The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
82
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structure length |
82
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Chain Sequence |
VPATRILLLVLAVIIYGTAGFHFIEGESWTVSLYWTFVTIATVGYGDYSPRTPLGMYFTCTLIVLGIGTFAVAVERLLEFLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
|
| source organism |
Methanothermobacter thermautotrophicus
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| publication title |
Novel insights into K(+) selectivity from high-resolution structures of an open K(+) channel pore.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Calcium-gated potassium channel mthK
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| total genus |
31
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| structure length |
82
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| sequence length |
82
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-01-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3TCU A; 2ZXW C; 4WFG A; 2R9R B; 4MVR A; 1KKD A; 4MW3 A; 4J9Y B; 2QTO A; 3E89 A; 4MVM A; 4R50 A; 3SPH A; 5BZB A; 5EC1 C; 3F7V C; 2KB1 A; 5CBG A; 4G28 B; 3K08 A; 1M57 C; 4WFE A; 2X6B A; 1BL8 A; 4LCU C; 1XL6 A; 4QE9 A; 4WFF A; 1OCC C; 4HZ3 A; 2DYS C; 1M56 C; 3SPC A; 4I9W A; 1OCO C; 4XDK A; 3E83 A; 2Q67 A; 3ABK C; 3EFF K; 3F5W C; 3E8F A; 4GX0 A; 2HJF C; 3K0G A; 3SYC A; 1V55 C; 1K4C C; 3IGA C; 4TWK A; 1JVM A; 2WLL B; 3R65 A; 4MTF A; 4OXS A; 3T1C A; 5EBL C; 3SYA A; 3RBZ A; 4J9Z B; 3IFX A; 4PDV A; 2EIM C; 4RUE A; 2Y69 C; 4MVU A; 2WLI A; 4EKW A; 4P9P A; 2AHZ A; 1P7B A; 3SPJ A; 4PDR A; 3STL C; 3SPG A; 3K04 A; 1OCZ C; 3AG2 C; 4PDL A; 3AG1 C; 4BW5 A; 1ORQ C; 3LDD A; 4H37 A; 5IY5 C; 4PDM A; 4XDL A; 2DWE C; 4F4L A; 2HG5 C; 1S5H C; 2HFE C; 3OR7 C; 5B1B C; 3E8H A; 3BEH A; 3FB5 C; 2ITD C; 3OR6 C; 3AG3 C; 4MTO A; 2P7T C; 4R8C A; 3SPI A; 3RVY A; 2EIN C; 4LBE C; 3E8G A; 3FB6 C; 2IH3 C; 4MW8 A; 3LUT B; 2WLK A; 4PA7 A; 4RO2 A; 4P2Z A; 4QNH B; 1R3K C; 5CBH A; 2EIJ C; 4MVQ A; 2Q6A A; 3X2Q C; 4MVO A; 1J95 A; 3ASN C; 3SYP A; 4PA9 A; 5B1A C; 1R3L C; 3RVZ A; 3ABM C; 3T4D A; 2AHY A; 1LNQ A; 3T4Z A; 2EIL C; 4JTC B; 4JTA B; 2ITC C; 4X89 A; 5EK0 A; 2DYR C; 4XDJ A; 5CBF A; 3K06 A; 5KUK A; 5EBM C; 3UM7 A; 3VOU A; 3UKM A; 5B3S C; 3SYO A; 4MVZ A; 2X6A A; 5KUM A; 3OUS A; 4WFH A; 2X6C A; 4PA3 A; 4MVS A; 2ATK C; 2K1E A; 2DWD C; 4RUF A; 2Q68 A; 4RAI A; 3ZRS A; 2H8P C; 2WLJ A; 4P30 A; 2IH1 C; 3OGC C; 3AG4 C; 4MTG A; 2JK5 C; 4MS2 A; 4R7C A; 4X88 A; 3RW0 A; 3TET A; 2WLI B; 4UUJ C; 5EBW C; 2EIK C; 2OCC C; 3ZJZ A; 3E86 A; 3ASO C; 3FB8 C; 2HVK C; 3KG2 A; 4QE7 A; 1K4D C; 2WLL A; 2NLJ C; 1R3I C; 2BOB C; 3K0D A; 5J9P C; 4PA4 A; 3OUF A; 4PA6 A; 4GX5 A; 2A0L A; 3SYQ A; 2HVJ C; 4LP8 A; 1QLE C; 4JTD B; 3T2M A; 2QKS A; 4X8A A; 4GX2 A; 5EC2 C; 1V54 C; 3E8B A; 1OCR C; 1G4Y B; 4KFM A; 4ZBM A; 4H33 A; 3K03 A; 4G27 B; 3FB7 C; 4P9O A; 4MSW C; 1ZWI C; 4R6Z A; 2A9H A; 3JYC A; 2BOC C; 3F7Y C; 2WLM A; 2YEV A; 5E1A C; 3WG7 C; 3LNM B; 2ZD9 A; 3ABL C; 4CBC A; 2WLN A; 3LDE A; 3HPL C; 3GB7 C; 4DXW A; 2WLH A; 3PJS K; 3STZ C; 3LDC A; 3SJQ C; 4HYO A; 4GX1 A; 1XL4 A; 2A79 B; 1R3J C; 2W0F C; 2Q69 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3KZI Z; 2UXB O; 3LSU A; 3L9D A; 3CMA V; 5JJE B; 3M99 B; 4DK0 A; 4X20 B; 2CK3 G; 3ICX A; 3SPC A; 2DYS C; 4LF6 O; 4U3F H; 3WB1 A; 2E75 B; 4K3A A; 1K4C C; 2E5L O; 3L73 H; 3VQW A; 2X0L A; 4LFA O; 3OTO O; 2ZDI A; 3STL C; 4PDL A; 3JD3 A; 3AG1 C; 5EZY B; 3W7W A; 3P3P A; 3ZHU A; 3CEI A; 4DUY O; 1TUB A; 5IY5 C; 2EJR A; 2DWE C; 3ZMV A; 2L35 A; 1JMK C; 2RQ6 A; 3MDS A; 2Q7G A; 4RO2 A; 4JAA A; 3GWK C; 1MSW D; 1YDX A; 3CHX A; 4IIJ A; 1XI1 A; 2UUA O; 1HNW B; 4NXM B; 2DYR C; 1K8A W; 1MZE A; 2UXC O; 2ZR3 A; 4DR1 O; 2ADP A; 3SYO A; 1Y74 B; 3A0H Z; 3I5D A; 2ATK C; 4DR7 B; 2R70 A; 4ABM A; 4PD4 F; 3I55 V; 1M90 W; 1TAE A; 4YIP A; 1JPX A; 2F66 C; 1FS0 G; 2QR4 A; 1Q86 W; 3P32 A; 2EX3 A; 4ZI7 A; 1NH2 D; 3CPW U; 3KCX A; 5JH7 B; 3CD6 V; 2ODM A; 3N2G B; 3A8T A; 1HWY A; 4LH7 A; 1VQ7 V; 2YIB D; 1NZ6 A; 2M6Y A; 4LF5 O; 1I7F A; 4O4L A; 2A9H A; 1OCC B; 4ICG A; 1AR1 B; 3LNM B; 1Q3E A; 4FFB B; 3CCS V; 2M7W A; 1K5S A; 1NR7 A; 4LF4 O; 4DV6 O; 2BTO A; 2JJ1 G; 4ZOL A; 3Q4H B; 3IC9 A; 1AI5 A; 1F4N A; 2QTO A; 3ZRW B; 1YEW A; 5K1X A; 3TJT A; 5L3F A; 5FPO A; 1AP5 A; 2NNU A; 4UFZ A; 1I94 O; 3SYC A; 3R65 A; 2Y48 A; 4FLT A; 4DUZ O; 3AK2 A; 2DOS A; 4PDV A; 4X64 B; 2FML A; 1QNM A; 1H38 A; 4EKW A; 2EIL B; 5CA0 A; 4X66 B; 1L0L H; 2JEU A; 5C8Y B; 4CC6 A; 2Y4T A; 5EYP B; 1MMM A; 3K79 A; 2Z3Y A; 4PV1 B; 4TUY B; 1HP8 A; 1NR1 A; 3CCL V; 4FZ0 A; 1YVW A; 1IBM O; 1P49 A; 4KL1 A; 5IJ0 A; 2BTQ B; 2B1G A; 1S76 D; 4O2A A; 2AHY A; 1TVK A; 1FXK A; 1R73 A; 1MZF A; 2OIG A; 2UU9 B; 1SS3 A; 3SJC C; 1HR0 O; 4F6E A; 3ZED A; 1ZTE A; 4EFB A; 3H1J H; 5B66 Z; 1NT2 B; 1FKA O; 4O4I B; 3LNN A; 4X20 A; 4P30 A; 5FLX N; 2P4V A; 4DV3 O; 3FB8 C; 2IU0 A; 1K33 A; 1E1Q G; 4CH3 A; 1K34 A; 3OGI B; 3DXR B; 3ZRV A; 5KHJ A; 2N74 A; 2Q73 A; 4JTD B; 5AG2 A; 1F4M A; 2V7Q G; 4JF3 A; 3ZHS A; 3W7X A; 3P30 A; 4FVM A; 5EZY A; 2UXN A; 5JQG B; 3QNE A; 1W0K G; 1MAB G; 2GBO A; 2ADQ B; 4JI7 O; 3LDE A; 3HPL C; 2QKA A; 2FTK A; 1IBK B; 1RPO A; 5BR8 O; 4UCO A; 4WBN B; 1UFI A; 2HJD A; 2QE7 G; 5HFL A; 5BZB A; 3N27 A; 5B1N A; 1VQ5 V; 3TXS A; 4GKK O; 1M56 C; 2E74 B; 2JVD A; 4LF9 O; 1GN4 A; 2F4V O; 2ZR2 A; 1JVM A; 3SYA A; 4H13 B; 2PI5 A; 2EIM C; 4RUE A; 4JI4 O; 3WFV A; 5LP6 C; 3E2E A; 4HNA B; 2IBZ H; 4BW5 A; 5JH7 A; 4XDL A; 4YJ3 B; 1IXM A; 2JS3 A; 1S3J A; 1V54 B; 4DV5 B; 2ZT9 B; 3FKS G; 3N2G A; 1Q43 A; 2ITD C; 4QPJ A; 5JVD B; 3ZHR A; 2YUA A; 1MNG A; 5CB4 B; 3SJB C; 2Y0P A; 1BE3 H; 5H6R A; 2OCC B; 1KD1 W; 3RVZ A; 4FFB A; 3T4Z A; 1SQV H; 4XDJ A; 3JD0 A; 3Q4H A; 3A0B Z; 3HR0 A; 1XMO B; 1OJH A; 1SQF A; 4RUF A; 1BSM A; 3O65 A; 3ZRW A; 2IH1 C; 2R72 A; 3OGC C; 3B40 A; 2Q7E A; 4X88 A; 1L0N H; 5EBW C; 3E86 A; 3ASO C; 1NQT A; 4FM1 A; 4GT1 A; 1D5N A; 4B3M O; 3T2M A; 1FXH A; 1WB7 A; 1F51 A; 2Q0A A; 1SQG A; 2HHH O; 1SQB H; 1VQO V; 5A9G A; 2F1M A; 3JD1 A; 2ZNI A; 1QR9 A; 5C8Y A; 1YHQ V; 5EYP A; 1VQM V; 4TUY A; 4AQY B; 3ZMU A; 1GK9 A; 3I56 V; 3B09 A; 2B5U A; 2BTQ A; 1GMG A; 4UCU A; 2K9P A; 1VAR A; 1N36 O; 2PUS A; 2WWW A; 3K08 A; 4LCU C; 2FYU H; 2IJJ A; 2W0X A; 3JAR B; 3K9S A; 1S77 D; 3BRC A; 4NYK A; 2WLL B; 4MTF A; 5LOV B; 4O4I A; 1SF9 A; 4OX9 B; 2P06 A; 2EIK B; 3D36 A; 1IBL O; 5GTI Z; 4DR4 O; 1I0H A; 4L8J A; 4EB6 B; 1U96 A; 2ZNJ A; 3LDD A; 1BT8 A; 4KP4 A; 4YHH B; 3DXR A; 1H2G A; 4LF8 O; 4QIW F; 3FX7 A; 3BPZ A; 4IYI A; 5B3S B; 3QO5 A; 1DTO A; 1NS1 A; 1FAF A; 4P2Z A; 5JQG A; 3T1Y B; 5F2V O; 1XNQ B; 3AG4 B; 1G1X B; 3X2Q C; 1QHT A; 1WAZ A; 1LNQ A; 1K9M W; 3QO7 A; 4KHP O; 1H8H G; 4UB8 Z; 1X4T A; 5GTH Z; 1HNX B; 4WBN A; 3OUS A; 3QG5 A; 5LMU O; 2Q68 A; 2XAG A; 2XAH A; 2JK5 C; 3RW0 A; 3TET A; 3CJH B; 1XBL A; 5J9P C; 4GX5 A; 5KHG A; 3T1H O; 2KQX A; 1QR8 A; 2WSS G; 4HNA A; 3OW2 U; 4MTX A; 3E22 B; 4CH4 A; 1ENV A; 2QWQ B; 4O4H B; 4YJ3 A; 4I50 B; 2ZDI C; 2UUC B; 1US6 A; 2YI9 A; 5JVD A; 4CBC A; 1HNZ B; 1NTM H; 5CB4 A; 2CUG A; 4GX1 A; 4ZHQ B; 2Q4P A; 4NR1 A; 4CZZ A; 1WB8 A; 4WFG A; 5L3G A; 1FJG B; 3MHS C; 2NN4 A; 4LC1 A; 1DF4 A; 4DR5 B; 1NH2 B; 3AG3 B; 2YI8 A; 1Y66 A; 3ZIA G; 3CCR V; 4FJC C; 4K35 A; 1HW7 A; 3CXH F; 4LNU B; 5B1B C; 3K5M A; 4MTO A; 5CA1 B; 3AK3 A; 3ETD A; 1SRY A; 3FB6 C; 4I9Q A; 1XOU A; 4PA7 A; 1R3K C; 4LFB B; 1KYO F; 4BIU A; 3JSL A; 3JAT B; 5B1A C; 1KP3 A; 4DR6 B; 4AHC A; 2AW9 A; 5KUM A; 4WFH A; 3B8M A; 2GHY A; 3A2F A; 1XUQ A; 3RYH B; 1EN5 A; 3JAW B; 3CC2 V; 4YXW G; 3JAR A; 3CRQ A; 4J41 A; 1HNW O; 4NXM O; 4X62 B; 2ZM6 O; 2WLL A; 3L75 H; 5LOV A; 5DED A; 1R3I C; 1VQK V; 1ZLZ A; 3DC5 A; 1OCZ B; 4D7S A; 4PI2 A; 4DR7 O; 4EB6 A; 1OCR C; 1P7G A; 4G27 B; 4R6Z A; 2QSA A; 3BCC H; 2ZD9 A; 4K0K B; 2PYL A; 4TV9 B; 2WLH A; 2JJ2 G; 1JQ0 A; 4FMT A; 3OMN B; 1R3J C; 2YXH A; 1YXB A; 2Q5Z A; 3RYI B; 3M8A A; 2XND G; 1JFF B; 2LFR A; 3K3W A; 5J2T B; 4MW3 A; 4MVM A; 1BHB A; 1PPJ H; 3B8N A; 4WFE A; 1BL8 A; 1F23 A; 3CRR A; 5LXT B; 1PKX A; 4JI8 B; 1Z5W A; 1N33 B; 2EIN B; 2Y0I A; 1FXK C; 1Q8I A; 2R9I A; 3T1C A; 2PI4 A; 3G71 V; 2XAF A; 3IC7 A; 2Y69 C; 1VF6 A; 1N8R W; 1VP7 A; 3ASN B; 3ABM B; 1KB9 F; 3K04 A; 2ETN A; 5JJN B; 1LUV A; 3CJH A; 4CS3 A; 1KC8 W; 2UXD O; 5LHI A; 3OMI B; 3OR7 C; 2YEV B; 3CCE V; 3OR6 C; 4UXN A; 1GN2 A; 3WG7 B; 3E22 A; 3ZHQ A; 4X64 O; 1VQ9 V; 2GTA A; 4O4H A; 1D2D A; 4I50 A; 2FB5 A; 2WA3 A; 4X66 O; 3UT5 B; 5EK0 A; 1B3Q A; 3G4S V; 4TV8 B; 2N04 A; 5CBF A; 4J10 A; 4ZHQ A; 3UKM A; 2VS0 A; 3H9V A; 4WFA V; 2X6C A; 3HKE B; 4OPH A; 1IUR A; 2H8P C; 4LFC B; 1DGS A; 1VIB A; 4JI5 B; 3C3T A; 2IJI A; 4UUJ C; 1T5E A; 2LJ2 A; 3GVM A; 4I0X B; 4JZG A; 3KG2 A; 2UU9 O; 1VQ6 V; 4F6R B; 1WA8 A; 2A0L A; 4UCV A; 2YIB A; 2MK3 A; 4YY3 O; 4X1Y B; 3BY6 A; 5IY5 B; 4BR6 A; 1QQC A; 4ZBM A; 3FB7 C; 4LNU A; 1OCO B; 3APO A; 5JCO A; 5LMN B; 5CA1 A; 3QF7 A; 1R6T A; 3AEI A; 1YI2 V; 1JJ2 U; 2QWP B; 2F95 B; 3VQV A; 2UXX A; 2A79 B; 2BCC H; 1R6K A; 3L71 H; 1Q82 W; 3BA9 A; 2R9R B; 4B3T B; 4H0L B; 2DYR B; 1PM9 A; 3K5L A; 2ZE6 A; 3OD4 A; 1OCC C; 5KAF Z; 3FFQ A; 1IBK O; 1GRJ A; 1B04 A; 2GUZ A; 3RYH A; 2PTM A; 3JAW A; 2QWR B; 2EIJ B; 1CPY A; 4CS2 A; 4DK1 A; 4DV0 B; 2E3C A; 2L6L A; 4J42 A; 3HKD A; 3HKC A; 2EBO A; 2PYJ A; 4F4L A; 2CGO A; 4X1K B; 2CGN A; 1YTF D; 4LBE C; 2MW2 B; 4QPK A; 1N34 B; 2IW5 A; 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2JIZ G; 4YJ2 B; 1NTK H; 2WPD G; 2RDC A; 4I7Z B; 4MVS A; 4FK5 C; 5L3B A; 2ARH A; 4HBN A; 3T1Y O; 1Z5V A; 1AJP A; 4Q6G A; 5GW7 A; 4LF7 B; 3BFR A; 2OCC C; 2A06 H; 4W4K A; 3U10 A; 3OUF A; 1HNX O; 1WLE A; 2HVJ C; 1SQP H; 2D3O W; 5EC2 C; 1TA8 A; 4Z2W A; 1VQ4 V; 1S0V A; 2G38 A; 4X1K A; 1DLB A; 3JAL B; 3ABK B; 3VBB A; 3GWO A; 1N0J A; 4DR2 B; 1IBM B; 4JYA B; 3S3W A; 2NR5 A; 1FFX B; 3JCU Z; 5DEC A; 4JYC A; 3ETG A; 5A2Q N; 2Q69 A; 1YIJ V; 4X65 B; 1A32 A; 4J11 A; 4JI2 B; 4TQD A; 3B77 A; 4RQE A; 1FPO A; 5CBG A; 1K3E A; 4QE9 A; 1XL6 A; 1K7D A; 2UUC O; 5FNV A; 1HNZ O; 1VQL V; 3CP1 A; 3EHB B; 4JI0 B; 1ROP A; 3H1H H; 2IJH A; 2FKX A; 1AI7 A; 1FJG O; 4DR5 O; 1GN6 A; 1S5H C; 4DV1 O; 3SPI A; 3RGB A; 4A5U B; 1JR9 A; 4RQF A; 3RVY A; 3SGI A; 5K1P A; 1CXZ B; 3W7U A; 4CC5 A; 1XHX A; 2GTS A; 4MW8 A; 4GKJ B; 4QNH B; 4MT8 A; 1EN6 A; 4D7T A; 2LW7 A; 4UVC A; 4TSF G; 4JI7 B; 4NTW A; 5IYB O; 3QO8 A; 4JGS A; 4X89 A; 2XHB A; 2BSK A; 4FLU A; 5C93 A; 2XAJ A; 4LWS A; 5B3S C; 2X6A A; 2LQT A; 4PA3 A; 4WFB V; 1K92 A; 1RM1 B; 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