3L9UA

Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium dsbl
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
199
structure length
199
Chain Sequence
ASAFTEGTDYMVLEKPIPNADKTLIKVFSYACPFCYKYDKAVTGPVSDKVADLVTFTPFHLETKGEYGKQASEVFAVLIAKDKAAGISLFDAKSQFKKAKFAWYAAYHDKKERWSDGKDPAAFIKTGLDAAGMSQADFEAALKDPAVQETLEKWKAAYDVAKIQGVPAYVVNGKYLIYTKNIKSIDSMAELVRELATKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and functional characterization of three DsbA paralogues from Salmonella enterica serovar typhimurium
pubmed doi rcsb
molecule keywords Disulfide isomerase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule tags Oxidoreductase
total genus 73
structure length 199
sequence length 199
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2010-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3l9uA00
1THOA 3MDKA 5DALB 1M99A 4EDYA 5DQSA 5H5SA 1BAYA 1A23A 1GSYA 3L78A 3VWUA 3O76A 4H86A 1K0NA 2ZNMA 3FRCA 4V1Ap 2PMTA 1PQNA 5E59A 2XC2A 2N5BA 2A2RA 3QCPA 5J9BA 3TKQA 2JSYA 1XBSA 3H1NA 5AISA 3M1GA 3GTUB 1FO5A 3HZ8A 3DKSA 3HA9A 3CXGA 1MTCA 4K0GA 4ECJA 1J9BA 3Q6OA 5CRDA 1A2JA 4OCEA 3I69A 1KEBA 3F3QA 3EE2A 4MMMA 1TU8A 16GSA 4KGIA 4P3YB 4E8HA 2HZEB 2MZCA 2VM2A 3IRAA 3LWAA 4GWRA 2ES7A 1GNWA 4MF7A 1RQMA 4XS1A 1TK0B 3E0UA 2H72A 4KA0A 1YF0A 1OC9A 3IDVA 1ERVA 1ZOFA 4TVEA 3QAGA 5H5QA 3HVXA 3KTBA 3L0HA 2HRFA 4J2FA 1J0FA 2GVPA 4EL1A 2YJHA 2VAFA 4GQFA 3ZIVA 4LL4B 3M0FA 5ELGA 2TIRA 2B3SA 4GSTA 5CO3A 3UARA 4NMUA 5CRWA 5ECRB 3FK8A 1Q98A 1OAZA 2I1UA 2IPAA 3LYPA 5H5RA 1O85A 5G1KA 1YEPA 4Z7XA 1IYIA 1A2LA 1G6WA 3DGQA 5G30A 3F0IA 4KUNA 4K6XA 4TR1B 5D8IA 3ERFA 1PL1A 1W89A 1T7PB 2FUG2 2DJ3A 4FIWA 1GSQA 3LEFA 3DVWA 3O6TA 2AYTA 4HEA2 1OE7A 2K9FA 2VCWA 4HOJA 3RHCA 3CSJA 4MABA 4KAEA 4LL1B 1S3AA 3HXSA 3KMNA 4DEJA 4RI7A 3KGKA 4MZWA 1ZZYA 2LUSA 2RIIA 1WPIA 1HNCA 3NZNA 1JLWA 3LSZA 1ZMAA 3GKMA 2LJKA 3R2QA 2JSZA 3APOA 1TXXA 2IIYA 4LLRA 1PKZA 4YAPA 2VOCA 1AQXA 2DJKA 1GULA 3VI7A 3VURA 2YCDA 1Z5YE 3C8EA 2GTUA 2LS5A 3F6DA 5J4UA 1XW5A 5DAKB 3VPTA 5CP1A 4ZBBA 4WR4A 1O6JA 2DBCA 2DIZA 2FNOA 1GLQA 1CQHA 1N2AA 4CHSA 4JE1A 3GNJA 2C3QA 5L71A 4HJMA 2GT5A 1TTZA 1M9BA 4TW5A 4GLTA 1NM3A 4MF5A 3P7XA 3FR9A 3TJFA 3UL3A 1H75A 5HR2A 4ZL9A 12GSA 2H74A 2GSQA 2MMZA 2OACA 1U88A 4I5QA 2C1YA 2AV4A 2HZFA 3UOMA 2D2ZA 3FZ5A 4EDZA 1OC3A 2AHEA 3F8UA 3GKXA 2YZUA 5DDLA 3F4TA 3TJKA 5CNWA 5AGYA 4V2LA 4NXIA 1HNAA 3UBLA 3A5WA 4AJ6A 4BA7A 2WS2A 1GNEA 1I5GA 1F2EA 1PGTA 4G9HA 3VLNA 1SENA 3EYTA 2YV9A 5IMFA 3GUSA 3VWWA 4XS4B 2WB9A 1EV9A 3RDWA 2WCIA 2C0DA 4PNGA 1YKAA 2IL3A 3GA4A 4K7NA 2NDOA 2YANA 2YNXA 3F4SA 4F0CA 1EOGA 3V1WA 5B8AA 1XWAA 3GTUA 2JZRA 1V9WA 5IO0A 2GSRA 2OBKA 4PQ1A 2L5LA 1DE1A 2FD3A 2C3TA 4GXZA 2XHFA 3ZMLA 2LSTA 1SK1A 2F51A 4KCAA 4POBA 4IELA 5D9VA 5DCHA 1YZXA 4BVYA 2QKEA 1ZCPA 2CZ3A 2HZEA 2REMA 2RUEA 4BWSA 3LORA 3KIJA 3F6FA 5FWGA 1ERTA 3TCOA 4K1FA 4YQUA 4OO4A 4EVMA 3TOUA 4OWYA 4I6XA 4ZB8A 4F9ZA 3QDNA 4D73B 3PR8A 5C04A 2R6KA 2CQ9A 3TJBA 4NV2A 1GTBA 4IJIA 1A8YA 3VK9A 3QAVA 5IIZA 1ILOA 3ED3A 5J5NA 4MCUA 2H76A 5AN1A 18GSA 4ECIA 2VIMA 1DBYA 3FZ9A 2DJ1A 1TRUA 4ZILA 4TR1A 4ECCA 2JL4A 3SBCA 4TXVA 1SD9A 2TRXA 1MD4A 1XWKA 1A0RP 3D21A 4TOPA 3PINA 1EGOA 1AAZA 2X8GA 3E3EA 1FAAA 4KX4A 4ML6A 4IBPA 3ZRDA 3RBTA 3APQA 1SJ6A 1SJZA 1TP9A 5CREA 1ACVA 1EOHA 4KDUA 2P0GA 2FGXA 2R37A 3H4KA 3HJMA 1E2YA 1ML6A 3UIWA 4HDEA 3ZVJD 3EURA 4DSRA 3M9KA 2LQOA 1HNBA 2F8AA 5AIVA 4WBRD 2AB6A 1GUMA 5IMZA 2HSHA 1XPVA 1JFUA 6GSWA 5DAKA 2GZPA 5ECOB 1Y6EA 2DC5A 5A4VA 2VD0A 1F3BA 2GSSA 5ECMB 2V6KA 2E0QA 2NPBA 5GSSA 2O87A 2H30A 1KBNA 3GURA 3WGDA 1DE2A 3DMLA 3FYGA 4FO5A 3DVXA 1MD3A 5INYA 2MMOA 2YZHA 1DUGA 3WYWA 1PX6A 5AIXA 2PWJA 3TJJA 1XWCA 1SL0B 1T1VA 2KP1A 4BWQA 2BMXA 2GQLA 5B7CA 4HU9A 1T3BA 1B4PA 2QSIA 1GUKA 5HFIA 3IE3A 4GF0A 4MPFA 2PN8A 1W4VA 1EWXA 5G1LA 2IMKA 1R4WA 2LNTA 2FWHA 5E4WA 3C73A 1TK8B 5F8BA 5KEJA 4KDYA 1B8XA 2DLXA 3AY8A 2VL3A 1JHBA 4G19A 5IMCA 1HYUA 3TKSC 2H0GA 2WFCA 4O92A 4DSSA 1FVJA 1A0FA 3GV1A 4N0VA 1UA5A 1TRVA 3FKFA 1TDIA 4MPGA 4XTSA 3LQ7A 6GSSA 4FH8A 2NTOA 2PERA 5A5KA 2M46A 2GQMA 1I9DA 3EWLA 4F2IA 4QL9A 3US3A 2YOIA 2LKUA 2C4JA 4POKA 3W8JA 3OR5A 5GZZB 1TW9A 6GSUA 1X9SB 3D22A 3H93A 1GSFA 3TUEA 2C80A 4KH7A 4TR0A 1K0OA 4JR6A 1SKWB 2H8LA 4N10A 2OE0A 4PUAA 4X43A 2JACA 4WKWA 1WRYA 3L9UA 1PL2A 3VI5A 3VFIA 3CSHA 2EIRA 2FWGA 1CQGA 4JBBA 1EZKA 1PN9A 3GRXA 2KHPA 4MLYA 4HU7A 2B5YA 1Z6MA 2X64A 4BPYA 4OO5A 2VLTA 4N30A 5IMVA 3IV4A 3QFBC 4D73A 4E8EA 2B1KA 1PA3A 2CVBA 2H19A 4EUYA 4JR4A 2A4VA 2MBSA 3IHQA 2B7KA 2WJUA 2EC4A 1QXHA 4POLA 1U3AA 2P5QA 1K3YA 3TKRA 4TXOB 2KUCA 5A4UA 4PQHA 1SKSB 4X1UA 3G7YA 2VCXA 5COHA 5J3RA 5ABRA 2YPMA 4I97A 2MYGA 1TI3A 2H70A 2FLSA 2LEGA 2MMNA 4WF5A 1FG4A 2OBIA 4OD7A 3CMIA 2RM6A 1SYRA 1FHEA 4NWYA 5F07A 4ID0A 3TKSA 3UVHA 2X8CA 2VUPA 1Z7RA 5G2ZA 3C1SA 3UVTA 2GDRA 4HQSA 3TRPA 3G7IA 3P8WA 1M2AA 3TB2A 5ID2B 2OADA 2VD1A 3HY2A 2CV4A 2DJ2A 5ECLB 3D0ZA 3ZFLA 4NAXA 2R3XA 1EP7A 4ECBA 3DYRA 4KSMA 5ECPB 1XOAA 3NOFA 1ABAA 2G0FA 1A8LA 2TRCP 1XVQA 4IHUA 4MDCA 4OFMA 5DBQA 5F05A 2J23A 2N5FA 2RLIA 1PMTA 2FA4A 2XBQA 5CAXA 4MJAA 1ZGNA 3ERGA 3HD5A 1JZWA 2ZUPA 4V2NA 2L59A 4MZCA 4FYCA 1GL8A 3PGTA 1OVNA 2GS3A 4KB3A 4F03A 4QQ7A 2H0HA 2YP6A 2V32A 1GSUA 5G5EA 4PUFC 20GSA 3FEUA 2ON5A 2K8SA 2IWTA 1GSSA 4IP1A 2B5XA 1HD2A 2VCZA 4PQIA 1XWGA 3PH9A 2AAWA 2I4AA 1GTAA 2JZTA 3DD3A 1O8WA 1A24A 2L4QA 4XCSA 5ENUA 1TI1A 3FY7A 1SD8A 2GLRA 1R5AA 3CTGA 3W6GA 2QC7A 3O3TA 1AXDA 1FVKA 3BCKA 4JRRA 5KN1A 4EC0A 2PU9C 3G9BA 1C72A 1NHYA 4KNDA 2I9HA 5DALA 4IP6A 4KCEA 2C0GA 2IFQB 1SL2B 1DSBA 1YF1A 2FWFA 3BOAA 3TKSE 2V1MA 2GT6A 6GSTA 5J41A 2VL2C 1QUWA 1YQ1A 5J9CA 3WT2A 1O81A 4K7IA 2ON7A 4FYUA 2KLXA 1OKTA 3TOTA 3SWLA 3FR6A 5ELAA 3VWVA 4CW9A 3M9JA 3S9FA 2YV7A 3D4TA 4JU5A 1JZOA 4XS6A 2CT6A 1VF2A 2IMFA 3CBUA 3ME7A 2JZSA 3UAPA 1G0TA 2PBJA 2H6YA 4I2UA 2HNLA 6GSVA 1WP0A 2PPTA 3A2XA 3KD0A 4WETA 1BG5A 2R4VA 2V6OA 3WGEA 5D73A 1FB0A 1FOVA 5EPFA 2KP2A 4I8BA 2RM5A 1XWBA 3BJ5A 3GIXA 2L6CA 3FW2A 4GQCA 5ECHB 4Q5QA 1B4QA 3HDCA 4NHZA 2RUFA 4EKZA 1ZYQB 2FY6A 3IAM2 4N11A 3IA1A 4GTUA 1N8JA 3DEXA 4TXOA 1UN2A 2OKAA 3Q74A 13GSA 5EL8A 6GSYA 1YJ6A 5KN3A 1ERUA 4Q5RA 3HVSA 3NIVA 5ECSA 2HXKA 3FR3A 1XFLA 1WJKA 3GSSA 2CA8A 2WULA 4IKHA 4TN8A 5IM9A 5DJMA 2H71A 3HHVA 5G31A 1ST9A 3ZVJA 5LNKe 4YQVA 2DSAA 4YAVA 4ULXA 4K0NA 3QOUA 1LU4A 3TJGA 2OA7A 2M80A 1XCCA 2O89A 5IMAA 1OYJA 3M3MA 1SK2A 2OE1A 1U87A 3IK7A 4MK3A 4IS0A 4DVCA 2R5GA 1VRSD 3A2VA 2VL2A 3QPMA 1V57A 1ON4A 2IN3A 4ILFA 1MDJA 1QQ2A 2H1AA 4EF0A 3ZREA 4BVXA 4MH3A 4O7HA 2CX3A 2YWNA 2HYXA 4HS1A 4Q5FA 1YDKA 5IPGA 3GFKA 3KP9A 2VO4A 1F6MC 1XOBA 3D5JA 4TR4A 4L5OA 3LJRA 1T4YA 1EGRA 4PX1A 4HQZA 3KJYA 1V40A 2E2GA 3K8NA 1QFNA 2B5EA 5DJLA 2NVLA 3LFLA 2H0IA 1Z3EA 3MAKA 5ECIB 5CRHA 2O85A 3BD2A 2PVQA 3UJ1A 3A2WA 3ZMKA 1AQVA 5ECQB 9GSSA 1E6BA 3ZITA 4NHWA 2H6ZA 1V2AA 1FB6A 1URMA 2H1BA 2DJJA 2LV3A 4TRXA 3GMFA 3GH9A 2X99A 2C0EA 4Q5NA 3I43A 4KE3A 4KDXA 4J56E 2B7JA 4GCIA 4YH2A 5IPHA 1T4ZA 2V41A 5DVBA 3KH9A 3IPZA 1F37A 4XS4A 1T00A 2XBIA 1TU7A 4F82A 5DQYA 1X5EA 4HZ2A 2YN1A 5FT3A 4AJ7A 2PVOC 2IFQA 3BCIA 5F06A 1GRXA 1K0DA 1NW2A 4MP4A 1EP8A 2CZ2A 5IOXA 1GTIA 3IK9A 2DMLA 1QGVA 1VF3A 1B9YC 1M7TA 2CAIA 4G2EA 2OJLA 11GSA 3UBKA 2I81A 1XVWA 2EIQA 4ISDA 1GWCA 3HJOA 3FZ4A 2FCHA 1Q4JA 3QAWA 3G7JA 1PD21 5IO2A 3EVIA 1UC7A 3H79A 1BQ7A 1G7EA 3HCZA 1BEDA 4CDOA 1K3OA 5HQPA 3RPPA 1THXA 4J57E 4L0WA 3D6IA 4PURA 3LYKA 2L4CA 1K3LA 2MMAA 1U3IA 1K0MA 3ZL5A 3W8SA 1B48A 2LJRA 2PUKC 4XHMA 5DCGA 1WOUA 3CRUA 1V98A 3VWXA 3KM6A 1FW1A 4N0ZA 3ZYWA 1LBKA 3RAZA 3L9SA 3P90A 2BTOT 3KTLA 3QR6A 1R5PA 3HKRA 2C3NA 4ZL8A 1QMVA 1OC8A 1X0RA 1F9MA 3L4NA 2F3MA 3TKPA 2PGTA 5KN0A 1LJRA 3LGCA 2K18A 1WWJA 1U6TA 4L8EA 5B8BA 2I3YA 3GL5A 2YWOA 5EVOA 1GLPA 5HR3A 3IOSA 4MJBA 4MH2A 2L57A 3DWVA 2BJXA 4X0XA 2GSTA 3N9JA 2OE3A 1S3CA 5D9TA 1BJXA 1AIUA 4JZQA 2Z9SA 1XW9A 1BX9A 1PRXA 4F0BA 4PNFA 2IJYA 3Q19A 3E9JB 4WR5A 3JCML 1AQWA 3RPNA 5B6NA 3F9UA 4KSOA 5B6MA 3F63A 2DMMA 2HLSA 5JCWA 3TRXA 3F4RA 4TKYA 3UEMA 5JCUA 3TDGA 7GSSA 2O7KA 4V1Ag 4OFNA 3APSA 3EU3A 17GSA 4OFTA 5FHIA 3TGZA 1TRWA 2GZZA 2NBSA 5GAPD 3F3RA 1GTUA 1JZDA 3ERWA 2E7PA 1F3AA 4WEYA 5IOWA 4EE0A 4MZBA 2L6DA 1H4OA 4BL7A 1YEXA 4V2MA 10GSA 3IXRA 4HJ2A 4MJCA 1VF4A 3KEBA 4EO3A 1XW6A 1M9AA 4JEDA 5IQYA 4RUVA 4OMVA 1QK8A 3BBYA 3GKNA 2H1GA 4DSQA 5LD0A 2VLUA 4ZBAA 4ZBDA 4AF2A 1B9XC 1V58A 1VF1A 4K7OA 1JLVA 3CSIA 4MF6A 3D4MA 2LRNA 1RK4A 3C1RA 1X9MB 1ZYEA 4OCFA 1TRSA 1Z7PA 4PGTA 2HE3A 1Y25A 4NPBA 1BYEA 1PX7A 3KP8A 2LNSA 3IR4A 3QD9A 5JWOB 1UVZA 1ERWA 2HFDA 2XPDA 4WF4A 2DJ0A 3WT1A 2CX4A 1MEKA 2B1LA 2G2QA 4O32A 3GHAA 2A2SA 5HR0A 5LCZA 1GUHA 1WE0A 2P5RA 3EC3A 2FA8A 1AUCA 4IN0A 4ZIJA 4L5LA 3ME8A 2L5OA 3LXZA 2XPEA 14GSA 1A2MA 4ZXGA 3QMXA 1SYXA 1PSQA 1O7UA 2IMIA 1Z9HA 1AC1A 4DSSB 4LMVA 2WZ9A 1ZL9A 1NHOA 3UMAA 1NSWA 2WGRA 4L0UA 5HFGA 2YWMA 3GYKA 3HVVA 19GSA 3H8QA 4ML1A 3ZFBA 3CTFA 1TJDA 4K8MA 2VCTA 1MDIA 3MNGA 3LXTA 4TR3A 4RQRA 3U6VA 1S3DA 2V2GA 3EINA 3WD6A 1SKRB 3I6AA 5D9WA 2FWEA 3HYPA 4PXOA 3DXBA 1MDKA 2X8HA 2FHEA 3ZLPA 2H6XA 1GSEA 3I9V2 3GH6A 4HUAA 1GH2A 2O8VB 3J7Yb 4GSNA 3QFAC 1GSDA 3EMPA 2QGVA 3A3TA 2M72A 1HQOA 1SL1B 2LJAA 2B6MA 3C7MA 1O8XA 4AJ8A 2CAQA 1T8EB 2GZYA 3TRQA 1R26A 3GL3A 2AJQB 4IJ3A 5CYYA 1J08A 2GQKA 3IBHA 3EU4A 5JCGA 3GKKA 1K0CA 4ZL7A 1K0BA 2JU5A 5A4WA 6GSXA 1OC9B 2CVDA 5HR1A 2YWIA 3J7Yk 3KMOA 4K9ZA 4GSSA 2YJ7A 2E2MA 4WBJA 4IVFA 1GP1A 2K8VA 3WGXA 5KN2A 4MA9A 1K0AA 3DRNA 3EMXA 5JWRB 3ZZXA 2R2JA 3C71A 4K2DA 2WDUA 2P31A 1SU9A 4XIHA 4POMA 3VPQA 5IMDA 1X5DA 5D93A 3CRTA 3L9VA 4HI7A 4I2TA 2JADA 1YKCA 1RW1A 3FZAA 2AUVA 1XZOA 2K6VA 3IC4A 2IMEA 1X5CA 2VCVA 4IW9A 5D96A 2N5AA 3LG6A 2VL9A 3HJPA 4O5RA 4HZ4A 5ID2A 2C8UA 2VCQA 2DIYA 3ISOA 3Q18A 4YQMA 2H01A 3GSTA 3MSZA 2KOKA 5ECNB 1OKDA 3RHBA 1OE8A 5GSTA 2EIOA 2VLVA 5ECKB 3FHKA 1EEJA 1EEMA 3CYNA 4IGJA 3U5RE 3M8NA 1KNGA 4EXJA 4XRAA 2H1DA 2HI7A 3DIEA 3ZTLA 4LMWA 4ZB6A 3N5OA 5G5FA 2IMDA 4ZB9A 1AW9A 22GSA 1M0UA 1TOFA 4FYBA 1X9WB 5D9XA 3ZIJA 1USBA 4IQAA 4AGSA 1VGLA 2LRTA 2ALBA 2LRCA 5C00A 3HZ4A 4RI6A 1TKDB 5EY6A 2HRNA 4WXTA 2LQQA 1TK5B 2C0FA 1O73A 1R7HA 1Z6NA 4LA1A 4KW6A 2H73A 1SK0A 2HT9A 4QL7A 4MJEA 4RQXA 3GX0A 3KXOA 2H66A 1G6YA 2VM1A 8GSSA 5CRGA 2ZCTA 5GAND 2MBTA 1WMJA 2GGTA 4G10A 1PKWA 3IAS2 2F8FA 3GX8A 5F0GA 1XXUA 5JWQB 3KCMA 1M2DA 2CVKA 3KZQA 5HFKA 3GN3A 3P2AA 4GRFA 1G7OA 1M2BA 4NV5A 2J9HA 1WIKA 2F9SA 2LTKA 1JZRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite