3M3FA

Pepa bound to the ligand binding domain of glua3 (flop form)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 3
publication title Molecular mechanism of flop selectivity and subsite recognition for an AMPA receptor allosteric modulator: structures of GluA2 and GluA3 in complexes with PEPA.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3m3fA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3m3fA02
4IO5A 5F7VA 1LAXA 1LFGA 3RNNA 1B3FA 1FTJA 2H98A 1SI0A 3K6UA 1MQDA 3CSBA 1JW1A 3VE1B 2RCAA 2V93A 5I58A 2XXUA 5FTIA 4BDNA 3PPOA 3I5OA 4OXVA 4R2FA 2OK2A 5EHSA 1FQBA 3A3CA 3DELB 3K1NA 1M5FA 5H8NA 1LB8A 3RGYA 1B1HA 1JW5A 1URDA 2UVHA 4F2QA 3HPIA 3ODBA 4KPTA 1MY3A 1H45A 4EF2A 3IO4A 1IIWA 1VSOA 2Z23A 3S4UA 2HQ0A 5IKBA 3LR1A 1Y1MA 1PC3A 4OFLA 4PFUA 1LAGE 5J1DA 1PB9A 5A5XB 1DPPA 3FASA 1SDXA 2ZNSA 4JSDA 4R6YA 2W7YA 3M3LA 3KOSA 2Z8FA 2FYIA 4H5FA 4X1DA 1ZBMA 1MH3A 1P1WA 3IOWA 3E13X 3PPNA 4LZ5A 1I69A 1A54A 1OVBA 5CMKA 1MQJA 2H9BA 4ISUA 4KHZE 2PT2A 4NMYA 4LP2B 5AA2B 1MQIA 1JNFA 3CG3A 1S7YA 2IEEA 3ZSFA 5KZTA 1NNPA 1Y20A 1YCJA 4YB7A 2XXRA 5H8HB 1WDNA 5ICTA 3TPAA 2F36A 2I6EA 3EF7A 2F8DA 3VDFA 1P1UA 5BWJA 4GWOA 5DYHA 4ZS9A 4OYVA 4DXCA 5H8FB 3N5LA 1R6ZA 1D9VA 1QUKA 1N84A 1A40A 2FA7A 3FVOA 3T9UA 4YAHX 2QS4A 2P0SA 1TWYA 2ONRA 3IB2A 3M3KA 1ZJLA 2NOOA 3M3FA 1MS7A 1XT8A 4F22A 3ILTB 2QMXA 1TFDA 3BFTA 4IY5A 4HCWA 4RY1A 3Q27A 4LA9A 1A99A 2XXPA 4BLAA 3W9VA 4PFWA 4FAJA 4ELPA 2DP8A 4U4XA 4PFTA 2GH9A 4GXAA 3PUXE 1SW5A 5JK4A 4YZZA 1SW2A 3C31A 2UVIA 2O7IA 4HTGA 1JVXA 4L17A 3OO6A 3RQTA 5AA3A 3FVNA 4O3AA 4LQ5A 1JVYA 3UIFA 1MPCA 2H25A 4K3FA 3IOVA 1MRPA 3QSLA 2REGA 2X26A 4G68A 1MY2A 3PV0E 4X48A 1UTBB 3Q28A 3K1PA 3OENA 4X9TA 3OMBA 4G8MA 4GF8A 4QF9A 1LCFA 2YJPA 4KD5A 3L6GA 1S9TA 3HN0A 4MLQA 1O7TA 1P1QA 5L9SA 3TTMA 3JZJA 4KYEA 5AA2A 1QUIA 3PMVA 3ONMA 1N0TA 3O6GA 3ILUB 4H1XA 5I2NB 2Y7PA 2ESNA 2ABHA 1Q35A 2A5TA 2ZNTA 1UIVA 5M2VA 5L9OA 4QHQA 2O7UA 3OEMA 3LUYA 1OLAA 3PUYE 3V89B 2Q2CA 4IO2A 2XXTA 5KDTA 4C1UA 4F31B 4YICA 4EF1A 3KGCA 5H8FA 4NE4A 2I0CA 3IORA 1AMFA 1RYOA 4GOTA 4XKRA 3C33A 1FCKA 1N04A 4TOZA 2VGQA 1SVXB 4NF8B 1HSLA 3GBAA 1MY4A 3BBRA 4JDFA 4ONYA 2DWHA 4EXLA 4YB5A 1GTKA 3OXNA 4QFOA 3SEUA 3T22A 2AL5A 3PUWE 2OCUA 3SEVA 3TQLA 4E0WA 1A55A 2QJEA 3O97A 3G7WA 4WEDA 4OZ9A 2CMOA 2UXAA 3H4ZA 4DXBA 3H7MA 4XKNA 1N3WA 2F6GA 5I84A 2PX1A 3DP6A 5IAIA 1MM7A 4I1DA 4U22A 3PD8A 3UGWA 4WEPA 4HS7A 1CE2A 4OEVA 3G3FA 4F3SA 2DE2A 1LBBA 2RC8A 1NKXA 2O1MA 3D4CA 4IO7A 1EZOA 3K02A 4RYAA 5ICQA 3PUVE 3SERA 5HM4B 3IR1A 5H8SA 2B3FA 1LB9A 2X7QA 2I3VA 5F1QA 1Y3NA 3UORA 2V3QA 1FQDA 3DP4A 1B7ZA 2QPQA 2DVZA 3U93A 2RC9A 5BUUA 3O9PA 4KCDA 3MJNA 4C0RA 4KCCA 1H44A 3RT6B 4ZEBA 1II5A 2E0SA 4NF4B 2Q2AA 3VFJA 2ZYMA 1US5A 3K6WA 4DCYA 5B7DA 4GD5A 1Y3PA 1DPEA 5L8DA 3HHFA 2RC7A 4FEDA 3I6VA 4EXKA 4HW8A 4FORA 4ZE9A 1D9YA 4WXJA 2QMWA 4P0GA 4YKIA 4JBZA 3KJ7A 1PDAA 3EHTA 1GR2A 3D4GA 3K1MA 2UYEA 3Q29A 3N94A 3SKPA 1B4ZA 3GZGA 3UN6A 3UK4A 3TQWA 3SETA 4H6DA 2V3TA 1LFIA 1POY1 2F7BA 3CRBA 4H0WA 2Z22A 3LC8A 3G3GA 3EHSA 3K6VA 3PMXA 1TFAA 1IXIA 2XD2A 3VVFA 2I58A 4DZ1A 4KYSA 3LSFB 2HAUA 3U1OA 4Q5TA 2VHAA 2I4BA 4O3BA 3Q25A 3K0VA 4BDLA 2OBGA 1BIYA 1ZKBA 5JTYB 2V84A 2DOJA 1N3XA 5K2YA 2GHAA 2HEUA 4PP0A 1FTLA 4F3GA 2G29A 4FJPA 3OOAA 4U1ZA 1FTKA 1B3LA 3I3VA 1USYH 2HZLA 2THIA 3Q26A 3T9HB 1SYIA 3MWBA 3MVYA 3S9LC 3PPQA 2Y7IA 1KWHA 2D21A 2Q88A 2ZMBA 3TZAA 1OQHA 4NTLA 3KN7A 3KG2A 1ZIUA 1LCTA 4ZDMA 1JQFA 4G68B 3FZVA 1S50A 2DXRA 2XD3A 1IEJA 2CZLA 2QSXA 3G3JA 1QJMA 4PE5B 3FATA 1LGBC 4FE8A 3U92A 2Z8DA 3ZKKA 3VLVA 5EYFA 4XTCQ 1R9QA 4OETA 2E1SA 3ZS6A 2O51A 4JWYA 4LONB 2PT1A 2QS1A 1QVSA 2XX8A 3B6TA 5HBCA 3TKDA 5TPAB 4QFKA 4NF4A 4KI0E 1O63A 2F7AA 2D5WA 4GVOA 3QAXA 4GIZA 2A5TB 1O64A 1HSJA 4ZEKA 2DWAA 1IXCA 5DEXB 4MF3A 5I2KB 5KDTB 1DMBA 5FHOA 4GRKA 5AE4A 3S9EA 1RYXA 4IGRA 3CFLA 3RT8A 4ECFA 4MLVA 2RKMA 3MAMA 1MXYA 1FTMA 3MBPA 2HFBA 3HHGA 3MW0A 2DE3A 1HSEA 3IL1B 3ECRA 4PQJA 2KLFA 4M1VA 2ZYKA 1B05A 4JB7A 3MUQA 3P7IA 1GVCA 1OLCA 1B5JA 3U8QA 2XXWA 4ZEFA 1A7LA 3FD3A 3KFMA 3H6UA 1XC1A 3TMGA 3TYHA 3EN3A 5CMCA 4R75A 4UACA 4R72A 1IXGA 3FUZA 4YKJA 2GHBA 2P1SA 1B7HA 1AL3A 3EQ1A 1YPNA 2DXYA 4R6HA 5JTYA 2QL3A 4DIGA 1AH5A 3KBRA 1ZMGA 4LUBA 3CFXA 2VD3A 4TLLB 1PB7A 3H03A 2O69A 3MVXA 3K00A 4TQUQ 5DT6A 3FXQA 3BKIB 2P2AA 3BFUA 1NNFA 2H99A 4H5GA 4FECA 4N13A 5KCJB 2OWTA 4OFOA 2G93A 3VXCA 5TP9B 1FQAA 4PETA 3R7XA 1NFTA 4F2OA 4DE8A 3PD9A 3CI8A 4IY6A 3QK6A 2Y7WA 1ANFA 3CR9A 2Y7RA 1IUDA 2DYXA 2VP1A 4ZZEA 2ALUA 2VOZA 4KYDA 3VLWA 5DTBA 1SW1A 3A3UA 1MXXA 3MZ9A 5DVJA 2ZYOA 4MH5A 4ESWA 1Q1KA 3F11A 2O6AA 1B3HA 5TPAA 1VFDA 3PMWA 4NF6A 3V8XB 1B5HA 4O3CA 3H6VA 4OHNA 1OMPA 5AA2D 3B7DA 4IO4A 1NMUA 5DVFA 2UVGA 5DEXA 1ATGA 1B1XA 3TUSA 1A8FA 2F5XA 3RPWA 5I2KA 4JWOA 3U94A 3FGSA 3T93B 4IGTA 2F7CA 3H6WA 4G8HA 5JEIA 5FTHA 1M5DA 3FJGA 4GLIA 3RTFB 3FV2A 4Z7EA 3PPPA 1Y9UA 4QSCA 2NUVA 3C4MA 3RTWB 2OZZA 4R9FA 2XXYA 4ELQA 1MXWA 1ELJA 5LOMA 4YU0A 1US4A 4M4GA 4U4SA 1LBCA 2AL4A 3C36A 2LAOA 3TCFA 2DSFA 3FJMA 2UYFA 1P1NA 3SEYA 2O68A 1DTZA 1GGGA 4F1VA 3QXMA 3MZBA 4U21A 1WVJA 4BDRA 3SESA 3FIRA 1URSA 4MBPA 5I57B 1PEBA 4OQOA 1MY1A 4OWDA 1VR5A 3S9NC 4UA8A 1FQEA 3WAEA 2I0BA 5I56A 2R9JA 4XKQA 4F3BA 5CC2A 2OLBA 4KFQA 5KCJA 1B0LA 4EDPA 5TP9A 4RPNA 3GXAA 4EUOA 3R26A 2WKYA 5CI5A 4P0IA 3KSXA 3SEXA 4F1YA 3E9XA 4RPOA 4ND9A 1SBPA 4YKPA 4KQPA 2V3UA 2XX9A 2DS9A 3IB1A 4PFYA 5ELVA 4LVQA 3TDJA 4N07A 2O1LA 4G8NA 4ESXA 1MPDA 3OO8A 1OQGA 4R74A 3KN8A 4F29A 3KN3A 5DVIA 1H43A 1EU8A 3USDA 4I9DA 2QRYA 4JXIA 1B7UA 4ZZAA 2Z8EA 3ZKLA 1P1OA 3IO6A 1YAEA 2YLNA 2VD2A 4U2RA 2Q9TA 3DP8A 4WKMA 3O6HA 3SDFA 4BDMA 2PBWA 2XXXA 4YMBA 4F3PA 2BJJX 4OENA 3W15C 3MZ1A 3K4UA 3THIA 1MY0A 3MPKA 3OSQA 2ONKE 2OWSA 2F78A 4H65A 3W9WA 4ELRA 3PPRA 1XOCA 4RK9A 3DM0A 4R2BA 2RCBA 4MFIA 3LBSA 1GV8A 3T9XB 3TTLA 1NL5A 1JW4A 2YPNA 4EQBA 4LZ7A 2Y7KA 1SI1A 3MC2A 2V25A 2AIXA 1N7WA 4RA1A 1POTA 3H06B 1WODA 3PUZE 4HCYA 1XVYA 5L9MA 2F35A 5ITPA 4IO6A 4ZE8A 1ZTYA 4I8CA 5I57A 3UP9A 3KOTA 2D3IA 4RJZA 4Q30B 2X7PA 1URGA 1BTJA 4QFPA 2DE4A 2HCAA 3TTKA 3MP6A 2GRVA 1FQFA 4BDQA 4Z0IA 1B2HA 4GFRA 2I49A 3TEPA 1B46A 1I6AA 1OIBA 2M8CA 4F39A 2I48A 1B51A 1H3DA 4EQ9A 5HPQA 3H6TA 2F34A 4AQ4A 1SW4A 4NWCA 1UTHA 3IOTA 4POXA 1FTOA 3B6QA 4ZECA 2NVUB 2H5YA 1QKAA 3KJTA 4OEUA 4GL8A 3T66A 3M8UA 4GXSB 4OESA 3N26A 1A8EA 4NF6B 1R9LA 3LSLA 1BKAA 3C34A 1NNKA 1P99A 4DDDA 3OEKA 1Y1ZA 2HZKA 4RK2A 2FNCA 3KEIA 3C35A 3HO7A 1ZLQA 1IITA 1B5IA 3VXBA 1CB6A 2XXVA 2R6GE 5AA4A 1QULA 3RUMA 3QIMA 1MPBA 2RINA 1LAFE 3IAZA 4YB6A 4XKPA 3H3GA 5H8QA 2DVCA 5ITOA 3K6XA 3JV9A 1R1NA 3CIJA 1B52A 1I6QA 3R6UA 3O29A 4FATA 3CFZA 4THIA 4G68C 2PYYA 3IK6B 5I59B 4OMBA 3S2VA 3RN8A 5CM6A 1BP5A 1MXZA 3FXRA 1XS5A 3LSWA 3MP1A 2AYSA 2XXHA 3G3IA 1MDQA 4OVJA 4OFJA 3PU5A 3FVKA 1NNTA 3KSJA 1H76A 4H67A 5TU0A 2F97A 2IA4A 3JYRA 4R73A 2DQVA 1AIVA 2Y84A 4R6KA 1YTVA 4BDOA 5I56B 3C32A 3LSXA 5CMBA 2ZXTA 1QUJA 4DXUA 2OJTA 4NF5B 1N76A 1B0HA 1B32A 3K01A 2XXQA 1F9BA 1D4NA 1MXVA 3IJXB 1J1NA 1IXHA 2QS3A 3N6UA 4Q8RA 1OVTA 4EQ7A 2REJA 4QSDA 3T9VA 3GBBA 1EZPA 1M5BA 5EHMA 4C1TA 3TCGA 4RXLA 5AA1A 3E3KA 4NEDA 1UIUA 2Q89A 5A5XA 4DCXA 1IQ7A 3WAFA 1MG1A 1PB8A 3FJ7A 4XIGQ 5CMMA 2RF1A 1MM6A 3CG1A 2ONSA 5FHNA 1B40A 3PGFA 1QKBA 5B70A 3TFLA 4RNSA 4ZEDA 2ANJA 4AB6A 4ELOA 3RLFE 3IJOB 1B58A 2I3WA 3FV1A 5CBSA 4KR5A 1MH4A 4H8IA 2NXOA 3QUFA 3L6HA 4XXUA 1FW0A 2F6PA 3S9MC 3QUJA 1M5EA 4LATA 4FIMA 4LQ2A 4JSOA 2H4IA 4N6PA 3TELA 5H8HA 1QW0A 4G2ZA 2XXIA 3KZGA 3GLBA 3HV1A 1B3GA 3FVGA 4I62A 2R71A 4GL0A 3MVZA 1NH7A 4G77A 1SYHA 3O66A 2HAVA 3T96B 1FQCA 5CBRA 1Y3QA 3VV5A 3EHUA 3O2AA 1MXUA 5K2XA 4U23A 4F19A 2ZNUA 2DWIA 5I59A 2A5SA 4DLDA 1MQGA 4OERA 1LLSA 3IX1A 3G3HA 1TT1A 1Z7ME 1JEUA 3FXUA 1DSNA 5I58B 4OTEA 2DWJA 2Q8JA 3U72A 5H8NB 2XX7A 4P11A 3MP8A 1D3KA 4NF5A 1B3EA 4NWDA 3VVEA 1ZU0A 1PBPA 3MVWA 4U1OA 3HSTA 3C9HA 3E4RA 4IB2A 1USYE 4POWA 1VFEA 5ISUA 4X1BA 3MQ9A 1DOTA 3VLUA 2NWJA 3AXFA 1LAHE 1UTHB 4JWXA 3G3KA 3OELA 4Q0CA 1L5TA 1UQWA 3OSRA 3UA8A 1Z7NE 1DTGA 1N7XA 2I4CA 3A09A 1B4HA 3TCHA 3K2DA 4QSEA 1EZ9A 1UTBA 2HXWA 1LSTA 3IOUA 4YMAA 3N6TA 1NH8A 1T0KA 4AB5A 1AOVA 1SQYA 4YKKA 3TAJA 2O84X 3TTNA 5AA4B 4IO3A 1VE4A 3OO9A 4TLMB 3MPLA 3HCQA 3V83A 3O28A 1LFHA 3V5AA 3B6WA 3VVDA 1XHYA 2B65A 1XVXA 5I2NA 3QYTA 1Y4TA 2ZYNA 4F18A 1IZ1A 2GFEA 3SEWA 5H8QB 2PMSA 4LZ8A 4QFLA 3OO7A 2B3BA 1MDP1 1Y4CA 5FHMA 3RY3A 1EH3A 3DLNA 1JEVA 3EPEA 2QS2A 4E0XA 1B6HA 4QFNA 1SD3A 4QRZA 4F1UA 3O6IA 3CVGA 4R9GA 2UVJA 3IB0A 3OD7A 1I6BA 2XHDA 3TODA 3TTRA 1PBQA 4FEBA 4NF8A 5CRYA 1JETA 4GQOA 1BLFA 4ZEIA 2PVUA 4H8JA 1RKMA 1MQHA 1M5CA 1B9JA 1TXFA 4G4PA 3CSGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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