3LBSA

Crystal structure of the cytoplasmic tail of (pro)renin receptor as a mbp fusion (maltose-bound form)
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDRELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAADPGYDSIIYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural analysis of the intracellular domain of (pro)renin receptor fused to maltose-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Renin receptor
source organism Escherichia coli
molecule tags Transport protein
total genus 120
structure length 372
sequence length 372
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lbsA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lbsA01
5F1QA 2UVJA 4F2QA 1FQDA 4X48A 1CE2A 2DS9A 2HZKA 2QS4A 3KG2A 3IL1B 5CRYA 5KDTB 1ZJLA 3Q25A 2PMSA 3TTMA 3VLVA 1QUKA 3S9NC 3OSRA 5I2NA 3R26A 4RPOA 3QYTA 5EYFA 3G3GA 1T0KA 4FIMA 3LSXA 4MF3A 2ABHA 5ISUA 4KYSA 3M8UA 4YICA 2HQ0A 4R72A 4GD5A 1EH3A 2HZLA 4R9GA 2F5XA 1OVTA 4OHNA 4EQ9A 3FXUA 3ILTB 3V89B 1XC1A 3QK6A 1B7HA 4N07A 1IEJA 5CMCA 1A8EA 3IR1A 5HBCA 1MXVA 4G4PA 2X26A 1WVJA 3VXCA 4TOZA 2V3UA 2F7AA 4RK2A 3KJ7A 1H43A 4XKQA 4QSCA 4UACA 3I5OA 1JW5A 2UVIA 2DSFA 4H6DA 3TCFA 1XT8A 4ZECA 1M5BA 3ZS6A 3B6WA 4DDDA 1B0HA 3QAXA 4OMBA 3FV1A 4LA9A 4JDFA 3EF7A 3KEIA 1P1WA 1ZBMA 2XX7A 1MXWA 3PPNA 3IAZA 1SBPA 3S9EA 5AA2A 1BLFA 3H6VA 3H7MA 3FVKA 1SQYA 3FVOA 1P99A 4OFLA 3RT6B 2DVZA 2XXRA 4PE5B 4HS7A 4POXA 1QVSA 1NFTA 5JEIA 2RCBA 3SEVA 4OETA 3TCHA 4NF4A 1A8FA 4Q8RA 3MVYA 4LP2B 3CG3A 1B3HA 3MP6A 4G2ZA 5H8QA 4EF2A 4P11A 2V3QA 3CG1A 4KD5A 4YKJA 4PFWA 2F8DA 3AXFA 3SKPA 4ND9A 3IB1A 1PEBA 2WKYA 5B70A 4FE8A 1UTBA 3CVGA 3GZGA 3B7DA 1Y1MA 1YPNA 3RTFB 1FTLA 4GIZA 3IORA 4KFQA 4MH5A 3G7WA 4FEBA 2XXXA 1XVYA 2NXOA 5A5XA 1S50A 1B32A 4F1YA 2GRVA 1AIVA 1N04A 3N94A 1A55A 1DPPA 2A5TB 3TYHA 1JW1A 1ZU0A 5KDTA 5I2KA 3C35A 3FXQA 4JSDA 4NF6A 3OELA 5L9MA 4DZ1A 4H0WA 1MPDA 2ZXTA 4O3CA 3QSLA 5ICQA 3BFTA 3PUYE 3I3VA 4ZZAA 4XKPA 1MH4A 4U4XA 4H67A 4MLVA 2FA7A 2O51A 3IB2A 4K3FA 2Y7KA 4N6PA 3BKIB 4ISUA 2DWJA 4C0RA 1B3FA 3MW0A 3C33A 3MUQA 2PX1A 3DP8A 3TMGA 3PPPA 1RYXA 3N6UA 1NKXA 2R9JA 5H8NB 3CFXA 1HSLA 2LAOA 1I6AA 3TTLA 3G3FA 4ZDMA 4OERA 3MQ9A 3OXNA 4G8HA 4ESWA 1MDP1 1O7TA 3O28A 2ZYKA 3H03A 3M3KA 3U72A 3QIMA 1O63A 2XXQA 2ZYMA 5CMKA 4RXLA 4BDNA 5K2XA 3TELA 4WKMA 1D9YA 3TQLA 1QUJA 5L8DA 3K00A 3B6TA 4U2RA 4ZEDA 2QL3A 3Q27A 5AA4A 4H65A 4LZ8A 2X7QA 3IOWA 3EQ1A 1B05A 1ZMGA 2IEEA 4FAJA 2DE4A 1UTHB 5EHMA 2H98A 3GXAA 4FJPA 4PFUA 2DE3A 3RY3A 2ZNSA 3MWBA 2F35A 3VLWA 3TPAA 5DTBA 2Q2AA 4F31B 5DVIA 2OJTA 3C32A 1A54A 5CC2A 2XXWA 4H5FA 1PBQA 2H25A 2H99A 3R7XA 3O2AA 1N84A 5JK4A 2V3TA 2GH9A 1ANFA 5FTHA 1SVXB 2Y7RA 1FQCA 4YAHX 2NWJA 4XKRA 5FHNA 1NNFA 3DLNA 1I6BA 4KCDA 4PETA 2I58A 2ONRA 1B3LA 4EXKA 4Z0IA 2P1SA 5H8HB 2VOZA 1SW4A 1HSJA 5I58B 3TUSA 2A5TA 1Y3NA 3CFLA 4GVOA 4RNSA 1ATGA 4ZEKA 3EHTA 4NWCA 3EPEA 5DYHA 3A09A 2XX8A 3M3FA 3H3GA 2O6AA 3QUJA 1N7WA 1MQJA 4NEDA 3O66A 2Q8JA 1IZ1A 4WEPA 4HCYA 1MY0A 2QS1A 4F2OA 4GXAA 1TXFA 4OZ9A 2DWIA 1N3XA 3FUZA 1MQIA 4POWA 4GL0A 1LCFA 5CI5A 1B6HA 5EHSA 2Z23A 1FTMA 4OENA 3MP8A 1N0TA 1POTA 1TFAA 5H8NA 1IXCA 4HW8A 5ITOA 2ZMBA 3G3KA 2HFBA 4E0WA 2QMXA 4NF8B 3MZ1A 4YB7A 4F1UA 5CMBA 3MBPA 4KI0E 3TTKA 5TPAB 4I62A 3MC2A 5K2YA 3PUWE 3RN8A 3HCQA 1II5A 2P2AA 3BBRA 4LATA 3OO6A 2H4IA 1JVXA 3IO6A 4BDRA 5I59A 2NOOA 4XTCQ 3C4MA 4RPNA 5HM4B 1IITA 3Q28A 1M5DA 3OENA 3KSJA 2DQVA 2IA4A 1N3WA 2RINA 3SEYA 2HAVA 4JWOA 2ANJA 2OWTA 2Q89A 1MXZA 4R74A 1FQAA 3EHSA 4C1TA 3T9VA 2BJJX 3OEMA 1NMUA 3RTWB 3VE1B 3E13X 2G29A 1LAFE 2F6PA 1SW5A 1Y4CA 3IOVA 4IO4A 5I84A 1GR2A 1PB7A 1BKAA 3WAEA 3K6UA 1P1OA 4Q0CA 4RYAA 1Y20A 4DXUA 4O3AA 3V83A 5KCJA 3HHGA 3C34A 2DE2A 1LGBC 5I56A 2CMOA 2GFEA 3ZKLA 4IGRA 3DP4A 3K2DA 1D9VA 2FYIA 5ELVA 4KQPA 1ZLQA 1LBCA 1Z7ME 1LFIA 3HPIA 3KFMA 4X1BA 2VGQA 4F3PA 4G8NA 1B7UA 1TFDA 3CR9A 3VV5A 1NNPA 3KOSA 3HHFA 1MM6A 1Q1KA 4EUOA 4TQUQ 4TLLB 5TP9B 1XVXA 1LSTA 3IB0A 3RQTA 1A40A 1LFGA 2VHAA 2V93A 4LZ5A 1NNKA 2R6GE 2PT1A 4G68B 1XHYA 1QW0A 4I9DA 3SERA 3RUMA 5J1DA 4KR5A 3O97A 3C9HA 5TU0A 3HV1A 4ZS9A 4MFIA 1O64A 3I6VA 4GWOA 3GLBA 3O9PA 5HPQA 2ALUA 2HEUA 3QXMA 4G8MA 3OOAA 3L6HA 4IO5A 1S9TA 1IIWA 4LQ2A 2XXYA 4NF8A 1WODA 2ONSA 3LBSA 1SDXA 2NUVA 1PB8A 2RKMA 4DXBA 1JVYA 4FORA 1EZPA 3U92A 1VE4A 3TAJA 1QULA 1IXHA 3ILUB 4ZZEA 3QUFA 3FVNA 4ZEFA 3ODBA 4XXUA 3TKDA 5ICTA 3K6XA 4R2FA 5DEXB 4R6YA 1B1XA 2XXTA 4NF5B 3UP9A 4YMAA 1MY1A 1B4HA 2XD3A 2Q2CA 2QS3A 1MM7A 1H76A 3O6IA 3SEWA 3UGWA 1YTVA 3RT8A 1JETA 1GVCA 1B4ZA 3KZGA 3E4RA 1EZOA 3OO7A 1B58A 1R9QA 3IK6B 1KWHA 1AH5A 1B7ZA 1SYIA 2KLFA 4JBZA 1DMBA 2W7YA 4HTGA 3RNNA 1UIUA 1URDA 1MPCA 2OWSA 5ITPA 5CMMA 2DOJA 2B65A 2RC8A 5AE4A 1FTJA 1DTGA 2ESNA 5CBSA 3T9UA 3FD3A 1XOCA 3LSFB 4F3GA 1Y4TA 1LCTA 1WDNA 2E0SA 1ZKBA 4IO7A 3S2VA 4F1VA 2VD2A 1VR5A 3T66A 3PPOA 4KPTA 2Q9TA 3T22A 4YMBA 4QSEA 2F97A 3MZBA 1I69A 3BFUA 5JTYB 1LFHA 2UYFA 4IB2A 1B5HA 1MQHA 3THIA 2PYYA 3O6HA 3HSTA 1OQGA 1M5CA 4BLAA 4OFJA 2YPNA 3MVZA 3S4UA 4DXCA 1MDQA 4QHQA 1FQFA 2QMWA 4IO2A 3K01A 1LAHE 2V84A 2DXRA 1OQHA 5DT6A 1MY2A 3UIFA 3PMXA 4QFOA 2P0SA 4HCWA 4OEVA 4EXLA 4U22A 2F7BA 1POY1 4PFTA 1A7LA 4QFLA 2RF1A 3PUXE 4OXVA 1QKAA 2I0CA 1ZIUA 3FJGA 3CFZA 1BP5A 3T9HB 2D3IA 3OEKA 4AQ4A 3ECRA 3S9LC 2XXUA 4BDMA 4OFOA 3LC8A 5I2NB 3H6TA 2I3VA 1P1QA 3FATA 1ZTYA 3P7IA 4X1DA 4EF1A 3HN0A 2QRYA 1D3KA 3FGSA 4ZE8A 2NVUB 2HXWA 2QS2A 5AA2D 4GOTA 4QSDA 1OLCA 3UORA 4IO6A 5DVFA 4QFKA 1I6QA 4DCYA 1PB9A 5FHOA 3SESA 3G3IA 1LLSA 4NMYA 3K1MA 4QFNA 3IJXB 3H4ZA 4BDLA 1Y3QA 1B40A 3D4CA 3T93B 5AA3A 3C31A 3KN3A 2Y7PA 4F19A 4EQBA 1B5IA 3RPWA 3LR1A 1JW4A 1LB9A 4IO3A 4EQ7A 1S7YA 2O7UA 4YKKA 3K6WA 2VP1A 3TTRA 4RJZA 1Y3PA 1QUIA 1NH8A 3OMBA 4JWYA 2X7PA 4F39A 2I4BA 3K1PA 4R73A 4OVJA 4ZE9A 2DVCA 1BIYA 5FHMA 5H8FB 5AA2B 1MXYA 5KZTA 5CM6A 1MXUA 3MJNA 4H1XA 1B0LA 2Z8DA 3E9XA 4RK9A 3CSGA 3K0VA 2OLBA 3PD9A 4Q30B 4UA8A 1R9LA 3SEXA 3KOTA 2D21A 4OYVA 1LAGE 3F11A 3WAFA 1YAEA 3K4UA 4F3BA 4GQOA 1VFDA 4U1OA 4YB5A 2XD2A 5H8QB 3G3HA 2M8CA 1Q35A 3SEUA 2XHDA 4I1DA 3Q29A 3MAMA 1MRPA 4Q5TA 2ZYNA 1Y9UA 1B5JA 3KGCA 4U1ZA 1UTBB 2GHBA 3TCGA 1UTHA 1MQDA 4YKPA 4R6HA 1B9JA 1MPBA 3LUYA 3W9WA 1L5TA 4XIGQ 3FJ7A 3JZJA 1M5EA 2RCAA 3M3LA 3K1NA 4M4GA 4ECFA 3IOUA 5A5XB 5M2VA 2I49A 4P0GA 2OK2A 3JV9A 1MQGA 4MLQA 5I2KB 1FTOA 3MPKA 2ZNTA 4NF6B 1AL3A 1LBBA 4G77A 2YLNA 3RGYA 2QJEA 2Z8EA 2RC7A 2UYEA 3IJOB 2XXIA 4GFRA 4ZEBA 3W9VA 2Y84A 4DE8A 5H8HA 3V5AA 4ESXA 3L6GA 4C1UA 5CBRA 5I58A 5I57B 5IKBA 3PMVA 1QKBA 3W15C 2UXAA 2XXVA 3USDA 5DVJA 3EN3A 1OIBA 3PPRA 3G3JA 3PGFA 2A5SA 4LQ5A 2PT2A 4GF8A 3OO9A 2AL4A 3RLFE 3VVDA 3U8QA 2QPQA 3N6TA 3A3UA 1P1UA 3E3KA 4GRKA 3N26A 3U93A 1B3EA 2G93A 4BDOA 4KYEA 3TZAA 3VXBA 3MVWA 4F22A 1FQEA 1Y1ZA 4QFPA 3PV0E 4U23A 1B52A 3MP1A 4H8IA 2AIXA 5H8FA 4RY1A 3TODA 5AA4B 4YU0A 4OESA 1CB6A 1HSEA 4ELPA 1OVBA 4LONB 1RYOA 2I0BA 3B6QA 4LZ7A 4P0IA 4N13A 4R2BA 1FW0A 4O3BA 1TT1A 4U21A 2DXYA 1PBPA 2O69A 5TPAA 4DLDA 4GLIA 3IO4A 1USYE 4JXIA 3KN8A 1YCJA 3OSQA 2H9BA 5FTIA 4THIA 1RKMA 1H3DA 3H06B 5AA1A 4RA1A 1EU8A 2HCAA 1UQWA 3PUVE 4MBPA 3H6UA 3TDJA 2ONKE 3KSXA 5LOMA 3C36A 1B2HA 1OLAA 1JQFA 4YB6A 3HO7A 3KBRA 3O29A 3O6GA 3VFJA 5BWJA 3CRBA 1VSOA 3A3CA 1JEVA 2XXHA 3DELB 2O1LA 4F29A 2QSXA 4L17A 3MPLA 1F9BA 4PP0A 2DWAA 1Z7NE 1FCKA 1GV8A 4OWDA 4KCCA 2I4CA 2R71A 3CIJA 4F18A 4H5GA 1H44A 1US4A 4LVQA 3OO8A 2O7IA 2DWHA 1FTKA 2UVGA 1JEUA 2AYSA 1US5A 1NH7A 5I57A 4PFYA 1USYH 3FV2A 3FXRA 4ONYA 1J1NA 2V25A 5F7VA 1DTZA 4NE4A 1N7XA 1H45A 1XS5A 2ZYOA 1BTJA 4YZZA 3MVXA 4X9TA 1MH3A 3FZVA 3PMWA 2VD3A 3ZSFA 1SD3A 5TP9A 4QF9A 4GL8A 3PUZE 2PVUA 1N76A 4IY6A 1MY4A 4R6KA 2I3WA 2F7CA 3PPQA 1FQBA 2DYXA 4G68A 4OQOA 1SW2A 4BDQA 4DCXA 4NWDA 4WXJA 4JWXA 3KN7A 2I48A 5I59B 3TEPA 1B1HA 2GHAA 1PDAA 3JYRA 2AL5A 3LSLA 1SW1A 1SYHA 4GXSB 3S9MC 3FVGA 4H8JA 1TWYA 5IAIA 1DPEA 2Y7IA 2Z22A 4ELQA 1DSNA 3D4GA 1QJMA 2O68A 1PC3A 1MG1A 1R1NA 1D4NA 3GBBA 4FEDA 2Q88A 3TFLA 2DP8A 1AOVA 1MXXA 3PU5A 2UVHA 3UN6A 4KYDA 2D5WA 2CZLA 2O84X 1B46A 2B3FA 5L9SA 1JNFA 1URGA 5DEXA 3IOTA 1B3GA 4E0XA 4NF5A 1GTKA 4G68C 4ELRA 2OZZA 1LAXA 3ONMA 3LSWA 4LUBA 1R6ZA 1UIVA 5KCJB 4XKNA 1P1NA 4JSOA 3VLUA 5I56B 4R9FA 2FNCA 4KHZE 4WEDA 2REGA 2F78A 1EZ9A 4IY5A 1DOTA 4ZEIA 3FJMA 1ELJA 4Z7EA 2Y7WA 3KJTA 4U4SA 3K6VA 4PQJA 3UA8A 4R75A 1MS7A 1GGGA 2HAUA 1SI0A 3VVEA 3T9XB 3VVFA 3FIRA 4TLMB 2OBGA 3K02A 3CSBA 2RC9A 3N5LA 3U94A 3DP6A 4ELOA 4OEUA 3SDFA 1AMFA 3OD7A 2I6EA 1MY3A 3DM0A 4IGTA 2PBWA 2E1SA 1OMPA 4NTLA 1B51A 2Z8FA 4QRZA 1URSA 4EDPA 3H6WA 4FATA 3VDFA 1IXIA 5BUUA 2B3BA 2H5YA 2ZNUA 2THIA 2REJA 3PD8A 3IX1A 3MZ9A 5JTYA 3ZKKA 1VFEA 3SETA 1M5FA 3UK4A 3V8XB 2F34A 3TTNA 5L9OA 4NF4B 4F3SA 2F6GA 4I8CA 3EHUA 5B7DA 3TQWA 4FECA 1LB8A 4DIGA 1NL5A 3CI8A 1A99A 2OCUA 3U1OA 1IUDA 1NNTA 3FASA 1IQ7A 3GBAA 2YJPA 4AB5A 3R6UA 4M1VA 2F36A 3Q26A 1SI1A 5H8SA 3T96B 4YKIA 2O1MA 2XXPA 4JB7A 1IXGA 2XX9A 4AB6A 4OTEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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