The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
82
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structure length |
82
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Chain Sequence |
VPATRILLLVLAVIIYGTAGFHFIEGESWTVSLYWTFVTIATVGYGDYSPHTPLGMYFTCTLIVLGIGTFAVAVERLLEFLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Calcium-gated potassium channel mthK
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| publication title |
Novel insights into K(+) selectivity from high-resolution structures of an open K(+) channel pore.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Methanothermobacter thermautotrophicus
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| molecule tags |
Transport protein
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| total genus |
31
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| structure length |
82
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| sequence length |
82
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-01-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4MW3 A; 4BW5 A; 1S5H C; 2KB1 A; 4HYO A; 3LDE A; 3WG7 C; 2DYR C; 2YEV A; 3F7Y C; 4UUJ C; 5B1B C; 2BOC C; 3RVZ A; 3AG1 C; 1R3K C; 4XDL A; 3ABK C; 5CBF A; 3OGC C; 3E8G A; 1P7B A; 3E8B A; 5CBH A; 3OR6 C; 4MVU A; 4X89 A; 2Y69 C; 3ASO C; 1QLE C; 3AG2 C; 3GB7 C; 4QE7 A; 2A0L A; 2R9R B; 2X6B A; 5KUM A; 4PA9 A; 3RW0 A; 1OCO C; 2ITD C; 4DXW A; 2AHZ A; 4GX2 A; 4G28 B; 4GX5 A; 4PA3 A; 4X88 A; 4X8A A; 2Q67 A; 4WFE A; 3STL C; 5BZB A; 4MVO A; 2BOB C; 3E83 A; 3T4D A; 4PA7 A; 4GX1 A; 4MVZ A; 5EBM C; 2Q6A A; 3BEH A; 4R50 A; 4I9W A; 4LP8 A; 4MW8 A; 2Q69 A; 2IH3 C; 3T1C A; 2P7T C; 5J9P C; 2HVK C; 4G27 B; 2WLJ A; 3K0G A; 4JTD B; 3SYO A; 4CBC A; 1R3J C; 4KFM A; 4PDL A; 4WFG A; 3JYC A; 2WLL B; 2H8P C; 5EBL C; 4PA4 A; 2IH1 C; 2K1E A; 4GX0 A; 1G4Y B; 2NLJ C; 3IGA C; 3SYC A; 3KG2 A; 4EKW A; 4MSW C; 4MVS A; 4JTC B; 3K06 A; 4J9Y B; 4ZBM A; 1OCC C; 2WLI B; 3RVY A; 2HJF C; 4F4L A; 3FB7 C; 3E8F A; 1KKD A; 1M57 C; 4P30 A; 4QE9 A; 3VOU A; 4MVM A; 1ORQ C; 3ABL C; 4WFH A; 3ABM C; 2DYS C; 1BL8 A; 3FB5 C; 4JTA B; 4J9Z B; 1XL6 A; 3SYA A; 4QNH B; 3PJS K; 5EK0 A; 3AG4 C; 3LDD A; 3LNM B; 4MVQ A; 1XL4 A; 4WFF A; 5EBW C; 4LBE C; 3STZ C; 3X2Q C; 4MTF A; 2EIK C; 1R3I C; 2WLI A; 4RUF A; 4MS2 A; 3OR7 C; 3TCU A; 2WLH A; 3EFF K; 2QKS A; 2DWD C; 3LDC A; 3T4Z A; 3R65 A; 2X6C A; 3SPI A; 1OCZ C; 3K0D A; 4XDJ A; 4RAI A; 3ZRS A; 1JVM A; 2OCC C; 3E89 A; 4MTG A; 4MVR A; 1OCR C; 3FB6 C; 4H33 A; 2QTO A; 3RBZ A; 4RUE A; 4H37 A; 2WLN A; 2X6A A; 2ITC C; 3E8H A; 3FB8 C; 1J95 A; 2ATK C; 4TWK A; 1V55 C; 3UM7 A; 3E86 A; 4P2Z A; 4R7C A; 3ASN C; 4PDV A; 1M56 C; 5IY5 C; 1LNQ A; 3K04 A; 2EIL C; 3AG3 C; 3OUS A; 4MTO A; 3LUT B; 4RO2 A; 2A79 B; 2WLL A; 4R6Z A; 2HG5 C; 1K4C C; 5CBG A; 2HVJ C; 1V54 C; 2WLK A; 3SPJ A; 3ZJZ A; 3K03 A; 3OUF A; 2JK5 C; 3SPC A; 3SYQ A; 3HPL C; 4PDR A; 4P9P A; 3T2M A; 4XDK A; 3UKM A; 1R3L C; 2AHY A; 4P9O A; 3F5W C; 2Q68 A; 5EC2 C; 2W0F C; 4PA6 A; 3SPG A; 1ZWI C; 3SJQ C; 2DWE C; 5B1A C; 3SYP A; 2ZD9 A; 4PDM A; 5EC1 C; 2WLM A; 2EIM C; 4OXS A; 3SPH A; 5B3S C; 4LCU C; 3IFX A; 5E1A C; 5KUK A; 1K4D C; 2A9H A; 2EIJ C; 4HZ3 A; 3F7V C; 3K08 A; 3TET A; 2HFE C; 2EIN C; 2ZXW C; 4R8C A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4HYO A; 5FNV A; 4UCT A; 3LDE A; 4LNU B; 2GV9 A; 1U97 A; 2P4K A; 1AR5 A; 1OJH A; 3UCS C; 3W7S A; 2B1G A; 4DUY O; 1F4M A; 4X88 A; 2UU9 B; 4AIL C; 4GT1 A; 5ITZ A; 4JYY A; 3J7A U; 2ZE5 A; 3CE2 A; 3TGU H; 3LSS A; 1MZE A; 1NQT A; 4I9Q A; 1GN6 A; 4O2A A; 2B9Z A; 4I9W A; 5JVD A; 4DV2 O; 3SYO A; 1WNS A; 2CH7 B; 3ZIA G; 3AK1 A; 1SQB H; 4OPA A; 5EZY A; 5B5E Z; 4YJ2 B; 2QWP B; 3SYC A; 5LOV B; 1NH2 D; 4TUY B; 3CRM A; 2UUB B; 5JJE B; 2HR3 A; 4J9Y B; 2ZM6 B; 4F4L A; 4RQE A; 3JAK B; 1KKD A; 2F4V B; 4DR6 O; 4EB6 A; 1DK1 A; 4JYA O; 2D2C B; 2QEX V; 4B3M B; 2JJ1 G; 4MTF A; 4JI5 B; 3RFR A; 4XBF A; 3T1Y B; 4FLU A; 4GCZ A; 1WB8 A; 1TUB A; 3A2F A; 2JEU A; 1DF4 A; 3LSQ A; 4QIW F; 4H37 A; 5LP6 A; 5FL7 G; 1PD3 A; 5CA0 B; 2ILM A; 1JCH A; 1YXB A; 1K33 A; 2YSU B; 1XI1 A; 4LF5 B; 4JI0 O; 1V54 B; 3SJB C; 4F6R A; 3Q4H B; 3K03 A; 1GTO A; 1HDJ A; 1NR1 A; 1ROP A; 4P9O A; 1XNR B; 2P67 A; 2ZD9 A; 5EC1 C; 3RYH B; 3UT5 A; 4I0X B; 5IJ9 A; 3HKB B; 1XHZ A; 2R9A A; 4YJ3 B; 4FIP C; 4IGG A; 2KB1 A; 1Y76 A; 4J7J A; 4PEL A; 3JAM N; 3AG1 C; 4JGS A; 4J11 A; 2LFS A; 3SJC C; 4J7Z A; 1VQ8 V; 4NR1 A; 1N0J A; 4U7N A; 1G1X B; 3RW0 A; 2AHZ A; 2PI4 A; 3P32 A; 4DV5 B; 1XNQ O; 4UFZ A; 2HHH O; 2GTS A; 4WCE V; 3U11 A; 2F93 B; 3KZI Z; 2XAQ A; 3OMA B; 2QA4 V; 4CH5 A; 3H1H H; 2F43 G; 5L3B A; 2R9I A; 2IJI A; 4O4J A; 5LYJ B; 2H8P C; 4JI4 O; 5A2Q N; 4DR5 O; 5CN0 A; 4GYC B; 3CCV V; 5A9G A; 1NJI W; 2HJF C; 4BIO A; 3JAL B; 4E2L A; 1BL8 A; 4JTA B; 5DM6 V; 4DV7 B; 2LW7 A; 4LF6 O; 2QKC A; 2OYQ A; 2RMK B; 3X2Q C; 4UVA A; 3CC2 V; 1F7Y A; 3FX7 A; 1R3I C; 4MS2 A; 4ZIB A; 3EXA A; 4DV0 O; 3D36 A; 5J2U B; 2F66 C; 4TV9 A; 5LBQ A; 5IE9 A; 1KEC A; 1IBL B; 4O4L A; 1H2G A; 1K4C C; 4FM0 A; 3TXS A; 1VQ5 V; 1VQM V; 2UU9 O; 2YXH A; 2OIG A; 3LSU A; 2JEX A; 3JD2 A; 4JZ2 A; 3GVM A; 3SYP A; 1UFI A; 4JI7 B; 1M90 W; 1SQX H; 2JGD B; 4FFB B; 4NXN B; 2YI8 A; 3CSX A; 4UCO A; 4LF7 O; 2IU3 A; 2EBO A; 2PF4 E; 5FPR A; 4YXW G; 1HNZ O; 4DUZ B; 1B6Q A; 2QKA A; 3ASO B; 3DXR A; 3GB7 C; 1Y67 A; 2L6L A; 1H2M A; 1OCO B; 1W0J G; 4I50 A; 1XUQ A; 4IIJ B; 2JDI G; 3CP1 A; 4BIZ A; 3K9A A; 4NTX A; 4B08 A; 2P7T C; 5CA1 B; 1QCE A; 1TAE A; 2OWO A; 4CH4 A; 1L8D A; 5AG2 A; 1BCC H; 1SQF A; 1ZL8 A; 3JAT A; 2VQF B; 1JR9 A; 3RT3 C; 3IGA C; 2OTJ V; 3KG2 A; 4MVS A; 3CCJ V; 1Q6I A; 2AGA A; 4CC6 A; 4UB8 Z; 4X66 B; 2DYS C; 4J9Z B; 1E79 G; 4JI1 O; 2ZR2 A; 1K9M W; 4LFC O; 1OHH G; 2EIK C; 2OT5 A; 2RQ6 A; 1KC8 W; 2ZE8 A; 4X20 A; 1R6K A; 1HWY A; 1ZAU A; 3FYE B; 4CS4 A; 3RYC A; 3E86 A; 3KCY A; 4LFB B; 2IJJ A; 3OE7 G; 4RO2 A; 1SF9 A; 4Z1V A; 2WLL A; 1IX9 A; 4U3J A; 1XQ8 A; 4I7Z B; 2N74 A; 3CEI A; 1QLE B; 4QPJ A; 2EIM C; 4X62 O; 4F6E A; 3IFX A; 4O4I A; 4CH6 A; 2GBO A; 3QO8 A; 3H1K H; 4JI2 B; 2RN9 A; 1IBK B; 3TET A; 2HFE C; 2ZXW C; 3P3N A; 3ETQ A; 1GH6 A; 4ZI7 B; 1JOY A; 1EBO A; 2BOC C; 5LA6 B; 1SRY A; 4NYK A; 4K0K O; 1SQQ H; 3JAW B; 3E8B A; 3OR6 C; 4L8J A; 2N04 A; 5GTH Z; 3AG2 C; 4X1I A; 2A0L A; 4LFA O; 4MT8 A; 2PTM A; 1P49 A; 5IWA B; 3C3T A; 4PA9 A; 2Q67 A; 4WFE A; 5C8Y A; 2XT9 A; 2PUS A; 2QR4 A; 1BHA A; 2HKO A; 4JI3 B; 4FLX A; 1HNW O; 5H2F Z; 2P22 C; 3G67 A; 2NNU A; 5LXT B; 4UV9 A; 3ABT A; 1IBL O; 2XAH A; 4JYC A; 2PY5 A; 3ZMU A; 3FKS G; 1NI8 A; 2YIB D; 2IH1 C; 2K1E A; 4D7T A; 4DV4 B; 4BAY A; 1RPR A; 1FS0 G; 1KMI Z; 1NBM G; 3VOU A; 1SC5 B; 2ZIO A; 4MVM A; 4GKK O; 1ORQ C; 5LMN O; 3SYA A; 3ZN1 A; 1QU7 A; 3AG4 C; 4KP4 A; 1XL4 A; 1WP8 A; 5GON B; 3IAY A; 2WLH A; 4KUM A; 3CX5 F; 4XDJ A; 1S76 D; 3UO2 A; 2QTO A; 2X6A A; 3E2E A; 4Z2W A; 4U3F H; 2LP7 A; 4R7C A; 1KP2 A; 5IY5 C; 3G71 V; 2V4D A; 1WP7 A; 1QR9 A; 4PHZ A; 5DEC A; 2ADP A; 5KX5 B; 1RM1 C; 1CXZ B; 3BFR A; 4PJ0 Z; 1GN2 A; 1NVP B; 2MW2 B; 4DUY B; 2YID A; 4I55 A; 2R72 A; 1PL0 A; 3CCL V; 4JAV A; 4LCU C; 1SQG A; 3F7V C; 2VQF O; 4DV2 B; 4R8C A; 4MW3 A; 4QJF B; 1S5H C; 3OEH G; 3WG7 C; 1NH2 B; 2UUC O; 3AG1 B; 3P30 A; 1PKX A; 2LGQ A; 3ABK C; 3OGC C; 3FAV B; 2Y69 C; 4FM2 A; 1H2S B; 4DR6 B; 2KG7 B; 4JYA B; 5JH7 B; 3D8C A; 4G28 B; 2JS3 A; 1BQZ A; 3E83 A; 4O2B A; 3T4D A; 4PA7 A; 5JCO A; 1TUE B; 1NTZ H; 1DTO A; 1JFF A; 2FL4 A; 5LP6 C; 4LFB O; 3T1C A; 3B4S A; 5B1N A; 3I5D A; 1ZUQ A; 1EFR G; 2GHY A; 1L0L H; 1ZX3 A; 2ZNI A; 3JYC A; 5EBL C; 4DR2 O; 1XBL A; 1KU9 A; 4CC5 A; 4JI0 B; 3QTC A; 3AK2 A; 3ZMS A; 2CH7 A; 1VQ6 V; 1SQP H; 3X2Q B; 3LDD A; 4RQF A; 4WFF A; 4LBE C; 3IC7 A; 1KP3 A; 3L9D A; 3AK3 A; 3LDC A; 2CGN A; 3SPI A; 1XDC A; 4FM1 A; 4JI8 B; 4B3S B; 3FD9 A; 2YEV B; 5LL6 Y; 1WA8 B; 4DRX A; 2Z0A A; 2Q7G A; 1VQL V; 3CMA V; 3C90 A; 3ZBH A; 5FLX N; 1N33 O; 2EUL A; 2XAF A; 1O9H A; 1IXM A; 3OUF A; 5LGN A; 2AHY A; 3DSQ A; 1GM8 A; 3B09 A; 3ML0 A; 2EJ7 A; 1XNQ B; 2HHH B; 4OXS A; 4BIU A; 2RDC A; 5KUK A; 2DOS A; 2M6Y A; 1MA1 A; 3CPW U; 2EIJ C; 1BT8 A; 3S3W A; 3G80 A; 3K08 A; 5LMU O; 3MHH C; 2EIN C; 4EFB A; 3HKC A; 4TV8 A; 2WA3 A; 5GW7 A; 3JAR B; 1H2L A; 2Q8V A; 1URF A; 1YZB A; 1Q43 A; 4DR5 B; 4YJ3 A; 1GM7 A; 1DF5 A; 3ZRW B; 2Q9L A; 1QLE C; 1WJZ A; 3BRC A; 5KUM A; 4EFE A; 3CRQ A; 4LF6 B; 2KQX A; 4GX2 A; 2E75 B; 2W6I G; 2WSS G; 5JQG B; 1F51 A; 1P84 F; 3ZRV A; 5EBM C; 4DV0 B; 3OD4 A; 3QVN A; 2CGO A; 3OTO O; 5D5Q A; 1R3J C; 1WB7 A; 2LGW A; 1Q7Y W; 1WPX A; 4JAS A; 5IYC O; 3K57 A; 4EKW A; 4MSW C; 4JTC B; 3B77 A; 1YJW V; 2WLI B; 1NVP D; 3K59 A; 2DYS B; 3ZED A; 4YY3 O; 4DO2 A; 4ZOL A; 2WA4 A; 3LNM B; 4B3R O; 2DE0 X; 2EIK B; 3B8N A; 3STZ C; 4JAU A; 1FXK A; 3JAL A; 2X6C A; 1OCZ C; 1SA0 A; 3HKE B; 1JVM A; 3N2K B; 4LF7 B; 5EYP B; 2G38 A; 3ASN C; 3AG3 C; 1HNZ B; 2ZNJ A; 1AI4 A; 5K1X A; 3G4S V; 2EJR A; 1GKF A; 1AI7 A; 1A32 A; 3SYQ A; 3LNN A; 4XDK A; 2D3O W; 4PA6 A; 3UQ8 A; 5C93 A; 3DGE A; 3CXC U; 4JV5 O; 2EIM B; 3CXH F; 4FPP A; 4J10 A; 2GDS A; 2PI5 A; 1D5A A; 2ZXW B; 5IDJ A; 3AEI A; 4CS3 A; 3N27 A; 4ICG A; 3ETD A; 1PP9 H; 1LUV A; 1JQ0 A; 4NTW A; 2GUZ A; 5CBH A; 3AG2 B; 2ARH A; 1HP8 A; 1YJ9 V; 1Q6H A; 1HR0 O; 2BTQ B; 4WBN A; 3D3Q A; 3E22 A; 1BQ0 A; 4JI1 B; 5JJJ B; 4PA3 A; 4LFC B; 1FFX A; 4JI8 O; 1LR1 A; 4B3S O; 1B3Q A; 1IBM O; 3M99 B; 5JWP A; 1N0N A; 4H44 B; 1TVK A; 4PI0 A; 4WFG A; 4N21 A; 1PM9 A; 4D6T H; 1QHT A; 4UCR A; 1OCC C; 3RVY A; 1B04 A; 1VF7 A; 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5H5N A; 5LXT A; 2Y0P A; 2EZP A; 1FYJ A; 2QWN B; 2ZE6 A; 2ZT9 B; 1GM9 A; 2ZCE A; 2JS5 A; 2QTS A; 5IJ9 B; 5CA3 A; 4FZ1 A; 4RUF A; 3HKD A; 3OR7 C; 3WFV A; 3K5O A; 1YIT V; 3OW2 U; 1N32 O; 4X1Y A; 1Y76 B; 4W4K A; 2Z3Y A; 5BY1 A; 4J42 A; 4FLV A; 2BCC H; 3U0Z A; 3FYI B; 1YDX A; 4TWK A; 2UUC B; 2X7R B; 4DR1 O; 1SQV H; 1RFY A; 1ENV A; 4KL1 A; 3KKY A; 2XUM A; 3T2M A; 2ZIM A; 4FVM A; 3TK1 A; 1R3L C; 1P7G A; 1W2B U; 5JCO C; 3ZCC A; 2K9P A; 4WF9 V; 3QNE A; 1WAZ A; 2EIJ B; 2A9H A; 1AJN A; 1COW G; 2EIN B; 4LH7 A; 2BSK B; 4O4J B; 3ETE A; 1Q81 W; 1GAX A; 2XAG A; 4DR2 B; 3RVZ A; 2UUA B; 4FJC C; 3BHP A; 1WPB A; 1XIL A; 2DN9 A; 1GN3 A; 1DLB A; 4KXR A; 2X6B A; 4LH6 A; 2ITD C; 4DV1 O; 3FAV A; 3JD4 A; 2E74 B; 2Y4T A; 3ZHQ A; 1AR1 B; 4LF4 O; 1RPO A; 4GZR B; 4FMT A; 3MDS A; 3JAS A; 2KG7 A; 1ZTE A; 3ZHT A; 1Q6U A; 4IHJ A; 1N33 B; 1FKA O; 4CH3 A; 5IT9 N; 2CTP A; 1BGY H; 2QSA A; 1QVF U; 3TJT A; 4QNH B; 1AIL A; 1VQ9 V; 3K5N A; 2Q7H A; 3PJS K; 2EZO A; 3JD3 A; 2LQT A; 2LJ2 A; 2L35 A; 2P4V A; 4B7K A; 3CCS V; 1OCZ B; 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