3LZMA

Structural studies of mutants of t4 lysozyme that alter hydrophobic stabilization
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Structural studies of mutants of T4 lysozyme that alter hydrophobic stabilization.
pubmed rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3lzmA00
242LA 3DMZA 118LA 1C6MA 126LA 1SWYA 188LA 185LA 1C6LA 3CDVA 238LA 2B6YA 1QT8A 1L72A 1G0PA 140LA 209LA 1KS3A 161LA 2OTYX 3HU9A 3HT8A 3SB9A 1L45A 144LA 127LA 1C6FA 1TLAA 1L28A 1PQMA 3HDFA 168LA 1P2RA 1G0GA 1L74A 1WTHA 1P36A 4S0WA 1LYFA 3EMLA 4PK0A 1QS9A 1L79A 1QTCA 1KY0A 2RBOA 2CUUA 1SWZA 142LA 146LA 3DMVA 1CU3A 1OVJA 4EKSA 4ZPUA 2ANXA 2IGCA 248LA 173LA 2OU9A 3DNAA 167LA 1L05A 1L36A 3CDOA 1L62A 1L08A 1L16A 3K2RA 1L32A 1L90A 226LA 1L81A 2RAYX 3RUNA 4EJ4A 1L83A 1L12A 2LC9A 2RB1X 4I7QA 1L65A 2RBSA 1C6HA 216LA 3SB8A 1L57A 186LA 3HUQA 1L96A 1L34A 2LZMA 236LA 2OE4X 1LYHA 4W57A 3NYAA 262LA 1C66A 115LA 234LA 178LA 107LA 2NTGA 1L47A 3HT6A 4W55A 2OEAX 3C83A 4YXCA 1LI3A 1OV5A 246LA 1L09A 1L82A 3C7WA 3LZMA 3FADA 4W53A 172LA 4YX7C 3C8SA 1L13A 5I14A 3HT7A 137LA 1DYBA 2O79A 7LZMA 1OYUA 206LA 1L77A 257LA 1NHBA 3SN6R 2ANVA 2RBPA 130LA 1C6TA 1PQOA 1L76A 1LLHA 3G3XA 3D4SA 1L37A 4EKPA 3VW7A 3QAKA 1QSBA 4I7SA 2RBRA 3GUJA 1L92A 227LA 1T8AA 1L35A 2F47A 3DMXA 3HTGA 1P2LA 147LA 1T6HA 3G3VA 1QT6A 1L14A 247LA 2RB2X 2HULA 2RBNA 2O4WA 128LA 119LA 205LA 1L48A 4I7KA 3HH6A 2QARC 3GUMA 256LA 3CDTA 3SBAA 1L84A 3FI5A 3OE8A 1JQUA 240LA 1KY1A 190LA 1L0JA 3DN0A 139LA 1C6QA 114LA 1D2YA 1G07A 3RZEA 4PJZA 1QS5A 3C8QA 5LZMA 3HWLA 1C65A 1L07A 229LA 148LE 4I7OA 2B7XA 3V2YA 180LA 3HUKA 1L70A 1LYGA 184LA 1L30A 1ZYTA 2B6WA 4AQNA 122LA 1P6YA 1PQIA 1LYJA 123LA 1C61A 1CX7A 1JTNA 3GULA 2OE9X 201LA 1L29A 1DYAA 3GUPA 1L00A 3F9LA 1CV5A 1C6AA 1G0MA 230LA 2LCBA 1LYIA 1L19A 255LA 1T97A 1C67A 232LA 2O7AA 3UONA 1G0JA 1L10A 1L64A 1LWGA 1D3JA 1L68A 1L66A 211LA 254LA 1C6KA 1L06A 1P64A 1L01A 3DN6A 1P3NA 1L86A 1C6CA 1C69A 3JR6A 1L89A 1T8GA 1P46A 162LA 1G0LA 1QT3A 222LA 1C60A 131LA 1CV0A 1L25A 3C7YA 1SX7A 1ZURA 4GBRB 196LA 223LA 112LA 4I7JA 1KW5A 4I7RA 145LA 1LGXA 182LA 225LA 1CUQA 1I6SA 3GUKA 4I7LA 1LI6A 3NY8A 1DYCA 1LYEA 2B73A 183LA 1L94A 103LA 1L51A 199LA 1L33A 1L56A 219LA 1L38A 1QT4A 1L39A 1LYDA 4W52A 1CU6A 1L42A 3SB6A 2OTZX 1XJUA 1C6EA 1L02A 1L43A 3SB5A 1K28A 1QUGA 1JTMA 1L18A 1G0KA 1L41A 1L80A 1D2WA 143LA 1L60A 104LA 1OVHA 3CDQA 249LA 150LA 187LA 1C6IA 4EXMA 3DN4A 214LA 2OE7X 1C68A 1P56A 1D3NA 2B75A 2RBQA 1LW9A 1L73A 4W59A 4YXAC 2L78A 164LA 1L50A 1P37A 1LI2A 1CU5A 237LA 3HT9A 1CV4A 1LWKA 244LA 1G1VA 157LA 2Q9EA 3DN2A 2B6TA 224LA 3HDEA 2RH1A 1SSWA 1L75A 110LA 4GRVA 1L95A 1L22A 4EKRA 1L93A 2B72A 1C6PA 158LA 3HTBA 1L59A 3C82A 4LDEA 3HUAA 1L52A 1P5CA 4DAJA 4EPIA 111LA 1L49A 4ARPA 1DYFA 1PQDA 1L21A 3DN8A 1L97A 1C64A 4W54A 2HUMA 3C80A 151LA 1XJTA 4DJHA 3C81A 1CV3A 2F2QA 4ARQB 170LA 3SB7A 1P7SA 2B74A 1CTWA 3HTDA 4EPFA 1L26A 260LA 3DKEX 1CU2A 1L88A 1L67A 195LA 1XEPA 2B6ZA 1QUDA 3PBLA 4I7TA 4I7PA 1L0KA 243LA 1PQKA 4K5YA 2NTHA 3L2XA 1OVKA 4ARJA 4ARMB 1C6GA 1CX6A 4W58A 4ARQA 1CV1A 6LZMA 1KW7A 239LA 1D3MA 109LA 1L11A 1SSYA 1L31A 1CU0A 1L23A 4OO9A 2RAZX 1L55A 1B6IA 189LA 169LA 171LA 1QT7A 1T8FA 217LA 218LA 1L63A 166LA 174LA 1L03A 163LA 4ARMA 2B6XA 1G0QA 160LA 3FA0A 2RB0X 1L46A 4EKQA 1L53A 2Z6BA 141LA 1QTDA 3OE0A 1L58A 1D3FA 3L64A 4W56A 1L15A 258LA 1DYGA 2B70A 1L04A 1L69A 1CV6A 198LA 259LA 1EPYA 3OE6A 245LA 1C6NA 165LA 1L27A 125LA 3OE9A 1L91A 3GUIA 2OU0X 1QUOA 1QSQA 3C8RA 1C62A 3SBBC 4ARLA 102LA 1C63A 2HUKA 3HH4A 1C6DA 1QTHA 1L44A 156LA 1OWZA 235LA 1OV7A 261LA 253LA 159LA 1ZWNA 192LA 2Q9DA 4IAPA 191LA 2A4TA 212LA 3CDRA 221LA 200LA 155LA 108LA 113LA 1L61A 1LGUA 1LGWA 3G3WA 1L17A 220LA 3HU8A 138LA 1L99A 1L85A 3HTFA 1L20A 252LA 1CVKA 3NY9A 2QB0B 4E97A 1G1WA 149LA 4W51A 1C6JA 1SX2A 3F8VA 4LZMA 3DN1A 3V2WA 1PQJA 1QTVA 1LPYA 228LA 1QTZA 1L24A 3GUNA 250LA 1CUPA 1C6BA 197LA 4I7MA 215LA 4DKLA 181LA 251LA 152LA 176LA 210LA 1L40A 241LA 2OU8A 120LA 4I7NA 1L54A 3ODUA 1KNIA 1QUHA 3HH3A 3PDSA 4LDLA 1L98A 1QTBA 3HH5A 4LDOA 1DYDA 1L87A 3DN3A 1L71A 175LA 129LA 1G06A 2F32A 231LA 1OWYA 1QT5A 177LA 3C7ZA 213LA 3GUOA 233LA 1D9WA 1DYEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
242LA 3DMZA 118LA 1C6MA 1LHLA 1OUJA 1SWYA 2ZNXY 2B6YA 1QT8A 3RNXA 1KS3A 1LPIA 3HT8A 2Z37A 4DQ7A 168LA 1P2RA 1VDTA 1G0GA 1WTHA 1P36A 4PK0A 1LSFA 1KY0A 2RBOA 1HEQA 2MEFA 1GF8A 1LSYA 1V7TA 4EKSA 4ZPUA 1L36A 1FKVA 4CJ2A 3RU5A 1L08A 1REZA 1UBZA 1LZDA 1L81A 4NY5A 1L83A 1A2YC 1KXYA 4H1PA 1B7SA 1D0MA 4I7QA 4OWBA 2A7FA 1L65A 5DM9A 1L57A 5L3IA 236LA 2OE4X 5KXSA 4W57A 3NYAA 262LA 234LA 1IP2A 3A34A 4QDNA 1J1OY 2OEAX 1OUGA 1OV5A 246LA 2H9KA 3W6AA 1L13A 1BHZA 1DYBA 2O79A 193LA 1L77A 2ANVA 4B4IA 2RBPA 1C6TA 1OUEA 1L76A 2X0AA 1JIYA 4EKPA 3LYZA 3FI7A 2MEEA 3GUJA 1IWYA 4BAFA 1L35A 1T6HA 3G3VA 3QNGA 5E4PA 1QT6A 2H9JA 2AUBA 1GF3A 2DBTA 4CFPA 3QE8A 4LYCA 3WVXA 2Z12A 2YBJA 3CT0A 1FDLY 1GEVA 3CDTA 1YQVY 3SBAA 3FI5A 3OE8A 1GF6A 240LA 1GFAA 2D4IA 1BVKC 5F14A 5A3EA 4R0FA 1G07A 4N0JA 4ET8A 3LN2A 1LJ4A 1C65A 1HEOA 2B7XA 4PJ2C 3V2YA 2EIZC 3WPLA 2B6WA 1WQQA 5B07A 4GN5C 1LCNA 1LYJA 1IVMA 1CKDA 2W1YA 5HNLA 4H94A 4TX7A 1OUCA 1L29A 2ZIKA 3GUPA 1CJ6A 4C5FA 3TXFA 230LA 255LA 1T97A 232LA 2CGIA 3UONA 1G0JA 4H8YA 4LFXA 2H5ZA 1XSFA 3A90A 2BQCA 1L06A 1GB8A 3P4ZA 1P46A 162LA 1LOZA 1GB9A 4M6DA 131LA 1GB0A 5DN5A 112LA 145LA 1BWJA 1LGXA 1UIFA 1GFKA 1I6SA 1IWXA 4I7LA 1LI6A 4ZEEA 3B0IA 183LA 1ZV5L 1OUDA 1IWWA 1L39A 1LYDA 1HNLA 4W52A 3MGWA 4OWEA 4RDSA 5APEA 2FBDA 3WW5A 4Z98A 1L80A 5KXKA 1L60A 3KAMA 1DI4A 187LA 3A95A 3DN4A 214LA 2OE7X 4H9HA 1HMLA 2YDGA 2RBQA 4DD0A 1LW9A 4G4CA 2HEDA 1LMOA 2DQHY 1NBYC 1ZMYL 4XJFA 5LIOA 1G1VA 1GDXA 1HENA 2LHMA 2C8OA 2B6TA 3HDEA 5D5FA 4GRVA 3LZ2A 110LA 5F9XA 3EO5A 1L95A 1NMMA 1L22A 4EKRA 3ZVQB 4H9EA 1C6PA 2ZIJA 4WLXA 3C82A 1LJHA 5KJ9A 4LDEA 3CSRA 3HUAA 2I26L 1L21A 1L97A 1C64A 4W54A 3IJUA 3RT5X 1XJTA 4J1BA 1F10A 4DD3A 1CV3A 3WL2A 3F6ZA 2B74A 1F6SA 3HTDA 1WTNA 1IOCA 3J4GA 4EPFA 1L26A 260LA 1L88A 1B7LA 1L67A 195LA 1XEPA 4I7TA 3PBLA 1B7QA 1L0KA 1PQKA 4H9BA 1GF7A 1GB6A 4ARJA 1OVKA 5APFA 1JSEA 1GHLA 4YEMA 2D4KA 239LA 109LA 1J1XY 1SSYA 1YL1X 2W1MA 5KXTA 4BS7A 189LA 1BB5A 2ZNWY 3A94A 1L03A 1GBSA 1GAYA 2F2NA 160LA 1UIGA 1PS5A 4H9CA 1LSMA 258LA 1DYGA 4NGWA 1L69A 1H87A 3M3UA 3OE6A 245LA 3GUIA 3B0OA 3EXDA 2BQEA 1SLYA 3SBBC 1FLYA 207LA 2G4PA 4CHXA 4LT1A 3HBEX 159LA 1ZWNA 3WPJA 4H8ZA 3TXJA 1IOSA 3CDRA 1JWRA 3AW6A 1IWTA 155LA 2F4AA 2XQOA 4C3WA 3G3WA 3AW7A 3G3BB 1IP4A 138LA 1QTKA 4IATA 1Z55A 3NY9A 2QB0B 4E97A 3AZ7A 1SX2A 4LZMA 4H9IA 1LZBA 2IFFY 1QTZA 1GF4A 1O23A 3A3RX 251LA 1KXXA 4O34A 1LMTA 120LA 3WU7A 4OWHA 3ODUA 1QUHA 3PDSA 4LDOA 4LFPA 1DYDA 1L71A 5FCPA 4GCEA 4TWSA 5HNCA 1GD6A 1QT5A 1E8LA 213LA 1DYEA 1C43A 4DT3A 4OWCA 185LA 3WPKA 1B7PA 2D4JA 1L72A 3CT5A 1LJEA 1G0PA 209LA 1MLCE 2BQMA 144LA 1JHLA 4NSJA 3OK0A 1L74A 4S0WA 1LYFA 2BQFA 1QS9A 1L79A 1QTCA 1OP9B 2CUUA 1OUFA 146LA 4NHSA 1GFJA 1GFRA 1REMA 1YAPA 2DQCY 3ZEKA 2OU9A 3DNAA 1WQMA 1IWZA 1L62A 1RJCB 3A6BY 3K2RA 2N5ZA 1ZVYB 4FJRA 2RB1X 1D0LA 5KXXA 2DQJY 3SB8A 2LZMA 5LAGA 1DKJA 1IR9A 115LA 1LSZA 4DYGA 178LA 1GE0A 4OOOA 2YBMA 1B5ZA 107LA 4RW2A 1IWUA 5JENB 1B7RA 2YBIA 4LYMA 3HT6A 3C83A 4YXCA 1L82A 3C7WA 1KIRC 5IHGA 1DI3A 1YL0X 2XBRA 2CWIA 2RSCA 1OYUA 1UICA 257LA 3SN6R 1YKXX 4UWNA 2G4NA 1C45A 1LLHA 3W6BA 1XGQC 2RBRA 1WVVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 242L A;  3DMZ A;  118L A;  1C6M A;  1LHL A;  1OUJ A;  1SWY A;  2ZNX Y;  2B6Y A;  1QT8 A;  3RNX A;  1KS3 A;  1LPI A;  3HT8 A;  2Z37 A;  4DQ7 A;  168L A;  1P2R A;  1VDT A;  1G0G A;  1WTH A;  1P36 A;  4PK0 A;  1LSF A;  1KY0 A;  2RBO A;  1HEQ A;  2MEF A;  1GF8 A;  1LSY A;  1V7T A;  4EKS A;  4ZPU A;  1L36 A;  1FKV A;  4CJ2 A;  3RU5 A;  1L08 A;  1REZ A;  1UBZ A;  1LZD A;  1L81 A;  4NY5 A;  1L83 A;  1A2Y C;  1KXY A;  4H1P A;  1B7S A;  1D0M A;  4I7Q A;  4OWB A;  2A7F A;  1L65 A;  5DM9 A;  1L57 A;  5L3I A;  236L A;  2OE4 X;  5KXS A;  4W57 A;  3NYA A;  262L A;  234L A;  1IP2 A;  3A34 A;  4QDN A;  1J1O Y;  2OEA X;  1OUG A;  1OV5 A;  246L A;  2H9K A;  3W6A A;  1L13 A;  1BHZ A;  1DYB A;  2O79 A;  193L A;  1L77 A;  2ANV A;  4B4I A;  2RBP A;  1C6T A;  1OUE A;  1L76 A;  2X0A A;  1JIY A;  4EKP A;  3LYZ A;  3FI7 A;  2MEE A;  3GUJ A;  1IWY A;  4BAF A;  1L35 A;  1T6H A;  3G3V A;  3QNG A;  5E4P A;  1QT6 A;  2H9J A;  2AUB A;  1GF3 A;  2DBT A;  4CFP A;  3QE8 A;  4LYC A;  3WVX A;  2Z12 A;  2YBJ A;  3CT0 A;  1FDL Y; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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