3MBPA

Maltodextrin-binding protein with bound maltotriose
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Extensive features of tight oligosaccharide binding revealed in high-resolution structures of the maltodextrin transport/chemosensory receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Periplasmic binding protein
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
total genus 127
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mbpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mbpA01
1LFHA 2I4BA 4OZ9A 4YKKA 4ESWA 3G3JA 4EXKA 5K2XA 3S9NC 3K4UA 3IOTA 1FW0A 2ONSA 4M4GA 5AA2A 5AE4A 5KCJA 1SW5A 3A3UA 2PYYA 4OYVA 1ZIUA 2PVUA 3C36A 4UA8A 3GLBA 1YPNA 1MY4A 1MPBA 2OWSA 1IXHA 2W7YA 1SDXA 3OO8A 4L17A 4OERA 1BKAA 2QMWA 4DCXA 3H03A 5FTIA 3S4UA 3O97A 1B7UA 1AL3A 3LC8A 5CI5A 3C9HA 2Y7PA 3KZGA 4I8CA 4N6PA 4PETA 1XS5A 1I6BA 4H1XA 2GFEA 1H76A 3KN3A 1QVSA 1NFTA 4NF8B 4RPNA 3EHUA 4ELOA 1MPDA 2Q8JA 3VV5A 4BDNA 3T22A 3N5LA 1URSA 4H0WA 4MFIA 3U93A 3FVKA 1MXVA 2DE4A 3EQ1A 1B7HA 2O6AA 1GGGA 2O7IA 4QSDA 3CG1A 2GH9A 2XXYA 4IO6A 4MH5A 5A5XB 2RC7A 1BP5A 3CIJA 3FVGA 3OOAA 2FA7A 3KN8A 3TELA 5I56A 3OELA 3SEYA 3K6WA 3O2AA 3VE1B 4DDDA 1OLCA 3BFUA 1M5CA 2O68A 2VD2A 3KOTA 5H8FA 2FNCA 4IO5A 3FV1A 1D9YA 3KBRA 3PUWE 4FORA 5I2KB 3S9LC 4RJZA 2XXTA 5CMKA 3IOUA 3K1PA 3N94A 1LAFE 1FQAA 3MVXA 3QAXA 4ZS9A 5FHNA 2RF1A 2H99A 4IB2A 4ZECA 5DYHA 5A5XA 2X7PA 3MPLA 2KLFA 4KYSA 4NF5B 5H8HA 3TAJA 3UIFA 1PBQA 4YICA 4YMAA 1R1NA 3OMBA 5DEXB 3T9XB 1H45A 5AA3A 1D9VA 2V3TA 3M3KA 3MPKA 4ZE9A 4NEDA 3IORA 3O6IA 4DXCA 3L6GA 1OQGA 3RT6B 5CBSA 2Q2AA 1UIVA 4G2ZA 1MPCA 4U1OA 3KN7A 2RINA 1WDNA 4GXSB 1NNTA 3MP6A 4LONB 1B3EA 1SI1A 3UP9A 4IY5A 1B46A 4NF8A 1EH3A 1XT8A 4RXLA 1R9QA 3SKPA 4GOTA 4FATA 3OO6A 4LA9A 5CRYA 4Q8RA 5AA2D 4HTGA 5ITOA 4DZ1A 3E3KA 3CG3A 3FGSA 3Q29A 1IIWA 4OQOA 1P1QA 3PD9A 2IA4A 4IO4A 3TYHA 3IAZA 4I62A 1MXUA 4ZZAA 3SERA 1FQBA 1EU8A 3FIRA 5H8NB 5CBRA 4NTLA 4F2QA 2D3IA 3TKDA 4F2OA 4LVQA 1LFGA 4OFOA 5EHMA 3RT8A 5I2NB 3K01A 3MUQA 3W9VA 5BWJA 2D21A 1QUJA 3IK6B 2DOJA 1SYIA 1DPEA 3CVGA 1SYHA 3IL1B 3Q25A 4H8IA 4I9DA 3MP1A 4F29A 5I2KA 2DS9A 2DVZA 3RTFB 1J1NA 1RKMA 4GRKA 3C32A 2QJEA 2O51A 2PBWA 2XXPA 1MQGA 3DM0A 1B2HA 2Q9TA 3IB1A 2O1MA 3PMVA 3K6XA 3HHFA 4QFOA 2ZXTA 3R7XA 1MY0A 4GWOA 5TPAA 3TTLA 1B3FA 1DPPA 1Q1KA 1LAGE 1CB6A 2OK2A 2V93A 3LUYA 3MC2A 3LBSA 3PUVE 4O3BA 3SDFA 2XX8A 5H8QB 5CMMA 2QS4A 2M8CA 5J1DA 4LQ2A 1PBPA 2XD3A 4ZEFA 5ELVA 1XOCA 2YLNA 5I58A 2Y84A 3PD8A 5CMBA 4Q5TA 1OQHA 4QSEA 1Y3QA 4JSOA 1HSLA 1I69A 1XHYA 2I4CA 4BDRA 3PMXA 4AB5A 4BDOA 2B3FA 4GL8A 4E0XA 3G3IA 3IOWA 1PDAA 1GR2A 1H43A 2RC9A 4YKJA 5JK4A 3QYTA 1B3HA 4HW8A 2F36A 3OO7A 3TODA 3LSXA 1OIBA 1JVYA 3K2DA 2AL4A 3MVWA 4JBZA 2NVUB 3VXBA 2UVIA 4LUBA 1JW5A 1B0LA 4OEVA 3D4GA 4F1YA 3M3LA 4DXBA 2DWIA 4BDLA 3FVOA 1HSJA 1TXFA 2AIXA 1LCFA 4PFUA 4MLQA 4H6DA 1A40A 4QFNA 3G3GA 1NH7A 1PB9A 2RC8A 3K00A 3L6HA 4YU0A 3Q28A 1MXYA 4LP2B 4F3BA 2P1SA 2ZYOA 4GIZA 3EHTA 3VLVA 5H8SA 1MQDA 2F7AA 1JNFA 3ONMA 3ZKLA 1B1XA 1MXXA 2V3UA 4IO7A 4ELQA 2XX7A 2Y7KA 2HQ0A 2X7QA 4R74A 4QHQA 4NWCA 2QSXA 2F6GA 1MXWA 1A55A 3WAEA 2Z22A 3C4MA 3TCHA 2ESNA 4LZ8A 5FHMA 3LR1A 4JWXA 3OD7A 1QKBA 5ITPA 1MXZA 2THIA 4HCWA 2GHAA 4FIMA 5ISUA 2CMOA 1LB8A 1N3WA 4N13A 3ILTB 1Y4CA 5EHSA 3KFMA 3TQLA 3PPQA 1AIVA 3U8QA 2XXVA 5TP9A 4YAHX 3G7WA 3UA8A 1CE2A 2B3BA 4EQBA 1IQ7A 2OLBA 5JEIA 3E4RA 2QL3A 4F3PA 1B3GA 3MQ9A 3OXNA 3FJGA 1FQFA 5H8FB 3KEIA 3OSRA 1FTJA 1LB9A 4O3CA 1FTKA 1L5TA 5KCJB 2IEEA 1ELJA 5EYFA 1B5IA 2O69A 5I57A 3QUJA 3UN6A 4U1ZA 1NNFA 4G8MA 3C31A 3UK4A 1QW0A 2UVHA 4ZE8A 4R75A 3FD3A 4ESXA 4X9TA 1Y9UA 1TFAA 1R9LA 1NKXA 2P2AA 4F3GA 3PGFA 3A09A 5KDTA 3R6UA 3TEPA 2V84A 1ZLQA 1B51A 3IJOB 4RA1A 2Y7RA 1B4ZA 3MWBA 5BUUA 4YKPA 3G3KA 1MDQA 2P0SA 3KG2A 4OVJA 4R2FA 2DP8A 2PX1A 2QMXA 2DWJA 4G4PA 4OETA 4R6YA 3A3CA 4F31B 2DYXA 1BLFA 5JTYA 2DXYA 4Q30B 2XHDA 3H6TA 4LATA 3DP8A 2X26A 5F1QA 4P11A 1PB7A 1MH4A 1NMUA 2E0SA 4YB6A 3SEVA 4THIA 4KCCA 2ZYKA 2XXWA 1US5A 2HZLA 2V25A 4U23A 1MQIA 5H8NA 3UGWA 2LAOA 1EZ9A 3B7DA 3T9HB 2AYSA 3H4ZA 3N26A 1B5HA 3UORA 4TOZA 3MZ1A 1LAXA 4H5FA 1O63A 4YMBA 1TWYA 1S9TA 1ZBMA 3QXMA 3USDA 4XXUA 2ZYMA 1LBBA 4YKIA 1USYE 2YJPA 3IX1A 2HFBA 4FJPA 4OHNA 1WODA 4F39A 2F7CA 3TQWA 5H8QA 4GF8A 2A5SA 4ZDMA 3ZKKA 4EDPA 3SETA 3VLUA 1II5A 4GFRA 4ZZEA 3U1OA 4BDMA 1US4A 3PPNA 4F22A 4XTCQ 3GBAA 3K02A 3RUMA 1SW1A 2F8DA 4OFLA 4H5GA 1SVXB 1JEVA 2ONRA 1B32A 1JQFA 2ALUA 3OENA 4GL0A 2D5WA 3PU5A 2GHBA 3DELB 1UTHB 1N0TA 3KSJA 2R9JA 1LSTA 4OENA 4HS7A 4F18A 3TCFA 2BJJX 1OMPA 2O1LA 3N6TA 4KYEA 1MM6A 1M5FA 4U21A 3FXUA 2G29A 3E13X 4IGRA 4PFWA 3ZSFA 4R6HA 1P1OA 3C34A 3VLWA 4OMBA 5I59B 4XKNA 3OSQA 2XD2A 4JWYA 1FQEA 3B6QA 4KCDA 1MRPA 4O3AA 3KGCA 1NL5A 4DIGA 2F6PA 3I6VA 1AMFA 3P7IA 1ZU0A 2HCAA 4K3FA 2VP1A 4DLDA 2NXOA 1XC1A 4G8HA 2QS2A 2DXRA 1N7WA 3RNNA 4G68A 4EF1A 1I6QA 1SI0A 5ICQA 2QRYA 4G68C 4XIGQ 4F1VA 2DVCA 3G3FA 1A54A 3C33A 5K2YA 1GV8A 3HPIA 4AQ4A 4C1UA 3V83A 1T0KA 2ZYNA 4ONYA 4DXUA 5L8DA 1B3LA 2I6EA 2Z8DA 4GQOA 1Y20A 2I0CA 2XXHA 3S2VA 4GLIA 4EUOA 3QSLA 4G68B 4PP0A 1MDP1 2RCAA 4Q0CA 2QPQA 2VOZA 1XVXA 1BIYA 1QUKA 2ANJA 1OVBA 3B6TA 3H06B 4LZ5A 1YCJA 1I6AA 2NUVA 1KWHA 5KZTA 2Z8EA 1A8FA 1FCKA 1LAHE 1P1NA 3TZAA 4OTEA 2O84X 4ISUA 2A5TB 4ECFA 3DLNA 3KJTA 4YB5A 2REJA 2Q2CA 5H8HB 1Y3NA 2XX9A 1LBCA 3IO6A 3FUZA 5DT6A 3EPEA 2DE2A 4JB7A 2G93A 1M5DA 3T93B 1N84A 2ZNUA 4MLVA 1UTHA 4ZEIA 4G77A 1MY3A 1LLSA 5HM4B 2Y7WA 3H3GA 1FTMA 1DMBA 2Q89A 1OLAA 3TTNA 3T9UA 4IGTA 1PC3A 4NF4B 4C0RA 3PUXE 3CFLA 5TP9B 1NNKA 3ZS6A 5I59A 1Y3PA 1LGBC 4R6KA 1S50A 3KSXA 2UYEA 1YAEA 3O9PA 4NF5A 5IAIA 1P99A 4M1VA 4KYDA 5CC2A 1EZPA 3H6WA 4G8NA 5F7VA 1P1UA 3HCQA 3MZBA 4RK9A 3IJXB 5CMCA 4ZEBA 1SQYA 5I57B 2I3WA 2XXXA 1MY1A 4OWDA 1VFEA 1UTBB 2QS3A 5ICTA 1ZKBA 2Z23A 3RY3A 1SW2A 1DOTA 4RPOA 1POY1 3HSTA 4PQJA 4MBPA 2F34A 4OFJA 4RYAA 4F19A 4NMYA 2UXAA 1XVYA 2I3VA 4I1DA 1TFDA 2CZLA 3ECRA 5DVJA 3U72A 3M8UA 4KFQA 4RK2A 1M5EA 4X48A 3TTRA 4ZEDA 2F5XA 5FHOA 1URDA 1Y1ZA 1UIUA 4FEDA 4ND9A 1N7XA 2HEUA 2OCUA 4H8JA 4R2BA 3RTWB 4FAJA 5HPQA 3C35A 4XKQA 1USYH 5JTYB 3SESA 1DTGA 1B05A 3K6UA 3O6HA 4YZZA 3O29A 4FEBA 4NF6B 3R26A 4JWOA 1POTA 3HN0A 3TFLA 1ATGA 3IO4A 2OJTA 4X1DA 3RQTA 2WKYA 1B1HA 1FTLA 3Q27A 1URGA 1N04A 1VR5A 4IO2A 4OESA 1D4NA 3FATA 1SBPA 4QF9A 4QFPA 3KJ7A 3VFJA 2OBGA 3QIMA 5CM6A 1IUDA 2DWHA 4WEPA 4EF2A 3LSLA 3VVFA 3IB2A 4NF6A 4ELRA 3CFXA 3O6GA 4KD5A 5HBCA 2VGQA 1AOVA 1JEUA 3MZ9A 3WAFA 3CR9A 1MQJA 1S7YA 1PB8A 2GRVA 1N76A 1AH5A 1D3KA 2XXUA 2HXWA 3OO9A 4NWDA 3V89B 3S9MC 4WEDA 1ZTYA 3LSWA 4TQUQ 1IITA 5L9OA 1Y4TA 4U2RA 3K0VA 4IY6A 2H4IA 2Y7IA 3DP4A 3JYRA 3O66A 1FTOA 4GXAA 4EQ7A 2I49A 1IZ1A 1IXIA 2H5YA 2VHAA 2YPNA 4U4XA 5DEXA 3JV9A 4KI0E 3TPAA 5KDTB 3H6VA 3TDJA 4DCYA 1JVXA 3RPWA 4U22A 1R6ZA 2HAUA 3FV2A 3I5OA 1SW4A 1IEJA 2R71A 1F9BA 2H9BA 3THIA 1ANFA 1BTJA 3V8XB 3VXCA 4F1UA 3FXRA 3K6VA 3EF7A 3MBPA 3PUZE 3CSBA 2ZNSA 2UYFA 4QSCA 2I48A 4WKMA 1SD3A 4R72A 2PT1A 2PMSA 2R6GE 2REGA 3N6UA 3TUSA 4OEUA 2XXIA 3MP8A 3T96B 1QUIA 1Y1MA 3FXQA 3TMGA 3K1MA 5B7DA 3MAMA 4EQ9A 2HAVA 1H3DA 3PPRA 4KR5A 1JW4A 2HZKA 1PEBA 3TCGA 2AL5A 1A7LA 2DE3A 3PPOA 4ELPA 1DSNA 1B58A 5L9MA 2UVJA 2Q88A 4DE8A 3H7MA 3PV0E 3B6WA 3RLFE 1IXGA 1JW1A 3GZGA 4HCYA 1VSOA 2OWTA 1MQHA 1NNPA 2FYIA 3BKIB 4FECA 4U4SA 4POXA 3RN8A 1A8EA 3BFTA 1MM7A 4FE8A 4RNSA 4PE5B 1B7ZA 3MW0A 5TPAB 2ONKE 3MVYA 3MJNA 4UACA 3IOVA 3U92A 1TT1A 3QK6A 3OEKA 3OEMA 4NE4A 3HO7A 4P0GA 5IKBA 3F11A 3T66A 1DTZA 3GBBA 3GXAA 4PFYA 1B0HA 1GTKA 1Z7NE 1RYOA 2H98A 2VD3A 2A5TA 5TU0A 3FASA 2NWJA 2E1SA 3FZVA 4JSDA 4ZEKA 3MVZA 3CRBA 4QFKA 4QRZA 1B40A 3O28A 1Q35A 3PPPA 1VE4A 5I58B 3VVDA 1LFIA 2XXRA 1N3XA 2ZNTA 3CSGA 1FQDA 3D4CA 1B5JA 2QS1A 3EHSA 3I3VA 3K1NA 4N07A 4OXVA 3V5AA 5LOMA 2ABHA 4R9GA 3QUFA 4GVOA 2F35A 3ILUB 4JDFA 3IR1A 1B52A 4BDQA 2PT2A 4H65A 3S9EA 1YTVA 3M3FA 1B6HA 4POWA 4TLLB 1IXCA 1B9JA 5I2NA 2O7UA 1HSEA 5AA2B 4KQPA 4TLMB 4Z0IA 4GD5A 1VFDA 3PUYE 4PFTA 2I58A 2Z8FA 3TTKA 4WXJA 1A99A 1OVTA 4C1TA 3U94A 1ZMGA 3T9VA 5DVFA 3Q26A 4XKPA 4QFLA 3PMWA 3FJMA 1UTBA 1QKAA 1Z7ME 1H44A 3H6UA 2XXQA 1LCTA 1O7TA 3G3HA 1RYXA 1O64A 2DWAA 2F7BA 1UQWA 1MY2A 3HHGA 2RKMA 3TTMA 1WVJA 3EN3A 3IB0A 5AA4B 2B65A 4E0WA 5I84A 2RCBA 2I0BA 2DSFA 4KHZE 1MH3A 5FTHA 4Z7EA 2H25A 3FJ7A 3ODBA 4H67A 4KPTA 3E9XA 4F3SA 4MF3A 4R73A 5AA1A 3SEXA 3DP6A 4NF4A 2V3QA 4LQ5A 4YB7A 4EXLA 3VVEA 3JZJA 5DVIA 1NH8A 3SEUA 3FVNA 3W15C 3CI8A 5AA4A 5I56B 4IO3A 2DQVA 1GVCA 1P1WA 3VDFA 3LSFB 1EZOA 4AB6A 1FQCA 4JXIA 3KOSA 4BLAA 4P0IA 1MS7A 1QULA 5M2VA 1ZJLA 2NOOA 3SEWA 3W9WA 1QJMA 4X1BA 1M5BA 5L9SA 4LZ7A 2ZMBA 3AXFA 2UVGA 3BBRA 3HV1A 3CFZA 4XKRA 5DTBA 2OZZA 1JETA 1B4HA 5B70A 2F78A 4R9FA 3RGYA 2F97A 4RY1A 1MG1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ESWA 3G3JA 5K2XA 4M4GA 1FW0A 3A3UA 2QVRA 4OYVA 4UA8A 3C36A 4F3SA 5DVIA 1LBXA 1SDXA 2WYKA 1BKAA 4F18A 5KDTA 3C9HA 4PETA 4DLDA 4PQJA 4HE2A 1I6BA 3KN3A 4PFRA 4MFIA 1MXVA 2DE4A 1GGGA 3CG1A 3CIJA 3OOAA 5I56A 5EYHA 3O2AA 2VD2A 2O68A 4IO5A 3FV1A 1LAFE 5FHNA 4ZS9A 4ZECA 2X7PA 1NV6A 4YMAA 5H8HA 1R1NA 3OMBA 2CEYA 5DEXB 1D9VA 3M3KA 4ZE9A 4NEDA 3FXBA 3RT6B 1FRPA 4AS5A 1MPCA 1FPFA 4GXSB 4LONB 1R9QA 4LA9A 5ITOA 3TYHA 1FPLA 1EU8A 5H8NB 1Q9DA 1LFGA 2D21A 3IK6B 4DXCA 4H8IA 2DVZA 2O51A 3R7XA 5TPAA 1IMBA 2QS4A 2XD3A 2Y84A 5CMBA 1HSLA 2I4CA 3PMXA 4AB5A 2B3FA 2RC9A 5JK4A 1B3HA 4HW8A 2F36A 1JVYA 3MVWA 2AL4A 4JBZA 4P1EA 4LUBA 1B0LA 3L6HA 4LP2B 2ZYOA 4GIZA 3VLVA 3RPLB 1MXXA 4ELQA 2V3UA 4IO7A 2XX7A 2HQ0A 3WAEA 2ESNA 5ITPA 1MXZA 4FIMA 1Y4CA 3TQLA 3KFMA 1AIVA 2XXVA 2B3BA 1NUYA 4F3PA 3OXNA 5H8FB 1FTJA 1LB9A 1L5TA 3CHGA 3QUJA 1IMDA 2UVHA 4ESXA 1R9LA 3PGFA 1IMAA 2P0SA 3KG2A 1BLFA 4Q30B 1YZ0A 2WBBA 4THIA 2ZYKA 3UGWA 2LAOA 3B7DA 3T9HB 3MZ1A 3QXMA 1ZBMA 2ZYMA 3RYDA 2HFBA 2WYPA 4GFRA 1NV5A 4O94A 4XTCQ 2F8DA 4OFLA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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