The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
60
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDIHIRLFKSHPETLEKHDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTELTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFESEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Roles of glutamates and metal ions in a rationally designed nitric oxide reductase based on myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
60
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-03-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DN1 B; 2SPO A; 1JPB A; 3WTG B; 1CH9 A; 2ZSQ A; 2LHB A; 1S0H A; 2HBC B; 3ECL A; 2VEB A; 3QJB A; 3PI8 A; 3WCU A; 1MLH A; 2DHB B; 1SWM A; 3GYS A; 2AV3 A; 5AB8 A; 1UC3 A; 1JEB A; 4O35 A; 3PI9 B; 1HRM A; 3NL7 B; 1C40 B; 3GDJ A; 3WCT B; 3BOM A; 1Y2Z A; 1HCO B; 3D4X B; 2FRK X; 1LA6 A; 3UGZ A; 1C7B B; 1J7Y A; 1F5O A; 3GQR A; 4NZI A; 1Y0W B; 3HEP A; 3G4U A; 109M A; 1UVX A; 1ABY A; 1RQA A; 5E83 B; 3BCQ B; 1ECD A; 1Y8K A; 1LHS A; 3WCW B; 1SDL A; 3B75 B; 3QMA A; 3ONZ A; 3E4N A; 1FAW B; 1YHU C; 1Y85 B; 1MYI A; 1GVH A; 1HGB B; 5KER A; 3QZZ A; 3ORD A; 2ZFO D; 1JDO A; 1Y4V B; 1Y4F A; 1HLM A; 1CQ2 A; 1Y4Q B; 1OR4 A; 1XZ4 A; 1X9F C; 1NS9 B; 3S65 A; 1GDI A; 4G51 A; 5HU6 B; 1HV4 B; 1JF4 A; 3D1A B; 1IWH B; 1LFV A; 2OHB A; 4UZV A; 2WTG A; 2O5L X; 1C7C B; 3EOK A; 1XY0 A; 2QSP A; 2ZT3 A; 3P5Q A; 1VXC A; 2D2M A; 1DLW A; 3ODQ A; 3RJ6 A; 1XZ2 A; 1A0Z B; 1BIJ A; 1A6K A; 4MXK A; 5EUI A; 2W72 A; 1Y8W B; 1LFL B; 1M9P A; 2G10 A; 1JP6 A; 1XZU A; 2ZT1 A; 1GCW A; 1MLN A; 5CND A; 1Y4P B; 4DWT A; 4MU5 A; 1YEU A; 1XYE B; 1J7W A; 4M4A A; 1A3O A; 3DHT B; 1V5H A; 1HDB A; 3LB1 A; 2H35 A; 2LH6 A; 1YVQ A; 1FSX A; 2ZT0 A; 1NZ5 A; 4ROL A; 2YRS A; 1YVT A; 2ZS0 D; 2E2Y A; 4ESA B; 2Z8A A; 111M A; 3TM3 A; 1KFR A; 2FRF A; 2BNL A; 3NFE B; 3GQG A; 2EKU A; 1MBA A; 2V1I A; 3GKT A; 1DTM A; 2VEE A; 1BIN A; 2VLZ A; 1J40 B; 3BJ3 B; 2W6X A; 1A0U A; 106M A; 3O89 A; 4F6I A; 3ZJR A; 4ROM A; 1YHR B; 1SHR B; 3A5G A; 3BA2 A; 4H0B A; 1EMY A; 3PIA A; 4F6B A; 1Y46 B; 2ZS1 B; 1R1X A; 2D60 B; 2DC3 A; 3SZK A; 2BLJ M; 1SPE A; 4L2M A; 3HXN B; 3AQ7 A; 5ILE A; 2D2N B; 3MJU A; 1CH4 A; 1DXT B; 3D1K B; 3GQP A; 3QJE A; 4M4B B; 4MQC A; 1AJG A; 4NXA A; 2D5X B; 2HHD A; 3NML A; 1OBM A; 1B86 B; 1COH A; 1PMB A; 3M38 A; 2BW9 M; 1NEJ B; 1A00 A; 4FH7 A; 1LFZ A; 1J7S B; 1GLI B; 1Y35 B; 2PEG B; 1I3D A; 3UH3 A; 1YHU D; 3WFU A; 1VXH A; 1JZK A; 4KMW A; 1QSI B; 3VRG A; 3ZHW A; 2ZLX A; 1GDJ A; 1KD2 B; 2KSC A; 1Y09 A; 4NI1 B; 2HHB B; 1A6N A; 3PI3 A; 1MKO B; 1LFY B; 3ZJO A; 1MNI A; 1QXD A; 1MYJ A; 1O1K B; 1V4W A; 1Y01 B; 2V1K A; 4HHB A; 1HAC B; 2ZLV B; 1J3F A; 3FS4 A; 1JL7 A; 1HLB A; 3OK5 A; 3S48 C; 1HBA A; 4ODC B; 1MBN A; 2LH5 A; 1MYM A; 1Y0T A; 1YFF B; 4DWU A; 3IC0 A; 1MBS A; 1YIH B; 1VXE A; 1MYZ A; 3LQD A; 3KMF A; 4XS0 A; 2WY4 A; 3IXF A; 4ZVA A; 1G0B B; 2EKT A; 1LH6 A; 1NZ2 A; 3QM9 A; 4G1V A; 3VRF B; 3OGB A; 3UH5 A; 3EDB A; 1Y7C B; 1XXT A; 1MYH A; 1Y4R B; 3MYN A; 1HBH A; 3UHR A; 1J41 A; 1EW6 A; 1RVW A; 1YE0 B; 1DXU A; 3CY5 A; 1MNO A; 3A59 A; 2LH1 A; 1S5Y B; 3AG0 A; 6HBW B; 1RQ3 B; 2MGM A; 1JF3 A; 2W6V B; 3S66 B; 2QU0 B; 2LH2 A; 1XZV B; 5HY8 A; 1J3Z B; 1CQX A; 3HHB A; 1ECN A; 2GKM A; 3UGY A; 4NK1 A; 1FCS A; 1PBX B; 1OFK A; 3PT8 B; 1SPG B; 1N9X A; 3ZJL A; 3ZJN A; 1HDA B; 1OUT A; 1Z8U B; 4MQJ B; 5EOH A; 4MQK B; 3D7O B; 4VHB A; 2ZSP A; 2EVK A; 3HRW A; 1S61 A; 5KDQ A; 2HBE B; 1LUE A; 1S6A A; 1V75 B; 2DXM A; 3WCV D; 1UT0 A; 1Y4G A; 4MAX A; 1B0B A; 5JGG A; 3UI0 A; 1CIK A; 1MBC A; 2R80 A; 1BAB B; 2MHB A; 3HF4 B; 1Y83 A; 3NG6 A; 1HGC A; 3OO5 B; 4YU3 B; 3H57 A; 2GKN A; 1LHT A; 1O1L A; 2H8D A; 4IRO A; 1X9F A; 2VLX A; 3KUO A; 1FHJ A; 2G11 A; 2GRF A; 1Y0C A; 4TWV A; 1CH7 A; 1LH7 A; 1MOC A; 1S56 A; 4ILZ A; 3CIU A; 1O1J A; 1Y0D B; 2JHO A; 1MLK A; 4KN3 A; 5KKK A; 1MOH A; 2ZSX A; 1O1O B; 1O1N A; 4MPM A; 1VXF A; 1SDK A; 1MLM A; 3WCU D; 3ZJS A; 2ZFO B; 3PT7 A; 3BJ2 B; 1ECA A; 2HBF B; 4O4Z A; 1LFQ B; 1Y4B A; 1A01 A; 2IN4 A; 2V1F A; 2D5Z A; 4N7O B; 4NI0 A; 2GTL A; 4B4Y A; 1Y5J B; 103M A; 2Z6T A; 3QJC B; 104M A; 1YH9 A; 1LH1 A; 1VWT B; 1CG8 B; 5B84 A; 3FH9 A; 2HCO A; 2GL3 A; 2DN3 B; 1HJT A; 1LJW A; 1GCV A; 3ECZ A; 3ZJJ A; 3W4U B; 1CH1 A; 3UHN A; 1JL6 A; 3QJD A; 1XZ5 B; 1HBR B; 1Y45 B; 1A6M A; 1HBB B; 1K0Y B; 3UHZ A; 1XCH A; 2MGD A; 4F6F A; 1IT2 A; 1Y5K A; 1SI4 A; 3NMM B; 1RTX A; 1O16 A; 1URV A; 1MOA A; 2QMB A; 4ZVB A; 4MQI B; 2QSS B; 4FC3 B; 1BZP A; 3UHU A; 1BZZ B; 1YHE B; 4N7P B; 101M A; 3WHM A; 1MBD A; 1BZ1 A; 1FLP A; 2GRZ A; 1UFJ A; 1YZI B; 2ZSY A; 4JAC A; 3O7N A; 1DM1 A; 1S5X B; 3IA3 B; 4HRT A; 1VXB A; 2ZLW B; 4C44 A; 3VRE B; 1U7R A; 2HHE B; 3EU1 B; 5AZR A; 1R1Y B; 1NGK A; 2ZS0 B; 3WR1 B; 1MLJ A; 2R1H A; 1HBS B; 1MTJ A; 1YIE B; 3ED9 A; 2B7H A; 2D2M D; 1LTW A; 2AV0 A; 2NX0 A; 5CNE A; 1GDK A; 4F68 A; 5CNB A; 1MLO A; 1V4X B; 4YU4 B; 1GBU A; 1V4U A; 1J52 A; 3DR9 A; 1Y8H A; 1HAB A; 1HHO B; 3UHH A; 1G09 A; 1A4F A; 1Y5F A; 3OO4 A; 3WCP A; 108M A; 3PEL A; 1YOI A; 1AJ9 B; 4MQH B; 4MXL A; 2NSS A; 3AT5 B; 1CMY A; 2HBD A; 1IRD B; 1LFT A; 4MQG A; 2RAO B; 2Z6S A; 1G08 A; 3K8B A; 4X0L B; 1O1P B; 3IC2 A; 1MLU A; 1Y31 B; 3WCW C; 2Z6N B; 2HBS B; 2MGG A; 1GBV A; 4N8T B; 1YOH A; 1CO8 A; 4AVE A; 1YHU B; 2FRI X; 1A6G A; 1WMU B; 1NZ3 A; 2QFK A; 2G12 A; 1A3N B; 2RI4 B; 2ZLU B; 5SW7 A; 2AA1 B; 1T1N B; 3AQ5 A; 1Y8I B; 3BJ1 A; 1GZX A; 1OJ6 A; 3UHK A; 1YMA A; 1FDH G; 3ZJH A; 2V1J A; 2OH9 A; 2PGH B; 1U7S A; 3DHR B; 1XQ5 B; 1YOG A; 1IBE B; 1YDZ B; 2CMM A; 1Y22 B; 1X3K A; 1ABW A; 1N9F A; 1FN3 B; 3MKB B; 1Y7Z A; 2XYK A; 2ZT2 A; 3QM6 A; 1YGD A; 1J3Y A; 2ZSO A; 1MWC A; 1UMO A; 2ZST A; 1QXE A; 2GTL C; 3UHT A; 3HYU B; 4SDH A; 3GKV A; 2HZ2 A; 2DN2 B; 1K1K A; 1MOD A; 3R5I A; 4MBN A; 5JDO F; 5CN8 A; 2H8F A; 1NZ4 A; 5E29 A; 3U3E A; 2MGC A; 1DO7 A; 2XKG A; 1OUU B; 1UIW B; 4N7N B; 2BK9 A; 3UHQ A; 1MGN A; 2MB5 A; 1BUW B; 1CG5 B; 1IRC A; 5B85 A; 4U8U A; 1F65 A; 2ZWJ A; 1YEQ A; 1N9I A; 5C6E B; 3LR9 A; 1RPS A; 1OR6 A; 1BBB A; 1DKE B; 5D5R A; 2G0Z A; 5ILR A; 4L7Y B; 1EBC A; 3UHY A; 1AJH A; 2ZSS A; 1NS6 B; 3MBA A; 2QLS B; 1QI8 B; 1Y0A B; 3GOU B; 2O58 X; 1THB A; 2G3H A; 2FAL A; 1YEV A; 1CLS B; 1G9V B; 3A0G B; 3UHC A; 3WCV B; 4OF9 A; 5HAV A; 1RQ4 B; 2MGA A; 1HGA B; 1G0A B; 1QPW A; 1CBM A; 4TWU A; 3D17 B; 1C7D A; 3UH7 A; 1O1I B; 1YEO B; 1HDS A; 1MNH A; 1Y7D B; 3MOU A; 3DUT A; 2ZS1 C; 5CN7 A; 2Z85 A; 4C0N A; 3G4V A; 3M39 A; 3LR7 A; 4HRR A; 1NIH A; 1S0H B; 1YEN A; 3QJB B; 3PI8 B; 5EQM A; 3WCU B; 3G46 A; 1MYF A; 2R50 A; 3GYS B; 3MJP A; 2LH7 A; 5C6Y A; 1QSH A; 4KJT A; 1JEB B; 1V9Q A; 1LH3 A; 2ZLT A; 1JZL A; 3GDJ B; 2MGL A; 5EE4 C; 3HC9 A; 3BOM B; 1Y2Z B; 1JY7 A; 1DLY A; 5CN9 A; 1LA6 B; 1J7Y B; 1Y7G A; 3GQR B; 3GK9 A; 2ZT4 A; 1YG5 A; 4G1B A; 3AT6 A; 1ITH A; 2O5S X; 2OHA A; 1ABY B; 1RQA B; 1MNJ A; 1X9F D; 3M3A A; 3V2V A; 1Y8K B; 1JZM A; 1TES A; 1SDL B; 2M6Z A; 4F4O A; 1YGF A; 1F5P A; 4H2L A; 3ONZ B; 1YCA A; 1MTK A; 2FRJ X; 1MLR A; 2WTH A; 1BZ0 A; 2ZFB A; 3OJ1 A; 5E6E A; 3G53 A; 1YE2 A; 5CN5 A; 1VXD A; 1O1M A; 1XZ7 A; 1VXG A; 5KER B; 2EVP A; 1DWS A; 2BLH A; 4TYX A; 1NQP A; 1DO3 A; 1DXV A; 1Y4F B; 2QFN A; 2VYW A; 2R4Y A; 1XZ4 B; 3TLD A; 2DN1 A; 2G0X A; 3WTG A; 2GTL D; 1M6C A; 3S65 B; 2ZSR A; 2MBW A; 2HBC A; 3WFX A; 4G51 B; 1DTI A; 2DHB A; 3V2Z A; 2MYC A; 1MLL A; 3UHD A; 1JP9 A; 3PI9 A; 3NL7 A; 1LFV B; 1C40 A; 3WCT A; 1BVC A; 2MGJ A; 1H1X A; 1HCO A; 1OFJ A; 3D4X A; 2BLI A; 4XDI A; 3EOK B; 5JDO C; 3LB4 A; 4NK2 A; 1C7B A; 1XY0 B; 2QSP B; 1YMC A; 5AZQ A; 2MGK A; 3P5Q B; 1Y0W A; 1NPG A; 2D2M B; 3ODQ B; 1XZ2 B; 1BIJ B; 1V07 A; 1BJE A; 5EUI B; 3H58 A; 105M A; 5HLX A; 5E83 A; 2W72 B; 3BCQ A; 1M9P B; 1XZU B; 4OOD A; 3WCW A; 1GCW B; 3WFT A; 1GDL A; 3B75 A; 2AUO A; 1FAW A; 3ZJI A; 1Y85 A; 4U8U C; 2XKH A; 4B3W A; 1ABS A; 1HGB A; 1YEU B; 1J7W B; 2GLN A; 4M4A B; 1A3O B; 2O5M X; 1HDB B; 3UHW A; 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2C0K A; 1HBH B; 3E55 A; 1J41 B; 1RVW B; 1DXU B; 2D5X A; 1IOP A; 3A59 B; 3CY5 B; 3WCT C; 2V1H A; 1B86 A; 3HEN A; 1WVP A; 4O2G A; 2V1E A; 1NEJ A; 1MYG A; 5HY8 B; 3HHB B; 1J7S A; 1GLI A; 1Y35 A; 2PEG A; 3OZV A; 3A9M A; 4U8U D; 1MDN A; 107M A; 3ARL A; 3VHB A; 5HBI A; 1H97 A; 1QSI A; 1CIO A; 3PI1 A; 1KD2 A; 4NI1 A; 2HHB A; 1MWB A; 1MKO A; 1OUT B; 1LFY A; 3AQ6 A; 1O1K A; 3HRW B; 1HAC A; 2ZLV A; 5KDQ B; 4ODC A; 7HBI A; 3A2G A; 1A9W A; 2DXM B; 2NRM A; 1YFF A; 2OIF A; 1Y4G B; 5JGG B; 3UHG A; 1YIH A; 2R80 B; 2MHB B; 1Y83 B; 3NG6 B; 1HGC B; 1BZ6 A; 1GJN A; 1DXD A; 4HBI A; 5MBA A; 1O1L B; 1G0B A; 2H8D B; 4IRO B; 4F69 A; 1WLA A; 1X9F B; 3VRF A; 2ZSN A; 4KMV A; 1FHJ B; 3HEO A; 1Y0C B; 1Y7C A; 3CIU B; 1O1J B; 3VAU A; 1BVD A; 1Y4R A; 3AQ9 A; 1NAZ A; 1DO1 A; 3GLN A; 1MLF A; 2NRL A; 1YE0 A; 1O1N B; 2GNW A; 1S5Y A; 6HBI A; 6HBW A; 1SDK B; 3ZOM A; 1RQ3 A; 5D1V A; 2W6V A; 2OH8 A; 3S66 A; 2QU0 A; 1XZV A; 3LHB A; 1J3Z A; 1S69 A; 5CNG A; 1DWR A; 2MYD A; 3PT7 B; 1Y4B B; 2VYZ A; 1A01 B; 2D5Z B; 1PBX A; 5ILM A; 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