3LR1A

The crystal structure of the tungstate abc transporter from geobacter sulfurreducens
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
235
structure length
232
Chain Sequence
NAEERLKMSTTTSTQDSGLLKVLLPPFEKKNNVKVDVIAVGTGQALKLGEAGDVDVVFVHARKLEDKFVADGFGVNRKDVMYNDFVIVGPKNDPAGIAKAKTAAEALKLLATKGATFISRGDKSGTHTKELDLWKSAGVDPKGNWYVEAGQGMGPVITMATERRAYTLTDRGTYNAFKGAKTDLVILFQGLFNPYGIMAVNPKKFPHVKYDLAMKLIDYVTGPEGLKIISDY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The crystal structure of the tungstate ABC transporter from Geobacter sulfurreducens
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Geobacter sulfurreducens
molecule keywords Tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding pro
total genus 65
structure length 232
sequence length 235
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lr1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lr1A02
4NF6A 2Z22A 1SW1A 2UVHA 4YICA 1MQIA 4ZECA 3AXFA 2F35A 1GGGA 1YCJA 2DWIA 3O2AA 3HO7A 3PPOA 3N5LA 4GWOA 2UXAA 4N6PA 1T0KA 5ITOA 5JTYB 4XKPA 5I56A 1XS5A 5I57B 1Y3PA 4IGTA 1SBPA 2P0SA 2Q88A 2Y84A 3RN8A 3S9MC 3CSBA 2AYSA 3I5OA 4JWXA 2OK2A 3O29A 1DTGA 3C35A 3U72A 1PB7A 1ZKBA 1LLSA 4C0RA 1LFGA 2FA7A 1HSLA 5H8QA 5I58A 5AA1A 3H03A 1ELJA 1D9YA 4Q5TA 1QKAA 3FIRA 2G93A 4MF3A 4JDFA 3FV2A 4DLDA 4JWOA 4JSOA 4KCCA 3FVKA 4X1BA 3KOSA 1N3WA 5AA4A 5I59B 1B5JA 1JQFA 5K2YA 4YU0A 2DSFA 1ZMGA 3QK6A 1S9TA 2XXQA 3GXAA 2HQ0A 3I3VA 4DZ1A 3KN3A 2A5TA 3IAZA 3K1NA 2HCAA 1NL5A 1JW4A 4G8MA 1FTOA 1M5EA 3OXNA 1SVXB 1MG1A 4G8HA 4RPNA 5EYFA 3M8UA 4WEDA 3U92A 3VVFA 1POTA 1MXWA 4IO2A 3T66A 4NTLA 3PMXA 4RPOA 4GIZA 5H8FA 2F7BA 5DEXB 1MY0A 3QYTA 3SEXA 1LBBA 1FW0A 3PPNA 3MVXA 1ZIUA 3MUQA 2ZNUA 4EQBA 1MDQA 3R26A 1B6HA 4ZE9A 3FV1A 2RC7A 3DM0A 1B2HA 2I48A 3Q25A 4GQOA 2ALUA 1MRPA 2O69A 4LA9A 3IR1A 4G2ZA 1EU8A 3EQ1A 3OD7A 4N07A 4KCDA 3KBRA 2XXTA 3MW0A 1B4HA 4L17A 1QVSA 3OO6A 4Z7EA 2REGA 4ZEFA 4Q0CA 3H6TA 3IB0A 3QUJA 1FTLA 4EDPA 1URGA 1WODA 2XXRA 4GXSB 3TPAA 3RGYA 3MQ9A 2PBWA 5HBCA 2H4IA 4PQJA 4YB5A 3CG1A 3KEIA 1N3XA 1H43A 4XXUA 3V83A 3SKPA 1EH3A 2I4CA 4KFQA 1B9JA 2H99A 4DXUA 1R9LA 4NF8B 4U21A 1N7WA 1IXIA 3CVGA 3K1MA 3TDJA 2DE2A 4QRZA 1FQFA 2X26A 4OYVA 4MLVA 4NF5A 4PFWA 4FEBA 3G3GA 3K6UA 1ZU0A 2IEEA 3IO6A 3TTKA 3C32A 1FCKA 2ZMBA 4ISUA 4OQOA 1BIYA 2PYYA 4RK2A 4EXLA 1SW5A 5H8SA 2QJEA 3MAMA 4N13A 1JNFA 1LSTA 4IY5A 5CM6A 1D3KA 4JWYA 2Y7PA 4U4SA 1LAHE 5KDTB 3DP4A 4OWDA 1HSJA 3K0VA 1JVXA 5I2NA 2I0BA 4IY6A 2OLBA 2UYEA 4UA8A 1Y3NA 1TXFA 1US4A 3OENA 3Q26A 5DVFA 5I56B 1MQGA 4JXIA 1YTVA 4ESXA 3IOTA 3SEYA 3OEMA 1NKXA 2F7AA 2QS2A 4TOZA 2A5SA 1Y1MA 4THIA 1NMUA 4QHQA 4GD5A 2PT2A 1DTZA 2Q2AA 4ZZAA 1IXGA 3B7DA 4OZ9A 1JVYA 1MY3A 2H9BA 1B3LA 1A99A 3P7IA 2F6GA 3KGCA 3TCHA 3ILTB 4NE4A 1B52A 3CFXA 4KPTA 2XD3A 2XD2A 5H8QB 5I58B 4E0WA 3HCQA 3FZVA 4BDRA 1CE2A 3JV9A 1MQHA 1BKAA 4IGRA 3IB1A 4HCWA 4XKRA 4QSCA 3C34A 3UN6A 3O9PA 1M5DA 4OETA 3C31A 1P1QA 2OBGA 3ILUB 2THIA 3E9XA 3FVOA 3T9HB 4NEDA 2O51A 1US5A 3MJNA 1MH4A 1TWYA 5AA4B 3DP6A 4QFLA 5B7DA 1UTBA 4KR5A 2F8DA 2A5TB 1L5TA 1EZOA 4C1TA 4JBZA 4F3GA 3MZ1A 3EPEA 3I6VA 2VHAA 3U94A 4DCXA 3ZS6A 3QSLA 4POXA 3QIMA 1PEBA 2OCUA 5H8FB 3KJTA 4FATA 3C33A 1UTHA 4QF9A 3RTWB 2HZKA 3HV1A 3TQLA 1F9BA 3SERA 4LONB 1GTKA 3IOWA 1WDNA 4FJPA 3KZGA 2DWHA 3G7WA 2XXXA 1A7LA 2V93A 3RLFE 3U93A 4GVOA 4FE8A 1IUDA 5DVIA 4WKMA 3O97A 3BFTA 4KHZE 5FTIA 1HSEA 1ANFA 4M1VA 1IXHA 2OZZA 1RKMA 3CI8A 5I2KA 5K2XA 3N26A 3N94A 1MPBA 4HTGA 2QMXA 2UVGA 3K2DA 3RTFB 3PPRA 2O1LA 4JB7A 2FYIA 1FQBA 3V8XB 4IO6A 4OXVA 3TCFA 3PUZE 4KD5A 2RC9A 1M5FA 4ZS9A 2NVUB 5CMKA 1NFTA 4FORA 3BFUA 3IJXB 4OFLA 3RT6B 2DE4A 2X7QA 1N04A 4IO5A 3FGSA 1JEUA 4O3CA 4ELPA 3TKDA 4E0XA 4KI0E 3FVGA 4EXKA 1O63A 1MPDA 4OFOA 1NH7A 1OLCA 3IO4A 4F29A 4I62A 3MP8A 4GXAA 3A3CA 1LFIA 4YZZA 5IKBA 2GRVA 3RNNA 2RCAA 3TEPA 1MQDA 4EF2A 4PFTA 5F1QA 5H8HA 5I2NB 2VP1A 1B7HA 3QUFA 4OEVA 3TODA 3GLBA 2WKYA 1N7XA 3TYHA 5AA2A 1B40A 2O6AA 1Z7NE 2H98A 2I4BA 2Z23A 1RYOA 3DP8A 5ICTA 3MVYA 3MC2A 5CBRA 3H3GA 2OWTA 1SD3A 1VFDA 4XTCQ 5EHMA 3KOTA 1MXVA 3K1PA 3SESA 5L9SA 2NOOA 1MXZA 1MXXA 1B3FA 2ONSA 3FJ7A 4I9DA 4LQ5A 4LATA 4YMBA 4LQ2A 1XHYA 1B7ZA 1I69A 3N6UA 3C9HA 1QULA 4QSEA 4F2QA 1N76A 2HEUA 1B7UA 3SETA 4ZEIA 2QS3A 2DS9A 3BBRA 3LSLA 2XX8A 2Y7IA 1B3HA 1P1NA 3IOUA 2UVIA 3OEKA 3DELB 4R2BA 4FECA 5M2VA 2ABHA 1PBPA 3U8QA 4G68A 4H1XA 1A55A 1VE4A 1UTBB 3FXUA 3FASA 2D21A 3UA8A 3B6WA 3OMBA 3CG3A 1LGBC 4XIGQ 5A5XA 5CC2A 1USYE 3K6XA 3UP9A 4RK9A 4R2FA 3OO8A 4WEPA 2Z8FA 4NF4B 3USDA 2F5XA 3VLUA 2GFEA 1LAXA 2AL5A 3RT8A 2R71A 3PGFA 3D4CA 1ZBMA 1SYIA 1LAFE 1FQDA 3UK4A 4OVJA 2I58A 2V3QA 3RPWA 3GBBA 1D9VA 2CZLA 5KCJB 1AMFA 4OTEA 4YB7A 3LBSA 2PT1A 1ATGA 4F3PA 5AE4A 2NUVA 2ZXTA 2F36A 1LB9A 4ZDMA 2NWJA 4FEDA 1IZ1A 5L8DA 3CFLA 2F78A 4RY1A 3K6WA 2P1SA 2DWJA 1JW1A 3CRBA 2I6EA 2F97A 2VD3A 1B46A 4MH5A 2PX1A 4GL0A 4QFOA 4PP0A 3N6TA 5I2KB 5CBSA 1SDXA 1SYHA 1H76A 2Y7RA 1TT1A 4OERA 3T9XB 3EHUA 4LZ8A 3MP6A 4U23A 3S4UA 4ONYA 1GV8A 4HW8A 3BKIB 5ISUA 3MZ9A 4UACA 1FQEA 2Z8EA 1B5HA 4BDNA 3PUXE 2XHDA 4GRKA 1H45A 3T93B 2ZNSA 3HN0A 1DOTA 2H25A 1VR5A 4NF6B 1P1WA 3OSRA 4NWDA 4F2OA 4QFKA 2RCBA 1DMBA 3M3FA 4NMYA 2PVUA 1Y20A 1LCFA 3PU5A 4ELOA 3SDFA 3IK6B 1H44A 4ECFA 1RYXA 5JTYA 3G3FA 4ELRA 1FQCA 4R74A 5IAIA 4MBPA 1XOCA 3TFLA 1DPPA 2HAVA 1OMPA 4FAJA 1D4NA 5HM4B 3HHFA 3S9LC 2XXWA 4TLMB 5H8HB 4GL8A 1B1HA 3TTLA 2QMWA 5LOMA 3THIA 3PPPA 5DTBA 4H5FA 3VV5A 4LZ5A 5CMBA 2ANJA 4P0IA 3LUYA 3QAXA 4F1UA 3UIFA 3VLWA 3IL1B 2I3VA 3S9EA 4QFPA 3ZKLA 4P11A 2OWSA 3ECRA 3LC8A 1LB8A 3QXMA 4DDDA 3EN3A 1P99A 1JETA 2Y7KA 3ODBA 3MPKA 4G77A 4EQ9A 2VOZA 4LVQA 4R6KA 4BDQA 3H06B 3H6VA 1R1NA 3RQTA 4Q30B 1N0TA 1B58A 2Z8DA 4X1DA 5DT6A 3PUWE 5L9OA 4U2RA 4EQ7A 4DXBA 4KQPA 2XXPA 1MDP1 1I6AA 5TU0A 3IOVA 1SW2A 4HS7A 3EHSA 4RNSA 3MWBA 3LSXA 3PMWA 1S7YA 3IJOB 4O3AA 4FIMA 3TQWA 1QUKA 2HAUA 3L6HA 2UVJA 4F31B 2Y7WA 1ZTYA 1QUJA 3KSXA 5HPQA 3RUMA 3FUZA 3PD9A 2GHAA 4G68B 4ZE8A 1B4ZA 3Q28A 4F22A 3A3UA 3OOAA 3TCGA 1ZLQA 3LSFB 3O6GA 5A5XB 1JEVA 1O64A 4IO7A 1H3DA 2CMOA 2W7YA 4ND9A 4I8CA 4F1YA 4RA1A 5TP9A 1DPEA 4BDMA 1NNTA 4BDOA 4R72A 3C36A 3M3KA 4X48A 4LZ7A 3Q29A 4OFJA 2O1MA 1GR2A 4F1VA 5FHNA 4PFYA 4U1ZA 1A8EA 5FHOA 3GBAA 1N84A 3K00A 4JSDA 4DE8A 3E3KA 1A8FA 3KG2A 2B65A 2DYXA 4EUOA 4ZEKA 1MM6A 4RYAA 2Q89A 2DWAA 1WVJA 5AA3A 4NF8A 1Y4CA 3EF7A 1B3EA 4GLIA 4TLLB 1QJMA 3R7XA 2F34A 4IO4A 4NF5B 4BDLA 1ZJLA 2YLNA 2GH9A 1M5CA 2I49A 1XT8A 3MVWA 3OSQA 4R6HA 5KDTA 4H8IA 1MM7A 3LSWA 3U1OA 3UGWA 4OMBA 2Q8JA 2RINA 3KN7A 2F6PA 5ITPA 2B3BA 5BUUA 4G8NA 4AB5A 2AIXA 1OVTA 4H6DA 5JEIA 3UORA 3WAEA 4U4XA 4H8JA 3PV0E 4R6YA 1FTKA 5F7VA 4F3BA 5TPAA 1LFHA 2I0CA 4RXLA 4DIGA 3JZJA 1MXUA 4KYSA 1MXYA 2HXWA 4H67A 2ZYOA 1B1XA 5BWJA 4XKQA 4F39A 5L9MA 2XXUA 4YKIA 2XXYA 1AL3A 3FJGA 3FXQA 1POY1 2DVZA 3CIJA 1LAGE 2XX7A 2RC8A 4F18A 1A54A 5ICQA 4KYDA 4R9FA 1QUIA 4OHNA 1M5BA 3DLNA 2D5WA 1Y1ZA 3JYRA 3V89B 4K3FA 3O66A 3VFJA 5H8NA 3K02A 5EHSA 4RJZA 3KFMA 4G68C 3LR1A 1R9QA 5B70A 4PFUA 3T9UA 1NNKA 3EHTA 1EZ9A 4QFNA 1PBQA 3IB2A 3PPQA 1NH8A 2P2AA 3V5AA 3M3LA 1LCTA 3GZGA 2ZYKA 2QRYA 3MPLA 2O68A 3MBPA 1I6BA 1DSNA 2V25A 2HFBA 2XX9A 1UIUA 1PDAA 1BTJA 2REJA 3FXRA 1PB8A 1QKBA 3FATA 2FNCA 3H6UA 4MLQA 3VXBA 3A09A 1B51A 3PUVE 1UQWA 4AB6A 1YPNA 2XXHA 3G3JA 1UTHB 1B0LA 1SQYA 3PUYE 1B3GA 4R75A 1FTMA 3FVNA 5DYHA 1Z7ME 3Q27A 5CI5A 4Z0IA 5TP9B 1BLFA 1IXCA 2YPNA 3TUSA 5FHMA 2DOJA 5FTHA 2V84A 4YKJA 4U22A 1KWHA 4OENA 4DCYA 2HZLA 2E0SA 4POWA 1IITA 4P0GA 4H5GA 3B6TA 4GOTA 3G3KA 1MS7A 2ONKE 2G29A 1IQ7A 3TTMA 1NNPA 3VDFA 1VSOA 1SI0A 1BP5A 1B05A 1LBCA 1A40A 3SEWA 3O28A 5CRYA 2XXVA 5JK4A 3W9VA 3OELA 4ELQA 2KLFA 4TQUQ 3K6VA 1MY2A 1AH5A 2V3UA 2R6GE 4BLAA 1GVCA 3O6IA 2O7IA 2V3TA 3S2VA 3F11A 4XKNA 4R73A 4X9TA 1OIBA 1SW4A 3HPIA 3SEVA 2DVCA 2IA4A 2RF1A 3SEUA 3MP1A 1OVBA 1IEJA 1B5IA 5I57A 3VXCA 1B32A 2R9JA 4LP2B 3VLVA 3B6QA 1OQGA 4HCYA 3H7MA 2QPQA 3C4MA 2DE3A 1MH3A 4C1UA 2ESNA 4Q8RA 1JW5A 3ZKKA 4YKPA 3FD3A 4GF8A 2D3IA 3TELA 3K01A 4IO3A 2OJTA 2VD2A 4PETA 1R6ZA 3E13X 2H5YA 3RY3A 5TPAB 2X7PA 4YKKA 5J1DA 3PD8A 4F19A 4YB6A 5AA2B 1PB9A 4I1DA 1S50A 3IX1A 3T96B 4EF1A 1MPCA 4H65A 3L6GA 1YAEA 2LAOA 3KJ7A 3R6UA 3W15C 2ONRA 1TFDA 3K4UA 3CFZA 4F3SA 3W9WA 2UYFA 3H6WA 2AL4A 4ZEBA 2Q9TA 4OEUA 1J1NA 3OO7A 4DXCA 1UIVA 1MY4A 3CSGA 5I59A 1QW0A 3MZBA 1TFAA 2PMSA 1IIWA 3HHGA 2YJPA 2ZYMA 2O84X 3T9VA 3ZSFA 2QS1A 4YMAA 5H8NB 1P1OA 4MFIA 3D4GA 1OQHA 3CR9A 1Y3QA 1USYH 2VGQA 1I6QA 2I3WA 1II5A 3KSJA 3IORA 2DQVA 3TMGA 2ZYNA 2M8CA 5DEXA 4M4GA 1Q1KA 4KYEA 3TZAA 3G3HA 1FTJA 5DVJA 3HSTA 2DXRA 3H4ZA 5I84A 1P1UA 3S9NC 5AA2D 4PE5B 4ZZEA 4NF4A 4U1OA 1SI1A 2BJJX 3OO9A 4R9GA 1URSA 3VVDA 4GFRA 1MQJA 3WAFA 2RKMA 4O3BA 2F7CA 5KCJA 2GHBA 3FJMA 5KZTA 3O6HA 2O7UA 1NNFA 2QSXA 5CMMA 4WXJA 1XVXA 2ZNTA 3TAJA 1OLAA 4OESA 2Q2CA 2B3FA 2NXOA 3T22A 1Y9UA 4NWCA 3VVEA 1B0HA 3VE1B 4QSDA 1CB6A 1Y4TA 4H0WA 3E4RA 2DP8A 1O7TA 1VFEA 5CMCA 3PMVA 5ELVA 1XC1A 3G3IA 2E1SA 1AIVA 1FQAA 2QL3A 2XXIA 3MVZA 3TTNA 4G4PA 1Q35A 4ESWA 1MY1A 1XVYA 3KN8A 4LUBA 1AOVA 4IB2A 2QS4A 4YAHX 1EZPA 4ZEDA 3ONMA 2DXYA 1URDA 1PC3A 4AQ4A 3TTRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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