3LC8A

Crystal structure of the cytoplasmic tail of (pro)renin receptor as a mbp fusion (maltose-free form)
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
b'EEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDRELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAADPGYDSIIY'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural analysis of the intracellular domain of (pro)renin receptor fused to maltose-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Renin receptor
source organism Escherichia coli
molecule tags Transport protein
total genus 120
structure length 372
sequence length 372
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lc8A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lc8A01
4NF6A 2XXTA 5CRYA 1VR5A 5KZTA 1IXCA 4F19A 2F7BA 1B4HA 3IOUA 3C35A 1DSNA 3ONMA 2Z8DA 3B6TA 2O6AA 1PBPA 4QSCA 2RC7A 3T96B 3QUFA 1IXHA 3H03A 2O1LA 4GL0A 4X1BA 3K00A 1JETA 4OWDA 2AL5A 4P0GA 2DP8A 4PFTA 3OELA 3E3KA 5H8QA 5CMKA 1LBBA 3KBRA 2VHAA 2DVZA 3RNNA 4F3BA 3M3KA 4YKPA 1LB8A 3PUVE 3O28A 2ANJA 1A7LA 3P7IA 4BLAA 4OHNA 1PB9A 3D4CA 5I2NB 3E13X 1US4A 2GHAA 4ZZAA 2R71A 1DPEA 2RCAA 3KOSA 3M3FA 3TCHA 3IOTA 1Z7ME 4R75A 1SW2A 2H99A 2ZMBA 3HHGA 2FNCA 3H6VA 2ZNSA 1NNKA 1PB8A 1GV8A 3VXCA 4ZEFA 2XXQA 1B5HA 3T66A 3QAXA 2V93A 1LAFE 5J1DA 1MY0A 1ZMGA 3VDFA 4LZ5A 3O2AA 4HCYA 3S9NC 4R73A 5I59B 4F39A 4OVJA 1Z7NE 3C31A 4ZECA 3U1OA 1HSEA 3T22A 4HS7A 4H5FA 4FIMA 5I59A 1OIBA 5HBCA 3W9VA 4LP2B 3Q28A 3U93A 1B3GA 1MPCA 4GOTA 3KFMA 4XTCQ 3IB2A 3DM0A 2HAVA 2B3FA 4TOZA 1BKAA 4MLVA 4EQ9A 4LATA 4U1OA 1MPDA 2XHDA 3V83A 1B3HA 1MDP1 1FCKA 5DVIA 3K6WA 4MF3A 3UGWA 4GF8A 1FQFA 2QJEA 4BDOA 3HN0A 1ZTYA 3OO9A 1NKXA 1IIWA 2H9BA 4O3BA 1MH3A 1P1QA 1H3DA 3G3GA 3K02A 2I48A 2HEUA 4YKIA 1SVXB 3PPPA 1I6AA 1EZ9A 3TTLA 2ONRA 4DCXA 3SESA 1ZKBA 1NL5A 5H8NB 1VSOA 1B1XA 4HCWA 1OVTA 2XXPA 4BDLA 3MVXA 4POXA 1B40A 1ATGA 4Q0CA 4GWOA 3T9UA 1VE4A 3MC2A 3BFTA 1EZOA 2FA7A 5H8NA 5CMCA 1OLAA 3RGYA 2YJPA 3FATA 4IY5A 4G68B 1R1NA 1B2HA 2XXXA 2NUVA 1ZIUA 2V25A 1N76A 4F1UA 4G68A 4G8NA 5I2KB 3VE1B 3G3FA 1O64A 2A5TB 2QS1A 3O6IA 2B65A 4WKMA 2DYXA 2PT2A 4JWXA 2DOJA 1FTJA 2OWSA 1URGA 1I6QA 5I2KA 5A5XA 2A5TA 1PEBA 1B6HA 2GRVA 3C9HA 4GRKA 3SETA 4GFRA 5I56A 3FVGA 4I9DA 4Q5TA 5BWJA 2QSXA 3PPNA 1F9BA 4YB5A 3VLUA 5DYHA 1MQJA 2IEEA 3R7XA 4QFOA 1SW1A 1PBQA 4MFIA 4Z7EA 1EU8A 3T9VA 3HO7A 2DE2A 4JWOA 1JW1A 2PT1A 1S50A 3IAZA 1B32A 2O7IA 4KYDA 2LAOA 1LFIA 2B3BA 2UVGA 4RNSA 4FAJA 2XD2A 4F3PA 3PUWE 4BDRA 3ECRA 3FVOA 3OEMA 4YU0A 3SEUA 1OLCA 1TFAA 5DT6A 3DP8A 2I6EA 3WAEA 1YPNA 4IO2A 4RK9A 4IO5A 5H8SA 2ONSA 3KN8A 4KYSA 4YMAA 3MJNA 3PGFA 3DP4A 3PMVA 4Q30B 3VVFA 4DLDA 3F11A 4TQUQ 1QULA 3OENA 4OYVA 2Q2CA 3THIA 4BDMA 1NMUA 3CI8A 4R6YA 2G29A 5L9MA 5HM4B 3CSBA 3L6HA 1B3FA 1B5IA 3SEWA 1MM7A 4Q8RA 3FXQA 4JWYA 2VD3A 4FE8A 5KCJB 1I6BA 4IY6A 1JQFA 3QSLA 4IGRA 3TTMA 2W7YA 5TPAB 1B5JA 2Q8JA 4U22A 4UA8A 3LSFB 3PUYE 3VVEA 3GXAA 3N26A 4ELQA 4F1YA 5B7DA 4ZZEA 2V84A 2KLFA 4F3SA 3CFZA 3SEYA 2YPNA 5TPAA 4OFLA 3IB1A 3G3HA 1SQYA 3TELA 4ESWA 1ANFA 4H65A 3VLWA 1FTKA 1YAEA 3IO6A 4IO3A 3IOVA 4TLLB 2P1SA 5JEIA 2O51A 3MWBA 1BP5A 2DWJA 1SI0A 1P99A 2F78A 3EHTA 2Q88A 1DTZA 3K1PA 1MQGA 4QFLA 2ESNA 1YTVA 4AB5A 1HSJA 1UTHA 3TFLA 4LVQA 3K4UA 3CG1A 4F29A 5IKBA 1B0HA 2OWTA 1A8EA 1A55A 4R2BA 3TQWA 3LSLA 3MVZA 4I62A 3U8QA 3G7WA 4HW8A 3FASA 3U72A 4NF4A 4AQ4A 1USYE 1PDAA 2A5SA 3C4MA 2RC8A 4NEDA 4P11A 3EF7A 4KQPA 4PETA 4M1VA 4RPOA 3KJ7A 3KJTA 4EF2A 5AA2B 3QUJA 3VV5A 1UTBA 4YAHX 3OO8A 3T9HB 5F7VA 4PFWA 2D21A 1S9TA 1B46A 1LLSA 5AA2A 1GGGA 4UACA 4R2FA 3K6XA 5IAIA 4DXBA 2HZKA 4FATA 2QS3A 4ECFA 3WAFA 3VLVA 1MXZA 3GZGA 3C32A 1NNFA 3S2VA 5KDTA 3I3VA 3RQTA 5H8QB 2Y7PA 1Y9UA 2I4BA 4QFPA 1YCJA 2AIXA 1QKBA 3MP6A 1OQHA 4U4SA 4AB6A 3N5LA 2R9JA 1D4NA 3RY3A 2F8DA 2NWJA 3TMGA 2REJA 4YB7A 1URDA 2XXVA 1AIVA 1LBCA 4H6DA 3C36A 3Q25A 2QL3A 4GLIA 1ZU0A 1MQIA 1IEJA 3DLNA 1B7ZA 5AA1A 2GFEA 2Z22A 1MY1A 2E0SA 1MH4A 2HCAA 2XXWA 3FIRA 4ELPA 3B7DA 2ALUA 4X9TA 4YKKA 2DE3A 3FV1A 2DXRA 3TDJA 3V89B 3MBPA 3C34A 1DTGA 5I58A 5EHMA 1SW5A 4GD5A 3KSJA 4PP0A 5FTHA 1Y20A 2H25A 1NH7A 4LUBA 3JZJA 3H6UA 4KR5A 3TEPA 1JEVA 3FV2A 3FXUA 4EUOA 3UN6A 2Z8FA 4H5GA 4U1ZA 2DWAA 1IZ1A 3H7MA 1FQCA 1UQWA 2UYEA 4O3CA 2X7PA 3IORA 3E9XA 4THIA 3O97A 3H06B 1LCFA 3ILUB 1LGBC 3KN7A 5H8HB 1JW5A 1ELJA 3I6VA 1XHYA 1AMFA 2DVCA 1Q1KA 2HXWA 4QFNA 3MZ1A 2F6GA 2Q2AA 2Y7KA 3L6GA 1TT1A 5H8HA 1P1UA 4LZ8A 1R9LA 1N7XA 3MQ9A 4H0WA 3K1NA 1JVXA 3HPIA 3H6WA 4IB2A 3U92A 4ZEBA 1MY4A 4R9FA 3FD3A 1GR2A 4OMBA 3TAJA 1Y4TA 3FGSA 2CZLA 1QJMA 3TZAA 4KHZE 1MY3A 2RKMA 2I58A 4L17A 4F3GA 4DIGA 2ONKE 3V5AA 3KEIA 3S9EA 1N0TA 4N13A 2V3QA 1LAGE 4BDNA 5I57B 3PU5A 1SYIA 4RA1A 4Z0IA 2XX7A 3C33A 3PMWA 4H8JA 3O6HA 1A54A 2DWHA 4XKQA 4U2RA 2XD3A 2O7UA 3H6TA 2O84X 5I57A 3R6UA 2I3WA 2ZNUA 4KYEA 1O63A 5DEXB 1RYXA 1VFDA 2XXIA 1FQDA 5CC2A 2DWIA 5A5XB 4TLMB 3M3LA 1M5BA 5DEXA 5I56B 4XKNA 2QMXA 4H1XA 1NNTA 3OOAA 1QW0A 3ZS6A 2WKYA 4EXKA 2PX1A 3TTRA 2VP1A 2VD2A 3MUQA 3PPRA 3O66A 3O6GA 1QUKA 4XKPA 1I69A 2QS2A 2RCBA 2Y84A 1POY1 2I49A 3LBSA 4GVOA 4POWA 3MW0A 2HFBA 3IX1A 3PMXA 1UIUA 2P2AA 4OQOA 1FQBA 4ONYA 3H3GA 2F97A 2ZYKA 5AA3A 1B05A 2UVIA 4DXUA 3UK4A 3FXRA 4N6PA 5F1QA 3TKDA 5DVJA 4KFQA 4G68C 3MZ9A 2V3TA 1MQDA 5I84A 4RY1A 1LFHA 1XC1A 4GIZA 1P1NA 1QVSA 4QF9A 4F22A 3K6UA 3SDFA 1M5CA 2DSFA 3MPKA 3OXNA 2DQVA 3PUXE 4NWDA 5L9OA 3OO6A 1A99A 4ZS9A 1QUIA 1QUJA 3EN3A 3PD8A 1S7YA 1B1HA 3FVNA 1DOTA 5CMMA 2XXHA 4PQJA 4OXVA 4F1VA 1SW4A 2I0BA 3K0VA 2O1MA 4C1TA 4LA9A 2BJJX 1MPBA 2NXOA 1EZPA 1N3XA 1B58A 3S9MC 2PBWA 4R72A 4ZEKA 2OCUA 4QSDA 3GLBA 4LONB 1MQHA 1H44A 3QK6A 3OO7A 1SI1A 1CE2A 1FTLA 1PB7A 3UIFA 4R74A 3Q27A 4GQOA 1Y1MA 1WDNA 1H76A 2I3VA 1II5A 4QFKA 2CMOA 5M2VA 5DVFA 3KG2A 4IGTA 3MZBA 5ICQA 1MM6A 4MBPA 3UP9A 4DCYA 5L9SA 1TFDA 2F5XA 3BKIB 4GL8A 4IO7A 3CR9A 1N7WA 1KWHA 3CVGA 4KI0E 1MG1A 3E4RA 2O69A 2OBGA 3R26A 5JK4A 2Z23A 3CFLA 1LAXA 3T93B 5FHOA 2THIA 5K2YA 2ZYOA 3VXBA 4G77A 1BTJA 3RT6B 4NE4A 3LSXA 3MP1A 1UTHB 1AH5A 2AYSA 1ZLQA 3EQ1A 3VVDA 1T0KA 1VFEA 2P0SA 3GBAA 1IXIA 3HSTA 4ISUA 5ELVA 1MXYA 3TTKA 4OETA 4EQBA 4LQ2A 1L5TA 4PFUA 1Y1ZA 2HAUA 5ITOA 2ZXTA 4NF4B 1IUDA 5TU0A 4I1DA 1PC3A 1GVCA 2F7CA 4XIGQ 2AL4A 3SERA 2UYFA 4PFYA 1UTBB 3DP6A 1QKAA 4JB7A 2ZYNA 3QYTA 4QHQA 4C0RA 1FTOA 1NNPA 4FEBA 1MXUA 1N84A 1IXGA 3OSQA 4KCDA 4QSEA 1ZJLA 1M5DA 3O29A 4NF5B 3ZSFA 1TWYA 3O9PA 3BFUA 2DS9A 4OEVA 5KDTB 1B51A 4ZE9A 4NF5A 4RYAA 4LQ5A 2VGQA 3CRBA 4KCCA 3RUMA 2HZLA 1M5FA 3EPEA 5FTIA 2NVUB 2PMSA 3OSRA 2DE4A 5ITPA 3MVYA 1FQAA 1FTMA 3MVWA 1MDQA 1P1WA 3PPOA 1B7HA 1Y3QA 3LR1A 3HV1A 2DXYA 2O68A 4LZ7A 4U21A 4U4XA 1HSLA 1AL3A 3JV9A 3ZKKA 3JYRA 4DE8A 4ZEDA 1DPPA 3K6VA 2OZZA 4C1UA 1B7UA 3VFJA 4FORA 3MPLA 4DXCA 4IO4A 3GBBA 3IB0A 3RLFE 4ESXA 3PV0E 4JSDA 2OK2A 3USDA 4FJPA 5I58B 1OMPA 1B52A 2X7QA 4PE5B 4OENA 2I4CA 3PUZE 5I2NA 2XX8A 3TCFA 3TYHA 4E0WA 2QRYA 4F2QA 1JEUA 1URSA 5B70A 2D5WA 1CB6A 3LSWA 3TQLA 3ODBA 3ILTB 4G8HA 1P1OA 2REGA 2XX9A 3EHUA 2XXYA 1Y3NA 5EHSA 3UORA 1NH8A 4HTGA 5AA4B 2Y7IA 3ZKLA 2UXAA 3S9LC 3FZVA 5CBSA 4WXJA 1JNFA 4NWCA 4OFJA 5AA4A 5AE4A 2R6GE 3CG3A 2RINA 1B3EA 1Y4CA 1H43A 4OEUA 4YMBA 3KSXA 4JBZA 4P0IA 2F34A 4GXAA 4KPTA 5CM6A 3OEKA 4RPNA 3FJ7A 5FHMA 1JW4A 4YICA 3KN3A 4XXUA 1SBPA 1A40A 4G8MA 2RC9A 3K01A 4R9GA 4OTEA 4WEPA 4OZ9A 1IITA 2RF1A 5CMBA 2H98A 3FJMA 1LSTA 4OESA 1FW0A 1XS5A 4K3FA 2NOOA 4WEDA 1WVJA 3G3KA 1DMBA 4U23A 4NMYA 3IJOB 3K1MA 3IJXB 1BLFA 2F36A 1A8FA 2HQ0A 1MXWA 2Q9TA 3MP8A 3S4UA 3A3CA 1MY2A 4ND9A 1XVXA 3T9XB 4JXIA 5JTYB 1D9YA 3LUYA 1B9JA 3Q26A 2I0CA 4GXSB 3KGCA 4H67A 5JTYA 3M8UA 4YZZA 3EHSA 2OLBA 3RT8A 1MRPA 1BIYA 2XXUA 3IK6B 1Y3PA 3SEVA 1SDXA 4H8IA 1O7TA 3MAMA 1Q35A 3IO4A 2PVUA 1J1NA 3U94A 2GH9A 1R6ZA 3DELB 5ICTA 4BDQA 4F2OA 1R9QA 2FYIA 4EF1A 1MS7A 2F6PA 4R6KA 1B3LA 1D3KA 5H8FB 2PYYA 3BBRA 3CFXA 2ZNTA 5LOMA 5H8FA 4YB6A 4FEDA 5ISUA 4KD5A 3SEXA 3B6WA 3KZGA 1RKMA 5HPQA 3G3JA 1M5EA 3N94A 3OMBA 3FUZA 1TXFA 3QXMA 3PPQA 4EDPA 5AA2D 5CBRA 1POTA 3HCQA 2XXRA 4QRZA 1NFTA 4RK2A 4N07A 4F31B 3RPWA 1MXXA 1D9VA 5CI5A 2Z8EA 1ZBMA 4G2ZA 2QMWA 3H4ZA 4FECA 3HHFA 3G3IA 4MLQA 2IA4A 4ZEIA 1LCTA 4M4GA 3A3UA 1OVBA 4MH5A 4I8CA 3RTWB 2V3UA 2QS4A 5EYFA 1N3WA 2OJTA 1JVYA 1XOCA 3CSGA 3K2DA 3KOTA 3QIMA 2M8CA 1EH3A 1LAHE 4RXLA 1B4ZA 2X26A 1IQ7A 2F35A 3AXFA 5BUUA 1OQGA 4ELRA 1SYHA 2H5YA 2Y7RA 4YKJA 3D4GA 3PD9A 5KCJA 2Q89A 3N6TA 2UVJA 5L8DA 5TP9B 1SD3A 1B0LA 3V8XB 1LFGA 4EQ7A 3TTNA 3TODA 3OD7A 4F18A 2ZYMA 3CIJA 4G4PA 5TP9A 1WODA 1XT8A 2ABHA 2VOZA 1N04A 2G93A 4XKRA 4X48A 4O3AA 4JDFA 2UVHA 3TUSA 3I5OA 2Y7WA 4RJZA 4NF8B 3LC8A 1US5A 3N6UA 3B6QA 3TCGA 1LB9A 3RTFB 3SKPA 1AOVA 2QPQA 4NF8A 4OFOA 3W15C 3TPAA 2YLNA 4OERA 2E1SA 3IL1B 5FHNA 3IOWA 5DTBA 3Q29A 4X1DA 1RYOA 1USYH 2H4IA 4DDDA 2F7AA 2GHBA 3W9WA 1MXVA 4ZDMA 1H45A 1GTKA 3RN8A 4E0XA 2D3IA 3FVKA 4ELOA 4NTLA 5K2XA 3A09A 4EXLA 1UIVA 4NF6B 4R6HA 3IR1A 3UA8A 1XVYA 4JSOA 4DZ1A 3FJGA 4IO6A 1FQEA 4ZE8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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