KVMA 1KM2A 3ATZA 1U5JA 2A4AA 1HO1A 3GX9A 3TJLA 3S1VA 5DN1A 2FFCA 1B4KA 3H55A 1SZEA 2E5CA 5D37A 4JN6A 1SU5A 2GJLA 4OHQA 3SW6A 3M0ZA 3BW2A 4M5PA 3S1UA 4H6KA 5H2ZA 2V0TA 3UWUA 1MEHA 4DO4A 3L0GA 3SR7A 4FIQA 4TU1A 3EX1A 2TPSA 2W0UA 4XBKA 2QCEA 2WV8A 5L9FA 5BOOA 5DY2A 1HL2A 2ZDRA 2VKZG 3W84A 4O0ZA 4GNJA 2RFGA 2NV2A 2WO5A 3ATYA 3LV5A 3P60A 2A6LA 1B4EA 3LTYA 3MYOA 3DFTA 3W72A 1F7BA 2DP3A 3GXNA 1OG0A 2H3BA 3LHVA 3SGZA 5LNRA 3S1WA 5FEPA 3NQCA 3B0VC 5K9XA 4KFOA 2VELA 2P1FA 4AHQA 4O18A 3GVGA 1VC4A 5KINA 3KX6A 3PC0A 3BG5A 2RKXA 1BTMA 4RZ4A 3ZWSA 1X6UA 1LBLA 3OVQA 3GAYA 2ZA2A 1PIIA 1W3IA 1YLVA 4O50A 4GUJA 3TQKA 4OV4A 1GOXA 4GJ1A 4Z1DA 4AAJA 2ZRYA 1QPOA 1VPXA 3CEPA 4NNBA 3OHIA 4WXZA 1NF7A 1J2WA 2CWNA 2VFFA 1RR2A 2ZTJA 5LGZA 1LDCA 2X1TA 6TIMA 1K8YA 3BW4A 4LVAA 4RXGA 3CC1A 3MMTA 3QSTA 2V82A 1EP3A 1WYIA 5GVJA 3TKFA 2C13A 3W1QA 2XN1A 1KM6A 3W73A 5KZDA 1RPXA 2V2HA 1A50A 1K7EA 2A85A 3QC3A 3LB0A 1Q3NA 3LI0A 1JCMP 4EOUA 2FQIA 4FXSA 1LCOA 3VE9A 1KM4A 1TJPA 4JR5A 4ZMGA 2PE4A 1THFD 4O19A 4AHPA 4RJEA 3HPSA 2WOQA 3C2OA 1S5VA 4K8EA 1TPEA 4XTDA 3NL2A 3QMRA 3B4UA 5KSWA 5D2TA 4CQAA 3L66A 1W5NA 3C4UA 1TV8A 2A7NA 4RX0A 3RK8A 3DENA 3QYQA 4LOCA 2CLOA 5HMSA 2PCQA 2YXGA 4LU0A 3S42A 3GNNA 1A5SA 3M47A 2CLMA 3NDOA 2EF9A 5I3HA 3S9YA 5EA9A 4PC8A 3TQVA 5F2LA 5G4EA 1TPFA 2QEZA 2FB3A 1GYNA 2HS6A 1SSDA 3CLMA 5E1QA 3M5VA 2FIQA 5I3IA 5CKSA 4UTIA 4O28A 1Q6LA 1H1YA 5I3FA 5D2WA 4O1CA 3CU2A 3T40A 4LWWA 4G1KA 4DO6A 3EX6A 2C6QA 3SGUA 3TUUA 1QR7A 4POCA 4UXDA 3KRZA 1W0MA 4AHOA 4FIRA 2ZRZA 2QCLA 5CPNA 1F74A 3UWVA 1FQ0A 2FPYA 1ZAIA 5DELA 2QCHA 3UPBA 2VFGA 4QISA 2NXIA 4L4MA 4HNNA 4LUJA 3P61A 4CCEA 1IXNA 1SPQA 1W56A 3W85A 1FCUA 1DQWA 4UTJA 4PL1A 4DPPA 1UUOA 3W3OA 4I7UA 3BG9A 1GEQA 4WJEA 1FCVA 1K3UA 2UV8G 4UFKA 3TU9A 4ADSA 1F6PA 2YZRA 3MHGA 1IXOA 3T55A 4A2SA 3UWYA 1I2NA 3G1HA 1RQBA 3LXBA 3CEUA 3MHUA 3TAKA 3NA8A 5AHFA 1UJPA 2DZVA 3NPXA 3S6DA 5D05A 1O5XA 2QKFA 1ONRA 1YDNA 1ZJIA 3EX2A 1QDSA 3L5AA 2B7QA 2DZWA 2LLEA 2P10A 1KM5A 1JCYA 4TIMA 4E2DA 4E2BA 5DBUA 4FNQA 3P5ZA 4CCCA 2Z1BA 3IIZA 3STFA 4PH6A 2YYUA 3F1QA 3KRUA 3IRDA 1MO0A 4UTKA 2RHGA 1F2JA 5BMXA 1OYCA 3L0KA 3C6CA 1LOSA 4LY8A 3W1UA 3L21A 4HSOA 4N02A 2J24A 4ML9A 1BWLA 4U4MA 4I7WA 4MOZA 2G95A 4WXYA 4O16A 3UXDA 3WJYA 5G2WA 5MHBA 4MUZA 2NWRA 3TSBA 1U83A 3CPRA 4KWVA 1VCGA 3EB2A 1XBZA 3EWWA 3SI9A 1TV5A 2ZZ1A 3H53A 5DLCA 2I1OA 3W7RA 2E6YA 4Y8FA 4JDBA 4HHPA 2CW6A 3MI3A 3NXFA 5AOUA 5AYZA 2J6XA 3TE9A 4FNRA 3QFEA 3QJAA 5FEZA 1OFQA 1OYBA 3PM6A 4UTWC 4CNOA 3V1PA 5HWJA 1Q6QA 5H91A 3DU0A 3GDRA 4UNKA 3MHFA 3O6DA 2A21A 1FCQA 1I2PA 4NQ1A 4YXGA 4MYXA 1TQXA 1EB3A 2YR1A 4MY9A 4NX0A 3OBKA 3A5FA 3TMLA 2OZ0A 1N55A 3G1SA 5CPMA 5G5IA 3BW3A 1L6YA 3W1NA 1QOPA 1XI3A 1DORA 3M5ZA 3ABQA 3PBVA 3HMJG 3W7EA 1ALDA 2ABAA 5LNUA 1FDYA 4LT9A 3GZ3A 5I3KA 4HNVA 4FB7A 4UTUA 1SO5A 1ADOA 4MZYA 3I7SA 4RV8A 1IXPA 3W7IA 5CSSA 1IIHA 1DV7A 1LRQA 3T4CA 3TA6A 3LCFA 3QQ0A 3W70A 3W7QA 3MI6A 3EKZA 2WSYA 1ZALA 4MZ1A 3EXSA 4M6QA 3PBYA 1YPIA 3IV3A 3WK1A 3M6YA 3KAOA 4K8HA 4LS2A 3W07A 2TRSA 2BXVA 1KV5A 3M5XA 5DXXA 3NOEA 2Y7GA 2J9ZA 1TPWA 3UPWA 5SWUA 4KKXA 4TO8A 4IMGA 3LDVA 3INPA 4MYAA 5U7SA 1G4EA 3NR0A 4ORIA 3CT7A 4X9SA 3OA3A 3TC7A 1OF8A 1W5QA 1Z48A 4GRSA 4DELA 1KM3A 4JD4A 3TROA 1FXQA 2Y85A 2W79A 3PY2A 4Q4KA 1IGSA 2WJZA 2ZRXA 5AN7A 5LHEA 3P8JA 4Q32A 1PS9A 1UBSA 1OK6A 3W2KA 2JGYA 4JTTA 4FXRA 3EKLA 2DJLA 5HUPA 1SUXA 3DZ1A 3IGUA 3LBCA 3QPYA 4O4VA 3W76A 2GJNA 1WV2A 2G5WA 4TMBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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