3ME7A

Crystal structure of putative electron transport protein aq_2194 from aquifex aeolicus vf5
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
169
structure length
169
Chain Sequence
SLGTYVPGDITLVDSYGNEFQLKNLKGKPIILSPIYTHCRAACPLITKSLLKVIPKLGTPGKDFWVITFTFDPKDTLEDIKRFQKEYGIDGKGWKVVKAKTSEDLFKLLDAIDFRFMTAGNDFIHPNVVVVLSPELQIKDYIYGVNYNYLEFVNALRLARGEGHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Aquifex aeolicus
publication title Crystal structure of putative electron transport protein aq_2194 from Aquifex aeolicus VF5
rcsb
molecule keywords Putative uncharacterized protein
total genus 53
structure length 169
sequence length 169
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3me7A00
1J08A 1XOBA 1F2EA 4GSTA 3E3EA 5CRHA 1THOA 4TKYA 3KTLA 2ALBA 4MDCA 4PQIA 5JCGA 4PX1A 1A8YA 3IAM2 5FHIA 5IO2A 2C4JA 3GUSA 3A2VA 2IPAA 2VIMA 4ZIJA 4N11A 2LNTA 5CREA 2A4VA 4EO3A 3D4TA 4MZWA 1WRYA 3ERFA 1XWAA 5ECMB 3VLNA 2O85A 1F3BA 1T7PB 4O92A 3U5RE 1S3DA 2CA8A 3M8NA 3D21A 1WOUA 3HKRA 1EGOA 1JFUA 1GWCA 2H73A 2F51A 4DSRA 3BOAA 2O7KA 2E7PA 1GULA 1SU9A 2LUSA 1W89A 2MMAA 4O32A 2NTOA 4XHMA 4OO5A 1G7OA 5DQSA 4HZ4A 1MD3A 4F03A 1PX6A 3DMLA 5JWRB 2H1DA 1LJRA 2YZUA 1O8WA 1SENA 3HJPA 4F9ZA 1A2JA 1FVKA 3HVSA 4POKA 4MCUA 1ERTA 4HS1A 4FYCA 3E9JB 16GSA 1ZCPA 3BBYA 3ME7A 5G2ZA 2AB6A 4BWQA 4J56E 2VLTA 2LS5A 1MDJA 2MYGA 4IBPA 5E59A 4CW9A 4YQMA 2VO4A 1AW9A 5ECRB 4HQZA 2MZCA 2C0EA 1F37A 4FYBA 1GSYA 4EXJA 3IRAA 1XZOA 2OKAA 4KDYA 3GRXA 2L59A 4V2LA 1BAYA 1DBYA 1OKDA 5HFKA 1GL8A 2AHEA 1E6BA 22GSA 2FY6A 4Q5QA 3LFLA 1H4OA 4V2NA 5ID2A 4X43A 4HI7A 1OE8A 1XW5A 5IMAA 5D9TA 3IC4A 1WMJA 1WPIA 4H86A 8GSSA 1Z3EA 4J2FA 3UAPA 5G5EA 4O5RA 1A0RP 3HJOA 3KM6A 4ZB9A 1X5DA 3EU4A 4DEJA 1VGLA 1EZKA 4NV5A 2IMFA 3HZ4A 2QC7A 2OJLA 2M46A 2RLIA 1AC1A 1YKAA 1XWKA 2VD0A 1PN9A 3LQ7A 2FWHA 2K18A 3N5OA 4MMMA 1K0NA 2VD1A 3QAVA 1Z7RA 3UOMA 3WD6A 4OWYA 2VM2A 4X0XA 4EUYA 2HRFA 5AN1A 3UEMA 3F3RA 5DBQA 4XRDA 3WGEA 3GKNA 1SJ6A 3GL3A 2ZNMA 1SL2B 1G6WA 4D73A 4GTUA 4BWSA 4XS6A 2GT6A 5L71A 3IXRA 1XXUA 3VURA 3KIJA 1XCCA 3MSZA 2B7JA 2L5LA 1LU4A 4IJIA 1C72A 1OAZA 3C1SA 3TRQA 2RUFA 1HD2A 2JSYA 1NHYA 2X8GA 1GSSA 3GX8A 4IN0A 2RM5A 3DWVA 2E2MA 4I8BA 1PQNA 4GLTA 2OA7A 1JHBA 3D5JA 1AAZA 4IQAA 3UL3A 4BPYA 5D73A 2B3SA 1EV9A 5AIVA 3EE2A 4WETA 2H1GA 4TXOA 2DMMA 1FHEA 4E8HA 4MH2A 4YAVA 2FA8A 1X0RA 1ZOFA 2GVPA 4IW9A 4I2UA 2AJQB 2YWNA 1KNGA 1PRXA 2FD3A 3DIEA 2RM6A 1V98A 2VCWA 2XHFA 2REMA 2HSHA 2VCZA 4RI6A 2N5FA 5IOXA 3HA9A 5DALA 3W8SA 1ERVA 1FAAA 3QAGA 1YZXA 2L6DA 3EYTA 1VF1A 3DVWA 2B1KA 5CP1A 3TKPA 6GSVA 2H0HA 2V41A 3ZFBA 1M99A 1CQGA 2WDUA 5IMDA 2X8CA 5J3RA 1BQ7A 3LG6A 5G5FA 3MAKA 3LYPA 3ME8A 4OD7A 1WWJA 2K6VA 2I4AA 3TJFA 2VCTA 2GS3A 1AQVA 4K7NA 5C04A 3ZVJD 2IN3A 1TRVA 2CV4A 4KH7A 3VPQA 3TJBA 5HR1A 1FB0A 3ZL5A 2F3MA 1ZGNA 2MMNA 3LGCA 5B7CA 3P8WA 3J7Yb 2VL2A 3CBUA 3UVHA 3L9VA 4TRXA 4BVYA 5J5NA 5ECLB 4Q5RA 5DCHA 2K9FA 4ULXA 3W6GA 1ERUA 4D73B 2WCIA 3HHVA 5EY6A 2J9HA 2ON5A 1Q4JA 2H76A 2I1UA 5ECIB 3UBKA 2WJUA 4K0GA 1HNCA 4PUFC 3FEUA 1OC8A 2XPEA 5F06A 5F07A 2KUCA 3KMOA 3Q19A 3SWLA 3GSSA 1X5EA 4K2DA 4KCAA 3HVVA 2LRNA 1PKWA 1B48A 1ACVA 1FG4A 1PX7A 3FRCA 1GSUA 5EPFA 2H6YA 1GUMA 5ELGA 2GDRA 5DDLA 2V32A 1JZOA 2X64A 4OFNA 4KDXA 1ERWA 2B7KA 2PVQA 4YQUA 3EC3A 5G31A 4NV2A 1XWGA 2LRTA 4ECIA 4OMVA 6GSYA 2YJ7A 5GAND 3CYNA 4MJCA 3RPPA 1U6TA 2G2QA 2H8LA 5H5SA 3J7Yk 3NOFA 3VI5A 1S3CA 4TR0A 1NW2A 3I6AA 1EGRA 4ZL7A 4MF5A 1EEMA 4WF4A 3ERWA 2CVBA 4FYUA 2IMDA 1JZRA 2FGXA 3A3TA 1AQXA 3Q6OA 2PVOC 3D22A 1K3LA 2ES7A 3HZ8A 1EWXA 3H4KA 1PL2A 3BCKA 1UN2A 4JR6A 2LNSA 2C3NA 2HFDA 5HR3A 2YZHA 3LEFA 5JWQB 1FVJA 1OC3A 1EOHA 1JZWA 1B4PA 4FH8A 2OACA 1SD8A 1U87A 4XRAA 2GSQA 3EWLA 4KNDA 1K3OA 1OC9B 4KSOA 5GZZB 1TJDA 2H75A 1ST9A 3TKRA 1A0FA 1O8XA 1QK8A 3TOUA 1TK8B 5LNKe 4OFMA 1AQWA 4O7HA 1SJIA 1RW1A 2YWIA 2GZYA 1QGVA 4PXOA 4GXZA 3F63A 3HYPA 4QQ7A 1ON4A 2C8UA 3ZMKA 5CRDA 5KN3A 1GSFA 3DGQA 4E8EA 2GGTA 3TDGA 4N30A 1QXHA 4OCEA 3QAWA 1OE7A 3BJ5A 2IMEA 2LSTA 2IMKA 3A5WA 5ECOB 2C0GA 2VL2C 3HXSA 3M3MA 5A4VA 3PINA 3HCZA 2LJKA 1TRUA 2YP6A 4I97A 2HT9A 3EU3A 5G1LA 1GLQA 1S3AA 1Z9HA 3IDVA 4J57E 4KE3A 3GTUA 3M0FA 2V6KA 4QL9A 4RQRA 1R5PA 2L5OA 4JRRA 1FB6A 3ISOA 1VRSD 1O6JA 2IIYA 3TOTA 3EMXA 3APSA 3D4MA 3C71A 1T00A 2H71A 4TXVA 4MA9A 1SK0A 4MLYA 5ELAA 3TGZA 1YJ6A 4ZBDA 2MMOA 3IK7A 2XC2A 4FIWA 3FKFA 5DJMA 2YWMA 2HYXA 4KA0A 4DSSA 2YJHA 2R3XA 4EF0A 1I5GA 4GSNA 14GSA 1SK1A 1A24A 1CQHA 1WE0A 2KLXA 4LMVA 3FYGA 4IHUA 3C73A 2WZ9A 3QMXA 3QPMA 3P7XA 4F82A 2LEGA 5EL8A 2FNOA 2IFQB 3HD5A 4IKHA 1QFNA 5IOWA 3RBTA 2CAIA 2ZCTA 6GSWA 3IV4A 5IPHA 2QSIA 3GV1A 1K0DA 2GZPA 3VWVA 1T4ZA 3GURA 2HNLA 2VLUA 1HQOA 1PSQA 2CVDA 5INYA 2JU5A 3L78A 4EKZA 3F9UA 2YV9A 4TR1B 3VWWA 2NBSA 2PGTA 3DXBA 2IMIA 3FR3A 1K0BA 1PGTA 3F0IA 1T8EB 3CMIA 2RUEA 4EVMA 1GP1A 1GLPA 1V40A 1AIUA 2LKUA 3I43A 3VFIA 4N0VA 3V1WA 2GTUA 3DEXA 2C3QA 5F05A 1KBNA 1XFLA 4HUAA 1JLWA 1M9BA 2WFCA 3VWXA 3ZIVA 4GRFA 1QQ2A 1SJZA 3UIWA 4ECCA 2CX3A 3BD2A 2HSYA 2YN1A 2K8VA 3DRNA 1MDIA 2GQKA 1M9AA 2DC5A 3ZRDA 3FR6A 3TRXA 1YEPA 2M72A 3GN3A 4FO5A 3GIXA 4RUVA 1SKRB 1VF3A 3GTUB 3DKSA 1ZZYA 4LLRA 4Q5NA 4LA1A 1Z7PA 4IGJA 4PURA 5E4WA 2JACA 4ML6A 1SKSB 1R4WA 5JCWA 5D8IA 3M1GA 4JEDA 3KGKA 1EP8A 1USBA 4L0UA 4XS1A 2CZ2A 4G9HA 5A5KA 5G1KA 2V1MA 4G2EA 4K1FA 4KDUA 4IELA 2CZ3A 4ECJA 2FHEA 3CTGA 5CNWA 3UJ1A 3ZITA 4ILFA 1KTEA 1DE1A 3L9SA 3L4NA 3O76A 1A2MA 1TRWA 3KMNA 4AJ6A 4HU9A 3ZVJA 5H5QA 2H0IA 2L4CA 2MBSA 3W8JA 2EIRA 5HFGA 1Z6NA 1Z5YE 3F4SA 1G6YA 13GSA 1J0FA 2XBQA 3RAZA 4X1UA 2DIZA 1K0CA 1T1VA 4L5OA 2YNXA 3FHKA 3S9FA 2GSTA 2LJRA 3D6IA 3VK9A 1B8XA 3TUEA 2V2GA 2Z9SA 2GSSA 2AV4A 4POBA 3OR5A 3ZYWA 3K8NA 2HZEA 3FZ5A 11GSA 2LJAA 5LD0A 4IP1A 1VF2A 2N5BA 4I6XA 3QFBC 1X9SB 3G7JA 4MH3A 1URMA 1F6MC 2VCVA 3QCPA 2NVLA 2FUG2 2WS2A 1RK4A 2VL3A 5IMZA 5D9WA 4XTSA 5IQYA 4K6XA 3DVXA 1G7EA 3KH7A 5COHA 5ID2B 1Y6EA 3P2AA 1Z6MA 4IP6A 1TOFA 1GNWA 4N0ZA 3PR8A 1U88A 3TB2A 3IOSA 3DD3A 2F8AA 3GH6A 2JZTA 5IO0A 2I3YA 1Y25A 1X9WB 1XOAA 5CRWA 2VAFA 3CRUA 3HDCA 1THXA 4AJ7A 2C0FA 1O73A 3RPNA 1F9MA 2LV3A 2H66A 1SD9A 4YH2A 1V57A 4ML1A 3GKMA 1HNBA 1T4YA 3MWHA 5J41A 4L8EA 5DAKA 5ABRA 4JR4A 1QUWA 3F4RA 4MPFA 3H93A 4WF5A 3C7MA 1B9YC 2M80A 4PQ1A 4MZBA 1T3BA 1XPVA 2JL4A 3WYWA 5EVOA 3WGXA 2B6MA 4JU5A 2C3TA 1YF1A 4ISDA 3TRPA 2K8SA 2I81A 4DSQA 4XS4A 1M2DA 5JCUA 2X99A 3F3QA 4MK3A 1SL1B 3M9KA 4P3YB 2O89A 2R2JA 1MD4A 3GA4A 4EC0A 1PA3A 3GKXA 3A2WA 3R2QA 2HZEB 2H70A 3KJYA 4GF0A 3P90A 2DJJA 2DMLA 3N9JA 1BYEA 2PWJA 5ECSA 4AGSA 1K0MA 3EMPA 4TXOB 6GSXA 17GSA 1OKTA 3VI7A 2WGRA 18GSA 3H8QA 2VCQA 3KP9A 3RHCA 9GSSA 1FO5A 4IS0A 2P5QA 1DSBA 4N10A 4K9ZA 4KX4A 2NDOA 1PMTA 1UA5A 4MP4A 3MNGA 5DALB 3MDKA 1WIKA 3Q74A 1IYHA 1BJXA 1V2AA 1EP7A 4XIHA 4WKWA 1K0OA 1OVNA 2YWOA 4KUNA 4GQCA 2AAWA 1B9XC 2YV7A 1N8JA 2DJ3A 1ABAA 1K3YA 1PKZA 2DJKA 4HDEA 3TKSA 3TJKA 2HLSA 4EDYA 5B8AA 3ZMLA 3WT1A 4WBRD 2FLSA 2B5XA 2BMXA 1R7HA 4DVCA 4KGIA 4OCFA 2FWEA 3GH9A 2H74A 2FWGA 1WP0A 2MBTA 1A2LA 3G9BA 2C80A 1O7UA 1JZDA 3PGTA 1G0TA 4HZ2A 4JE1A 3KZQA 4WXTA 3GKKA 5ECQB 5ECNB 1FW1A 1GUKA 1XVWA 3CSJA 1PL1A 1SKWB 3G7IA 3C8EA 2H1BA 2OE3A 5IMFA 2KP1A 2EC4A 2A2SA 4OFTA 1GTBA 2OADA 5AIXA 1IYIA 4I2TA 3LXZA 3KCMA 2VCXA 1XBSA 1DUGA 5D9VA 1SK2A 3EURA 3UBLA 5AISA 1BEDA 2E0QA 4RI7A 5A4WA 2L6CA 4ZL9A 1YF0A 3AY8A 2JZSA 5B6NA 1SL0B 4POMA 3GX0A 3TCOA 2HXKA 4GQFA 1B4QA 3IE3A 2CT6A 1UC7A 1E2YA 5IIZA 1EV4A 3IHQA 4BVXA 2CAQA 3ZIJA 2CQ9A 2CX4A 2H6ZA 1TTZA 3US3A 4HQSA 20GSA 3NZNA 3TJJA 4K7IA 1ZYEA 4YAPA 4JZQA 2PN8A 3L9UA 3QFAC 3ZZXA 1GNEA 4TN8A 3CRTA 3M9JA 4WR5A 2V6OA 1GUHA 2HRNA 5HQPA 2TRCP 3QOUA 1N2AA 5J9BA 3ED3A 4LL1B 4NHZA 1GTAA 1TI3A 5B6MA 4MPGA 4XCSA 1GH2A 4G10A 3DYRA 3KTBA 1XWBA 3GYKA 3KH9A 3NIVA 3FZ9A 4WR4A 2R5GA 3UMAA 4L0WA 1O85A 3SBCA 3ZREA 5FT3A 3HY2A 4V1Ag 1GSDA 5F0GA 1MEKA 2C1YA 4TR4A 4MABA 3A2XA 2VLVA 4NMUA 3IR4A 3APOA 4HU7A 2H0GA 1TDIA 4ZBBA 1BG5A 3LYKA 3TKSC 4EL1A 5J9CA 2DIYA 1ML6A 3HVXA 4HEA2 4TVEA 5DCGA 3LSZA 2GT5A 1YY7A 2R6KA 3HJMA 1XIYA 1XWCA 5B8BA 1QMVA 6GSTA 2OBKA 2RIIA 1HYUA 3KD0A 5IMCA 2LQQA 2MMZA 4GCIA 3UARA 2PMTA 4MF7A 4V1Ap 3LJRA 4F2IA 5ECHB 6GSUA 4Z7XA 5J4UA 3CTFA 2GSRA 5D93A 1R26A 2YPMA 2LQOA 2AUVA 1NM3A 1NSWA 1U3AA 1VF4A 2N5AA 4ZB8A 3O3TA 2XBIA 1KEBA 1TK5B 4DSSB 2PU9C 4ECBA 3TJGA 3F6DA 2F8FA 3GNJA 2HE3A 2GZZA 4HJMA 1PD21 4ZXGA 4EDZA 4ID0A 2R4VA 1UVZA 2VL9A 3IAS2 3VPTA 2WULA 4EE0A 5CAXA 1V9WA 2O8VB 4KSMA 1GTIA 4PGTA 5C00A 1LBKA 4LMWA 1GTUA 3FZAA 6GSSA 1RQMA 2LTKA 4NWYA 1XVQA 4ACSA 4ZBAA 2H1AA 5IPGA 1NHOA 3F4TA 4PUAA 2B5YA 3Q18A 1TXXA 3CSHA 1M2AA 10GSA 1TU8A 2WB9A 3TKSE 3GHAA 1TRSA 4NHWA 2O87A 2DSAA 2XPDA 2JZRA 4AF2A 5KEJA 2VM1A 3RHBA 2GLRA 3WT2A 3ERGA 2BTOT 4G19A 3FZ4A 1ILOA 4KB3A 2FA4A 3GMFA 2KHPA 4YQVA 3EVIA 5DJLA 3JCML 3L0HA 2EIOA 2B1LA 2FCHA 4KAEA 2PUKC 4IQ1A 5ECKB 5HR2A 4MJAA 2YANA 2EIQA 4Q5FA 5KN0A 2PERA 3LWAA 1H75A 4HJ2A 1O81A 1YKCA 4POLA 2WRTA 2TRXA 4RQXA 3C1RA 4GSSA 2OBIA 1OYJA 4HOJA 3O6TA 2P31A 1ZYQB 1DE2A 1V58A 5ENUA 4KCEA 4MJEA 4LL4B 3CSIA 3BCIA 3I69A 3QR6A 1A23A 4TR3A 2E2GA 5A4UA 1J9BA 2X8HA 4K7OA 2G0FA 1AUCA 2D2ZA 5H5RA 3FY7A 4JBBA 2DJ0A 2L4QA 3PH9A 2H01A 3APQA 3FW2A 3IBHA 1K0AA 4K8MA 3ZLPA 5G30A 1YEXA 3EINA 3FK8A 1OC9A 2HI7A 3CXGA 3LXTA 4ZB6A 2A2RA 2KOKA 1YDKA 1JLVA 4NAXA 3IPZA 4NPBA 1A8LA 3D0ZA 2KP2A 2B5EA 2NPBA 2QKEA 4CHSA 2IWTA 4ZILA 3LORA 1MTCA 1F3AA 3H1NA 4L5LA 2IJYA 3IK9A 5IM9A 1MDKA 4K0NA 1TU7A 1WJKA 4GWRA 2PBJA 4CDOA 3GL5A 5AGYA 4PNGA 3RDWA 1YQ1A 2FWFA 1TI1A 4ZL8A 4MZCA 5CYYA 3TKQA 2IL3A 4MF6A 3FR9A 2ZUPA 1M0UA 2YCDA 1TKDB 1X5CA 4BL7A 3F8UA 1ZMAA 3G7YA 4WEYA 1TK0B 2DJ1A 2H30A 5DVBA 3KXOA 5GSTA 3KEBA 2LRCA 1SYRA 2BJXA 4MJBA 4PQHA 2H19A 2PPTA 2JSZA 1EEJA 19GSA 1M7TA 2H6XA 4F0BA 5ECPB 3QD9A 5LCZA 1U3IA 2J23A 3VWUA 5IMVA 5CRGA 4OO4A 1GRXA 1I9DA 1FOVA 5JWOB 2QGVA 2OE1A 1SYXA 5D96A 2C0DA 3U6VA 2AYTA 5DAKB 4PNFA 5D9XA 3F6FA 2F9SA 4F0CA 4IVFA 2GQMA 4V2MA 1BX9A 2P5RA 3UVTA 1GSEA 3ZTLA 1ZL9A 3GSTA 3H79A 5CO3A 2R37A 5GAPD 2P0GA 2DJ2A 5DQYA 3KP8A 4QL7A 4AJ8A 1HNAA 2IFQA 2I9HA 2H72A 5HFIA 3IA1A 4I5QA 1XW6A 1X9MB 2DLXA 1EOGA 5HR0A 5KN1A 4XS4B 3I9V2 1R5AA 12GSA 5F8BA 5KN2A 2GQLA 1AXDA 4NXIA 2TIRA 2YOIA 3QDNA 2VOCA 5FWGA 3E0UA 3ZFLA 1XW9A 1TW9A 1W4VA 4TR1A 2L57A 1TP9A 2VUPA 4WBJA 3WGDA 4TOPA 2JADA 4BA7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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