3M3LA

Pepa bound to the ligand binding domain of glua2 (flop form)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular mechanism of flop selectivity and subsite recognition for an AMPA receptor allosteric modulator: structures of GluA2 and GluA3 in complexes with PEPA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3m3lA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3m3lA02
4Q5TA 4ECFA 2H4IA 3JZJA 4BLAA 4F1UA 3O6IA 4F1VA 4NE4A 1M5BA 3C35A 1DTGA 2I4BA 1B3HA 2DQVA 3PMWA 3EF7A 4IGTA 2F97A 3C34A 5TP9B 2HFBA 1B2HA 2H98A 4JWOA 5AA4A 1H43A 3DP6A 4HW8A 2HCAA 3UK4A 3RY3A 3GLBA 4PETA 2ANJA 2OCUA 3VVDA 3N94A 2NVUB 3CSGA 4M4GA 4IY5A 5F1QA 1LAFE 2DE4A 3VDFA 2F5XA 5A5XB 1F9BA 1MM6A 5M2VA 2Q2CA 3IK6B 1IEJA 5AA1A 2QMXA 4H5GA 1ZKBA 3MP8A 3DLNA 2YPNA 4LP2B 1LCTA 2FNCA 4R9GA 3PD9A 4YICA 5H8SA 1DTZA 3CI8A 3CRBA 5ELVA 1QJMA 2D21A 3R7XA 5KZTA 3T9XB 2PX1A 2F7CA 4F3BA 3G3GA 4OMBA 1UTBB 1LFIA 4QRZA 2CZLA 1B4ZA 5CM6A 4NF5A 5I56A 4NMYA 4JDFA 5BUUA 4JWXA 3SEWA 3V89B 2I6EA 1Y1ZA 2O7UA 1H45A 4ELRA 3QUJA 4QHQA 4RY1A 1BLFA 4H1XA 2F34A 5CMBA 3L6GA 3IOWA 4R75A 2Q89A 3LUYA 3OENA 3IB0A 5HM4B 2VD2A 3S4UA 1B1HA 4F39A 3EHSA 2RC7A 4RJZA 3TDJA 3KBRA 3RT8A 3KN7A 2DOJA 5ITPA 1LCFA 4F22A 2F6GA 3SEUA 4OFLA 2R9JA 1O7TA 2XXVA 1BIYA 4OFOA 1ZMGA 1SW1A 4DXCA 2QRYA 1JETA 2UXAA 2O69A 1MPCA 5AA2B 2I48A 4BDMA 3N26A 2B3FA 4FE8A 3O97A 3HSTA 1QULA 2E0SA 4P11A 4JSOA 3B6WA 3OOAA 5I57A 2QSXA 5TPAA 3RT6B 3OMBA 1TXFA 1OLAA 2F8DA 1JVXA 4OESA 3T22A 2P0SA 3SERA 3TKDA 2PVUA 4IO5A 4IO3A 3PMXA 1TT1A 4MF3A 1FTLA 3QUFA 4OFJA 1MDQA 2P1SA 3Q27A 1QKAA 1PC3A 3Q29A 2I0BA 3K02A 3N6UA 1Y20A 4NTLA 5H8QA 1VR5A 2O7IA 2ZNSA 2V93A 1JW4A 5DVIA 3DP4A 3PPOA 1MQGA 2A5TB 1VE4A 2XXTA 4O3BA 2V3QA 4G4PA 5FHMA 3VXCA 1B52A 4F2QA 1Y3NA 4FJPA 1FQBA 4O3CA 1FQCA 2I49A 3RTWB 3IX1A 3LBSA 3TPAA 3PV0E 1OVBA 4UACA 4LZ5A 2ONSA 1ZU0A 4BDNA 3WAFA 3G3HA 4NEDA 4GL8A 1H44A 2PYYA 2QS3A 2F36A 3UORA 4QSDA 3OEKA 5I2KB 1N84A 4QF9A 5TP9A 4EUOA 3JV9A 3BFTA 4ZDMA 4Z0IA 2NOOA 1RKMA 4PFYA 1YCJA 2P2AA 4QSCA 5ICTA 1USYH 1NNTA 4I62A 1B3LA 4GL0A 3E9XA 5KDTB 1B1XA 4RK2A 1D3KA 3HCQA 4YMAA 3RGYA 3FD3A 2XXWA 5A5XA 1AH5A 3BFUA 4ZEBA 3KJ7A 4QFOA 4ZEIA 1J1NA 3HHFA 1OMPA 3QAXA 1DPPA 2UVGA 3G3FA 4X1DA 3DM0A 1PBPA 1P1UA 1HSLA 2NUVA 1Z7ME 4R6KA 3TFLA 4G8NA 1LSTA 4LVQA 4F19A 4DLDA 2O6AA 3OSQA 3FATA 1WODA 4YMBA 1MQJA 3I5OA 3Q25A 4ESXA 3UA8A 3PUYE 2ESNA 1NNFA 3IR1A 3IO6A 4EF2A 1UTBA 3CFLA 3VVFA 3TZAA 3E13X 4WKMA 3A3UA 2ABHA 3KFMA 4QFLA 4C0RA 3RTFB 1H3DA 1URGA 4LZ8A 3U8QA 2XXPA 2UVHA 2XXUA 1N3XA 4IO6A 3MW0A 3VLUA 3MP1A 4EXKA 1DPEA 3I6VA 1I6QA 4XTCQ 4ND9A 1EU8A 1MXWA 3KN8A 4OWDA 3CFXA 2H25A 1PB7A 4XKPA 1B3EA 3CG1A 4U22A 3D4GA 2F7AA 1TFDA 1EZ9A 3K1MA 2DXYA 2ZNTA 4OETA 4NF6B 4POWA 4KPTA 2HAVA 3V5AA 2M8CA 1JVYA 1JEUA 4KI0E 3HO7A 5H8HB 1FTMA 4NF8A 1GTKA 1DOTA 2NWJA 5AA2A 2H99A 3V8XB 4IO7A 4F1YA 2RF1A 3U1OA 1MS7A 1DMBA 1QUJA 1Y1MA 3MVXA 1B7UA 2GRVA 2VOZA 1P1QA 4MBPA 4GRKA 1QW0A 5DYHA 3MZ9A 1SI1A 1URDA 4PP0A 4U2RA 4ZZEA 4DXBA 3FVGA 3RQTA 2ZYKA 3C36A 2O84X 2A5TA 3T96B 3T66A 2VD3A 5ISUA 4YKKA 2OBGA 2Z22A 3HHGA 3OD7A 3EHUA 2XD2A 3VLWA 2AL5A 4X9TA 3FJGA 1LB9A 4GD5A 4HCWA 5L9MA 3H03A 5JEIA 2GHAA 4F31B 5I2KA 3CIJA 2GHBA 2ONKE 2XX7A 3H4ZA 4MFIA 3EN3A 4HCYA 1B05A 3P7IA 2Z23A 3OXNA 1FCKA 4NF4B 4YAHX 1S50A 5EYFA 4DCYA 4GF8A 5KDTA 2ZYNA 4ZEDA 1AMFA 1POY1 3TEPA 3O9PA 4RA1A 2X7QA 5LOMA 1YAEA 1XVYA 4QFNA 3MQ9A 4KYSA 3ILTB 1UIVA 1UIUA 3R26A 2QMWA 1B6HA 3TTNA 2GFEA 4Q0CA 4F29A 4ELPA 1EZOA 4R73A 3K6WA 3H6WA 3SDFA 4PFUA 2DP8A 4YKJA 2DS9A 3UGWA 3O28A 3TELA 2O68A 1B32A 5CRYA 1LAXA 1B4HA 3W15C 2I4CA 1A54A 2UVIA 4F3SA 3FXQA 3G3KA 1SYIA 1OVTA 2DE3A 1NNPA 1MQHA 2OWTA 1UQWA 4OEVA 1VSOA 3F11A 3BBRA 3PPRA 5DT6A 2XXQA 4DDDA 3VXBA 4MLVA 1ZBMA 4XIGQ 5FHNA 4MLQA 1JW1A 3O2AA 3FGSA 2RKMA 1ZJLA 1QKBA 3QK6A 2IEEA 1IXIA 1A8EA 2QJEA 1SW2A 2B65A 2OZZA 2Q8JA 1BTJA 1Y3PA 1OQGA 2H5YA 2Y7RA 1N7WA 4NF6A 2DWAA 1IQ7A 1MPDA 3RPWA 5H8HA 1SYHA 3U94A 2XHDA 5DVFA 3USDA 4NF8B 2CMOA 4GIZA 3VVEA 4KHZE 2UVJA 5EHSA 4DXUA 4ELQA 1ATGA 4N13A 2D5WA 1Z7NE 3ZS6A 4YB6A 5DEXB 3PUVE 2XD3A 3TYHA 2AL4A 3K1PA 3TTMA 3ZSFA 1MY2A 4OHNA 2ZMBA 4G68B 3E3KA 1LB8A 1JW5A 3M3LA 5CMKA 4FECA 3DP8A 5H8FB 1B0LA 3OO7A 3MJNA 4U1OA 3I3VA 4WEDA 3SEXA 3MVZA 5K2YA 3A09A 2V84A 1SDXA 3OSRA 1D4NA 4OENA 4GWOA 1XVXA 4PQJA 4C1TA 4GQOA 1B5IA 2DSFA 2O1MA 2F7BA 4THIA 4G2ZA 5IAIA 3K6UA 3S9MC 1XHYA 2GH9A 4ZZAA 4ZE8A 4DIGA 2YLNA 3FIRA 3Q28A 3EQ1A 1FQEA 5L9SA 4R2FA 1ZIUA 4U23A 4AB5A 3TQWA 4GLIA 4NF4A 5DTBA 2A5SA 2QPQA 1R9LA 4HTGA 3MZ1A 1LAGE 3L6HA 3KG2A 1USYE 4LONB 4KD5A 3TTKA 1MQIA 1GVCA 4K3FA 4I9DA 1EZPA 3ONMA 4TLLB 4ONYA 4OXVA 2HAUA 2FYIA 2VP1A 4FORA 3O29A 3IB1A 4R74A 1LGBC 5B70A 2QS4A 3QSLA 1MQDA 1DSNA 1LFGA 1LFHA 5I59B 4OQOA 3ZKKA 2RC9A 1KWHA 4JXIA 3IB2A 2G93A 1LBCA 1Y3QA 1JEVA 2RC8A 4YZZA 3QYTA 1IIWA 3GXAA 4H67A 1LBBA 1BP5A 2QL3A 2VHAA 1SD3A 3BKIB 2I0CA 3GBAA 4GXAA 4QFPA 1Y9UA 1D9YA 1I6AA 1B40A 2HZKA 3LSLA 3FV2A 2E1SA 4F2OA 5AA2D 1A8FA 1CE2A 3N6TA 1L5TA 3R6UA 4PE5B 2UYFA 2V3TA 3IJXB 5CBRA 3SKPA 1FQDA 4F18A 1AOVA 2PT1A 2DWJA 4ESWA 3IJOB 2VGQA 1RYXA 2BJJX 4UA8A 3W9VA 3MZBA 3PPPA 4Q8RA 5K2XA 3MVWA 1FQFA 4IO2A 3K6VA 2NXOA 3TODA 1O64A 2DWHA 3H6TA 3D4CA 2RINA 3KSJA 3OEMA 4H5FA 3THIA 4BDQA 1B3FA 1ANFA 3TMGA 4OEUA 1AL3A 1B7HA 1SI0A 1SBPA 4Z7EA 4U21A 4TQUQ 3ZKLA 1B0HA 5CBSA 4OERA 1ZTYA 1MXZA 3KOTA 2F35A 1MXUA 4FEDA 1MG1A 1A40A 3K01A 4LQ2A 1MY0A 3LSWA 5DEXA 4N6PA 4DE8A 1N04A 2O51A 3FJ7A 4XKRA 2ZYOA 1P1OA 3C4MA 3IL1B 3QXMA 2X26A 1LAHE 4EQ7A 1R6ZA 2REGA 5KCJB 2DE2A 4L17A 4E0XA 3C9HA 2G29A 4G68A 4IY6A 2XX8A 1OIBA 4XKNA 1HSJA 4LQ5A 1PEBA 5H8FA 4MH5A 1B5JA 3S9LC 1B9JA 4ISUA 1D9VA 2XXYA 2R71A 4QSEA 4H8IA 4LUBA 3O6HA 3IORA 1S9TA 1HSEA 3CR9A 1Y4CA 3MUQA 4PFTA 2DXRA 4H65A 2AYSA 1Q35A 1P1WA 2LAOA 4X48A 3VV5A 5FTHA 3SEVA 1Y4TA 2D3IA 5HPQA 2Y7WA 4R6HA 4KFQA 2Y7KA 3S9NC 3B7DA 1IUDA 1M5DA 5I2NB 4G8MA 5IKBA 2V25A 3TCFA 4NWCA 3RN8A 2Q9TA 2IA4A 3IOVA 3FXUA 1ELJA 5DVJA 1NL5A 1XC1A 1MM7A 2OJTA 4U4SA 3C31A 5AA3A 5CC2A 1T0KA 4ZEKA 3QIMA 1VFDA 4EDPA 1NH8A 2UYEA 3H06B 4NWDA 2ZYMA 1MXXA 3T9HB 3MP6A 4FAJA 1M5FA 4KYDA 3FJMA 1O63A 2Q2AA 1SW4A 4GFRA 3K0VA 3A3CA 3AXFA 1MH3A 2THIA 2XXXA 4F3GA 4AB6A 5I59A 2HZLA 3CG3A 3B6TA 4YB7A 3UIFA 5EHMA 3M3FA 1JQFA 1SQYA 3FV1A 3RNNA 4RPNA 4KCDA 3PGFA 5J1DA 3PUXE 4BDRA 2V3UA 1UTHB 1NNKA 3CSBA 3T9UA 3H6VA 3T93B 2B3BA 4G8HA 3FASA 4WXJA 1JNFA 3V83A 3IOUA 1B51A 4EQ9A 3PD8A 4P0GA 3SESA 2QS1A 2DVZA 4POXA 2DYXA 4P0IA 4ZE9A 3MBPA 1MXYA 3B6QA 3ECRA 4C1UA 3M3KA 2REJA 2Z8EA 1PB8A 5JTYB 3UN6A 4QFKA 4ZS9A 2F6PA 1MH4A 1YTVA 4AQ4A 1QUIA 4XKQA 3MPLA 5L8DA 3C33A 4KR5A 3KEIA 3K4UA 1FTKA 4EQBA 4YB5A 1IXHA 1AIVA 1WVJA 4EXLA 2F78A 4U4XA 3KZGA 4JSDA 5I58B 2RCAA 3MAMA 1LLSA 2W7YA 4H8JA 1IZ1A 1IITA 2X7PA 4OVJA 2XXIA 4BDOA 4LATA 3LSFB 5KCJA 1FW0A 3G3JA 3OO9A 1IXCA 1N76A 3EPEA 1MDP1 2H9BA 1GGGA 2WKYA 3U92A 4GVOA 3TUSA 1S7YA 1PDAA 3TAJA 2O1LA 5CMMA 3U93A 3VE1B 4R72A 4YU0A 4WEPA 3E4RA 1CB6A 2XXRA 3ILUB 3RUMA 3KGCA 3IAZA 4N07A 5ICQA 2OK2A 2OLBA 2PBWA 5H8NB 4OTEA 5CI5A 4M1VA 3CVGA 3W9WA 4R9FA 3S9EA 4I8CA 1PBQA 1SW5A 2XXHA 3MPKA 3FVOA 1NMUA 1MY1A 1US5A 1MY4A 3K00A 1RYOA 1OQHA 1BKAA 3CFZA 4IB2A 3VFJA 3IO4A 1VFEA 3U72A 1A55A 4R6YA 2HXWA 3HV1A 5HBCA 1P99A 3T9VA 5B7DA 2I3VA 3OO8A 4FATA 3ODBA 5I2NA 4RPOA 3VLVA 2ZNUA 4O3AA 1M5CA 1A99A 4DCXA 5TU0A 1N3WA 1II5A 2QS2A 3MC2A 2I3WA 1B5HA 4JBZA 5JK4A 1N0TA 1TFAA 4DZ1A 3SETA 3H6UA 1QVSA 4KQPA 4U1ZA 4YKIA 1NFTA 3K1NA 4PFWA 4TOZA 1NH7A 2KLFA 5AA4B 2Q88A 2Y84A 1ZLQA 4OZ9A 3LR1A 4RYAA 1GV8A 1H76A 4ZECA 1B3GA 4X1BA 2Z8FA 4XXUA 4JWYA 3KOSA 3HPIA 3H3GA 3PU5A 1NKXA 4IO4A 1A7LA 3K2DA 2RCBA 4BDLA 1MRPA 4GOTA 1POTA 2HEUA 3TCHA 1B46A 1FQAA 3SEYA 1UTHA 2ZXTA 3UP9A 3G3IA 1I6BA 4RNSA 1SVXB 4LZ7A 1N7XA 5L9OA 3KJTA 1PB9A 3OO6A 4KCCA 3GBBA 3FVNA 3M8UA 5FTIA 1YPNA 4KYEA 2ONRA 1US4A 1FTOA 3C32A 4NF5B 4F3PA 5I56B 2Y7IA 1P1NA 4H0WA 4E0WA 5JTYA 4I1DA 1XT8A 3O6GA 3KSXA 1TWYA 4FIMA 1B7ZA 1WDNA 2R6GE 3RLFE 3HN0A 1QUKA 3FZVA 2FA7A 4H6DA 3EHTA 2YJPA 3MVYA 1OLCA 3TCGA 1XOCA 4JB7A 2XX9A 3K6XA 5CMCA 4ELOA 3FXRA 2ALUA 2DWIA 5I58A 5AE4A 3PUWE 2PT2A 2OWSA 3MWBA 3PPNA 3WAEA 1URSA 3PMVA 2Z8DA 1R9QA 3H7MA 3FUZA 4EF1A 2Y7PA 1IXGA 3S2VA 4IGRA 4GXSB 3LC8A 3OELA 5I84A 3PUZE 5BWJA 3JYRA 3FVKA 2DVCA 1XS5A 4FEBA 5I57B 5TPAB 3N5LA 2PMSA 4Q30B 1MXVA 2I58A 1MY3A 3DELB 4HS7A 3G7WA 2AIXA 3TQLA 5H8NA 1M5EA 1FTJA 2HQ0A 4G77A 5FHOA 4RK9A 3IOTA 1R1NA 1GR2A 1Q1KA 4ZEFA 3TTRA 1EH3A 1MPBA 3LSXA 3O66A 3GZGA 5H8QB 4R2BA 1B58A 4OYVA 3PPQA 5ITOA 5F7VA 3Q26A 4YKPA 4G68C 3KN3A 1I69A 4LA9A 4TLMB 4RXLA 3TTLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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