3ME8A

Crystal structure of putative electron transfer protein aq_2194 from aquifex aeolicus vf5
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
169
structure length
169
Chain Sequence
SLGTYVPGDITLVDSYGNEFQLKNLKGKPIILSPIYTHCRAACPLITKSLLKVIPKLGTPGKDFWVITFTFDPKDTLEDIKRFQKEYGIDGKGWKVVKAKTSEDLFKLLDAIDFRFMTAGNDFIHPNVVVVLSPELQIKDYIYGVNYNYLEFVNALRLARGEGHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of putative electron transfer protein aq_2194 from Aquifex aeolicus VF5
rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Aquifex aeolicus
molecule keywords Putative uncharacterized protein
total genus 52
structure length 169
sequence length 169
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3me8A00
2KP2A 2VL2C 3AY8A 2JSZA 4PNFA 1EV4A 2HZEB 2MMAA 3TKSA 4ZL9A 2K8SA 2VLVA 1ZL9A 4KCAA 1Z9HA 5IM9A 3ZIJA 3MWHA 2BJXA 4MA9A 3SWLA 2H01A 4JRRA 4CHSA 3D5JA 3VI7A 3QD9A 2PWJA 1WRYA 4MZBA 4V2LA 5AISA 4IJIA 1GSFA 2ON7A 1YF0A 2VM1A 3GV1A 3DEXA 3IK9A 3A3TA 3FR9A 5ECHB 4MLYA 4XS1A 4ZL8A 1J08A 4BL7A 3TJBA 2VL2A 5E59A 1G7OA 4F0CA 2L5LA 5KN2A 1G6YA 4Q5NA 4MK3A 2E7PA 1G0TA 3DWVA 1XIYA 3PINA 4ID0A 3CSIA 4OD7A 4E8EA 2H0IA 4RI6A 3ERWA 4POLA 5A5KA 1XW6A 1YY7A 3VPTA 1AQXA 5DALA 4ZXGA 1AUCA 3FZ5A 4ULXA 3VWWA 2H1BA 5AGYA 3G7JA 1OC8A 3M9JA 1DUGA 5ID2A 4PURA 1K0CA 3TOTA 1OE7A 2MBTA 2L4CA 4GQFA 3D21A 5J4UA 2QGVA 1GH2A 4TXOB 3GX8A 3DYRA 3LFLA 1SD9A 2PBJA 1JFUA 3KXOA 2H71A 2KOKA 2V1MA 2CZ2A 3C7MA 1FVKA 2XPEA 3H4KA 1TDIA 4GLTA 2XHFA 1TP9A 4I2TA 5A4UA 2GTUA 1XXUA 3GH9A 4PXOA 1M9AA 3QFAC 2CX4A 2IPAA 1XCCA 4K1FA 3GH6A 1XVWA 2MYGA 3ME7A 4EDYA 4N30A 2FA8A 5IMDA 2MMNA 4QL9A 2GZZA 3IRAA 4EKZA 4RQRA 2N5BA 1PX6A 1ML6A 4KA0A 4KW6A 3EU3A 2OBKA 1ZOFA 4K6XA 2B3SA 4HDEA 1AC1A 2R2JA 3GKKA 2O89A 3GKNA 1X0RA 1K3YA 3LQ7A 3UL3A 1QMVA 5DAKB 1FVJA 2IFQA 1G7EA 3A2VA 4MF7A 3UIWA 3EMPA 3LGCA 1AQVA 2KHPA 4EL1A 2E2GA 4HQZA 2A4VA 4EDZA 2IMDA 4MP4A 3S9FA 6GSUA 4K9ZA 2HE3A 4ECCA 4ECBA 4TOPA 16GSA 4FYUA 4LL4B 1TKDB 2X8GA 5DVBA 5G30A 4ACSA 1BEDA 5C04A 2P5QA 3ZVJD 3CTFA 4Q5RA 2HI7A 3TKSE 2AHEA 1OKDA 4L0WA 5IOWA 2LS5A 2D2ZA 4TR4A 4K0GA 4O5RA 3TRQA 2I1UA 2GT6A 3WT1A 2JZRA 5ECOB 1X9SB 5FT3A 4XIHA 1XOAA 2X8CA 2DLXA 1SK1A 1PL1A 1Z7PA 2MMOA 2N5AA 4KDUA 4BA7A 1GNWA 1BG5A 3RAZA 1K0BA 2IMFA 2B1LA 3H8QA 1T7PB 3LXZA 3DVXA 5IQYA 1OC9A 4AJ6A 1NHOA 1WPIA 3RBTA 4HJ2A 4I6XA 3PR8A 1XWAA 3HVXA 3KTLA 4ECJA 3FYGA 3RHBA 4NPBA 4TXOA 4DSSB 3QAVA 2VD0A 5D96A 2HNLA 2HSHA 5GAND 2YWNA 1V58A 5IMCA 1GLPA 2JZTA 2H72A 3FZ4A 2WDUA 2CAQA 17GSA 3ZFLA 2VIMA 4MJEA 3ZMKA 1DSBA 1O6JA 2JL4A 5IO2A 5B6MA 3EMXA 1F37A 5F06A 1JZDA 3FW2A 2V6OA 1TRSA 3KP8A 3N9JA 1M99A 3ZMLA 1OVNA 1WP0A 3Q19A 18GSA 4PQIA 2WFCA 1PX7A 2JZSA 3TKRA 4XRAA 1EOGA 1MDKA 2P0GA 1TOFA 2CA8A 2RUFA 3HJOA 1XWBA 1J0FA 2DBCA 1JZWA 3DVWA 4TR0A 4F82A 4OFTA 4F0BA 2H0GA 3IDVA 3VLNA 2AJQB 1SU9A 1ABAA 4YAVA 1A8LA 1TI3A 4DEJA 2FLSA 2H73A 2YNXA 2HLSA 3VFIA 1TTZA 1ZYQB 2H30A 3EVIA 1GTAA 3P7XA 2H0HA 5EY6A 2EIOA 1XFLA 4IS0A 3BCKA 1X9WB 1PL2A 2OE3A 4YQMA 3F9UA 4TR1B 2HRNA 1BX9A 3GFKA 1XWGA 4EVMA 3D4MA 4KUNA 3HZ4A 4PQ1A 2PERA 1GRXA 5ECKB 1XPVA 1FHEA 3LXTA 2V32A 1F3AA 2OJLA 1USBA 5DQSA 2WB9A 4IJ3A 4Q5FA 3W8JA 4D73A 2R3XA 1U87A 3HCZA 3ME8A 1IYHA 4HI7A 5FHIA 3ERFA 1GTUA 3H1NA 4HOJA 3Q18A 5LD0A 3RHCA 4JE1A 2GQMA 3HZ8A 5JWOB 1TJDA 2CVBA 3I69A 4L5LA 2MZCA 4KSOA 2GQKA 4AJ8A 2FY6A 3CXGA 2DIZA 4WF4A 3C73A 1W4VA 5DJLA 1B8XA 1DBYA 2TRCP 5ECLB 5ECSA 3FRCA 1JHBA 2G2QA 5DJMA 4E8HA 3NOFA 2YPMA 4ISDA 2B5XA 3W6GA 3M0FA 3GTUA 2VAFA 4N10A 1FB0A 3F3RA 4KSMA 4L0UA 4I5QA 4F2IA 5CO3A 4KAEA 3VPQA 2VL9A 3D4TA 1PKWA 2CT6A 2NTOA 4ZIJA 1TK5B 4GQCA 2V2GA 1G6WA 1V9WA 4JBBA 3IAM2 8GSSA 2NBSA 2VLTA 1YQ1A 2YCDA 1AW9A 4EF0A 1B9YC 4QQ7A 2FWFA 3MAKA 3TRPA 1VRSD 5B8BA 3W8SA 3ZREA 2GLRA 4NMUA 2M46A 2X64A 2BTOT 2DJ0A 1HD2A 4P3YB 3L78A 4ILFA 4V2NA 1PMTA 4Z7XA 3ZZXA 2XPDA 1UN2A 2RLIA 2HT9A 2VCXA 1RQMA 1Y6EA 3VURA 3P90A 1PKZA 5KN1A 1QK8A 1UA5A 2GSQA 2IN3A 4POMA 1GNEA 1ZMAA 2G0FA 3IBHA 2PMTA 3EWLA 3LG6A 5CRGA 1NHYA 1ST9A 2ZUPA 4IP1A 3LORA 3HJMA 4WBRD 2F8AA 4XS4A 4POBA 1XWKA 4O32A 2VLUA 3O6TA 2C0DA 4G10A 5ECMB 5GSTA 1PGTA 4BVYA 2YANA 2DMMA 2P5RA 1NW2A 1VF3A 3ZITA 2OADA 1HNBA 1OAZA 4FO5A 5ECQB 1UVZA 1WMJA 2CVDA 2V41A 1LBKA 3DD3A 3EINA 4IELA 3UARA 2QSIA 5A4WA 2B7KA 2H6ZA 3LYPA 1ZGNA 5LNKe 1RW1A 5ENUA 2LRTA 2GZPA 4L5OA 2OE1A 3FK8A 1TRUA 3LWAA 3GURA 1SL1B 4HUAA 4MH3A 5AN1A 5G31A 1PN9A 1V2AA 3M9KA 2H70A 2Z9SA 3KH7A 2L5OA 1I5GA 4IN0A 1GSEA 5COHA 2YZUA 5DQYA 2OKAA 1AXDA 4EUYA 4GSNA 3DIEA 5E4WA 5IPGA 2ES7A 4V1Ag 1X5EA 6GSTA 2WCIA 4IKHA 3PGTA 1S3CA 1IYIA 1GULA 2DJKA 1BQ7A 4WETA 2C80A 2GSRA 3FHKA 4MZCA 3CTGA 3GNJA 4K7OA 4KDXA 5IMVA 5GAPD 2R5GA 4O92A 4HZ4A 2LJKA 4IGJA 4CDOA 3IC4A 3P8WA 3HJPA 5HR3A 3D6IA 1GSSA 3KH9A 1ON4A 3GKMA 3HKRA 2CAIA 5IO0A 4MPGA 5DCGA 2YV7A 5ECPB 3TKQA 2NVLA 1TI1A 3LSZA 2KP1A 1OKTA 6GSVA 1R4WA 2OBIA 4WR5A 2C0GA 5G2ZA 3APSA 2HZEA 1BYEA 5HQPA 3KZQA 1SD8A 3H93A 4ZB6A 19GSA 1SKRB 2H6XA 3I6AA 3D22A 3GUSA 3QOUA 2A2RA 5J9CA 3KTBA 1O73A 5AIXA 3KP9A 2H66A 3KJYA 1XWCA 2VO4A 4AJ7A 4ZILA 3GKXA 5GSSA 1A8YA 1SJZA 1WOUA 2VOCA 1LU4A 2P31A 2R4VA 2DJ2A 3A2XA 1Y25A 3R2QA 4GXZA 4N0ZA 2RIIA 2L6CA 2AB6A 5CRDA 2GDRA 2FUG2 4MF6A 3TUEA 2EC4A 3WT2A 2YOIA 2B1KA 3WGDA 2HSYA 3TJKA 3IPZA 3FKFA 4MJCA 1MD3A 2L57A 4AF2A 3FZAA 1LJRA 1GTBA 2HYXA 2H1AA 4GCIA 2YWOA 1FAAA 4JEDA 3IR4A 1X5CA 5J9BA 2LUSA 2RM6A 3I43A 3KD0A 4MPFA 4MJAA 4HQSA 1F6MC 1HQOA 5L71A 2A2SA 4WEYA 1XOBA 3PH9A 4WBJA 4YAPA 3UEMA 1KBNA 1T1VA 2KUCA 2YP6A 4ZL7A 2OACA 2OE0A 1C72A 2C4JA 6GSYA 2IJYA 1GSQA 2VD1A 3CMIA 3GSTA 2LJAA 5JWRB 2XBIA 5J5NA 2L59A 5LCZA 2F51A 12GSA 1A0RP 2PGTA 2GS3A 3WGEA 4GSTA 4I2UA 3C8EA 4EXJA 3TKPA 4K7NA 4ML6A 2K8VA 2CQ9A 3F63A 2C1YA 5J3RA 1T8EB 2YZHA 3HYPA 4XHMA 1JZRA 5H5SA 5JCUA 3WGXA 1B9XC 3VI5A 4ML1A 2C8UA 1YEXA 3KGKA 5GZZB 5AIVA 3HD5A 1TXXA 3UMAA 3F3QA 4PUFC 4JR6A 3IOSA 1R7HA 3TCOA 4OO5A 4MF5A 2LTKA 4X43A 7GSSA 3K8NA 2IMEA 4I97A 2LJRA 2LV3A 5IMZA 1FB6A 2F9SA 5DAKA 2M72A 2F3MA 4NWYA 2K9FA 4G2EA 1KEBA 4ZBAA 5ELAA 1V57A 2RM5A 1XBSA 3KMNA 4L8EA 1SKWB 1VF1A 1VF2A 2NPBA 3A2WA 2GGTA 4IHUA 2E0QA 2ZNMA 4TR3A 2XC2A 3TGZA 4IQAA 2AV4A 2GSTA 2JACA 2LNTA 4MDCA 1ACVA 1EEMA 3O3TA 5KN3A 5G1LA 1A2JA 2OA7A 4WKWA 2VM2A 4KDYA 4IP6A 2ZCTA 3L0HA 2TIRA 1ZYEA 1GP1A 5F0GA 3HHVA 4BWSA 3ED3A 3GIXA 4NHZA 1OE8A 3ZYWA 1SK0A 3L4NA 4IVFA 3BOAA 2FA4A 5ECNB 4ECIA 3OR5A 3NZNA 5G5EA 4LA1A 2VCTA 3CSJA 3CSHA 1V40A 3ZTLA 3BBYA 2LEGA 4OCEA 1JLWA 3L9UA 4DSSA 3KEBA 2JU5A 2YWMA 5HFGA 3F4RA 2MMZA 1FOVA 1DE2A 1QQ2A 20GSA 2RUEA 3F4TA 2TRXA 5J41A 1S3DA 4HS1A 2VCWA 4HU9A 2PU9C 5ECIB 4HZ2A 4ZB9A 2IL3A 6GSXA 4OO4A 13GSA 2WGRA 3Q74A 4EO3A 3KM6A 4NV2A 4BVXA 1ZCPA 2FWHA 4IQ1A 1PRXA 2FHEA 4MABA 5D9VA 4HJMA 4QL7A 4MZWA 5KN0A 3N5OA 2LQQA 3MSZA 4GRFA 3LYKA 3C71A 1M2DA 3F8UA 1E2YA 3G7IA 4K2DA 1GTIA 3F6DA 3ZLPA 5DALB 3E0UA 2GQLA 4CW9A 1I9DA 2LRNA 1SKSB 1EP8A 4OMVA 3EE2A 3TKSC 1Z6NA 1TW9A 4DVCA 5ID2B 2F8FA 22GSA 2J23A 4ZB8A 2VL3A 2YN1A 4X0XA 4TKYA 3TOUA 5IOXA 1WIKA 5HR0A 2QC7A 1EV9A 2FWEA 5D9TA 1MEKA 4TR1A 2HZFA 2R37A 4K8MA 1U6TA 2H76A 1XZOA 4G9HA 3CYNA 5EL8A 3QAWA 2C0FA 3ISOA 3G9BA 2AAWA 1SK2A 4IBPA 1PQNA 1ERTA 2YWIA 2EIQA 2LRCA 1CQGA 3GN3A 2C3NA 2XBQA 5CAXA 3EC3A 1F2EA 2DC5A 1MTCA 4O7HA 4NXIA 1PSQA 3UOMA 4I8BA 3RPPA 1W89A 1O81A 4HU7A 2PVOC 3IAS2 1K0AA 2JADA 2IWTA 1A2LA 1OC3A 4NV5A 2AUVA 3FZ9A 5FWGA 3M1GA 1F9MA 4TVEA 2H6YA 3GX0A 4WR4A 1GSUA 1O8XA 4OFMA 3IXRA 1M7TA 4WF5A 4TN8A 1Z7RA 5G1KA 1URMA 2CVKA 2IFQB 1THXA 1X9MB 2WZ9A 5F07A 1SL0B 2CX3A 3UBLA 4HEA2 4XTSA 2L6DA 1TK0B 1A2MA 1T4YA 3GYKA 3UJ1A 1GUHA 3GRXA 4N11A 1A0FA 3VWUA 1S3AA 4TRXA 4GSSA 1A24A 1UC7A 3I9V2 4GF0A 4FYBA 4XRDA 4OCFA 1YKAA 2CV4A 4J2FA 1K3OA 3UBKA 5H5RA 1XW5A 4PX1A 1MD4A 1T4ZA 1YKCA 5DCHA 2V6KA 3U5RE 1OC9B 5ELGA 1QFNA 2K18A 5EPFA 2VCQA 3Q6OA 2JSYA 1MDIA 5D93A 1HYUA 1DE1A 5D9XA 3CBUA 3IE3A 1PA3A 3O76A 2CZ3A 1PD21 4V1Ap 1SJ6A 3KIJA 4WXTA 3TJJA 4IW9A 2R6KA 1U3AA 5JWQB 3J7Yb 1TRVA 3D0ZA 5H5QA 1R5PA 4G19A 3QDNA 5IMFA 4XCSA 3RPNA 2FD3A 1WE0A 1FO5A 1WWJA 3APQA 1FG4A 4LMVA 3M3MA 2O7KA 1J9BA 5JCGA 2O85A 1GSYA 3KMOA 5B6NA 3QAGA 2I4AA 3FR6A 3GL5A 4YQVA 3TDGA 3DXBA 2PN8A 1SYRA 2ON5A 3MDKA 5ECRB 3SBCA 2B6MA 3FEUA 3P2AA 2PVQA 2DJ3A 3DMLA 3ZIVA 4MMMA 1YZXA 3JCML 1H4OA 3TJGA 4RQXA 2O87A 3TJFA 1X5DA 4F03A 3VK9A 1SJIA 3UAPA 3UVHA 2DJ1A 3FY7A 2GVPA 3FR3A 3IV4A 2LNSA 1Z5YE 2PUKC 2MBSA 1U3IA 3ZL5A 1EWXA 3MNGA 5A4VA 1U88A 4PGTA 3VWVA 3GSSA 2GSSA 1QUWA 1BJXA 4DSRA 2FGXA 5CP1A 2M80A 2PPTA 5C00A 5CNWA 2WS2A 5KEJA 2B5EA 2VUPA 1TRWA 1B48A 3M8NA 4POKA 3E3EA 2H8LA 4FIWA 1OYJA 1K0DA 2C3TA 2X99A 4LLRA 2WJUA 2QKEA 4XS6A 4OWYA 2IMKA 3E9JB 4D73B 3F6FA 1ERWA 3U6VA 3IA1A 4YH2A 1JZOA 2EIRA 3L9SA 4J56E 3CRTA 1M9BA 3RDWA 4MCUA 1Q98A 2YV9A 3QR6A 3HY2A 5D8IA 2C0EA 4ZBBA 5HR2A 5EVOA 1O8WA 1MDJA 3NIVA 1RK4A 1QGVA 1V98A 1YEPA 1ZZYA 1EZKA 5DBQA 1YJ6A 4BPYA 3GMFA 5F8BA 2H1GA 2I3YA 1GLQA 5CREA 2L4QA 1T00A 1B4QA 4MJBA 1GL8A 1O85A 6GSSA 5IPHA 9GSSA 1M2AA 4PQHA 3GTUB 1EP7A 1TU7A 2VCZA 4NHWA 4RI7A 4Q5QA 2B7JA 2H75A 2HXKA 3GA4A 2DJJA 2FWGA 3G7YA 1AQWA 11GSA 1K0OA 3KCMA 3HVSA 3ZVJA 3ERGA 3C1SA 4LL1B 4TW5A 4N0VA 3UVTA 1N8JA 4GTUA 3LJRA 1K0NA 2H19A 5HR1A 1JLVA 4EE0A 3APOA 3IK7A 3US3A 1ERVA 3BJ5A 1Q4JA 3J7Yk 4FYCA 3DRNA 2BMXA 2I81A 2FNOA 1HNAA 3HDCA 5CYYA 4K7IA 4YQUA 2DMLA 3BCIA 3F4SA 1GUKA 4V2MA 2E2MA 1EEJA 4KNDA 5DDLA 4KE3A 3ZFBA 1VGLA 2YJ7A 4PUAA 1TU8A 2K6VA 3L9VA 2NDOA 2LQOA 2GT5A 3H79A 2HFDA 4JU5A 3QPMA 2YJHA 3BD2A 2X8HA 1FW1A 3EYTA 1ILOA 2B5YA 5JCWA 1R26A 1T3BA 4LMWA 2J9HA 4PNGA 2H1DA 1K0MA 2LSTA 4BWQA 5IMAA 2FCHA 1KNGA 1Z3EA 2O8VB 3HVVA 1E6BA 4RUVA 2GZYA 2N5FA 1ERUA 5HFIA 4XS4B 5CRHA 3QFBC 3EU4A 1YF1A 1VF4A 3TB2A 1TK8B 4AGSA 3HXSA 5INYA 1EGRA 2WULA 2I9HA 3QMXA 10GSA 4KH7A 4KCEA 4KB3A 3V1WA 3ZRDA 1GWCA 4NAXA 4JZQA 2C3QA 1N2AA 5HFKA 2ALBA 5D9WA 2H74A 2WRTA 1EGOA 2IMIA 3DGQA 4ZBDA 1XVQA 1AIUA 4FH8A 5B7CA 1B4PA 1F3BA 1AAZA 1SYXA 4OFNA 3LEFA 5B8AA 6GSWA 1R5AA 1XW9A 3HA9A 2VCVA 5F05A 1SENA 4DSQA 1CQHA 1YDKA 4X1UA 3GHAA 4JR4A 5D73A 2LKUA 5IIZA 4J57E 3IHQA 4TXVA 1GUMA 1O7UA 1THOA 3DKSA 3EURA 4H86A 1SL2B 2REMA 4EC0A 4MH2A 5G5FA 2AYTA 1K3LA 3F0IA 3WD6A 5ABRA 1GSDA 2HRFA 3QCPA 1QXHA 1BAYA 1Z6MA 2DIYA 1H75A 1HNCA 3VWXA 1NM3A 1EOHA 2DSAA 4KX4A 4GWRA 3A5WA 14GSA 4KGIA 2IIYA 1KTEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite