3LORA

The crystal structure of a thiol-disulfide isomerase from corynebacterium glutamicum to 2.2a
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
154
structure length
154
Chain Sequence
LDNAPLLELDVQEWVNHEGLSNEDLRGKVVVVEVFQMLCPGCVNHGVPQAQKIHRMIDESQVQVIGLHSVFEHHDVMTPEALKVFIDEFGIKFPVAVDMPREGQRIPSTMKKYRLEGTPSIILADRKGRIRQVQFGQVDDFVLGLLLGSLLSET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Corynebacterium glutamicum
publication title The Crystal Structure of a Thiol-disulfide Isomerase from Corynebacterium glutamicum to 2.2A
rcsb
molecule keywords Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins
total genus 42
structure length 154
sequence length 154
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3lorA00
4TXVA 5FWGA 3VK9A 2P31A 2HE3A 5J9BA 1Z6NA 3LEFA 4I97A 3RPNA 1GSQA 1IYIA 2AJQB 3QDNA 3VWUA 4D73B 1XVWA 1Y25A 1QK8A 2GZYA 2PMTA 2IL3A 3LWAA 2EC4A 3TCOA 4XS6A 4ECBA 3QAWA 1A8LA 2B6MA 3GSTA 1GSUA 4JZQA 3ZIVA 3FKFA 5ABRA 4ECJA 2YZHA 7GSSA 3WD6A 4ZB9A 2OKAA 2VD0A 2LQQA 4ACSA 4IP1A 1YEXA 1GL8A 2RUEA 5G31A 4MCUA 2H74A 2VCQA 5AIXA 2DSAA 19GSA 4ILFA 4GSSA 1GUMA 3KTLA 4WKWA 1KEBA 3QFAC 3APQA 4PURA 5J9CA 1GRXA 2PWJA 5F0GA 3CTGA 2F8AA 2HZEB 1HYUA 4JRRA 1AC1A 3DEXA 2GS3A 5JWRB 1ST9A 4MJEA 2KOKA 5ECOB 2VM2A 4Q5RA 2OBIA 3APOA 3ZITA 4F82A 1V98A 2VLTA 4X0XA 3VPTA 1XOAA 5HR0A 4ML6A 5ELGA 2GT6A 3R2QA 4N0ZA 1URMA 1TI3A 4EKZA 4N30A 2FGXA 4PQIA 3HY2A 4N10A 2JZSA 2LJKA 1G6WA 3F3RA 3KMNA 1SL2B 5CP1A 3EE2A 1O73A 2HFDA 3HD5A 4F0CA 4IVFA 5F8BA 1G7EA 1BYEA 1THOA 4YQVA 4OO5A 3GNJA 4PQHA 5DALA 1CQHA 4MZWA 2JU5A 2L59A 3DMLA 1EWXA 2GQLA 3HA9A 5DJLA 3HHVA 1DE2A 1QXHA 4GTUA 1EV4A 1B4PA 2GLRA 1XZOA 4YAPA 4KB3A 4POBA 2XPDA 1YJ6A 3TKQA 4ZL9A 3L0HA 5CYYA 1RQMA 2DJ0A 5A4WA 4MPGA 1M9BA 5KN1A 16GSA 2N5AA 4KW6A 3ME7A 5AN1A 4HJ2A 4POKA 5HR1A 3BCIA 1M2AA 3Q6OA 2AYTA 2IMDA 3KXOA 3F4TA 4HJMA 4NAXA 1O8XA 4GWRA 3TRQA 5D96A 1LBKA 2CVBA 1M9AA 5DAKA 6GSTA 1PD21 2H19A 1UA5A 2V1MA 4YQMA 3GMFA 1XWAA 2IPAA 3GKNA 2MBSA 5JCUA 3GKXA 2H1GA 4CW9A 1QFNA 3GRXA 1M99A 2YJHA 5B6NA 1TDIA 5GAPD 1GUKA 1TJDA 3H4KA 1AAZA 10GSA 4GQCA 1VF1A 3QMXA 1TW9A 1ERVA 2H1BA 1A0RP 4MABA 5DALB 2MMZA 1K0NA 2NTOA 1WJKA 1M7TA 4MA9A 5IIZA 2FHEA 2N5BA 2FNOA 3M0FA 2FCHA 2OADA 1A2JA 1SK2A 3ZTLA 2YCDA 1SKRB 3C1SA 2F3MA 3E9JB 3VWXA 4WETA 4K2DA 1BX9A 4BVYA 3GA4A 1FG4A 3UL3A 4KA0A 1S3CA 4GSTA 4RQRA 4OFNA 3KTBA 1ZL9A 2IMIA 2R4VA 5F05A 2P0GA 2H8LA 1T8EB 1HD2A 1ZMAA 2CVKA 4WXTA 4EUYA 2PERA 3ISOA 3ZFLA 5H5QA 3D5JA 2BJXA 4TRXA 3TUEA 2CX4A 4WEYA 4LL4B 2H76A 1MDJA 1AQVA 2YPMA 4PNFA 4EE0A 5DAKB 4IBPA 1AUCA 3WGDA 1RW1A 4ULXA 5CNWA 1U3AA 1MD4A 5IPHA 1TK5B 2VCVA 3F0IA 3I69A 4I2UA 4QL9A 4QL7A 2GDRA 4F9ZA 2VCTA 2NPBA 4DVCA 4IN0A 1FB6A 1T00A 1GNEA 1V2AA 5AISA 4V1Ap 2F51A 2LRNA 1TRUA 1OC9A 4LLRA 3Q19A 12GSA 2A4VA 5AIVA 3UEMA 2WCIA 2CAQA 4MP4A 3C71A 5IMCA 4TVEA 3GHAA 11GSA 1ML6A 4HQZA 5IPGA 2B7JA 4L0WA 1V40A 1TK8B 2DC5A 1SKWB 3IA1A 1ZGNA 2WS2A 1QUWA 4KAEA 2H0IA 2LNSA 5G2ZA 3EMXA 1XPVA 3GN3A 5J5NA 1SYRA 4XCSA 4GRFA 5IMFA 2VL9A 1EV9A 3GKKA 4TR4A 2WFCA 4JR4A 2YWIA 1XW5A 5IO2A 4MF6A 2EIQA 2O89A 5HR2A 1DSBA 4IELA 3FEUA 1WPIA 4NPBA 2CV4A 4PUFC 3ZVJA 2G0FA 1EP8A 3CSHA 5ECHB 3VI7A 1XVQA 3F6DA 4AF2A 3UIWA 5LD0A 1PGTA 1ZYQB 3EURA 1THXA 1NHYA 1A0FA 4FH8A 5G5FA 20GSA 4POLA 1PSQA 4HOJA 2HLSA 2P5QA 1UVZA 1GP1A 3HJPA 4EL1A 3GSSA 1HQOA 4IS0A 3JCML 1OC9B 3L9UA 2VLVA 2V32A 1ZYEA 1SYXA 2N5FA 3O76A 4O92A 1XWGA 2R5GA 3IPZA 3ERGA 4V2NA 4KDYA 2JSZA 2JZRA 5B6MA 1S3AA 1TRSA 5ELAA 2IMKA 1G7OA 3LORA 3TRXA 5A4UA 1GWCA 1SK1A 2X64A 4MLYA 4KCEA 3UBKA 5DVBA 4KH7A 3HZ8A 4MZBA 2OACA 3FR3A 1Z7PA 4PGTA 4PUAA 2GZZA 2YWNA 3KM6A 6GSVA 1U88A 4KSOA 4KDXA 2IMEA 3Q74A 2VCWA 4XS4B 6GSUA 4BVXA 2HSYA 5H5SA 3F4RA 2H6ZA 3F9UA 2FD3A 3GKMA 2GSQA 5B8BA 5IOWA 1FB0A 2LKUA 2ON7A 4ZL7A 3KJYA 1OE8A 3D22A 2C3QA 3FW2A 3U5RE 1WWJA 3EVIA 1XWBA 3US3A 1GULA 4K9ZA 2XHFA 2LS5A 3H79A 2AHEA 3SWLA 1PKWA 1K0DA 9GSSA 2H01A 3RBTA 2NBSA 2FLSA 4Q5NA 5DQSA 2LUSA 4MJBA 4RI6A 3M9KA 4I6XA 2IN3A 4L5LA 3ZFBA 2VOCA 1X5DA 4L0UA 3GURA 2H6YA 3WT2A 5ECLB 2A2SA 1UN2A 2GT5A 4EXJA 1GSEA 3IDVA 2FWEA 2DJJA 3CRTA 3FR6A 1BJXA 2YNXA 4TR3A 2HNLA 2PBJA 4MPFA 3DWVA 5D73A 1X5CA 2CAIA 3IAS2 4TN8A 1A2LA 1J08A 1SJZA 3HVSA 1W89A 3QFBC 2C0DA 3QOUA 4LL1B 2H73A 1SK0A 3UBLA 4EO3A 2IJYA 2HXKA 4WBJA 2DJKA 2ES7A 2KUCA 5D93A 4K8MA 5J41A 4HS1A 4WF4A 5J4UA 5DJMA 1HNBA 3FZ5A 5HQPA 3LG6A 2RLIA 4TR0A 2OBKA 2B5YA 5GZZB 1DE1A 4IJIA 3VI5A 3GIXA 1N2AA 2KP1A 3TKSC 3ZZXA 3M9JA 1PX6A 1FHEA 1R5PA 3IXRA 4XS1A 1FO5A 5HR3A 2L4CA 1F37A 3J7Yb 3TGZA 3A5WA 5ECKB 3G9BA 5B7CA 4NHZA 4MZCA 3SBCA 5IO0A 5CO3A 4ZILA 2BTOT 1KBNA 3IBHA 2M80A 5LCZA 2MZCA 3QD9A 1JZWA 2FA4A 4POMA 3WYWA 1K0MA 1I9DA 1EEJA 2AB6A 3DKSA 4FYUA 3LYKA 1X9WB 3F4SA 4MF7A 2DBCA 2NDOA 3W8SA 3GYKA 2LJRA 1YEPA 3ZYWA 4ZB6A 1ZCPA 1DBYA 4RQXA 4G9HA 1WP0A 3KGKA 1VF2A 3LQ7A 3KIJA 2YJ7A 5IMVA 3D0ZA 4HU7A 3KCMA 1OVNA 4V1Ag 2PVQA 2EIRA 4MDCA 3GX8A 5LNKe 2GQKA 2YANA 1O81A 3ZIJA 1SD9A 2HI7A 3IC4A 4L8EA 1V57A 2K8VA 2E2MA 1Z7RA 1ZOFA 2JSYA 4DSSA 1SL1B 2H6XA 4K7NA 4FO5A 2KLXA 4Q5FA 3TKPA 1EGOA 4RUVA 1WIKA 3D4MA 2LNTA 3BJ5A 3OR5A 4IW9A 2V6OA 4OMVA 3FRCA 1GTUA 5G1LA 4N0VA 3PR8A 3Q18A 4OCEA 4EF0A 2K9FA 2JACA 4F0BA 4J2FA 5D8IA 4JR6A 2L5OA 3I43A 5AGYA 1Z9HA 2VCXA 3RAZA 3HDCA 5IMAA 2L4QA 3ERWA 2O8VB 3F3QA 3WGXA 3GH9A 2H30A 3E3EA 1O7UA 3VPQA 3W8JA 1KTEA 5H5RA 1TKDB 4RI7A 3VWWA 1EOGA 2C0GA 2ZUPA 5JCWA 3G7YA 1K0CA 2J9HA 5IM9A 1E6BA 1GLPA 2WRTA 1AIUA 6GSXA 1MEKA 2REMA 3F6FA 2VIMA 3CXGA 5KEJA 1SU9A 1TU7A 5E59A 3L4NA 2I81A 3S9FA 2LSTA 1EGRA 4AJ7A 4JE1A 4G2EA 3O6TA 1FW1A 4KNDA 3G7IA 4OCFA 4ECCA 1LU4A 1ACVA 3UJ1A 8GSSA 1NHOA 1WRYA 1XCCA 3DIEA 3D6IA 2VL2A 4DSSB 4PX1A 3P90A 3NZNA 1BAYA 4EDZA 4MF5A 5ECRB 3U6VA 4X1UA 1K3LA 1YY7A 3EWLA 3MSZA 1T3BA 2H66A 3IR4A 3DVWA 3H8QA 2C0EA 4KGIA 2GSSA 2GZPA 2YWMA 2M46A 4FYBA 3M3MA 4O5RA 3KP9A 5GAND 1X5EA 2H71A 4EDYA 2TIRA 1FAAA 3QAGA 1C72A 1PN9A 3DGQA 4NMUA 1Z6MA 3TJFA 2JL4A 2RUFA 2LTKA 4WBRD 4XHMA 1TP9A 5KN0A 1SKSB 1NSWA 2K8SA 2RM5A 4NV5A 4BL7A 3KH9A 1H4OA 3IHQA 5C00A 1TRWA 1YZXA 2C1YA 4OWYA 1YQ1A 2GSRA 4MJCA 5KN2A 3PGTA 2E2GA 3GH6A 3HKRA 5DDLA 2IFQA 1JLVA 2R3XA 1OC3A 2JADA 4NV2A 3TOUA 2WJUA 5D9VA 4N11A 3TRPA 2B1LA 1V9WA 1HNAA 3M8NA 2YWOA 2V41A 1ERTA 2CT6A 1YKCA 3N9JA 2C3NA 3EU3A 3IOSA 4FYCA 4BWQA 5A5KA 5EL8A 1EOHA 3TJKA 4XS4A 4O7HA 14GSA 3HJMA 3FZAA 3G7JA 2YV7A 3CTFA 3O3TA 5ECSA 3GFKA 4ZBBA 1X0RA 4GSNA 1B9YC 2OE1A 2Z9SA 1A24A 1GSYA 4GLTA 4O32A 4IQ1A 2DJ2A 1XFLA 1AXDA 4I5QA 4TOPA 5FHIA 2H0HA 3EU4A 2C0FA 5JCGA 2ZNMA 3QAVA 1NM3A 1MDIA 5G1KA 5D9XA 1FOVA 4OFMA 2WULA 3GX0A 2H72A 3GTUA 3MNGA 1BG5A 3FK8A 2MMAA 2IFQB 2QC7A 1R26A 1O8WA 3KZQA 1XIYA 2V6KA 2I9HA 2YP6A 2LQOA 1XBSA 4I8BA 3BOAA 4P3YB 3UMAA 2YZUA 1SD8A 5E4WA 4MH3A 5DBQA 1A23A 2B1KA 2QGVA 4YH2A 3RPPA 4AJ6A 2H0GA 2DMMA 1JZOA 1MDKA 5EVOA 2LRTA 1FVKA 4PXOA 2FA8A 1GTAA 3QPMA 5CRGA 1Y6EA 3CRUA 1JHBA 2DJ3A 2RIIA 4HZ4A 2F9SA 2DIZA 3NIVA 3KP8A 2LRCA 3UARA 3ED3A 3RHBA 4HI7A 3UVHA 2VLUA 2O85A 4ZXGA 1A2MA 2MMOA 4IP6A 4ZBAA 2PN8A 4DSRA 1JLWA 4OFTA 1PX7A 4HU9A 1E2YA 3TJJA 2H1AA 2TRXA 2KP2A 4V2LA 2GQMA 2FWGA 3K8NA 1NW2A 5ECMB 2CZ3A 2X99A 1DUGA 2WB9A 3CMIA 3GTUB 3BBYA 5COHA 3CSJA 3GL5A 4WF5A 4YAVA 3KEBA 4L5OA 4TXOA 5GSSA 1X9SB 1M2DA 1GSSA 2I3YA 4KX4A 1YKAA 3WGEA 1F6MC 4PNGA 2B5EA 5HFGA 2E7PA 1Q98A 1SJIA 1OKDA 5CREA 4XRDA 5D9WA 1TXXA 3UOMA 2HRFA 2AV4A 3VURA 5GSTA 4HEA2 2HYXA 1GLQA 4LMVA 5G30A 2A2RA 2H75A 4J57E 4F2IA 18GSA 3N5OA 1R5AA 2M72A 3DVXA 5D9TA 3PH9A 3ZMKA 1QMVA 2C8UA 1BEDA 3TJBA 3A2XA 4DEJA 3APSA 3HVXA 1EZKA 3MWHA 3TB2A 2F8FA 1TRVA 1T4ZA 2JZTA 3D21A 3LGCA 1XXUA 3ERFA 3AY8A 2MMNA 2HZFA 2OA7A 2MBTA 4I2TA 4HQSA 1GSDA 3UVTA 2X8GA 5IQYA 4XRAA 2LJAA 2XPEA 5J3RA 3VLNA 3ZL5A 3EYTA 3IV4A 2MYGA 2C80A 2CA8A 1BQ7A 1I5GA 1PMTA 1LJRA 1TI1A 5L71A 1MD3A 3H93A 2VD1A 4TKYA 3NOFA 4K0GA 4G19A 3HXSA 4TXOB 2O87A 2PPTA 2K18A 3DYRA 2LV3A 2G2QA 3A2WA 2EIOA 2VCZA 5ID2A 4K7IA 5CRHA 5CRDA 2IIYA 1WOUA 1OC8A 5KN3A 3P8WA 5C04A 1YDKA 1WE0A 2YV9A 1K3OA 4QQ7A 1ERUA 4Z7XA 5IMDA 5JWQB 3IK7A 1XWCA 2HSHA 3ZMLA 2CZ2A 2VM1A 4F03A 2C4JA 4MK3A 3TOTA 2I1UA 1M2BA 1V58A 1J0FA 1R7HA 2K6VA 3HVVA 4K7OA 1J9BA 2P5RA 4ZIJA 5CAXA 2PGTA 2OJLA 2VL3A 2GGTA 2XBIA 2HRNA 2QSIA 2R37A 2VO4A 1SENA 4TR1A 2L6CA 1K3YA 1GSFA 2O7KA 4JEDA 1HNCA 5A4VA 1U3IA 2R6KA 1AW9A 5CRWA 1GTIA 3WT1A 2CX3A 5EY6A 2DJ1A 1EP7A 1VRSD 4AJ8A 5G5EA 4IGJA 3CSIA 2LEGA 1M0UA 4ID0A 3E0UA 4K6XA 2C3TA 2PU9C 6GSYA 5JWOB 4X43A 4K1FA 5DCGA 1MTCA 3BD2A 2GTUA 3IK9A 4IJ3A 2FUG2 3FY7A 3TJGA 4YQUA 6GSSA 2DMLA 5ENUA 2ZCTA 5ECPB 1G0TA 4IHUA 1YF0A 3PINA 3MAKA 2ON5A 3C73A 5ID2B 2KHPA 5ECNB 2FY6A 1PRXA 3V1WA 2AUVA 4FIWA 3HYPA 3P2AA 2GVPA 3GV1A 3LSZA 2CQ9A 4GQFA 5ECQB 5DQYA 5ECIB 4HZ2A 3FR9A 2B5XA 3C7MA 1EEMA 3MDKA 2RM6A 4KSMA 1AQXA 3DD3A 1F3AA 1TOFA 3CYNA 4JU5A 5F07A 2L6DA 3FZ4A 4Q5QA 2J23A 1GUHA 1K0BA 4DSQA 5INYA 4TR1B 2WGRA 3I9V2 3LYPA 2XC2A 1QGVA 2X8HA 1AQWA 4LA1A 1GNWA 1ILOA 1RK4A 4ECIA 3VFIA 4E8EA 5DCHA 4IKHA 4WR4A 1B9XC 5HFKA 1O6JA 1F3BA 2R2JA 4G10A 4KE3A 3L9SA 3LJRA 4ZL8A 1TK0B 1JZDA 4NHWA 3DXBA 1A8YA 5EPFA 4MH2A 3TDGA 3A2VA 1TU8A 4OO4A 3VWVA 3J7Yk 2X8CA 1CQGA 1YF1A 1JZRA 4PQ1A 3GL3A 2L5LA 1PL1A 4MMMA 3LXTA 1XW6A 5F06A 2BMXA 2V2GA 3KD0A 1WMJA 1PA3A 5FT3A 1XWKA 3A3TA 5IOXA 1G6YA 4NWYA 3C1RA 5IMZA 2IMFA 1PL2A 2AAWA 2YOIA 4XIHA 3RHCA 3TKRA 2CVDA 1TTZA 1USBA 3KH7A 4GXZA 2OE3A 3W6GA 1UC7A 1K0AA 5B8AA 2IWTA 3I6AA 3CBUA 1GTBA 2FWFA 2L57A 2DIYA 4JBBA 1OAZA 2PUKC 1GH2A 4ML1A 13GSA 3D4TA 3H1NA 1S3DA 2I4AA 3TKSA 4CDOA 1X9MB 4KUNA 1ERWA 4ZBDA 3RDWA 2XBQA 2YN1A 1F2EA 2HT9A 1SL0B 1OE7A 1ON4A 3EC3A 1JFUA 1QQ2A 4LMWA 4E8HA 4GCIA 2VAFA 5HFIA 4CHSA 3UAPA 1XW9A 1Z3EA 4V2MA 4H86A 4KCAA 1FVJA 2D2ZA 1SJ6A 1T4YA 3HCZA 4IQAA 1PKZA 2TRCP 3DRNA 3ME8A 3BCKA 4BA7A 4NXIA 3IAM2 4XTSA 1Q4JA 1B8XA 3ZREA 3P7XA 3IRAA 3LFLA 4D73A 3EMPA 2WZ9A 4TW5A 3QR6A 4KDUA 2B3SA 1PQNA 3C8EA 4HDEA 4WR5A 3F8UA 1B48A 1K0OA 3TKSE 1H75A 1XOBA 3ZRDA 4MJAA 1ABAA 1VGLA 1U87A 2E0QA 4ISDA 1ZZYA 3ZLPA 4J56E 3HZ4A 2VUPA 3GUSA 1T1VA 1OKTA 4OD7A 4HUAA 6GSWA 3M1GA 1W4VA 3LXZA 2QKEA 3FZ9A 1N8JA 2FWHA 3L78A 2ALBA 1U6TA 2NVLA 4ZB8A 3IE3A 3EINA 4BPYA 2VL2C 2B7KA 1VF3A 1IYHA 4GF0A 2GSTA 4EVMA 2DLXA 4AGSA 3F63A 22GSA 2HZEA 1F9MA 3FYGA 1O85A 1OYJA 1Z5YE 3FHKA 2WDUA 1KNGA 2H70A 2OE0A 3QCPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite