3LBSA

Crystal structure of the cytoplasmic tail of (pro)renin receptor as a mbp fusion (maltose-bound form)
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDRELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAADPGYDSIIYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural analysis of the intracellular domain of (pro)renin receptor fused to maltose-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Renin receptor
total genus 120
structure length 372
sequence length 372
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lbsA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lbsA01
4ZEBA 3LUYA 3SEVA 3MQ9A 2HZKA 2YJPA 1R1NA 3LSXA 3K6UA 4TQUQ 3P7IA 4IGRA 4NEDA 1MM7A 3ZKKA 2QPQA 2XXTA 1N7XA 2ALUA 4BDMA 3G3HA 3O29A 4F39A 5CMMA 3JYRA 3C9HA 2OBGA 2ZYMA 3KSXA 3TELA 3UORA 4LZ7A 2M8CA 4R2FA 4F18A 5H8FA 1Y3QA 5ISUA 3A3UA 1ANFA 3UN6A 2OWTA 2AYSA 2XHDA 4YKJA 4OENA 2PMSA 3HSTA 4XKQA 3I5OA 4H0WA 3RT6B 3H6VA 3C31A 1IIWA 1JW5A 4X48A 5AA3A 3WAFA 4H6DA 3Q25A 4AQ4A 1P1UA 2XD2A 4RPOA 4F22A 2HEUA 1POTA 4GVOA 4NWDA 3LSFB 2F7CA 1S9TA 3BFTA 5ICQA 1MG1A 3H4ZA 2Z8DA 3PUZE 4H1XA 2NUVA 4GOTA 4RNSA 3OELA 2UVJA 3KBRA 3SDFA 5IKBA 1US4A 1I69A 4WEDA 4PFUA 1UIVA 1AH5A 1JEUA 2LAOA 4EQ9A 3SEWA 4WEPA 3QSLA 4G8HA 4THIA 4F2OA 4R72A 3MW0A 2I0CA 4OFLA 5B70A 3IOTA 2RKMA 2BJJX 3G7WA 4Z0IA 4F29A 4KYEA 1N76A 1URSA 4R6HA 3IL1B 2IEEA 5DVFA 2UVGA 3C32A 3MPLA 3GLBA 3G3KA 1IUDA 1LB9A 1FQCA 1XOCA 3T66A 4H5GA 3T9UA 1JETA 1MH3A 4EXLA 3PMVA 1A7LA 1VFDA 4OESA 3TTLA 2Y7WA 3TTRA 1UQWA 3MVZA 2E0SA 2PVUA 3SKPA 4ZEKA 3PUYE 4QFOA 3Q27A 1NL5A 1N0TA 5A5XB 3E4RA 3O9PA 1URGA 4BDNA 2XXXA 1SVXB 4FATA 3LBSA 4OMBA 1M5EA 2Q88A 3R26A 2B3BA 4H5FA 2RCBA 1GGGA 2OJTA 4KPTA 2H25A 5I56B 2F36A 3VV5A 5DEXA 3E3KA 3FVOA 2DP8A 2Y7KA 2Z23A 1Y4CA 2DXRA 3DP8A 1EZPA 1JVXA 1FCKA 3GZGA 2F6GA 1ZTYA 1CE2A 4LQ5A 1UTBB 1MQIA 4DE8A 3FJ7A 5I59A 1D4NA 2I4CA 2QMXA 3BKIB 1N84A 3FATA 2ANJA 4XXUA 1ZIUA 1M5FA 2XXQA 3HHGA 5JEIA 3PPNA 5KCJA 3TQWA 3VLWA 1FQDA 4G4PA 2F35A 2QS3A 3O2AA 1O64A 2V84A 2ZNTA 5I2KA 1DPPA 1GV8A 1B52A 3G3FA 2I48A 4GXAA 4HS7A 1JNFA 4GIZA 3PU5A 4PFYA 1O7TA 1NH7A 3MAMA 3RTWB 3K6VA 3DP4A 2D3IA 2ZYNA 5L8DA 4QSCA 2PBWA 1B46A 4OTEA 3TDJA 5IAIA 1P1NA 4RA1A 5F7VA 1VE4A 4OQOA 3T9HB 4ZS9A 4WKMA 2B65A 4MLQA 3VVDA 3KEIA 5EHSA 1B0HA 4M4GA 1HSJA 4F1YA 5I57A 5JTYB 4NF6B 1FTOA 3FVKA 4FECA 3ZS6A 5ITOA 4RY1A 1FTMA 3OOAA 3HPIA 1FQAA 5H8QB 3E13X 3HCQA 1B4ZA 3AXFA 1Z7NE 3USDA 1B4HA 3PD9A 1SI1A 2RC8A 1TFDA 4QSEA 3WAEA 1ZU0A 4HTGA 4XIGQ 3OXNA 2KLFA 1R9LA 4KCDA 1GR2A 1B3LA 1XC1A 2GHAA 1GVCA 2OK2A 5FTIA 5L9MA 4U1OA 3VDFA 4POWA 3EHSA 3G3IA 5AA4B 1DTZA 4O3BA 2VHAA 1QVSA 3A09A 3QUFA 5CBRA 2VD3A 4KYDA 2RF1A 4GXSB 2P2AA 4QF9A 4JDFA 4EXKA 5DYHA 4OXVA 3IJXB 1SD3A 1USYE 3CVGA 1PB9A 1PB8A 1HSLA 4DCXA 4U22A 4IO2A 3MVXA 3MVYA 3MC2A 3H7MA 2AL5A 3G3GA 2UYFA 3IAZA 1FTJA 3TZAA 4YZZA 2NWJA 3FZVA 1JQFA 2VGQA 3EN3A 4F2QA 1H3DA 3ONMA 4F3SA 4ND9A 3CFZA 4KYSA 4ECFA 3OO9A 1L5TA 2I3WA 2A5SA 4QFLA 1ZJLA 3HHFA 4OZ9A 3S9NC 2DE4A 1M5DA 1YAEA 2XX7A 1YPNA 3UGWA 1S50A 4E0XA 3GBAA 2GRVA 5J1DA 2UVIA 1B3GA 1I6AA 2O6AA 3JV9A 1TXFA 2PT2A 4PFTA 1B1HA 1M5CA 4KD5A 3MP6A 2RC9A 3TMGA 1B40A 1MDQA 1QW0A 3F11A 5ITPA 5TU0A 3FD3A 4H65A 1MPDA 4N07A 2OZZA 5JK4A 1A8FA 2I6EA 4JSOA 1SW2A 1B51A 3N94A 2AL4A 1FQFA 4ESXA 3MPKA 3ECRA 3KOSA 2PT1A 3KG2A 3OSQA 3FIRA 5LOMA 1I6QA 3VE1B 1P1WA 2OWSA 4EQBA 5EYFA 4IO7A 2REGA 3IORA 5I2NA 1O63A 4F1VA 1WODA 4PE5B 1H45A 4JXIA 1N3XA 1MXUA 4NF8B 2O68A 5CMBA 2HZLA 4EF1A 3L6HA 3FXUA 4X9TA 3V89B 1PC3A 1WVJA 3RPWA 5A5XA 3HO7A 1EU8A 3ZKLA 4MF3A 3FASA 3BFUA 2DSFA 1MPBA 1URDA 4F3GA 3C4MA 3EPEA 3KSJA 2HFBA 1IITA 5B7DA 4FE8A 2H5YA 2O69A 5I56A 3MP8A 3OO7A 4KFQA 3TEPA 3DELB 2WKYA 4YKIA 1B5IA 4F3PA 3TTMA 2OLBA 3TQLA 1N3WA 1LLSA 1OLAA 4G2ZA 1Y3PA 1P1QA 1DSNA 2H99A 2ZYKA 2NXOA 3LSWA 4PQJA 2UXAA 2XX8A 4ZECA 1UTBA 1MH4A 2XD3A 3MZBA 1SW5A 2DE2A 5CM6A 1IXGA 5CRYA 2HXWA 1LFGA 3PPPA 2F5XA 2ZYOA 4DIGA 4DXUA 2DE3A 5CMKA 1DTGA 3R6UA 1Y1ZA 4NF5B 4XKRA 5I2NB 1KWHA 3U92A 2DWIA 3K01A 1T0KA 3CRBA 1OLCA 1NNPA 3T96B 3G3JA 1VFEA 1FTKA 3MZ9A 5BWJA 4G8NA 1SBPA 3OENA 4FIMA 1IXCA 1MM6A 1MXZA 3ILTB 3K00A 1LFIA 3TAJA 4KQPA 3IR1A 1D9YA 4OVJA 2HAUA 4HW8A 3B7DA 4KHZE 3TPAA 4ZEIA 2B3FA 2P1SA 3ILUB 1Y4TA 1MDP1 4NF4B 2Y7PA 1VR5A 2Q89A 2DWHA 4G8MA 1H43A 5KZTA 3C34A 3C35A 2W7YA 1USYH 4TOZA 3PD8A 3GXAA 3KGCA 3D4CA 4YB6A 4PETA 1FW0A 3O6GA 2UVHA 5JTYA 4NF6A 3V5AA 3OO6A 3TCHA 3KZGA 5HPQA 4LQ2A 4JB7A 4P11A 3I6VA 5TP9B 4O3AA 4U21A 3SEXA 1Q1KA 3UP9A 1ATGA 2QSXA 4G68B 5H8QA 3IJOB 2D21A 5TPAA 5ICTA 4JBZA 3SERA 4BDLA 3MP1A 2XXIA 2F7AA 4F3BA 3PUWE 5L9OA 1LAFE 4ELQA 3S4UA 3M3KA 2V3QA 3K6XA 2CMOA 3PMXA 3V83A 4L17A 3N6UA 4LP2B 3K1NA 3KN3A 3CI8A 1MQDA 3U93A 2QRYA 3RLFE 1A55A 5I58B 1DMBA 4KR5A 3ODBA 5AA4A 4IO4A 2DXYA 1HSEA 3B6TA 2V25A 4F19A 5AA2A 4LZ8A 3TUSA 4AB6A 1LBCA 3TODA 3TCFA 2F8DA 3U94A 3DP6A 3CR9A 3TYHA 2DS9A 3H03A 4QHQA 1Q35A 5H8HB 1XVXA 4OERA 5I84A 4DZ1A 2QL3A 2RC7A 4HCYA 4MBPA 2ONKE 2GFEA 2DYXA 4ZZEA 4YICA 1QULA 3HV1A 3PUVE 4GF8A 3T9VA 3KOTA 4MLVA 2THIA 5HM4B 3K02A 5ELVA 4YKKA 2HCAA 3K1PA 1B58A 1I6BA 2DVCA 2QS1A 4FJPA 3OMBA 2FA7A 1H76A 4JWOA 2FYIA 2O51A 5EHMA 3C33A 4LA9A 5DT6A 4LVQA 2A5TB 4BLAA 1LAGE 4R9GA 5TPAB 3TCGA 1UTHB 4F31B 1B9JA 4NMYA 3LC8A 4NTLA 1XS5A 3D4GA 3K0VA 4IY5A 4ELPA 2NVUB 5K2YA 3U8QA 4MFIA 1N04A 3H6TA 2O1LA 3W9WA 3Q28A 4KCCA 4Q30B 2HAVA 3S2VA 4GRKA 1BLFA 1D3KA 4WXJA 3SEUA 1DOTA 3CSBA 2XXUA 5AA2B 2I4BA 1XT8A 2YLNA 3TTKA 1PEBA 3RY3A 1SDXA 1MXWA 3KFMA 4GD5A 3VVEA 5L9SA 4JWYA 5AE4A 3VLUA 4YMBA 3PMWA 4R2BA 1A54A 4X1BA 4OFOA 1IEJA 4P0IA 3K6WA 4OEUA 4H8JA 4FAJA 3VFJA 3FVGA 4DXCA 2G29A 5H8NB 5BUUA 3M3FA 1MPCA 2VOZA 4YB7A 3N6TA 4E0WA 1UIUA 1MY4A 1LAXA 1JEVA 2GH9A 3FGSA 4LONB 4R75A 1QUJA 4AB5A 4NF8A 1AIVA 3JZJA 3FJGA 2Z8EA 3OO8A 2VD2A 1QUIA 2NOOA 3UK4A 2XX9A 2Y7IA 1SQYA 2Q8JA 1B6HA 2V93A 1SYIA 5HBCA 4ONYA 5KDTB 4OETA 3THIA 4LATA 4YKPA 1M5BA 3FUZA 2QJEA 4NE4A 4U4SA 1B2HA 1EZ9A 1US5A 1B3EA 4BDQA 1TWYA 1SW1A 1NMUA 3W15C 4GQOA 4TLLB 1F9BA 2VP1A 1AOVA 3EHTA 2QS2A 4TLMB 3VLVA 3UIFA 4GFRA 3V8XB 3FV1A 1LGBC 2Z8FA 5M2VA 3EHUA 3IB2A 1Y3NA 1MY0A 1MQHA 3CIJA 1B5HA 4G68C 2PYYA 3O66A 2D5WA 4R74A 1FTLA 1LFHA 3K1MA 3M8UA 3C36A 2ZMBA 1LBBA 4M1VA 3RN8A 4NF5A 1NKXA 1MXYA 4X1DA 4QFPA 3Q29A 3PPQA 3VXBA 4KI0E 2QS4A 4O3CA 2DQVA 1H44A 1FQBA 4ZDMA 1LSTA 3SEYA 1AL3A 3N26A 2Q2AA 2V3TA 3OEKA 3N5LA 4U23A 1MXVA 3S9MC 2Z22A 3QAXA 4C0RA 3IX1A 2UYEA 2AIXA 1MXXA 4YB5A 3A3CA 2H4IA 3ZSFA 1MQGA 2CZLA 1II5A 3I3VA 1CB6A 1Y20A 4QFNA 2XXHA 4QSDA 3OD7A 1B7HA 3MZ1A 3SESA 4YMAA 1OVBA 3H6UA 1ZMGA 1RYOA 4NF4A 1D9VA 3IO4A 3QYTA 2R71A 4RK2A 4EUOA 3RGYA 1NNKA 4H8IA 2DOJA 4OYVA 3TTNA 2I0BA 1ELJA 2YPNA 2RCAA 1EZOA 3E9XA 4ELRA 4P0GA 2E1SA 4Q8RA 4RPNA 5TP9A 4XKPA 3O28A 4XKNA 1OQHA 4OHNA 4G68A 1B32A 3DM0A 4Z7EA 4UA8A 3CG1A 4Q0CA 4ZE9A 1J1NA 1ZLQA 5H8FB 3DLNA 5K2XA 4EF2A 2V3UA 5H8SA 4Q5TA 4ZEDA 2I3VA 4LZ5A 2O7UA 3RTFB 1B1XA 5I58A 3RT8A 3QUJA 1Z7ME 4R73A 2O84X 4OFJA 1QJMA 5DVJA 5FHNA 1P99A 1ZBMA 3LR1A 1FQEA 3KJTA 1R6ZA 5F1QA 3H3GA 5H8HA 4JSDA 1TFAA 1NNFA 1MY2A 3RQTA 1BTJA 3FXRA 4NWCA 1NH8A 2IA4A 4IB2A 3O6HA 1YCJA 4R6KA 3QIMA 1A8EA 3Q26A 3K2DA 3B6WA 2G93A 5AA2D 3FVNA 1AMFA 2F78A 3PGFA 4JWXA 2X7PA 3SETA 2A5TA 3MBPA 4G77A 2F34A 1EH3A 2HQ0A 1B7UA 2DWAA 1UTHA 4RYAA 1B05A 4XTCQ 1B3HA 2ZNSA 1LCFA 2XXVA 3O6IA 1PDAA 1A99A 1TT1A 2O1MA 4GLIA 3CG3A 1S7YA 4H67A 3T22A 4EQ7A 1R9QA 2ONSA 1XVYA 1Y9UA 4DCYA 4C1UA 3R7XA 2XXYA 1MY1A 3IOVA 3PPRA 1A40A 1XHYA 2XXWA 3GBBA 4U4XA 2QMWA 3H06B 3RNNA 3IOWA 2OCUA 4ESWA 2REJA 4I1DA 3PV0E 1BP5A 1POY1 4DDDA 4YU0A 4QRZA 4R9FA 4IO6A 3MJNA 2ESNA 2DWJA 1MY3A 1IXIA 2Y84A 2I58A 3CFXA 3IK6B 4DXBA 3FXQA 5DTBA 4C1TA 3MVWA 4POXA 1B0LA 4RXLA 5AA1A 1PBQA 5H8NA 1GTKA 5DEXB 3LSLA 4EDPA 4DLDA 1RYXA 1WDNA 1LAHE 4QFKA 5CC2A 3PUXE 2X7QA 4IO5A 1SW4A 3OSRA 4IY6A 4I9DA 1Y1MA 1SI0A 3IB0A 4K3FA 3T93B 4MH5A 1N7WA 1OIBA 3RUMA 5I59B 3IO6A 5CBSA 2X26A 4ZE8A 2F7BA 5KDTA 2XXRA 1B7ZA 3FV2A 3T9XB 4ZEFA 1BKAA 1LCTA 3U1OA 1VSOA 2GHBA 2R9JA 5KCJB 2Y7RA 2ZNUA 3PPOA 2ONRA 4HCWA 4ZZAA 5CI5A 2PX1A 5I2KB 1IXHA 1P1OA 4I8CA 1OMPA 4GL0A 4N13A 1MRPA 2H9BA 4OEVA 3B6QA 5DVIA 4FORA 4RK9A 1QKBA 3UA8A 1BIYA 1PB7A 4F1UA 3S9EA 4BDRA 3QXMA 4R6YA 3K4UA 2DVZA 1B3FA 1B5JA 2XXPA 1JW1A 3CFLA 2R6GE 3O97A 4PFWA 1JVYA 3KJ7A 5FHOA 1SYHA 3EQ1A 2F6PA 3U72A 4GL8A 1MQJA 1NNTA 3L6GA 3VXCA 5FTHA 4U1ZA 3VVFA 3H6WA 4LUBA 1NFTA 3KN8A 4RJZA 2F97A 3BBRA 4N6PA 3TKDA 2FNCA 3W9VA 3M3LA 1OVTA 4YAHX 2ZXTA 1RKMA 4GWOA 3FJMA 5I57B 1IQ7A 3QK6A 1YTVA 3MUQA 4PP0A 1QUKA 1QKAA 2ABHA 4ISUA 3S9LC 1DPEA 3IOUA 5FHMA 2I49A 4OWDA 2O7IA 1ZKBA 4IGTA 3TFLA 2H98A 1MS7A 3HN0A 4IO3A 1LB8A 4UACA 1IZ1A 1PBPA 4FEDA 2Q9TA 1JW4A 4I62A 2RINA 2Q2CA 3MWBA 4BDOA 3OEMA 3EF7A 5CMCA 4ELOA 3KN7A 2P0SA 3IB1A 4U2RA 1OQGA 3CSGA 4FEBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZEBA 3LUYA 3SEVA 3MQ9A 2HZKA 2YJPA 1R1NA 3LSXA 3K6UA 4TQUQ 3P7IA 4IGRA 4NEDA 1MM7A 1RDZA 3ZKKA 2QPQA 4HE0A 2XXTA 1N7XA 2ALUA 4BDMA 3G3HA 5F24A 3O29A 4F39A 5CMMA 3JYRA 3C9HA 4O8MA 2OBGA 2ZYMA 3KSXA 5DW8A 2QVVA 1DBZA 3TELA 3UORA 4GX3A 4LZ7A 2M8CA 4R2FA 4F18A 5H8FA 1Y3QA 5ISUA 3A3UA 1ANFA 3UN6A 2OWTA 2AYSA 2XHDA 1RDXA 4NHBA 4YKJA 4OENA 2PMSA 3HSTA 4OVPA 4XKQA 3I5OA 4H0WA 1INPA 3RT6B 3H6VA 3C31A 1IIWA 4KXPA 1JW5A 5EQ9A 4X48A 4MIJA 5AA3A 3WAFA 4H6DA 3Q25A 4GBWA 4AQ4A 2WEFA 1P1UA 2XD2A 4QBAA 4N6DA 4RPOA 3T1BA 4F22A 1FBCA 2HEUA 1POTA 4GVOA 1SPIA 4NWDA 3LSFB 2CEYA 2F7CA 1S9TA 3BFTA 5ICQA 1MG1A 3H4ZA 2Z8DA 3PUZE 3GYYA 2NUVA 4H1XA 4GOTA 4RNSA 3OELA 2UVJA 3KBRA 3SDFA 5IKBA 4PFRA 1US4A 1I69A 4WEDA 3PTYA 4PFUA 1UIVA 1AH5A 2FBPA 1JEUA 3E79A 2LAOA 4EQ9A 3SEWA 4WEPA 3QSLA 4G8HA 4G61A 4THIA 1NV7A 4XFEA 1KZ8A 4F2OA 4R72A 3MW0A 2I0CA 4OFLA 5B70A 3IOTA 3U65A 1K9ZA 2RKMA 2BJJX 2WYPA 3G7WA 4I40A 4Z0IA 4F29A 4KYEA 1N76A 1URSA 4R6HA 3IL1B 2IEEA 1LBZA 5DVFA 2UVGA 3C32A 3MPLA 3GLBA 3G3KA 1IUDA 1LB9A 1FQCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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