3M3FA

Pepa bound to the ligand binding domain of glua3 (flop form)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular mechanism of flop selectivity and subsite recognition for an AMPA receptor allosteric modulator: structures of GluA2 and GluA3 in complexes with PEPA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 3
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3m3fA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3m3fA02
5M2VA 4F1UA 3DM0A 3FATA 3ILTB 4O3CA 4OFLA 2HFBA 2XD3A 1B51A 1B46A 2Q2AA 1M5CA 4H5GA 5JK4A 3HO7A 3S2VA 3K1PA 2GRVA 3G3IA 1D9VA 2QSXA 4KD5A 2PT2A 1TWYA 2OZZA 1B0LA 1LCFA 1A40A 1JETA 1B05A 5I84A 2Z22A 3LSXA 2F8DA 4C1TA 2F7AA 4QF9A 3MWBA 4UA8A 3T93B 1MQGA 2X26A 4EQ7A 4NF6B 4C0RA 3Q26A 1AL3A 5FTHA 2QPQA 2I48A 3HSTA 4X1DA 3ZS6A 4FJPA 4RK9A 3WAEA 2DYXA 3VDFA 2ALUA 4G68A 3IOWA 3IB1A 2I6EA 4RNSA 1UIUA 2HCAA 3MJNA 1NNFA 3VLVA 2VD3A 3B6QA 1B40A 4EXLA 2X7QA 1M5BA 4GQOA 2F78A 4H8JA 3UIFA 2ZYMA 4ESWA 3TQLA 4OZ9A 4TLLB 2I49A 4PFUA 1USYE 3HHGA 3JYRA 3IOVA 1SYIA 2THIA 4YU0A 3UGWA 3LUYA 4R75A 3EN3A 2Y7RA 5J1DA 1II5A 2QL3A 3PUYE 4U4XA 5L9OA 5CBRA 2NWJA 5H8NA 3Q28A 2V3QA 3KN3A 3LR1A 3THIA 1VE4A 3VVFA 1AOVA 2Y7PA 3ECRA 2W7YA 3FXQA 1MXWA 1FTKA 3QAXA 2RCAA 1NL5A 3VXBA 2ZYKA 1B6HA 1A8EA 2O1MA 2D5WA 1MXUA 4NF4B 4KYSA 4QSCA 4WKMA 4DXUA 4OFOA 3C35A 3O66A 4JWXA 3C31A 2I3VA 1LB8A 2R71A 2Y7KA 3L6HA 3C36A 5KZTA 1DTZA 4H65A 4YKJA 3IJXB 2OLBA 2ONKE 1Y4CA 2UYFA 4ISUA 2NOOA 2QS2A 1P99A 5L8DA 4POXA 3CSGA 2NXOA 4GOTA 5KDTB 4F31B 3TTRA 1WVJA 2O7UA 2DWIA 3K1MA 4GL8A 4FATA 1XOCA 4FEBA 1O7TA 4GFRA 2RC9A 4TOZA 5H8HB 5I57B 1SBPA 5I2KA 2PX1A 3VXCA 3M3FA 3IR1A 2PBWA 3K4UA 3IOUA 3O6HA 1N7XA 1OMPA 1PEBA 3PD9A 4LVQA 4U4SA 4ZEBA 1B32A 1QW0A 1R9LA 4X48A 3DP8A 1Y3PA 5I56B 4G2ZA 3DELB 1OVTA 4LA9A 1EH3A 4LZ8A 2GFEA 2XXUA 3CG1A 2E1SA 2I58A 5TU0A 3OEMA 2ZXTA 4U2RA 1TT1A 3PMWA 2IEEA 3PMVA 1B52A 5I2NB 3V8XB 2DWAA 4DDDA 4DCYA 2M8CA 3C4MA 4FAJA 1H45A 2F34A 2Q8JA 4HS7A 3IO6A 1UQWA 4BDOA 4XXUA 4Q8RA 3FJGA 1FQDA 1H3DA 4O3AA 4F22A 4U22A 5F1QA 5I2NA 3MZ9A 3HCQA 1NMUA 5H8QB 4OYVA 3FZVA 4G4PA 3OOAA 1BKAA 1MQJA 1B4HA 2F7CA 3S9NC 3CFLA 4ZEDA 4QSEA 4JSDA 1N3WA 1F9BA 1FW0A 5ICQA 2ZNTA 2Y7IA 3KOSA 3RT6B 1N04A 4JSOA 1I6BA 3WAFA 1MM7A 4FE8A 3K6XA 2H5YA 1JEVA 5H8QA 3MUQA 1MXXA 3KZGA 3IB0A 1QKBA 5CMMA 2F6GA 1H43A 1JW5A 1H44A 5BWJA 1A8FA 3TAJA 4ZZAA 4WEPA 4JBZA 4F19A 3IB2A 3PPNA 4GWOA 1ZBMA 2DP8A 2H4IA 5CC2A 1XVXA 3AXFA 4C1UA 4BDRA 1OLAA 3G3GA 1NNKA 3RQTA 1ZIUA 3CFXA 1JW4A 1B7UA 1LFGA 3ZKLA 4UACA 4EQBA 3KGCA 3Q29A 1IUDA 3RLFE 3N94A 3KSJA 2P0SA 1IEJA 4IGTA 1XVYA 4EF1A 1POY1 4GIZA 1YCJA 1MXYA 2A5TB 3MP8A 4YB6A 3TMGA 4PE5B 3T66A 3H6VA 1POTA 1H76A 3H6TA 3TELA 5B70A 4NF5B 2XXWA 5EHMA 1M5EA 4OMBA 3I5OA 1DOTA 4N6PA 4OETA 4R74A 3TCFA 1O63A 3QSLA 1P1QA 2FYIA 1UTHA 3HV1A 2R9JA 4ONYA 1B3HA 4YKKA 3EHTA 1B5JA 2VGQA 5FHMA 1B3FA 1NNTA 1Y1MA 2YJPA 3TPAA 1ANFA 1GR2A 2RC7A 1LAHE 4R9GA 3PPQA 4ZE8A 4XKNA 4P11A 3KJTA 4RPNA 1LSTA 4HTGA 3TUSA 4ESXA 1MPBA 5CMCA 1MH4A 3U1OA 4OERA 2QS4A 1HSJA 3B6TA 4P0GA 3MW0A 1Y3NA 4EF2A 3OSRA 1SW4A 3H06B 1JVYA 4EUOA 3SEUA 3H7MA 1SW5A 4KI0E 1SVXB 5ITOA 3UP9A 1D3KA 4IY6A 1LFIA 1FQEA 2XHDA 4LQ5A 3PUWE 2IA4A 3VVDA 1PB7A 1M5FA 3KSXA 2GH9A 2AL5A 3G3HA 3K6VA 1ZJLA 5I59B 1Z7NE 3KJ7A 3FD3A 4F29A 3ONMA 1AMFA 4ELQA 5H8FA 1P1UA 3ILUB 3PD8A 2YLNA 3HN0A 4H5FA 2Z8EA 4XIGQ 1MY3A 4H1XA 1A7LA 4LQ2A 1LFHA 3C9HA 5AE4A 2UVHA 1OVBA 4U1ZA 2O7IA 1M5DA 3ODBA 3A3UA 3U8QA 4F3SA 1QULA 1S7YA 3OMBA 2F36A 2O69A 3PV0E 3D4GA 3M8UA 1EZ9A 1ZMGA 2UXAA 4R6YA 1B58A 4F1YA 1ELJA 5I58B 1B3EA 1FTOA 1IXCA 4LP2B 2OWSA 4NF6A 3KEIA 3W15C 4FECA 3PGFA 2LAOA 2DOJA 3Q27A 2PT1A 4NWDA 4RK2A 2XXPA 3O28A 4TQUQ 3TTNA 1OIBA 5EYFA 2RKMA 4H8IA 4F18A 4PFYA 3FVNA 2ZYOA 1N7WA 2F6PA 1Y4TA 4IO6A 2FA7A 1B7HA 4Q0CA 1B0HA 1LAFE 3F11A 1B3GA 4Z0IA 5AA2B 4AB5A 4GVOA 5CM6A 1MXVA 3FVKA 4YMAA 3LBSA 4GD5A 2Y7WA 4NE4A 4U23A 3PUZE 4NTLA 2I4BA 2Q2CA 3FXRA 1FTMA 1EZPA 3RN8A 3U72A 1MPCA 3PUXE 1Y20A 3T9HB 4KPTA 3UK4A 1JNFA 4ZEIA 5AA2A 4Z7EA 2OCUA 3G3FA 3KN8A 4MBPA 1FQCA 3CIJA 4DXBA 1GVCA 3TEPA 3QUJA 3IORA 3K02A 4GXAA 3QUFA 3ZKKA 1IZ1A 4KCCA 2XXTA 5HBCA 3EF7A 1LBCA 4NF4A 4F39A 2Q89A 3PPPA 4HCYA 5LOMA 3G7WA 3MP1A 4LATA 2NUVA 1URDA 3H6WA 4NEDA 2GHBA 4Q30B 4KYDA 2HAUA 3VE1B 3FIRA 1IXIA 4JWYA 2ZNUA 4YB5A 3E3KA 1VFDA 4QSDA 5KDTA 4RJZA 3FJ7A 1PB8A 1DTGA 2WKYA 2B65A 4YZZA 2UYEA 1GTKA 2VOZA 4RY1A 4OVJA 3IL1B 4YKIA 1N76A 5IKBA 5K2YA 5BUUA 3CRBA 4H67A 3QK6A 5H8HA 5I57A 2A5SA 3LC8A 3VFJA 1NKXA 5CBSA 4X1BA 3U92A 1UTBB 4ELOA 4N13A 5I56A 4ELPA 1MQHA 4THIA 3RPWA 2DVZA 1R9QA 1SQYA 2RC8A 2H25A 4JB7A 4KYEA 2G93A 4X9TA 3TTMA 3OEKA 4ELRA 4MFIA 4FIMA 3TTKA 2H9BA 3M3KA 1TFAA 3KFMA 1ZTYA 1LBBA 1OLCA 4GRKA 4R6KA 2F7BA 4EDPA 3C32A 1MY4A 5HPQA 1B5HA 3LSLA 3DP6A 5F7VA 3G3JA 3OXNA 1P1WA 3R6UA 3SESA 3T96B 4IO7A 4ZECA 3OO9A 3SETA 2DWJA 3L6GA 1L5TA 1O64A 4GLIA 1BP5A 5FHOA 4IO2A 2PMSA 1P1NA 1S50A 2ABHA 1PDAA 1HSLA 3RTWB 2GHAA 2HZKA 3D4CA 3N5LA 4LUBA 5DVJA 4PFWA 1GGGA 5DTBA 1VSOA 3VLUA 5JTYB 5AA4B 3W9WA 2I0BA 4MH5A 1ZKBA 3BFUA 3O6GA 1TFDA 4XKRA 3I3VA 2F5XA 1MPDA 3EHUA 3T22A 4GF8A 4BDNA 2O1LA 4L17A 4OWDA 5HM4B 3EQ1A 2DVCA 1MDP1 2BJJX 1Y9UA 3SEWA 4XKPA 2XD2A 3QIMA 2HQ0A 5JTYA 1FTJA 1B5IA 4RXLA 3KN7A 1SD3A 2V25A 3U93A 3MVXA 2DQVA 4JDFA 4FEDA 4RYAA 4ZE9A 1JW1A 2XXVA 1QJMA 4OTEA 4F3GA 1CE2A 2O6AA 2E0SA 2I3WA 3E13X 4H0WA 4QFOA 3T9VA 3MQ9A 1MY0A 4YAHX 5FTIA 1B4ZA 2ESNA 2DE4A 3DP4A 3MBPA 3OO6A 4POWA 5IAIA 4ZS9A 4KHZE 1XT8A 1LAXA 5FHNA 1SI1A 1URSA 3K00A 4KQPA 3RT8A 2HZLA 5L9MA 3T9XB 3RY3A 2A5TA 4R2FA 3S9MC 1VFEA 4E0WA 1QUKA 5DYHA 4PP0A 2I0CA 2XXXA 1HSEA 3LSWA 3W9VA 4BDLA 3SDFA 1NNPA 4NF5A 3LSFB 1OQHA 3O29A 3OELA 2NVUB 2VHAA 4FORA 5AA2D 4IO4A 1GV8A 3MZBA 4YKPA 2V3UA 2Z8DA 5TPAB 2QRYA 3CFZA 1RYXA 3KOTA 3IOTA 2ZMBA 1LLSA 3TTLA 3N6TA 2XXQA 2XXYA 3OENA 3FV2A 4IO3A 4PQJA 2VP1A 3CVGA 1SI0A 3TQWA 2OBGA 1N3XA 4LONB 4G8HA 3MPKA 4MLQA 2H98A 1B1HA 2O51A 4DCXA 1JQFA 2HXWA 2DXRA 3TCHA 1N0TA 1EZOA 3PPOA 3O2AA 3SEVA 3MPLA 1DMBA 4NMYA 4QFKA 4JWOA 2V3TA 5CMKA 1QKAA 3KG2A 1NH8A 3K2DA 3SEYA 2AYSA 3S9LC 2Q88A 2PYYA 1AH5A 4U21A 1A55A 5ISUA 4HCWA 1BIYA 1OQGA 2CMOA 2Z8FA 4G68B 4IO5A 4AB6A 4DZ1A 3MAMA 3HPIA 3QYTA 4IB2A 4OQOA 5I59A 2XX7A 1VR5A 4LZ7A 2VD2A 4U1OA 2DE2A 4IGRA 2OWTA 4G8MA 4M4GA 1LAGE 3G3KA 2XXHA 1FQFA 3GXAA 3QXMA 1USYH 4Q5TA 2HAVA 5JEIA 3SEXA 4QHQA 3RGYA 4YMBA 1B2HA 3JV9A 4G8NA 1Z7ME 3RUMA 1XS5A 2RINA 2V93A 5H8NB 2QMXA 3H03A 3A09A 5I58A 3OO8A 3K6UA 5A5XB 4I9DA 1PC3A 1KWHA 4NF8B 3FXUA 4OEVA 5AA1A 1Y3QA 2REGA 3MZ1A 4F1VA 3MC2A 3S9EA 2Z23A 1EU8A 3V89B 2ZYNA 1MXZA 4BLAA 2UVGA 5DVIA 1CB6A 3EHSA 3Q25A 3IJOB 1R6ZA 3O97A 3A3CA 3TFLA 4R9FA 4OXVA 2D3IA 4JXIA 3GBAA 1SW1A 1SW2A 2O84X 4F2QA 1SYHA 3U94A 4RPOA 5A5XA 1DPEA 2CZLA 1BLFA 4NF8A 3SERA 4OEUA 4P0IA 1SDXA 2P1SA 3UN6A 1NFTA 4M1VA 3CR9A 1R1NA 1FTLA 3K01A 1QUIA 1MM6A 1YAEA 1D9YA 2ONRA 2ZNSA 2QMWA 2V84A 1MQIA 3FVGA 3C34A 2B3BA 4EQ9A 5I2KB 1J1NA 5ICTA 3JZJA 4ZEFA 3HHFA 1B1XA 2AL4A 1WDNA 3RNNA 3R7XA 5L9SA 1PBPA 3TODA 1UIVA 2B3FA 2FNCA 2XXRA 3FGSA 3TZAA 1WODA 3SKPA 3CSBA 1MG1A 4ECFA 1IIWA 4I62A 4DLDA 5K2XA 4IY5A 2QS1A 2XX8A 3PPRA 4H6DA 4YB7A 3O6IA 1MS7A 3MVWA 5B7DA 1LGBC 4PFTA 1RYOA 3KBRA 3IK6B 1MH3A 5CMBA 1QVSA 4WXJA 2HEUA 4MLVA 1YPNA 1ZLQA 4GXSB 4ZZEA 4DE8A 4HW8A 1MY2A 5ELVA 4OESA 1NH7A 4K3FA 5CRYA 2YPNA 1MRPA 1URGA 2UVJA 3OO7A 1UTBA 4N07A 4ZEKA 1MY1A 5AA3A 4I8CA 1XC1A 1IXGA 3TKDA 4F3BA 4DXCA 2XXIA 2DE3A 2DWHA 5DT6A 3B6WA 1B3LA 1A54A 2RF1A 3V5AA 1I69A 3PUVE 3K6WA 3BFTA 3GLBA 2DS9A 4PETA 1T0KA 4MF3A 3GZGA 1I6QA 3VLWA 4AQ4A 1MDQA 2OK2A 4TLMB 2H99A 4I1DA 2AIXA 3P7IA 5DVFA 4LZ5A 2OJTA 3FASA 3VVEA 2D21A 2DXYA 2XX9A 2QJEA 3UA8A 3M3LA 1IQ7A 3O9PA 2REJA 4BDMA 3H3GA 3IAZA 4R72A 1B9JA 3ZSFA 3CG3A 4RA1A 1Y1ZA 1B7ZA 1ZU0A 1BTJA 1IXHA 3TDJA 1Q35A 2O68A 5ITPA 2KLFA 4BDQA 3PMXA 4ND9A 4G77A 1IITA 3FUZA 2ONSA 1S9TA 5AA4A 3E9XA 3V83A 3T9UA 5TP9B 2F35A 3R26A 2Y84A 2P2AA 4KR5A 3TCGA 1RKMA 4YICA 4XTCQ 1JEUA 5CI5A 2DSFA 3FVOA 1UTHB 2G29A 1FQBA 2I4CA 1FCKA 4O3BA 4WEDA 3E4RA 5DEXB 1DPPA 1YTVA 4KCDA 3USDA 4NWCA 5TP9A 1PB9A 4OHNA 4R6HA 5H8SA 5EHSA 3OD7A 4ZDMA 3IX1A 3IO4A 3RTFB 4DIGA 3S4UA 2ANJA 3K1NA 4OFJA 5KCJB 1P1OA 3FV1A 1A99A 2PVUA 4QFLA 3N6UA 2UVIA 4R73A 4QFPA 2X7PA 1PBQA 1LCTA 2F97A 4R2BA 3N26A 3UORA 1QUJA 1MQDA 2RCBA 1ATGA 3GBBA 1LB9A 4OENA 3TYHA 4QFNA 5DEXA 3CI8A 3B7DA 3MP6A 3MVYA 2Q9TA 2R6GE 1FQAA 3MVZA 3BKIB 1N84A 1Q1KA 3K0VA 3FJMA 1XHYA 4XKQA 1I6AA 3OSQA 5KCJA 1TXFA 3DLNA 3VV5A 3H4ZA 3EPEA 1US5A 3C33A 4KFQA 3I6VA 2QS3A 1JVXA 4G68C 4QRZA 3H6UA 5TPAA 1AIVA 4F2OA 4E0XA 1DSNA 4EXKA 1US4A 3PU5A 1D4NA 5H8FB 3BBRA 4F3PA 4GL0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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