3L9SA

Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium dsba
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
185
structure length
185
Chain Sequence
ISDGKQYITLDKPVAGEPQVLEFFSFYCPHCYQFEEVLHVSDNVKKKLPEGTKMTKYHVEFLGPLGKELTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEAVQKTQTVQSAADIRKVFVDAGVKGEDYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADLQLQGVPAMFVNGKYQINPQGMDTSSMDVFVQQYADTVKYLVDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and functional characterization of three DsbA paralogues from Salmonella enterica serovar typhimurium
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule tags Oxidoreductase
total genus 67
structure length 185
sequence length 185
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2010-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3l9sA00
4K0NA 1VGLA 1YY7A 4NMUA 4PUFC 2CAQA 3M9JA 4XCSA 1Q4JA 4EVMA 2ZUPA 4XS4A 1SL1B 2CT6A 5F06A 3UOMA 2PBJA 4WR5A 2V1MA 4XRDA 4KSOA 4TXOB 3BD2A 5DCHA 3RPPA 4DSQA 4F0BA 2X8CA 9GSSA 1TU8A 4IJ3A 5D96A 2H66A 1G6YA 2EIOA 2P0GA 5LCZA 2B7KA 1V2AA 5FHIA 2Z9SA 1I5GA 1ON4A 3UBKA 4P3YB 2N5FA 5IMZA 4KX4A 2GT5A 1SD8A 2YWIA 3PH9A 5HR0A 13GSA 4KDXA 2F51A 2VM2A 5C04A 1ZYQB 1XVWA 3HJOA 4TR3A 2CX4A 1M9AA 2AB6A 1AW9A 2WZ9A 2VIMA 5KEJA 4JBBA 3FHKA 3A2WA 1EGOA 1ZYEA 1GTIA 4JRRA 4AGSA 1ZZYA 1B9XC 3M3MA 1K0DA 4XS1A 5EPFA 3VURA 5J41A 3GL3A 1PX7A 3TJKA 5KN2A 1T4YA 2XBQA 2O89A 4MA9A 4G9HA 3UBLA 1A0RP 3TOTA 3FZ4A 5ID2B 3VK9A 3VLNA 3WGEA 2IJYA 1TK0B 1TJDA 1AXDA 3TJGA 2WDUA 3ME8A 4V1Ag 2DJ1A 1MDKA 4KA0A 5ECIB 2VUPA 2VCTA 1CQGA 2CZ3A 4PURA 5D9VA 3WGDA 3Q74A 1EP8A 3FRCA 2YPMA 5IPHA 5INYA 1PGTA 2ALBA 1W4VA 3HZ8A 3IK9A 2FA8A 3QFBC 3DEXA 5AIVA 1GSYA 4PXOA 4DVCA 2GGTA 3VWUA 2YWOA 1OE7A 1AC1A 1Z6NA 2OACA 3BJ5A 4YQMA 1F9MA 2G0FA 4JR6A 3GX0A 2I1UA 1O73A 4FYBA 2DJJA 1JZOA 3RPNA 5J3RA 2K6VA 2H0GA 1PX6A 4IVFA 4TN8A 4KAEA 3ZMKA 5IOWA 1XZOA 1MTCA 12GSA 1WE0A 4L5OA 4L8EA 4D73A 2JL4A 4KNDA 4F03A 2O85A 1XBSA 4HZ4A 3KH7A 2VLTA 1R5AA 2ES7A 4GWRA 2VL2C 2MMNA 1BEDA 1H75A 2JU5A 3HA9A 4EUYA 3D6IA 2IPAA 4BA7A 3WT2A 1A2JA 5IMCA 1YEPA 1FAAA 2VAFA 4TOPA 1DSBA 3ZIJA 5B6NA 4XS4B 3DVWA 3L4NA 1TKDB 2IMFA 4X43A 2HZFA 2MBSA 1PKZA 2J9HA 4LLRA 1GLPA 1SK2A 1WPIA 3QAGA 4WF4A 2CVBA 1ZMAA 1ACVA 1F3BA 1K3LA 4MP4A 1X0RA 3MWHA 2L5LA 4GSSA 3IHQA 1HYUA 2JZSA 1SKRB 4KUNA 4Q5NA 4GF0A 1TTZA 4K7OA 5IMDA 3F4SA 1JZWA 5A4VA 3L0HA 4HQSA 1VF1A 2H0IA 3EYTA 2JADA 2LEGA 4JZQA 3IAS2 3DMLA 2J23A 5IM9A 2B7JA 2IMIA 3FZ5A 3TKSA 2AV4A 5DQSA 4I8BA 4DSSA 5IPGA 1WRYA 2QKEA 1M0UA 1OC9B 3GKMA 2RM5A 1GTBA 3UL3A 3KMNA 3E9JB 5J5NA 4TKYA 1XXUA 1A24A 4EDZA 4N30A 1TXXA 5DALA 1K0NA 2C1YA 4Q5QA 3FEUA 2IMDA 4LA1A 5A4UA 2V6KA 2LQOA 5H5RA 2BMXA 1M2AA 2KP2A 5G30A 2PVQA 2EIRA 1WMJA 1EOGA 5ECKB 2IFQA 2YWNA 3CSIA 3G7YA 1F2EA 1XWBA 1XOBA 3F6DA 1EEJA 2GVPA 3F63A 3DXBA 1MEKA 4KDUA 1O85A 3KH9A 2OKAA 5HFGA 2P5QA 17GSA 4HZ2A 3ED3A 1THOA 2AYTA 2G2QA 1TRWA 3KGKA 2CVDA 4MABA 5DAKB 16GSA 2H75A 1F6MC 2FWFA 1O7UA 5KN1A 2A2SA 1PKWA 4MJEA 3S9FA 1OE8A 2MBTA 3KTBA 2H0HA 1EEMA 1XFLA 2VCVA 1LJRA 5IQYA 1WP0A 3KIJA 2WGRA 4TR1A 2HSYA 4AJ7A 2HI7A 2YZUA 2R3XA 3HXSA 2L4CA 1EZKA 3EMPA 4LL4B 1J08A 4POBA 1K0BA 5HR3A 1TW9A 2ZNMA 4WF5A 2YP6A 5IIZA 2O87A 1M9BA 1Z3EA 5GAND 3ZVJA 3ZLPA 3EWLA 1GTAA 4X0XA 5IOXA 1K0MA 2C0GA 2PUKC 4FIWA 3G7JA 2DMLA 5ECRB 4CW9A 1A2MA 3A3TA 1KBNA 3GIXA 3HJPA 3IRAA 2VL3A 1GRXA 4D73B 2QGVA 4Q5FA 1Z9HA 5CRWA 3DRNA 4N0ZA 4J56E 4TR0A 2OBIA 3PGTA 1LU4A 3PINA 1ERUA 3H79A 3MSZA 3TB2A 2OBKA 3GKXA 2O8VB 1W89A 4GLTA 3TOUA 1EV9A 5D93A 2NBSA 1R5PA 1SYRA 1GSUA 2E2MA 4I2UA 2RIIA 1GNWA 3C7MA 4ZB6A 3DKSA 1SYXA 2I9HA 2C3NA 4E8EA 3M9KA 1U3AA 22GSA 1RW1A 1QUWA 3UVTA 3ZFBA 3DD3A 3C1SA 3CYNA 4XTSA 3UEMA 2OA7A 2LRTA 2F8AA 5D9XA 5H5QA 4MF7A 3I6AA 5FT3A 4DSSB 3FKFA 3SWLA 1GSEA 1M7TA 1YJ6A 5D9TA 3L9VA 4IN0A 3GKKA 3F8UA 1V58A 3CRUA 5JWOB 4KH7A 5J9CA 3C73A 4XS6A 4MJCA 2AHEA 1J9BA 5DALB 4J2FA 1MD3A 3FK8A 4K1FA 4Q5RA 1TRSA 2FHEA 1XWKA 2B5XA 3KMOA 1SKSB 1FW1A 4ZBAA 1XIYA 3GKNA 1RQMA 2CV4A 4IJIA 1BAYA 1OYJA 3M8NA 2IFQB 1EWXA 4GRFA 20GSA 4JEDA 1TP9A 4ML1A 2V6OA 2H6ZA 1T00A 4WR4A 3LQ7A 4K2DA 2VOCA 3TKPA 2D2ZA 1JLWA 2AJQB 2DJ0A 4OFNA 1KEBA 3EURA 1Y6EA 2JACA 2BJXA 2HXKA 4ZXGA 4ECJA 3UARA 4K7NA 1F3AA 1I9DA 4MF6A 3C71A 1FB6A 4KW6A 4TR1B 2IL3A 1KNGA 1URMA 3Q18A 1U87A 4NV5A 1G7EA 2V2GA 3ZYWA 2V32A 2VM1A 5B7CA 4OD7A 4BVYA 2F3MA 4KGIA 3ERGA 3KTLA 1TOFA 4FO5A 1QQ2A 2DLXA 1XPVA 4MK3A 4MH3A 1VF3A 5ECQB 3TCOA 2E0QA 1BJXA 4HDEA 5HFKA 1QXHA 7GSSA 2WULA 3CMIA 2VCXA 3GHAA 3SBCA 6GSUA 1Y25A 3IA1A 3M1GA 5LD0A 2HFDA 2WCIA 4DEJA 1B9YC 5CP1A 2OE1A 3HCZA 1PL2A 2A4VA 1X5EA 2PPTA 1V98A 3US3A 4PNGA 2FLSA 5ENUA 2GSRA 1E2YA 1KTEA 2OADA 4NXIA 3IK7A 2GSSA 6GSSA 5KN3A 1A23A 2OE0A 2YOIA 3W6GA 11GSA 5EY6A 1X5DA 3GYKA 3WT1A 4K0GA 19GSA 1SK1A 3BCKA 2CQ9A 2KLXA 3F6FA 4XHMA 4CHSA 2H1DA 3Q6OA 4G2EA 2WJUA 3CBUA 2C0FA 4YAPA 1AQVA 3TKSC 3MDKA 3TJBA 2L5OA 4WEYA 1FVKA 4LL1B 1SKWB 4L5LA 4WXTA 3D5JA 1EGRA 1ML6A 1BYEA 5IO0A 3UIWA 1FG4A 1O8WA 2H1AA 3H93A 3ME7A 1XW9A 2MYGA 2PU9C 1ZGNA 2GQMA 4HOJA 2H30A 4RI6A 4JU5A 3ERWA 4TRXA 4PX1A 4AF2A 5DJMA 1VF4A 2QSIA 3A5WA 2DMMA 2NPBA 1QGVA 1PA3A 4EO3A 1MDIA 1SJIA 1TU7A 2ON7A 5ABRA 3ZL5A 1J0FA 4V2LA 2GZPA 2GSTA 2M80A 3H4KA 1K3OA 3APQA 1ZCPA 18GSA 3GTUA 4GSTA 2H6XA 1GSFA 4MDCA 3HJMA 3OR5A 2H70A 2HSHA 2X99A 4NAXA 4ECBA 2FUG2 4PQIA 1XVQA 3UAPA 1YQ1A 2GSQA 2IIYA 1B8XA 4WBRD 2R2JA 5A5KA 2TRCP 3LXTA 4V2NA 4ECCA 1DE1A 5ECNB 1V40A 3C8EA 4LMVA 1YEXA 3CXGA 3DWVA 2H1GA 5B8AA 1PN9A 1ILOA 1HQOA 1O6JA 3LJRA 3D0ZA 3WD6A 1V57A 2LRNA 5CO3A 1E6BA 4HJMA 4J57E 4ACSA 2JZTA 3FR6A 4PNFA 1Z7PA 14GSA 1OVNA 4I97A 3D22A 4GQFA 2X8GA 4IQAA 3KEBA 3KP9A 2KUCA 3RHBA 3ZFLA 2BTOT 4N11A 3IXRA 4KCEA 1FHEA 3HVSA 3N5OA 5KN0A 3ZIVA 2VO4A 3VWXA 1X5CA 3ZZXA 2XC2A 2B5YA 4V2MA 1O81A 2GZZA 3DYRA 4IP1A 5JWRB 2H8LA 4ZBDA 1WOUA 1N2AA 3VPTA 1X9SB 1X9WB 5AGYA 3IPZA 2CZ2A 4L0WA 2HRFA 3EC3A 1ERTA 4WBJA 3F0IA 1NM3A 4O5RA 2HYXA 1NHYA 5A4WA 1GUKA 5CNWA 4GTUA 4X1UA 3VPQA 1EP7A 2DSAA 2QC7A 2GLRA 2O7KA 2PMTA 2LV3A 1AUCA 3EE2A 1GP1A 3WYWA 1GULA 2VCZA 3KD0A 3CTGA 3HDCA 4MZCA 3VI5A 2GTUA 4NWYA 4L0UA 2RUFA 2DJKA 4IHUA 4N10A 3GUSA 4MMMA 2YN1A 3KZQA 6GSVA 4IP6A 3QPMA 1VF2A 3GX8A 2RLIA 1GSDA 3TJJA 5ELGA 4PQ1A 4F2IA 4YQUA 3F3QA 1XCCA 3QOUA 2KOKA 4HS1A 4GXZA 2REMA 4ZILA 2PN8A 3TRXA 3PR8A 4KDYA 6GSWA 2YNXA 4OWYA 4MPGA 5ECOB 3V1WA 1K0AA 3Q19A 5IO2A 2C0EA 1SK0A 5DJLA 4MZBA 2ZCTA 1A2LA 4EXJA 1VRSD 5IMVA 1HNCA 1F37A 3GRXA 2H71A 1PD21 2LUSA 1TRUA 4K9ZA 4NV2A 2TIRA 2CA8A 1JFUA 5ID2A 1LBKA 3TDGA 5J4UA 1V9WA 1GLQA 3EINA 5JCUA 5GZZB 2HNLA 3GTUB 2OJLA 2XPDA 1SD9A 2PGTA 2FWGA 5F05A 4YAVA 2X64A 1B48A 3W8SA 3P90A 3P8WA 3LYKA 4ZL9A 1R7HA 1ZL9A 1NHOA 3D4MA 5G1LA 5JCGA 1JZDA 1UA5A 2V41A 1GUMA 1TI3A 4KSMA 1N8JA 3NOFA 5HR2A 1MDJA 3VFIA 1BG5A 4PGTA 2C80A 3ZVJD 5E4WA 4ZL7A 3HD5A 1FVJA 4ZB8A 1OKDA 3UVHA 2IMEA 1S3CA 4ZB9A 2MMAA 3ZTLA 2YV7A 1BQ7A 3KCMA 1PSQA 4QQ7A 3VI7A 3GA4A 2GZYA 4I2TA 3EU4A 1TI1A 1U88A 4AJ8A 2YJ7A 4ULXA 3LORA 4QL9A 2YJHA 1AAZA 1JZRA 3LFLA 3I9V2 5AISA 1OAZA 5DVBA 4FH8A 3AY8A 3BCIA 2H01A 3QFAC 4ML6A 4POLA 2LSTA 2DJ2A 3HZ4A 3BBYA 2B1KA 4ZL8A 1FOVA 2HZEA 1QMVA 5ECMB 4KB3A 1R26A 2DC5A 2WFCA 2I81A 4EDYA 3GSSA 1EV4A 1Z5YE 4K6XA 2FCHA 4YQVA 3TRQA 1EOHA 3GSTA 1FB0A 2K8SA 1ERWA 1T1VA 3F9UA 1GNEA 1GTUA 2FWEA 4G10A 1T3BA 5GSSA 3IBHA 3HVXA 2MMOA 1SL2B 1BX9A 2LS5A 3CRTA 2N5AA 4MJBA 4ECIA 3QCPA 2GT6A 1Z7RA 3A2XA 5EVOA 4BVXA 3RDWA 4XRAA 3TRPA 4OCFA 3VWVA 2TRXA 3QMXA 2KP1A 3L9UA 1B4PA 5G1KA 1U6TA 2YZHA 2JZRA 2LQQA 3F3RA 2VCQA 1R4WA 1YF0A 3ZRDA 5CRGA 3DGQA 5G5FA 4CDOA 5F07A 3GV1A 5DDLA 4ZIJA 1H4OA 4IQ1A 3APOA 2XPEA 2FY6A 2NDOA 4EKZA 2L57A 1SJZA 2P5RA 1XWGA 3QD9A 1GSSA 3L78A 3L9SA 1OC9A 1IYHA 3D4TA 2CVKA 3IOSA 2RM6A 1TK8B 2M46A 3BOAA 2R37A 2FD3A 2B1LA 1SJ6A 3N9JA 3HKRA 3I69A 1HNAA 4PUAA 2L6CA 2E2GA 3TGZA 2K18A 3QDNA 4O32A 4PQHA 5DCGA 1T8EB 4G19A 4ZBBA 2K8VA 5C00A 3U6VA 3NZNA 3LSZA 4MF5A 4RQXA 3MAKA 1ERVA 1YKAA 1PQNA 3W8JA 4HJ2A 1A8LA 3ISOA 5IMAA 1GUHA 4GSNA 4LMWA 4F0CA 3O3TA 3FW2A 8GSSA 2CAIA 3WGXA 5CAXA 2P31A 5DAKA 4OO4A 5ECHB 2YCDA 4F9ZA 5ECPB 2IWTA 3KXOA 4E8HA 1XOAA 2L4QA 3LWAA 1SU9A 4IKHA 1TRVA 4RQRA 1YF1A 3VWWA 1OC3A 3ZMLA 3D21A 2VLUA 2H19A 2JSYA 1G6WA 2MMZA 2DBCA 2PERA 4HU7A 4ILFA 5CREA 1PL1A 4NHZA 5D73A 5F0GA 4FYCA 4NPBA 3F4RA 2NTOA 1XWAA 2GDRA 2H76A 4RUVA 3E3EA 1K0CA 1X9MB 1K3YA 3UJ1A 4OFTA 2RUEA 4O7HA 5G31A 4IS0A 3H1NA 5IMFA 2KHPA 1GH2A 4FYUA 3FR3A 2AAWA 4KE3A 2GQLA 4F82A 2HZEB 3GL5A 3CSJA 2A2RA 4JR4A 3FY7A 5JCWA 5DQYA 5L71A 4AJ6A 2HLSA 2MZCA 3GH6A 2EC4A 5D8IA 1DE2A 3TKSE 3UMAA 5HQPA 2LJKA 3KP8A 1XW5A 1CQHA 3EMXA 3CSHA 5AN1A 2C4JA 4OFMA 1O8XA 2HT9A 3E0UA 1HNBA 2L59A 5CRDA 3O6TA 1RK4A 1DBYA 5E59A 2OE3A 4MCUA 2F9SA 4H86A 3GFKA 3O76A 3TUEA 2EIQA 3RAZA 2K9FA 4GCIA 2NVLA 3ZREA 5ECSA 1M2BA 4V1Ap 4KCAA 2GS3A 5GSTA 4N0VA 1A8YA 5G2ZA 1M2DA 5HFIA 1WWJA 3DIEA 1UN2A 3LYPA 4OMVA 2LKUA 5D9WA 4MLYA 2JSZA 4DSRA 2YANA 4XIHA 1AQWA 1SL0B 5COHA 3IAM2 6GSTA 4POKA 4GQCA 2VL9A 2LJAA 2M72A 1YDKA 2C8UA 1NW2A 1OKTA 4I6XA 1Z6MA 2PVOC 2B6MA 3TKQA 3R2QA 4O92A 3GURA 3IC4A 2LNTA 1HD2A 2I4AA 1K0OA 2VL2A 5ELAA 2HRNA 3J7Yb 4RI7A 4EC0A 1A0FA 1ST9A 3GMFA 1GWCA 2C0DA 3FZ9A 4TXOA 3DVXA 4BWQA 3HHVA 3HVVA 3C1RA 5G5EA 1AIUA 2C3TA 5J9BA 1G0TA 3NIVA 4NHWA 3GH9A 2YV9A 2DIZA 2DJ3A 3APSA 2CX3A 1YKCA 2H1BA 2IMKA 1GSQA 2YWMA 3FR9A 5H5SA 2XBIA 5JWQB 1USBA 1B4QA 5AIXA 4HU9A 3LG6A 3MNGA 3LGCA 4TXVA 4MZWA 1UC7A 4POMA 3IV4A 3TJFA 2C3QA 1T4ZA 10GSA 4OO5A 1MD4A 3F4TA 3H8QA 2FGXA 1NSWA 3K8NA 2LRCA 4IBPA 3ZITA 5F8BA 3IR4A 1XWCA 2WB9A 4MPFA 3LEFA 4MH2A 2N5BA 3G9BA 2H6YA 3M0FA 2XHFA 1FO5A 2H74A 2I3YA 2R4VA 2ON5A 3IDVA 3RHCA 3GNJA 4K7IA 1YZXA 2IN3A 1PRXA 4YH2A 3ERFA 4EL1A 2VLVA 1TK5B 1S3DA 2L6DA 1UVZA 3EU3A 1OC8A 4HI7A 2GQKA 2H73A 3JCML 5CRHA 2B5EA 5DBQA 4IGJA 2FA4A 4TR4A 1G7OA 3RBTA 3U5RE 3G7IA 3KJYA 4WETA 1ZOFA 5GAPD 1JLVA 3I43A 2H72A 4HUAA 2FWHA 4I5QA 1QFNA 2X8HA 2FNOA 3FYGA 3P7XA 3QAWA 2DIYA 2E7PA 2VD0A 2B3SA 3LXZA 5FWGA 4BL7A 4Z7XA 4IELA 3P2AA 5HR1A 1SENA 3FZAA 5CYYA 5ECLB 5B8BA 1XW6A 3CTFA 4EE0A 4BWSA 2WRTA 3EVIA 3HYPA 1S3AA 2HE3A 3KM6A 4ID0A 1T7PB 1WIKA 1IYIA 1Q98A 1TDIA 2LJRA 4HQZA 4HEA2 4OCEA 5EL8A 1QK8A 3TKRA 3HY2A 2LTKA 6GSXA 1AQXA 3GN3A 4K8MA 5B6MA 1THXA 3QR6A 2F8FA 4BPYA 4EF0A 3QAVA 1PMTA 4IW9A 6GSYA 1C72A 2AUVA 1WJKA 2R5GA 2VCWA 4JE1A 1GL8A 2LNSA 1M99A 3IE3A 4MJAA 1JHBA 1U3IA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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