3LSFB

Piracetam bound to the ligand binding domain of glua2
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Piracetam Defines a New Binding Site for Allosteric Modulators of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole-propionic Acid (AMPA) Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lsfB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lsfB02
2F78A 3CG1A 2CMOA 4ZEFA 5I56B 3GLBA 1D9VA 4UACA 1FQEA 4LQ2A 5B70A 2XD2A 1FCKA 4IO4A 4OVJA 4ZEBA 3U8QA 2UVHA 4MLQA 5DYHA 3V5AA 2WKYA 5JK4A 3LSFB 4P0IA 4R6YA 3UIFA 1FTMA 2X26A 4HW8A 1IXHA 5ISUA 3H03A 3PV0E 1MPBA 5AA2B 5ICQA 3CR9A 1LB9A 3H06B 2QL3A 1PDAA 2O1LA 5CBRA 1LBCA 3WAFA 3C35A 1OQHA 1XVXA 2XXUA 4KPTA 4PFTA 4OFLA 4FEBA 4YB7A 3HHGA 4OEVA 4E0XA 4G77A 4RYAA 2XXHA 1FQBA 1IXCA 4LZ8A 1HSEA 3T9VA 3HPIA 1GGGA 3PUVE 3SESA 2QS2A 4EUOA 3IJXB 5I57A 1Y9UA 1SW2A 3TTRA 2VD3A 4RPNA 3SEXA 3QXMA 3ILUB 2GHAA 1IITA 2VOZA 2B65A 4U23A 4ELOA 2QRYA 4PP0A 1S7YA 3K6UA 1GVCA 4ZZAA 1N7WA 4LP2B 3C34A 3PPPA 4NMYA 3KEIA 1B1XA 2DXRA 2ONRA 5EHMA 2AIXA 3G3GA 2UVJA 5CBSA 1AMFA 2G29A 3IOVA 5KDTA 4KQPA 4NF4A 1DOTA 2NVUB 2HZKA 4YMAA 5DVJA 4OHNA 5CI5A 3IK6B 1FTLA 3VLVA 3CSGA 1BP5A 1R1NA 2I48A 4U21A 1B7UA 1JW5A 3T9HB 2I0BA 3T22A 4U1OA 4GL0A 3UA8A 2B3BA 4IO6A 1PC3A 2X7QA 1PEBA 3N6TA 5ELVA 1WVJA 5KCJB 4G68A 3FIRA 5I59A 1T0KA 1JVXA 2GFEA 3ILTB 1VFDA 1ZKBA 1GR2A 1FTJA 2F97A 4YICA 2DYXA 3KN8A 3I6VA 2VD2A 1B52A 3PPRA 2PYYA 5CMMA 4TQUQ 1NKXA 5CMCA 4JDFA 2O68A 4XTCQ 2Z8DA 3GZGA 3M8UA 3TAJA 4YB6A 2GH9A 3PPNA 3THIA 1QJMA 4IGRA 2Y7PA 3PU5A 4F31B 4F3SA 3F11A 4HS7A 1WODA 1A54A 1GTKA 4DXCA 2OBGA 4Q0CA 3TYHA 1URDA 4Q8RA 5F7VA 3RT6B 4KR5A 4ZE9A 1QKBA 2I49A 3LSXA 1M5FA 5H8QA 3HHFA 3JV9A 3RQTA 2VGQA 2YPNA 2BJJX 5BWJA 3CFXA 5AA4A 3K01A 4POWA 3KOTA 4XKRA 3O2AA 3KZGA 3CFLA 1P99A 2ALUA 3TELA 5DTBA 5CC2A 3L6GA 4ESXA 1IQ7A 2ZYMA 3RPWA 4U22A 1L5TA 3UN6A 1R9QA 1PB9A 1Y20A 3R26A 1D3KA 4H5FA 4R75A 2F7BA 1QKAA 3R7XA 4ELPA 4G8NA 4F39A 3EF7A 1B4HA 1B0HA 2Y7RA 3H4ZA 5H8HA 1D4NA 1B7HA 2F7CA 1MH4A 3PD8A 1SBPA 3HV1A 2XX8A 3TTMA 3G3HA 1MDQA 3IAZA 1A7LA 1YCJA 3KN3A 4R73A 3B7DA 2KLFA 2Q2CA 2OWSA 2ZXTA 4NTLA 3H6UA 3SEVA 2DSFA 4YZZA 4DDDA 3H7MA 2ZYOA 3W9WA 5I57B 1MY0A 1FW0A 3BFUA 1VSOA 3CFZA 3MZ1A 1R6ZA 2D5WA 4GWOA 4UA8A 5AA3A 3KJTA 3MC2A 2HQ0A 3EPEA 2FYIA 5K2XA 1YPNA 4PE5B 4ZEDA 1B3FA 3CSBA 2RF1A 4F29A 4C1UA 4ZEKA 3I3VA 3VVFA 2A5SA 1SW1A 4AB6A 1OQGA 4BLAA 3E3KA 1A40A 4M4GA 4EDPA 2A5TA 2V3QA 5CMKA 1FQAA 5KDTB 4NF4B 3OENA 2G93A 2F6PA 1MQDA 2ZNSA 1MY1A 4F2OA 3K0VA 1B2HA 3TZAA 1LAHE 1AIVA 1P1QA 3U93A 4PFYA 4JWOA 3TDJA 1TXFA 3MJNA 3I5OA 3K1NA 4DZ1A 4R72A 1WDNA 3Q29A 1CB6A 1XHYA 1MY2A 1UQWA 5CRYA 3WAEA 1OLAA 1BIYA 4G68B 1USYE 2R6GE 3K6WA 5I59B 1MQGA 4OFJA 2RC8A 2W7YA 3ZSFA 3VV5A 1MPCA 2QS3A 3OEKA 1UIUA 1BLFA 1XOCA 4F1UA 3LSWA 2I58A 2B3FA 3VLWA 3M3FA 2V93A 2UYFA 4JWYA 4F22A 3K6XA 2NWJA 2Y7IA 2Z8FA 5EHSA 1H44A 1MS7A 1LSTA 3RGYA 1B5HA 3S4UA 1B3GA 2RC7A 3H6WA 1UTBA 1Z7ME 3EHUA 3QAXA 3OSQA 2O69A 3PUXE 1XT8A 4OXVA 1VFEA 1NNKA 5FHNA 1B58A 3B6TA 3PPOA 4P11A 5I84A 1B32A 3G3JA 1PB7A 4L17A 4I9DA 5FHOA 2IEEA 3FXRA 5H8QB 4GLIA 4YKJA 3TQWA 4LQ5A 2DXYA 3UORA 2XX9A 1IXGA 1N0TA 2QMWA 5AA4B 4MFIA 2V25A 4IY6A 4OQOA 3FATA 3RT8A 3FVNA 2Q88A 1QULA 4LA9A 2Y7KA 3MVXA 5DT6A 2H4IA 3RLFE 2HEUA 3S9EA 2UXAA 3H6VA 4H8IA 1NFTA 2REGA 3MBPA 3RUMA 1D9YA 4H8JA 5FTHA 4NWDA 3LUYA 1JETA 2ZMBA 5H8HB 3E13X 3FJ7A 3TQLA 4IO2A 3W9VA 5IKBA 3K00A 1QUJA 3UP9A 4DLDA 4R74A 3LR1A 1DPEA 3EHSA 1O7TA 5L9MA 4X9TA 1SQYA 3KG2A 3DP6A 2DQVA 5BUUA 3K2DA 2YLNA 4YKIA 3S9LC 1POY1 1B5JA 1I6QA 1ZIUA 2O7UA 1LFHA 3K02A 1LAGE 4G8HA 2Y84A 3LSLA 3VDFA 4MLVA 4ONYA 2QS4A 4OEUA 1Y4CA 3U94A 5I58A 5L9SA 2HZLA 3IORA 4LATA 5TPAA 3CG3A 3OO7A 3V8XB 1LFGA 2I0CA 1LAFE 4O3BA 3FZVA 2ANJA 4ZEIA 3T9XB 3O6GA 3IOUA 4MH5A 1JQFA 4QSDA 5TP9A 5DVIA 3MWBA 1LBBA 4OTEA 4WEPA 1EU8A 3IOTA 2A5TB 2THIA 4YB5A 4JSDA 3C4MA 4QSEA 3LBSA 1ZMGA 4IY5A 4POXA 2XXVA 1DSNA 3C32A 3P7IA 2O84X 3HCQA 4P0GA 4X1BA 2M8CA 3OO6A 1VE4A 4ZECA 2ZNTA 3ONMA 1DMBA 4XIGQ 5DEXA 2X7PA 1B0LA 3VFJA 1QW0A 4PQJA 3SETA 1B05A 3SEYA 3A09A 3GXAA 1A99A 3VXBA 4RNSA 5L8DA 1P1OA 2H25A 3FD3A 4FECA 1N3WA 3KN7A 2Q9TA 4F3GA 5I2KA 4OERA 3U92A 3FJMA 1I69A 3K4UA 4KFQA 4LVQA 4IO3A 3KOSA 1ZLQA 3G7WA 2XXIA 1Y4TA 4R2BA 4F2QA 3TCHA 1A8FA 2PMSA 1OVBA 2IA4A 2XHDA 1FQDA 4PETA 2RC9A 3TEPA 4RPOA 1CE2A 1PBPA 4R2FA 1S9TA 1UTBB 1ELJA 5EYFA 2VHAA 1NL5A 1UTHA 5AA2D 4U2RA 4X1DA 1TT1A 2P0SA 1LCFA 3KGCA 1B6HA 4DXBA 3RN8A 4QF9A 1P1NA 1LAXA 3DP4A 3QUFA 3O28A 2AYSA 3T9UA 2PVUA 4TOZA 1B3LA 3KSJA 1NMUA 2OZZA 4FORA 4G68C 4U4SA 1Y3NA 3MP1A 4F3BA 4I62A 3FUZA 4QSCA 3O29A 3QIMA 3O97A 3TKDA 3UK4A 1QUIA 1MXYA 4LZ5A 4WEDA 2V84A 1MRPA 4N07A 2P2AA 1FQFA 2I4CA 3B6WA 4Q5TA 1URSA 4H0WA 1S50A 4BDLA 3MPKA 1MH3A 1DTGA 1B1HA 3OELA 2DWAA 2D21A 4O3CA 3IOWA 4FATA 2NOOA 3S9MC 4FE8A 5F1QA 1N04A 3VXCA 2ZYKA 3IJOB 4ZDMA 4FEDA 1M5EA 1P1UA 3G3IA 1SW5A 5I2NA 1SD3A 3FJGA 5CM6A 3DELB 2HFBA 1MXXA 3VVEA 2RCBA 3FVKA 1POTA 3BKIB 2F6GA 1KWHA 2ESNA 4XKNA 5I58B 2Z22A 2Q8JA 5TPAB 3FV2A 3OO8A 4OETA 1AOVA 3PD9A 4TLMB 3C33A 3HN0A 2DE3A 4DE8A 4GOTA 1R9LA 1SVXB 3R6UA 4GVOA 4RJZA 1RKMA 5TP9B 2F36A 3E4RA 1MY3A 3IX1A 1H3DA 5DVFA 4ESWA 1FTOA 1I6AA 1MXUA 2H9BA 1LGBC 2OK2A 3DLNA 1VR5A 1PB8A 3QUJA 5DEXB 3IO4A 3MPLA 1Y1ZA 1H45A 4NF6A 4HTGA 4MBPA 3TODA 3CRBA 4TLLB 4F3PA 4RY1A 4NE4A 1A8EA 4U4XA 2UVIA 3VE1B 1O64A 2I6EA 1NH7A 1II5A 2QPQA 3SERA 5KZTA 1N84A 2R71A 1QUKA 3CI8A 4H65A 2OLBA 4OYVA 5I2KB 4OZ9A 3DP8A 3K1MA 3H3GA 5FTIA 1QVSA 3O9PA 3RTWB 3IB0A 5AA1A 4MF3A 2HCAA 3T66A 4X48A 1JVYA 1JNFA 4KYEA 4N6PA 4GXSB 4GFRA 3PUWE 1IUDA 3KBRA 3UGWA 3M3LA 3TPAA 1H76A 5IAIA 2DWIA 2FNCA 2Q2AA 1Q35A 4NWCA 5HPQA 1UTHB 2I4BA 4KYSA 5J1DA 3CVGA 1USYH 1TFAA 3CIJA 1SW4A 2RINA 1LCTA 2Y7WA 1XC1A 4RA1A 3TTKA 2PX1A 2DVCA 2XXTA 1YAEA 3O6IA 4IO5A 1NH8A 1EZOA 5HM4B 2XXQA 5HBCA 2V3TA 3C31A 3MVZA 4F1VA 3OOAA 3LC8A 4R9FA 2FA7A 5TU0A 1TWYA 3RTFB 4NF5A 3TTNA 1B46A 1MM7A 4OFOA 4WXJA 4N13A 4XKPA 1IEJA 4QFNA 4THIA 1Y1MA 2HAVA 5FHMA 1PBQA 3MZ9A 2H5YA 4K3FA 5L9OA 3KFMA 1F9BA 4NF8A 2ZNUA 1URGA 5ICTA 3MAMA 4I8CA 3MQ9A 1SI0A 4EXLA 3JYRA 1B51A 1JEVA 3MP6A 4GQOA 5B7DA 2O51A 1B40A 1SDXA 3A3UA 2I3WA 1MXVA 4ELRA 3TUSA 3M3KA 1UIVA 1MXWA 4Q30B 2ONKE 1FQCA 3FVOA 1NNTA 3C9HA 5I2NB 3U1OA 3TMGA 1B7ZA 1NNPA 4NEDA 1DPPA 4ZE8A 4AQ4A 3Q26A 2F5XA 2NUVA 1ZJLA 1AH5A 3OXNA 3RNNA 4HCWA 1M5DA 1B4ZA 1GV8A 1RYXA 4GL8A 1MG1A 1N76A 1LLSA 2CZLA 2OWTA 1EZPA 4DCYA 4ZS9A 4LZ7A 1ATGA 1LB8A 3KSXA 5JTYA 2XX7A 1FTKA 3A3CA 3MVWA 1ZTYA 2Q89A 1MDP1 5H8SA 4F18A 1JEUA 4GXAA 1IZ1A 4GD5A 3IB2A 3U72A 4DCXA 2HXWA 2F7AA 3W15C 2XD3A 1ZBMA 1Y3PA 2PT1A 1SI1A 4H6DA 1XVYA 2DP8A 4FIMA 3QSLA 1NNFA 5A5XA 2REJA 2O6AA 1MY4A 2P1SA 5H8NA 1B3HA 3FV1A 3MZBA 2F35A 5H8FA 2YJPA 4NF6B 1P1WA 4WKMA 2DS9A 4O3AA 3SDFA 4JBZA 2XXXA 3Q28A 4DXUA 3O6HA 1B5IA 4JXIA 4C0RA 3H6TA 3MVYA 1MQIA 2QS1A 3Q25A 4YKKA 3BFTA 2AL4A 3TCFA 4QFLA 3N26A 4KI0E 4BDMA 2XXPA 2F8DA 2DOJA 1AL3A 3PMXA 3G3FA 4YKPA 2VP1A 5ITPA 4BDNA 3FASA 4R6KA 4EXKA 2OCUA 2QSXA 1N7XA 2H99A 3B6QA 3GBAA 5I56A 3PUZE 5ITOA 3EQ1A 4OESA 3OMBA 4ZZEA 1IXIA 3PMWA 1Y3QA 2Z8EA 4KCCA 3MP8A 1EH3A 3ZKLA 2RCAA 4PFUA 4OWDA 4GF8A 4G8MA 4R9GA 1J1NA 2H98A 1MQJA 2R9JA 4LONB 4FAJA 3PGFA 2ABHA 3OSRA 4GRKA 1B9JA 5AA2A 3ODBA 4G2ZA 3QK6A 4YU0A 3MUQA 3OEMA 1I6BA 4KYDA 4BDQA 1B3EA 4IGTA 4H5GA 1A55A 4BDOA 3C36A 1MQHA 4EF1A 1MPDA 4JWXA 4E0WA 3QYTA 3TTLA 4ND9A 3ZS6A 4H1XA 2ONSA 3FXUA 3OD7A 4R6HA 3PPQA 3PMVA 2UYEA 4NF5B 3K1PA 2Z23A 3D4GA 5CMBA 3N6UA 3N94A 4ECFA 2DWJA 3IB1A 4EF2A 4YAHX 1OLCA 3FVGA 4KD5A 1MM6A 1US4A 2ZYNA 2QJEA 2AL5A 1MXZA 3OO9A 1ANFA 4NF8B 3USDA 3IL1B 1OIBA 2F34A 1M5CA 3T96B 4H67A 3HSTA 4BDRA 1DTZA 4RK9A 4F1YA 3S2VA 4YMBA 3VLUA 1BTJA 2DWHA 4EQ7A 2PBWA 4ELQA 1TFDA 2XXWA 1RYOA 4AB5A 4QFPA 4OENA 3T93B 4IB2A 2XXYA 3TFLA 4JB7A 4RXLA 2NXOA 5M2VA 2O7IA 3S9NC 3G3KA 3N5LA 4KCDA 4FJPA 4XKQA 3RY3A 4Z0IA 4G4PA 2LAOA 3SEWA 3E9XA 3V83A 2GHBA 2O1MA 1H43A 3EN3A 3VVDA 1O63A 2HAUA 3MW0A 4XXUA 1JW4A 5KCJA 4OMBA 2DVZA 4ISUA 3SKPA 1ZU0A 4LUBA 2I3VA 5JTYB 3SEUA 2DE2A 5AE4A 3FXQA 4C1TA 1SYIA 3FGSA 4QRZA 3JZJA 1IIWA 1OMPA 4Z7EA 4M1VA 2UVGA 5JEIA 3GBBA 3V89B 3HO7A 5K2YA 4QHQA 3ECRA 5A5XB 4GIZA 1YTVA 1M5BA 2DE4A 2E1SA 2QMXA 5H8NB 3TCGA 3IO6A 4DIGA 5H8FB 3IR1A 4RK2A 2RKMA 3PUYE 3EHTA 5LOMA 4I1DA 2D3IA 2PT2A 1Z7NE 3D4CA 3Q27A 3KJ7A 4KHZE 4JSOA 3AXFA 1BKAA 4QFOA 4PFWA 1N3XA 3BBRA 1SYHA 4U1ZA 3DM0A 3ZKKA 4IO7A 4EQ9A 3L6HA 1Q1KA 1HSLA 4QFKA 2XXRA 2OJTA 4F19A 1US5A 1JW1A 2V3UA 2GRVA 3O66A 1EZ9A 4EQBA 4HCYA 2E0SA 3K6VA 1HSJA 1LFIA 1OVTA 1XS5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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