3LC8A

Crystal structure of the cytoplasmic tail of (pro)renin receptor as a mbp fusion (maltose-free form)
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDRELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAADPGYDSIIY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural analysis of the intracellular domain of (pro)renin receptor fused to maltose-binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Renin receptor
total genus 120
structure length 372
sequence length 372
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lc8A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lc8A01
2ZYNA 4GVOA 5TP9A 4JDFA 1US5A 1USYH 2UVJA 2P1SA 1EZOA 3B6QA 3R7XA 3MP8A 1D9VA 3H6WA 4FEDA 3MP1A 5AA2A 1B51A 1LAGE 3IJXB 2DSFA 4AB5A 4NF5B 4JSOA 2I4CA 4LZ8A 4OESA 4R74A 3DP6A 3MVZA 1VFEA 4QSEA 4ELOA 5CBRA 2KLFA 5H8QA 1NFTA 3FXRA 5HPQA 3MZ1A 4R75A 5CMMA 5CM6A 4KYEA 1ZTYA 4XIGQ 1AL3A 1PBPA 1LBBA 1POY1 4OWDA 5CRYA 3RNNA 3K6VA 4FJPA 2XD2A 1LB8A 3K6UA 3FD3A 3QK6A 1MG1A 1S50A 1JEVA 4IO7A 4GL8A 4BDRA 4H8IA 1B4HA 3LSXA 1N0TA 4X1DA 3N26A 4I62A 3TTMA 2PVUA 3K6XA 4G68C 1B5JA 2H98A 2V3QA 1QULA 3C36A 1FTJA 1H43A 1MH4A 3S9NC 2PBWA 2NWJA 3MPKA 1B3GA 1IXIA 4F1YA 2ZYKA 3TEPA 1N76A 3MBPA 4LZ7A 4QSDA 1PDAA 1POTA 5TPAB 4LA9A 4OEVA 1EH3A 2O84X 2XXYA 4MFIA 4H67A 5F7VA 4E0WA 1PB8A 4G68B 2DYXA 4ZE8A 4NF6A 4C0RA 1SW5A 2Z8EA 3MPLA 2F36A 2HFBA 2DWIA 1ZBMA 3QXMA 1OLCA 4RK2A 3VLUA 4C1UA 5L9SA 1Y4TA 4HTGA 1R1NA 1XC1A 2PX1A 2UVIA 3C32A 4IGRA 4Q0CA 4WXJA 4ESWA 3TKDA 2XX9A 4PFUA 1BLFA 3G3JA 4NF5A 3WAFA 3EPEA 4DZ1A 3V89B 3RUMA 3UP9A 4G4PA 4ELPA 4MLQA 4BLAA 5ISUA 4IY5A 4U23A 1VFDA 2V25A 4WEDA 4YAHX 3LSFB 3BBRA 2YPNA 3CIJA 3E4RA 3RTFB 4G8HA 1M5FA 1OIBA 4QFOA 3RT8A 3QYTA 5FTIA 2UXAA 3JV9A 3KEIA 2DQVA 2F7BA 1B3HA 4KHZE 4U1ZA 3PPNA 5B7DA 1YTVA 3U8QA 3PMVA 3VE1B 4RXLA 2QMWA 2VP1A 2H5YA 3O9PA 5JTYB 3S2VA 4ONYA 5LOMA 3E3KA 3M8UA 1KWHA 3PUWE 4JWYA 4NE4A 4OETA 5H8FB 5I56A 1IXGA 2A5SA 2DE4A 3OSQA 1D3KA 4ISUA 4NTLA 1P1NA 3IO4A 1Z7ME 4QFKA 5L8DA 1B5HA 1NNPA 4U4XA 1B7UA 2QL3A 3D4GA 3S4UA 4OMBA 2GRVA 1BKAA 3H6VA 1H45A 4GLIA 1M5BA 4YMAA 2VD2A 3KOTA 1B3FA 5FTHA 4ZECA 1YAEA 2DVZA 1LCFA 4DXCA 2G93A 1Y4CA 3HO7A 3K02A 3RTWB 2Z22A 3HN0A 1TXFA 4TOZA 5I56B 2Y7WA 4P0IA 1IITA 5B70A 4DIGA 1Y1ZA 2HXWA 3B6TA 3IORA 2RCBA 4UACA 3TMGA 3VDFA 4F3PA 4X9TA 2HEUA 3H03A 3N94A 4H1XA 4OENA 4ZZAA 1SW2A 2DWJA 2DXRA 2G29A 3CI8A 1NNFA 4WKMA 3IR1A 3OEMA 1Y9UA 1F9BA 1B3LA 1UIVA 2O7IA 3EN3A 4GD5A 1FW0A 1UQWA 4OVJA 4XKRA 3LSWA 3TUSA 2AIXA 2Q2AA 3K1NA 3TTKA 1MH3A 5A5XB 1AIVA 2H99A 5H8NA 3UA8A 3ECRA 4DCXA 1A55A 2R71A 4QFPA 1SI1A 3O6GA 3OSRA 1B05A 4QFLA 3V83A 1N3WA 1LAXA 4HW8A 1XS5A 3C9HA 3FGSA 1M5EA 2VOZA 3KSXA 3O29A 2HCAA 2H9BA 3O66A 4YB5A 2XXTA 4LUBA 4NEDA 4R6KA 3H06B 5FHNA 2Y7KA 1P1WA 4PE5B 3TZAA 3FXQA 1MXYA 3C34A 5JEIA 3A3UA 1B0LA 1MY4A 5K2XA 1MPDA 1LFGA 1JVYA 1R6ZA 3FATA 4ELRA 1FQCA 3K00A 1FQFA 1MXZA 2V3UA 3IOUA 1D9YA 3PPPA 4KFQA 4LVQA 4C1TA 3OO6A 2W7YA 3BFTA 3SEXA 4H6DA 1XHYA 1RYXA 1Z7NE 2XX7A 4K3FA 5HM4B 4YU0A 2DP8A 2OLBA 4R9GA 4EXLA 2FYIA 3FUZA 2V93A 1H76A 1LSTA 4QF9A 2OWTA 3K1MA 3FJMA 4GQOA 2F6PA 4RA1A 3MQ9A 4ZEBA 5AA2B 4E0XA 5CMKA 3TFLA 4GF8A 2PT1A 2HAVA 5I2KB 1JETA 4BDOA 1SVXB 1MQJA 5CMCA 1JVXA 2WKYA 2PT2A 1SI0A 3R26A 1YPNA 2RINA 4U2RA 1IXCA 2F7AA 3O6IA 1B4ZA 3OO9A 3UIFA 4EUOA 5I58A 1LBCA 2ZNTA 3GBBA 4YB7A 5H8QB 5I59B 1Y3NA 4O3CA 5AA4B 1CE2A 3L6HA 2H4IA 3Q26A 1MRPA 3MUQA 3PU5A 1VSOA 4NF4B 3M3LA 4POXA 1H3DA 1FTOA 1XOCA 2CMOA 4G2ZA 2I4BA 3TODA 1N7XA 2QS2A 1URGA 3HHGA 3K4UA 1S9TA 1IXHA 4AQ4A 4ECFA 2VGQA 5L9OA 1S7YA 4KQPA 2ZYMA 5DYHA 4JWOA 1Q1KA 4G77A 4RPNA 5I59A 4MBPA 1LAFE 3K01A 4IO2A 4R73A 5CI5A 2OJTA 3T9VA 5I2KA 1B46A 3VXBA 3Q25A 1LGBC 2I0CA 4O3BA 3TELA 5JK4A 1M5CA 4N6PA 1USYE 4OEUA 4YKKA 1BP5A 4ZE9A 1TWYA 3CSBA 1US4A 2PYYA 1A8FA 5CBSA 3B6WA 4WEPA 2F34A 1A8EA 5TP9B 3MVWA 1IQ7A 1Q35A 2ESNA 1GV8A 3S9LC 2DS9A 2VD3A 3G3FA 3IX1A 3LSLA 5EHMA 3VVDA 2HZLA 1R9QA 1ZLQA 3H4ZA 1QVSA 3OENA 1JNFA 1I6AA 2NXOA 3H6TA 2XX8A 3HPIA 1NH8A 1UTHA 2X26A 3KJTA 2UVHA 4LQ5A 2F35A 4O3AA 1MXUA 1B0HA 1DOTA 3OXNA 5I58B 5ICQA 1O7TA 1SW1A 3ZKKA 3VLVA 3OO8A 4TLLB 4F19A 1PB9A 2I58A 3H3GA 1OVBA 3SKPA 3TCHA 2HAUA 3IOVA 3TTRA 3U1OA 4N07A 4PP0A 3C31A 4BDQA 4YB6A 2XD3A 2O1MA 2REGA 4M4GA 1AH5A 5FHMA 3CVGA 1N04A 3ZSFA 3FVGA 1UIUA 2NVUB 5KZTA 2B3BA 3ILUB 3HV1A 1HSLA 3KSJA 4JSDA 3TCFA 3BFUA 4KCDA 2I49A 5H8HB 4EQ7A 3WAEA 1XVXA 3CFZA 1LFHA 2F6GA 3LR1A 4JB7A 4R2FA 3KN7A 3RN8A 1IIWA 2I0BA 2YJPA 4R6YA 4DXUA 1CB6A 4Z0IA 1SYHA 1B58A 2CZLA 2UYEA 2R6GE 3MP6A 4GXSB 4NWDA 2O6AA 4GL0A 3MVXA 3SDFA 1LLSA 2XXVA 3FIRA 3HCQA 3U92A 3V8XB 3FVKA 4Q5TA 4F3SA 1A99A 5BWJA 2I3WA 4NF6B 4FORA 4XXUA 3RPWA 1LFIA 2RKMA 1MQHA 3DM0A 1BTJA 4KCCA 1NKXA 1ZJLA 3PPRA 4X1BA 2QS4A 3EHUA 3G3GA 1ELJA 3A3CA 5H8SA 3F11A 4Q8RA 4XKNA 1LB9A 4IO4A 4FEBA 2A5TA 2P2AA 1O64A 4AB6A 3IB0A 2Q89A 1QKAA 2O51A 3G3KA 1NH7A 1ZIUA 3EHTA 3IL1B 3Q28A 5FHOA 1RKMA 1GR2A 5ITPA 2QS1A 3CSGA 2BJJX 2REJA 2XXXA 3R6UA 5L9MA 1ATGA 2HQ0A 2ONRA 2XXIA 4NF4A 3RGYA 4OZ9A 3W9WA 4IY6A 1MQIA 2DWAA 4JWXA 4ZS9A 3FV2A 3KZGA 2Q8JA 1D4NA 3RLFE 1H44A 2RC9A 3CFLA 3OELA 1VR5A 2RC8A 4F3BA 1YCJA 3DLNA 4QHQA 5H8HA 3SETA 3VV5A 2FA7A 2XXWA 3M3FA 3MWBA 2E1SA 4GRKA 4OXVA 2DWHA 3OO7A 1Y20A 4QSCA 5HBCA 3HSTA 3CG3A 3PV0E 4I9DA 4PFWA 5AA4A 3IOWA 1N84A 4X48A 2ZXTA 3IB1A 4HCYA 5KDTA 3M3KA 4QFNA 3VVEA 1FQAA 3I5OA 2E0SA 4F31B 5I57B 2QMXA 4GFRA 4R2BA 3KJ7A 3S9EA 2LAOA 2QS3A 1MQGA 5EHSA 4OFJA 4F22A 3C35A 1MY1A 3RQTA 3PUVE 3Q29A 2XXRA 3IK6B 2D3IA 3GXAA 4RYAA 2Y84A 4EXKA 1NL5A 1SYIA 1Y3PA 3QAXA 4POWA 2DE2A 3FJ7A 4OFLA 4G68A 4YICA 2O68A 2OBGA 4ZEFA 3FV1A 5TU0A 1NNKA 2D21A 4BDLA 1FQBA 5I84A 1MPCA 4XKQA 5M2VA 1AOVA 4F2QA 2FNCA 1SDXA 1LCTA 2XXQA 5I2NA 3HHFA 5CC2A 5KDTB 2XXPA 2I48A 4U21A 3MC2A 2ZYOA 4IO5A 2I3VA 3FVNA 1URDA 3P7IA 1PBQA 4P0GA 1MXVA 3PD8A 1SBPA 2AYSA 3K2DA 5CMBA 5AA3A 1NNTA 3GBAA 3QUFA 4BDNA 3I6VA 4QRZA 3KOSA 5H8NB 5ICTA 1P99A 1WDNA 1P1QA 3TAJA 4FIMA 3U72A 2GH9A 3A09A 3T66A 3G7WA 3DELB 5DTBA 4NF8B 4YMBA 2D5WA 2Y7PA 4F1UA 3K6WA 3SEYA 3TPAA 2NOOA 2UVGA 4NWCA 2AL4A 3IB2A 3CFXA 1B7HA 3GZGA 4YKJA 5ELVA 3OMBA 1DPPA 3IOTA 5DVFA 3MAMA 4H5FA 1A7LA 4KI0E 2Y7RA 2X7PA 3KBRA 1ANFA 1FQDA 1RYOA 1J1NA 4H8JA 3KN3A 4G8MA 1OMPA 1R9LA 1FTMA 1XVYA 3KN8A 3N6UA 2A5TB 4GWOA 4KR5A 4ND9A 4RPOA 3E13X 3JYRA 1GGGA 1ZU0A 4UA8A 3RY3A 3T9XB 3OEKA 4EF1A 4Z7EA 2ZNSA 4KD5A 3IAZA 2F8DA 5A5XA 1MY3A 1PB7A 4MH5A 3TTNA 1WODA 1FQEA 5AA1A 3T22A 4EQ9A 2OWSA 3UGWA 2ONSA 2ZMBA 3CR9A 3H6UA 3PUYE 3VXCA 1B40A 5DVJA 5JTYA 4NF8A 3FVOA 3V5AA 1MDP1 4I1DA 3MVYA 4M1VA 5H8FA 4RNSA 3AXFA 3OOAA 2ZNUA 1L5TA 5AA2D 1B2HA 4KPTA 4YZZA 3USDA 3T9UA 1HSEA 5K2YA 1I6BA 1I69A 3K0VA 3TDJA 3E9XA 1MY2A 1PC3A 3TQWA 4EF2A 4F29A 1XT8A 2UYFA 1SD3A 4GIZA 1MDQA 1Y1MA 3BKIB 1OLAA 1B1XA 4RJZA 3THIA 1TFDA 2O69A 3S9MC 1GVCA 1UTBB 3QUJA 2Z23A 3ONMA 4F18A 1B6HA 1QKBA 3PMWA 1FCKA 2AL5A 3G3IA 4F2OA 3UORA 2DVCA 4OERA 3LC8A 4OTEA 1MM7A 1B32A 3VVFA 4IB2A 3FZVA 3SEUA 3L6GA 2F78A 5DT6A 1A40A 5J1DA 1URSA 2ABHA 1VE4A 3MZ9A 4R9FA 1B3EA 2XXHA 2DXYA 3VLWA 2Z8FA 3MJNA 2HZKA 1IUDA 1O63A 1WVJA 2R9JA 4PETA 2PMSA 3KG2A 3LBSA 4ZEKA 3VFJA 4F3GA 1PEBA 4LZ5A 3DP4A 4ZEIA 4RK9A 2ANJA 4XKPA 3B7DA 2V84A 3FASA 3FXUA 3IO6A 4FECA 4LP2B 3PMXA 4RY1A 3T93B 4DLDA 4I8CA 1GTKA 1M5DA 3JZJA 2ALUA 3PD9A 1HSJA 4LQ2A 1JQFA 2H25A 4GOTA 2ONKE 4HS7A 4H5GA 1MPBA 1I6QA 1B5IA 1QJMA 3TTLA 1ZMGA 5AE4A 4FAJA 5KCJB 4ELQA 1QUJA 1SW4A 3I3VA 2DOJA 4DDDA 3TQLA 1OQGA 1EZPA 3QIMA 3FJGA 1QUIA 4MF3A 1DTZA 2Z8DA 3EHSA 2B65A 1OQHA 2P0SA 3O6HA 3U94A 1FTKA 1JEUA 2GHBA 1EU8A 3ODBA 2RF1A 4IGTA 4N13A 3RT6B 3SESA 3ZS6A 1IEJA 3DP8A 3U93A 4NMYA 4DXBA 5BUUA 4F39A 1AMFA 4OHNA 5F1QA 4OQOA 1QUKA 3PUZE 5KCJA 2YLNA 4OYVA 4EQBA 1LAHE 2F5XA 2F97A 4F1VA 4THIA 1MY0A 1TFAA 1JW1A 4R72A 1P1UA 3EF7A 4H65A 1MQDA 2QPQA 1SQYA 4PFYA 3TYHA 1B7ZA 3Q27A 3N5LA 3O2AA 4L17A 4PFTA 4ESXA 3UN6A 4YKIA 3MW0A 4DE8A 2XXUA 3LUYA 5ITOA 1NMUA 4G8NA 1T0KA 2OCUA 5I57A 2I6EA 2O7UA 3PPQA 3QSLA 2B3FA 4TLMB 3T9HB 2Q9TA 3CRBA 2QJEA 3SEVA 1DPEA 1MS7A 2NUVA 2Q88A 4LATA 3TCGA 1FTLA 3SEWA 3W9VA 2DE3A 3N6TA 4R6HA 3ZKLA 2OK2A 2IEEA 4EDPA 1II5A 4P11A 5IAIA 4HCWA 1P1OA 2VHAA 1ZKBA 2QRYA 4IO6A 3SERA 5IKBA 1JW4A 4U1OA 2GHAA 2QSXA 3O28A 4ZDMA 4JXIA 1IZ1A 4LONB 3C33A 2Y7IA 3PPOA 4PQJA 2RC7A 1DSNA 1UTBA 1N3XA 2V3TA 4H0WA 2X7QA 3KGCA 5I2NB 4KYSA 2RCAA 1A54A 5DEXA 1B9JA 1MXWA 4TQUQ 2Q2CA 4GXAA 4U4SA 1DTGA 3K1PA 4DCYA 3IJOB 1BIYA 4FE8A 3EQ1A 2M8CA 4JBZA 3UK4A 4Q30B 1TT1A 3PGFA 3H7MA 1EZ9A 2IA4A 1Y3QA 4MLVA 3MZBA 4YKPA 2OZZA 4FATA 4ZEDA 2THIA 4KYDA 3G3HA 1B52A 3C4MA 3GLBA 3PUXE 4U22A 2GFEA 4ZZEA 3D4CA 1N7WA 1DMBA 1MXXA 2F7CA 4XTCQ 5DEXB 2O1LA 5EYFA 4BDMA 1UTHB 3ILTB 3OD7A 1OVTA 3KFMA 1JW5A 3CG1A 5TPAA 3T96B 4OFOA 1QW0A 1MM6A 2XHDA 5DVIA 3O97A 4IO3A 3W15C 1B1HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3H6WA 5AA2A 4JSOA 1FSAA 4LZ8A 1VFEA 4PDHA 1ZTYA 1PBPA 1LBBA 4OWDA 3RNNA 1S50A 4IO7A 4GL8A 1B4HA 1N0TA 4X1DA 5T3JA 4I62A 4G68C 1B5JA 3C36A 1IXIA 4F1YA 2GQ1A 2ZYKA 5JK4A 1POTA 5AA3A 2XXYA 4H67A 4G68B 4ZE8A 4C0RA 3MPLA 4C1UA 4HTGA 4Q0CA 2PX1A 2UVIA 4N6DA 2XX9A 1BLFA 3G3JA 3WAFA 4XEQA 4AS4A 4MLQA 4U23A 3LSFB 4PF6A 4QFOA 4PCDA 3KEIA 4GX6A 5IGAA 3PPNA 5B7DA 4RXLA 2QMWA 2VP1A 2H5YA 5JTYB 3M8UA 4OETA 1IXGA 4PFIA 1P1NA 4O8MA 1NNPA 4U4XA 1B7UA 1BKAA 1B3FA 1YAEA 2DVZA 2F3DA 2G93A 4MX6A 3HN0A 4TOZA 1IITA 1Y1ZA 2HXWA 2RCBA 4F3PA 4OENA 1SW2A 2F3BA 1NNFA 1B3LA 2WEFA 1MH3A 5A5XB 1AIVA 4DCXA 1SI1A 3OSRA 4QFLA 1N3WA 3FGSA 1M5EA 1VDWA 2VOZA 3O29A 4NEDA 2BJIA 3H06B 3TZAA 1B0LA 1MY4A 5K2XA 1MPDA 3FATA 1JVYA 4GWXA 3IOUA 3PPPA 4LVQA 1XHYA 2XX7A 2OLBA 4GWUA 4QF9A 4ZEBA 3FJMA 2F6PA 3TFLA 4GF8A 1JETA 4BDOA 1SVXB 3FXBA 2RINA 1IXCA 3O6IA 1LBCA 5I59B 5H8QB 1CE2A 2FVZA 2H4IA 3M3LA 1NV4A 3TODA 4GWSA 4KQPA 1IMAA 4FBPA 1LAFE 1QGXA 3T9VA 3Q25A 1LGBC 1US4A 5EQ8A 1DCUA 1GV8A 1FPIA 3LSLA 3H4ZA 4PFUA 1CNQA 1QVSA 1NH8A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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