3LXTA

Crystal structure of glutathione s transferase from pseudomonas fluorescens
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
204
structure length
204
Chain Sequence
SLKLIGMLDSPYVRRVAISLKSLGLPFEHHSLSVFSTFEQFKAINPVVKAPTLVCEGGEVLMDSSLIIDYLETLAGPQRSLMPTALPQRLRELRLVGLALAACEKSVQIVYERNLRPAEKQHGPWLERVGGQLQAAYGELEQELQKQPLPRDGSLGQAGISLAVAWSFSQMMVADQFNPGQFPAVRGFAEYAEQLPVFLATPAT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Glutathione S Transferase from Pseudomonas fluorescens
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas fluorescens
molecule keywords Glutathione S Transferase
total genus 69
structure length 204
sequence length 204
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3lxtA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3lxtA01
2NVLA 3TUEA 1SJ6A 4FYCA 3MWHA 3HD5A 4POMA 1F3BA 2GSQA 4ECIA 1B9XC 5CREA 4RQRA 3VURA 2MZCA 5DAKA 4KW6A 4J2FA 2C4JA 3TGZA 4KNDA 1LJRA 4O5RA 3IBHA 1B4PA 2HSNB 5J4UA 1F2EA 5E4WA 1V9WA 4PXOA 3IV4A 3LWAA 1HNAA 4AGSA 4MCUA 3CSIA 3GTUA 3KJYA 4RUVA 2C0DA 5F8BA 5KN3A 4I97A 2YANA 3QMXA 3LEFA 2PMTA 1Q98A 1UVZA 1M2DA 1FOVA 2JSYA 3EU4A 3GSTA 2H70A 1X5DA 4G10A 2A4VA 3FEUA 5IO0A 1AAZA 2YN1A 4TN8A 5IOXA 4ZIJA 5G5FA 4MABA 1AQVA 4EO3A 4GLTA 2HSHA 1Z7PA 1O81A 1YKAA 1X0RA 2LTKA 4BL7A 5JWQB 6GSUA 4WF4A 1LBKA 3ZYWA 3N9JA 4WR4A 2VIMA 3QOUA 4EC0A 3TKSA 1TXXA 2NDOA 4TW5A 2K9FA 4QQ7A 4XS6A 3FRCA 2LRCA 2H73A 19GSA 2H8LA 3M0FA 2YZUA 4BVXB 4ILFA 3ZLPA 1WJKA 2WJUA 2QKEA 1FB6A 2GSSA 5F07A 2VCXA 2R3XA 2H1AA 2B7KA 4N11A 3WYWA 3E3EA 2I4AA 4WBRD 7GSSA 3A2WA 3IE3A 1SD8A 3G7YA 1T4YA 3IHQA 1A24A 1T1VA 2OE3A 1JZOA 1TU8A 1GTAA 1M2AA 6GSWA 4JU5A 2B5EA 3GL3A 3VWUA 2YNXA 4GXZA 3RAZA 4TXOA 1MEKA 4I2UA 1GNEA 1A0RP 1A0FA 5CP1A 1WWJA 2WZ9A 4V2LA 1K3OA 3M3MA 3LFLA 3O76A 4Q5FA 2C0EA 2LKUA 2KHPA 2L4QA 5CAXA 4MDCA 4F03A 1S3CA 4PTSA 1PRXA 1OE7A 2DJKA 3E9JB 1V57A 2DSAA 2NBSA 5JCWA 1O6JA 3GSSA 3PH9A 1Y6EA 2L5OA 1IYIA 1TK5B 1GSQA 2YZHA 1JHBA 4Q5RA 2M80A 3EU3A 4KAEA 4P3YB 2YWOA 4JEDA 3MNGA 1ERUA 3GFKA 4NAXA 5D9WA 13GSA 1K0OA 3FR6A 3CMIA 4IKHA 3DIEA 4USSA 3GKKA 5D93A 2PVQA 1Z7RA 1N2AA 2C1YA 4EF0A 3HY2A 2B5XA 2YOIA 2TRXA 3BD2A 2X8CA 1DUGA 4TOPA 2CAQA 1ML6A 5DVBA 3HXSA 5B6MA 17GSA 2J9HA 5DBQA 1FHEA 5GSSA 3LYPA 2WRTA 1X5CA 3CXGA 2M46A 2JSZA 1RW1A 1EOGA 2PWJA 4F82A 2OE0A 1EOHA 1TU7A 4POLA 1TOFA 2LS5A 3P2AA 4IQ1A 2B3SA 4KCEA 2E0QA 2K8SA 4D73B 5A4WA 4MJCA 5JWOB 5AGYA 2B7JA 3I6AA 2HRNA 5DALA 1VF2A 2OBKA 4PQ1A 2DBCA 1Z6NA 1N8JA 2YCDA 1HNBA 1EP8A 2R2JA 1GWCA 1F37A 1SKWB 4PQIA 5CRDA 1K3YA 1TKDB 3IPZA 2L6DA 2OKAA 1AQXA 3TKSC 4ISDA 3HYPA 2DJ2A 4J57E 3US3A 2VO4A 1PKZA 2B5YA 1BQ7A 3QPMA 1XFLA 2G2QA 1YQ1A 4I8BA 2LJRA 4Q5QA 1VF4A 1KBNA 4YAVA 2L4CA 3Q18A 2IFQA 3M9KA 4HU7A 1ZMAA 3J7Yk 1IYHA 1JZDA 4IN0A 1O7UA 4KF9A 3WGEA 3VPTA 3L78A 3PINA 1F6MC 1DSBA 4TR1B 1AXDA 4L0WA 1XCCA 1XWBA 3DD3A 3PR8A 2X64A 1G6YA 1EP7A 3GL5A 3DVWA 4EXJA 6GSYA 5ELAA 2GLRA 2AHEA 4F0CA 20GSA 5J9BA 1W4VA 3IOSA 4EL1A 5G1KA 4F2IA 4G2EA 2JL4A 1U3AA 4GRFA 3FW2A 1SK2A 4HJMA 1SYXA 2FWEA 4HUAA 4ECCA 4EE0A 1XWCA 10GSA 3ERFA 3KP9A 3APQA 2H66A 4ECJA 4OFNA 3ZL5A 5ID2B 3VWXA 3SBCA 2FNOA 2R5GA 4ML1A 1OVNA 1EGOA 1U6TA 2IIYA 1QQ2A 1GSDA 4CHSA 4GSTA 1R26A 3JCML 3U6VA 1O85A 1PKWA 5ECPB 1Z3EA 2RUFA 2X8HA 1ABAA 2K6VA 1OC9B 3I69A 3IA1A 3BBYA 2V41A 2AYTA 2D2ZA 4GTUA 3UBKA 3FZ9A 2R6KA 4EUYA 5F06A 1ON4A 4HS1A 3TJBA 3G9BA 5IOWA 4G9HA 4F0BA 1TP9A 5DQSA 1EGRA 2JU5A 2H74A 3VPQA 1K0MA 4DSSB 4DSRA 5G1LA 2DJ1A 2VD0A 2KLXA 5D9XA 1AIUA 4TR0A 4O7HA 3ZITA 3VFIA 2DLXA 3ZMKA 2CAIA 1SJIA 4GQFA 2OADA 2FWHA 2TIRA 5IM9A 3DKSA 4XTSA 2WB9A 2P5RA 4DVCA 3CRUA 2I3YA 5IPHA 4J56E 4LA1A 1X9MB 5EY6A 1YZXA 4MLYA 3KP8A 2JZSA 5JCUA 3CSHA 3RPNA 4ML6A 5G5EA 4NV5A 2GSRA 1XW9A 2VM1A 5ECIB 1ZOFA 2DIZA 1PMTA 1SENA 4MZBA 3EINA 2HRAA 2H0IA 2RM6A 3F4SA 3M9JA 1SK0A 4Z7XA 1M9BA 1PSQA 4BVYB 2WULA 1PN9A 1A2JA 1OC8A 1K0NA 5HQPA 1ACVA 3Q6OA 4MH2A 5ECNB 2FCHA 2YWIA 1WPIA 1R5AA 3MSZA 2HQTA 1JZRA 1FVKA 3L4NA 5DCGA 4TKYA 2XPDA 2O7KA 2VUPA 2HNLA 3F9UA 2HZEA 1NW2A 1O8WA 5B8AA 1BX9A 2XBQA 3AY8A 2LRTA 3ZIVA 4PURA 3ERWA 2GDRA 1GUMA 4ZBDA 3ZFLA 2H71A 3IK7A 3M8NA 4HI7A 1XIYA 2X8GA 3H8QA 2V1MA 2LSTA 1XPVA 5AN1A 4OCFA 3EVIA 1UA5A 3QAVA 3HJMA 1SYRA 1XWGA 3EYTA 1XOAA 2VL2A 5DJMA 1PGTA 3Q19A 3W8JA 1GH2A 5D9TA 5ECKB 5ELGA 3KCMA 1EWXA 4MA9A 2IMDA 2DJJA 2V6OA 1F3AA 3LJRA 5A5KA 5D9VA 4JR6A 1EV4A 2X99A 3TJGA 1B8XA 2C80A 3FR9A 2LNTA 3HJPA 4IP1A 3QD9A 1TI1A 3HVXA 2FY6A 2H30A 1Q4JA 2B1LA 5HR1A 3D4TA 2LRNA 2H19A 3R2QA 5H5QA 1TJDA 4N10A 4I6XA 3A2VA 3EE2A 5CRGA 5LD0A 3APOA 4MMMA 4JR4A 3ZMLA 2FA8A 3TJFA 1T7PB 1V58A 1KNGA 3FKFA 4V1Ap 3QAWA 4XCSA 1X5EA 1HD2A 3GKMA 4K8MA 2LJAA 1UN2A 1TRUA 3APSA 1E2YA 3ZIJA 1TK8B 4OCEA 3HZ4A 4ZL7A 2FUG2 4PX1A 2FGXA 5DJLA 4KX4A 1Y25A 5AIVA 3F63A 5J41A 3BJ5A 4NHWA 2YJ7A 2YWMA 2VCVA 3ED3A 4GCIA 3ZZXA 4L8EA 3EMXA 3ZVJD 1TK0B 4NXIA 3BCIA 3GHAA 1SKSB 3TKQA 2E7PA 2GTUA 4ID0A 4DSQA 5D8IA 6GSSA 1DE2A 5KN1A 1BEDA 1QMVA 3KMNA 5CO3A 1M0UA 5B7CA 2IPAA 1J08A 3L0HA 2LQQA 2VLUA 5AIXA 3UVTA 5IQYA 2B1KA 3N5OA 3W8SA 4N30A 1M99A 2VL3A 1WRYA 2WFCA 1MD3A 1THXA 4GF0A 3VK9A 2M72A 3A2XA 2HSMA 4WETA 1GSUA 1OC3A 1KTEA 1GSEA 2DJ0A 2CVBA 1XOBA 2LQOA 1ZYEA 1WMJA 3UEMA 4KSOA 1B9YC 2BTOT 4LLRA 2A2SA 4LMWA 2KUCA 2C0GA 4DEJA 4ZBBA 3F6DA 2MMNA 5GAND 1WIKA 3CTGA 1PL2A 2H6XA 4IVFA 2VLVA 1TW9A 2MBTA 3TKSE 1FB0A 4JE1A 4OWYA 1RQMA 3PGTA 2YWNA 4EKZA 2DMLA 4JRRA 5G30A 3HZ8A 4HEA2 4HOJA 3RPPA 4HDEA 1USBA 5IMZA 5J5NA 3M1GA 4N0VA 4POKA 1CQHA 5HR3A 3GIXA 4K1FA 2CVDA 1JLVA 1HYUA 2ON5A 4WKWA 1SD9A 4PQHA 1K0CA 2OACA 3F4TA 2H76A 2HRKB 1BG5A 1BJXA 3KM6A 2VL9A 1ZYQB 1YY7A 5D96A 3D21A 5HFGA 1TRSA 1YF0A 4MP4A 2GSTA 1CQGA 4XS4B 1M7TA 4L5OA 2N5AA 3NZNA 3FHKA 2AAWA 3KGKA 2AJQB 1R4WA 5L71A 4PGTA 2HFDA 2KP2A 3DYRA 4FQUA 4TRXA 4KCAA 4PUAA 2MMZA 2H6YA 2ZNMA 4XIHA 4V2MA 3IRAA 5DAKB 4O32A 4IJIA 1OKTA 1ZGNA 2C8UA 2EC4A 5IMFA 1NHYA 4ECBA 2H1DA 1NM3A 2ZUPA 5LCZA 4AJ7A 4K7OA 2C3NA 3TRQA 2PUKC 4BVXA 1GLPA 4ZB6A 3C1RA 3BCKA 3GKNA 5GAPD 2WDUA 2RIIA 2AV4A 3ISOA 2H6ZA 3C7MA 3EWLA 3IC8A 2VCTA 5IMDA 1R7HA 3GTUB 3ZRDA 2JZRA 3CYNA 2GT6A 2O8VB 2V32A 5HFKA 1J0FA 5ECOB 2G0FA 4OO5A 6GSTA 3TJJA 2JACA 3VWVA 1G7OA 3HCZA 3RHBA 1ZCPA 4NMUA 3TRPA 1ERTA 5J3RA 1G0TA 3A5WA 4BL7B 1JLWA 3H79A 1OYJA 2IJYA 2K18A 1U87A 3IK9A 1NSWA 3A3TA 1XW5A 1NHOA 3MDKA 3R3EA 1GUHA 3UBLA 3E0UA 1MTCA 1BAYA 3VWWA 3D0ZA 5FT3A 4WBJA 4MPGA 3GYKA 5INYA 2BJXA 4XRAA 4CDOA 4OFTA 5FHIA 3KH7A 3TKRA 2FHEA 1O73A 3LORA 1K0BA 2EIOA 2PGTA 3TJKA 1HNCA 2DIYA 5CYYA 3H4KA 3WT2A 1OE8A 4KB3A 5GSTA 2K8VA 1YKCA 3GKXA 5ABRA 4I5QA 1GTIA 2VCWA 4ZL9A 1KEBA 1SL0B 2C0FA 3LSZA 4ZXGA 3F8UA 4NHZA 4TXOB 1K3LA 4MF6A 3J7Yb 1AQWA 2J23A 4WXTA 5JWRB 2VOCA 3HHVA 3ME8A 3DVXA 5D73A 3O3TA 4FIWA 5ECLB 4ZB8A 4YQMA 2R37A 1LU4A 2O85A 4AJ6A 3TCOA 5KEJA 2RM5A 1AC1A 2B6MA 5COHA 4D73A 2YPMA 4WF5A 1VGLA 4BA7A 1QUWA 4TR4A 3TOUA 3GX0A 3LG6A 2GQLA 2CZ3A 2CT6A 1M9AA 1FG4A 2PERA 3LYKA 4MPFA 1B4QA 2VAFA 3U5RE 1YF1A 4K9ZA 2GGTA 1GTUA 2YV9A 2CX3A 4KGIA 2FWGA 1T4ZA 1K0AA 4K0GA 3KIJA 1XZOA 3D5JA 3FYGA 3TB2A 2IWTA 1EEMA 2PPTA 2FA4A 5CRWA 4KH7A 3IXRA 4YQUA 4G0KA 3O6TA 1A2LA 5FWGA 3LGCA 3G7JA 2DC5A 3CTFA 1G6WA 2C3TA 3IR4A 5C04A 3KEBA 4PUFC 3WGXA 3GV1A 2AUVA 1TI3A 2LEGA 1GSFA 3RBTA 3KMOA 1YJ6A 4BPYA 3FK8A 5LNKe 5F05A 2WGRA 1XWKA 2YP6A 5KN0A 1Z9HA 4TR1A 2N5BA 4ZL8A 2VCZA 5DALB 1JFUA 2WCIA 2L5LA 3RDWA 4AF2A 1O8XA 3FZAA 6GSVA 2GZPA 4WR5A 3DMLA 2IL3A 2HE3A 2IMFA 2FLSA 1VF1A 3DEXA 1R5PA 3KD0A 1GULA 1EV9A 3EC3A 4QL7A 1XVQA 1QK8A 2E2MA 3F0IA 4QL9A 3QFAC 2QC7A 1T00A 3TDGA 2F8FA 5GZZB 3TKPA 5ID2A 2BMXA 2IFQB 3L9SA 1ERVA 4LMVA 3GH6A 3UIWA 1YDKA 1QXHA 2IN3A 4X1UA 4HZ2A 4PNFA 1Z6MA 1GTBA 3P8WA 3DRNA 1U3IA 1FW1A 3W6GA 5IPGA 3TOTA 5J9CA 2ON7A 5IMCA 3KH9A 4YQVA 2CQ9A 3CBUA 4N0ZA 1OC9A 4HQSA 3Q74A 1V98A 3ZFBA 1X9WB 5DQYA 1SJZA 1TDIA 4E8HA 2CVKA 3GRXA 1T3BA 3G7IA 1H4OA 2ES7A 4XS1A 4XHMA 2RLIA 1I5GA 3QDNA 2H1BA 4DSSA 4PNGA 5EVOA 3QR6A 4FYBA 1BYEA 1PQNA 2R4VA 1F9MA 3C73A 3H93A 2HYXA 4RQXA 5EPFA 4V2NA 3H1NA 4JZQA 22GSA 2EIRA 1XXUA 1S3AA 1AUCA 3IAM2 4K7NA 5E59A 1G7EA 5ENUA 2HLSA 4IGJA 2RUEA 2I1UA 3F3QA 2XHFA 9GSSA 2I9HA 4KDUA 3KXOA 2H01A 2GVPA 4FH8A 3IAS2 4NV2A 3NOFA 3ME7A 4KSMA 1GP1A 3GMFA 4G0LA 3L9VA 1J9BA 4KDYA 1URMA 4Q5NA 2LUSA 4H86A 3F3RA 1MDKA 3GURA 4MK3A 6GSXA 4G19A 5ECHB 4BVYA 1TRWA 3UAPA 5ECQB 2CV4A 4MJAA 2LV3A 2H1GA 1PA3A 3QAGA 5ECSA 4GWRA 4MJEA 1M2BA 4KUNA 3PPUA 4IW9A 1PL1A 3LXZA 3DWVA 2F3MA 3ZREA 1EZKA 3GX8A 5HR2A 3TRXA 2ALBA 2CX4A 3VI5A 1XWAA 2VL2C 3C71A 2IMIA 2CZ2A 4MZWA 2Z9SA 4K6XA 4L5LA 4RI7A 4TR3A 3FZ4A 1VF3A 3WD6A 4ULXA 1A2MA 1H75A 5CRHA 4KE3A 2L57A 2HI7A 2V2GA 1FVJA 3UL3A 3CRTA 1WOUA 1PX7A 2H75A 3C1SA 1AW9A 2AB6A 4OD7A 4KDXA 2FD3A 1S3DA 3UJ1A 1RK4A 3HVSA 2QSIA 3P7XA 2DJ3A 2PVOC 4IHUA 3UARA 3V1WA 2F51A 4MF7A 2YJHA 3GA4A 4BWSA 2NPBA 4IBPA 14GSA 2MMOA 2GS3A 4IP6A 4OMVA 1WP0A 5CNWA 4MZCA 4IJ3A 1XW6A 2JZTA 3WT1A 5IO2A 1DE1A 5A4UA 5ECRB 4EVMA 3UMAA 4O92A 3HDCA 1XBSA 3QCPA 2PBJA 3ERGA 4K0NA 1YEPA 3UOMA 1XVWA 5JCGA 4HQZA 4X0XA 3FR3A 3L9UA 2HZEB 2VM2A 4LL4B 1SU9A 3GH9A 4I2TA 5B8BA 1OKDA 4X43A 4GSNA 2I81A 3QFBC 1FAAA 4RI6A 3UVHA 2P31A 2VD1A 4POBA 2C3QA 2MYGA 1U88A 1GUKA 1WE0A 2F9SA 4OFMA 4AJ8A 8GSSA 3HVVA 3ZTLA 1I9DA 1OAZA 3MAKA 2OE1A 2ZCTA 1QFNA 2PN8A 4YH2A 4K7IA 4HU9A 4G0IA 2TRCP 3GNJA 2HZFA 1ZL9A 4XRDA 2EIQA 3S9FA 5G2ZA 2N5FA 2UZ8A 3OR5A 1ILOA 2L59A 3CSJA 3IC4A 5A4VA 3P90A 3RHCA 1FO5A 2DMMA 3HA9A 1VRSD 1MDIA 1TTZA 3VI7A 4E8EA 5H5SA 3BOAA 3F6FA 3KTBA 4TXVA 5IIZA 2VCQA 2OJLA 1THOA 2KOKA 3C8EA 5HR0A 1SL2B 4FO5A 16GSA 5G31A 2IMKA 4OO4A 2FWFA 1SL1B 3IDVA 4K2DA 5AISA 3ZVJA 1MDJA 1A8YA 3D6IA 2GZZA 2CA8A 3F4RA 4V1Ag 1GLQA 4ZB9A 2KP1A 3GUSA 5ECMB 1ERWA 4FYUA 1DBYA 2HRFA 2GT5A 4EDYA 4F9ZA 1PD21 2MMAA 1E6BA 2E2GA 4MH3A 3LQ7A 4YAPA 5IMAA 2LJKA 1PX6A 1K0DA 2REMA 5C00A 2OBIA 1ZZYA 4L0UA 1EEJA 2O89A 2XPEA 1ST9A 18GSA 2HSYA 1C72A 1GNWA 4WEYA 2PU9C 2JADA 1GL8A 3FZ5A 3GN3A 5IMVA 5DCHA 3HJOA 3NIVA 2HXKA 2H0GA 5B6NA 3KTLA 5EL8A 3DGQA 4ACSA 4IS0A 5HFIA 2A2RA 4CW9A 2P0GA 1SKRB 2XC2A 12GSA 3EURA 5F0GA 4MF5A 3D22A 3FY7A 3I43A 4NPBA 2QGVA 1A23A 2P5QA 2GZYA 4ZBAA 1HQOA 1V2AA 4BWQA 3HKRA 2O87A 2MBSA 11GSA 1UC7A 1X9SB 3SWLA 4GSSA 4KA0A 5H5RA 3KZQA 4IELA 2GQKA 4NWYA 4TVEA 3I9V2 1Z5YE 5BMUA 2IMEA 2GQMA 1JZWA 1YEXA 5DDLA 2VLTA 5KN2A 2HSMB 3EMPA 1W89A 4MJBA 1GSYA 2V6KA 4ZILA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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