3MBPA

Maltodextrin-binding protein with bound maltotriose
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Extensive features of tight oligosaccharide binding revealed in high-resolution structures of the maltodextrin transport/chemosensory receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Periplasmic binding protein
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
total genus 127
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mbpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mbpA01
4F1UA 4WKMA 3MVWA 3PV0E 1A7LA 3PPNA 3FVKA 5HBCA 2RCAA 3T66A 4U23A 1MS7A 2RC9A 1URDA 3VV5A 3IO4A 4GF8A 5H8HA 3UGWA 4P0GA 4F3PA 3CSBA 3KSXA 2P2AA 3IJOB 4NWDA 4F1YA 3TAJA 1QJMA 4F19A 3GBBA 4R6HA 5F1QA 1XC1A 5ICTA 2PX1A 2PMSA 3F11A 4PFTA 3QIMA 1BKAA 3FXRA 3SKPA 2HQ0A 3N26A 5DVIA 4RK2A 4RXLA 4F18A 4FORA 1ZBMA 1IITA 4BLAA 3KOTA 4PETA 3B6WA 3MP6A 4X48A 1T0KA 4OFOA 3FGSA 4HCYA 4JDFA 1O63A 1ZIUA 2HXWA 3R7XA 2I0CA 1B05A 4KYDA 1MY0A 3C4MA 4XXUA 4F2OA 3OMBA 3ZKKA 3FVGA 4NF4B 1M5DA 1SBPA 4O3BA 3E3KA 3MVYA 4C0RA 4R72A 2F36A 2F35A 3TTNA 1II5A 1MG1A 4DIGA 1P1OA 3TPAA 5FHNA 2DQVA 3PUWE 2ZNTA 1JEVA 4RK9A 2AYSA 4QSCA 4O3CA 3RUMA 1LBCA 1B40A 1OIBA 2H5YA 1FTMA 5IKBA 1QKBA 2O69A 2AL5A 3PPPA 1PBPA 3T96B 3IOUA 4LATA 4R73A 3U1OA 3ZS6A 5TU0A 5CBSA 1ZKBA 2O51A 3HO7A 1MPCA 1MPBA 2ANJA 3KG2A 3U8QA 3UORA 3UP9A 4LQ5A 5KZTA 1B2HA 1QW0A 3O6IA 5I58B 2HZLA 1B46A 2PT2A 4MLQA 1JW1A 3MBPA 1CB6A 2DE2A 3O6HA 4N6PA 4H67A 3BFTA 4H6DA 1DTZA 1NH8A 2O84X 1JEUA 1VFDA 3BFUA 4BDMA 3T9XB 4GL8A 5I59B 4LZ7A 3O9PA 4OQOA 4QFLA 3V83A 3JV9A 2ZYKA 1DTGA 4OEUA 1H45A 2W7YA 1IEJA 3G3JA 2O68A 1AL3A 3OO8A 4I1DA 1NFTA 4UACA 4WEDA 3BBRA 3W9WA 5J1DA 3ONMA 2P0SA 2R6GE 5BWJA 1MH4A 4I9DA 5CC2A 2XXUA 4X9TA 2H99A 3PUZE 1QKAA 1WVJA 3RQTA 2OLBA 4Z7EA 4JBZA 3L6HA 2I0BA 3G3KA 1A54A 2P1SA 1NNTA 4F31B 1OLCA 1RKMA 3UK4A 4R9FA 4THIA 4DXBA 5EHSA 3H6TA 3CI8A 3IOWA 2GHBA 1FCKA 1IXCA 1DSNA 2F7BA 3IX1A 3K1MA 4H1XA 3C32A 4KD5A 1D3KA 1P1UA 1JNFA 1HSEA 1VR5A 1A8FA 1ZJLA 2REJA 4G8NA 4YKIA 3KJ7A 1ZTYA 3TTMA 3IJXB 2G93A 1FQAA 2NXOA 1US5A 4U1ZA 1MY2A 4QHQA 3FVNA 5CM6A 4GIZA 2G29A 3H06B 3K02A 1N84A 3CFLA 4JXIA 4RNSA 3RTFB 3RTWB 4XIGQ 1D9VA 3K00A 3OSQA 3HV1A 1YAEA 2A5TA 2RC7A 4GL0A 4LP2B 4OZ9A 1MPDA 5F7VA 1DMBA 4KYSA 1CE2A 4G2ZA 4O3AA 3FD3A 2REGA 1NNFA 3FV1A 4G68A 3TFLA 3GZGA 1FQCA 3SEVA 3PMXA 1JW4A 2A5SA 4IY6A 5L8DA 1MRPA 3KN3A 3R26A 3PGFA 3A3UA 3QUFA 3U92A 4AQ4A 2OCUA 1SI1A 5JTYA 2UVHA 2OJTA 4G77A 4DE8A 3LSXA 2D3IA 2QMXA 2RKMA 3CSGA 4OFJA 1N3XA 1TT1A 4OYVA 1IXIA 1QUIA 3IORA 3C35A 1Y20A 3T22A 3TYHA 1B52A 4FEDA 4TLLB 2H9BA 2OWSA 3SEWA 1VE4A 1MH3A 3CIJA 5ITOA 3QK6A 4NMYA 4YMBA 1Q35A 4GWOA 3LSLA 4WEPA 3LUYA 1MQJA 4XTCQ 5I2KB 2YLNA 3DP8A 4F39A 4ZEDA 1FQDA 1SW2A 3FIRA 1S9TA 4KPTA 4IGRA 2PVUA 4XKQA 2ONKE 1FQBA 2I6EA 1MDQA 5BUUA 4KHZE 1Q1KA 1P1QA 3IAZA 3K6VA 3OD7A 2B3FA 4FIMA 3SEXA 5KDTA 5M2VA 5AA2B 2RINA 5H8FB 3FUZA 1JQFA 4ELQA 3VVDA 4ZE9A 4ESXA 1FTJA 3VVEA 1P1NA 1LAXA 2F8DA 1SW4A 1B6HA 2DWHA 1IQ7A 2DS9A 4QFKA 1PC3A 3RPWA 3HSTA 1FTLA 4ZS9A 4H8IA 4LUBA 5FHOA 3V5AA 1S7YA 1MQHA 1NMUA 5I2NB 1USYH 3Q29A 1ZMGA 1Y1ZA 1IXHA 5DVJA 3CR9A 3OEMA 3MUQA 2XXQA 2THIA 3ODBA 4QFNA 2NWJA 3TCFA 1FW0A 3N6UA 4FE8A 2DOJA 3SERA 5HM4B 5ITPA 1WDNA 2QS2A 4P0IA 3TDJA 1B3GA 1MXWA 2ZNSA 1MY3A 2UVJA 3QXMA 4GOTA 4RYAA 1XS5A 3H6VA 3ECRA 4DLDA 3QAXA 2F6GA 2QJEA 5JTYB 2QRYA 2R71A 3TQLA 5A5XB 5CMMA 2I48A 5H8HB 1US4A 3CRBA 4GFRA 3ILTB 4P11A 1J1NA 1MXUA 2DYXA 4FJPA 2YJPA 4ZZAA 3SEYA 4EQ9A 3O2AA 2XXWA 4NF5A 3MPKA 3OO9A 3MVZA 2ESNA 1A99A 4H0WA 2UYEA 4OESA 1I6QA 3R6UA 3THIA 1EZPA 3IOTA 1Y4TA 1URGA 4XKPA 4F2QA 5L9OA 1QUJA 1LB8A 5H8NA 1LAHE 2QS4A 3EQ1A 4G8HA 4ECFA 3GXAA 3ZKLA 4MFIA 4F3GA 4DCYA 3E9XA 3O66A 4TQUQ 1AOVA 3EPEA 1LCFA 3TKDA 3IOVA 1XVYA 1H3DA 4NF8A 3JZJA 4NF6A 5H8QA 1KWHA 2XXPA 3V8XB 4HW8A 4YKKA 5FTIA 2ALUA 4F22A 3CG3A 2H98A 2Q9TA 3VLWA 3H6UA 5B70A 4EUOA 2AL4A 2XX9A 1EH3A 5TPAB 5AA2D 1LBBA 4Q8RA 4ZEBA 1Y1MA 5JEIA 3U94A 1B3HA 3FASA 4ELPA 2VD3A 1N7WA 3E4RA 1NNPA 2ZYMA 1ZLQA 3Q25A 4GQOA 1JETA 2XXRA 4OTEA 3VLUA 3IL1B 3RNNA 3T9VA 3O29A 4XKNA 5EYFA 1A8EA 2ONRA 1YCJA 2Q89A 2OK2A 4H65A 5AE4A 2Q8JA 1L5TA 3O6GA 4ONYA 2DXRA 4LA9A 4TOZA 5I57B 3IB1A 1AIVA 3IB0A 3LR1A 1UQWA 3IR1A 3TQWA 2XX7A 1B3LA 4OMBA 3CFZA 4PQJA 3FJ7A 3IB2A 4K3FA 3HCQA 1IIWA 1OVTA 3MZ1A 4EXKA 4JB7A 1PB7A 2V25A 4NF4A 2RC8A 3RGYA 3FVOA 4JSDA 3ZSFA 5H8FA 1I6BA 1EU8A 4G68C 4LZ8A 5K2XA 3TCGA 2O7IA 3M3KA 4GRKA 1Y4CA 3H4ZA 2F7AA 2H4IA 3AXFA 4ESWA 3S9LC 1IZ1A 1DPEA 3O97A 2LAOA 1EZOA 3OOAA 2VOZA 4RJZA 3QUJA 5JK4A 2B3BA 2NUVA 1GR2A 4ZEKA 2ZNUA 1D9YA 3KEIA 1AH5A 1M5BA 3SESA 1F9BA 4F29A 3KSJA 1LFHA 4DXUA 1MXXA 1IUDA 4KFQA 2XX8A 3K6XA 5TPAA 2R9JA 1Y3NA 2IEEA 3PMVA 4M1VA 4Q5TA 2NVUB 3V89B 1Y9UA 2OZZA 2DP8A 3M8UA 3MPLA 1ELJA 2Y7RA 1B0HA 2FA7A 3PU5A 1XT8A 3Q26A 2O6AA 1IXGA 2XXYA 3MWBA 4Q30B 4I62A 4KCDA 5FHMA 3VFJA 4BDRA 1ZU0A 2OWTA 3FV2A 2DXYA 2V3TA 2I4CA 3MJNA 4OENA 3H3GA 3QYTA 4GLIA 4YKPA 3TEPA 2DSFA 1B51A 1B1HA 1FQFA 1ATGA 4YKJA 1LAFE 1B58A 5AA4A 2QS1A 4YB6A 4IO6A 2DE3A 2KLFA 1PEBA 3OO7A 4FEBA 4U4XA 4X1DA 1FQEA 5I58A 1XHYA 4EXLA 1N76A 3DP4A 3RN8A 3VDFA 1JVYA 1B4ZA 3FXUA 3K6WA 4ZZEA 2F7CA 4JSOA 3UIFA 1POY1 4Z0IA 2Z23A 3VXBA 3D4GA 4YAHX 5CMCA 1EZ9A 5ELVA 1R9QA 1NKXA 3VLVA 2HEUA 2QS3A 3B6TA 2O1MA 4ZE8A 2VP1A 1M5EA 3I6VA 2NOOA 3VXCA 5DVFA 1R1NA 3FXQA 4H8JA 4QFPA 4R75A 3U72A 4OETA 5DEXB 5I84A 3I5OA 1MDP1 4IO3A 3K1NA 2HCAA 3N94A 1AMFA 4ISUA 2DVCA 2HAUA 1LSTA 4ZEIA 2ZXTA 1YTVA 3MP8A 5CRYA 4E0WA 1N7XA 4NWCA 5I2KA 2XXHA 4ND9A 4PFWA 2AIXA 5CMBA 3CFXA 5LOMA 5L9MA 4OFLA 2ZYOA 3HPIA 1Y3QA 5AA4B 1FTKA 2ZMBA 4NF8B 4F3SA 4GD5A 4IO4A 1OQGA 4PE5B 4R74A 3T9UA 5I2NA 1B3EA 1OMPA 1QULA 2VD2A 3A3CA 4PP0A 1LLSA 3VVFA 4OERA 3DP6A 3MW0A 5HPQA 2Z22A 4EF2A 2HAVA 5DEXA 1MQDA 3KGCA 4GXAA 3DELB 3KN7A 4IO2A 1URSA 3BKIB 3G3HA 4LVQA 1Z7ME 4DDDA 4EQBA 4R6YA 3MAMA 1MXVA 3FJMA 3PPQA 4FECA 4Q0CA 3IK6B 1R6ZA 3W9VA 2F97A 4ELRA 4YU0A 3USDA 5I59A 4U1OA 5IAIA 1GVCA 2XXXA 4KYEA 5DT6A 3DM0A 1TFAA 1UTHB 1MM6A 2UYFA 2XHDA 4M4GA 3SEUA 4E0XA 1LCTA 3QSLA 2B65A 3WAEA 5A5XA 3PUXE 3G3IA 4FAJA 2FNCA 2OBGA 4TLMB 2D21A 3OEKA 1VFEA 2F6PA 1SQYA 3OENA 3MZBA 5CMKA 2Q2CA 4RPOA 2Y7IA 1UIVA 3CG1A 3HHFA 4NEDA 4PFUA 1B32A 1LFGA 4YMAA 3KBRA 1B3FA 2M8CA 2RCBA 4IO7A 1B9JA 3DLNA 2F78A 4HS7A 2QMWA 2IA4A 3I3VA 5ICQA 1M5FA 1UTHA 2PYYA 4ELOA 4MF3A 3PUVE 3H6WA 1B5HA 1B0LA 2I3VA 3S4UA 3LSFB 4BDNA 1I69A 2VHAA 1PBQA 4MH5A 4N13A 3EN3A 4QF9A 5TP9A 3U93A 5AA3A 4NTLA 4JWOA 2QPQA 1NL5A 4POXA 4AB5A 1I6AA 3W15C 4BDOA 4OVJA 2CMOA 3RY3A 2VGQA 1XVXA 5KCJA 1RYOA 4KI0E 1GTKA 1USYE 1R9LA 3B7DA 3C9HA 1B5JA 4UA8A 3RT8A 2CZLA 2Q2AA 1JVXA 3PPRA 1VSOA 1GV8A 1B7UA 2H25A 2DWAA 3EHUA 3KZGA 4JWXA 4OXVA 4YZZA 3OXNA 3TCHA 3UN6A 2XD2A 5K2YA 3TUSA 4NF6B 3G3GA 5H8QB 3TZAA 3N5LA 3K01A 3TTKA 1LAGE 4RPNA 3K1PA 4EQ7A 4X1BA 5L9SA 1D4NA 1NH7A 4LQ2A 3Q28A 1DPPA 1A55A 4R2BA 4ZEFA 3SETA 3TTLA 4AB6A 3S9EA 2X26A 1ANFA 2UVGA 4MBPA 1B7ZA 2D5WA 4KR5A 2V3QA 4DCXA 2PT1A 5I56B 4R2FA 1O7TA 3M3LA 3MP1A 3G7WA 4OEVA 4JWYA 1LB9A 3FATA 1MQIA 2V84A 1MQGA 1B4HA 3GBAA 3P7IA 3PD9A 1TXFA 2Y7PA 1SI0A 5DTBA 3G3FA 2GRVA 2F34A 3KN8A 4F3BA 3TMGA 5I57A 1BP5A 1H44A 1Y3PA 1B1XA 1BTJA 1SD3A 3Q27A 4L17A 3UA8A 3S2VA 3VE1B 5CBRA 3K0VA 3L6GA 1SVXB 3E13X 3EF7A 5H8SA 4DZ1A 3B6QA 1H43A 1BIYA 3MC2A 1QUKA 3ILUB 3N6TA 3OO6A 3RT6B 1MY1A 2V3UA 3K2DA 3FZVA 2DE4A 4IGTA 1POTA 1DOTA 4GVOA 4QSDA 4R9GA 4ZDMA 1UIUA 3HN0A 4G68B 1MM7A 3MZ9A 1N3WA 3O28A 4G4PA 3LSWA 3CVGA 4EF1A 1BLFA 2I58A 2I4BA 3OSRA 5EHMA 1PB8A 4C1UA 1FTOA 1XOCA 2Q88A 4WXJA 1N04A 4QSEA 5CI5A 2Z8DA 3KFMA 1B5IA 3PPOA 4PFYA 3GLBA 1HSLA 2Y7WA 1MY4A 1OLAA 3FJGA 3H7MA 5KDTB 5B7DA 2XD3A 1HSJA 4MLVA 4H5GA 3JYRA 4IY5A 4U4SA 3TODA 4N07A 4U22A 4RY1A 1WODA 2XXIA 3S9MC 5ISUA 3S9NC 1SDXA 3EHTA 2Z8FA 4IO5A 1NNKA 4POWA 4NF5B 1S50A 5AA2A 3H03A 3MVXA 5H8NB 4H5FA 4U2RA 2UXAA 5I56A 3PMWA 3PUYE 3RLFE 4IB2A 3EHSA 1Z7NE 2FYIA 1H76A 2GH9A 3T93B 2X7QA 2ONSA 3A09A 4KQPA 2QL3A 1P1WA 2V93A 1LFIA 2PBWA 1TWYA 2HFBA 4LONB 4I8CA 1UTBA 4YB7A 3T9HB 2YPNA 4HCWA 4GXSB 3WAFA 4OHNA 4C1TA 2O1LA 4F1VA 4DXCA 2E0SA 3MQ9A 2Z8EA 3IO6A 2GFEA 2ZYNA 1OQHA 3HHGA 1SYIA 1TFDA 2DWIA 2HZKA 2E1SA 2UVIA 1SW1A 3LC8A 2Y7KA 4LZ5A 4U21A 1LGBC 4BDQA 5KCJB 3K4UA 2BJJX 1GGGA 1OVBA 1RYXA 2A5TB 1QVSA 2RF1A 3KOSA 3C34A 1N0TA 1PB9A 2QSXA 2XXVA 3KJTA 4OWDA 5TP9B 4G8MA 3D4CA 3M3FA 2DWJA 4FATA 1P99A 2F5XA 3LBSA 4QFOA 4KCCA 5AA1A 4RA1A 1O64A 3PD8A 2WKYA 3SDFA 1B7HA 5DYHA 1UTBB 1PDAA 4R6KA 4YICA 2Y84A 1JW5A 1MXYA 1MXZA 3TELA 4BDLA 4YB5A 1SYHA 3C36A 4ZECA 2GHAA 1M5CA 3OELA 4EDPA 2I3WA 1YPNA 1SW5A 5FTHA 2X7PA 4QRZA 4NE4A 3C33A 4XKRA 2O7UA 3K6UA 2ABHA 2XXTA 3TTRA 3C31A 4HTGA 2DVZA 1A40A 2I49A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UABA 3PV0E 4U23A 4GF8A 5H8HA 3UGWA 4F3PA 1NV0A 2P2AA 3GBBA 4R6HA 2PMSA 3F11A 3N26A 4RK2A 2XWIA 4F18A 4FORA 2QVUA 3KOTA 1T0KA 4NHBA 1FPLA 1ZIUA 3B8BA 4GWZA 3OMBA 4NF4B 2F35A 1II5A 1KZ8A 3TPAA 5FHNA 4QSCA 1LBCA 1B40A 2H5YA 1FTMA 3U1OA 1MPBA 4OVTA 3U8QA 5EQ9A 4LQ5A 4MNCA 1B46A 4MLQA 4H6DA 2O84X 1VFDA 4OQOA 1DTGA 3G3JA 4WEDA 3BBRA 2P0SA 2R6GE 1MH4A 2XXUA 4X9TA 3PUZE 1WVJA 3FBPA 4R9FA 2F3BA 4DXBA 5EHSA 3IOWA 1DSNA 4KD5A 2FIXA 1HSEA 1VR5A 1A8FA 4G8NA 3TTMA 3IJXB 1FQAA 4PBHA 1US5A 3FVNA 5I7IA 2A5TA 2RC7A 1DMBA 4G2ZA 4O8MA 4GBWA 3GZGA 1FQCA 4IY6A 5L8DA 3U92A 3A3UA 2UVHA 4DE8A 2D3IA 2QMXA 1N3XA 1TT1A 3HFUA 1QUIA 5FBPA 1Y20A 3TYHA 3SEWA 5IZ3A 1LBYA 4YMBA 2YLNA 4F39A 2PVUA 1FBFA 2ONKE 1FQBA 4XKQA 1MDQA 1Q1KA 3SEXA 3K6VA 5AA2B 3IFCA 4N6KA 4MIJA 1FRPA 2XWOA 3RPWA 4I3YA 4ZS9A 1NMUA 1USYH 1ZMGA 2KQZA 3CR9A 2THIA 4JVCA 3ODBA 4QFNA 5HM4B 1FW0A 5ITPA 1WDNA 4DLDA 2UVJA 1RDYA 3ECRA 2QJEA 1FBPA 5A5XB 5CMMA 5H8HB 1US4A 1J1NA 2DYXA 2YJPA 4ZZAA 2ESNA 1Y4TA 4XF5A 1LB8A 4F3GA 2ZZVA 4TQUQ 1LCFA 4GWUA 5H8QA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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