3LR1A

The crystal structure of the tungstate abc transporter from geobacter sulfurreducens
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
235
structure length
232
Chain Sequence
NAEERLKMSTTTSTQDSGLLKVLLPPFEKKNNVKVDVIAVGTGQALKLGEAGDVDVVFVHARKLEDKFVADGFGVNRKDVMYNDFVIVGPKNDPAGIAKAKTAAEALKLLATKGATFISRGDKSGTHTKELDLWKSAGVDPKGNWYVEAGQGMGPVITMATERRAYTLTDRGTYNAFKGAKTDLVILFQGLFNPYGIMAVNPKKFPHVKYDLAMKLIDYVTGPEGLKIISDY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding pro
publication title The crystal structure of the tungstate ABC transporter from Geobacter sulfurreducens
rcsb
source organism Geobacter sulfurreducens
molecule tags Transport protein
total genus 65
structure length 232
sequence length 235
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lr1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lr1A02
2ZNSA 4U4XA 4PFYA 4TQUQ 1VSOA 3S9EA 3OO8A 1XOCA 1ZLQA 4IO7A 1OMPA 4G8NA 2XX9A 1IEJA 3T93B 3V83A 3C36A 5L9SA 3Q26A 1QKAA 1Z7NE 1MQIA 3OELA 4ZECA 1TWYA 1XHYA 1N3XA 2DYXA 2F7CA 1P1NA 3FJGA 1Y20A 4NF8A 2QMXA 5H8NA 3UORA 1Y3PA 5KZTA 4OETA 4GXAA 3K2DA 3DELB 5JEIA 5HPQA 2V3UA 2XXYA 2PT1A 4LP2B 5TP9B 4ZE9A 4OHNA 2OLBA 1USYE 4TLMB 3THIA 1LFHA 4LZ8A 3ILUB 4N13A 1JW1A 1KWHA 1I6QA 1GTKA 3MP6A 3W9VA 5JTYA 2ONRA 4QSDA 4ELQA 2HXWA 2DWIA 1EZ9A 2A5TA 3EHTA 1VE4A 3Q28A 5JK4A 2Z22A 3QUJA 3TODA 1MG1A 4O3AA 1Y1MA 2DVCA 1HSJA 2HQ0A 4X1DA 1D3KA 3S9NC 4ND9A 2Q2AA 4G4PA 2VD2A 3I6VA 3ODBA 4NF4A 1MY0A 4OXVA 1QJMA 5TPAB 2GRVA 3PPQA 2ZMBA 4JXIA 3Q29A 5EHMA 1B7ZA 4RA1A 4H0WA 2YJPA 3CI8A 4I62A 4YB7A 3K6WA 4GVOA 4F3SA 4C0RA 4R9FA 3MP1A 3JZJA 2XX7A 3KGCA 4LZ7A 4XTCQ 5CC2A 3PUXE 5ICQA 3P7IA 2F6PA 4C1TA 5IAIA 1JVYA 3MC2A 3Q25A 4P0GA 3TDJA 4I8CA 4C1UA 4GXSB 1M5BA 4RPOA 1IZ1A 1LCFA 4R74A 3FVNA 3RPWA 1B5JA 2QJEA 1QUIA 3PPPA 1CB6A 2I3WA 4R75A 5H8QB 3BBRA 4IGRA 1JW5A 3OD7A 4ZS9A 3MVXA 1URDA 1O64A 1FQBA 1MY4A 5FTIA 3K6UA 1OVBA 5EYFA 4I9DA 5ICTA 2O68A 1MS7A 3QXMA 3CRBA 4BDQA 5FHOA 3R6UA 1QW0A 3G3IA 2NVUB 4ZZAA 4OFLA 3U72A 2E1SA 2YLNA 4LVQA 4N07A 1FQDA 3FASA 3FV1A 3SESA 3TTNA 1WDNA 2I0BA 1PBPA 3A3UA 3QAXA 1S9TA 1URSA 1SI0A 1H44A 2Y7KA 3UN6A 4THIA 1ZJLA 2I6EA 3SETA 1LBCA 4RYAA 4YKJA 1YAEA 3UA8A 4XKNA 3EHSA 4OMBA 3O2AA 4TLLB 3IJOB 2NWJA 3PUVE 3OMBA 3A09A 2XD3A 3GBBA 4QSCA 4YAHX 2R9JA 4YZZA 2DP8A 3VXCA 3RGYA 3SEYA 2IA4A 4PFTA 5H8HA 3LR1A 3H4ZA 5FTHA 5I2NB 1FTOA 3G3FA 1DMBA 4DIGA 3K02A 3LSLA 2AIXA 2XXVA 1O7TA 2Y7WA 2W7YA 1MXWA 5AA1A 4WXJA 1A7LA 1Y1ZA 4H8JA 4YICA 5ITPA 3DM0A 3VLWA 5AA4A 3TQLA 4G68A 3T9VA 3E4RA 3OO6A 1DPPA 4DXCA 1JETA 5I58B 2VP1A 4F1YA 5CBSA 3W15C 3ILTB 3KBRA 2Q2CA 1B40A 1POTA 1XVXA 2HAVA 1ELJA 2ONKE 1NNKA 1M5CA 3GBAA 3EQ1A 2O7UA 3S9LC 2OWTA 4GL0A 3IOTA 3RUMA 5HM4B 5DEXB 3S4UA 2PX1A 2QPQA 4R72A 4MLQA 2I49A 2DVZA 2DOJA 4YMBA 3ZKLA 3IB1A 2Q88A 1ZTYA 4IY6A 4LONB 4KFQA 1N84A 3QUFA 4GD5A 3PMWA 1A8EA 4KD5A 5CMKA 3PU5A 5LOMA 3TFLA 3CFZA 3PUZE 2ESNA 2B3FA 3TKDA 3IX1A 1B05A 2Y7RA 4KYDA 4JSOA 4YB5A 1H76A 3H6UA 4R73A 3KOSA 4FIMA 4JBZA 1PEBA 3T9HB 1US5A 1UIVA 3IO6A 3UIFA 1MXUA 1MXVA 5AA2B 4O3BA 1NH8A 1B5IA 1NNPA 4X48A 2GFEA 1LB9A 1DTGA 4AQ4A 2V3TA 2O1LA 4ZEIA 4H8IA 3KJTA 4XIGQ 1N7XA 1B5HA 3FJ7A 4QRZA 4F3BA 1N0TA 3VFJA 1B52A 2PT2A 5KDTB 3B7DA 4U4SA 1B1XA 5AE4A 1N3WA 5I57A 1MPBA 4LATA 4ESXA 1IIWA 3VVEA 1BKAA 4EUOA 2O6AA 3O9PA 4GOTA 3ZKKA 4WKMA 3T66A 3OEMA 1B3EA 3TZAA 1MPCA 1HSEA 4F22A 1UTHB 3IOWA 3CSGA 2I58A 4H6DA 2I48A 3TMGA 3B6QA 2LAOA 1LCTA 2F34A 3EHUA 1OQHA 1B51A 3R26A 1QVSA 3DP8A 4BDLA 2OK2A 5EHSA 3QK6A 1IUDA 1ZKBA 3F11A 5KCJA 3N6UA 3CIJA 3UP9A 3AXFA 3M3KA 4JWXA 4PFWA 3KJ7A 2ABHA 4H5GA 1ANFA 2PYYA 4R2BA 3G3JA 1N04A 3C9HA 2PBWA 2Q9TA 4JSDA 1MXZA 3JV9A 4FATA 4PETA 1MDP1 3IOVA 2O84X 3CFXA 1LFGA 1YTVA 4YU0A 2XXRA 4RNSA 4XKPA 4U23A 1Y9UA 1B4HA 1MY1A 1GV8A 3HN0A 4OFJA 4M1VA 4Q30B 1D4NA 2QS2A 1AL3A 4ELOA 2DWAA 2XXXA 3FUZA 3RY3A 5M2VA 1Y3QA 3I5OA 1EU8A 1US4A 3MP8A 2GHBA 5J1DA 4R6HA 4F2OA 2RF1A 2REGA 2AL4A 3TCGA 3MZ9A 2RC8A 1ZMGA 3UK4A 1AOVA 2OCUA 1P99A 4EDPA 1QKBA 2V3QA 1AIVA 4BDMA 4E0XA 4PFUA 1NKXA 1P1WA 1L5TA 1TT1A 1MDQA 3JYRA 4YKKA 3CG1A 5TP9A 4EF1A 2Z8DA 4X1BA 2REJA 3K6VA 3SKPA 1D9YA 1OLCA 4F29A 2I4BA 4HS7A 2O69A 1JQFA 1Z7ME 3TAJA 1UQWA 3GXAA 4LUBA 2ALUA 1B1HA 3CVGA 2DSFA 3MWBA 1MQDA 2NXOA 4F18A 2OJTA 1POY1 3O6GA 3C4MA 3PMXA 1JEVA 2E0SA 4OYVA 4R9GA 1MRPA 2I4CA 3L6HA 4UACA 4ONYA 5I56B 4GLIA 3C35A 1XT8A 1Q35A 5TPAA 1GR2A 5ISUA 2VOZA 3CR9A 1SYIA 2I3VA 3EN3A 1EH3A 3RN8A 2QL3A 3MJNA 3TTRA 4GRKA 4IO6A 3HO7A 2UVJA 4R6KA 5BUUA 2F7AA 3O66A 3U93A 3K4UA 1H3DA 3G3GA 4F19A 1BLFA 1MQHA 1JEUA 1VR5A 3H3GA 4FECA 4ELRA 1B46A 4NE4A 2F35A 3KEIA 5I84A 3DP4A 4F39A 3PPNA 1MY2A 1R1NA 3UGWA 4MH5A 5CBRA 1NL5A 4H65A 2NUVA 4EXKA 3V5AA 2PVUA 4ELPA 1B3FA 1OLAA 5H8QA 3FXQA 2ZNUA 1LB8A 1IXCA 1B7UA 5L9MA 3M3LA 3K0VA 4GWOA 1BP5A 2B65A 1SDXA 4QFNA 4HW8A 4EF2A 2F8DA 1UTBB 5A5XB 4OEUA 2AL5A 3V8XB 3LSFB 1HSLA 3HV1A 4QFLA 5H8FB 1SW2A 1OIBA 4AB5A 4XKQA 2QS1A 3VV5A 3TQWA 4IY5A 3FVGA 3KSXA 2XXTA 3OO7A 2RINA 1B0LA 1SW1A 4NEDA 3KN7A 2H25A 1LGBC 2VGQA 2O1MA 3TTLA 1MM6A 4OVJA 1LAXA 5H8SA 4OESA 3OEKA 1P1QA 4FEBA 4Z7EA 2UXAA 4KR5A 4DZ1A 2RKMA 3DP6A 1PC3A 2I0CA 2NOOA 5HBCA 4QSEA 2R6GE 2P1SA 4G77A 4YKIA 2H99A 3PUYE 4F2QA 5I2NA 2B3BA 2CZLA 4IO4A 4ISUA 2ZNTA 4HCWA 3WAFA 5I59B 1IITA 2XXQA 4IO2A 3SEWA 3KG2A 2ZYMA 1QULA 3G7WA 3SEUA 3TTMA 1FTKA 1B32A 5I58A 3I3VA 1IXHA 3TCHA 4ZE8A 4JDFA 3U92A 1NNTA 4HCYA 4FE8A 1FTLA 3PUWE 1LLSA 1LAFE 4KPTA 1MXXA 3FV2A 1OVTA 3KN3A 4F3GA 1B6HA 4KYEA 1GVCA 3TPAA 2XHDA 4F3PA 4LZ5A 1B0HA 3TCFA 3FVKA 3D4CA 1B58A 2UVIA 1WODA 1RYOA 2O7IA 5DEXA 2XXWA 3H06B 5DVFA 3FVOA 1QUJA 4YMAA 1GGGA 1A8FA 1URGA 1PDAA 1XVYA 1MM7A 1NFTA 1M5FA 2DQVA 3IB2A 2P2AA 3OENA 3RLFE 3M8UA 3IR1A 3MZBA 4GF8A 3TUSA 3SEXA 4K3FA 5F1QA 3CSBA 1B9JA 3GLBA 3HSTA 1SVXB 2DXRA 3HPIA 5ELVA 1S50A 1Y4CA 2H98A 4H5FA 4ZDMA 3IORA 5AA2A 4DCXA 1R9LA 3MW0A 2RCBA 3KN8A 4P11A 4POXA 1H43A 1R9QA 4H1XA 5TU0A 4KCCA 3K1NA 3W9WA 4U1OA 4G2ZA 5KDTA 2Z8EA 1FTMA 1VFDA 4M4GA 1SBPA 1J1NA 1IXIA 3K01A 5DVJA 3LSWA 1MY3A 4NF6B 3VLVA 3PGFA 1BTJA 3C32A 5B7DA 5CMMA 4R2FA 3RTWB 3GZGA 3G3HA 4KHZE 4NF6A 4TOZA 3MBPA 1M5DA 2M8CA 2UVGA 4ESWA 1UTHA 2H5YA 3E13X 2FYIA 4RY1A 4F1VA 3BFTA 2DE2A 4O3CA 1A40A 2F5XA 1DOTA 1UIUA 4G68C 3FZVA 3L6GA 4U22A 2F78A 2QS3A 2X7PA 1ATGA 1PB9A 2QRYA 3N94A 2QSXA 1B3GA 5CRYA 2ZXTA 2PMSA 3EF7A 4FEDA 4MF3A 2G29A 1PBQA 1USYH 2HZLA 4IO5A 4QHQA 5I2KB 3K00A 2UYEA 2ONSA 3B6WA 5IKBA 1I69A 3ONMA 3QIMA 1LSTA 1CE2A 1S7YA 1FQCA 3ZS6A 3FXRA 1Y3NA 5I2KA 4BDOA 1MQJA 5AA2D 4NF8B 1FQEA 1MQGA 4NMYA 3HCQA 5H8NB 2Y7IA 4ZEFA 3O6IA 4I1DA 3Q27A 2FA7A 3RQTA 5B70A 4U1ZA 3OO9A 3TTKA 3T9UA 1FQAA 4IB2A 3RNNA 3BFUA 2IEEA 4DXBA 1N76A 3LSXA 4DCYA 4KCDA 3S9MC 1P1UA 2QMWA 2D5WA 1R6ZA 3IK6B 2DE3A 3LUYA 3VXBA 5JTYB 1FTJA 4OZ9A 2A5TB 5CI5A 2V93A 2DS9A 2DXYA 3PD9A 3PV0E 1NH7A 3N6TA 4RK2A 1NMUA 1QUKA 4QF9A 3K1MA 4F1UA 2ZYKA 2ZYOA 3H6TA 3PD8A 3IJXB 1A55A 1M5EA 3LBSA 4NF4B 3O6HA 4RK9A 2Q89A 1Q1KA 3TEPA 4JWOA 3R7XA 3VVDA 5DT6A 3KFMA 4Q8RA 4Q0CA 3O29A 3TYHA 3VDFA 3MVWA 2DWHA 1B4ZA 3IOUA 3H03A 5I56A 1MH3A 2UVHA 1PB7A 3IB0A 3MVZA 2ANJA 3VE1B 2HEUA 1JW4A 2VHAA 2Y7PA 3MZ1A 1SW5A 4ECFA 4G8HA 3CFLA 1A99A 4JB7A 5BWJA 2G93A 3SERA 3B6TA 2GHAA 3V89B 3QSLA 4OEVA 5F7VA 4ZEBA 2F97A 3HHFA 3MVYA 3MUQA 2O51A 2HZKA 3KOTA 4ZEKA 4KI0E 1LAHE 4ZZEA 3FD3A 1VFEA 3DLNA 4LQ2A 1SW4A 3FIRA 1DSNA 1IQ7A 1I6BA 2ZYNA 4NF5B 1YPNA 4Q5TA 4WEDA 3OXNA 3T9XB 4NWCA 2X7QA 1YCJA 1T0KA 2KLFA 2HFBA 4NF5A 1AMFA 1DPEA 1NNFA 1LAGE 2D21A 4MBPA 3O97A 4L17A 5K2YA 5FHMA 1UTBA 4QFKA 5A5XA 3M3FA 1F9BA 3TELA 1RYXA 3S2VA 3SDFA 2P0SA 4E0WA 2Q8JA 2R71A 1O63A 4IO3A 4HTGA 4U2RA 2F6GA 3RTFB 5H8FA 1EZPA 3MPLA 2BJJX 3FXUA 3E9XA 1OQGA 4BDRA 1FCKA 1ZU0A 4POWA 1Y4TA 4FJPA 3EPEA 4DE8A 1FW0A 1XC1A 3IAZA 1ZBMA 3LC8A 5H8HB 3KZGA 5CMCA 5L9OA 4WEPA 3C31A 2XXPA 2V84A 4G8MA 3A3CA 4GQOA 4OTEA 1FQFA 1SQYA 4UA8A 4DDDA 3KSJA 4MFIA 3OSQA 3BKIB 3FGSA 1MH4A 1AH5A 3WAEA 3QYTA 5AA4B 4EXLA 1TFDA 1TXFA 4G68B 1LFIA 3VLUA 2F36A 5FHNA 4EQBA 4PE5B 2QS4A 4OFOA 3N26A 2CMOA 1II5A 4FAJA 4N6PA 1JNFA 3MAMA 3PPRA 5I59A 3K1PA 4KQPA 1IXGA 3CG3A 4RXLA 2OZZA 4LQ5A 4FORA 1SYHA 3D4GA 3ZSFA 4DXUA 2OWSA 2FNCA 1RKMA 4AB6A 2H4IA 3HHGA 4F31B 1H45A 3E3KA 3OOAA 4Z0IA 2XXHA 4X9TA 3H6WA 4JWYA 1TFAA 1DTZA 1LBBA 2AYSA 1PB8A 2XXIA 4IGTA 2H9BA 1MPDA 4PP0A 4RPNA 3T96B 4DLDA 4EQ7A 2A5SA 4H67A 1I6AA 2DWJA 3SEVA 3IO4A 3N5LA 4PQJA 4EQ9A 3C34A 4QFPA 2HCAA 4OERA 2DE4A 5CM6A 1SI1A 4MLVA 4XXUA 2RC9A 3VVFA 2V25A 3RT8A 2Z23A 5AA3A 1B7HA 4RJZA 1B3LA 3U8QA 4YB6A 2RC7A 4P0IA 4ZEDA 1XS5A 2THIA 3PMVA 3MQ9A 3OSRA 4GFRA 1N7WA 3C33A 2Z8FA 4NWDA 2YPNA 1A54A 5DYHA 3MPKA 4NTLA 4U21A 2OBGA 3IL1B 5I57B 1WVJA 5DTBA 4OQOA 2WKYA 2X26A 3FJMA 2UYFA 3U94A 5K2XA 5ITOA 4BDNA 5DVIA 5L8DA 2GH9A 2HAUA 4QFOA 1P1OA 1SD3A 3USDA 3O28A 4BLAA 2XD2A 5CMBA 4LA9A 4GIZA 1MXYA 1EZOA 2XXUA 4KYSA 1B3HA 1BIYA 1D9VA 4GL8A 3U1OA 3PPOA 2VD3A 3H7MA 3H6VA 4R6YA 5KCJB 2RCAA 1JVXA 4OENA 3G3KA 3RT6B 3ECRA 4XKRA 2D3IA 4YKPA 2XX8A 2F7BA 1B2HA 3T22A 2Y84A 4OWDA 3FATA 1ZIUA 3K6XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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