3M9JA

Crystal structure of human thioredoxin c69/73s double mutant, reduced form
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
b'MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASESEVKSMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human thioredoxin revealing an unraveled helix and exposed S-nitrosation site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 38
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3m9jA00
5F06A 4JEDA 4NHZA 1B4PA 4YH2A 2B5EA 1A24A 2HZFA 2C0DA 3I6AA 4KDXA 3VWWA 3G7JA 4K7NA 3EU3A 2HRFA 3I43A 3IPZA 1AXDA 3EE2A 4DVCA 3HCZA 3QR6A 2M46A 3DYRA 3BJ5A 4V2MA 1OYJA 5GZZB 3WGEA 5G30A 3HDCA 4ZL8A 2GT6A 1G6YA 3CSJA 2HFDA 3APSA 2XPDA 5CYYA 1V40A 2NPBA 1C72A 4KNDA 3HKRA 2IMKA 3UL3A 1BJXA 3Q74A 4GLTA 3F9UA 5DCHA 3GYKA 4TOPA 1TRVA 3I69A 5LD0A 3IC4A 1OC8A 4I2UA 4KUNA 1XFLA 1X5CA 3ZITA 1PN9A 1GNEA 5H5RA 2NTOA 4HU7A 1HQOA 3MNGA 4KE3A 2WJUA 4EUYA 5HR2A 4PQ1A 3DVWA 1EEMA 1JFUA 5A4WA 1ERWA 2ON7A 2B1KA 2D2ZA 5IO2A 2IMEA 3EMPA 2DJKA 2KOKA 2VLUA 2R3XA 4ZB9A 2JZRA 2VL2C 4CW9A 5DDLA 5E59A 1M9AA 1RK4A 2X8HA 2OJLA 5IMZA 2GSRA 1ZYEA 7GSSA 2LQOA 3HVSA 3I9V2 3TKSA 3VPTA 4F9ZA 4YQUA 5J41A 1EWXA 2K8VA 4EKZA 2F51A 2LNSA 4Q5FA 4ACSA 1A0RP 3ZMKA 3KP9A 2VCXA 1AAZA 2VUPA 2BJXA 3E0UA 1KNGA 2YV7A 2H1GA 1HYUA 3FW2A 4Q5QA 2LS5A 4XS4B 3CXGA 2AB6A 4F03A 3FYGA 3PGTA 3N5OA 3DGQA 3TJKA 4V2NA 2I3YA 2GSTA 3IRAA 1K0BA 4HJ2A 4BL7A 4FYUA 4AJ6A 4NWYA 4XRAA 3C7MA 1W89A 1H75A 2GSQA 1GSQA 1T1VA 2DMLA 5ECPB 2G2QA 2I9HA 3KTLA 5DVBA 2YJ7A 4JU5A 2N5FA 1SJZA 2MMZA 5KN0A 1TRUA 5IOWA 3L9UA 3WYWA 5A4VA 2IMFA 2BMXA 3GNJA 1WRYA 2VO4A 3VK9A 1XOAA 2B5XA 4WXTA 3VWUA 1GTBA 3HHVA 2OA7A 4I6XA 3TUEA 4JRRA 4V1Ag 2X8CA 3GKNA 4J56E 3TJFA 5IPHA 2IWTA 2CAQA 1LJRA 1GLQA 1S3DA 2H0IA 3ZZXA 3MWHA 4POMA 2A2SA 1ZL9A 2V6OA 3GKKA 3LJRA 1SD9A 3IAS2 1F3AA 5LCZA 1SK1A 2B7JA 4MF7A 1F9MA 3ZTLA 2YWIA 4WETA 3MSZA 2IMDA 1Z7RA 1V9WA 3Q19A 2FA4A 2QKEA 1TU8A 3G9BA 1R4WA 3QDNA 3RBTA 18GSA 1PGTA 1CQHA 3HA9A 3NOFA 3APQA 4IVFA 1XWKA 1X5EA 2CAIA 5D73A 3KTBA 1AQVA 3UVTA 2LJRA 2HLSA 3ME7A 1T4YA 4EDYA 3TJBA 4MZBA 2EIRA 3M9KA 4NHWA 2HE3A 4WF4A 5JWRB 4LLRA 3IK7A 1F37A 1VRSD 2DSAA 3FK8A 1DSBA 3H79A 3TJJA 4MCUA 6GSTA 1GUHA 3TRXA 2K8SA 1F6MC 4NXIA 5J5NA 4KAEA 1SL2B 1YZXA 3DRNA 5JWOB 2HSHA 1O8XA 3QOUA 3FZ9A 4FH8A 3U6VA 2HT9A 5H5QA 5ECNB 5J9CA 3KIJA 4N0ZA 4F2IA 4WR4A 1HNAA 3LWAA 1WWJA 2JL4A 2FY6A 2O87A 1MDIA 3JCML 1TK5B 1UVZA 3DMLA 4IQAA 5IIZA 5IO0A 4ISDA 2PVOC 5HFKA 1GUMA 5LNKe 4J2FA 2WZ9A 8GSSA 3IE3A 3FZ5A 2E2MA 3FEUA 4IP1A 3CSHA 1T3BA 5D9XA 3F0IA 2IIYA 1BEDA 1QFNA 2K9FA 6GSXA 2YOIA 4TR1A 4HI7A 3VPQA 1EOHA 4P3YB 4QL7A 3J7Yb 1X9MB 1Y6EA 3H8QA 4ZL9A 1Z9HA 1Z6MA 5ECLB 3GTUB 5ECKB 1QXHA 4HEA2 1BYEA 3CMIA 3SWLA 2H19A 3UBKA 3ZFBA 3IA1A 3EURA 2EIQA 2RIIA 2HI7A 1NHYA 1WMJA 4TN8A 2PERA 3UVHA 1ZYQB 4KSOA 4ID0A 4O32A 3FRCA 4XRDA 4I2TA 5GSTA 6GSUA 3ERFA 1TKDB 1IYIA 4DSRA 3TOTA 5IM9A 4IQ1A 5A4UA 2GQMA 1YEPA 2CV4A 4HZ4A 3IV4A 2FLSA 1PMTA 2RUFA 2JU5A 1ZGNA 5B7CA 4I8BA 4DSSA 2FCHA 1GRXA 3HZ8A 5HR3A 2MYGA 5IQYA 5HR1A 5HQPA 5KN3A 1NW2A 1OE8A 2NVLA 1S3CA 5CRHA 1YEXA 1GLPA 1QGVA 2A4VA 4AJ7A 3F6FA 1BAYA 3TKSE 2CX3A 3HVXA 3GSSA 4I5QA 3P8WA 1GSSA 4XTSA 1ZMAA 2FGXA 2F8AA 2L4QA 3KGKA 1OC9B 3GL3A 1EEJA 1K0NA 3GSTA 1SJIA 1M99A 4IJ3A 2DJ2A 4MP4A 4GTUA 4NV5A 3LXTA 3F8UA 1B9YC 4WBJA 2GGTA 3F6DA 2C4JA 2GLRA 2H76A 5F8BA 2CZ2A 2KP2A 2PUKC 2TIRA 4ZBDA 1ACVA 4K0GA 2MBTA 4MF5A 2FA8A 4NPBA 3L78A 4WR5A 3RPPA 1TK0B 2HSYA 4MMMA 1J0FA 4MH2A 3GKMA 3G7YA 3EC3A 1PA3A 5GAPD 5AGYA 2YCDA 2R37A 3IK9A 3D0ZA 3QPMA 2YJHA 4GF0A 2H01A 3GX0A 1XWAA 2H71A 2H70A 1A8LA 5E4WA 1XVQA 1FHEA 1YQ1A 12GSA 4LL4B 3CRUA 4PNFA 1DUGA 4ECJA 3GURA 4NAXA 4H86A 1QMVA 1HNBA 1UC7A 2WDUA 4MJCA 4LMWA 5AISA 5C04A 1XOBA 2HYXA 3VLNA 2C3TA 2PBJA 1GP1A 1W4VA 4GSTA 16GSA 1SYRA 3E9JB 2O89A 5J9BA 2X64A 1NSWA 4XS6A 4RUVA 1A0FA 2GVPA 2PMTA 6GSSA 1XBSA 3UARA 1F3BA 1N8JA 1SYXA 1YF1A 1GTAA 3GX8A 2VM1A 3TKPA 1F2EA 5CRGA 2J9HA 2B7KA 2C0GA 1SL1B 3M8NA 3BBYA 3GH6A 4KA0A 2QGVA 1EGRA 2PU9C 2CQ9A 2B5YA 3QAGA 4EVMA 1O85A 1O81A 4BWQA 5ABRA 2QC7A 5D8IA 5DAKA 1TOFA 4IKHA 1G6WA 10GSA 3IHQA 2IJYA 1XIYA 3ED3A 3HJMA 2VD0A 5INYA 1MD4A 1XWGA 4E8EA 2IL3A 2CVDA 3M1GA 3IBHA 1FOVA 1SKWB 19GSA 2BTOT 1O73A 2K18A 1PX6A 3R2QA 2E7PA 3HY2A 17GSA 3HVVA 4K7IA 2C3QA 5ELAA 1HNCA 4FIWA 2WCIA 1X5DA 1A2LA 1ZZYA 4L0UA 3LFLA 2PN8A 2PPTA 5FT3A 6GSVA 1Z7PA 1G7EA 2N5AA 1EP8A 4ZIJA 4FYBA 4OD7A 1ERUA 2AUVA 2H74A 2KLXA 1OC9A 1Q4JA 2RLIA 3ZYWA 4LL1B 1O7UA 5A5KA 1GWCA 1VGLA 5D9VA 1XW6A 1AC1A 1R5PA 3LYPA 3TB2A 4FYCA 4TXOB 5CRWA 2GZPA 1PQNA 3LEFA 5G31A 3G7IA 1PX7A 2WB9A 4TR3A 3H4KA 2LJAA 2FWHA 1QK8A 2H30A 2H0GA 3VFIA 2L5OA 1EZKA 5IPGA 3K8NA 3L4NA 1TK8B 2VOCA 4TR4A 1M0UA 3SBCA 4G19A 1AIUA 3FZAA 5EY6A 3QFAC 3V1WA 3TJGA 4TW5A 2LQQA 2IFQB 4Q5RA 5HFIA 5CP1A 2WULA 2R6KA 3GRXA 2CZ3A 5AN1A 1XVWA 1U3AA 1Z3EA 3D6IA 3UAPA 5J4UA 3D4TA 3WD6A 3MDKA 3UJ1A 2B1LA 1VF4A 5ID2B 1U3IA 4N0VA 1KTEA 2XC2A 2XPEA 4HJMA 4MK3A 3C1SA 2DIZA 1GNWA 3FR6A 4PX1A 2VCTA 1NM3A 6GSYA 1GSUA 4NMUA 2GTUA 5ELGA 3RDWA 3NIVA 1K0OA 4TXVA 1G0TA 5CO3A 2TRCP 5EVOA 2RM5A 4WKWA 2YWOA 2YZHA 2DC5A 2ZCTA 1AUCA 2V6KA 1B9XC 1ILOA 2PGTA 4L5LA 3TKSC 2F9SA 4LA1A 5DJMA 3GMFA 4YAPA 2VCZA 3A3TA 3QAWA 4EC0A 2C1YA 3Q6OA 5HFGA 2R4VA 4RQXA 4MA9A 1ML6A 6GSWA 2JZTA 4BVYA 4IN0A 2H75A 4ZL7A 2P0GA 4KCEA 5DCGA 2V41A 2RUEA 3O6TA 3F4RA 5KN1A 2I1UA 4GQCA 1JHBA 2MMAA 5L71A 1B48A 3RHBA 5G5EA 2A2RA 2OACA 4MZCA 3VI5A 1BX9A 4N11A 1M2DA 3RAZA 2AV4A 3F3QA 1FB6A 3IDVA 4D73B 2HZEB 3GHAA 4KCAA 2XBIA 3WT1A 2H1AA 2PVQA 1A2JA 3A2XA 3O76A 2DJ0A 1XCCA 5DALB 4X0XA 2FUG2 5JWQB 1YKCA 2CX4A 5IOXA 5DJLA 3IAM2 4XS4A 2B6MA 3C73A 3FY7A 3GL5A 4AF2A 2VLTA 4ECCA 3UIWA 4MJBA 1FB0A 3RHCA 1SENA 1K0MA 4BWSA 1RQMA 5ECIB 4KDUA 5ECMB 2Z9SA 1GL8A 1K0CA 4GQFA 5ECRB 3BCIA 3LYKA 1VF3A 2IFQA 2LRNA 2B3SA 1X9WB 2CVBA 2H72A 4K2DA 1NHOA 3KJYA 1Z6NA 1X0RA 3ZVJD 4MPFA 2YNXA 4IJIA 3WGXA 4GCIA 1WOUA 2XBQA 5ECHB 1EOGA 2EIOA 1OKTA 3HYPA 4G9HA 5ID2A 2CA8A 4PNGA 2GZYA 4MJAA 2TRXA 3KD0A 1KEBA 1PD21 3GIXA 1DBYA 2P5RA 4ML6A 2WFCA 4IS0A 4JR4A 1Z5YE 2HXKA 4GSSA 2KP1A 2C3NA 2LRTA 4EE0A 5EL8A 4ECIA 1U87A 1URMA 1PSQA 2IPAA 4YQVA 2G0FA 5C00A 3VWVA 3FR3A 22GSA 1O8WA 3TDGA 2GS3A 4ZILA 3UOMA 1J9BA 5F07A 5B6MA 1XW5A 4GWRA 4X1UA 5B6NA 3CSIA 3E3EA 3IR4A 2YN1A 1B8XA 4KGIA 4KH7A 1SD8A 2FWEA 2VCQA 1R26A 5G5FA 4XIHA 13GSA 4HQZA 3TRQA 5D93A 4PUFC 1MTCA 1GH2A 1IYHA 2ZNMA 4BA7A 4MF6A 1THXA 4HDEA 1TTZA 2NBSA 2FWFA 1MEKA 1XXUA 20GSA 4NV2A 2V2GA 3L0HA 2LJKA 2XHFA 4PUAA 1FAAA 2O85A 1PKWA 4I97A 1K3YA 1PL1A 5ENUA 1V98A 2LKUA 3EU4A 5JCUA 1H4OA 2VD1A 5CREA 5ECOB 4EL1A 1FO5A 1LU4A 2RM6A 3GA4A 2H1BA 2VCWA 2OBKA 2VAFA 2LRCA 4OFMA 3FR9A 3KZQA 4XHMA 2ON5A 3HZ4A 4V2LA 3J7Yk 1YJ6A 5COHA 2M80A 4N30A 5F05A 1R5AA 1TRSA 4MDCA 2VM2A 3HXSA 3LORA 3ZFLA 4K6XA 2LV3A 2L6CA 5G1LA 2R2JA 3FZ4A 3CTGA 1QQ2A 3IXRA 4JR6A 1DE2A 1WE0A 3BCKA 1GTIA 5JCWA 1TP9A 4OFTA 3D5JA 1JZOA 4AGSA 4G10A 3DEXA 4K7OA 5G2ZA 4JZQA 4V1Ap 2VL2A 3ERWA 4EF0A 1GUKA 4KX4A 2FHEA 3DIEA 1SU9A 2H0HA 3QCPA 4O92A 1TI1A 3AY8A 3APOA 4OWYA 3GTUA 1AW9A 4CDOA 1S3AA 3KM6A 3CYNA 14GSA 2DJJA 2YWNA 5DQSA 1USBA 2H6XA 2C0FA 4N10A 1TW9A 1HD2A 2YP6A 1XWBA 2WS2A 1WJKA 2C8UA 3GV1A 5JCGA 4KSMA 2VL3A 1OE7A 2JZSA 2K6VA 1SK2A 1Q98A 4TR0A 3GN3A 1GULA 3A2VA 2VIMA 2H6YA 4OMVA 2YANA 2DIYA 2GZZA 1I5GA 1EV9A 5B8AA 1M2BA 4WEYA 3ZIVA 1JZDA 3GUSA 2WGRA 5D9WA 2OE1A 1ZCPA 2L4CA 2CT6A 2C80A 2V1MA 3P7XA 1YDKA 4TRXA 2GQLA 1JLVA 3MAKA 4IBPA 4HQSA 3HJPA 2YWMA 3EWLA 1THOA 3UMAA 1GSFA 2GT5A 4PQIA 2GDRA 3PR8A 2VL9A 2HRNA 1A2MA 1TXXA 3KXOA 2JADA 1PKZA 1BQ7A 4J57E 1T00A 3ZMLA 3F4SA 3M0FA 4YAVA 3DD3A 1GSEA 3ZLPA 4BPYA 4G2EA 2MZCA 1TDIA 3CRTA 4Q5NA 4XCSA 2HNLA 4CHSA 4OCEA 1X9SB 1JLWA 1MD3A 3HJOA 4PXOA 5H5SA 5IMVA 2LTKA 4GXZA 1TI3A 2OADA 1VF2A 3FKFA 5DQYA 1M9BA 1YY7A 5ECSA 4O7HA 4HOJA 4L5OA 3A5WA 2L59A 3H93A 5FWGA 3UBLA 3P2AA 1E6BA 3D21A 4OFNA 4F0CA 1TJDA 2QSIA 4FO5A 3QAVA 3CBUA 4POBA 3KH7A 4EDZA 3OR5A 3A2WA 1O6JA 2NDOA 1XZOA 3DXBA 3DKSA 3BD2A 3PINA 3KEBA 5D9TA 1GSDA 4PURA 1SK0A 4ZB6A 5J3RA 4GSNA 4X43A 1T4ZA 2PWJA 2VCVA 5B8BA 1E2YA 4MABA 3ZREA 1OAZA 3F63A 2JSYA 4Z7XA 2OE0A 4TR1B 5IMAA 4MLYA 2E0QA 1V57A 4WF5A 3P90A 2FD3A 4K8MA 4HU9A 3QD9A 4KW6A 3ISOA 1YF0A 3O3TA 4OO5A 5AIVA 1FVJA 4POLA 11GSA 3H1NA 4YQMA 4K9ZA 2R5GA 3ZRDA 1WIKA 5GSSA 4JE1A 5FHIA 1EV4A 2F3MA 1WP0A 1EP7A 4ZB8A 1ERVA 1QUWA 4BVXA 2ZUPA 2AAWA 1T8EB 4IHUA 1SKSB 1TRWA 1CQGA 1N2AA 3TGZA 4ILFA 5IMDA 1GTUA 2ALBA 4ZXGA 2L6DA 5CAXA 4PGTA 3HD5A 2YZUA 2F8FA 1XWCA 3C71A 4DSSB 1K3LA 3W6GA 4RI7A 2I81A 2IN3A 5AIXA 1OC3A 1JZWA 1SL0B 3EMXA 3D4MA 2V32A 2L5LA 4QL9A 4EXJA 1EGOA 3L9SA 1LBKA 2IMIA 4E8HA 1FG4A 3QMXA 3TOUA 1ZOFA 3EYTA 3F3RA 4MJEA 4TXOA 9GSSA 2L57A 2OBIA 2AJQB 3NZNA 4RI6A 2LSTA 1PL2A 3WGDA 1A8YA 4TKYA 2OKAA 4PQHA 2X99A 4GRFA 1JZRA 4RQRA 4AJ8A 5IMCA 4MH3A 1DE1A 1TU7A 1ON4A 3N9JA 2ES7A 1R7HA 1K3OA 4KB3A 2MMOA 1B4QA 3DVXA 1WPIA 3VURA 1V2AA 5HR0A 4HS1A 1A23A 3FHKA 3F4TA 1XW9A 3EINA 1I9DA 1MDJA 1SKRB 5CRDA 3LG6A 3UEMA 2MMNA 3IOSA 1U88A 4IW9A 1BG5A 1Y25A 2C0EA 5D96A 3TKQA 4JBBA 2GSSA 3C8EA 2MBSA 4TVEA 1VF1A 2H6ZA 3ZVJA 2REMA 3GFKA 5DBQA 2YPMA 2LNTA 2I4AA 3VI7A 2P31A 4DSQA 1KBNA 3Q18A 5CNWA 4IELA 4O5RA 4WBRD 1UA5A 2P5QA 1AQWA 5IMFA 2FWGA 1SJ6A 3KMOA 5F0GA 3KCMA 2DLXA 2CVKA 5G1KA 3WT2A 4L8EA 1FW1A 1V58A 2WRTA 3CTFA 4MZWA 1XPVA 1PRXA 5KN2A 2DBCA 3BOAA 3KP8A 3M9JA 4LMVA 3ZL5A 2M72A 4ULXA 1J08A 4MPGA 1G7OA 1RW1A 3ERGA 3QFBC 1YKAA 2LEGA 3RPNA 3TCOA 5DAKB 2KHPA 5KEJA 2H73A 2H8LA 4ML1A 1ERTA 4XS1A 4ECBA 1M2AA 4HUAA 3PH9A 3EVIA 3W8SA 2X8GA 2H1DA 3ZIJA 4F0BA 2LUSA 4D73A 2HZEA 4POKA 3KMNA 3LGCA 2JACA 3ME8A 1T7PB 3C1RA 3US3A 1AQXA 4OCFA 2DJ1A 5DALA 1ST9A 3GH9A 4K0NA 3GKXA 2AHEA 2OE3A 3LXZA 4EO3A 2FNOA 3KH9A 3U5RE 2E2GA 2GQKA 1FVKA 3TRPA 2H66A 4L0WA 2EC4A 3W8JA 4IGJA 3DWVA 2VLVA 1OKDA 1MDKA 3VWXA 1M7TA 4DEJA 4ZBAA 1OVNA 2JSZA 2YV9A 2DMMA 1ABAA 2DJ3A 4K1FA 5ECQB 1U6TA 1GSYA 1K0DA 3M3MA 3LSZA 2N5BA 4QQ7A 2O7KA 3D22A 1UN2A 3LQ7A 4IP6A 4F82A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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