3LR1A

The crystal structure of the tungstate abc transporter from geobacter sulfurreducens
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
235
structure length
232
Chain Sequence
NAEERLKMSTTTSTQDSGLLKVLLPPFEKKNNVKVDVIAVGTGQALKLGEAGDVDVVFVHARKLEDKFVADGFGVNRKDVMYNDFVIVGPKNDPAGIAKAKTAAEALKLLATKGATFISRGDKSGTHTKELDLWKSAGVDPKGNWYVEAGQGMGPVITMATERRAYTLTDRGTYNAFKGAKTDLVILFQGLFNPYGIMAVNPKKFPHVKYDLAMKLIDYVTGPEGLKIISDY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The crystal structure of the tungstate ABC transporter from Geobacter sulfurreducens
rcsb
molecule keywords Tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding pro
source organism Geobacter sulfurreducens
molecule tags Transport protein
total genus 65
structure length 232
sequence length 235
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lr1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lr1A02
3KSJA 3SEXA 4DLDA 1B1XA 4U23A 3KJTA 3U1OA 4E0WA 3VFJA 1USYH 1P99A 3L6HA 2P0SA 3CFLA 4QFNA 2DOJA 2I48A 3K1MA 4OFJA 1SBPA 1MY3A 2XXYA 1B7UA 1EZOA 3IO6A 1QKBA 5AA2A 3T9XB 1F9BA 2YPNA 2O51A 1B51A 3U93A 4YU0A 3KOSA 4H6DA 1UIVA 1UTHB 1SW4A 1SI0A 3RNNA 2ZNTA 3PD9A 1I6AA 4YZZA 4F31B 3VE1B 1T0KA 4MBPA 1N84A 3FASA 2PBWA 3PMXA 4QRZA 4GFRA 3UA8A 2Q2AA 3UORA 5I2NA 1SD3A 3MVWA 4MLVA 1LBBA 2ZYMA 3TUSA 4GXSB 1ZTYA 3Q29A 4ELRA 4H5FA 3EHUA 3OD7A 4OMBA 4BDOA 1UTHA 4DXBA 1DTGA 3UGWA 4NF6B 3ODBA 3QSLA 3PPOA 1IUDA 3EF7A 2VD3A 5HM4B 1MQJA 4MLQA 3B6WA 4ZZEA 3A09A 3GBBA 3TCGA 5L9MA 1EZPA 4ELPA 2E0SA 4WEDA 4JXIA 4ESWA 4NMYA 4GL0A 1RYXA 3ZKLA 1JETA 4YB6A 1FQAA 5EYFA 3WAFA 2Q2CA 2RC8A 2OLBA 3PUWE 3G3FA 3KGCA 3IJXB 3FJMA 3G7WA 2Y7RA 4KFQA 5CMCA 3CIJA 2DWHA 3PMWA 1GV8A 2F6GA 1MDP1 4F18A 4EDPA 3T9UA 5FHOA 4YICA 2VD2A 1SDXA 4H8IA 1ZBMA 3N26A 3V83A 2ZMBA 4X9TA 2X7QA 4IO7A 3MBPA 3IOVA 3K1PA 1IQ7A 1DMBA 2I0BA 2ZYKA 1A8EA 1H43A 2O68A 4I9DA 4R74A 2UYEA 4LQ5A 4YKKA 1MM6A 5ELVA 1H3DA 2RINA 3JZJA 2XD2A 1NH7A 4E0XA 5CBRA 3SEYA 1HSJA 2DE4A 4OZ9A 4R2FA 1M5FA 2F8DA 2DS9A 1QW0A 1B3EA 4ZZAA 1Q1KA 2GH9A 1P1NA 4G77A 5F7VA 1B6HA 4H8JA 1SYHA 2DVZA 4IO2A 3S9MC 4LVQA 4C1TA 1Y9UA 4F3PA 5J1DA 5I2KB 1FW0A 4LZ8A 1DSNA 4FATA 3CFXA 1OLAA 2NVUB 2ONKE 1GVCA 1AIVA 4NF4B 4RK9A 2YLNA 2I4BA 3W9WA 2O7IA 2ZXTA 1P1QA 1LCFA 2Y7IA 4FJPA 1JW5A 2AL4A 2Z8FA 2Y84A 4OFLA 1FTOA 4ZEIA 4F39A 3TCHA 3GLBA 3JYRA 1ZMGA 2XXRA 1B3HA 2I4CA 3MPKA 4OENA 3SEUA 1XC1A 3CSBA 5DTBA 2QSXA 1MM7A 4ZDMA 3K6WA 2DSFA 4QFLA 1Y3NA 4TLLB 4R6HA 2O6AA 2QRYA 2DWAA 1MH3A 3VLUA 3G3JA 3PPRA 3A3CA 3CR9A 5CI5A 3TTRA 3K4UA 4F3GA 4RA1A 4RPOA 4KCCA 5TP9B 3SKPA 4R73A 3H03A 3P7IA 4Q8RA 3QIMA 3O9PA 4FAJA 5ITOA 4F22A 4OEVA 4IGRA 4GOTA 4R75A 4GD5A 5I84A 3TELA 2A5TA 3IO4A 4PFYA 4ISUA 3KZGA 1FQEA 1B3FA 4YB7A 3CG1A 1I69A 4WKMA 3TTNA 2ANJA 4GF8A 4HS7A 5KDTA 4G68B 3RLFE 4ZS9A 1VSOA 2A5SA 4PFWA 3T9VA 2Y7PA 3FVGA 1POY1 2F35A 3UIFA 1L5TA 3M3KA 1H76A 3KSXA 4GVOA 3H6WA 4YKPA 4OESA 2Q8JA 5IAIA 3O6IA 4IY6A 3MVXA 1KWHA 2D3IA 3K2DA 1SW5A 3FUZA 2QS4A 1MPBA 5L8DA 1LCTA 3TTMA 4Z0IA 3I5OA 3CG3A 2UVHA 3USDA 3G3KA 1QUKA 4BDNA 1IZ1A 1UQWA 4L17A 4DE8A 1USYE 2H99A 1URGA 1D3KA 2I3VA 2BJJX 4QSCA 2XXHA 3GZGA 4G68A 3TYHA 1O64A 2H98A 1GR2A 3FZVA 4QHQA 3SETA 5FHNA 3VXBA 3O97A 4P11A 5B70A 3LSXA 3VLWA 3FJ7A 4JWOA 2UXAA 1AOVA 5DYHA 3TTKA 4OTEA 4G8MA 2V93A 1N7WA 1MY1A 4YKJA 5BUUA 1P1WA 2Y7WA 3TAJA 1B3GA 3I6VA 2HAUA 3QYTA 1MPCA 3DP8A 3N94A 5H8QB 2R9JA 1EU8A 4XKQA 4LUBA 4BDRA 4ELQA 5H8HB 4R6KA 3SDFA 1B0LA 1B5IA 4G8NA 4M1VA 3OXNA 3UK4A 3C9HA 3TQLA 4R9FA 3PUZE 1D9VA 1N3XA 4O3CA 3EQ1A 2E1SA 4EQ9A 1JEUA 1IEJA 2KLFA 3PPNA 2F97A 1OQGA 2F7AA 5AA4B 3H4ZA 3MQ9A 5AA2B 3OENA 3WAEA 4H65A 1B58A 4ESXA 2ONRA 2I49A 1DPPA 3RN8A 5H8QA 2DWJA 3S9EA 3RGYA 1MXYA 3Q28A 5H8HA 1OVTA 4YMBA 4KCDA 1LFIA 4F2OA 3VVFA 3G3IA 1QUIA 3JV9A 2VP1A 4IO3A 3OSRA 2R71A 3IAZA 4HW8A 2ZYNA 5I2NB 3O29A 1LAHE 5AA4A 3OO6A 4C0RA 3K6XA 4N07A 4R2BA 4NEDA 2H4IA 2HZKA 4XKRA 2M8CA 4AQ4A 1B52A 5EHSA 4F1UA 5CM6A 3IR1A 1FTMA 4U1ZA 2Z8EA 1Y3QA 2B3BA 4FORA 1NKXA 4H1XA 4G4PA 3MUQA 1RKMA 3RT6B 5EHMA 4NE4A 3OEKA 2DYXA 4TOZA 2GRVA 3QUFA 1LLSA 1B3LA 4Q0CA 4YB5A 1NFTA 3TCFA 2H5YA 4KD5A 4YMAA 4KYDA 1XS5A 1QVSA 3H6VA 3BKIB 3C35A 1FTLA 2OBGA 1OQHA 2AYSA 1D4NA 1JEVA 3O6GA 1ZJLA 3GXAA 4NWCA 2XHDA 3MJNA 4DCXA 1US5A 4P0GA 2DWIA 4JWYA 4X48A 2G29A 1A55A 3Q26A 3FD3A 1OIBA 4IB2A 1B46A 2XXTA 3TPAA 1IITA 3FIRA 2I0CA 4OWDA 2H9BA 1Y3PA 3B6TA 5KCJA 1LFGA 4POWA 4DCYA 4H67A 4GL8A 3A3UA 3TFLA 4OEUA 1MXXA 2REJA 2I6EA 2DQVA 1ELJA 2XXIA 4M4GA 1N0TA 2REGA 4OETA 1IXHA 1UTBA 1Z7NE 2QMXA 4FECA 4KPTA 2X7PA 3E4RA 3FXUA 1LB9A 3SEVA 1JW4A 1TT1A 5FHMA 3TDJA 4RPNA 2VGQA 1DPEA 3VVDA 2ABHA 5CMBA 3LR1A 2RC9A 1PBQA 2O1LA 3CSGA 1Y20A 1LAXA 1WVJA 1Y1ZA 1EZ9A 2F34A 1TWYA 2GHBA 3HO7A 1A8FA 1O7TA 1B5JA 3Q25A 3BFUA 3H3GA 1LFHA 3CI8A 2OCUA 2ZNUA 2CZLA 3TMGA 4F29A 4KYEA 2FA7A 3HV1A 1JNFA 1M5DA 2RCBA 1FCKA 1XVYA 4GIZA 1NNPA 1MXZA 4U2RA 4HCWA 4JB7A 2IA4A 1B4ZA 1IIWA 4RK2A 4QF9A 1P1UA 1N04A 3IJOB 2RF1A 1QUJA 4O3BA 4PFTA 4Z7EA 1JW1A 4Q5TA 2PVUA 4X1BA 3MPLA 3H7MA 3HPIA 1PDAA 4U4SA 3F11A 3RUMA 1IXIA 2I3WA 1R1NA 2A5TB 3RY3A 3EHTA 4EXLA 1AMFA 4NF5A 2OZZA 1FQFA 1LAFE 3CFZA 1MQDA 3IB2A 2XXVA 4QFKA 5KDTB 1WODA 3K01A 4IO4A 1TFDA 5ITPA 3U92A 1QJMA 4QFPA 3S9LC 4RNSA 3ZKKA 1BIYA 2O84X 4EF1A 3IOWA 3TQWA 3VDFA 1H45A 2F78A 3VXCA 2HCAA 4DXUA 1EH3A 2HQ0A 3M3FA 4PE5B 2VHAA 1CE2A 2H25A 1FQDA 1NH8A 4NWDA 3U8QA 3O28A 3E13X 3UP9A 3K00A 5TPAA 3MAMA 1PB9A 4P0IA 1O63A 2XX8A 4NF8A 2PT1A 1GTKA 1PEBA 1SYIA 5I57A 4DXCA 1ZLQA 4QSEA 3IORA 3N6UA 5JK4A 1RYOA 3MC2A 3MW0A 2Z22A 5I56B 3OO9A 2B65A 2LAOA 4XKNA 2XXWA 1I6BA 2P1SA 4EUOA 4F2QA 4YAHX 2RC7A 3R7XA 1II5A 2X26A 1QULA 3D4CA 3O66A 3HN0A 2PT2A 3V89B 4HTGA 3R26A 4I1DA 1M5CA 2IEEA 4QSDA 3C33A 5AA3A 1OLCA 1MG1A 1ANFA 3FVKA 2AL5A 2QL3A 3TODA 1PBPA 3KN7A 3U72A 4F3SA 5JEIA 1MXVA 2PYYA 5I56A 1PB8A 3TKDA 3Q27A 1AL3A 3TEPA 1LBCA 3D4GA 1VR5A 1TFAA 3ILTB 3BFTA 3LSWA 5I59B 1POTA 2R6GE 3DM0A 4LQ2A 1M5EA 3QAXA 2V3QA 4XKPA 3T93B 2HXWA 3MZBA 4THIA 3IL1B 4LA9A 2RKMA 1OVBA 3CRBA 2NOOA 1MS7A 5B7DA 1A7LA 3K02A 4JSDA 3OEMA 3O2AA 2G93A 2O1MA 3EPEA 1LAGE 2F36A 3S9NC 5I59A 5CRYA 4HCYA 3W15C 3QK6A 1D9YA 1N76A 5AE4A 4R6YA 1LSTA 4PFUA 1S9TA 1IXCA 1MQIA 1Y1MA 4F1YA 5I58A 1M5BA 3OELA 1MQHA 5ICQA 2QS1A 5DVFA 1TXFA 3HHGA 3SERA 1MQGA 5FTHA 4DDDA 1DOTA 4OVJA 5BWJA 1B7ZA 2FYIA 4XIGQ 1XOCA 4LONB 5H8FB 4LZ7A 2QPQA 4BLAA 1B40A 2F6PA 3THIA 1B1HA 3MP1A 3MP8A 4AB6A 1FQBA 1LB8A 1MXWA 4ZEDA 5H8NB 1Z7ME 3IX1A 2DE2A 3DP6A 5L9OA 2ESNA 4OQOA 5DEXA 2QS3A 4JBZA 5IKBA 4XXUA 2CMOA 1UIUA 2GFEA 2ZNSA 2UYFA 3K6VA 4F19A 4TLMB 5M2VA 4ECFA 3LBSA 3RQTA 4RY1A 5CBSA 5H8FA 1B0HA 5K2YA 3ILUB 4GWOA 2V3UA 1URSA 1S7YA 2XXXA 4XTCQ 2XXQA 1QKAA 5H8NA 1ZKBA 1B9JA 4ZEBA 4ZE9A 2F7BA 4FEBA 1SQYA 3T66A 3HSTA 5KCJB 3FVOA 5ICTA 2UVJA 1SW1A 3KFMA 2THIA 3FJGA 5K2XA 3EHSA 2ALUA 1B4HA 5DVJA 3IK6B 3O6HA 1MY0A 2F7CA 5AA2D 3H6TA 3PPQA 4IO5A 3N6TA 1R9LA 1J1NA 1UTBB 2VOZA 5ISUA 3TTLA 3OMBA 4K3FA 2DXYA 4U22A 2DVCA 1PC3A 3I3VA 5DT6A 1B5HA 4RXLA 4UA8A 4KQPA 1MY2A 5FTIA 3ECRA 2RCAA 1GGGA 4AB5A 3MZ1A 2XD3A 1S50A 4O3AA 3KOTA 2UVIA 4UACA 3IB0A 3LUYA 3PV0E 1PB7A 4LP2B 3E9XA 3ZSFA 2YJPA 1R6ZA 4NF6A 1I6QA 2NXOA 3M3LA 2XXUA 3CVGA 4KYSA 4ZE8A 3UN6A 5KZTA 3PD8A 3U94A 3RTWB 3FGSA 4JWXA 1MY4A 3T22A 1A99A 3KJ7A 4X1DA 5H8SA 3K1NA 2I58A 4RJZA 1JQFA 3C34A 1BKAA 1B32A 3K0VA 2V3TA 3TZAA 4U1OA 3E3KA 4WEPA 3PU5A 5A5XB 4GXAA 3PUVE 4R9GA 4KI0E 2QJEA 4EXKA 1P1OA 4I8CA 3C4MA 4POXA 3S4UA 3HCQA 1YTVA 1YPNA 1ATGA 3FVNA 4DIGA 3LSFB 2DXRA 4OERA 1AH5A 4ND9A 2DP8A 2O7UA 2V25A 2WKYA 3DP4A 3BBRA 4GLIA 3LC8A 3H06B 4NF5B 1FTJA 2Q88A 3K6UA 1XHYA 5A5XA 1BLFA 1IXGA 3OO7A 4PP0A 1A54A 5HBCA 3FATA 3MVYA 2GHAA 3PUYE 4JDFA 4EQBA 3KN8A 5JTYB 2OWTA 2D5WA 3MP6A 4DZ1A 1H44A 3FV1A 3B6QA 3VLVA 3PMVA 3T9HB 1BTJA 3IOTA 3C36A 1JVYA 1R9QA 2Q9TA 5CMMA 1NNKA 3G3HA 4R72A 4LATA 2V84A 3AXFA 2ONSA 2XX7A 5I2KA 3R6UA 5TPAB 3H6UA 4NF8B 4F3BA 4FIMA 4GRKA 4IO6A 5I57B 3VVEA 4JSOA 3PGFA 4Q30B 4ZECA 4OYVA 1FTKA 4F1VA 2UVGA 1B2HA 1HSEA 4NF4A 1VE4A 3B7DA 2HZLA 5JTYA 2Q89A 2AIXA 3DELB 2B3FA 2OK2A 4ZEKA 4RYAA 1VFEA 3MZ9A 5HPQA 3FV2A 1OMPA 5AA1A 4IGTA 1US4A 1XT8A 4YKIA 1LGBC 2W7YA 4MFIA 3RTFB 3QUJA 5TU0A 1CB6A 1Y4CA 3RPWA 4QFOA 4OFOA 4IY5A 4U4XA 3PPPA 2Z23A 4G68C 1FQCA 3M8UA 4G8HA 4ELOA 3IOUA 1SI1A 4EF2A 3KBRA 5LOMA 1Q35A 3C32A 1SVXB 5TP9A 3W9VA 1NNTA 4OHNA 2Y7KA 1JVXA 3KG2A 3SESA 4FE8A 3V8XB 5CMKA 1DTZA 3OOAA 3ONMA 2HEUA 1XVXA 3N5LA 2XXPA 2D21A 3G3GA 2OWSA 1MXUA 3L6GA 1MPDA 1ZU0A 3GBAA 4MH5A 2F5XA 4GQOA 4WXJA 1NNFA 4NTLA 3V5AA 4PETA 4KR5A 4H5GA 3LSLA 1MDQA 4N6PA 1NL5A 4MF3A 3OSQA 4PQJA 4C1UA 2O69A 4I62A 2OJTA 3HHFA 1A40A 2P2AA 1YAEA 4LZ5A 4FEDA 1VFDA 5DVIA 1MH4A 2PMSA 4BDQA 3IB1A 5I58B 1YCJA 4U21A 2ZYOA 1Y4TA 2DE3A 3KEIA 1NMUA 4KHZE 1MRPA 4OXVA 4BDLA 3SEWA 4TQUQ 3DLNA 4ONYA 4H0WA 3C31A 1HSLA 3T96B 5CC2A 4ZEFA 2NWJA 3FXQA 1WDNA 3ZS6A 1SW2A 2HFBA 5L9SA 3FXRA 2FNCA 3RT8A 3PUXE 2XX9A 3EN3A 3OO8A 3KN3A 4EQ7A 3MWBA 2PX1A 1URDA 3MVZA 4BDMA 1BP5A 3S2VA 1B7HA 3VV5A 5DEXB 1B05A 2QMWA 2Z8DA 2QS2A 1ZIUA 3QXMA 1N3WA 4G2ZA 2HAVA 4N13A 5F1QA 1N7XA 2NUVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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