3LZMA

Structural studies of mutants of t4 lysozyme that alter hydrophobic stabilization
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structural studies of mutants of T4 lysozyme that alter hydrophobic stabilization.
pubmed rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3lzmA00
2OU0X 158LA 1L42A 1QSQA 215LA 206LA 1G0LA 1L71A 3G3WA 3HUQA 238LA 260LA 3CDVA 176LA 1L00A 4W59A 197LA 2RBQA 1L15A 4W53A 6LZMA 1L06A 110LA 143LA 1L21A 1L75A 151LA 1KW7A 3HTBA 4W58A 4I7MA 112LA 1L65A 128LA 248LA 1QTDA 3HT6A 1QT5A 3C80A 1L76A 1LLHA 3HTDA 168LA 1JQUA 147LA 125LA 1KS3A 3HDEA 2Q9EA 2L78A 102LA 1C64A 3HU9A 4EPIA 2LC9A 1L56A 1P6YA 1C6TA 148LE 2RB1X 1QTCA 249LA 2B6ZA 1L54A 2F47A 2QARC 3GUIA 250LA 239LA 2RAYX 2O7AA 2B6TA 1L84A 2HUKA 4I7RA 118LA 189LA 1L55A 1T8AA 1L02A 4K5YA 4OO9A 4ARPA 2B6WA 3OE0A 1L27A 1L69A 1L51A 2RBRA 1CX7A 1T6HA 4LZMA 1C6PA 1SX7A 3HH4A 108LA 4DAJA 1PQOA 4PK0A 1L99A 1L33A 3CDOA 3HH5A 247LA 1C66A 1L47A 5I14A 1LWKA 1L81A 1L32A 1CU2A 180LA 3SB5A 2B73A 165LA 181LA 1L70A 1QTVA 1NHBA 127LA 2ANXA 184LA 212LA 164LA 1L44A 2RBOA 1C63A 138LA 1C6QA 231LA 3SB7A 4EKQA 156LA 4EKPA 3HUAA 3VW7A 149LA 1L19A 3CDQA 1LPYA 1L07A 4W51A 1L30A 1L87A 3SBBC 111LA 1L89A 1OVKA 109LA 4GBRB 177LA 1D9WA 173LA 1LI6A 1L85A 3HT9A 115LA 222LA 1C6MA 1C6DA 3HH3A 120LA 3FI5A 1L88A 2HULA 1L39A 2OE9X 1DYAA 2RBPA 1LGUA 4I7JA 1L63A 1DYCA 4ARQA 3CDTA 1T8FA 4ARMA 3JR6A 1PQMA 4YXCA 1C6CA 150LA 1LI2A 160LA 3V2WA 1QTHA 201LA 1LYHA 200LA 3D4SA 4W57A 257LA 2CUUA 3F8VA 1L77A 4I7PA 4LDOA 1L82A 1L36A 205LA 1P5CA 1KY0A 1LYDA 235LA 1B6IA 195LA 1G0MA 2HUMA 1LGWA 4I7SA 114LA 2QB0B 1OV7A 3GUKA 1C69A 1L17A 1L83A 1L80A 220LA 123LA 3EMLA 1L64A 4I7QA 2NTHA 3V2YA 2B6YA 2F32A 196LA 4W55A 1L46A 1L92A 185LA 2B72A 1L52A 233LA 3L2XA 4IAPA 4DJHA 2B70A 103LA 131LA 1DYDA 1L12A 1CUPA 1ZWNA 2A4TA 1L29A 1P56A 3DKEX 4LDLA 1L41A 1C61A 1LYEA 1DYFA 141LA 1L68A 2OU9A 3GUNA 1QUDA 1G0GA 2OTZX 1L73A 4ARMB 3OE8A 1G0QA 1L11A 1LYJA 3F9LA 3GUPA 163LA 1D3FA 2LCBA 1L66A 157LA 107LA 170LA 1D3JA 1PQJA 3C7ZA 4EKRA 3C8QA 1C6GA 3HT8A 1P2RA 2ANVA 1P2LA 1L16A 1P64A 1D2YA 4I7NA 172LA 2OU8A 1QTBA 4EPFA 4I7TA 1C6EA 1L37A 1L90A 214LA 218LA 3C7WA 3GULA 3GUMA 2OE4X 245LA 4ARLA 219LA 252LA 1L61A 1QT6A 217LA 211LA 1K28A 1L24A 1L0JA 4W56A 1L20A 3PBLA 140LA 3FA0A 1QUHA 1P36A 1OWZA 1L74A 1LI3A 254LA 1PQIA 2O79A 3HT7A 2RH1A 244LA 1P37A 4LDEA 1CTWA 146LA 3DN0A 1XJUA 1L31A 234LA 3HDFA 1TLAA 1SSWA 3SBAA 1P7SA 1CV4A 7LZMA 4S0WA 171LA 4EKSA 2OEAX 145LA 3C82A 1DYBA 3OE6A 1L25A 175LA 2B6XA 3K2RA 3NY8A 192LA 1L60A 152LA 1L96A 5LZMA 2B75A 3DMVA 3NY9A 130LA 1EPYA 3ODUA 1OV5A 221LA 1C6NA 1CV0A 1L04A 1QSBA 187LA 1C6IA 251LA 2F2QA 1OYUA 4GRVA 1QS9A 3GUJA 3CDRA 3DN3A 1C62A 230LA 104LA 261LA 1L97A 1L57A 232LA 1C6BA 4YXAC 4I7OA 1G0KA 1G1WA 1L26A 224LA 4AQNA 226LA 3DN4A 4E97A 1QTZA 2OTYX 3HTGA 198LA 1SWZA 1C6LA 1L10A 1C6JA 1L23A 1G07A 1WTHA 223LA 1G1VA 2Z6BA 1CV1A 3SB8A 241LA 1D2WA 1C6KA 1L91A 1OWYA 1CUQA 1T8GA 3G3XA 1L53A 3G3VA 1LGXA 3DN2A 1G06A 210LA 1L48A 1L94A 1L40A 2LZMA 209LA 1L62A 1SSYA 1L28A 228LA 1L0KA 1L98A 122LA 190LA 253LA 159LA 3FADA 1L43A 1CU0A 3LZMA 1L59A 1L58A 1QUOA 236LA 183LA 1L72A 2RB0X 1CV5A 242LA 4W52A 1I6SA 129LA 1L50A 166LA 167LA 169LA 4ARQB 1L79A 1LYGA 1L05A 3OE9A 161LA 3HTFA 237LA 3C8RA 3DMXA 1L09A 4EXMA 1CU3A 1L01A 2O4WA 199LA 1CX6A 216LA 3DN6A 2IGCA 3RZEA 1CU5A 1LWGA 1LYIA 1L08A 3SB9A 1P46A 2B74A 178LA 227LA 1G0PA 1L95A 4DKLA 2RB2X 1ZYTA 4I7KA 3HWLA 126LA 2RAZX 1C65A 144LA 1C67A 1OVJA 3RUNA 1L03A 1L18A 1LYFA 1CVKA 1XEPA 2NTGA 137LA 188LA 142LA 162LA 1L45A 113LA 1C60A 1L35A 1T97A 3L64A 4W54A 1CU6A 243LA 1KNIA 1L34A 1C68A 262LA 3GUOA 258LA 259LA 3C81A 3PDSA 1JTMA 1PQKA 1L13A 3HH6A 1CV6A 3DNAA 1L22A 186LA 3C83A 4EJ4A 1CV3A 1G0JA 1QT3A 1D3MA 1L86A 3SB6A 1ZURA 213LA 1DYGA 1XJTA 3C7YA 1D3NA 1C6HA 3HU8A 3DMZA 1SX2A 1KW5A 1L14A 1OVHA 1JTNA 1L93A 1KY1A 1L67A 1P3NA 246LA 2RBSA 1QUGA 255LA 3DN8A 3QAKA 240LA 139LA 174LA 1LW9A 2Q9DA 4ARJA 1QT7A 1SWYA 1PQDA 1C6AA 229LA 2RBNA 155LA 1L38A 3NYAA 3C8SA 1DYEA 1QT8A 1QS5A 2B7XA 3SN6R 225LA 119LA 2OE7X 4YX7C 3DN1A 4PJZA 4ZPUA 3HUKA 1C6FA 3UONA 1QT4A 256LA 4I7LA 182LA 191LA 1L49A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LYSA 3TXIA 1L42A 215LA 1G0LA 1SLYA 2LYZA 194LA 4NHQA 260LA 1TBYA 3N9AA 1WQRA 1L00A 4W59A 1GB0A 143LA 1L75A 1IEEA 1LAAA 151LA 1HENA 4QEQA 4I7MA 2IFFY 112LA 248LA 1G7LC 3IJVA 1JQUA 125LA 3CSQA 3HDEA 2Q9EA 2L78A 3CB7A 1IWWA 4LYMA 1P6YA 1HEPA 2B6ZA 2F47A 3P68A 2RAYX 2B6TA 1CJ6A 1YKXX 1IR9A 1CJ8A 1T8AA 4UWNA 1B5XA 1GPQC 2BQIA 1L27A 1LHIA 1L69A 4FDYA 4R6CA 2RBRA 5F9UA 1IO5A 2XBRA 4ZEEA 1I56A 1C6PA 3AZ4A 4C3WA 4DAJA 4PK0A 3W6FA 2LZ2A 3HH5A 1C66A 1JITA 1LWKA 4NHSA 5LVIA 1CU2A 180LA 1A2YC 2B73A 1BGIA 5E4PA 1D6PA 165LA 184LA 3W3EA 1L44A 3CQLA 4LFPA 138LA 231LA 1YAQA 3SB7A 4EKQA 156LA 3HUAA 1C45A 3CDQA 1LMNA 4N1EI 1LZ8A 1L87A 3SBBC 111LA 1OVKA 4DDCA 2CDSA 5LAGA 4NGYA 1LSCA 1GB5A 1C6DA 3FI5A 4H1PA 1LKRA 1B7MA 1JHLA 1UIEA 2RBPA 1BVKC 1LI2A 5EBHA 2CUUA 4BS7A 5B07A 4WO6A 2MEHA 2G4NA 1L36A 205LA 1P5CA 4J1AA 1LYDA 1GFTA 1BWHA 5B1GA 5APDA 1NDGC 2HUMA 1LGWA 3AZ7A 1EL1A 1OV7A 3GUKA 2Q0MX 1HHLA 1LSDA 1OQMA 2ZIJA 1YILA 220LA 2D6BA 3WU9A 4AGAA 1L64A 2NTHA 4GN4A 1L46A 4DD1A 1REXA 2BQMA 5KY1A 4IAPA 133LA 4DJHA 4ETCA 1IC7Y 1HFXA 103LA 4LYBA 1JKDA 1ZWNA 3W6BA 1LJ4A 3AGGG 1L41A 5IELA 2D4KA 1L11A 1LZ6A 3QY4A 4DT3A 1L66A 2DQJY 157LA 1D3JA 1B9OA 1P2LA 1L16A 1P64A 1UCOA 172LA 3FE0A 3A6BY 1B7SA 3W6AA 1J1OY 4I7TA 2ZQ3A 1L37A 2Z2EA 214LA 218LA 4ARLA 1LZNA 219LA 1WVVA 4NGZA 1L61A 1QT6A 3WPKA 4WG1A 1IWTA 1GB2A 2B5ZA 140LA 1HEOA 1EQEA 1QUHA 1GE3A 3A94A 254LA 4NIJA 2Y8PA 3WVYA 2O79A 1JTPL 1RJCB 1CTWA 5C6IA 1GD6A 5I4WA 1FN5A 5LA8A 5DLAA 4NGWA 3HDFA 4Z46A 3A3RX 2BAAA 1J1PY 1CKGA 4PRUA 3A90A 2OEAX 4MCKA 3NY8A 1QUSA 3P65A 134LA 3ODUA 4KPMA 1C6IA 2BPUA 4WM5A 1QS9A 3DN3A 1C62A 104LA 1LZ4A 4HPIA 3EO5A 1L97A 3WVXA 4I7OA 4AQNA 1L26A 1GE2A 3DN4A 3ZEKA 1LZEA 1DKJA 2Z6BA 3SB8A 1D2WA 1C6KA 4XJFA 4XADA 1L94A 1C43A 1L62A 1SSYA 1ZV5L 1HC0A 1L0KA 1L98A 253LA 159LA 3LZMA 4H9FA 1L59A 4XJHA 1QUOA 4G4BA 1JIYA 5I54A 1LSFA 4GCCA 1GFAA 166LA 4PGJB 167LA 4ARQB 1L79A 4YEOA 5DN5A 1L05A 3OE9A 1B7PA 5DN4A 1UIHA 1PZYA 161LA 3HTFA 1OUFA 3WPJA 1LSEA 2H9KA 3P64A 4G49A 1L09A 5A3EA 2O4WA 3N9EA 5KXRA 3DN6A 2IGCA 3RZEA 1LWGA 5KXZA 3WMKA 2B74A 1QDRA 4G4HA 227LA 1LZAA 4YOPA 1REYA 1L95A 3A6CY 1YAPA 4H9IA 4I7KA 2BQDA 3HWLA 2RAZX 1OVJA 3RUNA 4G4CA 1D9UA 188LA 1LZTA 4TX7A 4LYCA 1T97A 1HNLA 1LZYA 243LA 4H91A 2YSSC 1KNIA 1C68A 154LA 258LA 3C81A 3PDSA 1LZCA 5KXWA 1IP6A 186LA 1B0DA 5IDDA 3TMUA 1LJ3A 1QT3A 1VFBC 1D3MA 1DI4A 1DYGA 1BB7A 3C7YA 1SX2A 1NMMA 1Z55A 2RBSA 3DN8A 4LYTA 3QAKA 1LZ1A 4PHIA 1PQDA 2XTHA 1C6AA 5HLLA 1QTEA 1LPIA 2B7XA 225LA 4OWEA 4YX7C 1B5VA 1IC5Y 4ZPUA 4NG1A 4I8SA 4RLMA 1XGTC 4I7LA 2OU0X 3A95A 1WQMA 1L71A 1JKAA 5LYZA 1INUA 2G4PA 4DDBA 1WQPA 1A4VA 4GCDA 4NGJA 1L06A 4A7DA 2PC2A 3AYQA 1KW7A 1IWZA 2BQGA 4WO9A 3WXTA 1GF3A 1AT6A 128LA 1VDQA 1GFHA 3HT6A 1QT5A 2Z2FA 3C80A 4HTKA 1LMOA 1UBZA 5DL9A 3GXKA 1IWXA 1GFRA 2LC9A 3RNXA 1LSPA 1L56A 4LYOA 1ZMYL 1QTCA 1DXJA 1L54A 1IR7A 2QARC 250LA 239LA 2O7AA 2YBLA 4GN5C 2HUKA 1C46A 1LZSA 4K5YA 5L3HA 1L02A 4OO9A 2F2NA 1FKVA 2B6WA 2MEDA 1OUAA 1BB5A 1HSWA 4NG8A 108LA 1GF7A 1PQOA 1L99A 1LYOA 5J7CA 5I4XA 5I4YA 1L47A 1BWJA 1L81A 1L32A 1IP4A 1G7IC 4LT2A 1QTVA 1NHBA 2ANXA 2BQNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LYS A;  3TXI A;  1L42 A;  215L A;  1G0L A;  1SLY A;  2LYZ A;  194L A;  4NHQ A;  260L A;  1TBY A;  3N9A A;  1WQR A;  1L00 A;  4W59 A;  1GB0 A;  143L A;  1L75 A;  1IEE A;  1LAA A;  151L A;  1HEN A;  4QEQ A;  4I7M A;  2IFF Y;  112L A;  248L A;  1G7L C;  3IJV A;  1JQU A;  125L A;  3CSQ A;  3HDE A;  2Q9E A;  2L78 A;  3CB7 A;  1IWW A;  4LYM A;  1P6Y A;  1HEP A;  2B6Z A;  2F47 A;  3P68 A;  2RAY X;  2B6T A;  1CJ6 A;  1YKX X;  1IR9 A;  1CJ8 A;  1T8A A;  4UWN A;  1B5X A;  1GPQ C;  2BQI A;  1L27 A;  1LHI A;  1L69 A;  4FDY A;  4R6C A;  2RBR A;  5F9U A;  1IO5 A;  2XBR A;  4ZEE A;  1I56 A;  1C6P A;  3AZ4 A;  4C3W A;  4DAJ A;  4PK0 A;  3W6F A;  2LZ2 A;  3HH5 A;  1C66 A;  1JIT A;  1LWK A;  4NHS A;  5LVI A;  1CU2 A;  180L A;  1A2Y C;  2B73 A;  1BGI A;  5E4P A;  1D6P A;  165L A;  184L A;  3W3E A;  1L44 A;  3CQL A;  4LFP A;  138L A;  231L A;  1YAQ A;  3SB7 A;  4EKQ A;  156L A;  3HUA A;  1C45 A;  3CDQ A;  1LMN A;  4N1E I;  1LZ8 A;  1L87 A;  3SBB C;  111L A;  1OVK A;  4DDC A;  2CDS A;  5LAG A;  4NGY A;  1LSC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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