3L9SA

Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium dsba
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
185
structure length
185
Chain Sequence
ISDGKQYITLDKPVAGEPQVLEFFSFYCPHCYQFEEVLHVSDNVKKKLPEGTKMTKYHVEFLGPLGKELTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEAVQKTQTVQSAADIRKVFVDAGVKGEDYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADLQLQGVPAMFVNGKYQINPQGMDTSSMDVFVQQYADTVKYLVDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural and functional characterization of three DsbA paralogues from Salmonella enterica serovar typhimurium
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 67
structure length 185
sequence length 185
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2010-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3l9sA00
4MPFA 1I9DA 4F0BA 3H93A 3QD9A 3I69A 4EO3A 1K3YA 2VL2C 3G9BA 3HZ8A 3TKSC 3FZ4A 1BJXA 3GL3A 2EIQA 1GUHA 4POMA 2AAWA 1GSQA 2IIYA 2QKEA 2CV4A 1DE1A 3KH9A 4J56E 2HFDA 1AUCA 3EINA 4MDCA 2CX4A 3H4KA 2CX3A 4HUAA 2GS3A 3TOTA 1SJIA 3EE2A 1TP9A 5DJMA 4ZB9A 3IAS2 4PNFA 4IP6A 2GZPA 2DJ3A 2HSHA 1DUGA 1A8YA 5LD0A 3LXTA 3H1NA 2M46A 3ZLPA 3HJOA 2NBSA 3GX8A 1CQHA 3E9JB 1M9AA 1YEXA 4X1UA 2H0IA 2C0GA 4I5QA 3UVTA 1F9MA 4MF6A 2H0GA 3WT1A 5ELGA 3GMFA 1E2YA 1ZGNA 3QAVA 1Y25A 2ZUPA 1X9WB 3DGQA 4MCUA 2GQMA 1R4WA 2XPDA 1ZCPA 2YV7A 4K0GA 3HKRA 4ZILA 3UEMA 5EVOA 1DBYA 1BG5A 1EWXA 1KEBA 1SK0A 1M2BA 2GDRA 2L6CA 1PX6A 2YJHA 3VPQA 1BQ7A 2RM5A 3G7JA 1XVWA 3OR5A 5J3RA 1SK1A 4F03A 1HNBA 3UAPA 1A2MA 1Y6EA 5ELAA 1V58A 3I6AA 5ABRA 2DIYA 1O8XA 1XWCA 1O81A 3KEBA 4I2TA 5IMDA 1PL2A 1W4VA 3KD0A 4WR5A 2E2MA 3NOFA 2HNLA 2DMMA 2YWOA 4F2IA 3QPMA 1ACVA 3C8EA 1J0FA 1EGOA 3TUEA 1EOGA 1X5EA 4XS6A 1S3CA 4ID0A 1B9XC 2H6XA 4PXOA 1K0MA 2R3XA 2Z9SA 2H1AA 10GSA 4BL7A 5JCWA 4PX1A 4ILFA 3GNJA 2YV9A 4FYCA 2HRNA 5KEJA 5ID2B 5ID2A 3ERGA 3HJMA 5H5SA 4CHSA 1YEPA 3ZMKA 3HHVA 1AQVA 4GXZA 6GSWA 3PGTA 4O5RA 3TKSE 4TRXA 3W6GA 3I9V2 1GLPA 2B5EA 3HVSA 2L4QA 5IO0A 4YQMA 3ED3A 1ABAA 2VIMA 4KSOA 5KN0A 4K0NA 2GSSA 3TCOA 2FLSA 5IMCA 3F6FA 3TKPA 4IN0A 1RQMA 2LRCA 3MDKA 2A4VA 2KP2A 4NV2A 5B6MA 2ON5A 3C73A 9GSSA 1GSFA 3LFLA 4NHWA 5H5QA 2WRTA 2GZYA 2V2GA 1JHBA 6GSUA 2V6KA 3TRPA 3LORA 3EU3A 3IK9A 3KMNA 3Q6OA 4TXOA 3JCML 5ECKB 3GURA 1ZZYA 5CRGA 4EUYA 1URMA 1YF1A 4MPGA 1M2AA 5IMFA 3ZVJD 2IMIA 4L5LA 4MH3A 3APSA 2G0FA 1F6MC 1J9BA 4LLRA 2O8VB 4XCSA 1FVKA 5E59A 2CAIA 3UBLA 2RIIA 2K9FA 1EP7A 2DJ1A 1ZYEA 1YDKA 3TB2A 1OC8A 3TRQA 4L0WA 1GULA 3PH9A 2HZEB 2HZEA 3CSIA 1A23A 2M72A 5JCGA 5G30A 4BVXA 5KN3A 3GX0A 1ZYQB 4WBRD 1K0CA 1XPVA 3CSHA 3LQ7A 4WETA 1T4YA 1TI1A 5JWOB 1F3BA 4QL7A 5CAXA 1K3OA 5CNWA 1EOHA 1FVJA 2RLIA 4WXTA 1TRVA 1WP0A 2AUVA 2JU5A 1VF4A 2YWNA 5IQYA 3LYPA 5DQYA 1ST9A 2HZFA 1AW9A 3FYGA 2YPMA 1VF3A 2CVBA 2VD1A 3DIEA 4JU5A 2I3YA 1XOBA 3LGCA 1VGLA 3VWVA 2NDOA 3FHKA 3WT2A 1TW9A 3F4TA 4EF0A 3TOUA 4Q5NA 1JLVA 3QFAC 4ZIJA 5CP1A 4LL1B 2LSTA 1THOA 4IQ1A 5IIZA 1PN9A 1B4PA 3IBHA 2R2JA 4N30A 3GTUB 1EEJA 3GTUA 3TRXA 4JEDA 2YZHA 5H5RA 4NWYA 2VLVA 4IQAA 2YJ7A 3HXSA 3DEXA 5HFKA 2N5FA 4HQZA 3TJFA 2F8FA 1X5DA 1Z7PA 4POBA 17GSA 2B1LA 3GL5A 4CW9A 3HVXA 2B7KA 4GSTA 1BX9A 1HD2A 3E3EA 2MMOA 5J5NA 3SWLA 1F2EA 4TR1B 5E4WA 2WB9A 4PQHA 5ECIB 1S3AA 2MMZA 3LWAA 5F8BA 3A5WA 3EURA 2N5AA 2WDUA 3LYKA 1SYXA 2H0HA 1MEKA 1W89A 2FA4A 4GSNA 4PUAA 6GSTA 2OBKA 1TDIA 2K8VA 1S3DA 4KDYA 1B8XA 2L6DA 1R5PA 2HI7A 1ON4A 3HVVA 1WIKA 5HR1A 2LNSA 2WCIA 3HJPA 1OKDA 2X99A 1E6BA 1K0BA 1T3BA 1B9YC 2H6ZA 3DRNA 1TK5B 1GSUA 4MA9A 1OE8A 4OFNA 3A2VA 3TJBA 4I2UA 5A4UA 1XBSA 2GSRA 3PR8A 4O32A 1LU4A 4AJ7A 3UL3A 4TN8A 1GSSA 3GH9A 3N5OA 5DCGA 3ZIVA 5IMVA 2LJRA 2H30A 1SJZA 1WOUA 5B8BA 4AJ6A 2B5XA 4L5OA 5HR2A 2X8CA 2FCHA 4J2FA 1EV4A 4BWQA 5DALA 3ISOA 1WPIA 3KM6A 1Z6MA 4MF5A 1LBKA 5HFIA 1ML6A 2X8GA 4WKWA 3Q74A 3GKKA 3FK8A 1WJKA 2DSAA 1GNEA 4DEJA 4YQUA 2KUCA 3KTBA 2N5BA 2O87A 3UBKA 1TRUA 2I4AA 4E8HA 13GSA 2FA8A 4EE0A 4POLA 2L5LA 2NTOA 2JL4A 2DJKA 3IXRA 4N11A 4IJ3A 4G10A 1GLQA 4XRDA 1XW6A 2HRFA 5CRWA 4NMUA 2GT5A 4LA1A 1X5CA 3L78A 1QFNA 2JZSA 4JR6A 2VL9A 4BPYA 3VPTA 5F07A 2H71A 4KW6A 2PWJA 3EVIA 3HDCA 2JACA 4N10A 3M1GA 4OMVA 3FEUA 5FWGA 1TRWA 1EEMA 4GSSA 4PQIA 2FGXA 1O6JA 4TXVA 5HQPA 4ECJA 1QK8A 2J23A 4ECCA 4HEA2 4KCEA 4BA7A 1SJ6A 2LTKA 3UOMA 4FIWA 1U3IA 1A0FA 5IO2A 2L57A 1YF0A 4OFTA 3HZ4A 4D73B 3F6DA 4D73A 4AGSA 1G7EA 4N0VA 2B7JA 5D8IA 1GP1A 1WMJA 1GUKA 2CZ2A 2CA8A 2AYTA 2AV4A 4ZXGA 3C7MA 3FZ9A 3ZRDA 3DYRA 4IHUA 3HA9A 3Q18A 2DBCA 2I81A 3CYNA 5FT3A 3F3QA 3DD3A 3F0IA 3IAM2 1B48A 4EXJA 1A8LA 1G6WA 1A2LA 1IYIA 3ZYWA 3HCZA 3EC3A 1SD8A 3BOAA 2VCWA 2LKUA 5AISA 3P8WA 5D9XA 5C04A 1GSYA 2R37A 2GQKA 1V2AA 3HY2A 6GSVA 1GWCA 1XIYA 2B1KA 2MMNA 1V9WA 2IN3A 3IHQA 4KAEA 1VF1A 3EMPA 1H4OA 2H75A 2V6OA 4ZBDA 1TK0B 3HD5A 3EYTA 2LUSA 1KTEA 4YQVA 3J7Yk 1VF2A 5AN1A 3U5RE 1C72A 4F82A 2KP1A 1Q4JA 1U3AA 5A4VA 3DVXA 4BVYA 1GSEA 5KN2A 4NXIA 3UARA 4HI7A 4V2NA 3ERWA 4EDZA 1O7UA 2K18A 1GTIA 4GQFA 1FAAA 2OA7A 4YAVA 1OE7A 3KP9A 2F3MA 3VURA 1O85A 3M8NA 4IW9A 2K6VA 2H73A 2L4CA 1SYRA 3GYKA 4EL1A 4XS1A 1QQ2A 3J7Yb 2IL3A 2OJLA 1GUMA 3DKSA 4G2EA 5HR0A 4GQCA 4MF7A 3VI5A 1HNAA 5D73A 1PKWA 2C0DA 5A5KA 3CMIA 2GVPA 4KB3A 4MH2A 1XFLA 2FY6A 2B6MA 2J9HA 3G7YA 2IMEA 4HS1A 4KX4A 2VCQA 3QOUA 5GAPD 1ZOFA 3D5JA 4MK3A 3C1SA 1QMVA 2AB6A 3ZVJA 2H66A 3CRUA 3RHBA 1BYEA 3IRAA 4IJIA 5CRDA 1DE2A 3KP8A 4K1FA 2VM2A 1O8WA 3P90A 3FR3A 2FWEA 5ENUA 2EIRA 4IKHA 4TW5A 3HYPA 4MABA 2B5YA 3O76A 3APQA 5JWRB 1R7HA 1PL1A 2CQ9A 1AIUA 5ECQB 2H1DA 3BCKA 1N2AA 1X9SB 1HYUA 2IFQB 2IFQA 3C71A 2VOCA 3GFKA 2WULA 2LRTA 2PN8A 4X0XA 5AIVA 2K8SA 1ZMAA 1I5GA 3APOA 4RI6A 1XCCA 1M7TA 3CRTA 3P7XA 3ME8A 2C0EA 2MYGA 2YN1A 4MLYA 2HLSA 1U88A 5IMAA 3TKQA 2FWHA 2XPEA 3KTLA 1EP8A 5D9TA 1XVQA 2EIOA 3U6VA 2TRCP 4PUFC 1SK2A 4G9HA 3CXGA 5ECPB 1VRSD 2CVDA 3GRXA 4XHMA 3D4MA 4QQ7A 1V98A 5JCUA 2MZCA 4DSSB 5A4WA 4DSSA 1ERTA 14GSA 5B7CA 2HT9A 2PUKC 2QC7A 2ON7A 4ML6A 1HQOA 2F9SA 4RUVA 1TU8A 2HYXA 3FW2A 3M9KA 1NSWA 3IE3A 1TRSA 1O73A 3TDGA 2FD3A 4IGJA 2LS5A 4HDEA 5IM9A 3F9UA 3KJYA 2GT6A 2C3QA 2CAQA 4FYUA 1CQGA 4MJAA 2MBTA 4FH8A 2H19A 4NHZA 4HU9A 4KDXA 4Z7XA 3PINA 2FWGA 5GSTA 4V2MA 6GSXA 5ECMB 1MD4A 2WZ9A 2YCDA 2VAFA 4OCFA 1Z7RA 1U6TA 1JZWA 2C3TA 3KZQA 3RPNA 3GKNA 4WR4A 4PQ1A 4G19A 4TR1A 1Q98A 1FB6A 5L71A 5EPFA 2OBIA 3DVWA 2OADA 1IYHA 2REMA 3TJGA 1XW5A 2OE1A 4KSMA 4MZCA 3L0HA 4GF0A 3AY8A 1GTUA 5DBQA 2VCTA 3QR6A 4K8MA 4Q5QA 2LQOA 4ZB8A 4J57E 2P5QA 4ECBA 3W8SA 3CBUA 4HZ2A 4KDUA 4HQSA 1AXDA 3QDNA 2XBQA 4F9ZA 2ALBA 2G2QA 2C8UA 2B3SA 1OKTA 1NHYA 4PURA 5IPHA 2O85A 1DSBA 1PA3A 3KIJA 1K0NA 3A3TA 4TVEA 2ES7A 1Z3EA 1K0AA 3QMXA 1ERUA 3F4SA 1T4ZA 5D9VA 2A2SA 2YWIA 3KH7A 3LXZA 1Z5YE 2VCXA 1TXXA 4V1Ag 2DIZA 1X9MB 1TJDA 3VWXA 4ZL9A 2H74A 1YY7A 2D2ZA 2H6YA 5ECHB 2X8HA 4K7NA 5J41A 4OO4A 1JZRA 3GA4A 4K7OA 4ULXA 2C3NA 1F3AA 3Q19A 3MAKA 4KA0A 4MJCA 3F63A 5GZZB 3R2QA 2F8AA 5IOWA 1U87A 2H1BA 1T00A 1JZDA 4AF2A 3LJRA 2WGRA 1XXUA 5D96A 1TK8B 5CO3A 3VFIA 5CYYA 2OACA 1Z6NA 3DXBA 2VCZA 1PD21 3NIVA 2H76A 2GLRA 2JZRA 3IV4A 4JR4A 3ZTLA 5CREA 3ZREA 2DJJA 1SKSB 5EY6A 5G1LA 1PSQA 2PPTA 2R6KA 5DVBA 5C00A 1ILOA 3DWVA 1JFUA 1FW1A 3LEFA 1XOAA 4OFMA 2NVLA 1AC1A 3IC4A 3N9JA 4RQRA 2LRNA 4X43A 2JSYA 3IOSA 3ZL5A 3KCMA 3GV1A 4EDYA 2GTUA 3KMOA 4JBBA 3IA1A 1JZOA 4XS4B 4DVCA 2GSTA 2E0QA 1UN2A 1G7OA 4K9ZA 2CZ3A 2ZCTA 4Q5FA 2EC4A 2C1YA 5F0GA 3VK9A 2VUPA 1OVNA 2JZTA 1SKRB 3FRCA 1FO5A 4KCAA 1R26A 5ECSA 2DLXA 5IPGA 5B6NA 4NPBA 3I43A 2P5RA 2HSYA 1SL0B 3D0ZA 3L9VA 4QL9A 5ECNB 1MTCA 3UJ1A 3D21A 3QFBC 3GSSA 1JLWA 4OCEA 5FHIA 4EC0A 2MMAA 2JADA 5DCHA 3UVHA 1M0UA 2C80A 3CSJA 2NPBA 1G0TA 2RUEA 2PBJA 4BWSA 4ISDA 3BJ5A 2PMTA 5F05A 4LMWA 2WFCA 3GH6A 1RK4A 1GRXA 4LMVA 4V1Ap 1FG4A 3UMAA 2OKAA 1TOFA 3D22A 1KNGA 3TJJA 4OD7A 2PVOC 4L0UA 3FY7A 2TIRA 1XW9A 4GCIA 3MNGA 3KXOA 5AGYA 4O7HA 2VL3A 5COHA 4JZQA 1QGVA 2IJYA 4EKZA 2F51A 5ECOB 1RW1A 1ERVA 1TTZA 3WYWA 4GLTA 1XWBA 2XBIA 4TR3A 3DMLA 4HOJA 2CT6A 1BAYA 2ZNMA 1OAZA 3M0FA 1X0RA 4JE1A 2C4JA 3TJKA 4MZWA 1MD3A 3UIWA 5EL8A 5D93A 1NW2A 1YQ1A 3WGEA 3D4TA 2CVKA 18GSA 2HXKA 1HNCA 2MBSA 4F0CA 1FOVA 1LJRA 3H8QA 5G5FA 2YP6A 4WBJA 20GSA 3BCIA 1SD9A 5J4UA 2E2GA 2GGTA 1H75A 4IP1A 3WGDA 2C0FA 22GSA 2V41A 1SL1B 4DSQA 4ZL7A 3O3TA 3IDVA 1N8JA 2L5OA 2O89A 2VLUA 2VO4A 4RI7A 3FZAA 5LCZA 2X64A 3L4NA 2L59A 2PGTA 2H01A 3MSZA 3SBCA 2M80A 3RHCA 3NZNA 3ZZXA 3G7IA 4P3YB 1UA5A 4AJ8A 2R5GA 1EV9A 1TU7A 5G2ZA 5IMZA 1TI3A 2GZZA 4I6XA 4IELA 2LJAA 4HJMA 4NV5A 4MJBA 3FKFA 3VI7A 4RQXA 3GUSA 1M9BA 4L8EA 1WWJA 1T7PB 1GNWA 1UVZA 2FHEA 4IBPA 4V2LA 3QCPA 1T1VA 3A2XA 3CTFA 3IK7A 2DC5A 2IWTA 3GKMA 2XC2A 4K6XA 2R4VA 5DQSA 1PMTA 4MMMA 1ERWA 4I97A 3BBYA 5D9WA 3W8JA 1MDKA 4JRRA 2XHFA 4TXOB 4XRAA 2PVQA 3O6TA 2V1MA 1Z9HA 1MDJA 5JWQB 3FR6A 4GTUA 2WJUA 11GSA 2V32A 5G31A 1PQNA 1OYJA 2TRXA 4N0ZA 19GSA 2FUG2 5IOXA 2PERA 4PGTA 16GSA 1SENA 1A2JA 3RDWA 1GTBA 2OE3A 1FHEA 2OE0A 4FYBA 4E8EA 4ECIA 3F3RA 1OC9B 1OC9A 1XWKA 3RPPA 1A0RP 2I9HA 1XWAA 2H70A 2PU9C 5J9BA 1K0DA 6GSSA 3VLNA 1WE0A 1MDIA 1F37A 2DJ0A 4ACSA 3RBTA 2IMKA 5G5EA 2BMXA 4YH2A 2VM1A 3ME7A 3ZFBA 1PRXA 5DDLA 2H72A 1TKDB 2LEGA 3QAGA 4H86A 5J9CA 1A24A 1OC3A 4GRFA 1NM3A 5B8AA 1BEDA 5INYA 4ML1A 4TKYA 4CDOA 3GN3A 2YWMA 3WGXA 4PNGA 7GSSA 4EVMA 2VD0A 1YKCA 1ZL9A 2KHPA 1R5AA 1EZKA 1FB0A 4WF5A 2E7PA 4Q5RA 3EWLA 2I1UA 4LL4B 2IMFA 3KGKA 4TR0A 4I8BA 4WF4A 3F8UA 3M3MA 2YNXA 3H79A 5DAKB 4HZ4A 5DAKA 3FZ5A 1NHOA 2A2RA 2GSQA 2KLXA 1XWGA 1GH2A 4HJ2A 1PKZA 5AIXA 3A2WA 2BJXA 4HU7A 3RAZA 4K2DA 3ZITA 1THXA 4KH7A 2LQQA 2P0GA 2DJ2A 3L9SA 1XZOA 5DJLA 4ZBAA 2QSIA 3FR9A 3US3A 1WRYA 2O7KA 1USBA 1AQWA 4K7IA 3K8NA 1AQXA 4KNDA 2IPAA 5HR3A 4ZB6A 5G1KA 1V40A 1SKWB 4FO5A 2AHEA 4YAPA 3ERFA 1SL2B 4POKA 1SU9A 4TR4A 4TOPA 1K3LA 1K0OA 2VCVA 3BD2A 3GHAA 3F4RA 1EGRA 1J08A 4XTSA 4NAXA 3CTGA 2YZUA 2H1GA 2WS2A 2HE3A 2LV3A 5GSSA 1YJ6A 3M9JA 2AJQB 4OO5A 4MP4A 3EMXA 1YKAA 3GIXA 2H8LA 3EU4A 2JSZA 5ECLB 1G6YA 4IVFA 3WD6A 2YANA 3GKXA 2LNTA 1PX7A 2RM6A 4KUNA 4XIHA 2FNOA 2BTOT 4ZBBA 3IR4A 3VWUA 1B4QA 3E0UA 1AAZA 1GTAA 2DMLA 4MJEA 2LJKA 3V1WA 2VL2A 1M2DA 3TKSA 4IS0A 3GSTA 3TGZA 1GSDA 5DALB 5GAND 2RUFA 2GQLA 4KGIA 3LG6A 1QUWA 5CRHA 1GL8A 3ZIJA 4WEYA 12GSA 3LSZA 5HFGA 1QXHA 3ZFLA 3L9UA 4MZBA 3S9FA 2IMDA 5KN1A 5LNKe 3ZMLA 4KE3A 8GSSA 2YOIA 2P31A 6GSYA 2FWFA 2VLTA 3C1RA 2KOKA 5ECRB 1YZXA 2QGVA 3TKRA 1KBNA 4DSRA 3QAWA 4OWYA 1UC7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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