3M40A

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme ii with 4-[n-(6-chloro-5-nitropyrimidin-4-yl)amino]benzenesulfonamide
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title 4-[N-(Substituted 4-pyrimidinyl)amino]benzenesulfonamides as inhibitors of carbonic anhydrase isozymes I, II, VII, and XIII
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3m40A00
2WEHA 1IF6A 4R5AA 4CQ0A 3JXFA 4Q7SA 1JD0A 4GL1X 1FQRA 4RUZA 3V3FA 1HEDA 2VVBX 1JV0A 1RAYA 1G46A 1OQ5A 1CA3A 3M40A 3HKTA 5E5RA 3GZ0A 4G7AA 4E49A 2FNMA 1RJ6A 5C8IA 3IBUA 4KUWA 4QIZA 4HEWA 4ZAOA 2FNKA 3RG4A 1CZMA 2POUA 3MHOA 2NNGA 1FQLA 1FR4A 1XPZA 8CA2A 1I9MA 3TVNX 4KUVA 1TG9A 1CAOA 3V2MA 1CRAA 2GD8A 4Q7PA 1XEVA 2POVA 4Q8XA 3UYNA 4KNNA 4Q49A 1CCUA 4QJOA 1YDBA 2POWA 4FIKA 4Q6EA 4YHAA 1CILA 1BN3A 1YO1A 1RAZA 5FNMA 1J9WA 1G0FA 5FLQA 3DCWA 5G03A 1CNKA 4ILXA 3P4VA 3DAZA 5FL6A 4DZ9A 3MNAA 1DCBA 3KLDB 4FL7A 4QSJA 3T84A 1CNBA 4YGLA 3MNIA 1FQNA 5CLUA 5LMDA 5IPZA 2F14A 2HFWA 4WL4A 1TEQX 5E2KA 4WUQA 1FSQA 3ML5A 4ZWXA 1G4JA 3TMJA 3M98A 5EHEA 3RYZA 2NXTA 4UOVA 3DV7A 3F4XA 3U45X 3ZNCA 1CAIA 2IT4A 1I9LA 4YWPA 2FOVA 2O4ZA 1ZGEA 2X7SA 4E3DA 5JEPB 3N4BA 3M5SA 5A6HA 5EH5A 1HUGA 4Q08A 3RZ5A 3SAPA 5E2NA 3RYVB 4CNVA 1XQ0A 5DVXA 1IF5A 4G0CA 3S77B 4BCWA 3PYKA 1FLJA 4QK1A 4XIWA 5DSNA 5DRSA 3NB5A 3M96A 1CVFA 1FSNA 4QK3A 1CNGA 3HKQA 1T9NA 3MNKA 3M2XA 2NWPA 3NI5A 4KAPA 3B4FA 4N16A 2NWOA 2NMXA 3JXHC 2CBCA 3DVDA 2HL4A 5FNGA 1CAZA 5JDVB 4ZWZA 4Q8YA 2FMZA 1KOPA 2Q1QA 1KEQA 3OKUA 3FW3A 1I9PA 4L5WA 4K0TA 5DSLA 2FOYA 1AVNA 1G0EA 3T5ZA 4C3TA 4YGNA 1KWRA 3V5GA 1G3ZA 3KKXA 3EFIA 4MDMA 3LXEA 3TVOX 3V7XA 1G54A 3F7UA 5DOHA 5EKHA 1Z97A 3D93A 1HVAA 3M2NA 3M1QA 3N2PA 3K34A 1HCBA 3MWOA 4QK2A 4RN4A 4BF6A 5BRWA 4YGFA 1V9IC 7CA2A 2EZ7A 4FU5A 5SZ7A 3P3JA 4KV0A 3M14A 3BL1A 4E4AA 4KP8A 5EHWA 3MHMA 3ML2A 4FRCA 9CA2A 1CIMA 4LP6A 2EU2A 1BNWA 1IF8A 4KNIA 4X5SA 3SBIA 1EOUA 3U7CA 3IBNA 4XIXA 1YDAA 3DVBA 5JEGB 3P5LA 3T83A 4YX4A 4MLTA 1KWQA 3MZCA 1OKMA 4YGJA 4Z1NA 5FLRA 2H4NA 1BV3A 1CA2A 3V3GB 2GEHA 3CZVA 3PO6A 3R16A 3RYJB 2NNVA 1CVHA 1CNHA 3M5EA 4MTYA 5FNLA 1HEAA 3CAJA 5G0CA 5SZ0A 4QSAA 1CVEA 4Q6DA 3M2ZA 5JESB 5HPJA 4YYTA 1G53A 5DOGA 3PJJA 3KOIA 5FNIA 3IAIA 4CNRA 5SZ2A 1HCAA 1YDCA 2FNNA 4R59A 1H4NA 4QEFA 5AMDA 1ZFKA 1I91A 1IF4A 1MOOA 3RJ7A 2FOSA 4L5UA 3RZ1B 3N3JA 1ZSCA 1CAMA 4ZX1A 2NWYA 1I9NA 4QTLA 5CA2A 2HD6A 3DD8A 2W2JA 3MHLA 4M2UA 1CAJA 5FNKA 3MHCA 1A42A 2AW1A 4Q9YA 1JCZA 1YO2A 3L14A 3BL0A 4MLXA 5CACA 1IF7A 1ZFQA 4K0ZA 1ZGFA 2X7TA 3CYUA 4RH2A 5FL4A 2X7UA 1I8ZA 2NN1A 3D8WA 4HEZA 4WUPA 4XFWA 5FNHA 1UGEA 1MUAA 4E3GA 5FLOA 1ZE8A 4QJWA 3M2YA 4M2RA 1CVDA 4QJXA 3MDZA 4Q87A 2HKKA 5EKJA 4ETQC 1UGGA 3S76A 3RYYA 1G1DA 4WR7A 1G6VA 1G4OA 3CA2A 5L6KA 1ZNCA 4QSIA 2ZNCA 5EKMA 4CNXA 4Q8ZA 3T82A 3DD0A 3V3HB 3KS3A 2HNCA 5JQ0A 1V9EA 3N0NA 1RZDA 4RUYA 2Q1BA 3M67A 4Z1KA 1RZAA 3U3AX 2NN7A 5EH8A 4E3FA 5EIJA 5E28A 1UGCA 4DZ7A 3IGPA 4ITPA 4Q78A 4HF3A 4Y0JA 4CA2A 1AZMA 5SZ6A 1UGDA 1I9QA 3DCCA 4PXXA 3P58A 1OKLA 4WW6A 1BNTA 2FMGA 3JXGA 4FVOA 5E2MA 3T85A 3M04A 5SZ4A 5EH7A 4KP5A 1CNYA 1G52A 2Q38A 4K13A 4Q99A 2ILIA 1Y7WA 1BNMA 3FE4A 4HT2A 1BCDA 3B1BA 4CNWA 1CANA 2OSMA 3MYQA 3C7PA 4ZX0A 4KUYA 4YVYA 1UGFA 4Q83A 1FSRA 3M5TA 2CBEA 3DC9A 5AMLA 4JSSA 5DSMA 1LG5A 2WD3A 4Z1JA 2H15A 2OSFA 2NNSA 4JS6A 4RFCA 3BETA 12CAA 2CBBA 3K2FA 1KOQA 4Z1EA 1CAKA 3P44A 3DBUA 3SAXA 3W6HA 3RZ7A 3S78B 3T5UA 1TBTX 5L3OA 1XEGA 4ZWIA 3MHIA 3OIMA 1CCSA 5FDCA 2CABA 2CA2A 4FVNA 5FL5A 1CNXA 5DSIA 4BF1A 1Z93A 4HBAA 4YXOA 1ZSBA 2QO8A 3M1KA 4TWMA 4JSWA 5J8ZA 1CAHA 1YO0A 5E5UA 4MDLA 3S75B 1TG3A 2CBDA 1BN1A 5DSRA 1ZH9A 4PZHA 3U47A 4HT0A 1G45A 1CRMA 4PYXA 5BNLA 4Q90A 3IBLA 3OYQA 3MNHA 3P3HA 2HOCA 4LU3A 4WW8A 5DSKA 3RGEA 4R5BA 4PYYA 5G01A 3RG3A 1DMXA 1BNQA 2NNOA 3M3XA 3M1JA 4QIYA 2NXSA 1TB0X 4QJPA 3K7KA 1TH9A 2WEGA 3S97A 3F7BA 5FNJA 4CACA 4N0XB 3SBHA 4IDRX 1BNVA 4Q07A 4E9OX 1LUGA 1LG6A 3V2JA 1DMYA 1THKA 3S71B 3OY0A 1FQMA 1RJ5A 1HUHA 2WD2A 4XZ5A 5BYIA 3KIGA 1TE3X 3DA2A 1CNJA 5FLPA 4Z0QA 4XE1A 4L5VA 1DCAA 4RUXA 3HKUA 3DC3A 4K1QA 5BRVA 4M2VA 5JGSB 1AM6A 1CNCA 4QSBA 3IBIA 5SZ1A 3D0NA 1CCTA 1ZSAA 4YXIA 1OKNA 1BZMA 2EU3A 3KONA 3R17B 5EHVA 3S8XA 4YXUA 5G0BA 1CAYA 5EZTX 3OYSA 4Q7WA 5JEHB 4QJ0A 3S72B 3P55A 1URTA 4ZWYA 3VBDA 1BNNA 3D9ZA 5BRUA 5SZ5A 4M2WA 3P5AA 1IF9A 4Q81A 5EOIA 3V3IB 1CNIA 1TEUX 1CVCA 2NXRA 5DSPA 1CVAA 3QYKA 4MO8A 1HEBA 2AX2A 3HS4A 4Q0LA 5DSOA 3S9TA 3Q31A 3HFPA 1UGAA 2FOQA 4FPTA 4K0SA 3ZP9A 3S73B 3KWAA 3W6IA 4IWZA 5DSQA 5FDIA 4Q09A 3RYXB 4JSAA 5JGTB 1F2WA 4HEYA 3DVCA 5FLTA 1TTMA 4KNMA 4E3HA 3UYQA 4YGKA 1UGBA 3MNUA 3RZ0B 1CNWA 3KNEA 4QJMA 4COQA 1RZEA 1I90A 3OILA 3HLJA 3HKNA 2ABEA 6CA2A 2CBAA 1H9QA 5SZ3A 2QP6A 4RIUA 3M1WA 1FR7A 1BN4A 4Q06A 2NWZA 2WEJA 3F8EA 3MNJA 5E2SA 3IEOA 5AMGA 3OIKA 2FOUA 4HU1A 1BNUA 1RZCA 2VVAX 3NJ9A 5JQTA 3FFPX 4RFDA 1CINA 1H9NA 4JSZA 1I9OA 3OKVA 1HECA 4LHIA 3S74B 1LGDA 5A25A 5JG3B 4ITOA 5E2RA 3RZ8A 1Z9YA 5JG5B 3MMFA 1BICA 2QOAA 5DSJA 4E5QA 5FLSA 2FW4A 1RZBA 3EFTA 4TWLA 1YDDA 5CJFA 4RIVA 4QY3A 3RLDA 4Q7VA 3D92A 1LZVA 1CVBA 2WEOA 3KOKA 1CALA 4MDGA 4PQ7A 4KNJA 1G48A 3DCSA 3V3JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2WEH A;  1IF6 A;  4R5A A;  4CQ0 A;  3JXF A;  4Q7S A;  1JD0 A;  4GL1 X;  1FQR A;  4RUZ A;  3V3F A;  1HED A;  2VVB X;  1JV0 A;  1RAY A;  1G46 A;  1OQ5 A;  1CA3 A;  3M40 A;  3HKT A;  5E5R A;  3GZ0 A;  4G7A A;  4E49 A;  2FNM A;  1RJ6 A;  5C8I A;  3IBU A;  4KUW A;  4QIZ A;  4HEW A;  4ZAO A;  2FNK A;  3RG4 A;  1CZM A;  2POU A;  3MHO A;  2NNG A;  1FQL A;  1FR4 A;  1XPZ A;  8CA2 A;  1I9M A;  3TVN X;  4KUV A;  1TG9 A;  1CAO A;  3V2M A;  1CRA A;  2GD8 A;  4Q7P A;  1XEV A;  2POV A;  4Q8X A;  3UYN A;  4KNN A;  4Q49 A;  1CCU A;  4QJO A;  1YDB A;  2POW A;  4FIK A;  4Q6E A;  4YHA A;  1CIL A;  1BN3 A;  1YO1 A;  1RAZ A;  5FNM A;  1J9W A;  1G0F A;  5FLQ A;  3DCW A;  5G03 A;  1CNK A;  4ILX A;  3P4V A;  3DAZ A;  5FL6 A;  4DZ9 A;  3MNA A;  1DCB A;  3KLD B;  4FL7 A;  4QSJ A;  3T84 A;  1CNB A;  4YGL A;  3MNI A;  1FQN A;  5CLU A;  5LMD A;  5IPZ A;  2F14 A;  2HFW A;  4WL4 A;  1TEQ X;  5E2K A;  4WUQ A;  1FSQ A;  3ML5 A;  4ZWX A;  1G4J A;  3TMJ A;  3M98 A;  5EHE A;  3RYZ A;  2NXT A;  4UOV A;  3DV7 A;  3F4X A;  3U45 X; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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