The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
82
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structure length |
82
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Chain Sequence |
VPATRILLLVLAVIIYGTAGFHFIEGESWTVSLYWTFVTIATVGYGDYSPHTPLGMYFTCTLIVLGIGTFAVAVERLLEFLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Novel insights into K(+) selectivity from high-resolution structures of an open K(+) channel pore.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Methanothermobacter thermautotrophicus
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| molecule tags |
Transport protein
|
| molecule keywords |
Calcium-gated potassium channel mthK
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| total genus |
31
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| structure length |
82
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| sequence length |
82
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-01-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2X6A A; 4G27 B; 1JVM A; 5B1B C; 5CBF A; 3UM7 A; 3AG1 C; 3E86 A; 1G4Y B; 2Y69 C; 2WLI A; 4PA3 A; 4X88 A; 4R7C A; 2EIN C; 2HJF C; 2EIK C; 2YEV A; 3AG3 C; 5EC1 C; 1LNQ A; 3LDD A; 4MVZ A; 3STL C; 4J9Y B; 3LUT B; 4P9O A; 2R9R B; 3E83 A; 2AHY A; 2BOB C; 4PDR A; 4TWK A; 2WLJ A; 5EBL C; 3SYA A; 3SYQ A; 3RVZ A; 5J9P C; 3F7V C; 4PA6 A; 3F5W C; 3UKM A; 2W0F C; 4XDK A; 4HZ3 A; 3E8H A; 2Q69 A; 4BW5 A; 2EIJ C; 4MW8 A; 4GX2 A; 4MTO A; 1V54 C; 2WLN A; 3K0D A; 4MVM A; 1QLE C; 4F4L A; 4ZBM A; 4P30 A; 4QE9 A; 3GB7 C; 3K08 A; 1K4D C; 4QE7 A; 3T2M A; 2EIL C; 1BL8 A; 2EIM C; 3AG4 C; 3OUF A; 5CBH A; 2WLK A; 3IGA C; 3OUS A; 2A0L A; 2WLM A; 2WLL B; 5KUK A; 3SPH A; 3TCU A; 3IFX A; 3ABM C; 4PDV A; 3RVY A; 4CBC A; 5CBG A; 3LDC A; 3OGC C; 4UUJ C; 3TET A; 4WFG A; 4LP8 A; 4WFE A; 4RO2 A; 2K1E A; 4OXS A; 1OCR C; 3SYO A; 4I9W A; 4HYO A; 2HVJ C; 2IH3 C; 3SPJ A; 3HPL C; 2AHZ A; 3VOU A; 2H8P C; 3R65 A; 4PA7 A; 1R3J C; 1OCO C; 2A79 B; 1R3K C; 1M57 C; 4JTD B; 3FB6 C; 3SPC A; 5B3S C; 2HG5 C; 2IH1 C; 3E89 A; 3FB8 C; 3SPG A; 3X2Q C; 1V55 C; 5EK0 A; 4KFM A; 4XDJ A; 2ZXW C; 3OR6 C; 3T1C A; 5EC2 C; 2QKS A; 4JTC B; 3WG7 C; 1ORQ C; 4R6Z A; 1OCC C; 5IY5 C; 2HVK C; 3AG2 C; 3OR7 C; 2Q6A A; 4MVO A; 3LNM B; 4PDL A; 3ABK C; 3RBZ A; 2JK5 C; 4RUE A; 3ZJZ A; 3LDE A; 2OCC C; 4X89 A; 1R3L C; 2WLL A; 4MVU A; 5KUM A; 1J95 A; 2P7T C; 4LBE C; 4JTA B; 4MS2 A; 4GX1 A; 1OCZ C; 2QTO A; 2WLH A; 4MVR A; 1XL4 A; 3T4Z A; 4R50 A; 5BZB A; 4PA4 A; 4MVQ A; 3KG2 A; 3SYP A; 3SPI A; 3EFF K; 4P9P A; 4MW3 A; 3E8G A; 3JYC A; 2ZD9 A; 2ATK C; 1ZWI C; 4WFF A; 4LCU C; 1K4C C; 5EBM C; 3FB7 C; 2WLI B; 4X8A A; 3SYC A; 4DXW A; 3ZRS A; 3SJQ C; 4GX0 A; 3T4D A; 3PJS K; 1R3I C; 3ABL C; 4P2Z A; 3E8B A; 4MVS A; 3K04 A; 4J9Z B; 3K0G A; 4MSW C; 3K06 A; 3BEH A; 4GX5 A; 4RAI A; 2HFE C; 3ASN C; 4H37 A; 3FB5 C; 2BOC C; 5EBW C; 3STZ C; 4MTF A; 2DWD C; 4EKW A; 2Q68 A; 2Q67 A; 5E1A C; 4PDM A; 4G28 B; 4PA9 A; 4H33 A; 3E8F A; 1P7B A; 2X6B A; 1KKD A; 1S5H C; 3K03 A; 1M56 C; 2A9H A; 3ASO C; 2DYR C; 5B1A C; 2DWE C; 2ITC C; 2X6C A; 3F7Y C; 4QNH B; 4XDL A; 3RW0 A; 2NLJ C; 2DYS C; 4R8C A; 4WFH A; 1XL6 A; 2ITD C; 4RUF A; 2KB1 A; 4MTG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4TV9 B; 1TUE B; 1PNL A; 4K8Z A; 5L3E A; 3SJA C; 5EZY B; 3KCY A; 1JA8 A; 3STL C; 1H2K A; 2A06 H; 2QWR B; 4TWK A; 1IBL O; 4YY3 B; 5AG2 A; 2JRI A; 5FLX N; 4BIO A; 4X65 O; 3UO2 A; 2QWN B; 3S3W A; 3K0D A; 2P4K A; 4LFA O; 4DR2 O; 4GKK B; 1TUB B; 2ZXW B; 3EVK A; 2E5L B; 2EIL C; 4LH7 A; 4X65 B; 3OUS A; 2A0L A; 3RYH A; 1NH2 D; 3I56 V; 3SPH A; 3TCU A; 3CRA A; 1HNW B; 1F23 A; 3HR0 A; 2KKW A; 3JAM N; 3OT7 A; 3CSX A; 1B06 A; 3JD3 A; 4EEQ A; 3E35 A; 4JPR A; 3BA8 A; 4PEL A; 1AR4 A; 4JTD B; 1Q6U A; 4DRX B; 1Q90 D; 2HG5 C; 4LF8 O; 2Q0O C; 3OTF A; 1XHZ A; 2W6I G; 5LP6 C; 1W2B U; 2Q73 A; 1OCC C; 4X64 B; 2GTA A; 1NTZ H; 4LF9 B; 2LQT A; 4MVO A; 1HWY A; 4JZG A; 5JJJ B; 1NR7 A; 4RUE A; 4YJ3 A; 3JD1 A; 5LHG A; 4MS2 A; 3T4Z A; 4KXR A; 1QBZ A; 1K73 W; 3SPI A; 1AR1 B; 5JQG B; 2GTS A; 3RYI A; 2DYR B; 2Z5U A; 3ABL C; 2YIC A; 2Y4T A; 2NNU A; 4MVS A; 4X62 B; 5CA3 A; 1AP5 A; 1ZTE A; 4MSW C; 2K9P A; 2QWQ B; 3K06 A; 4DR3 B; 3BRC A; 3FB5 C; 4J7J A; 1ARO P; 3ASO C; 2DYR C; 5B1A C; 1VF7 A; 4O4H B; 1OCR B; 3OMI B; 5JJE B; 3CMA V; 4JYC A; 1XRE A; 1GRJ A; 2QM7 A; 1KP3 A; 3N2K B; 1TGO A; 3F5T A; 5EC1 C; 4BIU A; 2EJR A; 3UT5 B; 2R9R B; 4PDR A; 1Q6I A; 3K59 A; 3D36 C; 2LGQ A; 5J9P C; 1LR1 A; 3E22 B; 4XDK A; 1SER A; 3K5O A; 3K5L A; 1DTO A; 3OMA B; 3FFQ A; 1EN6 A; 4MVM A; 1CPY A; 1RPR A; 1QHT A; 1EZV H; 2FKX A; 2OWO A; 1BT8 A; 3ZMU A; 4FFK A; 3L75 H; 4LF7 O; 4CBC A; 4H44 B; 1YEW A; 3HKC B; 1M57 B; 1N0N A; 3SPJ A; 2ETN A; 2FL4 A; 3AK3 A; 3K9S A; 2AHZ A; 3CCM V; 1FPO A; 4EFE A; 4H0L B; 2LO1 A; 4E2L A; 5JJN B; 3ETG A; 4UFZ A; 2YSU B; 3AK1 A; 1WAZ A; 2EIK B; 2GDS A; 4B3S O; 4R6Z A; 4JAV A; 4YHH O; 2DJV A; 2JK5 C; 3LDE A; 3CWB H; 2V4D A; 4B3M O; 1ROP A; 1SQG A; 1S0V A; 5BZB A; 2MW2 B; 3G6E V; 3CRM A; 1VQ4 V; 3JAL A; 2HHH B; 2E76 B; 4FM2 A; 2OT5 A; 3B8N A; 5B1B B; 2IW5 A; 3JSL A; 1SET A; 5B66 Z; 2X7R B; 1BGY H; 1PL0 A; 4X1Y B; 5LXT A; 2HFE C; 1WA8 A; 3HKC A; 2X0L A; 4DR5 O; 5JH7 A; 4FM1 A; 3PN1 A; 2DMX A; 2X6B A; 1OCC B; 2ITC C; 5DEC A; 3CCJ V; 3AEI A; 2ILM A; 1ORQ C; 2X6A A; 4NXM O; 2UXN A; 4X88 A; 4YIP A; 1NU1 H; 4JAS A; 2R9A A; 1WB8 A; 4W4K A; 4NKG B; 1IDS A; 3RVZ A; 4JI2 O; 2UXC O; 1QCE A; 3S3X A; 5GTH Z; 1US6 A; 3OM3 B; 3CYO A; 2F66 C; 2DOS A; 3UT5 A; 1I94 O; 4X20 B; 3K08 A; 3ZRW B; 4UVB A; 1GMG A; 1Y76 B; 2EZO A; 3OEE G; 3FX7 A; 1HR0 B; 4RO2 A; 4X66 B; 2HJD A; 4I4T B; 1OJH A; 5DED A; 3JSN A; 1BCC H; 1M9N A; 1AI4 A; 3ABL B; 1R3J C; 4UV8 A; 3RN4 A; 2ZNI A; 3RYF B; 5LMN B; 3FB8 C; 3G6B A; 1Y66 A; 3G67 A; 2RMK B; 4XDJ A; 1S5L Z; 2UUC O; 1NQT A; 3CS5 A; 3RWR D; 4FLZ A; 2YID A; 4NTW A; 3VQW A; 4QGP A; 3LNM B; 2YUA A; 1SF9 A; 3ZJZ A; 1N36 O; 2QJ1 A; 2ZKO A; 1K92 A; 4MVR A; 2QTO A; 2CUG A; 1HNX B; 4GUN A; 3E8G A; 4WFF A; 2JVD A; 2AXT Z; 3SYC A; 4IYH A; 1O9G A; 1M5I A; 1S76 D; 3T4D A; 5LHI A; 4XBF A; 1RSO A; 3UO3 A; 1GK9 A; 3E8B A; 3CC7 V; 3VQX A; 4RWU A; 5KHG A; 4DR7 B; 4TQF A; 4H37 A; 2PF4 E; 2KG7 B; 2AZ2 A; 4F6E A; 4H33 A; 1N0J A; 2JS3 A; 1S5H C; 4LFC O; 2Q7E A; 4DR4 O; 1AJP A; 4W4L A; 1WA8 B; 3ABK B; 3AG2 C; 2ODM A; 2EIN B; 3C90 A; 4FZ0 A; 4PA3 A; 4FFB B; 5TIS Z; 2OIE A; 1GH6 A; 4LF4 B; 4FPP A; 3TK1 A; 2PYJ A; 3U10 A; 3BCC H; 5J2T B; 4UVC A; 2AHY A; 4DV7 O; 2QGN A; 1XI1 A; 1R6N A; 4JI1 B; 2W0X A; 5IJ0 A; 4K0K B; 3U0Z A; 1V55 B; 3CHX A; 5JQG A; 4QE9 A; 3T2M A; 3ZHR A; 3IGA C; 2XT9 A; 5GON A; 3IFX A; 1B04 A; 1SKV A; 4WFB V; 3I5D A; 5BR8 O; 4CH4 A; 1SQQ H; 4WF9 V; 3L72 H; 3L74 H; 4I9W A; 1YSC A; 4O2A B; 3ZHS A; 4NTY A; 3HPL C; 4U3J B; 3H1J H; 1AIL A; 5LBQ A; 4PA7 A; 2QSA A; 1F4N A; 1YDX A; 4ZI7 B; 3E89 A; 4LF6 B; 5EK0 A; 3GWK C; 2Q9L A; 2OTJ V; 5KAF Z; 5CA1 B; 5L3F A; 4IT5 A; 4LF8 B; 3CCE V; 2Q6A A; 4EB6 A; 1W59 A; 2PI4 A; 2F93 B; 1PV0 A; 1SZT A; 3P3P A; 3ZIA G; 1NS1 A; 4ABM A; 1HW7 A; 2ZM6 O; 3HKE A; 1S72 V; 4J80 A; 3EFF K; 2QDO A; 4JI6 B; 4K0K O; 3ZBH A; 2Q7G A; 3CC2 V; 4DV4 B; 3SJQ C; 2Y0I A; 2YXY A; 1S3J A; 5BXZ A; 3OTO O; 5BY1 A; 1W0K G; 4RAI A; 4O4H A; 2V7Q G; 1M90 W; 4MTF A; 2DWD C; 5LOV B; 1HNZ B; 1P7B A; 1VQN V; 3WU2 Z; 1VIB A; 4JI8 O; 1MZE A; 3MD0 A; 3D3Q A; 2OCH A; 4LFC B; 5JVD A; 3CB2 A; 2IJK A; 3RYI B; 2O57 A; 4J9Y B; 2RNB A; 2JEX A; 4ZKI A; 2Z3Y A; 1PP9 H; 3HKE B; 3N2K A; 1GM7 A; 2W0F C; 4NXN O; 1IUR A; 1I08 A; 1L8D A; 2V1D A; 2XTA A; 2IJH A; 2H94 A; 1VP7 A; 1WNS A; 3CRQ A; 1EM1 A; 4QE7 A; 1WP7 A; 3H9V A; 3OUF A; 5LP6 B; 1QNM A; 3JD2 A; 5CBG A; 2F43 G; 3OAA G; 3ETD A; 4LP8 A; 1FKA O; 5LA6 B; 1G8M A; 2NR5 A; 3ZMZ A; 1Q86 W; 2N05 A; 3A0B Z; 4TSF G; 5B3S C; 2YIA A; 1AB3 A; 3X2Q C; 3P30 A; 3VQV A; 1ZLZ A; 4BWA A; 3B8M A; 1OCZ B; 1QLN A; 4JTC B; 3R66 A; 3RYH B; 5IY5 C; 3H1H H; 1YJW V; 1RM1 B; 1MSW D; 1EN5 A; 3ZHU A; 4X89 A; 1VQ5 V; 3AK2 A; 1COW G; 2P7T C; 2UXB B; 3KG2 A; 3SYP A; 1YTF B; 1R73 A; 2CE4 A; 2GSM B; 5JCO C; 4DV1 B; 2YI9 A; 4AI8 A; 1Q43 A; 4JI7 B; 2WSS G; 3Q4H B; 2E3C A; 1WJZ A; 1KUQ A; 1BQZ A; 4DR6 B; 4J9Z B; 4BR6 A; 4J42 A; 1EBO A; 5D5Q A; 2VQE O; 4NB5 A; 1R6K A; 4DV4 O; 1M56 B; 3AG7 A; 3QTC A; 5LMN O; 1KKD A; 2WA4 A; 3ZN0 A; 1H8H G; 4QNH B; 3OEH G; 1NVP D; 3ABT A; 1XIL A; 3A0H Z; 1PNK A; 1OV9 A; 5CBF A; 1N34 B; 4DV7 B; 2M6Y A; 4X1I B; 1AP6 A; 1N4C A; 3D3I A; 1I5Y A; 3BAB A; 4J7K A; 4P9O A; 1S5J A; 2FML A; 1XMQ O; 3L9D A; 4LC1 A; 4U7O A; 2ZIN A; 2PTM A; 3OW2 U; 3LSQ A; 2CTW A; 4LFB B; 1KD1 W; 4JI0 O; 1VQM V; 3TXS A; 4UUJ C; 4B3R B; 4GKJ B; 1OCR C; 2XAS A; 2EIJ B; 3LSU A; 3JAS B; 2Q0A A; 1NVP B; 3JCU Z; 5JWP A; 1BQ0 A; 4RQE A; 2L6L A; 2PY5 A; 1X4T A; 1YIT V; 1V54 B; 3OR6 C; 4DR4 B; 2E74 B; 3WG7 B; 3H1L H; 4UB8 Z; 1FXK A; 4EFB A; 1IBL B; 3BY6 A; 5D5P A; 2QM4 A; 4TQD A; 2QTS A; 4I7Z B; 2P6J A; 4NTX A; 3CCV V; 4DV2 O; 1R6T A; 2CDY A; 5EYP A; 3ZHT A; 2E5L O; 1K33 A; 1VF6 C; 4DV2 B; 3APO A; 4FM0 A; 4J41 A; 3PJS K; 1DLB A; 4AQY O; 4CH3 A; 2UXX A; 1PL4 A; 1DF5 A; 4B3R O; 4G28 B; 1CEZ A; 4LWS A; 3JAT A; 2UUB B; 3K03 A; 3ZN1 A; 1N33 B; 1D2D A; 3TJT A; 4BIZ A; 2NLJ C; 1XL6 A; 4IHJ A; 2CGN A; 3AG3 B; 3G80 A; 3UM7 A; 4D7T A; 3E86 A; 1G4Y B; 3CXC U; 3FYE B; 1LNQ A; 1K5S A; 1FXK B; 4OPA A; 2GV9 A; 1K97 A; 2UUA O; 2ZM6 B; 5DN6 G; 1GN3 A; 3M8A A; 1K8A W; 1D5N A; 2Q69 A; 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1CP9 A; 4TUY B; 3JAR A; 1Y67 A; 5FL7 G; 2M7W A; 1R3K C; 5BMV B; 5JH7 B; 4X64 O; 1W0J G; 1Z5W A; 4I55 A; 1VQO V; 5LMU O; 4OX9 B; 2OYQ A; 1Q8I A; 2HVK C; 3H1I H; 1YVW A; 3ZMT A; 4NR1 A; 2Q4P A; 3T1H B; 4UXN A; 4KP4 A; 3D36 A; 1H8E G; 1JJ2 U; 3EXA A; 1YIJ V; 2XAJ A; 1XEQ A; 5IYZ A; 1IBM O; 4TUY A; 3BPZ A; 2JGD A; 1NTM H; 2AW9 A; 4FLV A; 3CJH B; 3CRR A; 4LNU A; 2R72 A; 5LOV A; 1JFF B; 2Y48 A; 2ZR3 A; 1HR0 O; 2XUM A; 1R3I C; 4DUZ B; 4G2K A; 3ZRW A; 4FLW A; 3CP1 A; 2PUS A; 4JI4 O; 3ETE A; 5H9C A; 3N27 A; 4B08 A; 1M56 C; 1Z5V A; 1KC8 W; 1IBK O; 3O65 A; 2ITD C; 2ZR2 A; 1ZAU A; 1G6U A; 3BAA A; 2DQ3 A; 4G27 B; 3I55 V; 2JDI G; 1I7F A; 1QU7 A; 1Y74 A; 2VS0 A; 2XND G; 2MK3 A; 1TVK B; 1K7D A; 3N2G B; 2YEV A; 4NVP A; 4LNU B; 2BOB C; 4IL6 Z; 4DUY O; 1M4U A; 3F7V C; 5HFM A; 2W6J G; 5K1P A; 3RYC B; 2EIJ C; 3MDS A; 4MTO A; 2LP7 A; 4YY3 O; 1XMQ B; 3G4S V; 3QO8 A; 5CBH A; 4MTX A; 1NT2 B; 5ITZ B; 3FYI B; 1VQP V; 3W7W A; 2H8P C; 4DK0 A; 2PYL A; 5H6Q A; 1EZJ A; 2CK3 G; 2ZE7 A; 4IYI A; 2RJZ A; 1V55 C; 1WN7 A; 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