3MGWA

Thermodynamics and structure of a salmon cold-active goose-type lysozyme
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
181
structure length
181
Chain Sequence
HHDITKVDTSGASEITARQDKLTLQGVDASHKLAEHDLVRMNKYKELITRVGQKHGLDPAIIAGIISRESRAGSALDHGWGDHGKGFGLMQVDKRYHKIVGAWDSEKHISQGTEILIEFIRRIQAKFPVWPKEHQLKGGISAYNAGDKNVRTYERMDVGTTGGDYSNDVVARSQWFKSQGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme g
publication title Thermodynamics and structure of a salmon cold active goose-type lysozyme
pubmed doi rcsb
source organism Salmo salar
total genus 74
structure length 181
sequence length 181
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3mgwA00
5HQ1A 1RJCB 4DD9A 5KXOA 4ETDA 1BB3A 1FN5A 1BVXA 1GHLA 3IWRA 3RU5A 3WVXA 2LZTA 5I4XA 1NKHA 3TXIA 1AT5A 1FLWA 2CJLA 4PHIA 4B4EA 5LA8A 5C6LA 3RZ4A 1ZMYL 1J1XY 1JJ3A 5FSTA 1YQVY 3AZ7A 1JTTL 3HBHA 1LHKA 1C08C 4DD1A 4KT3A 1VFBC 5B59A 2Z39A 3G3AB 3QE8A 4LT3A 5C6IA 4NWHA 1HNLA 4X3BA 1UIAA 5KXLA 3VWOA 2WARA 5LVHA 2BQEA 3B72A 4J0LA 2Z38A 4G4BA 3B0IA 4TSBA 5DM9A 3A91A 3F6ZA 4WM5A 4NGKA 154LA 1REZA 4HTQA 1OUJA 5LVGA 1UIHA 4H94A 1UBZA 2AUBA 1DZBX 4B4JA 2YBHA 4DD3A 1RCMA 2ZQ4A 2IFFY 1QTEA 2LYOA 1GFVA 1F10A 5F81A 1HMKA 4N1CC 4OOOA 1YAMA 4XJHA 2BQJA 1NF5A 5FELA 1WQOA 5KXNA 2BQAA 1LZ6A 4NFVA 2Z12A 1IR9A 3BKVA 3J6KA 5K7OA 1LHJA 1SQ2L 1IP2A 2LZ2A 5A3ZA 4P2EA 4NHIA 1GDXA 4EOFA 2F30A 4PRUA 9LYZA 3TXGA 5L9JA 1INUA 3J4GA 3N9EA 2XJWA 4NGOA 1GE2A 4WMGA 5JENB 1VEDA 1F0WA 2HEDA 1IP3A 4Z3MA 5E9RA 5KXSA 5KKJA 1WVVA 4OWEA 2LYZA 1OUGA 1OUIA 3A8ZA 3WXTA 5D5FA 2EQLA 4WM3A 4BS7A 4EMNA 3HBEX 1GPQC 4WLXA 4YM8A 5I5QA 4IJ4A 5FHWA 4XJFA 2MEEA 2HECA 2W1LA 2F4AA 3LZTA 1HFZA 1IP6A 1TBYA 1FBIX 3RT5X 1WTMA 4WM6A 1GF0A 1GFKA 1OUDA 3GXRA 1JHLA 4ETBA 4XJGA 3AGGG 3WUAA 3TXEA 1LZ1A 4TWSA 4WOAA 4NY5A 4GN4A 1UIFA 1WTNA 2HEBA 1LSMA 3WU9A 4NWEA 2DQAA 1HC0A 2BQDA 3ZVQA 2IHLA 4ETAA 1AT6A 3A93A 5LINA 4H9CA 4DWXA 2BAAA 135LA 1GFJA 4ETEA 2BQMA 1HEQA 1GB6A 4H9FA 1B5XA 1D9UA 3WPLA 4B0DA 1MELL 1HF4A 1GXXA 3ZVQB 1HMLA 2I25L 4H92A 3ZEKA 2YBIA 4RDSA 2RSCA 1GB2A 2DQEY 1XSFA 1B5YA 1XGPC 2EPEA 3A67Y 5LXWA 1IP5A 1LJHA 1KXWA 4PRQA 4YENA 1IVMA 4XJBA 1HFXA 1GF5A 3AYQA 3EO5A 5LYZA 5J7CA 5L3HA 1JTOL 3A92A 3RW8A 4DD0A 4H9AA 1WQNA 2YVBA 4NHPA 5APDA 1HSWA 4TUNA 3OK0A 6LYZA 1VDSA 1LJEA 3CT1A 4IASA 1JTPL 5I4YA 1VDQA 4XYYA 1YROA 2FBDA 1NDMC 1BB6A 5B05A 1ZVYB 5KXTA 1NMMA 4GCCA 1ZV5L 1LZYA 2DQGY 2MEBA 4OWCA 1V7TA 2W1XA 2FBBA 1IR7A 2N5ZA 4OWHA 4UWUA 4UWVA 3ULRA 4C5FA 1J1OY 1LZ5A 1HENA 1QDRA 3CSRA 1LKSA 1G7HC 2A7DA 1IEEA 2DBTA 2YBMA 1GEVA 4U3XB 3SP3A 1XEKA 194LA 1O23A 4LYZA 4MR1A 1NHEA 3HBDA 1HERA 1GBZA 3A3RX 1HEOA 1XGUC 3FI7A 1REXA 3AGHA 4H9IA 3WXUA 1LSAA 4HJYA 3IJUA 3QNGA 3AGIA 1H6MA 3WUNA 4W94A 1FLUA 1DPXA 1LJFA 1E8LA 2F4GA 1G7MC 1JIYA 5HMJA 1QUTA 1GXV2 4G9SA 2D4IA 4LYMA 5I53A 3P66A 3P68A 4WG7A 5EBHA 1B5WA 1JUGA 1EL1A 3LYZA 5HNLA 3T6UA 1B7NA 1GE1A 1REYA 3AW6A 3LYMA 4BADA 4WLTA 1B7RA 5DL9A 1LSCA 5APFA 4LZTA 5B06A 4ZIXA 5ILFA 3A90A 4LGKA 3D9AC 1LZ4A 5KXYA 4NGWA 1VAUA 4WO6A 3WULA 2BQCA 1LJ4A 4H9BA 1UIEA 1GB7A 4PJ2C 5KXWA 1LMQA 1GBSA 1LAAA 4WM1A 3WU8A 1LJGA 1IC4Y 1LCNA 4NGVA 3W3EA 3WUMA 5KXKA 3LN2A 1WQQA 2DQHY 1J1PY 1B0DA 1IO5A 1LZ9A 3A6BY 1AZFA 133LA 1B5UA 3WYHA 1BB7A 1EQ4A 1GB3A 1VDTA 4HPIA 2Y8PA 1LMAA 4ET8A 1LSGA 1OUHA 2CGIA 1NQIA 1I1ZA 1BGIA 5LVJA 3HFMY 5KKIA 3GXKA 1KXXA 5LVIA 3D3DA 2Z37A 1DQJC 1H87A 1WQPA 3BKHA 153LA 3EXDA 2D4KA 5HLLA 1RFPA 3AZ6A 5F16A 5FDJA 1IWVA 1LPIA 5T3FA 2FYDA 2I6ZA 4PGJB 4RLNA 3M18B 2ZYPA 2DKVA 1QQYA 4GCBA 4BAPA 4DT3A 1HSXA 1KXYA 4DDBA 5II3A 4ML7A 1GBXA 1YKYX 4J1BA 5IHGA 1LYZA 2X0AA 2H9JA 4TX7A 1LZSA 1GB5A 1GB8A 1IORA 1B7MA 3EBAB 3RNXA 3AW7A 4H8YA 4H8ZA 3WL2A 2XBRA 1UUZC 3W6EA 4N0JA 3A6CY 3ATNA 3EMSA 4NG1A 3T36A 1YAQA 1VATA 3CT5A 3E3DA 4NHTA 4H91A 1GBYA 3G3BB 1NWGA 4KL7A 1YL0X 2Z18A 2D4JA 4YF2A 4DC4A 3CQLA 1YKZX 4NEBA 3W6BA 4II8A 2HEAA 3AZ5A 4NGYA 1AM7A 4H9EA 1DI3A 1LHHA 1GE4A 5F9XA 1LZEA 1GEZA 2BQHA 2NWDX 3AZ4A 4Z41A 5KXZA 2YDGA 5LA5A 4BAFA 1XEJA 1IWWA 1JPOA 1G7LC 1LZDA 2DQJY 4N5RA 4XJDA 4M6DA 2XTHA 1NDGC 1I56A 1IC7Y 1JSEA 4QDNA 1DI5A 1LMCA 2BQLA 4QY9A 1BB4A 3TXJA 4HSFA 4O34A 3WPKA 5HNCA 2F2NA 1IY3A 1D6QA 1LHLA 1W08A 2LYMA 4HJZA 1YANA 1LZAA 1GFHA 2ZQ3A 1I20A 1LHMA 5B1GA 1LZRA 4Z46A 5DN4A 1QSAA 1FKQA 1F6SA 1GF7A 1FDLY 4LT0A 3A3QA 2HEFA 2HU3A 1C10A 4HJVA 1OP9B 4B4IA 5B1FA 3LHMA 1PS5A 1OUCA 3AB6A 1BWHA 1GBOA 2MECA 4GN3A 3P64A 2BQIA 4L41A 4J1AA 5B07A 3TXHA 1IOQA 3W6AA 1QSWA 4ZFPA 1LSBA 4HP0A 3OJPA 4GLAA 1UA6Y 3TMXA 1B7QA 1LZNA 2ZNWY 4LYOA 3WU7A 1LSYA 1ALCA 1T3PA 1QTKA 1YKXX 4QEQA 3A34A 3W6FA 1HEPA 4NGZA 4PPOA 1IC5Y 4B49A 1G7IC 2VB1A 4OW1A 1OUEA 1QIOA 1JISA 1GDWA 2BQGA 4H8XA 1LZTA 4DDCA 3N9AA 1HFYA 2PC2A 4W96A 1LJ3A 5E4PA 4FJRA 2C8PA 4CFPA 4KPMA 1D6PA 4DD2A 3TMWA 1B5VA 2ZIJA 3WVYA 5M1YA 4LFXA 4N9RA 4MSTA 4OOTA 5LIOA 1KIQC 1LZBA 1IWZA 1REMA 1VDPA 2H5ZA 4YOPA 2BPUA 1IWYA 1LMNA 1V7SA 8LYZA 1LSZA 3CT0A 1CKGA 2C8OA 1IOCA 2EKSC 4GLVA 4TTDA 1IY4A 1XGTC 1UC0A 208LA 5ILCA 1JKAA 4ET9A 2ZWBA 2ZIKA 207LA 4G4CA 2ZYCA 1QUSA 2MEGA 1GB9A 2YBJA 1JKDA 1EQ5A 3A95A 1YAOA 2G4PA 1IWTA 193LA 4R0FA 4NSGA 4E3UA 1YIKA 1JITA 3QY4A 3IJVA 1GWDA 1TAYA 5F14A 1LSNA 1UIDA 1XGRC 3LZ2A 4HTKA 2CWIA 1UCOA 2G4NA 3TXKA 1LSEA 3TXDA 3WW5A 1B7LA 2MEDA 1IP1A 1B7SA 1BVKC 3N9CA 4B1AA 4CJ2A 1B7OA 1WQMA 4IATA 3ATOA 5KXPA 4DDAA 2EIZC 1CKHA 1BHZA 4NHSA 2D91A 4TSCA 4XADA 5C6JA 5APCA 5I4WA 1IP7A 1B5ZA 3W6CA 1CNSA 2YBNA 2ZNXY 3WW6A 1GFAA 5IELA 4ANRA 1G7JC 1JSFA 3KAMA 1B7PA 1YILA 2HUBA 2MEHA 4N8ZA 4NG8A 4RW2A 3TXFA 2ZILA 4ZEEA 5I54A 4D9ZA 4RW1A 1C46A 4LYTA 5FEKA 3W6DA 1LJIA 1C7PA 3TMUA 1GF9A 3CSQA 4GCFA 4QGZA 4MCKA 1GD6A 1LSDA 1DKKA 4NSHA 4AGAA 5A3EA 1LJNA 4HV1A 4KXIA 1XEIA 4A7DA 2LHMA 4M4OA 1A4VA 4YEOA 4YEMA 1JJ1A 4CHXA 1YAPA 5DLAA 1IIZA 2Z19A 1FLQA 3K3TA 1GF6A 1XFPL 1NBZC 1IOSA 1B2KA 1NBYC 2BQOA 4XJIA 1D0MA 2HU1A 1GFUA 4WL7A 1UIGA 4R6CA 1CKCA 1IR8A 1TEWA 3LYTA 1JJ0A 2BQBA 2DQIY 4I0CA 4LYCA 1WQRA 3MGWA 4HPEA 4G49A 1LJJA 1GFGA 1D0LA 1GB0A 1RI8B 4XENA 4Z98A 5LVKA 5KXXA 5KXRA 1CJ6A 4C3WA 1GE0A 1LMPA 1N4FA 2DQFC 2MEAA 4OWBA 1WVUA 6LYTA 3A94A 1TCYA 7LYZA 4HTNA 4WL6A 1GFEA 1LOZA 1LTMA 1UACY 1KIPC 1EQEA 1GFTA 1DKJA 4NIJA 1B9OA 3LYOA 5FCPA 1OUBA 5KJ9A 1DPWA 2BLYA 2Z2EA 3B0KA 1C45A 1GE3A 1LZCA 1AKIA 4H9HA 3P4ZA 1BWJA 4LYBA 1FKVA 5DN5A 4I8SA 2W1MA 5LAGA 1JEFA 2I26L 3P65A 1IWUA 1P2CC 2BQKA 1LKRA 2B5ZA 3AJNA 2DQCY 1LSPA 1CJ9A 1A2YC 4H1PA 4WM2A 4NSIA 5F9UA 2XBSA 1CJ8A 3A96A 5D5CA 1JWRA 1DXJA 2HTXA 1YL1X 4AXTA 1FLYA 4G4HA 5KXMA 1XGQC 4GCEA 3TXBA 5AMYA 1QDTA 3FE0A 3M3UA 1JKCA 1LYYA 1OUAA 2BQNA 4GCDA 2MEFA 3WPJA 5KY1A 4FDYA 1DI4A 1OQMA 1KIRC 1W6ZA 4UWNA 4LFPA 1T6VL 4NGIA 2D6BA 1Z55A 1UIBA 3B6LA 4H90A 1LSFA 1GF8A 1C43A 2BLXA 1LMTA 1HELA 4NGLA 2HEEA 2W1YA 5APEA 4CFOA 4OWAA 1GAYA 4LT1A 2GV0A 1BWIA 5LYMA 5HMVA 1LYOA 4NHQA 1OUFA 1LHIA 1RE2A 1PZYA 1IOTA 4H93A 1GAZA 4ETCA 2DQDY 4NSJA 2MEIA 1UICA 1GF4A 1CJ7A 132LA 4GN5C 4WLYA 1IP4A 1D0KA 2H9KA 4J7VA 5IDDA 4HV2A 3CB7A 5L3IA 3B0OA 1GBWA 1LZ8A 2G4QA 4LT2A 4NGJA 3WMKA 4DYGA 1HEMA 1HHLA 4WG1A 1GFRA 1BQLY 2BQFA 2CDSA 4CGEA 3WH1A 1CKDA 1LJKA 1LMOA 1HEWA 2Q0MX 2YBLA 3TMVA 4RLMA 1F6RA 134LA 4DD7A 4WM4A 2FYCA 5LYTA 4N1EI 2Z2FA 1JKBA 1TDYA 1GF3A 5LAFA 1ZVHL 4WLDA 4XN6A 1LZGA 1CKFA 1BB5A 1IWXA 1IX0A 1MLCE 2A7FA 2YSSC 3CSZA 4WO9A 1SLYA 1LYSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IWRA 1BVXA 1GHLA 5I4XA 1NKHA 2QB0B 1AT5A 4DQ5A 3AZ7A 1JTTL 155LA 2RAZX 3QE8A 4LT3A 5C6IA 4X3BA 3VWOA 176LA 2BQEA 3B72A 4GBRB 2RBRA 4TSBA 3HTBA 1REZA 4H94A 1UBZA 1DZBX 2ZQ4A 1QTEA 1GFVA 4N1CC 2QARC 1YAMA 220LA 1LZ6A 4NFVA 3BKVA 1CV6A 5K7OA 1SQ2L 1L08A 2F30A 4PRUA 1CX6A 1F0WA 4Z3MA 2LYZA 1OUIA 2EQLA 4WM3A 5I5QA 2F4AA 3LZTA 1QT6A 1IP6A 3DN6A 1OUDA 3WUAA 3TXEA 2HEBA 3WU9A 4NWEA 2DQAA 1HC0A 1LPYA 4ETAA 1AT6A 1LYJA 1C6KA 1L41A 1MELL 1GXXA 2I25L 3ZEKA 4RDSA 2RSCA 2DQEY 3A67Y 1KXWA 185LA 1L12A 1C6BA 5L3HA 3HH4A 3A92A 3RW8A 2RB2X 4H9AA 1L77A 147LA 4TUNA 6LYZA 1VDSA 4IASA 5I4YA 1C6LA 5B05A 2MEBA 1V7TA 172LA 2N5ZA 4UWVA 4EKRA 3CSRA 1LKSA 2DBTA 2YBMA 2B74A 1G07A 1GBZA 3A3RX 3FI7A 1REXA 1L71A 3AGHA 3GUIA 1H6MA 1L11A 1L93A 257LA 2B70A 2RBOA 1GXV2 5I53A 4WG7A 4DAJA 5I14A 3LYZA 3T6UA 1B7NA 5DL9A 5KXYA 1VAUA 1LJ4A 1GB7A 4PJ2C 2B7XA 3WU8A 3W3EA 3LN2A 4I7TA 1IO5A 1XEPA 1B5UA 1BB7A 1LGWA 1LI6A 1VDTA 2Y8PA 1LMAA 2OE7X 1LSGA 1LYHA 3HFMY 1WQPA 1JTMA 3BKHA 5HLLA 1RFPA 1QUGA 1IWVA 2B6TA 3M18B 1DYCA 3DN8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5HQ1 A;  1RJC B;  4DD9 A;  5KXO A;  4ETD A;  1BB3 A;  1FN5 A;  1BVX A;  1GHL A;  3IWR A;  3RU5 A;  3WVX A;  2LZT A;  5I4X A;  1NKH A;  3TXI A;  1AT5 A;  1FLW A;  2CJL A;  4PHI A;  4B4E A;  5LA8 A;  5C6L A;  3RZ4 A;  1ZMY L;  1J1X Y;  1JJ3 A;  5FST A;  1YQV Y;  3AZ7 A;  1JTT L;  3HBH A;  1LHK A;  1C08 C;  4DD1 A;  4KT3 A;  1VFB C;  5B59 A;  2Z39 A;  3G3A B;  3QE8 A;  4LT3 A;  5C6I A;  4NWH A;  1HNL A;  4X3B A;  1UIA A;  5KXL A;  3VWO A;  2WAR A;  5LVH A;  2BQE A;  3B72 A;  4J0L A;  2Z38 A;  4G4B A;  3B0I A;  4TSB A;  5DM9 A;  3A91 A;  3F6Z A;  4WM5 A;  4NGK A;  154L A;  1REZ A;  4HTQ A;  1OUJ A;  5LVG A;  1UIH A;  4H94 A;  1UBZ A;  2AUB A;  1DZB X;  4B4J A;  2YBH A;  4DD3 A;  1RCM A;  2ZQ4 A;  2IFF Y;  1QTE A;  2LYO A;  1GFV A;  1F10 A;  5F81 A;  1HMK A;  4N1C C;  4OOO A;  1YAM A;  4XJH A;  2BQJ A;  1NF5 A;  5FEL A;  1WQO A;  5KXN A;  2BQA A;  1LZ6 A;  4NFV A;  2Z12 A;  1IR9 A;  3BKV A;  3J6K A;  5K7O A;  1LHJ A;  1SQ2 L;  1IP2 A;  2LZ2 A;  5A3Z A;  4P2E A;  4NHI A;  1GDX A;  4EOF A;  2F30 A; 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 1DKK A;  4NSH A;  4AGA A;  5A3E A;  1LJN A;  4HV1 A;  4KXI A;  1XEI A;  4A7D A;  2LHM A;  4M4O A;  1A4V A;  4YEO A;  4YEM A;  1JJ1 A;  4CHX A;  1YAP A;  5DLA A;  1IIZ A;  2Z19 A;  1FLQ A;  3K3T A;  1GF6 A;  1XFP L;  1NBZ C;  1IOS A;  1B2K A;  1NBY C;  2BQO A;  4XJI A;  1D0M A;  2HU1 A;  1GFU A;  4WL7 A;  1UIG A;  4R6C A;  1CKC A;  1IR8 A;  1TEW A;  3LYT A;  1JJ0 A;  2BQB A;  2DQI Y;  4I0C A;  4LYC A;  1WQR A;  3MGW A;  4HPE A;  4G49 A;  1LJJ A;  1GFG A;  1D0L A;  1GB0 A;  1RI8 B;  4XEN A;  4Z98 A;  5LVK A;  5KXX A;  5KXR A;  1CJ6 A;  4C3W A;  1GE0 A;  1LMP A;  1N4F A;  2DQF C;  2MEA A;  4OWB A;  1WVU A;  6LYT A;  3A94 A;  1TCY A;  7LYZ A;  4HTN A;  4WL6 A;  1GFE A;  1LOZ A;  1LTM A;  1UAC Y;  1KIP C;  1EQE A;  1GFT A;  1DKJ A;  4NIJ A;  1B9O A;  3LYO A;  5FCP A;  1OUB A;  5KJ9 A;  1DPW A;  2BLY A;  2Z2E A;  3B0K A;  1C45 A;  1GE3 A;  1LZC A;  1AKI A;  4H9H A;  3P4Z A;  1BWJ A;  4LYB A;  1FKV A;  5DN5 A;  4I8S A;  2W1M A;  5LAG A;  1JEF A;  2I26 L;  3P65 A;  1IWU A;  1P2C C;  2BQK A;  1LKR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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