3M9JA

Crystal structure of human thioredoxin c69/73s double mutant, reduced form
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASESEVKSMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of human thioredoxin revealing an unraveled helix and exposed S-nitrosation site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
total genus 38
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3m9jA00
4PNGA 5H5RA 2H1DA 1B48A 2L6DA 5AGYA 1GWCA 2PWJA 3IK9A 2OE3A 2C3QA 1ZGNA 3C1SA 3L9VA 4ML6A 3ZTLA 3KM6A 2OBKA 1ABAA 1TTZA 4RQRA 4WKWA 3L9SA 4OWYA 1WRYA 1XWBA 4K7OA 2G2QA 4FO5A 2B1LA 2LUSA 3EVIA 3FR9A 1TK8B 1XXUA 2P31A 5D96A 3VWWA 3ZMKA 2HFDA 3FRCA 2OBIA 3NIVA 4CDOA 3DVWA 2VCTA 2V2GA 1GSQA 4PUFC 1BG5A 1RQMA 7GSSA 3KGKA 2F9SA 1PL2A 4NHWA 2XHFA 2RLIA 3WGXA 5ECSA 2GQKA 4MLYA 1VF2A 2YN1A 3DEXA 3RHBA 4N10A 3TKSC 1X9MB 2C0FA 3TJFA 1R26A 3F8UA 3LORA 5G31A 1EGRA 1A8LA 1Q4JA 2H66A 2HRNA 1PSQA 1QK8A 4HU7A 1K0DA 4DSQA 3HXSA 2VD1A 3CSJA 3CSHA 4KDXA 1T00A 2LJKA 2O7KA 3D21A 2EIOA 3I69A 5KN1A 2IMEA 2C3TA 2P0GA 1NW2A 1N8JA 5G1KA 1XW5A 2JU5A 2P5RA 4AF2A 4O92A 3IV4A 3U6VA 4XHMA 2WGRA 3ZFLA 2M46A 2L59A 3CRTA 2RM6A 4HQZA 2GSTA 3IOSA 5F8BA 5DQSA 4MF5A 5GAND 3QDNA 3GIXA 3HA9A 2CX3A 1YEXA 1M0UA 1A2LA 4AGSA 1BJXA 2DJ3A 3H1NA 1FB6A 2I3YA 2DIZA 2RUEA 5GZZB 2AAWA 4BPYA 1HNBA 2E2GA 3VPTA 2KHPA 4MA9A 1BEDA 1M7TA 4ZXGA 1AQVA 1T8EB 4MJBA 3KP9A 3GKMA 5ECKB 1F37A 4MPGA 4OD7A 3ED3A 5JWOB 4PXOA 5B8BA 4GF0A 1IYIA 1XWGA 3KEBA 2HSYA 1ACVA 1GH2A 5B6NA 3M0FA 3BJ5A 4LLRA 1F3AA 3IR4A 3IAM2 5IIZA 2WS2A 4BVXA 2KUCA 4L5OA 2ZCTA 1K3LA 1LU4A 1YF1A 2YWIA 2L4QA 3EWLA 3F3QA 1U6TA 4PQIA 3HJPA 2VLUA 4ZIJA 1O7UA 4YQVA 2E7PA 1WE0A 2FGXA 4G10A 4IQ1A 3H79A 3GKNA 3VLNA 2HZEB 1JZRA 3EMPA 5G5EA 5J5NA 1PKWA 5ECRB 1JLVA 5JCGA 1UN2A 1K0OA 1MD3A 2WJUA 4IBPA 2AV4A 2B6MA 5IOWA 1ERVA 4ISDA 1XIYA 2OE0A 3G7YA 4ZBAA 3GL3A 1HNCA 3ZREA 3F63A 4HEA2 1OE7A 4ACSA 1YKAA 2BTOT 3FZAA 1ON4A 5F06A 1T1VA 3FZ5A 1EWXA 4EF0A 4POMA 1GUKA 2LKUA 2VAFA 1OAZA 1XFLA 3SBCA 3A2VA 3VI7A 2H76A 2GSQA 2E0QA 6GSSA 3HJMA 4I97A 2AJQB 2MMZA 2YJ7A 4E8HA 1XBSA 4MJAA 1BX9A 2H71A 5HR0A 4V2LA 3TJGA 4OO4A 2CAQA 4OCEA 3M3MA 1SL2B 3CMIA 2REMA 3DWVA 3D0ZA 1QMVA 1SJ6A 4Q5FA 17GSA 4PNFA 1GTAA 4Q5QA 4WR4A 4WETA 2PN8A 2R3XA 1G7EA 4K7IA 3CTFA 2X99A 2YCDA 5CRWA 2V6OA 3FW2A 1FW1A 1WWJA 3ZIJA 3PR8A 4HZ4A 1Q98A 1O85A 4WF4A 4D73B 2I9HA 2VD0A 3UARA 4TOPA 3IE3A 6GSUA 5C00A 2MMOA 1MEKA 4ZB8A 1PX6A 1T4YA 1URMA 4LL1B 5B8AA 3HVSA 3Q18A 4FYUA 2L57A 1XVWA 4HQSA 3Q6OA 4F9ZA 1M2AA 1FO5A 4N11A 4J2FA 2WB9A 4YQUA 3TRXA 5LCZA 6GSTA 2LRTA 3BD2A 1OC9A 3NZNA 1EP8A 3ZL5A 4V2NA 3IA1A 3TJBA 3O6TA 4BWSA 4ULXA 3A3TA 1OC3A 1UC7A 3KXOA 2GLRA 2PMTA 4OFNA 2O85A 4RI6A 5DAKB 1M2DA 3K8NA 1NSWA 1Z6MA 1JFUA 2LJAA 4TXOB 1HNAA 4PUAA 5INYA 1O81A 2X64A 1MDKA 1GNWA 4OCFA 1FAAA 3ERFA 1DE1A 4L0UA 1Z7PA 4MZBA 1PRXA 5AIXA 2IPAA 1EEJA 2H0GA 2H01A 3NOFA 2GS3A 3GV1A 2K8VA 4HZ2A 4BA7A 2NTOA 3EE2A 3D5JA 2WCIA 2HT9A 3O76A 5IO0A 5EY6A 2X8GA 2DJ0A 4DSSA 1XW6A 5DALA 1VF4A 1F2EA 1JZWA 4FH8A 5DQYA 1XVQA 2C0EA 2BMXA 3I6AA 4KDUA 1XWAA 16GSA 2HXKA 3LEFA 3Q19A 4AJ7A 3ZMLA 1SL0B 2ES7A 4NPBA 2FWEA 5DCHA 2C0DA 1EV9A 4GTUA 3HDCA 1BQ7A 5CRGA 5G30A 1Z7RA 1KBNA 2N5BA 4G9HA 1MDIA 1GUMA 4RI7A 1QGVA 4XCSA 3S9FA 4MF6A 4ILFA 4HOJA 3VWVA 2VM1A 4JU5A 5CNWA 1GSYA 2VM2A 3BBYA 1OKDA 2H73A 3G7JA 2IWTA 3TKQA 4ZB9A 1AW9A 1TU7A 2CV4A 2O87A 3ZITA 1XOAA 3LSZA 2XBIA 2DIYA 1AAZA 3HYPA 3P7XA 2B7JA 4HU9A 3F6FA 1K0CA 5HR3A 1X5DA 2FUG2 1U3IA 2P5QA 3QOUA 4ECBA 2FLSA 2FNOA 2HLSA 3RDWA 1AQXA 5J41A 3FZ9A 2QC7A 2FD3A 2H30A 14GSA 1TJDA 5GSTA 1MDJA 2B5XA 2GSRA 4NMUA 2TRCP 1K0BA 2IFQA 1QFNA 4CHSA 1S3DA 1UA5A 2CQ9A 3GSTA 3ZLPA 1VRSD 4MK3A 2J9HA 4K7NA 5EL8A 2B1KA 3ZYWA 1OC8A 3TKPA 2O89A 2FA4A 3LJRA 2YWNA 2EIRA 4TR1B 3M9JA 3KH9A 2JL4A 2LQOA 1A2MA 5J9BA 5E59A 4X0XA 4MF7A 1EOGA 2VCZA 2H8LA 3ZFBA 1F3BA 2NDOA 2YANA 3HY2A 1TRVA 2F51A 1CQGA 1UVZA 3PINA 3FKFA 3FY7A 4IKHA 1O8WA 4K9ZA 2LTKA 5IM9A 2CVKA 2FY6A 3N5OA 2VOCA 3GA4A 3KH7A 1WMJA 2OJLA 3GH6A 3VFIA 3DMLA 2K9FA 2K8SA 2IJYA 2PVQA 5EVOA 2VIMA 3D4TA 9GSSA 5ELGA 3KCMA 1E6BA 4X43A 3D22A 4NWYA 3APSA 3MWHA 4GRFA 3UIWA 3JCML 3H4KA 2L6CA 4IGJA 4IP6A 1WP0A 1B4QA 3KP8A 3TJJA 6GSXA 2KOKA 2NPBA 4DSRA 1B9YC 1XPVA 5CAXA 1GTIA 5FWGA 1TI1A 1Z5YE 3TRPA 3HVVA 3WD6A 5D9XA 3RPNA 4DEJA 3UEMA 1ZL9A 3QAVA 1O73A 2GT6A 1XWCA 12GSA 5JWRB 5ABRA 4KE3A 3ZZXA 3QPMA 1EZKA 5F0GA 3LYPA 3IK7A 2PVOC 3GUSA 4L8EA 4DVCA 1BYEA 1PKZA 2OADA 1OVNA 2FA8A 1K3YA 1R7HA 2MYGA 4F03A 1SJIA 4JEDA 10GSA 2C0GA 2AB6A 3HVXA 3A2XA 3VWUA 3KJYA 4MH2A 3QMXA 1AC1A 5IMFA 4KX4A 4PURA 3VK9A 3ZRDA 3H93A 4HJ2A 4KGIA 3RAZA 4TR3A 2H70A 4HDEA 1C72A 1XCCA 2HNLA 3UJ1A 5D9VA 4IVFA 1MD4A 1IYHA 1U88A 3DKSA 1NHOA 2DLXA 2VCWA 1WJKA 3UMAA 2GVPA 4RQXA 5D9TA 1K0MA 4EXJA 1PA3A 4OO5A 4KDYA 4EVMA 8GSSA 1X5CA 1N2AA 4HS1A 4EE0A 3ZVJD 3CYNA 3J7Yb 4XIHA 3G7IA 3KMNA 2LJRA 4POBA 3P90A 2FWGA 2C80A 2FCHA 4LL4B 1V9WA 2A2RA 4QQ7A 2KP1A 3DXBA 3L78A 1GTUA 2K6VA 4LMVA 2Z9SA 2JZRA 4J57E 2C8UA 3EYTA 4I8BA 3H8QA 5AIVA 2R5GA 4MMMA 2R4VA 2ALBA 3DGQA 3TRQA 4YQMA 2HI7A 5FHIA 1Z9HA 1XWKA 1PQNA 1X9WB 2OKAA 2PBJA 5ECMB 5DVBA 1KEBA 4XRDA 4ZILA 3GYKA 11GSA 5D9WA 2IL3A 2MMNA 4BVYA 4IQAA 1GSFA 1SYRA 3APQA 1SD9A 3FK8A 2OE1A 5HFGA 4KAEA 2TRXA 5H5QA 2IMIA 3L0HA 1OKTA 5IMZA 3LQ7A 4YAVA 1X5EA 2NVLA 3V1WA 4K2DA 3LG6A 5ECOB 1SYXA 1DE2A 1EP7A 4O5RA 4WR5A 3TKSE 3U5RE 4TW5A 2B3SA 4KUNA 4CW9A 3AY8A 3VWXA 5G5FA 2L5OA 2YOIA 3APOA 5IMDA 2A2SA 3HD5A 2AUVA 2DC5A 1GSSA 4RUVA 1SK0A 3GURA 2I1UA 1FHEA 4POLA 4K8MA 5G2ZA 2HYXA 1BAYA 1PN9A 2ON5A 3KTBA 1GULA 2VL3A 2ON7A 4EKZA 1KTEA 1E2YA 1W4VA 3ZIVA 1R5PA 3F4RA 3DIEA 4PX1A 2V6KA 1GNEA 1M2BA 5A5KA 2IMDA 3KZQA 2HRFA 2LNSA 3C7MA 4MP4A 4PQHA 4MDCA 1ZYQB 3HZ4A 1YY7A 6GSYA 1DUGA 3TB2A 2CAIA 5CRHA 5C04A 2H6YA 4K1FA 5ID2A 3CBUA 3GTUB 3VURA 4I5QA 3LFLA 2VLTA 5DCGA 2CA8A 2MBSA 1THOA 1GSEA 1TU8A 1SK2A 2JSYA 4AJ6A 1TDIA 4EL1A 4I2TA 4KB3A 3US3A 4DSSB 1TRUA 4QL7A 4TR4A 19GSA 3KIJA 1YEPA 3GKXA 2PERA 4ECCA 3ISOA 2VO4A 1W89A 2RM5A 3UL3A 2H74A 1J08A 4XRAA 1U3AA 4WF5A 4GQFA 2B5YA 1GSUA 2OA7A 5ECNB 1NM3A 4V1Ag 3A2WA 3VI5A 4KCAA 2GZPA 2JSZA 3QFBC 2HSHA 1SD8A 3LXZA 3PGTA 1G6YA 1FVJA 2JADA 2V1MA 4O32A 5A4UA 4KNDA 3ME8A 1EOHA 3GRXA 3LXTA 4MCUA 4ZL8A 1DBYA 5GAPD 3W8JA 2O8VB 1MTCA 3MDKA 5CRDA 3L9UA 2H6ZA 2H72A 4MABA 2YV7A 1TW9A 1A0RP 1VF1A 2G0FA 2C4JA 5L71A 3BCKA 3L4NA 1G6WA 3CXGA 1EGOA 1X9SB 1ZZYA 2CX4A 1B4PA 4MH3A 2MMAA 3ZVJA 4XS4A 1HQOA 2JZTA 5F05A 3QD9A 5D73A 3O3TA 4KSMA 1YF0A 4GXZA 3EMXA 1X0RA 3ERGA 3LGCA 2I4AA 3TOUA 1JZDA 2KP2A 1T7PB 4IP1A 2DMMA 4F82A 1WIKA 3RBTA 3TDGA 1Z3EA 3GMFA 5JWQB 2ZUPA 1GLQA 2AYTA 2QGVA 4XS1A 3EINA 18GSA 5IMCA 2IFQB 4TXVA 4GWRA 3GNJA 2JZSA 2X8CA 5IMAA 5ECHB 1O8XA 4OFMA 4EO3A 1HYUA 3M9KA 1G0TA 2LV3A 5ELAA 1I5GA 3DYRA 2CZ2A 5AISA 5DJLA 3WGDA 1M9BA 1AXDA 2E2MA 5GSSA 1TK5B 3F3RA 4I6XA 5B7CA 3IBHA 3E3EA 5CP1A 4EDYA 4FIWA 2GZZA 4JRRA 5DJMA 4V1Ap 4QL9A 2H1AA 1FG4A 2XBQA 2VL2A 3TOTA 1LJRA 2MBTA 3FR3A 1A24A 1FB0A 2VL2C 2IIYA 2XC2A 2N5FA 5EPFA 3HHVA 5KN3A 5CO3A 2R6KA 2H0HA 4TR0A 2M72A 3FZ4A 2GQLA 2TIRA 1GRXA 3WT2A 3TKRA 2B5EA 4GSSA 2F8FA 1YDKA 1NHYA 4ZB6A 4KW6A 3P2AA 1Y25A 1SU9A 2YZUA 4MJEA 4F0BA 5DBQA 3N9JA 5J9CA 1PX7A 1ILOA 1YKCA 3TKSA 2ZNMA 4WBRD 1ZYEA 3GL5A 1PL1A 4IJ3A 2KLXA 5IPGA 4PGTA 3P8WA 5B6MA 4KSOA 4GSNA 4JR4A 4TR1A 5COHA 2PPTA 4TRXA 1H4OA 4PQ1A 1YQ1A 2JACA 1ZMAA 2RIIA 2XPEA 2VCXA 3C1RA 2FWFA 2GQMA 3A5WA 2DJ2A 4HI7A 1J0FA 4MZCA 5J4UA 4O7HA 4P3YB 4EC0A 1F6MC 1ST9A 2HZFA 3QFAC 3WYWA 1USBA 1ZCPA 1B9XC 3GFKA 2V41A 2WRTA 5ENUA 2PUKC 4BL7A 2HE3A 4IHUA 4MZWA 4TN8A 2LRNA 2DJKA 2LSTA 3M8NA 1R4WA 1SL1B 5IQYA 2CVBA 3PH9A 5AN1A 3HCZA 5JCWA 1JLWA 4XTSA 2IMFA 4KA0A 2YWOA 5ECPB 3RHCA 4X1UA 2YV9A 3FR6A 3MSZA 1RW1A 3HJOA 1B8XA 4YAPA 1O6JA 3QR6A 1TRWA 1GSDA 5HQPA 2YNXA 5HR1A 1FVKA 2VLVA 4NV2A 3FHKA 2DMLA 2OACA 1VF3A 1M99A 1FOVA 2AHEA 2R37A 4IJIA 2D2ZA 2RUFA 2LNTA 1OYJA 3G9BA 5KN0A 3I43A 3UVHA 4K0NA 1PD21 2QSIA 3QAWA 3Q74A 1G7OA 3TGZA 4NXIA 4GSTA 2BJXA 2VL9A 4L0WA 2NBSA 3GH9A 4J56E 3DVXA 1AIUA 1THXA 1T4ZA 20GSA 3VPQA 1V57A 2GGTA 4GCIA 4TVEA 4EUYA 5ECLB 1PGTA 2LS5A 2C1YA 1J9BA 4MPFA 2XPDA 5CYYA 1A8YA 4ID0A 4H86A 2R2JA 3TJKA 1K0AA 3GSSA 1A2JA 5LNKe 1WOUA 2CZ3A 3IDVA 2F3MA 3CSIA 3KMOA 3WT1A 4LMWA 4Z7XA 2LEGA 4KH7A 2CVDA 4YH2A 1K3OA 1GL8A 3BCIA 3CRUA 2YPMA 1XZOA 4E8EA 1TXXA 2B7KA 5HFIA 2V32A 4F0CA 5IMVA 3MAKA 6GSWA 5HFKA 5H5SA 2HZEA 3LYKA 1Y6EA 1GP1A 1S3AA 3OR5A 2GSSA 4ZL7A 5DDLA 2DJ1A 4ML1A 3C71A 3EU4A 2FHEA 4N0ZA 4JZQA 2CT6A 5IOXA 1EEMA 1SK1A 2VUPA 3CTGA 5KN2A 4IELA 4ECJA 1GLPA 2F8AA 2PU9C 4IW9A 3IAS2 4WBJA 3D4MA 2DSAA 2WULA 5IO2A 1V2AA 3F9UA 2IN3A 4G2EA 5J3RA 1GTBA 4EDZA 4FYCA 3E9JB 1JHBA 3BOAA 1V40A 3F6DA 1HD2A 3C8EA 3UAPA 1OC9B 2WDUA 4OMVA 3IRAA 4MJCA 3F0IA 13GSA 4L5LA 2YP6A 2X8HA 4NHZA 1ML6A 3LWAA 2H19A 3J7Yk 3IHQA 2DBCA 5A4WA 5G1LA 1V58A 4ZBDA 2A4VA 1TI3A 1TP9A 3GKKA 4HJMA 5ID2B 3KTLA 1JZOA 2PGTA 3ERWA 4HUAA 4Q5RA 22GSA 5ECIB 2C3NA 4KCEA 1YJ6A 3KD0A 5E4WA 3ME7A 4TKYA 4K6XA 2MZCA 3E0UA 3UBLA 2J23A 4ZL9A 1ERWA 3GHAA 4JR6A 4K0GA 4D73A 1ZOFA 1T3BA 5LD0A 3IXRA 2DJJA 4GQCA 5HR2A 1GUHA 3DD3A 1SKWB 1EV4A 2LRCA 5IPHA 4IS0A 2H75A 3IC4A 2H1GA 4ZBBA 3W6GA 5FT3A 1OE8A 3EC3A 5A4VA 2N5AA 2EIQA 4GLTA 3W8SA 5CREA 5ECQB 1LBKA 5DALB 1AUCA 1XW9A 5D93A 3FEUA 5D8IA 3QAGA 3HKRA 2WZ9A 4POKA 2YWMA 2I81A 2GZYA 3M1GA 5DAKA 1ERUA 2M80A 5KEJA 1TK0B 4AJ8A 1DSBA 3UBKA 2L4CA 3GX8A 3QCPA 4TXOA 1TKDB 3GTUA 2YJHA 1KNGA 4JBBA 1XOBA 2VCVA 3I9V2 2L5LA 1R5AA 2YZHA 3WGEA 1Z6NA 3R2QA 1F9MA 4XS4B 1QXHA 4IN0A 2GT5A 1M9AA 3C73A 1S3CA 3HZ8A 1I9DA 1YZXA 3IPZA 1TOFA 3DRNA 1A23A 3MNGA 4I2UA 4N0VA 4WXTA 1QQ2A 2EC4A 3RPPA 1H75A 1VGLA 4NAXA 1AQWA 1ERTA 4N30A 4NV5A 3EURA 1SKRB 3EU3A 2H6XA 2LQQA 3GN3A 3F4TA 5JCUA 4XS6A 3F4SA 4WEYA 4LA1A 3TCOA 3D6IA 2QKEA 2WFCA 3SWLA 2VCQA 1WPIA 2H0IA 2K18A 3TUEA 3FYGA 1CQHA 4V2MA 4BWQA 1SENA 1PMTA 4F2IA 2GTUA 4OFTA 2IMKA 1RK4A 2FWHA 3GX0A 1U87A 1V98A 6GSVA 4G19A 4Q5NA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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