3LCLA

The d-sialic acid aldolase mutant v251i/v265i
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
NLRGVMAALLTPFDQQQALDKASLRRLVQFNIQQGIDGLYVGGSTGEAFVQSLSEREQVLEIVAEEAKGKIKLIAHVGCVSTAESQQLAASAKRYGFDAVSAVTPFYYPFSFEEHCDHYRAIIDSADGLPMVVYNIPALSGVKLTLDQINTLVTLPGVGALKQTSGDLYQMEQIRREHPDLVLYNGYDEIFASGLLAGADGGIGSTYNIMGWRYQGIVKALKEGDIQTAQKLQTECNKVIDLLIKTGIFRGLKTVLHYMDVISVPLCRKPFGPVDEKYLPELKALAQQLMQER
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title Modulation of substrate specificities of D-sialic acid aldolase through single mutations of Val251
rcsb
molecule keywords N-acetylneuraminate lyase
total genus 122
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.3.3: N-acetylneuraminate lyase.
pdb deposition date 2010-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3lclA00
1LTDA 3FA5A 3GAKA 4OQVA 1OYAA 2DZXA 3N14A 3R5EA 4PODA 5LNSA 2HSAA 3W1RA 2YXGA 5CPOA 1P0KA 3NL2A 4AWUA 2YGYA 2QJIA 3CEUA 2FB3A 2A6NA 1XUZA 4M7SA 5MHBA 1FDJA 4OV9A 3W74A 2WSYA 4UTWC 4EIVA 1KLZA 4LS2A 4O18A 2Q8LA 3W7MA 3BW2A 3LDVA 3EWUA 3S9YA 4NQ1A 5C6MA 1W5PA 4QJ1A 4XBKA 2ATMA 3PUDA 5CG7A 4LTSA 4OGZA 3DI0A 3M9YA 2ZDRA 1THFD 3W83A 2TSYA 3FOKA 1EIXA 2BSLA 4TMCA 4U4MA 4GWEA 3GDLA 4JN6A 1OF6A 1MEIA 4NJGA 5FEXA 3RLVA 3INPA 1QPRA 3LRMA 1H63A 1TQJA 1WYIA 1CX9A 1ONRA 3R13A 3FIGA 1SO4A 4Z0JA 3GB6A 3G8RA 1DJQA 2ZRWA 3QEZA 5D03A 1HL2A 2FFCA 4LVFA 3RMJA 1S5TA 5GVJA 1YPIA 4AH7A 5AYXA 1UUOA 5EKYA 3MO7A 2ZRVA 2W6RA 3NPUA 3UZJA 5J5DA 3UD6A 4UTKA 1JQVA 3PBWA 3PY2A 3OIXA 2O7QA 1GVRA 3BG5A 3E02A 1TPDA 3FLUA 2EAWA 4IXXA 1MXSA 4JDBA 1NAL1 2GJLA 2A7PA 4ZVJA 3TJLA 5KTLA 3QSTA 1G67A 4XUGA 4XZ9A 3GDTA 1TRIA 5HJLA 4LVAA 3PWAA 4JX6A 3B0PA 3STCA 1XUUA 1QMLA 4LS0A 2ALDA 3W7GA 2ZZ3A 4NX0A 4FB7A 3GAYA 1KM2A 2W79A 2CW6A 3DFOA 3EXRA 5DBUA 3G1YA 2ZZ7A 1OFOA 3SGUA 4PEKA 2J9ZA 1WV2A 4NNBA 1GQNA 3BLFA 4FXRA 4O1AA 2JKPA 2E5CA 2QUUA 1OJXA 1QAPA 5U4NA 3I6RA 4Z1CA 3IVUA 3TE9A 1NVMA 2YCEA 4R34A 4DO6A 4JTHA 1GYLA 1VGAA 4A2RA 5LNVA 4P61A 4HSOA 1TTJA 3KAOA 4XKYB 4MYAA 4LWWA 2G5WA 2C6QA 5FF3A 4MKNA 5LKYA 3WK1A 4P2VA 1DKWA 5F4SA 1L6WA 5G2IA 3O16A 3W1MA 1JR1A 3OBKA 2NWRA 4UTTA 5CGQA 4UFIA 1OX4B 2P10A 5K3VA 3G8EA 4R53A 1NFBA 3L21A 3BK0A 3BGGA 4N6EA 4MY1A 1G4TA 1VYSX 3R8RA 3UWWA 3MP3A 3HPSA 4UFLA 1R2SA 3LHVA 2V82A 3M47A 4E0CA 3C3NA 1LOQA 3NQEA 1LRQA 3EWWA 4XKYA 3W7EA 3IVSA 4GRSA 1FBAA 1KTCA 4DXVA 5HQEA 3VNDA 4WOZA 2AGKA 2CLFA 2VKZG 3C61A 3G18A 3P5YA 4Q32A 4Y90A 4BI7A 1AMKA 4UR8A 3W86A 2Z1BA 1YTKA 1IF2A 3IIPA 1F73A 1IIGA 5I3JA 3UWQA 1Q6RA 3NDOA 3NM3A 4NJIA 4I7VA 3W1PA 3THAA 1T0OA 5HR7A 1PCWA 2XN2A 3P84A 1WX0A 5SWUA 1J2WA 1LRTA 1OFBA 2F84A 3W2JA 3DENA 4RLIA 4QSHA 4IMFA 3UNDA 4PH6A 4YMZA 3TCEA 3P82A 3BV4A 4NJJA 4HPJA 1A5CA 5D38A 3E12A 3W7JA 1F7BA 3JS3A 1C9DA 1KFCA 1TJRA 2C3ZA 3QW4B 4N4PA 1TJPA 2A1YA 5LHEA 4ORIA 2RDWA 2ZZ4A 3A24A 4Q33A 1YTEA 4N02A 2TRSA 2ZFAA 3MYPA 3W7RA 3S1VA 3W7KA 3ZS4A 2D73A 1OX5A 3NZ1A 3LLFA 4GUIA 1RV8A 3IIVA 3DZ1A 2B4GA 3HJZA 2C0AA 5F1VA 4A3UA 3FJ6A 1GTHA 3IGSA 3DKLA 2E6YA 1QFEA 1W5NA 4HSNA 4RXFA 4UTLA 2QCLA 1JCXA 4CQAA 2H8ZA 4IMDA 1PE1A 3P60A 1LBMA 2PRMA 3M0ZA 3TSDA 3P8IA 1BWKA 4GBUA 2I1OA 5CZTA 3W1NA 1HFBA 1Z41A 3S5OA 3TMQA 1U5JA 4OE7A 1K8ZA 2EPHA 2VEKA 1SR9A 5DBTA 5KZMA 4UTWA 5LZLA 3MW7A 3SR7A 5AHFA 4AEOA 3LCXA 1WBHA 3ZR4A 1O5XA 2NUXA 5CZJA 2Y7DA 3C8FA 2A5HA 5AHMA 1Q45A 2X1TA 3E96A 2GJNA 1SU5A 1BTMA 1H7OA 2WO5A 2CZEA 4EF8A 4IPIA 2RDTA 4MVAA 3LERA 1LZOA 4BWLC 1YXCA 4MZ1A 2CLKA 4RKAA 1O60A 1KM3A 1M6JA 1TSIA 3MUXA 3CB8A 2WV8A 4LC6A 4JTJA 5TQLA 3GXNA 1X6UA 3MWAA 1H7XA 3I7RA 2V8ZA 3GDRA 4JNMA 3OG3A 5BMWA 4ZQRA 2J27A 3W2LA 1YXYA 1LBLA 2QCCA 1XKYA 2CZDA 3NGJA 3ANYA 2OT0A 2XN0A 1S5WA 4M6PA 1Z42A 2Z0IA 2ZTJA 2EHHA 5G4WA 2WSRA 1UB3A 3A5FA 1A5BA 1GJPA 3G1FA 5L9FA 1W3IA 4E2BA 1FCBA 1JCMP 4HNUA 1TCDA 2VFEA 3IV3A 1K03A 3NVTA 4XBSA 1XCFA 3KVKA 4RJEA 2RKXA 3GNNA 3PVFA 2PE4A 4KKXA 7TIMA 1JCJA 2CLLA 3W76A 3U6WA 3PAJA 3TQKA 3NPWA 3FS2A 1A50A 4DF2A 3GVGA 3KRUA 1IGSA 5A8GA 2C15A 3PSWA 3RF9A 2X1RA 1W37A 4AMAA 3KFTA 1JCLA 5G1YA 1RPXA 4N9DA 1VJIA 8TIMA 4NXSA 4NJKA 1SUXA 1F05A 3C6CA 1F6KA 2QEZA 1ZAIA 3GZ3A 5LGZA 3L0GA 3YPIA 1RVGA 2J6XA 4TR9A 2QDGA 2OCZA 2Z6IA 1FWRA 3NNTA 4OU1A 3C4UA 3W7DA 2QR6A 3SIZA 4DQWA 3S5YA 1O5KA 3W1TA 1D3HA 2H3BA 5D37A 4UNKA 5KZDA 5AFDA 3RU6A 5KINA 1YXDA 1QPNA 3TSBA 4JGDA 1I45A 4O11A 2YYTA 2WJZA 5TIMA 5CZ0A 1LOSA 1G4EA 3P5ZA 5AC8A 1JULA 3S5NA 3EB2A 3W1LA 2Q3RA 2V2CA 3Q58A 5DCBA 2ZRYA 3NG3A 3LRKA 5L6UA 4HNVA 4Y6GA 3CU2A 5AYZA 1L2UA 1Z48A 4O50A 3CQ0A 1XC4A 2FTPA 3TUUA 3F4NA 2ZZ5A 1X1ZA 1LP6A 1L6YA 4K6AA 1TO3A 1ME7A 1W3NA 3W70A 2YR1A 1AK5A 1R30A 4FNUA 1G7UA 1TMHA 1HUVA 1QWGA 4DO5A 1VHNA 2FPTA 4C1KA 3EX1A 1XBZA 4UFHA 1KV8A 3FYOA 1J4EA 3LXBA 3WJXA 3L67A 5EBUA 3UY7A 1NSJA 3QM3A 3LHUA 1TB3A 3L66A 2DZPA 3P81A 1SW7A 3TSMA 4BR1A 4K7YA 5H91A 3F03K 4OT7A 3RFAA 3VFLA 1ICQA 3B03A 1LM1A 2GPTA 1AG1O 5DY2A 3MP4A 3SGZA 3PC0A 3W2UA 1ALDA 3HG5A 4RZ4A 3EX6A 3I7SA 4MJMA 1QCWA 3DBPA 3T78A 3DFSA 1ZY9A 2I14A 2BWGA 3N9RA 1P0NA 3LGEA 1ZCOA 1F2JA 4IX2A 1SFLA 4WX2A 3HPXA 5U7SA 3TW6A 4N6FA 3O6CA 4JTEA 4WXYA 2J9XA 3S6DA 2ZZ2A 4J9JA 1C29A 3UWVA 3NQ7A 3NQ8A 4IXHA 4I7WA 4N4QA 3ATZA 3PM6A 4AVFA 3G24A 3OA3A 3P8JA 2E5BA 1LYXA 5AN7A 1W5QA 4Z1BA 3W84A 4DBDA 5F1UA 1I2QA 2C18A 4UFJA 3LTYA 3TW7A 3BARA 2QJGA 2V9DA 1H7NA 2FLIA 5G2WA 3KVLA 4LVDA 2IQTA 3BGJA 3NQDA 3QRHA 1GG0A 3JR2A 4A21A 3KVJA 1TPH1 1UBSA 3G0XA 2J9YA 4ADSA 3M7WA 1VRDA 2TPSA 1KFJA 2FJKA 4XTDA 5F2IA 1X1OA 1AW2A 1VYPX 1WQ5A 1B4EA 3DH7A 5LNUA 3U8GA 3NZRA 4UTIA 1TYGA 3NXFA 3A22A 2YW4A 3GIYA 3NQAA 4RR4A 3SECA 1GVQA 3EKLA 2NLIA 4DF0A 3UWZA 5FF4A 4NX5A 3QMRA 3BW4A 2C14A 3W85A 1KBJA 3N73A 2JK2A 1VH7A 3DGRA 4O28A 3GXTA 5LGXA 1QOPA 4BWLA 1PL9A 3IVTA 1PV8A 1FDZA 5D2WA 1KFLA 1OG0A 3PUEA 3HF3A 1YPFA 1IXOA 4M6QA 5K9XA 2DZVA 3L0KA 2JBMA 5CKSA 4ZMGA 4WJEA 1T99A 3TR2A 3G22A 5BMXA 1SO3A 3N3MA 1EWDA 1H62A 2H3DA 3L5MA 3NYZA 2FDSA 4DPQA 2NV1A 4GNJA 5E0KA 1O95A 1IXPA 2GVLA 2Y63A 1LBFA 3FJLA 1XL9A 3BG9A 1U83A 2B0MA 3TXZA 1SO6A 1LORA 1GVSA 5DCDA 4X3ZA 2ZRXA 2ATSA 3C0JA 3A9IA 5AHEA 4CCEA 1L9WA 3B05A 4O13A 3QW3A 4GUHA 2A2IA 3G0UA 1HTIA 2ZA1A 3NEVA 5F2LA 3W7LA 4BK9A 3TC7A 2EKCA 2Y7FA 3S42A 3I68A 2WQPA 3O15A 5EYWA 3G1XA 3M44A 1LOLA 3WJZA 1ZAHA 4FF7A 4GXMA 1XDLA 2C1HA 3GDKA 4FNQA 4O16A 2Y62A 4JY8A 1VC4A 5KMYA 4UR7A 1A5SA 2VXNA 4JTGA 2V5LA 2X30A 3LTSA 1OFDA 2X1UA 1TTPA 3TQVA 2WNZA 4Y96A 5CZSA 3UY8A 4RK8A 2X16A 4O8RA 1G7VA 2WNNA 5BW6A 1F5ZA 3GR8A 3DFQA 2A85A 1AL7A 4K39A 3B0VC 5D05A 2CLHA 4GUJA 5A5WA 1Q3NA 5D2XA 4O10A 3TROA 1VHCA 4YCOA 4CCCA 5AHLA 3MJYA 1TPUA 2CLEA 3GX9A 5T26A 2ZA3A 4OHQA 1K02A 1F76A 2QCMA 2QKFA 2FB2A 5HNRA 1IXQA 3TAKA 3MI2A 4YL2A 2XFWA 2QAPA 1C8VA 3O8AA 1ME9A 3KRSA 1PS9A 3DHDA 3BVJA 2VFGA 3TA6A 5BRBA 1VLIA 3STGA 2WOQA 2YPIA 1WBJA 3IIOA 1VQTA 5D33A 4LUJA 1EX5A 4WXZA 1KBIA 4AF0B 1TTIA 2UV8G 1FCUA 3FKKA 4WQ6A 1DHPA 1W54A 4IWWA 4JDYA 4RXGA 3D0CA 4FHAA 3T40A 4AB4A 2A0NA 3GLCA 2Z6JA 2PRHA 4NVTA 2A4AA 3W2NA 1KM4A 5KZEA 3B04A 3NL3A 1TPEA 4RZ6A 4LNYA 4XQ6A 3EWZA 1JCNA 3EEGA 2A7NA 3VKJA 3LM7A 1I4NA 3GKAA 1ICSA 2YFOA 3GNDA 4AAJA 1H50A 3Q94A 1H7RA 4AF0A 3DXIA 3ABSA 3W72A 4ZZ9A 1SW3A 1LLWA 2CFFA 3LCGA 3NL5A 4CCDA 3T4CA 2J88A 3NAVA 2C16A 1DQXA 5AC6A 1ME8A 3UXDA 3UPBA 4K36A 1VLWA 1IIHA 1SFJA 1SZGA 1BEUA 3A23A 4L4LA 1VZWA 3L5LA 1G6CA 4LC8A 1W56A 1YDVA 1R46A 4EF9A 5HR6A 1DBTA 2QAFA 3NQCA 4ONVA 3HPZA 4EWND 1UJPA 4GFSA 1YDOA 3KXQA 2CU0A 1I8JA 4G1KA 1I2OA 3AJXA 1JCYA 4GC4A 1E51A 5LNWA 4HN4A 1VR6A 4DF1A 2WNQA 1XFBA 1KW1A 1FY6A 2V30A 3OVPA 3H53A 3I65A 3SFKA 5IBXC 2OX1A 3SW6A 1XXXA 4LRTA 1H1YA 3MI6A 3LOTA 4Z0SA 2C19A 3P80A 3VCRA 4UMCA 5DXXA 4JYEA 3FFSA 4KWVA 4DEFA 3HGOA 4UCGA 3WFAA 1OK6A 3CHVA 3KRZA 5G4EA 4CNNA 4WY0B 3M1ZA 5HMSA 3GR7A 4FEZA 1KFKA 2Y7GA 3Q37A 4RV8A 1B57A 1RQEA 3V75A 2Z2UA 2CLOA 5I3FA 5CPLA 1ZALA 2QCGA 1TPWA 3CWNA 3EX2A 5HWNA 3WJYA 3SZ8A 4JYFA 1GZGA 1KLYA 3HOJA 3N2XA 4RCXA 5E93A 1KM5A 1OYBA 5LSMA 5I3IA 4K8HA 1SW0A 3W7HA 3EX4A 4MYXA 1OFPA 3P7YA 2R91A 1K7XA 3N19B 3G3DA 4O15A 4Z1AA 2RH9A 3HBLA 3LRLA 3MMTA 2QDHA 1YDNA 2Q8ZA 4WY0A 4RX0A 4MFDA 3W9ZA 3LCLA 3ABOA 4JICA 1ZNNA 4JIQA 3HB9A 4AWTA 3T44A 4DO4A 4JEQA 3IEBA 4GE8A 3KHJA 2ZTKA 1JUEA 4NU7A 1K3UA 1XBXA 2ZCGA 5D2VA 2E1DA 3SI9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GAK A;  4OQV A;  3V18 A;  4AEF A;  4POD A;  2HSA A;  4P8W A;  2YXG A;  5CPO A;  4E8G A;  1AJZ A;  1Z32 X;  3HPF A;  3NL2 A;  2GGH A;  1OGB A;  3CEU A;  1WPC A;  2A6N A;  4M7S A;  1VBR A;  3B9A A;  3A4X A;  4GXW A;  3WUB A;  4UTW C;  3VD7 A;  2ZX7 A;  4GY1 A;  4NZ1 A;  4LS2 A;  2OXN A;  1EL3 A;  3SCW A;  2XIB A;  2YL6 A;  4HMC A;  4I6V A;  4AIE A;  2D0H A;  3MUI A;  4XAF A;  2ZUU A;  3PUD A;  1JPM A;  5CG7 A;  3PN8 A;  4ZE5 A;  3AIB A;  5LYR A;  1GVI A;  3C5Q A;  4HA0 A;  1P6C A;  4NJG A;  1H63 A;  1DJY A;  2TOD A;  3ZT7 A;  4LEF A;  1CX9 A;  4PCN A;  3R13 A;  3FIG A;  4LNC A;  4MSS A;  2PSN A;  2WWC A;  2Q02 A;  1XHG A;  1GPF A;  1MXD A;  2QII A;  2ZRW A;  3DC8 A;  4LVF A;  3RMJ A;  4R85 A;  1S5T A;  4L6O A;  4ZOD A;  4YWS A;  4XSL A;  3UZJ A;  2ZWZ A;  1JAK A;  2XTK A;  4UTK A;  1JQV A;  3PBW A;  3PY2 A;  4KCV A;  2PWU A;  2O7Q A;  1GVR A;  2EAW A;  1MXS A;  1QI4 A;  4F0K A;  2A7P A;  4D6J A;  1PBG A;  3TJL A;  1E6P A;  3GDT A;  1TRI A;  4E4F A;  2R24 A;  2CWX A;  4LVA A;  2PDW A;  4JX6 A; 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