3LSFB

Piracetam bound to the ligand binding domain of glua2
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Piracetam Defines a New Binding Site for Allosteric Modulators of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole-propionic Acid (AMPA) Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lsfB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lsfB02
3M8UA 1IUDA 1Y4TA 2DXYA 4G8NA 4NF5B 1LBCA 1LAHE 3ZKLA 4YKKA 4RYAA 5I57B 1B7HA 3O28A 2OCUA 1FQAA 3RT6B 1QUIA 1XOCA 3FIRA 1D3KA 3WAEA 5TP9B 3M3LA 4N6PA 4R74A 1MXVA 3JZJA 1T0KA 2YLNA 4X48A 3SEXA 2QMXA 2F7CA 1MQJA 2Q9TA 5DTBA 3HPIA 2PVUA 4OHNA 1OLCA 4H65A 1P1WA 2I4CA 3SEUA 3TODA 4F3GA 1N0TA 1JETA 1MY0A 4KYSA 3SEVA 3HHGA 1FTKA 3OELA 5H8QB 4F19A 2RCAA 3LSLA 4LQ5A 4DXUA 3HO7A 4ZECA 4AQ4A 4DLDA 1QUJA 3KZGA 3UA8A 3TAJA 3PPNA 1MDP1 1QULA 2XD3A 3KN8A 4F18A 2RC9A 5ITOA 1N3XA 3K6VA 1B4ZA 3DP6A 1LAXA 2XXUA 1LFHA 4JWXA 2DWIA 3L6HA 4LATA 2Z8DA 4NF8A 1AIVA 3K0VA 1HSEA 3VLWA 2F6PA 3MJNA 4G8HA 3B6TA 2HAUA 2ONRA 4HCWA 4NF6B 1GR2A 4EQ7A 1MY1A 5FHOA 3IOWA 3VVEA 1SVXB 3L6GA 5CM6A 5AA1A 5L9MA 3MVXA 1ELJA 1Z7NE 5DYHA 4ELQA 1FQCA 3GLBA 3VXBA 3THIA 3IJOB 1JW5A 3KBRA 3PUYE 1EZ9A 3SDFA 1YTVA 3Q26A 1A99A 3CSBA 5BWJA 2DE2A 1TFDA 1BLFA 1GVCA 3EPEA 2O7UA 1US5A 3RY3A 4OZ9A 1B51A 4NWDA 2NUVA 3H6VA 1CE2A 5I59A 1YAEA 3QUJA 1TFAA 1O64A 4F3BA 2F7AA 1OQHA 2B65A 1POTA 3PD9A 3MP1A 4C1UA 1B3LA 1MPCA 4M1VA 3G3GA 1MXYA 2XXXA 3ZKKA 5KDTB 4YKPA 3FVOA 4TQUQ 4PQJA 5H8NA 4I62A 2Q2CA 3T9HB 1OMPA 4NF4A 2QL3A 1A54A 3N26A 1NNFA 3TEPA 4F31B 1QUKA 1A7LA 3HHFA 3Q25A 1OLAA 5CBRA 2PT2A 3PUWE 4NWCA 5DT6A 4YB7A 4M4GA 1UTHA 2BJJX 3ECRA 1N3WA 5AA2A 1FQBA 1IIWA 3TYHA 3SEWA 4ZDMA 2ZNUA 4KFQA 1SW1A 1BP5A 4TLLB 5F7VA 2V25A 1MPDA 1ZKBA 1NNPA 3MZ1A 4K3FA 2UVGA 1TT1A 1PB9A 5DVIA 5AA3A 1IXCA 2I49A 2HAVA 1B1XA 2Q2AA 2ONSA 3OSRA 3I6VA 3Q27A 3O2AA 3RTFB 2DYXA 5TPAB 3FV1A 1FQEA 3HSTA 2E1SA 1SBPA 2F36A 3PUZE 4GLIA 4QF9A 3C33A 1XT8A 5CI5A 3G3KA 4NMYA 2NXOA 1D9VA 4P11A 3V83A 3GZGA 1URGA 1R9QA 2P2AA 4PFUA 2OWTA 2DE3A 4DCXA 1MQGA 3T66A 5HBCA 2HCAA 5I57A 3IO6A 4JWYA 1AMFA 4YKIA 4KD5A 2O51A 2F6GA 4XTCQ 3CFXA 2VGQA 3IX1A 2I4BA 4YB5A 4QSEA 1Y1ZA 4OXVA 3U1OA 4ZZEA 1FW0A 5I59B 3S9LC 4G77A 2Y84A 4LP2B 4O3CA 2DWAA 3BBRA 1B3HA 2ZYKA 3A3UA 1B1HA 3PMXA 3F11A 4YICA 3MPLA 3KOSA 2ZYNA 4WKMA 3UP9A 4I9DA 3TQLA 4ECFA 4DXBA 4MFIA 4GF8A 1B7ZA 2ZMBA 5ICQA 4ZEFA 4R6KA 4OQOA 3GBBA 5H8NB 4BDOA 3P7IA 3H03A 1M5BA 3VVFA 4XKPA 4NF4B 2GHAA 3N6UA 4JDFA 4G68A 4R6HA 3C32A 3IR1A 4DIGA 3O9PA 4LZ8A 1D9YA 2Y7WA 1H3DA 1UTHB 2F35A 5I58A 3V5AA 4FEDA 4KR5A 5AA2B 1WVJA 1JEVA 1SDXA 2AYSA 4I1DA 3IOUA 3OEKA 4YB6A 1MY3A 4HTGA 1RKMA 2NWJA 4OETA 3DP4A 3LSWA 2Y7RA 4F29A 2PYYA 1OIBA 3Q29A 3OSQA 5FTIA 4YU0A 4F3PA 1QKAA 4IO3A 3FXUA 3VLUA 2QS1A 4KHZE 3CI8A 3DM0A 1JVYA 1MH3A 1A55A 4RXLA 3TCFA 4X1DA 1NL5A 1JEUA 3H3GA 5CRYA 3AXFA 3MUQA 5FTHA 3WAFA 4G68C 3S9NC 3BFTA 3K1PA 1USYE 1MH4A 3R6UA 4JBZA 5DVJA 4R9GA 2VD2A 3FATA 4OYVA 2HZKA 2QMWA 2ANJA 4F39A 3SERA 3KN7A 3T22A 3Q28A 1URDA 3EF7A 4QSDA 1MS7A 4Z7EA 3QYTA 4LVQA 1DSNA 1DMBA 5KDTA 2P1SA 1S50A 1Y3QA 4FECA 4ZS9A 4JXIA 3IB0A 3K02A 3MW0A 5F1QA 4TLMB 2I6EA 1XHYA 3HV1A 5ISUA 4PFYA 1FTLA 4YMBA 3K1MA 1PBPA 5EHSA 1NNKA 4N07A 3V8XB 4EQBA 4KPTA 3N94A 1Y3PA 3O6IA 5L8DA 1JW4A 1ZJLA 2IEEA 5ELVA 4PFWA 3TKDA 2PMSA 3H7MA 4RY1A 2XXTA 3U93A 1IEJA 5ICTA 4U4XA 1N76A 4RPOA 4WXJA 1MQDA 3USDA 2I58A 3IB2A 1P1OA 2F8DA 2D3IA 4BDLA 3T9VA 3OMBA 1IXHA 5FHMA 1I6QA 3KEIA 4P0GA 5M2VA 3TELA 1B0HA 1QJMA 2PX1A 3B7DA 2O1LA 2O7IA 4H5FA 4MLVA 5JEIA 1A40A 1ZMGA 3PPOA 3TQWA 2H5YA 4G68B 2I48A 4G8MA 3HN0A 2HXWA 3O66A 4JSDA 4XKRA 3PPPA 1B4HA 3T9UA 5ITPA 5TPAA 1M5CA 5I58B 4ZEDA 2LAOA 5JTYA 2XHDA 4MLQA 3W15C 3K00A 1ZLQA 1I6BA 5TU0A 4ZEBA 4YAHX 5DVFA 4JSOA 2DWHA 4RK2A 3MP6A 3CR9A 2ONKE 2UYEA 2RKMA 2XX9A 3O97A 3PPQA 3ZSFA 3RN8A 3IORA 4GRKA 2UVIA 2Y7KA 4WEDA 1GGGA 2H25A 5I56A 1QW0A 3E13X 5JK4A 2ABHA 1F9BA 1H43A 4EQ9A 4ISUA 4POWA 2I3WA 3H6UA 4QHQA 3IL1B 3W9WA 3RLFE 3TPAA 3TTMA 3N6TA 4GD5A 3A09A 4GVOA 2Y7IA 3EHUA 1B2HA 4P0IA 4PFTA 4L17A 4YKJA 1N84A 4KI0E 1I69A 2OBGA 1AOVA 4LZ5A 4MH5A 2THIA 1FTOA 3OO7A 2DXRA 1LAGE 4R9FA 4GIZA 1PBQA 3ILTB 3BFUA 2VHAA 3IB1A 4OEVA 4G2ZA 1B5HA 3R26A 5A5XA 3MP8A 2O84X 1EU8A 3TCHA 1LLSA 2X7PA 1OVTA 2HFBA 4IO5A 1A8FA 1DOTA 3CG3A 1LB9A 3LR1A 4YMAA 2WKYA 3FV2A 4QRZA 2XXHA 2FYIA 3ODBA 2DE4A 5I2KB 2B3FA 2PBWA 2V3TA 4ELRA 4YZZA 1PB8A 4EF2A 1B5IA 4F2OA 1OQGA 1TXFA 1XS5A 4JB7A 1A8EA 4NEDA 1VFDA 2GH9A 4U21A 2I3VA 3TDJA 1TWYA 1MQIA 1SQYA 3DELB 1P1QA 5KZTA 1HSJA 1ATGA 2O1MA 2FA7A 2DQVA 2V3QA 3RTWB 2XXPA 4GOTA 5JTYB 3QK6A 2OLBA 4KYDA 1II5A 2F97A 4DXCA 4QSCA 4GXSB 3VFJA 3PV0E 1LCTA 4KCDA 4BDMA 1H76A 5I2NA 4R6YA 1B3FA 3HCQA 2OZZA 4OENA 5I56B 3M3FA 4U1ZA 2H9BA 1LSTA 3RNNA 1B7UA 2QSXA 1Y9UA 1VE4A 1UIUA 1N04A 2UVHA 2XXIA 1M5DA 3MZBA 3MVWA 3UIFA 2D5WA 1S9TA 2R6GE 3U94A 1B40A 1H45A 1JW1A 4OERA 1SD3A 4QFOA 4IB2A 4UACA 3LSFB 3UK4A 1P1UA 1SI1A 4C1TA 3G3JA 4GL8A 3QSLA 2ESNA 1SW2A 1QKBA 4OMBA 4R73A 3H4ZA 1POY1 3EHSA 5CMBA 5LOMA 1B0LA 4FJPA 2XD2A 4F3SA 4ELOA 4IO7A 2YJPA 3EQ1A 3OO6A 5BUUA 4ZE8A 1SYHA 3O6GA 1OVBA 4TOZA 5A5XB 2DSFA 1SW5A 2V84A 4EF1A 4RA1A 1ZBMA 3D4GA 4H8IA 1NNTA 2M8CA 3KJTA 3MVZA 4XKQA 1PEBA 3K4UA 4H8JA 1IZ1A 1P1NA 3KGCA 3OXNA 4JWOA 1JQFA 2Q89A 1MRPA 4POXA 2ZNSA 4ZEIA 2XX7A 4FATA 2UXAA 1DTZA 1EZOA 4GXAA 5L9SA 1NFTA 2YPNA 4GL0A 4ONYA 3EHTA 3K6UA 3TTRA 4IY6A 1R1NA 2AL5A 4EXKA 3CSGA 3TTNA 4N13A 1N7WA 1EZPA 3SKPA 1ANFA 1Y1MA 2Y7PA 3B6WA 5CMKA 1Z7ME 5KCJA 1AL3A 1HSLA 3OD7A 4E0WA 3MBPA 4DE8A 5EHMA 2XXWA 2F7BA 1XVYA 4NTLA 3C31A 3G3HA 4X9TA 4HS7A 5I84A 1L5TA 1SW4A 1CB6A 2RC7A 3PD8A 4H1XA 5H8FB 1KWHA 2Q88A 5IAIA 4F1UA 3H6WA 1PB7A 1JVXA 4ND9A 4OTEA 3R7XA 2F34A 2XXRA 4LA9A 2I0CA 5I2NB 1UTBA 3LSXA 3N5LA 3OO8A 3PUXE 3S2VA 1LB8A 4PETA 1WODA 2XX8A 1IXIA 3KSJA 2QS4A 3OOAA 3KFMA 1Y3NA 4QFKA 3T93B 2REJA 1IXGA 4DZ1A 3FJMA 1B46A 4THIA 2NOOA 3VDFA 3TZAA 3K2DA 2ZYMA 4WEPA 1LFGA 2CMOA 1LCFA 4U4SA 3U92A 4U22A 4H0WA 4AB5A 1DPPA 4F1VA 4GWOA 4PE5B 1RYXA 2DS9A 4LUBA 1EH3A 5FHNA 3TFLA 4QFLA 1B05A 1B3EA 2GFEA 3H6TA 4H67A 5AA2D 3SESA 3FUZA 2OWSA 3QAXA 5H8HA 4O3AA 5I2KA 3O6HA 2P0SA 4Z0IA 4EDPA 5CMCA 4HW8A 2Z8FA 4Q0CA 3RPWA 1MM6A 3VV5A 3QUFA 3K01A 2KLFA 4PP0A 1B6HA 3FGSA 4DCYA 4IGTA 3RT8A 5H8SA 3JV9A 1FTMA 3EN3A 3E9XA 5K2YA 1XC1A 2G29A 5J1DA 4MF3A 4EXLA 1R9LA 1Y4CA 3S9EA 3GBAA 4LONB 4QFNA 4FE8A 3I5OA 2GRVA 1DTGA 2PT1A 2AIXA 1I6AA 5EYFA 3IO4A 2X7QA 2RINA 1YCJA 2V3UA 1P99A 2AL4A 3IOVA 3MPKA 4ESWA 4FIMA 2B3BA 2F78A 3CVGA 1NH7A 3FJ7A 1PDAA 2O6AA 3G7WA 1BTJA 3FASA 4F1YA 4OFJA 3RQTA 2RF1A 3K1NA 1WDNA 5KCJB 3CRBA 1O7TA 4OEUA 4LQ2A 4O3BA 4H5GA 3OO9A 3U8QA 4F2QA 1AH5A 3GXAA 5DEXB 3DP8A 3PU5A 3QXMA 4R75A 3PGFA 2A5TA 3C9HA 3MAMA 4U1OA 5L9OA 4FAJA 4Q8RA 5HPQA 4EUOA 2R9JA 4R2FA 2VOZA 1MXZA 2DP8A 3K6WA 1GV8A 3MWBA 1LAFE 4RPNA 1IQ7A 3LBSA 1UTBB 3SEYA 4OESA 3FVKA 1B58A 1B52A 1B9JA 2I0BA 2QS3A 3U72A 3KSXA 4BDQA 4U23A 1H44A 3CFLA 1DPEA 3VLVA 2QJEA 1ZU0A 2G93A 2RC8A 3KJ7A 1MM7A 1M5EA 5HM4B 3RGYA 1IITA 1FQDA 3FD3A 1NMUA 3ONMA 2QPQA 5CMMA 3B6QA 2ZXTA 2DWJA 3I3VA 4RNSA 5K2XA 2O68A 1BKAA 4MBPA 1B32A 4C0RA 4GQOA 3MC2A 4I8CA 4H6DA 3VE1B 1LGBC 1BIYA 2VP1A 5H8HB 1LFIA 2O69A 3PPRA 4XKNA 3KN3A 1M5FA 4R2BA 4F22A 4ESXA 1J1NA 1MY2A 3KG2A 3UN6A 3T9XB 2XXVA 3PMVA 2UYFA 4ZZAA 1ZTYA 1MXUA 1O63A 3TMGA 3ZS6A 1UQWA 3W9VA 3IJXB 2Q8JA 3E3KA 2OK2A 1RYOA 2VD3A 3UORA 3IAZA 4NF8B 4KYEA 3LUYA 3UGWA 3C35A 1NKXA 3PUVE 5AA4A 5H8FA 4Q5TA 2XXYA 5CBSA 2ZYOA 2GHBA 4E0XA 1Q1KA 3KOTA 3H06B 3MQ9A 1MDQA 1JNFA 2QRYA 1FTJA 5B7DA 1YPNA 3MVYA 3C4MA 3JYRA 4NF5A 3FJGA 4IO4A 4IY5A 4XIGQ 4ELPA 4G4PA 2QS2A 2FNCA 3T96B 3PMWA 1B5JA 1D4NA 4OFLA 1FCKA 1NH8A 2E0SA 4NE4A 5TP9A 2H4IA 1B3GA 3CG1A 3FXQA 2A5TB 1US4A 2R71A 4U2RA 1Q35A 3FVNA 3M3KA 1VFEA 3OEMA 4ZEKA 2X26A 5H8QA 2NVUB 4UA8A 3G3FA 3V89B 4BDNA 2Z23A 2V93A 4X1BA 1QVSA 3MZ9A 2Z22A 2HZLA 4IO6A 1MG1A 5B70A 3K6XA 5CC2A 1N7XA 4IO2A 4FORA 3LC8A 1UIVA 3FXRA 1SI0A 1VR5A 1MQHA 4LZ7A 4IGRA 4AB6A 4OWDA 3FVGA 3ILUB 4GFRA 2ALUA 2D21A 4BDRA 2UVJA 3OENA 1FQFA 2HQ0A 3C36A 4RJZA 4XXUA 2ZNTA 3DLNA 2F5XA 1Y20A 2CZLA 4Q30B 2A5SA 3TCGA 3TUSA 2OJTA 3CFZA 4NF6A 3RUMA 1S7YA 2XXQA 4KCCA 4OVJA 1MY4A 3CIJA 4OFOA 1SYIA 3VXCA 3BKIB 4HCYA 4FEBA 1USYH 2REGA 3S9MC 2HEUA 2DOJA 1LBBA 3A3CA 3QIMA 4RK9A 3TTLA 2IA4A 1XVXA 1URSA 2H98A 4R72A 1ZIUA 5AE4A 3IK6B 3C34A 3O29A 1MXXA 2Z8EA 1R6ZA 4QFPA 2DVCA 3TTKA 3S4UA 2RCBA 4BLAA 3VVDA 1MPBA 4DDDA 4KQPA 5DEXA 2H99A 3G3IA 1MXWA 2DVZA 3IOTA 1VSOA 5AA4B 3D4CA 5IKBA 2W7YA 4ZE9A 3SETA 3FZVA 1GTKA 1PC3A 3E4RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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