3LXZA

Structure of probable glutathione s-transferase(pp0183) from pseudomonas putida
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
b'SLKLYGFSVSNYYNMVKLALLEKGLTFEEVTFYGGQAPQALEVSPRGKVPVLETEHGFLSETSVILDYIEQTQGGKALLPADPFGQAKVRELLKEIELYIELPARTCYAESFFGMSVEPLIKEKARADLLAGFATLKRNGRFAPYVAGEQLTLADLMFCFSVDLANAVGKKVLNIDFLADFPQAKALLQLMGENPHMPRILADKEASMPAFMEMIRSG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of probable Glutathione S-transferase(PP0183) from Pseudomonas putida
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase family protein
source organism Pseudomonas putida
molecule tags Transferase
total genus 67
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3lxzA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3lxzA01
3IAM2 3ZTLA 1ZL9A 2R37A 4KCEA 2WS2A 5ECNB 4ZL8A 1GSUA 2GSSA 4KAEA 3FYGA 1YDKA 4IS0A 2GQLA 4N30A 4G19A 2DJ0A 5ECSA 2PMTA 3IPZA 1M2BA 2R4VA 3EMPA 4K0NA 4L5LA 3GTUB 1WRYA 1FB6A 2X8HA 4IHUA 2PVQA 3N5OA 1PQNA 2YCDA 2IN3A 5GZZB 3FZ5A 1AUCA 1EEJA 1V57A 4KA0A 1DSBA 2YV7A 5IM9A 1T7PB 4KF9A 1X5EA 4K7NA 3S9FA 5J41A 1GUKA 4BWQA 1OC3A 2HE3A 3PINA 1GNEA 3IOSA 2P0GA 5IO0A 2B5EA 2AB6A 4I6XA 3TJJA 2DBCA 1ERUA 4MP4A 2VL2C 4I2TA 2EIRA 3D4MA 3ZMKA 1ZOFA 1IYIA 3H8QA 4ACSA 4KSOA 1F37A 3UIWA 4JRRA 2EIQA 4PQIA 2LRTA 1YF0A 3DYRA 2IMKA 2KUCA 2I9HA 5G30A 2HZFA 1A8LA 1JZRA 5IO2A 4EL1A 4GSTA 2HZEA 4MLYA 5HR1A 3M9KA 3TKSA 3RDWA 3VLNA 4HS1A 3IC4A 5J9BA 4AJ7A 7GSSA 2CVDA 5EL8A 2O7KA 3EURA 1OKDA 1YJ6A 4LMWA 3GYKA 3KJYA 1AQVA 1WJKA 2P31A 1XW9A 4F0BA 2IFQA 4HU7A 1ZZYA 2GT6A 1A23A 1K0DA 4ID0A 3L9SA 3HZ8A 5ID2B 1OAZA 2GQKA 3E3EA 1B4QA 4L5OA 2FD3A 1VF4A 3GL3A 1JHBA 1G6YA 1QXHA 1RK4A 2VCWA 5L71A 2JADA 3LEFA 4TR1A 3UJ1A 2RLIA 3DIEA 4MZWA 1R5PA 5KN2A 3APOA 2HRKA 2CV4A 4N10A 2H73A 1GNWA 1HYUA 4XS6A 4EE0A 4TXOB 2X8GA 2YWMA 2H70A 5LCZA 4AJ6A 3H93A 1XWAA 5G2ZA 1VF1A 3C8EA 2ZNMA 4ML6A 2DJKA 3DRNA 4KCAA 2DC5A 12GSA 3MDKA 4MF6A 1XVWA 4AGSA 2NPBA 4ILFA 2GTUA 2FWGA 2F8FA 1VF2A 1JLVA 8GSSA 5DJMA 3IC8A 3NOFA 2XC2A 4POMA 1GL8A 1K3LA 2MMZA 5G31A 2AV4A 4TKYA 3SBCA 1T00A 1O8XA 1GULA 2E7PA 5B8BA 1EWXA 2MBSA 2NVLA 3QD9A 2H0GA 4MZCA 3F0IA 5AISA 1M7TA 4FQUA 1UVZA 4PTSA 1GRXA 1WOUA 3E9JB 5DDLA 3LJRA 3IRAA 1THXA 5H5RA 3ERWA 4GWRA 1G7OA 1SU9A 2H75A 2B6MA 2L6CA 4GQFA 2DMMA 1T4ZA 3M9JA 3DD3A 4YQMA 1JFUA 3LWAA 3HJMA 4O32A 2JZTA 4IBPA 3TDGA 3L78A 1PSQA 5AN1A 2FCHA 4J56E 3VURA 1Z7PA 3HCZA 1TW9A 5CO3A 5CNWA 3GTUA 4TR3A 3L9UA 2LKUA 4EVMA 1GSQA 4K8MA 4RQRA 5IMDA 4HJ2A 2FHEA 1MD4A 1W89A 4HQZA 1B4PA 5IQYA 2I3YA 5AIVA 4K7OA 2PVOC 5DQYA 3ERFA 4F0CA 3CRTA 4KUNA 4MH2A 2YN1A 4MF5A 2DIYA 2OJLA 1K0CA 4N0VA 3ZMLA 3BOAA 3TJGA 2H66A 2K9FA 4F2IA 1U88A 2C4JA 5F06A 4HJMA 2HYXA 2WRTA 1H75A 2H1GA 3HHVA 3R3EA 2IIYA 1Y6EA 2XPDA 1M2DA 1GTAA 1EV4A 5ECPB 1QMVA 2PERA 2YWNA 1LJRA 3NIVA 3ZIJA 4NHZA 3IR4A 3IAS2 5D73A 1Y25A 5JCUA 4KGIA 4G9HA 3I6AA 5ECLB 5ECRB 5JWQB 2GQMA 3IHQA 3W6GA 2R6KA 1R26A 2IWTA 5GSSA 1JZWA 5A4UA 4BA7A 5JCWA 2JSZA 3ISOA 5HQPA 2K18A 3J7Yb 3F4SA 4CHSA 2F8AA 4GLTA 5ID2A 1HD2A 2H71A 4JU5A 2H6YA 3KTBA 4OCFA 3ZREA 2DIZA 3GKNA 1H4OA 3KMNA 2GS3A 2WULA 2BMXA 3FZAA 1B9YC 5FHIA 1HNCA 1NW2A 4LL1B 5LD0A 1SKSB 1CQHA 2JZRA 1MD3A 4JBBA 3RHCA 1AQWA 4TXOA 2FUG2 3LQ7A 2QC7A 2HFDA 4JR4A 2GVPA 1OE7A 4XRAA 4YAVA 2LJAA 5KN0A 1Z6NA 5IMCA 9GSSA 4JR6A 4IELA 3TRXA 4TRXA 3RPPA 2VD1A 1BG5A 1TP9A 1K0NA 2N5BA 2J9HA 1VF3A 3QPMA 2FNOA 2DJ3A 19GSA 2CZ2A 1WMJA 1XXUA 4GTUA 3QFAC 1O6JA 2A4VA 2AHEA 4BL7B 3P7XA 1OE8A 2M46A 6GSSA 1SKRB 4USSA 4IQAA 3WGDA 3U5RE 1XCCA 1U3AA 2FA4A 4MA9A 4ZILA 2IJYA 3FKFA 3GUSA 1TOFA 1M2AA 2WGRA 3F3RA 1TI1A 2H76A 3ZIVA 1RQMA 16GSA 3C71A 3H1NA 4IVFA 1OC8A 1JLWA 2JL4A 3GRXA 2HRNA 5DQSA 3UVTA 5G5EA 4HDEA 2L57A 4BPYA 4PNFA 1BQ7A 2ZUPA 1O85A 3GX0A 2L5LA 3TKRA 4GF0A 3GKKA 3UMAA 3LORA 1GSYA 1SJZA 1N8JA 2OACA 6GSVA 1PKWA 1M9AA 1K0OA 2XHFA 3H79A 2MMNA 1PGTA 3GIXA 4K7IA 2XBQA 3U6VA 4JZQA 4PGTA 2RIIA 3FK8A 1O81A 3ME7A 2N5FA 2LRCA 5CAXA 1O7UA 1TRWA 2OE3A 4Q5FA 3LFLA 1PRXA 1XWGA 5F8BA 3GH9A 10GSA 2CVBA 1WP0A 1GSSA 2OBKA 4AJ8A 1SK1A 3C1SA 1WE0A 1AC1A 5FWGA 6GSTA 4LA1A 3FHKA 4K0GA 1AW9A 3KZQA 1G7EA 5A4VA 3APQA 2CVKA 1YEPA 1AAZA 2WJUA 2VL3A 3CMIA 2CAIA 2LJKA 4EC0A 1ERWA 4FYCA 2YZHA 2A2RA 2V32A 2K6VA 4MJCA 3WGXA 2DSAA 2PWJA 1SK0A 5G1LA 2G0FA 5CREA 4Q5RA 3G7JA 3WGEA 4GCIA 2VLTA 1T1VA 2F3MA 1QQ2A 1X9MB 2YZUA 5IPGA 4MABA 4ULXA 4DVCA 2H0IA 4K1FA 1THOA 1SJIA 4PX1A 1Z5YE 3GV1A 4OD7A 1XIYA 2GSTA 3DEXA 3TJFA 2B1KA 4CDOA 5COHA 4OCEA 4GRFA 4NXIA 3D22A 3ZYWA 4O7HA 2NDOA 5IMFA 2GT5A 2IMFA 1GSEA 20GSA 3IK9A 4PURA 3FEUA 1Z6MA 4PQHA 3IBHA 2E2GA 4BVYA 3EU4A 4I2UA 3APSA 3P2AA 5H5SA 2VD0A 2RM6A 3F3QA 3RPNA 3KTLA 1EZKA 3BCKA 2TRXA 5A4WA 2VLUA 3EWLA 3O6TA 5ENUA 2WCIA 2X64A 1XFLA 5LNKe 4NWYA 4BVXB 4X0XA 2OE1A 1FVKA 2YWIA 1BYEA 3HYPA 3HA9A 4WKWA 2VOCA 1TJDA 1GSFA 1X0RA 4OMVA 4DSSB 4BL7A 1TRVA 3VWXA 4ECBA 1F9MA 5DCGA 2C80A 3FR9A 3SWLA 2M72A 3EC3A 4G2EA 1MDKA 5DVBA 4K2DA 1ZYEA 3L0HA 4ZBBA 1OKTA 3NZNA 4QL7A 1S3CA 4MK3A 4KDUA 1TXXA 5B6NA 2P5RA 4IN0A 3BD2A 4XRDA 5ABRA 2H6ZA 2HT9A 2C0EA 3BJ5A 22GSA 2FWHA 2AYTA 5DALA 1ILOA 3GSSA 1IYHA 3IA1A 5AGYA 4IP6A 3TOUA 3GH6A 3KGKA 3ME8A 3D6IA 3ZITA 2C8UA 1U87A 3QAWA 2M80A 2KHPA 2VM1A 3MAKA 2JACA 2H19A 2O89A 5EY6A 1I9DA 2CZ3A 2LUSA 3KP9A 3KH9A 2CX4A 1LBKA 2F51A 3LXTA 5F05A 18GSA 1TDIA 2L4CA 1B9XC 3RBTA 4LLRA 2H1AA 2GSRA 1ZYQB 5AIXA 2ALBA 1YQ1A 5D9XA 2TIRA 1TI3A 6GSUA 2V6OA 2P5QA 1V98A 5HFGA 1A8YA 5C04A 2VCQA 1FW1A 1R4WA 3M8NA 3KM6A 3FY7A 3MWHA 3W8SA 1GTBA 4DSRA 4X1UA 1SD9A 2MBTA 5ECQB 1TRUA 2J23A 4HQSA 2O85A 3BCIA 1YY7A 1OVNA 4WF4A 3UBKA 2LS5A 4ZB6A 1SK2A 4N0ZA 4LL4B 3ZL5A 4GSNA 2BTOT 1LU4A 4PUFC 4XS4B 1S3DA 2EC4A 2B7JA 5ECKB 1X9SB 1BJXA 2NBSA 3Q19A 2ES7A 4WBJA 2CA8A 4JEDA 11GSA 3VWVA 1XOBA 1YEXA 6GSYA 1PX7A 2I1UA 3MSZA 2IMEA 4NV5A 3CSIA 2C0DA 4KH7A 3RAZA 1VGLA 3J7Yk 4ISDA 4PXOA 1ZCPA 1B8XA 3TKSC 4KDYA 2IPAA 4MJBA 4IP1A 4N11A 2FLSA 5ECMB 2CX3A 4KW6A 1TK5B 2WDUA 4AF2A 5D8IA 3AY8A 2WFCA 3UAPA 4V2MA 3VPQA 1FG4A 5DCHA 1YKAA 3UOMA 1MTCA 4BVXA 3GKMA 4NAXA 1VRSD 1DE2A 2HSMB 5IPHA 2IL3A 1GLQA 2B3SA 4XIHA 1R5AA 1Z7RA 3EU3A 3GA4A 1JZDA 1XZOA 4TN8A 3VFIA 2L59A 1GSDA 3LXZA 3WD6A 4HU9A 1HQOA 2VM2A 1R7HA 3QFBC 4WF5A 5JCGA 3VWUA 4HI7A 1QFNA 4OO5A 1ON4A 2YP6A 3C1RA 2K8SA 2HQTA 2XPEA 3ZFBA 3O76A 3LYPA 4HZ4A 4KE3A 5IMAA 3PPUA 2B7KA 1BX9A 5KN1A 1GTUA 4HEA2 2H01A 3Q18A 3EYTA 4PQ1A 5INYA 3OR5A 4EXJA 3KP8A 4IGJA 3TKQA 3A5WA 4WR4A 2JSYA 3GFKA 4DEJA 3FRCA 3C73A 4TOPA 3HY2A 1RW1A 5EPFA 5ELAA 1A2LA 2OADA 1NHYA 2QSIA 4V2NA 4Q5NA 2MMOA 3TUEA 1PMTA 1OYJA 2LQOA 3W8JA 2H74A 2H6XA 1SL2B 4H86A 4XCSA 1SKWB 4HOJA 1PL2A 3I9V2 1ERTA 2O8VB 5JWRB 3ED3A 1TKDB 3UL3A 1B48A 4O5RA 4F03A 2R2JA 3GN3A 5IOWA 1J08A 2L6DA 1A0FA 3BBYA 1ZGNA 4ZB8A 4BWSA 1NSWA 5HR2A 2HI7A 2H30A 5IMVA 1YZXA 4YQUA 2ON5A 3Q6OA 2VIMA 2FY6A 1M0UA 1BAYA 4GQCA 3LSZA 4F82A 2BJXA 2YOIA 4NV2A 1M99A 1Q98A 5ECHB 5F0GA 3N9JA 3FZ4A 3GX8A 2VCZA 2L4QA 3GKXA 4GSSA 4ZIJA 1S3AA 4XS4A 1BEDA 4O92A 1DBYA 3M3MA 1FAAA 3UBLA 5GAND 2F9SA 4E8EA 4FH8A 4IKHA 1QGVA 1T3BA 1FHEA 3ZRDA 4WEYA 4WR5A 2JU5A 3E0UA 4EUYA 5E59A 1EP7A 2IMIA 3FZ9A 3WT2A 2C3NA 3TKPA 4XS1A 4L8EA 4V1Ap 2HSNB 2LQQA 5ECOB 1EGOA 4FIWA 1AQXA 5CRWA 2C3TA 1MDIA 2LNSA 3F6DA 1PN9A 1I5GA 2LV3A 4EO3A 4HZ2A 5J5NA 1ST9A 2IMDA 4POBA 2RUFA 2VL9A 2EIOA 1EV9A 4KX4A 2H1DA 3HVVA 3PGTA 3G7YA 6GSXA 2K8VA 2HSMA 3FR6A 2LTKA 4D73B 5G1KA 3TRQA 2NTOA 3CTGA 4NMUA 4G0KA 3HKRA 5B7CA 5EVOA 2QKEA 4WBRD 4PNGA 3A2VA 1TRSA 4XTSA 3P8WA 2VCVA 5IOXA 2G2QA 2OE0A 1JZOA 3KXOA 1EOGA 2H1BA 4V1Ag 4MCUA 2RM5A 1T4YA 3HJOA 3ZFLA 2ZCTA 3KCMA 3DMLA 2OKAA 1DE1A 3K8NA 1F3AA 3EVIA 4WETA 1KBNA 4IQ1A 4HUAA 3DKSA 2B5YA 4TW5A 3VI7A 3DVWA 3EE2A 1F2EA 1E6BA 3I69A 4G0LA 3HVSA 1XWKA 2CQ9A 4Z7XA 4FYUA 4K9ZA 4L0UA 2GZPA 3TKSE 4ECJA 1ML6A 2V6KA 3HJPA 4KDXA 4J2FA 2HXKA 1GUMA 3F4RA 3QAVA 1SJ6A 1F3BA 4OFNA 4G0IA 3C7MA 4POKA 5D96A 2B5XA 2OA7A 4ZL7A 2PGTA 1J0FA 3GHAA 2TRCP 2FWEA 4WXTA 4G10A 1NM3A 3VWWA 3HZ4A 4ML1A 4YH2A 1SYRA 1OC9B 5FT3A 3F6FA 2O87A 2FA8A 5DBQA 1A24A 2V2GA 4ZBAA 3QR6A 3DXBA 3L9VA 5GAPD 5HFIA 4MDCA 2WZ9A 2GZYA 1FB0A 1PA3A 2R5GA 5B6MA 3VK9A 1YF1A 4F9ZA 1MDJA 3VPTA 4ZB9A 1PD21 3VI5A 2KP2A 5CRGA 1V2AA 4EDZA 1GUHA 3F4TA 1O8WA 4POLA 1XWCA 1ERVA 3M0FA 1U3IA 1GWCA 3EINA 4RQXA 2VCTA 3QAGA 5G5FA 1DUGA 2H0HA 2KLXA 5DAKB 1TU7A 1G6WA 2HNLA 4KSMA 2JZSA 3CSHA 2MZCA 5DJLA 4OFMA 2LSTA 5CYYA 3CTFA 1XVQA 2GDRA 1A0RP 2FWFA 2CT6A 5CRDA 4ECCA 1NHOA 13GSA 3QDNA 3GURA 5BMUA 2ON7A 3F8UA 5D9TA 5IIZA 4YAPA 2YJ7A 1F6MC 1G0TA 4L0WA 4MH3A 3CXGA 3CRUA 2HLSA 5CRHA 1EOHA 4KB3A 4MPFA 1V9WA 1PL1A 1J9BA 1SD8A 2PPTA 2REMA 1EGRA 4V2LA 1TK8B 3FR3A 2GZZA 3KIJA 1O73A 1CQGA 3ZVJD 3HXSA 2VCXA 1TTZA 1K0MA 1KTEA 3CBUA 3GL5A 5J3RA 1GP1A 1X9WB 2PUKC 3I43A 3Q74A 2A2SA 1Q4JA 2C0FA 3QMXA 2PU9C 4ZXGA 1GLPA 2YWOA 5D9WA 2QGVA 3IXRA 3MNGA 5J4UA 1Z3EA 2HSHA 1K0BA 2D2ZA 5C00A 1FOVA 4D73A 3R2QA 3KEBA 1GH2A 3KMOA 4J57E 14GSA 3HDCA 4MMMA 1K0AA 1UC7A 4IJ3A 3GMFA 4MZBA 2C3QA 2MYGA 4IW9A 2YV9A 1SENA 3D21A 3DWVA 1PKZA 1AXDA 4NPBA 3PR8A 3HD5A 1WWJA 1FVJA 1WIKA 1HNAA 5JWOB 2KOKA 2FGXA 2AAWA 3GNJA 2YANA 4OO4A 2E2MA 2UZ8A 1TU8A 1K3OA 2VO4A 1W4VA 2YNXA 4TVEA 4EKZA 2MMAA 3IDVA 2AUVA 3US3A 1UN2A 1TK0B 2DJ1A 2Z9SA 3V1WA 1PX6A 1EP8A 2C1YA 3IV4A 3RHBA 4OFTA 3TCOA 2V41A 1FO5A 4PUAA 2GSQA 2KP1A 4KNDA 5CP1A 5D93A 1KNGA 1E2YA 4MPGA 3P90A 3JCML 4Q5QA 3CYNA 4X43A 1AIUA 3O3TA 5ECIB 2DLXA 4NHWA 3KH7A 5HFKA 1XW5A 3GSTA 2PN8A 4DSSA 3TJKA 2H8LA 3TGZA 2PBJA 5GSTA 2OBIA 1OC9A 3M1GA 2HRAA 4EDYA 3A2WA 3FW2A 1XWBA 1QK8A 3F9UA 1XOAA 5J9CA 1C72A 2VL2A 4DSQA 1T8EB 1ZMAA 4I97A 1XW6A 1XBSA 3TRPA 5ELGA 3G7IA 2V1MA 2R3XA 2DMLA 4TR4A 4BVYB 3ZZXA 4XHMA 1SYXA 4ZL9A 2HZEB 1USBA 2VAFA 1A2MA 5IMZA 1WPIA 1UA5A 2LRNA 3PH9A 5F07A 3QOUA 1X5CA 5H5QA 1A2JA 3EMXA 1K3YA 3DVXA 1Z9HA 2XBIA 6GSWA 4OWYA 5DAKA 2IFQB 4FO5A 4LMVA 3UVHA 2LEGA 3H4KA 3IK7A 4IJIA 1XPVA 3IE3A 4FYBA 4TXVA 3DGQA 4MJAA 4EF0A 2X99A 3WYWA 4TR1B 2VLVA 3ZLPA 2YPMA 1M9BA 3TB2A 2HRKB 3UARA 3A2XA 1ACVA 4MJEA 2DJ2A 2HSYA 3L4NA 4JE1A 1N2AA 3UEMA 3ZVJA 5E4WA 2LJRA 1KEBA 4I8BA 3WT1A 2RUEA 1MEKA 2X8CA 4TR0A 4CW9A 2DJJA 3G9BA 3LG6A 3LYKA 4E8HA 5DALB 2I81A 3KD0A 4K6XA 3F63A 1EEMA 1X5DA 3TJBA 1SL0B 2GGTA 4GXZA 1SL1B 1U6TA 2CAQA 3CSJA 3ERGA 5B8AA 1QUWA 5KEJA 2YJHA 1HNBA 2B1LA 4I5QA 4RI6A 3LGCA 3A3TA 3D4TA 4MF7A 5HR0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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