The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDIHIRLFKSHPETLEKHDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTELTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFESEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Roles of glutamates and metal ions in a rationally designed nitric oxide reductase based on myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
59
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-03-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3ZJL A; 1YFF B; 2HBD B; 2HBS B; 1COH A; 1IRC A; 1NS9 A; 1J40 A; 1WMU B; 1MDN A; 3A0G B; 3ODQ B; 1MLG A; 3BCQ A; 2HBE B; 3GQG B; 1LFV B; 2NRL A; 2EKT A; 3SDH A; 4YU3 A; 1M6M A; 1V5H A; 2PGH A; 3A59 A; 3MN0 A; 1YZI A; 5CMV A; 1MLM A; 2NRM A; 3UH5 A; 3WCP A; 1HAC B; 1MYI A; 2NSS A; 1CQX A; 3S65 A; 4FWZ A; 1RSE A; 2G11 A; 2MHB B; 2V1E A; 2PEG B; 2Z6S A; 1GZX A; 3LB1 A; 1BVD A; 2ZS0 B; 3MKB A; 1SHR A; 4H0B A; 5CN6 A; 1O1I A; 3QJD A; 4PQC A; 1JPB A; 1IDR A; 4NI1 A; 1UVX A; 3OO4 B; 1Y8I B; 3GOU A; 4C0N A; 1SDL B; 1FSL A; 1XYE B; 5CNC A; 1LH1 A; 1YH9 A; 3EOK A; 3UGY A; 3RJ6 A; 2DN2 B; 4MU5 A; 1N9H A; 1FDH G; 3AQ6 A; 1J41 B; 2R4Z A; 1A9W A; 1J7W B; 4F6D A; 4YU4 B; 1A00 A; 2Z6T A; 1Y7Z B; 2IN4 A; 1B0B A; 3HYU A; 1YVQ B; 4WJG A; 3PI1 A; 2O58 X; 1CMY A; 1ABY A; 1FN3 A; 1A0Z A; 1NGK A; 1CIO A; 2DHB B; 3HRW B; 4HRT A; 5JOM A; 3UHI A; 1O1M A; 1Q1F A; 3NL7 A; 2DXM B; 2OIF A; 3ED9 A; 1FSX A; 1S6A A; 1A0U A; 3AQ8 A; 1NZ4 A; 2QMB B; 1QSH B; 1MBA A; 1R1Y B; 3VRE B; 1AJG A; 1Y8H B; 1MYJ A; 5JDO F; 1JF4 A; 1YIE A; 2D2N B; 3VRG B; 2G12 A; 5EOH A; 1HBA A; 3WCW B; 2D2N D; 4H2L A; 2ZT1 A; 1YG5 B; 1ABW B; 1MNK A; 4N7O B; 3DUT B; 1YFF A; 1AJH A; 3WCW D; 1V9Q A; 3D1K B; 1G0B B; 1LTW A; 2D5Z B; 3BJ1 B; 1BZ0 A; 2HBD A; 2ZFB B; 2HBS A; 3FH9 B; 5EUI B; 2VLZ A; 1AZI A; 1WMU A; 2RAO B; 3A0G A; 3ODQ A; 1MYM A; 1MLR A; 2HBE A; 2SPN A; 1LFV A; 2QFN A; 3GQG A; 3UI0 A; 5HBI A; 1MZ0 A; 1MOD A; 1NZ5 A; 1HAC A; 1OR4 A; 1EBT A; 2MHB A; 4LPI A; 1HCO B; 1MWB A; 4U8U C; 2G0X A; 1HGC B; 1BZP A; 2PEG A; 5CHQ A; 1X9F D; 1YIH B; 3NMM B; 4TWU A; 1DXV B; 2ZS0 A; 1QPW B; 3A5G A; 1Y7D B; 4ESA A; 1MLJ A; 2SPO A; 5CNB A; 5HLX A; 3OO4 A; 5ILP A; 1UFJ A; 1Y8I A; 3QZZ A; 1SDL A; 2VYZ A; 1C40 B; 1XYE A; 2VEE A; 2W6X A; 5JDO E; 4HSW A; 1LHS A; 2DN2 A; 2R80 B; 4M4B B; 3PT8 B; 4PNJ A; 1GDI A; 1J41 A; 103M A; 1J7W A; 4YU4 A; 1J3Y B; 1Y7Z A; 2VYW A; 4JAC A; 1YVQ A; 1BZR A; 1DXC A; 2ZSO A; 5B85 A; 2DHB A; 3HRW A; 1NQP B; 3ZOM A; 1RQ3 B; 5KER B; 1A6N A; 2DXM A; 1RPS B; 5SW7 B; 1URY A; 3D7O B; 4G1V A; 2QMB A; 1YE2 B; 1DWR A; 1DXD A; 5KDQ B; 1YHE B; 1QSH A; 1IT2 A; 108M A; 1R1Y A; 3VRE A; 2MGL A; 2GKN A; 3UHD A; 1Y8H A; 1F5P A; 2D6C A; 1HAB B; 3MYN A; 1Y45 B; 1UT0 A; 2D2N A; 3UH6 A; 4G1B A; 3VRG A; 1HBR B; 1X46 A; 3WCW A; 1J7S B; 2GDM A; 1Y8W B; 2GNW A; 2GTL C; 4L7Y B; 4MQI B; 3IXF A; 1GCW B; 4ODC B; 1YG5 A; 1CP0 A; 3AQ7 A; 3WFT A; 1ABW A; 1HBS B; 4N7O A; 3DUT A; 1HLB A; 1S5X B; 3D1K A; 2QU0 B; 1D8U A; 3UHG A; 3BJ1 A; 3WI8 A; 2EKU A; 1DWT A; 1CBM A; 1YEN B; 2ZFB A; 1OJ6 A; 3FH9 A; 5EUI A; 3UHC A; 3OK5 A; 5C6E B; 3HHB B; 101M A; 2RAO A; 2GRH A; 1RVW B; 2ZLV B; 2HZ1 A; 1MYF A; 3AT6 B; 1HV4 B; 5EV5 A; 3QJE B; 3ASE A; 1HDS B; 3WCT B; 4H07 A; 4DWT A; 1X9F A; 2ZSQ A; 1CG8 B; 1HCO A; 3WTG A; 1HGC A; 2Z6N B; 1J7Y B; 3H58 A; 2G0R A; 4MAX A; 3ONZ B; 1YIH A; 3NMM A; 4UIQ A; 1HSY A; 5CNG A; 1DXV A; 1QPW A; 1U7R A; 1YEQ B; 1CH5 A; 1F5O A; 4ILZ A; 4B3W A; 3UH7 A; 4MQK B; 1C7C B; 1JP9 A; 1Y7D A; 4O2G A; 3IC0 B; 1Y5F B; 3QM7 A; 1Y4Q B; 1YOH A; 1I3E A; 3KUO A; 1VXG A; 3ZJQ A; 1YE0 B; 1T1N B; 1C40 A; 1BZZ B; 3HF4 B; 4X0L B; 1GVH A; 1NPG A; 2FRI X; 1QSI B; 3SDN A; 1MKO B; 2R80 A; 4M4B A; 3NML A; 2O5T X; 1MOA A; 3PT8 A; 1NZ2 A; 1VHB A; 2BMM A; 1N9X A; 1S61 A; 1J3Y A; 4G51 B; 4MQG A; 2ZFO B; 1MTK A; 1EWA A; 3GQR B; 1UX9 A; 4DWU A; 109M A; 1UIW B; 2AV3 A; 2LH7 A; 5E29 B; 1NQP A; 4M4A B; 4KN3 A; 1RQ3 A; 1S56 A; 5KER A; 2ZFO D; 2EB8 A; 2ZT4 A; 4GZG A; 1RPS A; 2OH9 A; 3E5O A; 5SW7 A; 1C7B B; 2W72 C; 3D7O A; 1YE2 A; 1BZ6 A; 5KDQ A; 1YHE A; 1SWM A; 2B7H B; 2R1H B; 2NX0 A; 2AA1 B; 1HAB A; 1Y45 A; 2FAL A; 2M6Z B; 1Y7C B; 1HBR A; 1J7S A; 2ZLU B; 1Y0D B; 1NIH B; 1Y8W A; 4L7Y A; 4O35 A; 4MQI A; 1GCW A; 4ODC A; 3UHS A; 1YCB A; 1HBS A; 1MTJ A; 1S5X A; 3S66 B; 1U7S A; 2QU0 A; 5CND A; 2MYD A; 1RQ4 B; 1FDH A; 1YEN A; 2OH8 A; 3UHV A; 1Y7G B; 4FC3 B; 5C6E A; 1A3O A; 3HHB A; 1RVW A; 2ZLV A; 3G4W A; 4MBA A; 2MGM A; 4FH7 A; 3AT6 A; 1HV4 A; 3QJE A; 1HDS A; 3WCT A; 4DC7 A; 1XZ2 A; 3S1I A; 2MGF A; 3O89 A; 1CG8 A; 1THB B; 3WCU B; 2Z6N A; 1SDK B; 1PBX B; 4TWV A; 1J7Y A; 3AG0 A; 2AV0 A; 3ONZ A; 2FAM A; 2MGD A; 5C6Y A; 1HRM A; 1GDK A; 1YEQ A; 4MQK A; 1C7C A; 2W6Y A; 2ZST A; 3WCU D; 4MQC B; 3GLN A; 3E5I A; 3IC0 A; 1Y5F A; 2R50 A; 3QJB B; 1Y4Q A; 3GQP B; 1MLH A; 2ZLT A; 1YE0 A; 2MGC A; 1T1N A; 1BZZ A; 1QXE B; 3HF4 A; 1FLP A; 1IBE B; 4X0L A; 1QSI A; 2W6V B; 2V1I A; 4JYQ A; 1MKO A; 2V1K A; 1XCH A; 1CQ2 A; 1BIJ B; 2V1H A; 2D2M B; 1M6C A; 111M A; 1LHT A; 2VRY A; 2EVK A; 2ZS0 D; 4G51 A; 2ZFO A; 4ZVA A; 1XZ7 B; 3ARJ A; 2D2M D; 3PIA B; 1UIW A; 2XKG A; 1LH6 A; 4M4A A; 4NI0 B; 1HLM A; 1L2K A; 1BIN A; 5CN5 A; 1HDA B; 1S69 A; 2O5L X; 5ILE A; 3UHY A; 2O5M X; 4O1T A; 1C7B A; 1HGA B; 1DXU B; 3ORD A; 2B7H A; 2R1H A; 3UHN A; 2AA1 A; 3NFE B; 106M A; 2QFK A; 3LQD A; 2AUQ A; 2M6Z A; 1DUK A; 1Y7C A; 3E55 A; 4ZVB A; 1HJT A; 2LH5 A; 2ZLU A; 1Y0D A; 1NIH A; 5KKK A; 1O1K B; 3WCV B; 1F63 A; 4DC8 A; 1HBB B; 1JL6 A; 1MLO A; 5JDO D; 2LH3 A; 3ECL A; 3S66 A; 3AQ9 A; 112M A; 2O5Q X; 1MYZ A; 1MLQ A; 1MCY A; 3WCV D; 1RQ4 A; 2ZWJ A; 1YCA A; 1AJ9 B; 3DR9 A; 3UGZ A; 1Y7G A; 4FC3 A; 3V2Z A; 2RI4 B; 1MNO A; 3D1A B; 2DN3 B; 1DLY A; 2NSR A; 3OZV A; 1JP8 A; 1HDB B; 4L2M A; 2HHB B; 1Y5K B; 1Y83 B; 3G4Y A; 3IC2 B; 1C7D B; 3EU1 B; 1Y0T B; 5E6E B; 4N8T B; 1JZM A; 1MNI A; 1LFT B; 4HRR B; 3GDJ B; 5E83 B; 1LA6 B; 3WCU A; 1SDK A; 1PBX A; 2HZ2 A; 2EF2 A; 1CLS B; 3VRF B; 3UHU A; 1CH2 A; 1URV A; 3RJN B; 1MYG A; 3KMF A; 4MQC A; 2MBW A; 3QJB A; 2XKI A; 3GQP A; 1J3Z B; 5CNE A; 4F6B A; 3K8B B; 4IRO B; 6HBW B; 4XS0 B; 2O5O X; 2AUP A; 1QI8 B; 1MLF A; 1GBU B; 1QXE A; 1DO3 A; 1IBE A; 4NK2 A; 1IRD B; 2W6V A; 2R4W A; 1DO4 A; 4FWX A; 1O16 A; 3S48 C; 3UHR A; 1BIJ A; 2D2M A; 105M A; 2D60 B; 1O1P B; 2ZT2 A; 1UC3 A; 1TU9 A; 3HEN A; 4PQ6 A; 1XZ7 A; 1OUU B; 1PMB A; 3PIA A; 1V4X B; 1K0Y B; 1X9F C; 1CH1 A; 1YHU B; 2R4X A; 4NI0 A; 1MTI A; 1LFY B; 1HDA A; 3UHW A; 6HBI A; 1LFZ B; 1Y4P B; 4HSX A; 1YHU D; 1O1J B; 3W4U B; 1HGA A; 1DXU A; 4B4Y A; 4F4O B; 1V4U B; 3QQR A; 1G09 B; 1A6K A; 3B75 B; 2E2Y A; 1ABS A; 1HGB B; 3NFE A; 2VM0 A; 2LH6 A; 2ZS1 B; 5EE4 C; 1Y4V B; 1LH3 A; 2MGB A; 1UX8 A; 2H8F B; 4VHB A; 2QSS B; 3G4R A; 1O1K A; 3WCV A; 2ZS1 D; 3ZJN A; 5AB8 A; 2MYE A; 1HBB A; 1MBO A; 3MVC A; 3ECX A; 1LH2 A; 1MOH A; 2GRF A; 1LFQ B; 1X3K A; 1AJ9 A; 3G4Q A; 1KFR A; 1Y31 B; 3WFW A; 3NG6 B; 2VLX A; 2RI4 A; 3DHT B; 2MGG A; 3D1A A; 3BOM B; 1DWS A; 2DN3 A; 3OGB A; 1FHJ B; 3IA3 B; 1XQ5 B; 1HDB A; 2HHB A; 3UH3 A; 1Y5K A; 1Y83 A; 1G0B A; 3IC2 A; 3M3B A; 2D5Z A; 2LHB A; 1C7D A; 3EU1 A; 1Y0T A; 4NZI A; 2HBF B; 5E6E A; 5HAV A; 4N8T A; 1Y4F B; 1LFT A; 3GDJ A; 5E83 A; 1LA6 A; 1R1X B; 3FS4 B; 2V1J A; 1MWC A; 2SPL A; 2ZSR A; 4F68 A; 3VRF A; 1LUE A; 2H35 B; 1KR7 A; 1MWD A; 3QZX A; 3UBC A; 1LH7 A; 1GDL A; 4ROM B; 4XDI A; 1VRF A; 4MQJ B; 3OO5 B; 1BAB B; 3LB2 A; 1J3Z A; 3K8B A; 3TM3 A; 4IRO A; 1XZU B; 1G08 B; 4XS0 A; 3WCT D; 1VXB A; 1QI8 A; 1Y0W B; 1GBU A; 1J3F A; 3MOU A; 5JGG B; 2R4Y A; 1KD2 B; 1IRD A; 3WHM B; 1JL7 A; 1MLK A; 1Y2Z B; 2ZLW B; 3BJ3 B; 3OJ1 A; 4NXA A; 1CH9 A; 2D60 A; 3O7N A; 2LH1 A; 1O1P A; 2KSC A; 1NS6 B; 1OUU A; 3LR9 A; 1V4X A; 1K0Y A; 2LH2 A; 1YHU A; 1HHO B; 1NPF A; 3QM6 A; 3DHR B; 1CPW A; 1LFY A; 1A6M A; 1LFZ A; 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5B84 A; 3WHM A; 3LR7 A; 4QAU A; 3WFU A; 5CN4 A; 3UHZ A; 3PI4 A; 2MGI A; 1BZ0 B; 1Y2Z A; 2ZLW A; 3BJ3 A; 1VRE A; 1XY0 B; 1G9V B; 3QM9 A; 5CNF A; 1NS6 A; 5EYS A; 1YMB A; 1H97 A; 2XYK A; 1Y0A B; 7HBI A; 5D1V A; 2HHE B; 1HHO A; 3PT7 B; 1JZL A; 110M A; 4F6F A; 1CG5 B; 4HBI A; 1Y5J B; 3DHR A; 1N9I A; 5HLQ A; 3UHK A; 3WCU C; 4MXK A; 3TLD A; 4ROL B; 3TM9 A; 1OFK A; 1GBV A; 4F69 A; 2AUO A; 5MBA A; 3KMF C; 3HEP A; 3GYS A; 1BUW A; 1FAW B; 1VXC A; 2W72 A; 3GQR A; 1Y85 A; 5D5R A; 1A9W E; 3GK9 A; 5E29 A; 2ZLX A; 3CIU A; 4ESA B; 1DKE B; 1IWH A; 4AVE A; 5AZR A; 3HXN A; 3ZJI A; 1G0A A; 2ZT0 A; 2SPM A; 1BZ1 B; 2C0K A; 3UHB A; 2VYY A; 3PEL A; 2ZS0 C; 4WJG 1; 1VXA A; 1O1N A; 2ZSN A; 1JDO A; 3PI9 B; 1S5Y B; 1IT3 A; 3GKV B; 2BKM A; 1O1O B; 2D2M C; 1DM1 A; 4OF9 A; 1ITH A; 1VXE A; 4AVD A; 2H8D B; 1V75 A; 1YMC A; 1OR6 A; 2FRK X; 4PQB A; 5EYJ A; 3U3E A; 2BLH A; 1YVT B; 1CIK A; 3WR1 B; 3P5Q B; 3V2V A; 1Z8U B; 1K1K B; 1XZ5 A; 1Y09 B; 1MYH A; 4TYX A; 1SPG A; 4IT8 A; 1UFP A; 2Z8A A; 1DXT A; 4C44 A; 3QQQ A; 3QM8 A; 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