3MBPA

Maltodextrin-binding protein with bound maltotriose
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
publication title Extensive features of tight oligosaccharide binding revealed in high-resolution structures of the maltodextrin transport/chemosensory receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Periplasmic binding protein
total genus 127
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mbpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mbpA01
1NNTA 1NFTA 1N84A 2XD3A 4RK9A 4RPNA 4EUOA 5DTBA 1XC1A 3CG3A 4ZEKA 4O3BA 4LONB 4F22A 2HFBA 3TTMA 3MPLA 1LAGE 4LA9A 4Q0CA 3S4UA 5TPAB 3VE1B 1XVYA 4RNSA 3CSGA 3TYHA 2F78A 2YJPA 2RC7A 1PB7A 1P99A 3EPEA 1UTHB 2DWHA 2DQVA 4ELQA 4WEDA 1N76A 3CFZA 4YKPA 4KPTA 4OHNA 4JWYA 1RYOA 4GOTA 3PUWE 4WXJA 4BDMA 1Y3QA 3TTRA 4AB6A 3ECRA 1MY2A 3LR1A 2PT2A 2A5TA 1Q35A 4XXUA 1Y3NA 1SQYA 1SI0A 4YKKA 4C1TA 1LFHA 3HCQA 5K2XA 3K4UA 4FORA 2B65A 4IO4A 3VXCA 1MY1A 1LAFE 2V3QA 2AYSA 4UA8A 3HV1A 3SEWA 5JTYA 2ZYOA 4FJPA 4H67A 1GVCA 1CB6A 4C0RA 3PGFA 3PUVE 3PMWA 4NF6A 1JW4A 4IO2A 3L6HA 4FEDA 1Y4CA 1EU8A 2H5YA 3OO9A 5EYFA 2WKYA 3M3KA 2DVCA 2ONRA 4ZE8A 4F19A 3QYTA 2Q88A 2Y7IA 3FV1A 1MG1A 1M5EA 1S9TA 2DOJA 3U8QA 3DP8A 1B6HA 2XXUA 3B6QA 1O64A 4QFLA 3IX1A 4G68A 1MPCA 4XKRA 1DTZA 1B4ZA 2P2AA 3TCGA 2XXTA 1HSEA 4AB5A 1MPBA 2PVUA 4JSDA 1UQWA 1MQDA 2QMWA 2RKMA 4GXAA 3RTWB 1OQHA 3FVNA 4DE8A 2F6GA 3CG1A 3TTKA 1EZPA 3FVGA 3O2AA 4LP2B 1N3XA 3MP1A 4P0GA 3BFTA 5DYHA 4XKPA 4YMAA 5B70A 3O6HA 2REGA 3N5LA 1Y9UA 1IXIA 1P1UA 4P0IA 4IGRA 3FIRA 4F31B 1DSNA 2Y84A 2ZNSA 1N3WA 3Q28A 5A5XB 2OLBA 2M8CA 4PFTA 3Q29A 3MWBA 4ESWA 4HCWA 1YTVA 1LCTA 3QK6A 4ND9A 3SKPA 5CMKA 1CE2A 3FVOA 2I58A 4F1UA 2NVUB 1IZ1A 4PFWA 3U72A 3JZJA 1QJMA 5CMBA 4H5GA 5CBRA 4I62A 2XX7A 4IO3A 1SI1A 2ESNA 5L8DA 1D9VA 3QIMA 4JDFA 4R72A 4LZ5A 5AE4A 3RY3A 5I56B 4FIMA 3TCHA 5I58A 4UACA 1WODA 3HN0A 1R9QA 2I4CA 3IOVA 2DE3A 4I9DA 3PPPA 2I48A 1WDNA 1B1XA 1QULA 4R2FA 1TFDA 2I6EA 2GHBA 2QS1A 3FUZA 4GQOA 5H8FB 3UGWA 1LSTA 1OLAA 3PU5A 1NH7A 1WVJA 3H3GA 4OEUA 4KCCA 3K6VA 3CVGA 1Y4TA 1TWYA 2V93A 1B9JA 4BDRA 4M4GA 1VR5A 4GL0A 4U23A 1IXGA 2O7IA 2GRVA 3OO8A 2NWJA 4KQPA 2FNCA 5BUUA 5KZTA 3C31A 4H5FA 2UYFA 2I3VA 2RCAA 5DT6A 3K02A 4NF8B 3ILUB 4OMBA 5I84A 1R6ZA 1TT1A 4NE4A 2HAVA 2V3UA 1FCKA 1OIBA 2UVHA 4GF8A 3TUSA 1JVXA 3K6UA 1R1NA 5JK4A 3O97A 2XXRA 1ANFA 1MDP1 2G93A 3V83A 2Q9TA 2B3FA 1MXUA 4R9GA 3VV5A 3KZGA 1EH3A 2O68A 3IJOB 4BDLA 2O7UA 3FZVA 3MBPA 2Z22A 1SW1A 4ELOA 1B2HA 1MXXA 5AA4A 2HQ0A 4IO6A 3V5AA 3LUYA 3KN8A 3N6TA 1SD3A 4FE8A 3RLFE 4O3AA 2ONKE 1P1OA 4IY6A 2CZLA 3K6XA 1ZMGA 1B5IA 2O84X 4BDOA 1AIVA 3T9HB 4FATA 1LBCA 3GZGA 1SW2A 4OENA 4GRKA 2VGQA 1MH3A 4EQBA 5I59A 4QSDA 4ELPA 3UP9A 3MPKA 2UYEA 3GBBA 1GGGA 5DVIA 3G3JA 3PMVA 1MDQA 3T96B 3HPIA 4QRZA 3RN8A 3T93B 1URSA 3K6WA 3MUQA 3QUFA 1B0HA 1YPNA 1A55A 3MJNA 2I49A 1B58A 4JSOA 4DCXA 1FQDA 5I2KA 4I1DA 5HM4B 3T9UA 4QFPA 5JTYB 3TTNA 2XX9A 4NF6B 2HEUA 2XXPA 1GR2A 4Z7EA 5I2NA 3S9EA 1PB9A 3S2VA 1B1HA 1NKXA 2H25A 1FTMA 3E9XA 1B3LA 3OOAA 1MXWA 3TQWA 3KOSA 2I3WA 4OWDA 1B40A 5L9MA 3QXMA 3M3LA 2UXAA 1PBQA 3W15C 1JEUA 4EF1A 4JWXA 1GV8A 4EXKA 5LOMA 1SW5A 3E4RA 4RXLA 4G68B 4KYDA 4KHZE 3FATA 2PMSA 4TLLB 4R73A 3RTFB 4C1UA 2QPQA 3IB1A 3G3FA 3KSXA 4YICA 1QW0A 4KYSA 5AA3A 4QSEA 2XXVA 1MY0A 3E13X 4X48A 4G4PA 1QUJA 4X1BA 4F2QA 1GTKA 4U21A 1N04A 2V25A 1MS7A 4QHQA 5L9OA 1URGA 4DDDA 5K2YA 3LSLA 2VOZA 3RGYA 3FXRA 2QS2A 1PBPA 3G3GA 5H8HA 3BKIB 4ISUA 4EXLA 1MPDA 2QRYA 4EDPA 5CMMA 4OXVA 2X7PA 4ZZAA 2F34A 4JWOA 3I5OA 1QKBA 2HCAA 3IAZA 3MAMA 1BIYA 2PBWA 3CIJA 3KJ7A 1B7ZA 1P1WA 1LAHE 1EZOA 4GFRA 4PP0A 3PUZE 1DTGA 3O9PA 3E3KA 1Y20A 1MXZA 5I57A 3SEUA 5IAIA 1UIUA 1QUIA 3UK4A 1IITA 1JVYA 2DSFA 5ICQA 3KFMA 2I4BA 1POY1 4ZEDA 3TTLA 3C34A 1QKAA 3LSFB 4KCDA 1US5A 3KSJA 2DWJA 1MQHA 4ECFA 4G8HA 3JV9A 4LUBA 1MM7A 1XVXA 3TMGA 4KI0E 3FJMA 3IR1A 4TOZA 4EQ9A 2H4IA 5I58B 1M5FA 4ESXA 2ZYMA 2GH9A 3H6WA 5FTIA 1OQGA 1UTBA 4G68C 3BBRA 5H8QA 4HCYA 4OETA 4TQUQ 4NF4A 1FQAA 1POTA 1NH8A 4OFLA 5M2VA 5EHSA 3HHGA 5FTHA 4YKIA 2X26A 2OBGA 4KFQA 3VDFA 1T0KA 5AA2B 4YB5A 1MH4A 4R9FA 5TP9B 3CSBA 5AA1A 3VLUA 5TPAA 4PFUA 3KG2A 3TPAA 2RC9A 3H7MA 4FEBA 4HTGA 2DWAA 3KOTA 2Z8FA 3C4MA 2Z8EA 2H98A 2RC8A 3N6UA 4MFIA 4JXIA 4LQ2A 4QFKA 5IKBA 5ITPA 3D4GA 3SEXA 3TFLA 4GXSB 1A40A 2O1MA 4NF5A 4F1VA 2DP8A 4ZEIA 3MVZA 3EF7A 1QVSA 1ZKBA 5TU0A 4BLAA 3MZ1A 1S50A 3VVFA 4ZEBA 3F11A 3UIFA 3JYRA 1J1NA 1MQJA 1QUKA 3CFXA 1MQGA 5DEXA 3RT8A 4Q30B 3H6TA 1Z7ME 3K1MA 3T9VA 2P1SA 3IOUA 2E0SA 2O51A 1B3GA 4QFNA 2OJTA 4Z0IA 4NMYA 4H1XA 2E1SA 4OFJA 2IEEA 5F1QA 1DOTA 3CRBA 3O28A 3RNNA 5AA4B 1R9LA 3WAEA 5BWJA 5KDTB 3TELA 4F39A 3PUXE 3V89B 3O6IA 1HSJA 3KN3A 3OMBA 3K01A 4F3SA 2F5XA 2FA7A 5H8NA 3FASA 1FTJA 1SW4A 3ILTB 3HSTA 3G3HA 4DXUA 1FQCA 2I0CA 3T22A 3VXBA 1ZU0A 2UVJA 3S9LC 4E0XA 1D3KA 3KJTA 3LSXA 3U92A 3MP6A 2F7BA 5CRYA 1IEJA 4QF9A 2HZLA 3C36A 2R9JA 2UVIA 2VP1A 3M8UA 3R6UA 2D21A 1EZ9A 2OCUA 4N13A 4HW8A 3EHTA 1MRPA 3THIA 3SEYA 4KR5A 4U1ZA 3EHUA 3H06B 3IOWA 4RK2A 3DM0A 4JBZA 4OTEA 4ELRA 3SDFA 3SETA 1JETA 2QS4A 2ALUA 5A5XA 2RCBA 4BDQA 3FXQA 3IL1B 1B3HA 4GD5A 3SESA 2OWTA 1FTKA 4ZEFA 4KYEA 1A7LA 3K0VA 3FJ7A 4DXBA 2D5WA 4LATA 4N6PA 4DZ1A 2XD2A 5FHNA 1BLFA 1MXYA 1H44A 2XXXA 3PPOA 1Z7NE 4LZ7A 3DP6A 1D4NA 4IY5A 1B7HA 2VD3A 4GL8A 3KGCA 5CI5A 1I69A 1NNFA 2NOOA 2DXRA 2YPNA 3W9WA 3EQ1A 4XKQA 3AXFA 1IIWA 3DELB 3LC8A 5I56A 3MQ9A 4H6DA 3A09A 1OVBA 1Q1KA 4GVOA 4N07A 3U94A 4F3GA 3FD3A 3B6TA 1ELJA 1H3DA 3W9VA 4H65A 4FECA 2DS9A 3OENA 2H99A 4MBPA 3EN3A 2ZNTA 5H8HB 3RUMA 1SDXA 3TZAA 5B7DA 2XXIA 3FV2A 4POWA 3I6VA 4PFYA 1B5JA 2QS3A 1S7YA 1IXCA 4OESA 4YAHX 2A5TB 1O63A 1B7UA 4G77A 1TFAA 4THIA 3S9MC 1LLSA 2F36A 1XOCA 5J1DA 3TEPA 2OK2A 3CI8A 1PB8A 2F8DA 5I57B 1AMFA 3TCFA 4YKJA 3ONMA 1FQEA 4QSCA 2W7YA 5CM6A 3TAJA 3MZBA 3KEIA 3G7WA 5ITOA 3Q26A 1SVXB 1KWHA 4GWOA 4H0WA 2XXYA 2DE4A 2ANJA 2D3IA 4WKMA 2F7AA 4OZ9A 1HSLA 4MF3A 1TXFA 3QSLA 5CMCA 3IK6B 1H43A 1M5BA 3MVXA 1PC3A 2GFEA 3K00A 1LCFA 4JB7A 1LAXA 4NF4B 1Y1ZA 1RYXA 3VVDA 3MVWA 1B05A 3VFJA 1FQFA 3MZ9A 1XT8A 4XKNA 1M5CA 2DE2A 2GHAA 1L5TA 4E0WA 5ISUA 2XXQA 2BJJX 5DVJA 4U2RA 5KCJA 3H4ZA 4M1VA 1P1QA 5JEIA 3QAXA 4DIGA 2XX8A 1N7XA 1MY3A 1BP5A 2ZYNA 1VFEA 1AL3A 3B7DA 3IJXB 4OVJA 3GBAA 3CFLA 2V3TA 5L9SA 3H6VA 4F3BA 2AIXA 2QSXA 4U1OA 4IGTA 3A3CA 1IUDA 3RT6B 1DPPA 3FGSA 3IOTA 1FW0A 5H8SA 3G3KA 1IQ7A 1AH5A 4NF5B 3IB0A 1FQBA 4QFOA 1N0TA 3L6GA 1JEVA 3IO6A 4H8IA 2B3BA 3OXNA 3K1PA 5ICTA 1VFDA 1MY4A 3ZKLA 1OLCA 1LB9A 3PPNA 4RPOA 4IB2A 4NEDA 2Q89A 1DPEA 2Q2CA 3FJGA 2F97A 5DEXB 3H03A 3OO7A 2F6PA 3HO7A 1BKAA 4MLVA 4DLDA 1US4A 4YZZA 4GLIA 1IXHA 5FHOA 3OEMA 2Q2AA 1VSOA 3TODA 1F9BA 1Y3PA 2QMXA 5CC2A 1ZTYA 3CR9A 1MQIA 4I8CA 2HXWA 1A54A 1B3FA 1RKMA 2XXHA 3PD8A 3VLWA 2QJEA 3OELA 4RA1A 2G29A 3OSQA 5H8NB 2RF1A 3U93A 4X1DA 4YB6A 2HAUA 4ZZEA 3I3VA 3PV0E 3IB2A 1B3EA 4R2BA 2XHDA 2PYYA 1ZLQA 1B5HA 4U4XA 1H76A 4YMBA 4G8MA 1SYIA 2Z23A 3MVYA 1SYHA 3PMXA 1NNKA 1VE4A 3B6WA 1UTHA 1SBPA 2CMOA 3RPWA 3PUYE 4U4SA 3Q27A 3H6UA 2RINA 1OVTA 1JQFA 4WEPA 5ELVA 2DVZA 4NWCA 3RQTA 3D4CA 3V8XB 2QL3A 4OFOA 1B52A 5HBCA 4ZE9A 3O6GA 1N7WA 4EF2A 3C33A 1USYH 3OD7A 2O6AA 4GIZA 3MC2A 1H45A 4POXA 2FYIA 3PPQA 2O69A 1JW5A 2VHAA 4DCYA 1URDA 2V84A 4NTLA 2P0SA 3M3FA 4BDNA 4ZECA 1XS5A 4OYVA 2ONSA 3ZS6A 2A5SA 3MW0A 3USDA 5HPQA 3N26A 1D9YA 4H8JA 2DXYA 2KLFA 3PD9A 3LSWA 4R6YA 3MP8A 1NMUA 4LZ8A 3HHFA 1JNFA 4IO5A 3UORA 1I6QA 5I59B 1O7TA 4OERA 1ZBMA 4MH5A 1ZIUA 3TKDA 3O66A 2XXWA 3GLBA 2VD2A 4AQ4A 1OMPA 4U22A 4Q8RA 4PQJA 1A8FA 2I0BA 3IO4A 3OO6A 5AA2A 3ZSFA 3OSRA 4YU0A 4PETA 4F3PA 2ZYKA 4R6KA 1I6AA 2ABHA 1USYE 5TP9A 4MLQA 2R6GE 5EHMA 5I2KB 1B4HA 2Y7KA 4R74A 4Q5TA 2NXOA 3TQLA 4F18A 4G8NA 1AOVA 4IO7A 2IA4A 2THIA 3P7IA 1A99A 5I2NB 4G2ZA 1B46A 3R26A 2OZZA 1NNPA 3PPRA 1ATGA 1XHYA 4PE5B 4R75A 5AA2D 1LB8A 4ZDMA 4X9TA 4DXCA 1LGBC 3FVKA 1B0LA 3T9XB 2OWSA 4F29A 4EQ7A 2ZXTA 2YLNA 3A3UA 4TLMB 1LFIA 3R7XA 4ZS9A 4LVQA 3C9HA 1YCJA 3ZKKA 1ZJLA 2O1LA 3BFUA 4RYAA 3T66A 2PT1A 5CBSA 1PEBA 1MM6A 3UN6A 2F35A 3VVEA 2REJA 1I6BA 4L17A 4XTCQ 2AL4A 2H9BA 4K3FA 3EHSA 1MXVA 5KCJB 4NWDA 2NUVA 2DWIA 3U1OA 3O29A 2ZNUA 4HS7A 1FTLA 4P11A 5KDTA 3LBSA 3C32A 4F1YA 3QUJA 1BTJA 1UIVA 1PDAA 4ONYA 2F7CA 3K1NA 3Q25A 5H8FA 4RY1A 3IORA 3DP4A 3G3IA 1JW1A 2PX1A 4FAJA 4OQOA 4YB7A 1YAEA 3KN7A 3S9NC 2X7QA 2Q8JA 3GXAA 5DVFA 1A8EA 3TDJA 3ODBA 2Y7WA 1B51A 1FTOA 3KBRA 3VLVA 3FXUA 3DLNA 1Y1MA 2UVGA 3K2DA 4NF8A 3N94A 2AL5A 1B32A 2Y7PA 5F7VA 2R71A 3WAFA 3OEKA 4O3CA 1LFGA 3SEVA 2ZMBA 3SERA 3UA8A 5FHMA 1II5A 4F2OA 4LQ5A 1NL5A 4OEVA 2DYXA 2Y7RA 4KD5A 1P1NA 1UTBB 2HZKA 2LAOA 4RJZA 4XIGQ 5H8QB 1M5DA 2Z8DA 3C35A 4R6HA 1LBBA 1DMBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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