3L78A

The crystal structure of smu.1142c from streptococcus mutans ua159
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
117
structure length
117
Chain Sequence
b'MVTLFLSPSCTSCRKARAWLNRHDVVFQEHNIMTSPLSRDELLKILSYTENGTEDIISTRSKVFQKLDIDVDELSVSELINLISKNPSLLRRPIIMDNKRMQIGFNEDEIRAFLPRD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of SMU.1142c from Streptococcus mutans UA159
rcsb
molecule keywords Regulatory protein spx
source organism Streptococcus mutans
molecule tags Transcription
total genus 34
structure length 117
sequence length 117
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03960 ArsC ArsC family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3l78A00
1XW5A 3ERGA 3WGDA 4ZBBA 3ZTLA 5AGYA 3PR8A 4QL7A 4TXOB 4ZB6A 1TI3A 4Q5QA 2ES7A 4L0UA 3DYRA 3QPMA 1QK8A 2HSYA 3FYGA 1NSWA 1QXHA 4TR3A 1X5CA 1A0FA 4MF5A 2BMXA 2B7KA 2GT6A 1XVWA 2VL2C 2FGXA 2DBCA 3MNGA 1FW1A 1YEPA 1ZCPA 2C4JA 4HQZA 1EWXA 1XW6A 2JZTA 3GH6A 3GUSA 18GSA 1OAZA 2YCDA 5ID2A 3KH7A 4WF4A 1FVKA 4AGSA 5AISA 2XPEA 5DAKA 4QQ7A 1TXXA 4WR5A 2L6DA 2GSQA 4KSMA 1MD4A 3V1WA 3HDCA 3US3A 5J9BA 2FWEA 3FZAA 3CRTA 2VIMA 4EL1A 1OYJA 2QGVA 4MMMA 3QAVA 5D9TA 1U6TA 1TJDA 4I5QA 2GTUA 5IM9A 3FK8A 1ZYEA 1YF0A 1QGVA 1A23A 2FHEA 2VAFA 2VCTA 5IMCA 1RK4A 2O7KA 3GSSA 1EP7A 2AHEA 1JHBA 3BCIA 4PNFA 2HFDA 2NPBA 1M7TA 3TJFA 3TUEA 4MJEA 1JZOA 3F3QA 1XWGA 2LEGA 3E3EA 2H72A 4DSSB 3C73A 5JCGA 2LRCA 4XRDA 1I9DA 5ECLB 1YKAA 1G6WA 2OADA 3I6AA 4TN8A 4MPGA 1FAAA 3H4KA 2VO4A 3A2XA 4TR1A 3HJPA 4IN0A 13GSA 4JZQA 3F4SA 4PQIA 2C3TA 4K8MA 4KCAA 3IDVA 4OCEA 4CHSA 2VUPA 3EU4A 5G31A 3OR5A 3DVWA 2LTKA 2M80A 1ACVA 2K9FA 4N11A 1HQOA 2LRTA 4KAEA 2KP1A 5C00A 4OFMA 1M9AA 1GSFA 3HCZA 2AAWA 1T4ZA 3GIXA 5AN1A 5ABRA 1R5PA 3QCPA 2K6VA 1GLQA 2VOCA 2PGTA 5ECNB 3NIVA 2QC7A 5IO2A 3QAGA 4J2FA 4JRRA 1THOA 4XS6A 1GTIA 1VF1A 3KGKA 1XIYA 4MZCA 5CRWA 4AJ8A 5IIZA 3UAPA 2XHFA 2R2JA 1EOHA 1QQ2A 5B8BA 1GUMA 1MDJA 3HJMA 3RBTA 4EDYA 2IPAA 5LNKe 1XWAA 5KEJA 1RW1A 4IBPA 3TCOA 2RUFA 1FOVA 1YY7A 1SJ6A 3G7IA 5G30A 2IMEA 2LUSA 4KDXA 3WGEA 2OE0A 5G1LA 4MJBA 2LJKA 1ZL9A 5B7CA 4BWQA 4YQVA 1JZRA 3ERFA 1ILOA 5H5RA 5E59A 4OFTA 5LD0A 3NOFA 2FWFA 4KCEA 1FHEA 4FH8A 1XCCA 2B1KA 3C7MA 1TP9A 2ON7A 3LYKA 3A2VA 6GSVA 2WDUA 2YWIA 2QSIA 2TRCP 2KP2A 4EE0A 4ZL8A 1NM3A 3TB2A 3M1GA 4X0XA 4RQXA 2V2GA 4YH2A 2JSYA 3G7YA 3UJ1A 2GSTA 4POKA 1A24A 1VF4A 2M46A 3HYPA 3GKXA 3IC4A 1OC9A 1YJ6A 2LS5A 3ZIVA 4PXOA 2X8CA 1CQGA 1UC7A 2K18A 3LYPA 3QFBC 2WJUA 3LWAA 1A2MA 4EO3A 3TKSE 4HJ2A 3JCML 1YQ1A 3CSJA 2FY6A 3IR4A 3LSZA 1GRXA 3VLNA 1FVJA 3AY8A 5CAXA 5EVOA 4P3YB 4DSRA 3GL3A 5G5EA 3EMPA 1MDIA 2FWHA 2FA4A 5AIVA 1M0UA 2C80A 1Y6EA 3F4RA 3EE2A 5KN2A 2EC4A 2CQ9A 3GFKA 4WR4A 2WGRA 3H1NA 2X64A 3D4MA 3VI7A 2H6YA 4POMA 6GSUA 2GS3A 2VD1A 4IGJA 1GLPA 1EZKA 3HA9A 4EXJA 2IMIA 1XZOA 3M3MA 4IVFA 3ZRDA 1HNBA 3FHKA 3E0UA 2H6XA 4TXOA 4ZB8A 1SKSB 1F2EA 4QL9A 4HZ2A 4MH2A 1OKTA 2HRFA 1R4WA 1PKZA 3HVVA 1PN9A 3TRQA 2N5AA 5DVBA 2QKEA 2IJYA 5JWOB 4GSTA 3DEXA 4NXIA 1SYXA 2CX4A 2H73A 2H1DA 5GSTA 3VPTA 4KB3A 3KM6A 2M72A 4HU7A 4Z7XA 4JEDA 2YP6A 2DIZA 4Q5FA 5CRHA 4NMUA 3GMFA 2YOIA 3MSZA 4GQCA 4FIWA 1F3AA 1FB6A 2LSTA 4JR4A 3ZITA 4ECIA 1QFNA 1NHYA 5HR3A 1LU4A 3BBYA 2IN3A 4L8EA 4GLTA 3HVXA 3HD5A 1XWCA 1PL1A 1E6BA 5KN3A 1EGRA 2VLTA 2VD0A 2OKAA 2H8LA 1SKRB 2H0IA 3IAS2 4MA9A 2FCHA 5D9XA 2C8UA 2PBJA 5CP1A 3ME8A 1M2AA 2YZUA 2P5RA 2MMAA 4KDYA 2PU9C 1XOAA 4F9ZA 2DMLA 4G10A 1ERWA 1E2YA 1KBNA 3D22A 4PQHA 3IXRA 1XXUA 2C0FA 2ALBA 2NTOA 3G9BA 2YN1A 2H01A 4KX4A 3W6GA 2DJ2A 4DSSA 19GSA 4Q5RA 1SL0B 1B8XA 1VRSD 1YDKA 5ECIB 2H70A 3HHVA 2HT9A 4KNDA 6GSSA 3TKRA 1JZWA 1TU8A 3FZ4A 5J4UA 5ECQB 2L5LA 3KH9A 1N2AA 4EKZA 1AQVA 1PSQA 1SL1B 4WEYA 1NW2A 4L0WA 1G7EA 1K0DA 2H0GA 2VCVA 3KD0A 4J56E 1GSDA 4GTUA 4K1FA 2RM5A 3K8NA 3GNJA 3BJ5A 5A5KA 1C72A 2HZEB 2V6OA 2AYTA 4ZBAA 2YWNA 3GKKA 2DSAA 14GSA 4MLYA 3WYWA 2N5FA 2GQMA 4I97A 3TRPA 4JR6A 1A2JA 2F51A 2XC2A 1HYUA 2L4QA 4F2IA 5D73A 1XWKA 2LKUA 2JSZA 3J7Yk 3EINA 2HSHA 2IMDA 3EVIA 1XFLA 2VLVA 5DQYA 2VCWA 5IOWA 3P8WA 3ZZXA 4KUNA 3QD9A 1AW9A 1SJIA 3C1RA 3QMXA 2OE1A 4ZIJA 2VM1A 1Z7RA 5E4WA 3M8NA 1AIUA 4OO5A 1J0FA 1GTUA 4NV5A 2EIQA 2GSSA 3IA1A 2O89A 4MZBA 4E8HA 3LEFA 3UARA 1OC3A 4BL7A 2DIYA 4N10A 1B48A 5FHIA 2HLSA 3O6TA 1Y25A 4TVEA 5ELAA 2H76A 3KTBA 1ST9A 4F0BA 3VK9A 3TOUA 4EC0A 4I8BA 3RPPA 5KN1A 3UEMA 3HZ8A 2JADA 4FO5A 2C3QA 1PA3A 2B5XA 3BOAA 2GZZA 4J57E 2I4AA 5J9CA 3ZYWA 1MEKA 4D73B 3M9JA 1A0RP 4V1Ap 3L4NA 2RM6A 1W4VA 3IV4A 2FLSA 2C1YA 2GSRA 4V1Ag 4I6XA 2OACA 4GXZA 2B6MA 3A3TA 2F3MA 3TJBA 2I1UA 4X43A 3U6VA 1U3IA 2PVQA 1IYIA 1V9WA 3IPZA 3GX8A 2MZCA 1WRYA 3MDKA 1OVNA 2CZ2A 4EDZA 2B3SA 1KEBA 3P90A 4L5OA 5DBQA 2C3NA 4ZILA 5HFIA 1MDKA 2DC5A 2CX3A 1A8LA 1S3AA 3H93A 1TI1A 1PL2A 5A4UA 1JLVA 2XBQA 2WRTA 5F07A 1ZMAA 4HJMA 3I69A 4OD7A 3F4TA 4DSQA 2CZ3A 2HYXA 3D0ZA 4G19A 1AQWA 3RDWA 1THXA 1PMTA 4PNGA 2P31A 5G5FA 3GV1A 3IHQA 5EPFA 1F3BA 4XRAA 3ME7A 3WT2A 2MMOA 1OE7A 1FB0A 5HFKA 1GH2A 2PUKC 1PD21 4KW6A 2VCXA 4MF7A 2CVKA 2PMTA 2O8VB 4V2LA 5J5NA 2HXKA 3L9UA 3ZIJA 4JE1A 10GSA 5EY6A 8GSSA 3L78A 1YF1A 1PGTA 4LMWA 2OA7A 4POBA 5A4WA 2PERA 1T4YA 5ECMB 1PKWA 3WD6A 3WGXA 1SENA 2Z9SA 1T3BA 1BG5A 2LRNA 5DCHA 2PPTA 1H75A 1GUKA 1TOFA 2ON5A 3Q6OA 4OCFA 1RQMA 2A4VA 3GN3A 4FYCA 3I9V2 1PX7A 1GTBA 4HQSA 3KIJA 1K3LA 3HKRA 3IOSA 2YANA 2KLXA 1R26A 1M2BA 1N8JA 4ZB9A 4AF2A 1WJKA 3VI5A 3D21A 2C0EA 1GSYA 2L5OA 1V58A 4GQFA 1SU9A 3PINA 2CVBA 1Z7PA 4NPBA 5LCZA 1TU7A 4IELA 3PGTA 3J7Yb 1XWBA 3QOUA 1DUGA 3VPQA 7GSSA 5D8IA 2TIRA 5JWRB 1GSEA 3VFIA 3F8UA 3RAZA 4POLA 5IQYA 2DJJA 2DJKA 2K8SA 1BX9A 1EOGA 4MZWA 3GL5A 5H5QA 2CVDA 1BYEA 4WBJA 1KTEA 4YAPA 3DRNA 3FZ5A 2R3XA 1O85A 3QAWA 4FYUA 1V2AA 5D93A 5JCUA 2VM2A 1U3AA 3SBCA 3LXTA 4ECCA 2H19A 1XW9A 3ED3A 2V32A 1GULA 3O3TA 1NHOA 3DIEA 5IMVA 3E9JB 1M2DA 4I2TA 1ML6A 4TOPA 1Z6MA 4DVCA 2V41A 3L9SA 1U88A 5ECRB 1OE8A 3ISOA 4JBBA 1YKCA 4ML6A 2HZEA 1AQXA 3FR6A 1K0AA 1TRWA 2HI7A 1XOBA 4ID0A 1TRSA 3A2WA 4ECBA 5ECSA 1T8EB 1SD9A 4L5LA 2AUVA 2YPMA 1SYRA 2L4CA 3P7XA 4IQAA 2RUEA 1WPIA 4RUVA 1EEJA 2OE3A 5C04A 3CMIA 2AV4A 5IO0A 3Q74A 1DBYA 4YQMA 3M9KA 4CDOA 1S3DA 3A5WA 5G2ZA 1S3CA 2KOKA 2MYGA 1XBSA 3UVHA 4HZ4A 3QFAC 4CW9A 3DMLA 4K9ZA 2CAQA 5IPHA 1GL8A 3FKFA 3IK9A 2LQQA 2MBSA 2B7JA 1ABAA 2YJ7A 3UIWA 2WB9A 1O8WA 2P0GA 4KDUA 3P2AA 4NWYA 4KA0A 1K3YA 4MABA 2OJLA 4O32A 4ISDA 3KJYA 5INYA 5DJMA 4PX1A 3F6FA 2IMFA 2LNSA 3CSIA 4D73A 5L71A 5J3RA 3H79A 4IQ1A 4WETA 3SWLA 5ECPB 3IAM2 4MH3A 1URMA 3DD3A 3CTFA 3KCMA 2NVLA 2GDRA 2VLUA 4OFNA 1SJZA 2X8GA 3RHCA 2L59A 2JACA 3CXGA 1SD8A 2HZFA 4H86A 16GSA 5B6MA 3LFLA 2YWOA 20GSA 3FY7A 3KP9A 2PVOC 2AB6A 3FW2A 2FD3A 1TRVA 2J9HA 11GSA 2YV9A 1Q4JA 1PRXA 4IW9A 4AJ6A 9GSSA 3EYTA 4XS1A 2WCIA 1JZDA 4HS1A 2H1BA 3GTUB 2C0GA 4WF5A 1SK2A 3D4TA 2XPDA 1SK1A 1GSUA 3L9VA 2EIRA 3D5JA 3VWUA 2F9SA 1V98A 1DSBA 2H30A 3RPNA 3RHBA 1WWJA 3O76A 5COHA 3UVTA 4XS4B 4XTSA 2DJ3A 3UBKA 5IMDA 5ECKB 1GUHA 3GSTA 3EMXA 2IFQB 3LGCA 5HR2A 1GWCA 1Z5YE 4TRXA 3N9JA 1MTCA 2H75A 3DKSA 5KN0A 4OMVA 3GX0A 1AAZA 1X9WB 4IP1A 1UA5A 1LBKA 2ZCTA 1HNAA 1G6YA 3TJKA 4YQUA 1B4PA 1X5DA 4MK3A 3F63A 2FA8A 1SL2B 1BQ7A 1X9MB 1EV9A 1JLWA 1B9YC 4PGTA 1ERUA 4IP6A 3UOMA 1VF3A 3TGZA 1ZOFA 1TW9A 1TTZA 3BCKA 2CV4A 5GAND 3Q18A 1FG4A 4FYBA 1EEMA 2PWJA 4GRFA 4BWSA 4LL4B 1O7UA 2I9HA 4IJ3A 1BAYA 1WE0A 3TDGA 4K2DA 3VURA 4IKHA 2GLRA 3U5RE 3ZMKA 2RLIA 2C0DA 4O92A 1GSSA 2CA8A 1QUWA 2I81A 5AIXA 1ERVA 12GSA 5HR0A 2CAIA 2V6KA 3EU3A 4WKWA 4HOJA 5CO3A 22GSA 4WBRD 1B4QA 1R7HA 3LORA 5IPGA 2B5YA 4O5RA 2ZUPA 6GSYA 6GSXA 3LJRA 4TXVA 2H74A 2CT6A 4IJIA 4ULXA 1KNGA 4F03A 1J08A 3DVXA 5DALB 4KE3A 1Z6NA 5IMAA 3GURA 2F8FA 3LQ7A 4IHUA 1M99A 4G2EA 2VCQA 2DJ1A 4GWRA 4PUAA 5EL8A 3VWVA 4N30A 4TR0A 3ERWA 2JZRA 4O7HA 1TRUA 3UBLA 1ZZYA 5D96A 1USBA 4JU5A 1TDIA 4HU9A 4KSOA 1YEXA 2X8HA 3TKSA 1BEDA 3H8QA 3GRXA 4PUFC 2E2GA 4PURA 3ZLPA 1O6JA 5ECOB 5ELGA 1A8YA 3BD2A 2X99A 4LLRA 2R4VA 1HD2A 3APSA 1TK8B 1W89A 3HVSA 4OWYA 3W8JA 1Z3EA 3I43A 4HEA2 4XHMA 4GF0A 4NHWA 6GSWA 1ZGNA 2EIOA 1TK5B 1F9MA 2IMKA 4BVXA 4EF0A 3TKSC 2AJQB 5H5SA 1GSQA 2WFCA 1V57A 3HY2A 3VWXA 2B5EA 4I2UA 1SK0A 5FT3A 1ON4A 3DGQA 2HE3A 1MD3A 1XVQA 2L57A 3FR3A 2DJ0A 3EC3A 2LJAA 4XIHA 1WOUA 4G9HA 4K6XA 2H71A 5A4VA 1K0CA 3C71A 2NDOA 2R37A 1K0NA 4KGIA 1K3OA 4ZBDA 5JWQB 3QR6A 4GSNA 4XCSA 2HNLA 1CQHA 4EUYA 5IMFA 2IL3A 2B1LA 3S9FA 5ENUA 2GQKA 1X0RA 2NBSA 1DE1A 1B9XC 3LXZA 3APQA 3EURA 2WZ9A 3LG6A 5ID2B 2JZSA 4MJAA 4GCIA 1UN2A 3TJJA 5F0GA 5DAKB 1K0MA 4BPYA 1R5AA 3WT1A 2WULA 5G1KA 5HFGA 1O81A 4LL1B 4IS0A 3IK7A 4ILFA 2PN8A 4MCUA 3ZVJA 1YZXA 3N5OA 4K7OA 4LA1A 5F06A 2YZHA 1AUCA 4EVMA 4TR4A 1T00A 3HZ4A 2YNXA 1JFUA 1H4OA 2I3YA 4V2MA 3FEUA 4MJCA 2KHPA 1VF2A 4ECJA 3TKPA 2L6CA 2OBKA 1X5EA 1BJXA 2E0QA 4HUAA 5HR1A 2A2SA 1VGLA 2KUCA 2VCZA 5CRDA 1I5GA 5DQSA 2LQOA 4YAVA 4ML1A 3GTUA 2REMA 4K0NA 1WIKA 1GP1A 3KZQA 2N5BA 4F82A 4TR1B 4HDEA 2BTOT 4N0VA 3NZNA 2K8VA 3CBUA 1M9BA 3TKQA 3CSHA 6GSTA 4RI6A 3L0HA 5D9VA 2BJXA 3HXSA 2E7PA 2WS2A 3KEBA 5F05A 2IIYA 1U87A 3APOA 4XS4A 3FR9A 2P5QA 2A2RA 5CREA 4RQRA 2JL4A 3M0FA 4OO4A 2H1GA 1X9SB 2IFQA 1Z9HA 5FWGA 2GGTA 17GSA 3ZFLA 3TJGA 1EP8A 3ZL5A 1O73A 2J23A 2E2MA 3C1SA 2GZYA 4KH7A 2LJRA 3TRXA 2DMMA 1G7OA 3ZMLA 1F6MC 4ZL9A 2JU5A 1V40A 3GHAA 4NV2A 2H1AA 3TOTA 2VL3A 3IRAA 4V2NA 2V1MA 3G7JA 4BVYA 1EV4A 2RIIA 2GQLA 5J41A 1EGOA 1O8XA 4MPFA 4AJ7A 4E8EA 2MMNA 1QMVA 5GAPD 1G0TA 4ZL7A 3D6IA 4MDCA 1PQNA 4NAXA 1ZYQB 1ERTA 4X1UA 3VWWA 1GTAA 3ZREA 3F3RA 5CYYA 2D2ZA 2IWTA 2TRXA 3GH9A 2GT5A 4K0GA 5B6NA 3GKNA 1FO5A 5JCWA 2ZNMA 3KMOA 4GSSA 3QDNA 1K0BA 2XBIA 1LJRA 3CYNA 1F37A 3UL3A 4PQ1A 3EWLA 2MMZA 3CTGA 4WXTA 2VL9A 1T7PB 1SKWB 4DEJA 5GZZB 2F8AA 5GSSA 2YJHA 1TKDB 2H6ZA 3GA4A 3PH9A 3KXOA 4TW5A 4F0CA 4TKYA 3DXBA 2GVPA 4ACSA 3KTLA 5CRGA 5DALA 3W8SA 2H0HA 1Q98A 1J9BA 1OC9B 1WP0A 1UVZA 2FNOA 3DWVA 2LNTA 5IMZA 5CNWA 5DJLA 3FZ9A 2FUG2 2R5GA 2YWMA 1GNEA 4MP4A 3GKMA 3KP8A 1OC8A 2G2QA 1HNCA 2OBIA 2O87A 1AXDA 5F8BA 5D9WA 3F0IA 4NHZA 4Q5NA 1DE2A 3CRUA 2FWGA 2R6KA 3MWHA 5B8AA 2DLXA 3R2QA 5ECHB 2H66A 3FRCA 5DDLA 4RI7A 3IE3A 4BA7A 2HRNA 1PX6A 1AC1A 1TK0B 3ZFBA 3ZVJD 3HJOA 1XPVA 3F9UA 2LV3A 5HQPA 1T1VA 4K7IA 4K7NA 5IOXA 4N0ZA 4MF6A 1K0OA 4ZXGA 4HI7A 1GNWA 2G0FA 2O85A 3KMNA 3F6DA 1WMJA 2VL2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite