3LSWA

Aniracetam bound to the ligand binding domain of glua3
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Piracetam Defines a New Binding Site for Allosteric Modulators of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole-propionic Acid (AMPA) Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
molecule keywords GluA2 S1S2 domain
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lswA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lswA02
1GGGA 1M5DA 4G8MA 2DWHA 2Q89A 4R73A 3U94A 3K01A 3TMGA 4GOTA 3TEPA 3MAMA 3CRBA 1J1NA 3V83A 5KZTA 5K2XA 1HSJA 4P0IA 1UQWA 1CB6A 3IK6B 1B7HA 5FTIA 3G3IA 1BIYA 2E1SA 5AA1A 4LZ7A 5FHMA 2O1MA 1SVXB 2DS9A 4PP0A 1LCFA 5I84A 5KCJA 2QS4A 1NH8A 2OWSA 1BP5A 4ZEBA 3TQWA 4MF3A 3ILUB 4OHNA 5TP9A 2RF1A 3SESA 3S2VA 5AA3A 4F1VA 3PPOA 2Z8EA 4ZEIA 4F29A 4I1DA 3UIFA 3W15C 5JK4A 4KQPA 1URSA 5HM4B 1LSTA 3HHGA 5K2YA 4ESXA 3KOSA 1B3EA 3K1NA 3QK6A 4U21A 2F36A 3WAEA 1B58A 3K1MA 3OXNA 3C33A 3RTWB 2UVJA 1UTHB 2HQ0A 3C34A 3F11A 1A7LA 4QRZA 3PU5A 1MRPA 4DIGA 5AA2D 5I58B 1ANFA 2O68A 5I2KA 1LAGE 3N5LA 3OENA 3KZGA 2QS2A 3PUVE 4LZ5A 2DE4A 4U4XA 1AOVA 3MZ1A 1A55A 4OXVA 5DEXB 4FJPA 3UGWA 4DCXA 3M3FA 4OWDA 2AL5A 3IJOB 4NEDA 4ZS9A 1ZBMA 3FJGA 5H8FB 1N7XA 4F2OA 1JEVA 3CI8A 2XXRA 3K6UA 1LFGA 3K2DA 3O97A 4G8HA 1SQYA 2Y7KA 4OETA 4OZ9A 3T66A 4F1UA 5CBSA 4RXLA 4YAHX 4NTLA 2UYFA 3P7IA 1EZ9A 1BLFA 3QSLA 4NF4B 4HS7A 1GR2A 2PMSA 2QMWA 1P1WA 3D4CA 3DP4A 4IO5A 1R9LA 1MY4A 3SDFA 1DPEA 4C1TA 3U92A 3VV5A 1USYH 2WKYA 4ZECA 5AA4A 1MS7A 4GD5A 3IL1B 3T96B 1UTHA 3MW0A 4KYSA 1YAEA 2A5TB 2QS1A 2Y7PA 3TTLA 3B7DA 1AL3A 1SI0A 2ZNSA 1MH4A 1EU8A 4KFQA 1ZLQA 1FCKA 3FASA 2PBWA 3KSXA 3OO9A 3I6VA 5CMMA 2DP8A 4F18A 3PGFA 4X1BA 4FEDA 3PPQA 4EXKA 5ICTA 2BJJX 4NMYA 1LB8A 1N76A 1Y20A 4KD5A 5DVJA 3VLVA 1YTVA 3VXBA 1AIVA 1ZJLA 1DTGA 3CR9A 3HO7A 1N7WA 1MY1A 1A8EA 2RCBA 3G7WA 3FVKA 3C4MA 5KCJB 1D4NA 4F3BA 4QSEA 4OFOA 4R9GA 2PYYA 2I49A 2DSFA 2REGA 2I3VA 3TAJA 4IO2A 1FQCA 3KFMA 2DQVA 3M3LA 3S9MC 5ITPA 1NNFA 1POY1 3RLFE 2DVCA 3RPWA 1MPCA 3BFUA 2D21A 3R26A 2Q88A 1I6QA 4YB5A 5FHNA 1IQ7A 3RT8A 1ZMGA 2ONKE 1B4HA 3FIRA 1NMUA 2AIXA 1Y1ZA 1MQGA 4GLIA 2XXQA 2A5SA 3MC2A 2VD2A 5H8SA 2I6EA 3Q27A 4ELPA 1WDNA 2P1SA 1AH5A 3Q28A 1IEJA 3IR1A 1M5CA 5I2NA 2Z23A 3ILTB 4PFUA 3IJXB 3TELA 1PEBA 3TCHA 2A5TA 1N3WA 1PB9A 2Y7WA 3LR1A 4IO6A 2CZLA 1PB7A 3HCQA 3OSRA 1B3HA 1Y1MA 5DT6A 3CSBA 4N13A 3QXMA 2F7BA 3PUZE 3UN6A 2E0SA 3O28A 4IGTA 4GL8A 2RINA 3LBSA 4DLDA 3IOWA 3M3KA 3T9HB 4QFLA 3PMXA 4XXUA 2X7PA 1B6HA 1FQAA 3UA8A 4E0WA 4ZEFA 3RN8A 5DTBA 1Y9UA 3DELB 3IORA 3TODA 2OLBA 2P2AA 2VGQA 3SEWA 2UVGA 3G3KA 1D3KA 3TCFA 3KN7A 3O9PA 4ONYA 1KWHA 1H76A 1S50A 1IIWA 4RK2A 4ZDMA 1B5JA 3TDJA 4IO7A 4GXAA 3HSTA 3HV1A 5B7DA 1B0LA 2HZLA 3KSJA 4KR5A 2GH9A 3A09A 3N6TA 4OERA 1Q1KA 3A3UA 3GBAA 4U2RA 4BDMA 1UIVA 1Y3NA 4U1OA 4JXIA 4KCCA 4YKJA 2X26A 2THIA 1I6BA 2GHBA 3IOTA 1T0KA 2F5XA 4QFKA 3HN0A 1US5A 3KGCA 1S7YA 4EUOA 1TFAA 4YU0A 5DVIA 5ICQA 3H03A 2ANJA 2VHAA 1HSLA 1ATGA 3AXFA 4F19A 4I9DA 4KHZE 1GTKA 3S9NC 2R71A 3MVZA 4RJZA 1NKXA 2DE2A 3N26A 1B5HA 2UXAA 1MQDA 3OELA 1US4A 4EQ7A 4F1YA 1SI1A 3EHUA 4IO3A 4H5GA 5BUUA 1JQFA 2ONRA 3SKPA 1VFDA 1LFIA 3MP6A 3OEKA 4NWDA 4M4GA 1B1XA 2V3TA 4MBPA 1SDXA 2RKMA 1P1OA 2DWAA 3IX1A 2B65A 3K6XA 4G68A 4HTGA 4IGRA 4LUBA 4YKPA 5H8QB 1B5IA 4KYEA 4Q8RA 5KDTB 1FTMA 1JETA 3I5OA 3IOVA 2H98A 4U1ZA 4R6KA 2H5YA 4JWXA 2G93A 3CFLA 1P1QA 3N6UA 4QFNA 1MQHA 4KYDA 4H8JA 2YLNA 3C31A 1RKMA 1NNPA 4RYAA 3OSQA 4G68B 4JBZA 1FTKA 3SEXA 3O6GA 4PFWA 4QFOA 4YMBA 1TFDA 5TP9B 2NWJA 2HAUA 2GRVA 4RA1A 1WVJA 4BLAA 1B40A 2ZYMA 1M5EA 1OLCA 3VFJA 3EHTA 3PMWA 2M8CA 3Q26A 2NOOA 5L9MA 1MH3A 1MY3A 5CMBA 1FTJA 3K6WA 2FNCA 1JW4A 3KN3A 1B7ZA 1QVSA 3CG1A 3KJ7A 3MUQA 2H4IA 2O7IA 4RK9A 3TTMA 2Y84A 3GLBA 4MH5A 4E0XA 3L6HA 4YB6A 1NFTA 1XVYA 5JEIA 5TPAA 2ZMBA 4NE4A 5AE4A 5JTYA 3QUFA 4XIGQ 2G29A 2O51A 1FQEA 5DYHA 4FAJA 1QW0A 3CFXA 4EDPA 3H7MA 4TOZA 3TCGA 2XXXA 1NNKA 2QS3A 3A3CA 1MXZA 3GZGA 3JYRA 3O66A 4PQJA 4Q0CA 3RY3A 4BDRA 4F31B 1MM7A 3G3GA 4LONB 4NF5B 2RCAA 2DVZA 3HHFA 3O2AA 2XX7A 4H0WA 4DXCA 4G4PA 1WODA 4LQ5A 3KG2A 4POWA 3W9VA 4BDNA 4BDLA 5CMKA 3ONMA 3LUYA 4XKQA 4DE8A 1S9TA 2RC9A 3B6TA 4JSOA 3DLNA 1M5FA 3MZBA 3E9XA 4GF8A 4G77A 1IZ1A 4AB5A 1SYHA 1A54A 1XT8A 4R74A 4ELOA 1OLAA 3S9LC 4H1XA 1FTLA 4RPNA 3VXCA 4WXJA 1ZTYA 5L8DA 4F22A 4OEUA 3UK4A 2QL3A 5L9SA 1B7UA 2XXTA 4DDDA 3OO6A 3Q25A 2B3BA 4KCDA 1LFHA 5ELVA 1ZIUA 3PV0E 2OJTA 4X48A 2Y7IA 1LBCA 1A8FA 3IO4A 2QRYA 5ITOA 3DP8A 4GVOA 4DZ1A 3EPEA 5JTYB 1QULA 3B6WA 3FJ7A 4FEBA 3LSWA 1Y4CA 2AYSA 1N0TA 3S9EA 3CFZA 5EHMA 1A40A 2O6AA 2F34A 1XVXA 4JWOA 1H44A 2I3WA 2XX8A 1QJMA 3LC8A 2XHDA 1ZKBA 1N84A 4G8NA 4X1DA 5H8NA 4HCYA 4FATA 1JEUA 2XXVA 2HEUA 4LATA 1NNTA 4N6PA 4ND9A 4R2FA 4WKMA 3RQTA 3V5AA 3EF7A 4JSDA 3MP8A 4UACA 3LSFB 2H9BA 3IB1A 4ZE9A 3E4RA 3IB2A 1B1HA 1SW1A 3SEYA 4DXUA 1P99A 3FXQA 1YCJA 4YB7A 5TPAB 1FQDA 4QHQA 3CVGA 1RYOA 3TQLA 5I2NB 3O6IA 2HXWA 1JNFA 1JVXA 2OZZA 5BWJA 2V3QA 3FVGA 2XXUA 2XD2A 4OFJA 3RTFB 4AQ4A 3GBBA 5AA2B 4KI0E 3THIA 5I56B 2NVUB 4PFTA 3FATA 1IITA 1FQFA 2F35A 2DWJA 3CSGA 3VLUA 4HCWA 3V8XB 2ZYNA 2O69A 4AB6A 5I59B 5LOMA 3I3VA 1MXWA 3IOUA 4ELRA 4ESWA 3ZKLA 1B3GA 1H3DA 4TLMB 4U22A 4EQ9A 5I57B 4O3AA 1LB9A 1N3XA 3B6QA 3C35A 2VOZA 4ZZEA 4OENA 5A5XA 1DMBA 3MQ9A 1URGA 4IO4A 3FV2A 1B51A 3VLWA 1UTBA 3H4ZA 1B2HA 4O3CA 1MM6A 2DWIA 3ZSFA 3H3GA 5I58A 2I58A 4GL0A 4DCYA 4YICA 3QAXA 2HFBA 5CBRA 4EXLA 3LSLA 4LVQA 3VVDA 1MQJA 2ESNA 1B9JA 4G68C 3U93A 4Z0IA 5H8FA 1B4ZA 1XOCA 2IEEA 5EYFA 2RC8A 3V89B 4F3SA 2HAVA 3OD7A 5AA2A 2O84X 2Y7RA 3KEIA 1MXYA 3ECRA 3BKIB 4QSCA 2B3FA 4EF2A 3MBPA 4OTEA 3MP1A 1OMPA 3EQ1A 1MXUA 3L6GA 3JZJA 5AA4B 4WEPA 1DPPA 1FTOA 4ELQA 3PPRA 1O7TA 2ONSA 2V25A 4F2QA 4HW8A 4ZEDA 1OIBA 4R9FA 3TPAA 5HPQA 5I56A 5H8NB 2ABHA 1R1NA 2D5WA 4R75A 2F6GA 3FVNA 4EQBA 5F1QA 3PD9A 4H8IA 2OK2A 3OO8A 2F78A 3PUXE 2ZNUA 3CIJA 2H99A 3MWBA 3LSXA 3ODBA 2FA7A 3G3JA 2I4CA 1CE2A 4N07A 2NXOA 2ZXTA 4UA8A 5KDTA 3QUJA 3N94A 2H25A 4LA9A 3T93B 4FORA 2GHAA 3U72A 4Z7EA 5F7VA 2REJA 2LAOA 3K4UA 4Q5TA 5A5XB 3E13X 2ZYOA 3OEMA 1M5BA 4MFIA 5DVFA 4ZZAA 1VE4A 1II5A 5I57A 3SETA 3Q29A 4JWYA 4TLLB 2QPQA 3G3FA 3H6WA 3SERA 3TZAA 4U23A 4R6HA 5FTHA 4WEDA 3C9HA 3D4GA 2PVUA 4YMAA 3UORA 1QUKA 1Z7NE 2ALUA 4YKIA 5FHOA 3K1PA 1OVTA 4EF1A 2VP1A 3K6VA 1Y3PA 3DP6A 2QJEA 4C0RA 4ISUA 1H45A 1Y4TA 4GQOA 4GWOA 3OO7A 3U8QA 4GXSB 4H6DA 3U1OA 1HSEA 1SBPA 2XXYA 4ZEKA 1MPBA 5IAIA 1NL5A 4OFLA 1MDQA 4F39A 4NF5A 3FV1A 3PUWE 3M8UA 4OESA 1VFEA 2PX1A 4G2ZA 1GV8A 4H5FA 2HCAA 4P11A 3VDFA 2PT1A 3RT6B 3USDA 2Q8JA 1IUDA 1FQBA 2IA4A 3WAFA 2HZKA 2QMXA 1B46A 1PDAA 3H06B 1LAXA 3TTKA 3W9WA 4XKNA 3K00A 2GFEA 5CM6A 2UVIA 3FD3A 4I62A 1Y3QA 1BTJA 1GVCA 2I0BA 1MQIA 1LAFE 1MDP1 1QUJA 3FZVA 2OWTA 3TFLA 1B32A 4R2BA 4H65A 4GFRA 4LQ2A 2RC7A 3H6TA 3O6HA 3PUYE 2AL4A 4IY6A 4NF6B 4NWCA 3TYHA 4K3FA 3IAZA 1OVBA 3OMBA 1JW5A 5ISUA 1URDA 4TQUQ 2DXRA 5I2KB 3S4UA 1B0HA 2DYXA 4NF8A 1ZU0A 4LP2B 1SW5A 4OYVA 3RNNA 4C1UA 3TUSA 5CMCA 1EZPA 2Z8FA 1USYE 1SW2A 1N04A 3RUMA 4NF4A 4XTCQ 4IY5A 1MXXA 4BDOA 4KPTA 1SYIA 3PMVA 4P0GA 3TTNA 1L5TA 2P0SA 4RY1A 1PBQA 4H67A 3SEUA 1LCTA 2F6PA 3MVXA 4R72A 4QFPA 1D9YA 1SW4A 5H8QA 2CMOA 5B70A 1IXHA 4U4SA 3IB0A 4GRKA 4I8CA 5IKBA 1XC1A 3PD8A 2O1LA 2Q2CA 3C36A 1I6AA 1POTA 3MVWA 3EN3A 3EHSA 4PE5B 2YPNA 3MZ9A 5DEXA 3HPIA 2QSXA 1EZOA 2R6GE 2XXIA 2YJPA 1QKBA 1VR5A 2Z22A 4XKPA 1LLSA 4DXBA 3RGYA 2XD3A 5TU0A 2I0CA 2I48A 3GXAA 3R7XA 5I59A 1DSNA 2XX9A 5CI5A 1DTZA 3MPKA 4OVJA 3TTRA 1YPNA 4POXA 1LAHE 3KBRA 5EHSA 3T9UA 4XKRA 1UTBB 3CG3A 3IO6A 5HBCA 1JW1A 1MG1A 1R9QA 1TXFA 2F7AA 4ZE8A 3QYTA 1DOTA 2V84A 2Q2AA 2W7YA 1B52A 1JVYA 2PT2A 2DE3A 3PPPA 3MPLA 4OQOA 1AMFA 1O64A 1D9VA 3R6UA 2XXHA 4NF6A 1B05A 3KN8A 1MPDA 3BFTA 4QSDA 1QKAA 3QIMA 4L17A 2OCUA 1FW0A 4MLQA 1R6ZA 3ZS6A 1LBBA 3BBRA 4IB2A 1Z7ME 1B3LA 1BKAA 4YKKA 1F9BA 5H8HA 2Q9TA 3DM0A 4NF8B 1PBPA 1TT1A 3H6VA 5CC2A 3FGSA 4Q30B 2ZNTA 1Q35A 4X9TA 3JV9A 1NH7A 1RYXA 3UP9A 4THIA 1QUIA 3TKDA 1OQGA 3K0VA 4JB7A 3FJMA 2UYEA 1EH3A 2V93A 3VVFA 4BDQA 1TWYA 4OEVA 1IXIA 3FUZA 3FXUA 2XXPA 3FVOA 2OBGA 1VSOA 4JDFA 1UIUA 2F7CA 1PC3A 3MJNA 1LGBC 4FIMA 5M2VA 3T9VA 2X7QA 5J1DA 1H43A 3O29A 4O3BA 3VE1B 3K02A 2D3IA 3ZKKA 1ELJA 4MLVA 4QF9A 3T22A 4GIZA 3VVEA 3C32A 3PPNA 4FE8A 5CRYA 4R6YA 1IXGA 2DOJA 1I69A 2DXYA 3G3HA 4LZ8A 2F97A 1P1UA 2UVHA 4PETA 1O63A 4YZZA 1P1NA 1SD3A 1B3FA 2I4BA 1A99A 2R9JA 2O7UA 3KOTA 2NUVA 3T9XB 4FECA 4PFYA 2KLFA 3OOAA 1PB8A 3FXRA 2ZYKA 4OMBA 1XHYA 3MVYA 3E3KA 4RPOA 4RNSA 4F3GA 1MY2A 2Z8DA 2VD3A 3KJTA 4M1VA 3SEVA 4ECFA 2FYIA 1MXVA 4F3PA 5L9OA 1OQHA 2XXWA 3H6UA 2F8DA 5H8HB 2V3UA 1MY0A 1XS5A 1IXCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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