The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
82
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structure length |
82
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Chain Sequence |
VPATRILLLVLAVIIYGTAGFHFIEGESWTVSLYWTFVTIATVGYGDYSPHTPLGMYFTCTLIVLGIGTFAVAVERLLEFLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Novel insights into K(+) selectivity from high-resolution structures of an open K(+) channel pore.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Calcium-gated potassium channel mthK
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| molecule tags |
Transport protein
|
| source organism |
Methanothermobacter thermautotrophicus
|
| total genus |
31
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| structure length |
82
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| sequence length |
82
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-01-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4H37 A; 3STZ C; 2WLJ A; 1M56 C; 2WLK A; 1BL8 A; 3E86 A; 4MSW C; 4PA6 A; 3TET A; 4P9O A; 4RAI A; 3R65 A; 2YEV A; 4MTO A; 2WLI B; 1R3I C; 3AG3 C; 3OUS A; 1LNQ A; 3LDE A; 3LDD A; 4MVM A; 1ZWI C; 4PA7 A; 2EIJ C; 1OCR C; 2W0F C; 3SYP A; 4DXW A; 5CBG A; 1OCO C; 3GB7 C; 1P7B A; 5CBF A; 2Q68 A; 3RVZ A; 5EBM C; 5EBW C; 2WLH A; 1ORQ C; 2Y69 C; 3X2Q C; 3OR6 C; 4BW5 A; 3T4Z A; 3K0G A; 4WFF A; 1K4C C; 4G27 B; 2Q67 A; 2P7T C; 4P30 A; 5KUM A; 4MVS A; 3RW0 A; 3ASO C; 3JYC A; 4GX1 A; 4LCU C; 4R7C A; 2DYR C; 2X6B A; 3FB8 C; 2QKS A; 4F4L A; 2AHY A; 4PA3 A; 4J9Z B; 3K06 A; 4WFH A; 4PA4 A; 1XL4 A; 5EBL C; 1J95 A; 2KB1 A; 3AG2 C; 2HVK C; 2Q6A A; 3LUT B; 4RO2 A; 4X88 A; 3SPI A; 4G28 B; 2ATK C; 4XDJ A; 4OXS A; 3ASN C; 2HJF C; 4ZBM A; 2H8P C; 3SPH A; 3SYA A; 3LDC A; 4JTA B; 4PDR A; 5E1A C; 1M57 C; 5B1B C; 3E8F A; 3T2M A; 2JK5 C; 4MVU A; 4TWK A; 3FB5 C; 2DYS C; 3SPC A; 3E8H A; 3STL C; 3SYQ A; 5CBH A; 3ABK C; 4EKW A; 5KUK A; 3EFF K; 3HPL C; 4P2Z A; 2AHZ A; 2R9R B; 1S5H C; 4H33 A; 4X8A A; 4I9W A; 3E83 A; 3SPJ A; 5IY5 C; 2NLJ C; 4QE7 A; 2BOC C; 3E89 A; 3FB6 C; 4HYO A; 3OGC C; 4KFM A; 5EK0 A; 2HG5 C; 2Q69 A; 4XDK A; 2HVJ C; 4MS2 A; 3RVY A; 1R3L C; 3FB7 C; 4HZ3 A; 2ZXW C; 3K08 A; 4MW8 A; 3IGA C; 4X89 A; 3SYO A; 2DWD C; 2A0L A; 5B1A C; 3AG1 C; 1JVM A; 4PDV A; 2WLM A; 3E8B A; 3SPG A; 2A9H A; 3VOU A; 2X6C A; 3F7V C; 5J9P C; 3F5W C; 4MVR A; 4GX2 A; 4CBC A; 3F7Y C; 3K03 A; 4J9Y B; 2WLL A; 4MW3 A; 5EC2 C; 2EIL C; 4PDM A; 3OUF A; 3ABL C; 1OCC C; 2A79 B; 3T1C A; 3KG2 A; 4LP8 A; 4MVQ A; 4PDL A; 1K4D C; 1QLE C; 4LBE C; 4QNH B; 2EIM C; 2IH3 C; 3E8G A; 2ZD9 A; 3PJS K; 3RBZ A; 2DWE C; 2WLI A; 2K1E A; 4MVO A; 1XL6 A; 1V55 C; 4MTG A; 4RUE A; 3ZJZ A; 3T4D A; 3SYC A; 3ZRS A; 4R8C A; 2ITD C; 2BOB C; 1G4Y B; 4XDL A; 4PA9 A; 4GX5 A; 5EC1 C; 3ABM C; 3K0D A; 4GX0 A; 2QTO A; 4MVZ A; 4UUJ C; 4RUF A; 4JTC B; 1R3K C; 2ITC C; 3UM7 A; 4JTD B; 1V54 C; 4MTF A; 3BEH A; 5BZB A; 3SJQ C; 3K04 A; 5B3S C; 1KKD A; 1OCZ C; 3WG7 C; 4P9P A; 2WLN A; 3IFX A; 3LNM B; 4R6Z A; 4WFE A; 3AG4 C; 4WFG A; 2HFE C; 2IH1 C; 3TCU A; 2OCC C; 3UKM A; 1R3J C; 2WLL B; 3OR7 C; 2EIK C; 4R50 A; 4QE9 A; 2X6A A; 2EIN C; #chains in the Genus database with same CATH topology 2OYQ A; 2R70 A; 4YJ3 B; 3C90 A; 4P9O A; 3J7A U; 4JYB A; 1MMM A; 1UFI A; 5CBF A; 2P22 C; 4LFB O; 2LW1 A; 1GM7 A; 3T4Z A; 4JV5 B; 2XOK G; 3H1L H; 2GSM B; 1K4C C; 3VBB A; 4AQY B; 3C3S A; 5EZY A; 2PTM A; 3K06 A; 5LL6 Y; 3JD2 A; 4G28 B; 1YXB A; 1AJP A; 3VQW A; 1DF4 A; 4TV9 A; 2Q0O C; 4JI4 B; 2DE0 X; 1FPO A; 3LDC A; 1PPJ H; 4GKK B; 5IT9 N; 3RWR D; 1RM1 B; 5LYJ A; 4LFC B; 1S76 D; 1K3E A; 4WFB V; 2XAJ A; 1FXH A; 3KCY A; 4W4L A; 2VQE B; 3IC9 A; 4X8A A; 4I9W A; 4E4E A; 3SPJ A; 3AK1 A; 4LF4 O; 2E76 B; 3ZBH A; 4JYY A; 1TVK A; 2Y69 B; 1WPX A; 4BIO A; 4O4L B; 2EIN B; 2GTA A; 2KG7 B; 2QWQ B; 4JI3 B; 1S72 V; 5K1X A; 5H2F Z; 3JSN A; 1EFR G; 4LH7 A; 3L73 H; 4Z2W A; 1U97 A; 4LP8 A; 1NVP B; 2NN4 A; 2A7W A; 1IBL B; 1H8H G; 1XBL A; 2K1E A; 1HW7 A; 5C8Y A; 4CS2 A; 3ZRS A; 1G1X B; 1G4Y B; 4EEQ A; 1ZL8 B; 5CB4 B; 2Q5Z A; 2HEP A; 2ZT9 B; 4WBN B; 4IHJ A; 4NB5 A; 1XNR B; 1R3K C; 5BZB A; 1GAX A; 4HNA B; 1KKD A; 1B6Q A; 3K9S A; 4R6Z A; 1XMO B; 3UKM A; 1QCE A; 2R9I A; 3JSL A; 4LFA O; 3T1H O; 4FK5 C; 4DR3 B; 3E86 A; 5JCO C; 4OX9 B; 3AG3 C; 2LFR A; 2Q7G A; 2QWR B; 1BE3 H; 3CCL V; 4UCO A; 2ZM6 O; 2M6Y A; 1QQC A; 4JAS A; 4LF8 B; 2ZE8 A; 5LP6 B; 1NQT A; 1BQ0 A; 4WFA V; 1XMQ O; 4B3S O; 5JVD B; 1GRJ A; 4DV7 O; 5KHI A; 2C2A A; 4F4L A; 2PF4 E; 2ZIN A; 3QTC A; 1QHT A; 1OHH G; 2AZ2 A; 3LUT B; 3K58 A; 5LMN B; 4XDJ A; 3CC4 V; 3ZRV A; 1DTO A; 2IJJ A; 2YI8 A; 4IYI A; 3A8T A; 4TWK A; 3N2G B; 4DV2 B; 2GHY A; 2XND G; 1XNQ O; 2FB5 A; 1S5H C; 4I55 B; 5IY5 C; 1VQO V; 4QE7 A; 2OIE A; 5IDJ A; 5KLV H; 1RFY A; 5B1O A; 2ADP A; 1S77 D; 3HKD B; 4MW8 A; 4X66 B; 2B5U A; 4EFB A; 4DR7 B; 4X1K B; 5IJ9 B; 1FS0 G; 3AEI A; 3OTO O; 1N4C A; 4PEL A; 1URF A; 4X20 A; 1M1K W; 4J11 A; 1K4D C; 1W59 A; 5JWP A; 3JAS A; 2EIM C; 3PJS K; 3CCS V; 1NT2 B; 3RYI A; 3LNN A; 4RWU A; 1YF2 A; 4RUE A; 1N32 O; 2JGD B; 4JZG A; 3A0R A; 4PA9 A; 3RYH B; 5KHH A; 3L70 H; 2YIB A; 2ITC C; 3I56 V; 4JTD B; 3UT5 A; 3JAM N; 3ETE A; 1FYJ A; 4DV4 O; 4DR5 O; 3A0B Z; 3AG4 C; 1BGY H; 4F6R A; 1TUE B; 4FM2 A; 3TET A; 4DV1 O; 1M90 W; 2Q8V A; 5IYC O; 4TUY A; 2P5O A; 2W0X A; 4X62 O; 2W6J G; 4KXR A; 4X1Y A; 2Q68 A; 2WSS G; 4TT3 G; 4YJ2 A; 3M7M X; 2Q67 A; 2AGA A; 1SRY A; 3ABM B; 3JYC A; 1F4N A; 4U7O A; 2EJ7 A; 3CD6 V; 1Y76 B; 3ZCC A; 3B40 A; 3JAK A; 4TV8 B; 2R72 A; 4FLY A; 2UXB B; 1PL0 A; 2H8P C; 5B1B C; 1DF5 A; 1GMG A; 4LWS B; 1GN2 A; 4WCE V; 2CGO A; 1SZX A; 3GVM A; 5A2Q N; 4H33 A; 1Q7Y W; 3BAA A; 2Z3Y A; 5KX5 A; 1OCO B; 4H44 B; 1JX9 A; 1P49 A; 4O2B A; 1S5L Z; 1PV0 A; 4IIJ B; 2OCC B; 1EN5 A; 2QJ1 A; 5AG2 A; 5EIB D; 5FNV A; 3W7S A; 1M56 B; 3CX5 F; 4GYC B; 1NH2 D; 3JAR A; 2OTL V; 2D3O W; 1K5S A; 5EC2 C; 4DUY B; 3OUF A; 2LQT A; 1HNZ O; 1NTK H; 2JVD A; 2UXD B; 3NR7 A; 2LO1 A; 4LBE C; 3CC2 V; 1IX9 A; 2WLI A; 2BSK A; 2ETN A; 2HR3 A; 5ITZ A; 3JAW B; 2UU9 B; 1SQQ H; 2K9P A; 5CA1 B; 4B3R O; 1K73 W; 3ML0 A; 5KHK A; 2ZXW B; 3TCU A; 2EIK C; 4K0K O; 1CPY A; 2E3C A; 4CH6 A; 4WF9 V; 2JJ1 G; 3ICX A; 4J80 A; 4I50 A; 3ZHT A; 3SJB C; 3J81 N; 4JZ2 A; 1SC5 B; 3QVN A; 5JH7 A; 4I5S A; 2QKA A; 3JAL B; 1ORQ C; 3X2Q C; 2ODM A; 2B1I A; 4MVS A; 5J2T A; 4DV3 B; 5B1A B; 4AI8 A; 2RMK B; 3FB8 C; 3D3Q A; 3K57 A; 5L3F A; 4DW0 A; 2ZDI A; 1BHA A; 1W2B U; 1SQF A; 2Q6A A; 3AG2 C; 1QNM A; 2YID A; 3ZX6 A; 4ABM A; 4FFB B; 4ZHQ A; 3UO3 A; 1H2K A; 3OMA B; 1RPR A; 1GN4 A; 3HB3 B; 4PDR A; 4FLT A; 1SQG A; 2BCC H; 4P2Z A; 2EIJ B; 4QPJ A; 3CMA V; 4GT1 A; 1I94 B; 5GW7 A; 4D7T A; 4FIP C; 3ZHQ A; 2YXY A; 2E5L O; 5JQG B; 4C7U A; 4K3A A; 4YY3 B; 4EB6 B; 3QO5 A; 4HZ3 A; 2A0L A; 3G6B A; 1FFX A; 1TGO A; 2A9H A; 3S3W A; 1COW G; 5BR8 O; 2QWO B; 1NKD A; 4MW3 A; 1IBM O; 2VWJ A; 4O4J B; 5TIS Z; 1OCC C; 5GTH Z; 3T1C A; 3APO A; 5HFM A; 1GN6 A; 1N33 O; 1BSM A; 4I0X B; 1VIB A; 4GUN A; 1K97 A; 3U0Z A; 4R8C A; 1SZT A; 3L75 H; 2QTO A; 3ZRX A; 1XQ8 A; 1R6T A; 3RYF B; 3K04 A; 4ZOL B; 1AR5 A; 3BFR A; 1KEC A; 3FX7 A; 3OGC C; 1CEZ A; 2YEV A; 4W4K A; 1LNQ A; 4LF9 B; 3LDE A; 1ZWI C; 4PA7 A; 4UCT A; 4CS3 A; 4LF5 O; 1IUR A; 2UXX A; 4E2L A; 1ZX3 A; 2CK3 G; 4DV5 B; 2H3O A; 4O4H B; 1JFF B; 2FML A; 3RFR A; 1J5E O; 1VP7 A; 5IYD O; 3N2K A; 1HP8 A; 3LSU A; 1AI5 A; 5LMU B; 5E79 Z; 2X6B A; 4JI8 B; 4N23 A; 3HKC A; 1D5N A; 5CA0 B; 1M93 A; 2PYJ A; 3J80 N; 3E22 B; 2YIB D; 1UPG A; 2EJR A; 3U10 A; 2P90 A; 3F5T A; 3P32 A; 4YJ3 A; 5H5N A; 2ZKO A; 3JAT A; 2GDS A; 3B8N A; 3G67 A; 3ZMT A; 4B7K A; 3BA9 A; 1QU7 A; 4JI0 B; 3IGA C; 3EXA A; 3AG1 C; 4UCU A; 4JI5 B; 2WPD G; 1NI8 A; 3OT7 A; 4X1I A; 4DW1 A; 5IWA O; 5KA5 A; 2XAG A; 3CXH F; 1N34 O; 4X64 B; 4DK0 A; 1OCR B; 3HKE B; 4B08 A; 4MVO A; 1V55 C; 4MTG A; 1KP2 A; 1Q43 A; 4GX0 A; 2PY5 A; 4O2A B; 2KQX A; 1FJG B; 3UM7 A; 5IJ0 A; 1V54 C; 5B3S C; 2ARH A; 3Q4H B; 4DUZ O; 2IH1 C; 1H38 A; 3CCR V; 1QLN A; 3BPZ A; 3U11 A; 1HNX B; 1BL8 A; 1IVS A; 3B8M A; 4FPP A; 2CTP A; 4ZI7 B; 4MVM A; 1TUB B; 1VQ6 V; 3MHS C; 3G4S V; 1YJW V; 2Y4U A; 4YHH B; 2UUA B; 4FZ1 A; 1M4U A; 3ASO C; 3HKB A; 3D8C A; 1CP9 A; 4J7K A; 4JYA O; 4UCV A; 5EYP A; 4DR4 B; 1OCZ B; 5LXT A; 1PD3 A; 2B9Z A; 2F95 B; 5FL7 G; 1VQP V; 1AJQ A; 1Y74 B; 4UXN A; 1HR0 B; 3RT3 C; 3OEE G; 5JCO A; 4JTA B; 4NXM B; 2DYS C; 3H1K H; 1F23 A; 1N36 O; 5LOV B; 1K33 A; 4LNU B; 1H8E G; 4XBF A; 2F4V O; 4I4T A; 5JJJ B; 3T1Y O; 1BS3 A; 4XDK A; 3ZMV A; 3OFN G; 3WG7 B; 3JD1 A; 1YEW A; 3CRC A; 2ZE7 A; 4O4I B; 3E2E A; 4Z1M G; 3IC7 A; 1FXK A; 1HWY A; 2YIA A; 4J42 A; 3RGB A; 5JVD A; 4B3R B; 5JJE B; 3OD4 A; 4LF7 B; 3UCS C; 2YXH A; 3GWK C; 1VF6 C; 2EZO A; 1RM1 C; 2GBO A; 3K0D A; 1JPX A; 3A0H Z; 5DEC A; 2QSA A; 5GTI Z; 4KL1 A; 1Y66 A; 1YHQ V; 1KYO F; 1O9H A; 3BAB A; 2FKX A; 2Q7E A; 4OPH A; 2VRZ A; 2WLN A; 1A32 A; 4DV6 O; 2GUZ B; 2GTS A; 2EIN C; 3ASN B; 5KMG B; 4JI2 O; 3CSX A; 1SQX H; 1HNW O; 4JI7 O; 1WA8 A; 2VQF O; 1WNS A; 3CPW U; 4DR2 O; 4FLZ A; 4X1K A; 2UUB O; 3RYC A; 1XUQ A; 3APQ A; 2UXC O; 3ETG A; 1B04 A; 1X4T A; 3CRR A; 4D6T H; 2P6J A; 2QM8 A; 2OWO A; 1YTF D; 3B4S A; 4WFH A; 1Q82 W; 1HDJ A; 1NJI W; 2EIL B; 2HVK C; 3EHB B; 4NVP A; 3ABL B; 1SES A; 4FFK A; 3M99 B; 1N0N A; 3OMI B; 1F7Y A; 2DN9 A; 1NH2 B; 3E8F A; 3B77 A; 4MVU A; 1THZ A; 1XRE A; 1GTO A; 2AHZ A; 1Q6U A; 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4QPK A; 3OE7 G; 3LSQ A; 3QO8 A; 3CRQ A; 1MZF A; 1AI4 A; 3BCC H; 1XOU A; 1US6 A; 2DW4 A; 1PNL A; 5H6Q A; 4FJC C; 1WP8 A; 3SGI A; 4WFE A; 4NXN O; 1H2S B; 5L3B A; 2OCC C; 1QVF U; 5CMU A; 1WLE A; 4X20 B; 4F6E A; 1M56 C; 2WLK A; 5L3C A; 1H2N A; 1PNM A; 2R9A A; 2MW2 B; 2RNB A; 3RYI B; 3CWB H; 1M9N A; 4JV5 O; 3OUS A; 3M8A A; 4LF6 B; 1KD1 W; 4DXW A; 3QO7 A; 4AQY O; 3RVZ A; 2ZIM A; 3W7W A; 4FLW A; 3UT5 B; 1JA8 A; 2OTJ V; 5KUM A; 2JS5 A; 4I0X A; 4CH4 A; 2PI5 A; 3ETD A; 5D5Q A; 1I7F A; 4R7C A; 1S3J A; 4LFB B; 4JI4 O; 4F6R B; 5CA3 A; 3B09 A; 5LBQ A; 4PJ0 Z; 4GKK O; 1J95 A; 4LFC O; 1AIL A; 2VQE O; 2F4V B; 2A06 H; 4ZOL A; 3W7U A; 4X1Y B; 3SPH A; 1FD9 A; 3SYA A; 1SQB H; 2PUS A; 4EKW A; 2WAM A; 1H2G A; 4YJ2 B; 2D2C B; 2ILM A; 1WPB A; 4KFM A; 4PHZ A; 1ZUQ A; 5LA6 A; 1AJN A; 3X2Q B; 2OIG A; 1K7D A; 3ZRW A; 5B1A C; 4PDV A; 4ICG A; 3JAK B; 2X6C A; 3C3T A; 4LF4 B; 1JFF A; 4DV0 O; 2Q4P A; 3WFV A; 4OPA A; 3L72 H; 2WA4 A; 1XNR O; 2V4D A; 5LHG A; 1Q90 D; 5KX5 B; 4PD4 F; 1EN4 A; 1VQK V; 3ZJZ A; 5L3E A; 5D5P A; 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