The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
82
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structure length |
82
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Chain Sequence |
VPATRILLLVLAVIIYGTAGFHFIEGESWTVSLYWTFVTIATVGYGDYSPRTPLGMYFTCTLIVLGIGTFAVAVERLLEFLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Calcium-gated potassium channel mthK
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| publication title |
Novel insights into K(+) selectivity from high-resolution structures of an open K(+) channel pore.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Methanothermobacter thermautotrophicus
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| molecule tags |
Transport protein
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| total genus |
31
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| structure length |
82
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| sequence length |
82
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-01-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JK5 C; 5EBM C; 3FB8 C; 4GX2 A; 4R6Z A; 2K1E A; 3ASN C; 3R65 A; 1R3K C; 3OUS A; 3SPH A; 4BW5 A; 3K06 A; 3UM7 A; 3X2Q C; 2Q68 A; 4H37 A; 2EIM C; 4MW8 A; 2QTO A; 2X6B A; 4PA7 A; 4HZ3 A; 5CBH A; 3T4D A; 4G28 B; 3PJS K; 3RVY A; 5J9P C; 4J9Z B; 3ASO C; 1R3J C; 5EC1 C; 3BEH A; 5B3S C; 4MVM A; 5BZB A; 2HFE C; 1OCR C; 3AG2 C; 5EK0 A; 1J95 A; 3SJQ C; 3SYQ A; 3LUT B; 4P30 A; 4MVO A; 3T2M A; 4WFG A; 3E89 A; 4EKW A; 1ZWI C; 4WFH A; 2EIJ C; 3STL C; 3VOU A; 4KFM A; 1V54 C; 3F7V C; 3OUF A; 2Q6A A; 2DYS C; 4RUF A; 1R3L C; 2WLK A; 3AG4 C; 1LNQ A; 4UUJ C; 3UKM A; 2BOB C; 3K04 A; 3SYP A; 4G27 B; 4PA3 A; 4ZBM A; 2WLL B; 4LBE C; 3WG7 C; 4F4L A; 4PDL A; 4MSW C; 4XDJ A; 3E8B A; 4X89 A; 3SPG A; 4MVR A; 4WFF A; 4PDV A; 3E8F A; 5EC2 C; 5EBW C; 4QNH B; 2ITC C; 2ITD C; 2HVK C; 1S5H C; 3RBZ A; 2H8P C; 3AG1 C; 4JTA B; 2A9H A; 2DYR C; 1JVM A; 1XL4 A; 1M56 C; 4GX1 A; 4MW3 A; 2AHZ A; 2WLL A; 4PDR A; 4R8C A; 1ORQ C; 2Q69 A; 2QKS A; 4DXW A; 2X6A A; 2R9R B; 3OGC C; 4MVU A; 3E8H A; 3SPI A; 2DWD C; 3F7Y C; 3KG2 A; 2EIN C; 4I9W A; 5E1A C; 4P9P A; 1R3I C; 4HYO A; 3OR6 C; 3K03 A; 2WLI B; 4LP8 A; 4X88 A; 2HVJ C; 3LDD A; 1G4Y B; 2ZXW C; 3ABM C; 3SPJ A; 2WLH A; 4GX0 A; 4JTD B; 3ZJZ A; 2W0F C; 4H33 A; 1KKD A; 5CBG A; 3RVZ A; 1K4C C; 4P9O A; 3FB7 C; 2ZD9 A; 2DWE C; 3E86 A; 4J9Y B; 3F5W C; 4JTC B; 4MS2 A; 2IH1 C; 3ABK C; 2ATK C; 4MTF A; 3LDE A; 2Q67 A; 2HJF C; 2WLI A; 3LNM B; 2X6C A; 3ZRS A; 1V55 C; 4QE7 A; 4WFE A; 3EFF K; 4MVZ A; 2HG5 C; 4RUE A; 4PA6 A; 4TWK A; 3AG3 C; 4OXS A; 3T1C A; 4R50 A; 4MVS A; 3K08 A; 4MTO A; 3E8G A; 4XDL A; 4CBC A; 2WLJ A; 4QE9 A; 5B1A C; 3LDC A; 4X8A A; 3T4Z A; 2OCC C; 3STZ C; 3SYA A; 1QLE C; 1K4D C; 2EIL C; 2KB1 A; 3GB7 C; 5EBL C; 5KUK A; 3K0D A; 1M57 C; 3FB5 C; 3RW0 A; 4XDK A; 4PA9 A; 3SYO A; 3E83 A; 3K0G A; 2BOC C; 4GX5 A; 4RO2 A; 1P7B A; 2P7T C; 3IGA C; 3IFX A; 2EIK C; 3OR7 C; 4LCU C; 1OCO C; 2AHY A; 4RAI A; 1XL6 A; 3JYC A; 3ABL C; 2Y69 C; 2A79 B; 2WLN A; 4PDM A; 3TET A; 1OCC C; 2YEV A; 5KUM A; 5IY5 C; 2IH3 C; 3TCU A; 4R7C A; 3SYC A; 4MVQ A; 3FB6 C; 3SPC A; 5CBF A; 2A0L A; 2NLJ C; 1BL8 A; 4P2Z A; 3HPL C; 4MTG A; 4PA4 A; 2WLM A; 5B1B C; 1OCZ C; #chains in the Genus database with same CATH topology 3K5N A; 4BIO A; 4ZIB A; 1FYJ A; 3ML0 A; 1BHB A; 2ZCE A; 4J41 A; 3O65 A; 1H2N A; 4PI0 A; 3PJS K; 4J9Z B; 5LOV B; 2Q0O C; 3QO8 A; 3T1H B; 5C8Y B; 5K1P A; 4LF7 B; 1HNX O; 4WF9 V; 3L73 H; 3NXS A; 3K57 A; 5LOV A; 1VQ4 V; 4X1I B; 3G6B A; 1S72 V; 4X20 B; 3CCV V; 4DW0 A; 2R70 A; 4DR6 B; 4F4L A; 5JQG B; 1VQK V; 1OV9 A; 4PDV A; 3ZHR A; 4X1I A; 3AG1 C; 1FFT B; 4YIP A; 3CC2 V; 4X20 A; 1SQF A; 1AJQ A; 2Q69 A; 4R8C A; 5JQG A; 4X62 B; 1XIL A; 4E2L A; 1YIT V; 5CB4 B; 4QPK A; 1FJG B; 3JAT A; 4YJ3 B; 5L3G A; 3JD2 A; 2ZIO A; 2LQT A; 2Q8V A; 2X7R B; 3W7U A; 1LUV A; 1IUR A; 1IBL O; 5CB4 A; 1M93 A; 3JSL A; 4DV5 B; 1MAB G; 5BMV B; 4YJ3 A; 2UUB B; 2CAZ C; 2OTL V; 4DRX B; 4QE7 A; 4MVZ A; 2PI5 A; 2A7W A; 3T1Y O; 1AIL A; 3CRR A; 4DYL A; 4DR1 O; 2MK3 A; 4DRX A; 1FPO A; 4J7K A; 3ZCC A; 2GSM B; 1K33 A; 2OTJ V; 2EIN B; 2VWJ A; 3B40 A; 2CUG A; 4DV7 O; 2ZXW B; 2WLN A; 2OT5 A; 5IYB O; 2JGU A; 5LBQ A; 3OT7 A; 3DSQ A; 5B1O A; 3QVN A; 1V55 B; 3DC6 A; 3H9V A; 5KMG B; 1NJI W; 5JWP A; 5IE9 A; 4LF6 O; 3R65 A; 4OGQ B; 4FVM A; 1KD1 W; 4OPA A; 3CCS V; 1JX9 A; 5CMU A; 5H6R A; 5KMG A; 5GTI Z; 3ASO C; 1JPX A; 3OAA G; 4B7K A; 2Y69 B; 4ASU G; 2QWR B; 3VOU A; 3JCZ A; 1KC8 W; 2PUS A; 3DXR B; 1KEC A; 3K58 A; 1BZK A; 4NXN B; 1YTF B; 4LR3 A; 1S5J A; 3K04 A; 4NB5 A; 4B3R B; 3L72 H; 4IYH A; 4MVR A; 3DXR A; 3IJ4 A; 1MZF A; 2ITC C; 2AHZ A; 1ORQ C; 1IDS A; 2VRZ A; 3SR2 C; 5CN0 A; 1HNZ O; 3FX7 A; 4F6R B; 3FAV B; 3JD1 A; 4TV9 B; 1XMO O; 2XUM A; 1IXM A; 4GZR B; 4PI2 A; 4X88 A; 2ZM6 B; 1W0K G; 1U97 A; 4DW1 A; 4F6R A; 3FAV A; 4TV9 A; 3F5W C; 3PN1 A; 4JI1 B; 2Q9L A; 1VEW A; 2P06 A; 4DV1 B; 1XMO B; 1WNS A; 1B3Q A; 4JF3 A; 2YUA A; 1M4U A; 2IBZ H; 5K1X A; 1K34 A; 5AG2 A; 4X8A A; 3SYA A; 3CX5 F; 2ZQM A; 3JD0 A; 2UUC B; 1PD3 A; 4LCU C; 1LUW A; 4N23 A; 1SQX H; 1K5Q A; 1YJ9 V; 3MDS A; 5HFM A; 3ABL C; 3UCS C; 5LA6 B; 1F7Y A; 1SZT A; 3D3Q A; 5CBF A; 5D5P A; 4PA4 A; 3JAW B; 1U96 A; 4Q6G A; 3RFR A; 1JOY A; 5LA6 A; 2EBO A; 1L1F A; 1E1Q G; 3APQ A; 2Q0A A; 5EC1 C; 3UT5 B; 2UXB B; 3LSS A; 3CJH B; 1XEQ A; 2EIJ C; 4H44 B; 2HEP A; 1Q6H A; 2QWO B; 1N33 O; 4HNA B; 3L70 H; 1N4C A; 2DMX A; 1Y4M A; 3CJH A; 4JYA B; 2WLL B; 4UCU A; 3WG7 C; 1PPJ H; 3MAQ A; 2YIC A; 1Y66 A; 3OFN G; 4JI7 B; 4DV0 O; 2A9H A; 2JRI A; 2M6Y A; 2WLL A; 4GYC B; 3ZHV A; 1VQ8 V; 5JVD B; 3S3W A; 2E5L B; 4TUY A; 1VF6 C; 3CWB H; 1RPR A; 3OR6 C; 5JVD A; 1E1R G; 1NR7 A; 1R6N A; 4X9Q A; 2ZE7 A; 2DWE C; 1DLB A; 2R9I A; 2HJF C; 2B5U A; 3ZRS A; 3H1K H; 2BTQ B; 4CBC A; 3JAR B; 1M56 B; 5LP6 B; 2OCC C; 2P6J A; 2QE7 G; 4HBN A; 2HP8 A; 2IU0 A; 1IBK B; 2VQE B; 2YXY A; 3G80 A; 4DUY O; 5L3C A; 4LF5 O; 2BTQ A; 3JAR A; 3IGA C; 1I5X A; 5LP6 A; 4CC5 A; 2M7W A; 2A79 B; 3W7W A; 3BY6 A; 2KG7 B; 4Q20 A; 4JI0 B; 3WB0 A; 2XHB A; 3G71 V; 4KHP O; 2IU3 A; 1S0V A; 2DQ0 A; 1OCZ C; 2KG7 A; 2Y4T A; 1IX9 A; 3QO7 A; 2YXL A; 4BW5 A; 1YTF D; 1VQ6 V; 4YHH O; 5CBH A; 2FTK A; 4D7S A; 1JJ2 U; 4YXW G; 3VQV A; 3T2M A; 2LP7 A; 1H8E G; 5IDJ A; 5LGU A; 2LW7 A; 3AG7 A; 4D6T H; 4KFM A; 4DUZ B; 3IC7 A; 1R3L C; 3JD4 A; 5JCO A; 4FLZ A; 2RQ6 A; 4UB6 Z; 3FKS G; 1OJH A; 4W4K A; 1VQM V; 1BGY H; 1YSC A; 2VQF B; 1YZB A; 4JI4 B; 4JI2 O; 4LNU B; 2P4K A; 1ZLZ A; 2FYU H; 4PDR A; 1FAF A; 3E22 B; 4LFB O; 2ARH A; 4LNU A; 3KG2 A; 4DV2 B; 5IYC O; 1WP8 A; 4LP8 A; 3E22 A; 1IVS A; 1TUB B; 3ABM C; 3ZJZ A; 2E76 B; 3CXC U; 3JCU Z; 3RVZ A; 4J9Y B; 2QKA A; 1TGO A; 4I9Q A; 1XHZ A; 1TUB A; 2OIG A; 3O9O A; 5KHI A; 3AG3 C; 2F93 B; 3AG1 B; 4FK5 C; 4XDL A; 3JAS B; 1ZTE A; 3B4S A; 3D36 C; 1VMG A; 3JAS A; 5KAF Z; 3OR7 C; 1XMQ O; 3IC9 A; 4MTX A; 4FPP A; 3IAY A; 3A2F A; 4B3T B; 4TQD A; 3I55 V; 3CC4 V; 2QTS A; 4JI8 O; 1NBM G; 1OZ0 A; 1Q6I A; 2JK5 C; 4R6Z A; 2LJ2 A; 4IL6 Z; 3ABT A; 1R3K C; 3OUS A; 4LFC B; 1L0N H; 3ETQ A; 2Q68 A; 4X65 O; 1HDJ A; 2QTO A; 4PA7 A; 4EEQ A; 4J7J A; 5JJJ B; 3BEH A; 4MVM A; 4AHC A; 1ENV A; 1XNR B; 3U0Z A; 2V4D A; 3SYQ A; 2EX3 A; 4B7E A; 3CRC A; 4JV5 O; 3RN4 A; 3JAK B; 1W0J G; 2QSA A; 3EXA A; 5LMU O; 4DR2 O; 2GTS A; 2G38 A; 1RSO B; 1SQP H; 1LNQ A; 2LW1 A; 2BOB C; 5EIB D; 4X66 O; 4BIZ A; 2XAG A; 3KCX A; 2PYL A; 5C93 A; 4DV4 O; 1RSO A; 1Q90 D; 4B3S B; 3E35 A; 1JVM A; 1AR5 A; 3B77 A; 2EZP A; 5LMU B; 4DR2 B; 4UCS A; 3ASO B; 5D5Q A; 4FM1 A; 4DR3 O; 3F7Y C; 3DTU B; 5TIS Z; 3J7A U; 4FIP C; 4I0X B; 4GCZ A; 3SPJ A; 2WLH A; 1QU7 A; 1J5E B; 2AZ2 A; 4XBF A; 2EJR A; 2IH1 C; 2ATK C; 4I0X A; 1SA0 B; 4WFE A; 3EFF K; 4DR5 O; 1Y6X A; 1ZAU A; 2UXC O; 1SA0 A; 3K5L A; 1GM8 A; 1K97 A; 4PV1 B; 4MT8 A; 1M57 C; 3RW0 A; 5LXT B; 4Z1V A; 2K9P A; 5H6Q A; 4OX9 B; 3B09 A; 2YIA A; 3THO A; 2IJJ A; 5LHG A; 3KCY A; 5L3E A; 3ZBH A; 1M9N A; 5LXT A; 1QQC A; 1VP7 A; 2PF4 E; 2IH3 C; 1HWY A; 4UVB A; 3RYI B; 4YY3 O; 2A0L A; 4FLW A; 2Z0A A; 4JAU A; 1BSM A; 2ZR2 A; 2P5O A; 2QM8 A; 2HR3 A; 3MHH C; 3RYI A; 1YJW V; 1KBH A; 1S76 D; 2QR4 A; 1SS3 A; 3P30 A; 2RDC A; 3LNN A; 4MVO A; 3ABL B; 1NTZ H; 3TK1 A; 2N05 A; 1PM9 A; 2Q6A A; 3U10 A; 2WLK A; 3T1H O; 1GN4 A; 3BHP A; 4FM2 A; 2ADP A; 4ZBM A; 1GH6 A; 2QM7 A; 4LF7 O; 4MSW C; 2RN9 A; 1H2K A; 1IXB A; 4L8J A; 2L35 A; 2OCH A; 4JTA B; 1Q8I A; 4I4T B; 2GBO A; 1WA8 B; 4QIW F; 4DR6 O; 3I56 V; 3W7X A; 2F66 C; 3CEI A; 3ZX6 A; 2R9R B; 3OGC C; 4W4L A; 1BQZ A; 1DF5 A; 4PEL A; 4X1Y B; 2LFR A; 4LWS B; 4I4T A; 1W2B U; 1R3I C; 1WA8 A; 2EIJ B; 5B1N A; 4X62 O; 3ZHT A; 4JZ2 A; 2ODM A; 4FFK A; 5C8Y A; 2XT9 A; 1FJG O; 4GX0 A; 3VQY A; 3B8N A; 5CBG A; 1K4C C; 4X1Y A; 4LWS A; 1COW G; 3FD9 A; 3F5T A; 1HW7 A; 1PNL A; 5IYD O; 3WG7 B; 2OWO A; 2UUA B; 3BAB A; 3ZIA G; 4DV5 O; 1F4M A; 2R72 A; 3RYC B; 4QPJ A; 4NR1 A; 2UUB O; 3E8G A; 1SES A; 1K73 W; 4DR7 B; 2H3O A; 1WPB A; 3T4Z A; 2JDI G; 5IJ0 B; 1HP8 A; 2ZT9 B; 2YSU B; 3CMA V; 5LHH A; 3RYC A; 2JJ2 G; 1NZ6 A; 1SZX A; 1Q6U A; 3E83 A; 2P7T C; 4TQF A; 3OGI B; 3H1L H; 2YIB A; 5BMV A; 2C2A A; 1VF6 A; 4MVQ A; 5A9G A; 1P49 A; 2HKO A; 2LGQ A; 1H38 A; 5FL7 G; 5FPO A; 3DC5 A; 4L87 A; 4GKK B; 2OCC B; 4WBN B; 3K06 A; 3GVM A; 1AI4 A; 1W59 A; 3HKE B; 1V9P A; 4IYI A; 2Q7E A; 4UCR A; 4UV8 A; 1D2D A; 5J9P C; 3ZS8 C; 1QNM A; 2VS0 A; 4FLV A; 5GTH Z; 2AZ0 A; 3CRQ A; 3AG2 C; 4WBN A; 4UVC A; 3HKE A; 4C7U A; 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2OIE A; 4CH6 A; 3JAW A; 2B1G A; 3JAL B; 2KSD A; 3QNE A; 4JYA O; 1AI7 A; 1N8R W; 1JA8 A; 3JAL A; 5LMN B; 4JI7 O; 5A2Q N; 5E1A C; 3UT5 A; 4JI6 B; 3K03 A; 1YDX A; 1JMK C; 1TUE B; 2CE4 A; 2E5L O; 3FB7 C; 1DGS A; 2YIB D; 3CB2 A; 3TGU H; 1XI1 A; 4HNA A; 1WN7 A; 4K8Z A; 4FZ0 A; 2WLJ A; 2RJZ A; 5IT9 N; 3GB7 C; 4NYK A; 3QF7 A; 2ZNI A; 3SYO A; 3K0G A; 4GX5 A; 1KP3 A; 1MG1 A; 3H1J H; 3RYH B; 3L71 H; 1MZE A; 2QWP B; 4TV8 B; 4RAI A; 4GKJ B; 1IBK O; 2VQE O; 1ZSP A; 2XTA A; 3W7S A; 1IBM B; 1OCC C; 2P4V A; 3RYH A; 2GV9 A; 3OTO B; 2CTW A; 1XHX A; 4TV8 A; 4P2Z A; 1BL8 A; 1I94 O; 3HPL C; 4FJC C; 1UPG A; 3OM3 B; 1PNK A; 1AI6 A; 4O4I B; 4JI0 O; 4LF9 B; 1M90 W; 4J80 A; 1M57 B; 3K9S A; 2ADQ B; 4O4I A; 5BXZ A; 1P7G A; 1I94 B; 4TOI A; 2YC0 A; 3K5O A; 5BY1 A; 1YHQ V; 1TVK B; 2F43 G; 2QDO A; 5DED A; 4X64 B; 1GN6 A; 2VWK A; 1G8M A; 3APO A; 4G2K A; 3MD0 A; 2QWQ B; 3BRC A; 1TVK A; 5L3F A; 2FL4 A; 3SYP A; 1CXZ B; 2P90 A; 3E8B A; 4DUZ O; 1R1B A; 3B2E E; 5EBW C; 2QGN A; 2IW5 A; 2N74 A; 1GM7 A; 3SJA C; 2IJI A; 3TXS A; 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