3LXZA

Structure of probable glutathione s-transferase(pp0183) from pseudomonas putida
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
SLKLYGFSVSNYYNMVKLALLEKGLTFEEVTFYGGQAPQALEVSPRGKVPVLETEHGFLSETSVILDYIEQTQGGKALLPADPFGQAKVRELLKEIELYIELPARTCYAESFFGMSVEPLIKEKARADLLAGFATLKRNGRFAPYVAGEQLTLADLMFCFSVDLANAVGKKVLNIDFLADFPQAKALLQLMGENPHMPRILADKEASMPAFMEMIRSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of probable Glutathione S-transferase(PP0183) from Pseudomonas putida
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas putida
molecule keywords Glutathione S-transferase family protein
total genus 67
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3lxzA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3lxzA01
1GSUA 4MZBA 4AJ8A 1GRXA 4ZXGA 4NV5A 1JZOA 4OWYA 4F82A 3Q19A 2OA7A 2VM1A 2B7JA 5JCWA 2NDOA 3BOAA 2OBIA 2F51A 1SK1A 2KHPA 1U87A 2I9HA 2YNXA 1JFUA 3G7JA 1AUCA 5H5QA 1M0UA 4POBA 5ID2A 1B48A 1PQNA 4MPFA 1XBSA 4DSSA 1PL2A 2HQTA 3M8NA 2LJRA 1MD4A 4PURA 2K18A 1Z9HA 2CA8A 1R5PA 3RPPA 3SWLA 5D73A 2REMA 4HZ4A 1V58A 1SL1B 1V40A 2L5LA 4YAPA 3D4TA 4AJ7A 1JZDA 3GX8A 1SYRA 2E2GA 1B9YC 2V6KA 4OCFA 5B7CA 4TR0A 2HSNB 3ISOA 1PRXA 4HS1A 3WYWA 1QQ2A 3BCKA 2IMFA 1UN2A 4OO4A 2C3QA 1OC8A 4AF2A 2I1UA 2VL2A 1Y25A 1WRYA 3WGEA 1GNWA 1M2BA 19GSA 1MD3A 5F05A 5JCUA 2YWNA 3W6GA 3LEFA 1AXDA 3KCMA 3TKQA 2VLTA 3LXZA 1XVWA 4KCEA 1XWCA 2HSYA 2VD0A 1NSWA 2GSRA 3HVVA 4TN8A 2XHFA 2PUKC 1R26A 1B4PA 4PGTA 2XPDA 2YPMA 5DQSA 1FG4A 2A2RA 5ECPB 2H19A 2L6CA 2LV3A 3C1RA 5J9BA 4TVEA 4MP4A 4E8HA 11GSA 3KH7A 3KGKA 1ILOA 1W89A 1PL1A 1FO5A 1F37A 1S3DA 4IW9A 1FW1A 1YQ1A 2H71A 6GSWA 1TKDB 2Z9SA 3TKSA 2XBQA 1GTBA 3CTGA 5IQYA 3P90A 2GSTA 3UIWA 3GH6A 5B8AA 3HJOA 4ZBAA 5ABRA 2LRTA 1DUGA 5G30A 1EZKA 3ZL5A 5IMAA 4KCAA 3WT2A 1A2JA 4K7IA 4J2FA 3QD9A 1EWXA 2C0FA 3F8UA 2P0GA 3UBLA 4WETA 1QFNA 1SL2B 1VGLA 1VF3A 2I3YA 4J57E 5FT3A 2MYGA 1I9DA 2IMDA 1OKDA 4MH2A 2R37A 4Q5FA 3UL3A 3QFBC 1TI3A 2EC4A 1T3BA 3GKMA 1FVJA 1SJZA 4F9ZA 1AQVA 2GTUA 4HJ2A 2FWEA 1QK8A 4ZL7A 5CRHA 5DQYA 3WGDA 4XS4A 5GSTA 2AHEA 4JE1A 1ZYEA 4HJMA 1X5EA 1X9SB 3ZREA 5ECKB 1G6WA 4MJBA 1JZWA 3FRCA 1WMJA 1YEPA 1XW6A 3JCML 3L9VA 4YQVA 6GSXA 3LSZA 4BVXA 2V32A 1Q98A 3CYNA 2KOKA 2LS5A 3CRUA 3TRXA 4O5RA 2FWGA 2PMTA 5DCGA 3R3EA 2YV7A 1XFLA 4K6XA 4FO5A 1YY7A 3VURA 5JWOB 3BBYA 5IMVA 4RI6A 3FR3A 5F07A 3E0UA 4G10A 1YZXA 4PXOA 1HYUA 2H0IA 1SKSB 2DIZA 2ALBA 2AV4A 4ZIJA 1TI1A 1GUMA 2LQOA 4MJAA 5AIVA 2H1AA 4F2IA 1YJ6A 2HRNA 1M7TA 2B5EA 3QOUA 3ED3A 2O87A 2I81A 5IMFA 4G0LA 2NVLA 1H4OA 4FIWA 1F3BA 2VCZA 4IJIA 4O92A 9GSSA 1EP8A 3DVXA 3RPNA 3PPUA 4EDZA 1U3IA 1LBKA 3GURA 5J5NA 2L5OA 4TKYA 5LCZA 2RUEA 3U5RE 2CV4A 2QSIA 3APQA 3DKSA 1NHOA 4MCUA 1J9BA 1UC7A 4FQUA 1URMA 2YP6A 2CAQA 4N0ZA 3R2QA 3FR6A 3GV1A 4IGJA 4GWRA 4EO3A 4OFNA 3GH9A 4NPBA 1A2LA 1AQXA 4IELA 1G7OA 1K3YA 3D5JA 4HUAA 3LWAA 5J41A 4K0GA 1YEXA 4L0WA 2BJXA 2CVKA 3GFKA 3RBTA 5IIZA 5IMDA 3ERFA 5A4UA 3CSIA 3ZRDA 3EU4A 4ACSA 5IPHA 2GQLA 2FNOA 2R2JA 1VF4A 1K0NA 2LRCA 2R4VA 2IMIA 2OADA 4NAXA 2XC2A 4EKZA 1Z5YE 4FYBA 2LRNA 4WF4A 4IP1A 1UVZA 4PQ1A 1GTUA 4TR1A 1MDIA 1XVQA 2IMEA 4D73B 1R7HA 4MMMA 2GT6A 1GLQA 2HT9A 4JR6A 1FVKA 5BMUA 4IP6A 3H1NA 1BX9A 4F03A 2HFDA 1AAZA 1HNAA 3Q74A 2OBKA 3DYRA 1E6BA 2FWHA 1WPIA 4L5OA 2H73A 2C8UA 4GTUA 4LL1B 1PX7A 1OE7A 2FY6A 4PX1A 3KM6A 3IV4A 4ZL8A 1GSSA 3NOFA 5LNKe 3CXGA 2LNTA 2MMOA 2X64A 3ZFBA 3IRAA 1O8XA 2G2QA 1TRVA 3M1GA 5G5EA 4ISDA 2VAFA 3KIJA 3GTUB 1WIKA 2CQ9A 3MSZA 5DVBA 4V2NA 1W4VA 4F0CA 5KEJA 2X8GA 3IXRA 4IJ3A 3HZ8A 1ZL9A 2M72A 3ZVJA 5B8BA 4LMWA 4N11A 2LKUA 3GN3A 5CRWA 4MF7A 5ECIB 2FA8A 4GQFA 1BQ7A 2VL9A 2A2SA 5IPGA 2X8HA 3VK9A 16GSA 4ECBA 4K0NA 4TRXA 3HCZA 3DVWA 3CSJA 4WR4A 1TRSA 5DAKA 4HDEA 1FB0A 3VFIA 2H70A 1K3LA 5HR0A 3ERGA 3MAKA 3RHBA 1UA5A 2B3SA 3IPZA 3KTLA 3WT1A 5ECNB 4MA9A 4MPGA 2VLVA 2X8CA 3F9UA 2FWFA 1PA3A 2HRKB 1U88A 4RUVA 3QPMA 4BA7A 2KUCA 4I2TA 3IOSA 4KX4A 2WULA 1AQWA 2JL4A 3TGZA 3ZTLA 4HQZA 3ZYWA 1OC3A 2H0GA 1X9WB 4ZB6A 3P8WA 1TRUA 4LLRA 3UMAA 2VCVA 2AYTA 3EVIA 1M9AA 2HYXA 3J7Yb 5GSSA 2PPTA 2HZEA 5INYA 1FHEA 3G7YA 3FR9A 1NM3A 2KP1A 1GTAA 5F0GA 2KLXA 3HVSA 3F4SA 3GUSA 4BVYB 1TW9A 1KTEA 1JLWA 2RM6A 2F3MA 4MF6A 4ZBBA 2OACA 4EL1A 1T4ZA 4ID0A 3GNJA 4CW9A 3EWLA 1A24A 2VD1A 5AIXA 2EIQA 4L5LA 3TKSE 3N9JA 4Z7XA 3TJBA 1IYIA 3ME8A 1J0FA 4BPYA 2GSSA 5G1KA 2VCQA 3KZQA 1F6MC 5JWRB 4XS6A 3PINA 2VO4A 2ON5A 2VIMA 2H75A 4K7OA 3KP9A 1GSQA 20GSA 2HRAA 1C72A 1JLVA 1KBNA 1GP1A 4FH8A 2N5FA 5CYYA 5AISA 2NPBA 5L71A 3Q6OA 2YWIA 4BL7B 4V2MA 4ML1A 2K6VA 3BD2A 4XRAA 5F06A 4TXOB 3VPQA 3S9FA 1V9WA 2IN3A 2C4JA 6GSYA 2CVDA 3APSA 5GZZB 1R4WA 4POKA 1GUKA 4H86A 2HI7A 5DDLA 3QDNA 3GA4A 2HZFA 1F9MA 1B9XC 1QUWA 3F4TA 4N10A 3QR6A 2F9SA 2H1GA 5JWQB 4LL4B 4IKHA 4ML6A 5H5SA 3GL3A 4V1Ag 4N0VA 1MTCA 2PGTA 3HYPA 2FHEA 3D4MA 4MZWA 1A8YA 1WOUA 1YF0A 1YDKA 1OKTA 2NBSA 3FW2A 1LJRA 4WXTA 2AUVA 4ILFA 3ZIVA 4BWQA 1O8WA 2WFCA 3GIXA 4OFTA 4KGIA 3KD0A 1XW9A 2L4QA 4JRRA 2VL3A 1ST9A 1DE2A 2YCDA 2L6DA 3C1SA 5E4WA 3M9JA 3DWVA 1SK0A 4KE3A 3FKFA 2H1DA 4EE0A 2DMLA 2VOCA 2IFQB 4F0BA 4IQAA 1V57A 1YF1A 2MBTA 2ZUPA 3O76A 2DC5A 1BAYA 1K3OA 5G2ZA 3EURA 2LQQA 14GSA 1VRSD 4V1Ap 3C8EA 3VLNA 4WBRD 2C1YA 4RI7A 3APOA 3TOTA 3H93A 1ZGNA 1I5GA 2D2ZA 3GL5A 4EVMA 5D9VA 5HFIA 2MMAA 3AY8A 3GRXA 3LORA 1MDKA 4K9ZA 5D9XA 2H6ZA 3UVHA 3C7MA 3GKKA 4V2LA 2DJ1A 1GSFA 4NHWA 4KSOA 2VCTA 1WWJA 3FZ5A 3QAGA 5EL8A 1U6TA 2LJAA 2GS3A 1V98A 3LJRA 1O73A 3M9KA 3Q18A 1ZCPA 1Y6EA 3IR4A 4MJCA 3UOMA 2CAIA 1BYEA 2HSMB 2GZZA 5IO0A 3QFAC 1K0DA 3RHCA 2LNSA 2V41A 5DBQA 4MABA 1TTZA 2WS2A 2TIRA 2P31A 1KNGA 4KDUA 5ECHB 1VF2A 2JZSA 1BJXA 1YKAA 4GLTA 4MH3A 5HFKA 1XPVA 1VF1A 4KSMA 3D6IA 2O7KA 1Z3EA 5HR3A 1EP7A 2I4AA 4IBPA 2CZ3A 2C0DA 5GAND 4E8EA 4K1FA 2WRTA 4EC0A 2FCHA 2HNLA 2EIRA 1THXA 1BEDA 2FA4A 4OD7A 2GLRA 1N2AA 1SD8A 2YANA 5ELGA 3WD6A 3FY7A 4YQUA 3E9JB 5G31A 4I5QA 6GSVA 5D9TA 4RQRA 5CNWA 3GSTA 3IA1A 4KH7A 1ERVA 5CO3A 1WJKA 3FEUA 1QGVA 4MK3A 4GRFA 2B5YA 3VWWA 1Z6NA 12GSA 5ECLB 4XTSA 4EDYA 4MLYA 2JSYA 6GSSA 5EY6A 2DJ3A 1XXUA 3EE2A 2H30A 4ECCA 1OC9B 4JBBA 3NIVA 1T7PB 2MMZA 2QGVA 1EV4A 3F0IA 4GF0A 4XRDA 2FUG2 4NWYA 4PNGA 4JEDA 3A5WA 2B1KA 4QL9A 1F3AA 3F3RA 3US3A 3HJPA 3GKXA 3GYKA 5A4WA 1QXHA 2VL2C 2OJLA 3DIEA 3HDCA 1AC1A 2BMXA 3CBUA 3MNGA 1AIUA 1SK2A 3F6DA 3IBHA 5D8IA 4RQXA 1K0OA 3RAZA 3W8JA 3EYTA 4POLA 3PR8A 1GWCA 1WE0A 5KN0A 4XS4B 1GUHA 1O7UA 5GAPD 1IYHA 2CX4A 2H01A 3IC4A 4MJEA 4KB3A 1GH2A 2C80A 3KJYA 5CRDA 4PUAA 2LSTA 4ECIA 1PX6A 1NHYA 4I2UA 4FYCA 3ZIJA 3KMOA 1ZOFA 4FYUA 1EOGA 3HXSA 5IM9A 3DXBA 1TDIA 4BVXB 2CT6A 4XCSA 3IK7A 3TUEA 2H6XA 3F63A 2GQMA 3IDVA 3LFLA 3TRQA 1H75A 1T1VA 2IPAA 2G0FA 3RDWA 5DJMA 3LGCA 5ECMB 5LD0A 4K7NA 4GCIA 2GVPA 3A3TA 1X5CA 1O85A 4YH2A 4PTSA 2YZUA 2YJHA 4O7HA 3CMIA 3TB2A 1M99A 2WJUA 2OE3A 4EUYA 3ZMKA 1ERTA 4CDOA 2LTKA 4G2EA 4X1UA 3TCOA 2P5RA 1XOAA 1FOVA 3UBKA 3HHVA 3G7IA 3ZMLA 3VWVA 1O6JA 2NTOA 1ON4A 4WR5A 2RLIA 3D22A 2B1LA 4WF5A 5HQPA 1XWAA 1TRWA 1EGOA 2BTOT 1QMVA 1Z7RA 4BVYA 2WB9A 3TJFA 1GULA 3M3MA 2LJKA 1X9MB 4HU9A 2EIOA 2GT5A 6GSTA 1B4QA 1ERUA 3VWUA 3F4RA 5AGYA 4KAEA 2C0EA 1SD9A 1RQMA 2YOIA 3D0ZA 5HR1A 4IQ1A 2ES7A 1V2AA 2E7PA 4K2DA 4IS0A 7GSSA 2YWOA 2DJ0A 2VCWA 3CSHA 5G5FA 4KDYA 3MDKA 1GTIA 2V2GA 1R5AA 4BL7A 1OAZA 2DJ2A 3TKRA 3M0FA 4Q5RA 5D96A 4WEYA 4TXOA 2O85A 3CTFA 4LMVA 5IMZA 2AAWA 2RM5A 3E3EA 3J7Yk 4XIHA 3C71A 3HD5A 1TU8A 2L59A 2YV9A 1TJDA 4TW5A 2HSHA 2P5QA 2RUFA 4POMA 4ECJA 5DALB 3IAS2 1A8LA 1T4YA 5AN1A 5CP1A 2HLSA 1XWBA 4OO5A 3FZAA 1F2EA 3QMXA 2IFQA 1SJ6A 3GMFA 3UAPA 2OKAA 13GSA 1U3AA 5EVOA 4DVCA 2M46A 4GSTA 5CRGA 5IO2A 1HNCA 2JSZA 1MEKA 3PGTA 2K8VA 2KP2A 2J23A 2VUPA 2DSAA 2ON7A 4G9HA 4TOPA 4JU5A 3VPTA 4NV2A 5B6MA 3ERWA 5DAKB 3WGXA 4OMVA 4WBJA 1JHBA 3KXOA 1G0TA 2H76A 1PKWA 4DSRA 2XBIA 3HY2A 2B5XA 4USSA 2HSMA 4XHMA 1K0CA 4HEA2 2WGRA 5B6NA 2O8VB 1X0RA 4I6XA 5J9CA 4GXZA 1TK5B 3IC8A 1XOBA 3EINA 2UZ8A 6GSUA 4ZILA 1SYXA 5G1LA 2LEGA 3I9V2 1SL0B 1JZRA 2LUSA 3IAM2 1DSBA 2PVQA 3FZ4A 3KMNA 2PERA 2VLUA 4KDXA 3U6VA 2JADA 3HJMA 2MBSA 1SKRB 1RK4A 1O81A 4J56E 2JZRA 1XWGA 3LYKA 1TK0B 2N5BA 2HZEB 3VI7A 5A4VA 3FHKA 3UJ1A 4EF0A 1AW9A 3ZFLA 5H5RA 3VWXA 2GQKA 5ID2B 2CVBA 1OYJA 2H74A 2PN8A 1USBA 5KN1A 3A2WA 4DSSB 4PQIA 2GDRA 2C0GA 2HRFA 2DLXA 4ZL9A 2QC7A 2QKEA 4HU7A 5IOXA 2JACA 2TRXA 3H79A 1CQGA 2A4VA 4HQSA 1GLPA 5COHA 1A0RP 1KEBA 2IIYA 4MF5A 4ULXA 1XWKA 3TJGA 4KW6A 1NW2A 1ABAA 1EEMA 1TP9A 3EMXA 1ACVA 1OC9A 2ZNMA 3TJKA 4X43A 3ZITA 3OR5A 1J08A 3KP8A 17GSA 1OVNA 1PN9A 3FK8A 4DSQA 2OE0A 2R3XA 4WKWA 3TJJA 8GSSA 5KN2A 1K0BA 2WDUA 2C3TA 2XPEA 2O89A 1Q4JA 5E59A 4P3YB 4PNFA 1G6YA 4JZQA 2L4CA 3BCIA 4O32A 2J9HA 5FWGA 3GKNA 3QAWA 2FGXA 5FHIA 2H72A 3TRPA 4Q5QA 4NXIA 3I43A 3I69A 1M2AA 2R5GA 2YWMA 2DMMA 1SJIA 1EGRA 1THOA 1GSYA 4OCEA 1X5DA 2CX3A 1K0AA 5CAXA 2DJKA 2MMNA 3ZLPA 2PVOC 1GSEA 4GSSA 1M2DA 2DBCA 1FAAA 2H66A 3H8QA 1A0FA 3P2AA 3DGQA 3L0HA 3O3TA 4X0XA 4PQHA 5HFGA 4ZBDA 5J4UA 3L9UA 4IHUA 3LQ7A 3I6AA 1S3AA 2MZCA 2WZ9A 4KUNA 3IK9A 1XCCA 1ZYQB 2B7KA 3BJ5A 4D73A 3ZVJD 2PBJA 5HR2A 2TRCP 3F6FA 5ECOB 3D21A 4HZ2A 2GGTA 1TK8B 1T8EB 3KTBA 2HE3A 3DD3A 2M80A 2IWTA 4TR4A 1PD21 4YAVA 2VM2A 2H1BA 2B6MA 2R6KA 1ML6A 4DEJA 4G0IA 2E0QA 4JR4A 3HZ4A 2L57A 3ME7A 1DBYA 2PWJA 5ECSA 2GZPA 3GTUA 3CRTA 4AGSA 3MWHA 3TKPA 4K8MA 1K0MA 1N8JA 3EC3A 2H6YA 4I8BA 4BWSA 2OE1A 4KNDA 1SKWB 4CHSA 2H0HA 2FLSA 1PMTA 2C3NA 4YQMA 2VCXA 4HI7A 4ZB8A 3EU3A 4NHZA 3KEBA 2AB6A 3LG6A 3K8NA 3G9BA 3KH9A 2N5AA 4OFMA 3HKRA 1TOFA 3N5OA 2GZYA 3IE3A 3H4KA 5DJLA 5ECRB 5IOWA 4IVFA 2CZ2A 3A2XA 1G7EA 2ZCTA 3HA9A 22GSA 1M9BA 2K9FA 4EXJA 1HQOA 4IN0A 4L8EA 1BG5A 2YN1A 3GHAA 3GSSA 2F8AA 18GSA 3LXTA 1HNBA 1PSQA 1B8XA 3FZ9A 3V1WA 2HRKA 3PH9A 3TKSC 2H8LA 5C00A 3QAVA 1SENA 2V1MA 2WCIA 3IHQA 2X99A 3TOUA 3ZZXA 1EEJA 1TU7A 4QQ7A 3NZNA 1GSDA 3QCPA 1PKZA 1Z6MA 3DMLA 3W8SA 5CREA 4Q5NA 2IMKA 1T00A 1GL8A 4AJ6A 2YJ7A 1OE8A 5KN3A 1YKCA 3UEMA 3GX0A 4LA1A 2HXKA 5DALA 3EMPA 2DJJA 5F8BA 3VI5A 1S3CA 5ECQB 5ENUA 3DRNA 2K8SA 5A5KA 3F3QA 2JU5A 4N30A 4KF9A 3L78A 4TXVA 1EV9A 1A23A 1SU9A 1MDJA 1WP0A 2V6OA 5DCHA 1DE1A 1EOHA 2IL3A 1ZMAA 4L0UA 5JCGA 3A2VA 2YZHA 1A2MA 3SBCA 2F8FA 4MDCA 3O6TA 1PGTA 1HD2A 4I97A 2PU9C 2JZTA 1ZZYA 1GNEA 4GQCA 4G19A 1LU4A 3LYPA 1RW1A 1CQHA 3TDGA 10GSA 2AJQB 4HOJA 4MZCA 3C73A 4GSNA 5D93A 1XZOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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