3LHMA

Crystal structures of the apo-and holomutant human lysozymes with an introduced ca2+ binding site
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLDDNIADDVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords HUMAN LYSOZYME
publication title Crystal structures of the apo- and holomutant human lysozymes with an introduced Ca2+ binding site.
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 51
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3lhmA00
5F16A 3WL2A 3AZ6A 4YEOA 1I1ZA 1GE2A 1AM7A 1GBZA 2HEBA 1DQJC 1LSBA 1OP9B 4XJDA 3T36A 1BWIA 1LSDA 4NEBA 4ETBA 3A6BY 4YM8A 4G4HA 1GFKA 1NBZC 1WVUA 3QNGA 5I5QA 2DQHY 4M6DA 2X0AA 5DN4A 3TXBA 4BADA 1LYOA 4XENA 1FLYA 1DKJA 2BQFA 1IOTA 1IX0A 1KXXA 2YBJA 1UICA 1LSZA 2YBLA 3HBHA 4N5RA 1B7SA 1GPQC 2Z2FA 2ZIJA 4H9HA 3TXFA 1BVXA 1FBIX 1XFPL 4ZIXA 4WG1A 2LZTA 1GF5A 1LCNA 2MEBA 4NHSA 1CKHA 1YKYX 4H94A 1OUGA 3J4GA 1QDTA 133LA 1VAUA 1IC4Y 4IATA 4J1BA 4WLTA 4Z3MA 4NG1A 1KIRC 3W6BA 7LYZA 1WQNA 1IWTA 3TXHA 2ZQ4A 3TXJA 1KIQC 1F6RA 1EQ4A 1QDRA 1ZMYL 1WQRA 1DZBX 3LYZA 1IP2A 1IR7A 1IP1A 2GV0A 1F6SA 1B5YA 5ILCA 1LKSA 3TXKA 3N9EA 1LMOA 1TCYA 2Z12A 1DXJA 1V7TA 4LYZA 3WVXA 1HNLA 1IP4A 193LA 5KXWA 1LZNA 2ZYCA 1HMLA 1UBZA 4CHXA 1GE3A 4TSCA 1W08A 1LYSA 3IJUA 4WM4A 3VWOA 1HEPA 1CKGA 1QUSA 1QIOA 1LOZA 1SLYA 4Z98A 1LMPA 4WG7A 1QQYA 2F4AA 2ZYPA 4DD2A 2Y8PA 1LZCA 2ZWBA 2A7FA 2W1YA 4NGJA 3IWRA 1BB6A 4OOOA 3A95A 2HU1A 3G3BB 3N9AA 2Z38A 2VB1A 5FCPA 1C46A 1XGRC 3D3DA 1OUDA 1QSWA 2EPEA 1IOSA 3HBDA 4NGKA 3W6CA 5FELA 3WUNA 4C3WA 4M4OA 1HENA 3TMXA 1LHIA 3A6CY 4GCDA 1H6MA 4H9AA 3WMKA 3RNXA 3BKVA 3CSZA 1LZ6A 3P66A 1HEWA 3B0IA 4OWCA 1FN5A 1REMA 4B4JA 1IWVA 3A34A 1JJ1A 4LFXA 1O23A 1UACY 4GN5C 1IWZA 4PJ2C 5B1GA 1GFGA 2RSCA 4U3XB 3TMUA 5A3EA 3EBAB 1YROA 1LZSA 5FSTA 2IHLA 4LT2A 4IJ4A 1UA6Y 2A7DA 1IR9A 1GF6A 4W96A 1B7OA 5LVGA 2BQJA 2YBMA 4DD7A 5HNLA 4LYTA 3RZ4A 1LZ1A 2MEAA 1GB7A 4N9RA 3CB7A 1OUCA 4H91A 4IASA 3A67Y 1BB5A 2IFFY 2MEDA 5APEA 1YIKA 3T6UA 1B5VA 2BQHA 1B2KA 3CT1A 3RU5A 4QY9A 1LSEA 1GB9A 1BGIA 1LSNA 3B72A 2Z19A 4YENA 4WL6A 1SQ2L 3P68A 1NBYC 4NHIA 1OQMA 5B07A 1CKCA 5KXTA 1JKBA 2BQLA 1HEOA 1REXA 3WXTA 1GFHA 1BWJA 1HEMA 1QSAA 2Z18A 5HLLA 6LYZA 5FHWA 2I6ZA 2D4KA 4OWHA 3AGGG 4PHIA 1B9OA 2BQDA 4LT3A 3A3RX 1DI3A 4LT1A 1XEJA 4DD3A 5APDA 3ULRA 1OUFA 1HEQA 4NIJA 4DYGA 6LYTA 2BQGA 4UWVA 2EKSC 4GN3A 2LZ2A 1JTTL 4H92A 4RLMA 4NHTA 1NDMC 4C5FA 4ET9A 5I4XA 2HU3A 4ZFPA 1B7QA 1VFBC 5LAFA 4HP0A 4PRQA 1CKDA 3AGHA 1GB3A 2CDSA 1KXYA 3CQLA 5C6JA 2BQOA 4WM6A 3K3TA 4ANRA 5C6LA 1REYA 5AMYA 1TDYA 1DI4A 2YDGA 4NFVA 4XADA 1WVVA 1EQEA 4XJBA 4ETDA 3B6LA 3P64A 2ZQ3A 3GXRA 1IP7A 1GDXA 3IJVA 1LJFA 1JJ3A 1FLQA 1IWXA 1GBXA 4B49A 4GLVA 5APFA 1GBWA 4HJYA 4Z46A 3AZ5A 4WO6A 3WPJA 1E8LA 3ZEKA 4BAPA 1GF8A 2D6BA 5HQ1A 2ZNXY 5LYTA 4LT0A 1EQ5A 1GFJA 1CJ6A 1JHLA 4J7VA 4UWNA 1LHKA 4HPIA 1GFAA 1C7PA 4HJVA 4W94A 3J6KA 1JTPL 1GF4A 5L3IA 4P2EA 2HTXA 5ILFA 5J7CA 1J1PY 1LZTA 1IOQA 4NWHA 4BAFA 2DQFC 1F0WA 1FKVA 1LHJA 1OUBA 207LA 1VDTA 1LZAA 1WQPA 9LYZA 1LJ4A 5HMVA 1GE1A 4H9EA 1B7MA 2DQCY 154LA 5LVJA 1GAZA 4LZTA 4OOTA 3RW8A 1A4VA 5KJ9A 4EMNA 1XGQC 1DPXA 5B06A 3AZ7A 5DM9A 2LYZA 1NHEA 2HECA 2EQLA 1LSGA 4PGJB 1OUJA 3WU7A 1RE2A 3A3QA 1LHLA 2LYOA 1LZRA 4TWSA 1GD6A 3B0KA 5KXSA 2BQIA 4NHQA 1IC5Y 4NGIA 3W6FA 5I4YA 4H9IA 1LZEA 5KXZA 4I8SA 3WULA 1LMTA 4LFPA 1GFEA 4B4EA 3F6ZA 4NSGA 1D6PA 1GF7A 5A3ZA 5IELA 1IY4A 3KAMA 4OW1A 4G49A 1IORA 2CJLA 1F10A 3WYHA 1J1XY 1CJ7A 3WPLA 3AYQA 4A7DA 1H87A 5LXWA 4QEQA 2BQCA 1REZA 4ZEEA 5KXOA 1GWDA 5F81A 1FDLY 1I56A 4NGVA 3WVYA 1HERA 4CGEA 4NGLA 1A2YC 3CT5A 5EBHA 1LZ8A 4H8XA 4J1AA 4LYMA 4XJHA 1LMCA 2AUBA 4J0LA 4NSHA 4XYYA 3W6AA 1QTEA 2YBHA 1ZV5L 3AJNA 4XJGA 1V7SA 2H9KA 2DQEY 1VDQA 4NSJA 3RT5X 1C10A 4DDBA 1IEEA 5KXPA 4RDSA 2G4QA 4CFOA 5E9RA 2FBBA 4KL7A 1UC0A 4X3BA 2F30A 3LYOA 1IWUA 1LYYA 5JENB 1BB3A 2Q0MX 1XGUC 2C8OA 4N8ZA 1LZ9A 2DQIY 2BLXA 3AZ4A 4H1PA 4ML7A 5KXYA 1D0MA 1YAQA 3HBEX 4H8ZA 1CJ8A 4LYOA 5IDDA 1MLCE 2Z39A 4RW2A 4GCEA 3CSQA 5K7OA 1YAOA 5KKJA 4DT3A 1IOCA 3CT0A 5LA5A 1JUGA 1LZYA 1IR8A 5D5FA 1CNSA 2D4JA 1HMKA 1LSYA 1LZGA 1RJCB 1HFYA 1YAPA 3BKHA 3SP3A 1B5XA 1QUTA 1RFPA 4FDYA 1UIHA 3AW6A 5T3FA 3WH1A 1VATA 4ETEA 5KY1A 1GE4A 2Z37A 1DPWA 2ZIKA 2FYDA 1LPIA 3GXKA 4ETCA 1BVKC 1LMAA 4OWBA 5FDJA 1JKDA 4E3UA 2FBDA 132LA 1LHHA 1PS5A 2YBNA 5L3HA 3TXEA 4GLAA 1GHLA 2MEFA 2XBSA 1UUZC 1GB6A 5C6IA 1JTOL 5LVHA 4R6CA 1G7JC 1N4FA 4G9SA 3A92A 3M18B 1GBSA 1B5ZA 1ALCA 3ATNA 4HV2A 1C08C 1NQIA 1EL1A 3A90A 4KPMA 4B0DA 4BS7A 3TMWA 4CJ2A 2I25L 4WM5A 1XGPC 4H9FA 4WL7A 4MCKA 5APCA 1NF5A 5L9JA 1UCOA 1VEDA 4N0JA 1D6QA 1HC0A 1GDWA 2I26L 1HELA 1LJKA 2DBTA 1W6ZA 3WU8A 1HFXA 5HNCA 4OWAA 1LJ3A 1B5UA 4NGZA 1LSFA 2D4IA 2XBRA 2BQNA 2HEAA 5KXNA 4ET8A 1LYZA 3M3UA 1LHMA 2G4PA 1AT5A 2W1MA 4TTDA 1OUHA 3W6EA 4D9ZA 1P2CC 1YL1X 2YBIA 4HTQA 1IC7Y 2BPUA 3LZTA 2BAAA 1OUAA 1JSEA 1GXXA 4H93A 4RLNA 3TXGA 3P4ZA 1GXV2 3ZVQA 1GF9A 3TXIA 1XEIA 4H90A 4YEMA 3A93A 5DLAA 3W6DA 4XN6A 1T6VL 1QTKA 5LINA 2MEIA 2WARA 3G3AB 4GCBA 3WUMA 4B4IA 4DWXA 5IHGA 1IWYA 1XSFA 2DQDY 1B7LA 3LN2A 4NY5A 5F14A 1T3PA 3AW7A 1BHZA 1IVMA 1VDPA 1G7IC 1WTNA 1IO5A 1FKQA 3QE8A 4DDAA 4DD9A 1JWRA 2FYCA 1GFVA 1AKIA 1WQMA 1ZVHL 2HEEA 4AGAA 1LMQA 1DKKA 3AGIA 3FI7A 4DD1A 2MEGA 3WU9A 4TSBA 4WM3A 4DD0A 4YOPA 4WM2A 153LA 1YQVY 4AXTA 3WW5A 1IY3A 4EOFA 1BWHA 1NWGA 2LYMA 4LYCA 4TUNA 2YSSC 5D5CA 4DDCA 1LJHA 1JISA 4I0CA 1JJ0A 4II8A 1OUIA 4R0FA 4H8YA 1GB5A 1HHLA 3N9CA 1LSCA 4NG8A 4XJFA 1NKHA 5LYZA 1GFTA 2XTHA 1WTMA 1D0KA 5F9UA 1GF0A 2HEFA 5I53A 1CKFA 1GAYA 1B5WA 1LJIA 4HTKA 4WM1A 3AB6A 5I4WA 1INUA 1LJJA 4H9CA 3WPKA 2CGIA 3A8ZA 2W1XA 1BB7A 1Z55A 2N5ZA 4L41A 5DN5A 4GCFA 1BQLY 4QDNA 1KXWA 1OUEA 2BQEA 4LYBA 4NWEA 3OK0A 2H9JA 1G7HC 1LZ4A 1LZ5A 1YKXX 1JITA 1GEZA 1CJ9A 1HFZA 3MGWA 4NHPA 1UIFA 1UIAA 5B05A 3ATOA 1JSFA 1XEKA 1YKZX 3A94A 2BQBA 2D91A 1VDSA 2CWIA 1IIZA 1B7RA 1HSWA 5LAGA 3QY4A 1B0DA 4PPOA 5I54A 4CFPA 2DQJY 1B7NA 1FLUA 2BQMA 2DQGY 1IP6A 2XJWA 1GBOA 1RCMA 2NWDX 3A96A 3LYMA 1GBYA 5F9XA 5LA8A 5KXKA 3WXUA 2H5ZA 4NSIA 1BB4A 2ZILA 5LVIA 1JKAA 1GEVA 1B7PA 1IP3A 5KXRA 5M1YA 1LJNA 2Z2EA 2MEHA 4MR1A 1I20A 1YANA 2F2NA 1LMNA 3P65A 1HF4A 3W3EA 3B0OA 5DL9A 5KXXA 3ZVQB 3A91A 1JIYA 208LA 1FLWA 5KXLA 2F4GA 5LIOA 5II3A 1AT6A 4HSFA 1JEFA 1ZVYB 2HUBA 3D9AC 1XGTC 1LJEA 5LVKA 1AZFA 1MELL 4H9BA 4NGOA 1YILA 1GFRA 4G4CA 4PRUA 4FJRA 4GCCA 3EXDA 1LJGA 3FE0A 4HJZA 4WMGA 2LHMA 3LHMA 4WLYA 1GF3A 1RI8B 1UIEA 1UIGA 2EIZC 4NGWA 1C45A 5B59A 1UIDA 4N1CC 5E4PA 4ETAA 4XJIA 1C43A 1G7MC 1LAAA 2DKVA 1LSAA 2C8PA 3E3DA 2HEDA 4HV1A 4QGZA 5FEKA 2BLYA 4KXIA 4TX7A 1GB0A 134LA 4RW1A 4WOAA 3EMSA 4O34A 1LKRA 4UWUA 4G4BA 1TAYA 1J1OY 1GB2A 2G4NA 3WW6A 4WLXA 3TXDA 1LSMA 3HFMY 1IP5A 1LZDA 1NMMA 4LGKA 1UIBA 2MECA 2BQAA 1LZBA 1LTMA 4WO9A 4N1EI 1D9UA 194LA 3TMVA 3OJPA 5B1FA 1GE0A 4HPEA 3LZ2A 2BQKA 4MSTA 4Z41A 2PC2A 1D0LA 4HTNA 5HMJA 1PZYA 2ZNWY 1GFUA 2B5ZA 135LA 2W1LA 1GB8A 4WLDA 3WUAA 5KXMA 4OWEA 3EO5A 4KT3A 3LYTA 1LSPA 1JKCA 1YAMA 2MEEA 5KKIA 2DQAA 4YF2A 2YVBA 4DC4A 1IWWA 1G7LC 1WQQA 5LYMA 1YL0X 1JPOA 4NGYA 1HSXA 1KIPC 1TEWA 1WQOA 1NDGC 1TBYA 4B1AA 1DI5A 4GN4A 8LYZA 3CSRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WL2A 1L10A 1DQJC 3GUOA 1KW5A 3HTGA 1L04A 1NBZC 3QNGA 4DJHA 1L08A 4BADA 225LA 2YBJA 1L06A 3TXFA 1XFPL 3JR6A 210LA 4WG1A 250LA 4NHSA 4H94A 4WLTA 168LA 1KIRC 1IWTA 3EMLA 3TXJA 1WQRA 4ARJA 1F6SA 1B5YA 1C67A 3N9EA 102LA 1TCYA 3WVXA 1V7TA 3OE8A 1L73A 246LA 1PQMA 1UBZA 3C80A 4CHXA 1LYSA 1HEPA 1CKGA 112LA 4ARPA 1L47A 1P46A 2A7FA 1C6PA 3N9AA 1C46A 243LA 3TMXA 1LHIA 1LZ6A 1HEWA 1L40A 1CV0A 1G07A 1IWVA 4LFXA 185LA 1GFGA 1LLHA 3DN1A 1QT5A 2RSCA 3TMUA 1GF6A 4W96A 3RUNA 5LVGA 5HNLA 3CB7A 2F32A 1OUCA 186LA 1BB5A 2B70A 2MEDA 3CT1A 192LA 1QUOA 1LSNA 4WL6A 1CV5A 1OQMA 4LDOA 1C6GA 1REXA 5HLLA 1QSAA 2I6ZA 2RBSA 1B9OA 4DD3A 1D3JA 1HEQA 3C81A 4DYGA 2BQGA 2EKSC 4GN3A 1L28A 2LZ2A 196LA 3VW7A 4C5FA 4ET9A 3C8RA 3C8SA 4HP0A 3AGHA 3SBAA 2BQOA 3CDRA 4ANRA 4ETDA 1SX7A 3B6LA 1PQOA 1L49A 3HH3A 1FLQA 150LA 4B49A 5APFA 1GBWA 200LA 3AZ5A 245LA 1E8LA 4BAPA 1GF8A 4LT0A 1CJ6A 1ZURA 4UWNA 3CDOA 2HTXA 1LZTA 4BAFA 1F0WA 1JQUA 1VDTA 1LJ4A 1OVKA 1L09A 1B7MA 2DQCY 3LZMA 4EMNA 1XGQC 4EKPA 1KS3A 5B06A 2B72A 1NHEA 2EQLA 1OUJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5F16 A;  3WL2 A;  3AZ6 A;  4YEO A;  1I1Z A;  1GE2 A;  1AM7 A;  1GBZ A;  2HEB A;  1DQJ C;  1LSB A;  1OP9 B;  4XJD A;  3T36 A;  1BWI A;  1LSD A;  4NEB A;  4ETB A;  3A6B Y;  4YM8 A;  4G4H A;  1GFK A;  1NBZ C;  1WVU A;  3QNG A;  5I5Q A;  2DQH Y;  4M6D A;  2X0A A;  5DN4 A;  3TXB A;  4BAD A;  1LYO A;  4XEN A;  1FLY A;  1DKJ A;  2BQF A;  1IOT A;  1IX0 A;  1KXX A;  2YBJ A;  1UIC A;  1LSZ A;  2YBL A;  3HBH A;  4N5R A;  1B7S A;  1GPQ C;  2Z2F A;  2ZIJ A;  4H9H A;  3TXF A;  1BVX A;  1FBI X;  1XFP L;  4ZIX A;  4WG1 A;  2LZT A;  1GF5 A;  1LCN A;  2MEB A;  4NHS A;  1CKH A;  1YKY X;  4H94 A;  1OUG A;  3J4G A;  1QDT A;  133L A;  1VAU A;  1IC4 Y;  4IAT A;  4J1B A;  4WLT A;  4Z3M A;  4NG1 A;  1KIR C;  3W6B A;  7LYZ A;  1WQN A;  1IWT A;  3TXH A;  2ZQ4 A;  3TXJ A;  1KIQ C;  1F6R A;  1EQ4 A;  1QDR A;  1ZMY L;  1WQR A;  1DZB X;  3LYZ A;  1IP2 A;  1IR7 A;  1IP1 A;  2GV0 A;  1F6S A;  1B5Y A;  5ILC A;  1LKS A;  3TXK A;  3N9E A;  1LMO A;  1TCY A;  2Z12 A;  1DXJ A;  1V7T A;  4LYZ A;  3WVX A;  1HNL A;  1IP4 A;  193L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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