The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
82
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structure length |
82
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Chain Sequence |
b'VPATRILLLVLAVIIYGTAGFHFIEGESWTVSLYWTFVTIATVGYGDYSPHTPLGMYFTCTLIVLGIGTFAVAVERLLEFLI'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Calcium-gated potassium channel mthK
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| publication title |
Novel insights into K(+) selectivity from high-resolution structures of an open K(+) channel pore.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Methanothermobacter thermautotrophicus
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| molecule tags |
Transport protein
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| total genus |
31
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| structure length |
82
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| sequence length |
82
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-01-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2AHZ A; 5EBM C; 2ZD9 A; 4R50 A; 3SJQ C; 3TCU A; 4MVZ A; 3FB8 C; 3IFX A; 4MVS A; 4JTA B; 4MTF A; 1JVM A; 3SYC A; 1R3I C; 1G4Y B; 3ZRS A; 1KKD A; 2Y69 C; 2A9H A; 4PDR A; 4J9Z B; 4BW5 A; 1XL4 A; 3FB5 C; 1LNQ A; 2X6C A; 4I9W A; 4MTO A; 3SPC A; 3F5W C; 1R3K C; 2EIL C; 3SYQ A; 3T2M A; 4R8C A; 1R3J C; 2NLJ C; 1V54 C; 2X6A A; 1P7B A; 1M56 C; 3VOU A; 4PDM A; 2DWE C; 3ASN C; 5EBW C; 3ABL C; 5EK0 A; 3GB7 C; 4X88 A; 3K0G A; 1R3L C; 3K04 A; 4GX0 A; 2WLN A; 2WLK A; 2WLI A; 4HYO A; 5B1B C; 3X2Q C; 4JTD B; 3SPJ A; 5J9P C; 2QTO A; 4PA6 A; 3T4D A; 2Q6A A; 4MSW C; 4RUF A; 4QE9 A; 3OR6 C; 5EBL C; 3PJS K; 4PA3 A; 3E8G A; 1J95 A; 5KUK A; 2DWD C; 2WLL A; 3AG2 C; 4LP8 A; 4TWK A; 3K08 A; 5CBF A; 2DYR C; 1OCC C; 3OUS A; 2HVJ C; 3E8B A; 3FB7 C; 3ASO C; 2Q67 A; 4J9Y B; 4PA7 A; 5IY5 C; 4MVR A; 5B1A C; 3IGA C; 4UUJ C; 3RVY A; 2WLI B; 2IH3 C; 2OCC C; 2H8P C; 3F7Y C; 3OR7 C; 4G27 B; 1OCR C; 3BEH A; 3SPI A; 3HPL C; 4ZBM A; 3KG2 A; 4HZ3 A; 3EFF K; 4P30 A; 3STZ C; 2K1E A; 2EIN C; 4GX2 A; 4H37 A; 5E1A C; 4MW3 A; 4QNH B; 2JK5 C; 5CBH A; 2A0L A; 3K03 A; 3E89 A; 4MVU A; 3ZJZ A; 3OGC C; 2Q69 A; 2KB1 A; 2WLL B; 2WLJ A; 4H33 A; 2WLH A; 4WFF A; 2W0F C; 1V55 C; 2ATK C; 4WFH A; 3AG4 C; 4PA9 A; 3T4Z A; 4R7C A; 2HJF C; 3SYP A; 3LDE A; 3OUF A; 1QLE C; 3E8F A; 4P9O A; 3R65 A; 4PDV A; 3RW0 A; 4F4L A; 2AHY A; 3ABM C; 2DYS C; 3JYC A; 4GX1 A; 4RO2 A; 2HVK C; 2YEV A; 4MVQ A; 2A79 B; 2EIJ C; 4KFM A; 4X8A A; 1S5H C; 2EIK C; 2Q68 A; 4OXS A; 4G28 B; 4PDL A; 3FB6 C; 4XDK A; 5EC1 C; 3SYA A; 1ORQ C; 4MW8 A; 4GX5 A; 5CBG A; 3TET A; 4DXW A; 2ZXW C; 2IH1 C; 2WLM A; 4MTG A; 4JTC B; 4XDJ A; 3LDD A; 4LCU C; 3E83 A; 5B3S C; 2P7T C; 3LNM B; 4RAI A; 1OCO C; 3AG1 C; 2QKS A; 4MS2 A; 4MVO A; 4R6Z A; 5BZB A; 2HFE C; 5EC2 C; 5KUM A; 1XL6 A; 3LUT B; 3UM7 A; 3STL C; 3ABK C; 4PA4 A; 2HG5 C; 4P2Z A; 4EKW A; 2BOB C; 2EIM C; 3RVZ A; 3K06 A; 3SYO A; 3SPG A; 4XDL A; 4P9P A; 2BOC C; 3K0D A; 2ITD C; 2X6B A; 1M57 C; 3F7V C; 4MVM A; 3E8H A; 3T1C A; 3E86 A; 3LDC A; 1K4C C; 3RBZ A; 4WFG A; 1K4D C; 4X89 A; 3UKM A; 2ITC C; 4QE7 A; 4RUE A; 4WFE A; 2R9R B; 4LBE C; 3WG7 C; 1OCZ C; 3SPH A; 3AG3 C; 4CBC A; 1BL8 A; 1ZWI C; #chains in the Genus database with same CATH topology 5D5P A; 1BQZ A; 4Q6G A; 1XRE A; 1HNW O; 2ZD9 A; 3AK3 A; 1Q86 W; 4RQE A; 3M8A A; 4TV8 B; 4J7J A; 1AIL A; 1NQT A; 5KHJ A; 1HNZ O; 1K5Q A; 4HNA A; 4J10 A; 2XTA A; 4X66 O; 3ZHU A; 1S5J A; 1T5E A; 4PDM A; 2A06 H; 3ABL C; 3OM3 B; 5IY5 B; 1N36 O; 3K04 A; 1RPO A; 3JAT A; 1MOF A; 2VQE B; 2OWO A; 1GK9 A; 1RFY A; 2CK3 G; 1FXH A; 3ZRW A; 2NNU A; 3OR6 C; 1RPR A; 1NR1 A; 2DYR C; 3MAQ A; 4J11 A; 4FIP C; 3K57 A; 3A0R A; 4K35 A; 4O2B A; 1O9H A; 5JCO A; 1SRY A; 2WWW A; 4CS4 A; 3VBB A; 4I5S A; 2R9A A; 1N34 O; 2PF4 E; 1P84 F; 2P22 C; 4WFF A; 2W0F C; 4WFH A; 4BWA A; 4AIL C; 2JJ1 G; 4CC5 A; 4JI2 B; 3RT3 C; 4UFZ A; 4TV8 A; 4K0K B; 4EB6 B; 4I50 B; 4AQY O; 4DR3 B; 1IBL B; 2Q68 A; 2Q8V A; 3WFV A; 4JF3 A; 3H1H H; 4U7N A; 1AJP A; 5B3S C; 2UUC B; 5JH7 B; 5DED A; 1H2S B; 3N2K B; 2QM4 A; 4GKK B; 3FFQ A; 1XMQ O; 3CRC A; 2EZO A; 3T1H O; 1R1B A; 2UXB B; 3MDS A; 1J5E O; 3K0D A; 4MVM A; 4X64 B; 5CB4 B; 4J80 A; 4LBE C; 2L6L A; 3BAA A; 1QLN A; 2YC0 A; 2ZNJ A; 4B3R B; 2ZM6 O; 3SJQ C; 4LF9 O; 3X2Q B; 5KA5 A; 4IT5 A; 2D3O W; 3K5M A; 3O65 A; 1WB8 A; 1G1X B; 1KKD A; 2XAF A; 3D36 A; 4ICG A; 1AP5 A; 2Q0O C; 1MMM A; 3SGI A; 4GT1 A; 3BA8 A; 1B3Q A; 1NZ6 A; 4JI3 O; 4O4L B; 4TQF A; 4EB6 A; 1YCI A; 2WAM A; 2YI8 A; 4I50 A; 2GDS A; 1GRJ A; 1MA1 A; 2ZR3 A; 4BW9 A; 4YJ3 B; 3OEH G; 2EIN B; 3HKC A; 4QE9 A; 4UB6 Z; 3G6E V; 2WLL A; 5CBF A; 2ZIM A; 4IHJ A; 1YTF B; 1SQV H; 2QSA A; 3AG4 B; 3AK1 A; 2F4V O; 4ZI7 B; 1EBO A; 3CPW U; 3CX5 F; 2BSK B; 4UCS A; 2OCC C; 5JVD B; 3L70 H; 2FYU H; 4YJ2 B; 3SJC C; 4U7O A; 3D36 C; 1YJ9 V; 2EIJ B; 3CME V; 2Q4P A; 4K3A A; 3ZJZ A; 1WP8 A; 3ZBH A; 4CS2 A; 4N21 A; 5LA6 B; 3MHH C; 4LWS A; 4DW1 A; 1Y74 A; 2XAG A; 1VQM V; 2JDI G; 4DK1 A; 4KUM A; 2RQ6 A; 1PD3 A; 2WPD G; 4JYA B; 4DO2 A; 4I7Z B; 4L8J A; 4NTW A; 3ABU A; 4FM1 A; 2Y4U A; 1ZL8 B; 2YXY A; 2B5U A; 1KQS U; 1MSD A; 1VMG A; 4UV9 A; 4GKJ B; 3L72 H; 4YJ3 A; 2F95 B; 2BOB C; 4X1I A; 1NTM H; 5IDJ A; 1N0N A; 1AI5 A; 3SYO A; 2WA3 A; 3L75 H; 4JI6 B; 1FFX A; 3F7V C; 1M57 C; 3Q4H B; 1AI7 A; 3OTO O; 4JV5 O; 2FTK A; 5JVD A; 3ZRX A; 1M56 B; 2P4V A; 1OCR B; 3BRC A; 4YJ2 A; 4FZ1 A; 4LF8 O; 4Z1M G; 2VRZ A; 5LHH A; 1HR0 O; 3JAK B; 4TT3 G; 4O4J B; 4DR2 B; 2GBO A; 3K58 A; 3CCE V; 5LA6 A; 1YJW V; 3SYQ A; 1QLE B; 4R8C A; 2Y0P A; 4I55 B; 3CXH F; 1HNX O; 4ZOL A; 5K1X A; 4YHH B; 4DV6 O; 1H2K A; 4UB8 Z; 1B04 A; 2UXC B; 4UCT A; 1N32 B; 1KP2 A; 3RYF A; 1URF A; 1EN4 A; 4QIW F; 1ZL8 A; 5LBQ A; 1BHA A; 3K9S A; 4KL1 A; 1V55 B; 3FB7 C; 2JRI A; 2DN9 A; 1YIT V; 4G27 B; 1GN3 A; 4P30 A; 4IYH A; 4H37 A; 2FKX A; 1S5L Z; 4B3S O; 2Y4T A; 2RMK B; 1OCZ B; 1FXK B; 1F4N A; 1Q82 W; 2NN4 A; 1VQ7 V; 2AZ2 A; 5FPR A; 4H13 B; 1YSC A; 4C7U A; 4FZ0 A; 4O4J A; 3F5T A; 3L9D A; 3HKB B; 3RYC A; 4BR6 A; 2CTR A; 1MG1 A; 3TET A; 4HAM A; 4DR4 O; 2ZNI A; 1CP9 A; 4WCE V; 4MS2 A; 2OT5 A; 2H94 A; 1NTZ H; 3UM7 A; 1BE3 H; 5KHK A; 1XMO O; 4JI5 O; 2X7R B; 2MK3 A; 4PA4 A; 2UU9 O; 1SS3 A; 4FLZ A; 4CH4 A; 2ITD C; 3WB1 A; 1FPO A; 3H1L H; 5D5Q A; 4JPR A; 1E1R G; 1IUR A; 5AG2 A; 5B1A B; 1Y6X A; 2YXL A; 3ETD A; 4R7C A; 2UUB O; 3ASN B; 3RYH A; 2LW7 A; 4AHC A; 1KUQ A; 3K59 A; 1P7G A; 3JAW B; 1VQL V; 1B6Q A; 3OGI B; 2JJ2 G; 2EIL C; 1YZB A; 1GM8 A; 3G6B A; 1W0J G; 1JR9 A; 3VQV A; 3DXR B; 1Z5V A; 4JI0 B; 4PA6 A; 3EXA A; 4GUN A; 2LO1 A; 3T4D A; 3SR2 C; 5LGT A; 1S72 V; 3RFR A; 2P06 A; 3CS5 A; 2BTO A; 2E76 B; 3ZX6 A; 4QPJ A; 3RVY A; 2IH3 C; 2RN9 A; 3I55 V; 4NXN B; 3HPL C; 1I5X A; 2LFS A; 2FB5 A; 2QWO B; 2QM8 A; 1IBK O; 2UXD B; 2KB1 A; 2Z5U A; 1HNW B; 3KCX A; 1YVW A; 1ZX3 A; 4UCO A; 3B09 A; 3JSL A; 1NT2 B; 2XT9 A; 3R65 A; 3BHP A; 1HNZ B; 4YY3 O; 1GM7 A; 4JZ2 A; 5H6R A; 3QO5 A; 3S3W A; 3W7T A; 4DXW A; 3JAL A; 1N36 B; 1W59 A; 5B66 Z; 4H44 B; 4DV1 O; 3DSQ A; 2P7T C; 3FKS G; 5BZB A; 2Y0I A; 2YID A; 3O9O A; 4PV1 B; 2Q7G A; 4BAY A; 2ZT9 B; 2FML A; 1K33 A; 5LL6 Y; 4OGQ B; 2CTP A; 2X6B A; 3CCM V; 1L1F A; 1K34 A; 1QNM A; 1H2N A; 1X4T A; 5LP6 B; 1QVG U; 1WNS A; 4JYY A; 3FAV A; 3TGU H; 1N33 O; 2DE0 X; 2RNB A; 4F4L A; 4DR7 O; 1YXB A; 1ZTE A; 5IJ9 B; 1N34 B; 5FL7 G; 3TCU A; 1GN2 A; 4B7K A; 1K9M W; 4EFB A; 4UXN A; 1Q5O A; 4LNU A; 1I94 O; 3G67 A; 1GKF A; 2Q9L A; 3T2M A; 3BY6 A; 3VOU A; 3GB7 C; 4HBN A; 2P4K A; 1Q6U A; 3U11 A; 4HYO A; 1QR9 A; 4JTD B; 1QHT A; 1Z2G A; 4L87 A; 2XAJ A; 2ZDI A; 1SA0 A; 4PA3 A; 1XMQ B; 4LP8 A; 2BTQ A; 2CTW A; 5C8Y B; 3OMI B; 1X59 A; 3ASO C; 1SET A; 1GH6 A; 4LFB B; 2CGO A; 3TJT A; 1RM1 C; 1IBM B; 1DGS A; 2YIB D; 4LH6 A; 3F7Y C; 4HZ3 A; 3JD4 A; 4KXR A; 3I5D A; 4MW3 A; 1D2D A; 1K3E A; 1RSO A; 4MVU A; 4DRX B; 5BMV A; 4X62 O; 1F4M A; 2H3O A; 3BCC H; 2UXN A; 1OCO B; 3JSN A; 2DYS C; 4RO2 A; 1JOY A; 2HVK C; 2EJ7 A; 3CWB H; 5TIS Z; 2ZDI C; 1V9P A; 2KKW A; 2N04 A; 4E2L A; 3G80 A; 1MSW D; 2A3Q A; 1SER A; 3E83 A; 2CH7 A; 5LGU A; 4DR5 O; 3WG7 B; 1US6 A; 4LF5 O; 3HKE A; 3W7W A; 1JX9 A; 1WN7 A; 1GAX A; 3EHB B; 4B3T B; 2F4V B; 1H8E G; 4TQD A; 1N0J A; 2ODM A; 1JQ0 A; 4F6R A; 4UV8 A; 1JFF A; 3JCU Z; 2IJJ A; 3CYO A; 3JAR B; 1A32 A; 2KG7 A; 3OD4 A; 3JD3 A; 5IYZ B; 4DV4 O; 1H2M A; 2IJI A; 1DF5 A; 2Y69 C; 1OHH G; 4BW5 A; 3FB5 C; 2QDO A; 4FLV A; 1NH2 B; 1P7B A; 2YUA A; 5GW7 A; 1UPG A; 1PL4 A; 2WLN A; 4DV2 O; 5L3C A; 1AJN A; 3ZMT A; 2M7W A; 4MSW C; 4FLW A; 1NBM G; 3L71 H; 5CA3 A; 3AG2 C; 5CA1 B; 2XND G; 4ZKI A; 3OUS A; 3CC4 V; 2NR5 A; 4U3J A; 4FFK A; 3IGA C; 4ZHQ A; 2AXT Z; 2HKO A; 3AEI A; 5B5E Z; 1MZE A; 4ZBM A; 1ZSP A; 4FM2 A; 1KBH A; 1F7Y A; 3NR7 A; 4QNH B; 2PYL A; 1L8D A; 4O4I B; 1F51 A; 4W4K A; 2YIC A; 1H38 A; 1ZAU A; 2E3C A; 3JAS B; 4NR1 A; 1BT8 A; 3CRM A; 1JA8 A; 2P6J A; 1HP8 A; 3R66 A; 3BAB A; 3ZED A; 2V7Q G; 1HNX B; 3CRR A; 3FB6 C; 5CBG A; 2ZE7 A; 4B3M O; 2GHY A; 1CPY A; 2ZXW C; 1Q6H A; 3A0B Z; 3C3T A; 4NXM O; 3DC5 A; 2PYJ A; 3CJH B; 3T1Y O; 3AG3 B; 1Y67 A; 2AW9 A; 4FFB B; 3TK1 A; 4J41 A; 4LF7 O; 5CA1 A; 2YIA A; 2R72 A; 1GM9 A; 3A2F A; 2ITC C; 1VQO V; 5FLX N; 1V54 B; 3SPH A; 5BR8 B; 1Q90 D; 1G8M A; 1U96 A; 5JCO C; 4O4I A; 1R3I C; 4BIO A; 4FVM A; 4D7S A; 4DUZ O; 1K7D A; 2ILM A; 2QWR B; 3K5N A; 1VF6 A; 2NLJ C; 1SQB H; 2P90 A; 5IYD O; 4PI2 A; 1AR1 B; 1I08 A; 3CRA A; 3CCU V; 2E5L B; 3KKY A; 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1KYO F; 4O2A B; 4U3F H; 1VEW A; 1YDX A; 2HLD G; 3LSS A; 1WLE A; 4WFA V; 1Q6I A; 4IYI A; 5BXZ A; 4IL6 Z; 3ZN1 A; 3VQY A; 5KX5 B; 1H2L A; 1VAR A; 1ZUQ A; 1WB7 A; 2EIN C; 2EIK B; 1N33 B; 3M99 B; 4J7Z A; 3MD0 A; 1PL0 A; 2WLH A; 2ATK C; 3AG4 C; 1OZ0 A; 3RGB A; 1NU1 H; 1M5I A; 3SYP A; 5C93 A; 2IU3 A; 1BZK A; 5LXT B; 1I94 B; 2IM9 A; 4D6T H; 5FNV B; 2LGQ A; 5JJJ B; 2MW2 B; 2EIJ C; 2A7W A; 2EIM B; 2R9I A; 1W2B U; 2EIL B; 1KKC A; 1ORQ C; 2QWN B; 3Q4H A; 2EZP A; 4XDJ A; 4DUY O; 3B4S A; 4E4E A; 1P4R A; 3SDL A; 3U10 A; 1HW7 A; 1PM9 A; 2P67 A; 5EC2 C; 1QR8 A; 3UT5 B; 4JI2 O; 3ZHV A; 4FLU A; 4DR1 B; 1YJN V; 3JAK A; 1YI2 V; 3OFN G; 4OX9 O; 1TVK B; 3BPZ A; 3CCQ V; 1E1Q G; 1I5Y A; 4WFG A; 2R9R B; 4I55 A; 5KX5 A; 2CDY A; 3LSU A; 3J7A U; 4X62 B; 3IFX A; 2GUZ B; 3ZRS A; 4X64 O; 4G2K A; 5LXT A; 3ZMV A; 1M56 C; 5L3E A; 3E2E A; 2QTS A; 5EK0 A; 1SC5 B; 3K0G A; 4PEL A; 5LHG A; 5LMN B; 1M93 A; 1SQX H; 3H9V A; 4QGP A; 1EM1 A; 2HEP A; 1MZF A; 4DR6 O; 3CCJ V; 5K1P A; 1FXK A; 3UCS C; 2GTA A; 4TOI A; 2HVJ C; 3JD0 A; 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