3MJNA

Crystal structure of the complex of c-lobe of lactoferrin with isopropylamino-3-(1-naphthyloxy)propan-2-ol at 2.38 a resolution
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
publication title Crystal Structure of the complex of C-lobe of lactoferrin with isopropylamino-3-(1-naphthyloxy)propan-2-ol at 2.38 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 113
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2010-04-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mjnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mjnA02
4QFKA 3OO6A 3IL1B 3C32A 1FQEA 2XX7A 1LFIA 1P1OA 3GLBA 1TFDA 4O3CA 1ANFA 5KDTB 1I6QA 3V89B 3E4RA 1SI1A 1T0KA 5F1QA 1S50A 1QKBA 4TLMB 3T9XB 5IAIA 3JZJA 3KJ7A 4Z7EA 2F7CA 4GFRA 5CMCA 2PBWA 1OLAA 1AOVA 1ZKBA 4XKNA 4ND9A 4F3GA 2BJJX 3ODBA 5L9SA 3SEYA 3KN7A 3G7WA 1B3GA 5H8HA 3EN3A 4LZ8A 4F29A 3N94A 2O68A 3UP9A 1LCFA 4OTEA 2AL4A 2ZNUA 2OBGA 4Q5TA 2O69A 4YKKA 1SW5A 2ZXTA 3FV1A 1N3WA 1MQIA 1OIBA 3TTLA 4FJPA 2DE4A 3TCGA 3MQ9A 1LAGE 4X9TA 2XXUA 3QXMA 2I3WA 1O64A 4GLIA 2X7QA 4F31B 1TXFA 3D4CA 3T96B 3TTMA 1R1NA 3MP1A 2RC8A 5HM4B 2V25A 5ICTA 4O3BA 1RYOA 5AA4A 4LUBA 1A8EA 3MP8A 3RT8A 5DT6A 3OO9A 3K2DA 3PGFA 5K2YA 1GGGA 4KD5A 5FHMA 3MW0A 1EZOA 3IB1A 2Z22A 3K6XA 4WXJA 5CMKA 1SQYA 4KHZE 1FQCA 5AE4A 2OZZA 2QSXA 1UIUA 1USYE 2OLBA 4FATA 3O2AA 1M5DA 3QSLA 5CBRA 5CRYA 1FTOA 3D4GA 4ZEFA 1MDP1 1B1XA 4GRKA 3ILUB 1NNTA 2UYEA 2GFEA 2F7BA 4TOZA 1MXWA 2UVIA 2XXVA 4H5FA 1UTBB 4E0XA 3V5AA 4ZS9A 1JNFA 2Q9TA 3PV0E 3RN8A 1MM6A 1MY3A 3W9WA 3FVNA 1SDXA 2H4IA 4EQ7A 3U8QA 5I84A 2F6GA 1EH3A 5TPAB 4YKIA 1B1HA 4Q8RA 1VFDA 3Q27A 1P1WA 2Y7KA 4Q0CA 3F11A 3C34A 1N7XA 1EU8A 4QRZA 1ZLQA 3VVFA 1M5CA 3EF7A 2XHDA 3IO4A 2P0SA 1A99A 3WAEA 3IAZA 3G3JA 3TCHA 5L9MA 5FHOA 2O84X 1FQBA 1B3HA 3RT6B 3UK4A 4NWCA 3UA8A 2I4BA 3R7XA 4ESWA 4X48A 3CR9A 2XXPA 3CSBA 3MJNA 3DP4A 3C31A 4OEVA 2DP8A 3IOTA 4GL0A 1B51A 4R2FA 5K2XA 3G3IA 4XXUA 3MPLA 5DTBA 3RTWB 3PPRA 2P2AA 5ISUA 3TODA 4IGTA 1OLCA 1R6ZA 1NH8A 1IZ1A 2HCAA 1MY0A 4QFPA 4XKPA 3FJ7A 4RK9A 4F19A 3O97A 2Y7PA 5I2NA 4ZZEA 1DSNA 3VFJA 2QPQA 3M3LA 2R6GE 4PFTA 3H6VA 4DCXA 4YICA 1B3EA 2QS2A 4NEDA 3G3GA 4HCYA 1RYXA 3M3FA 4YB5A 4GQOA 1SVXB 3FXRA 2UVGA 4EXLA 1N0TA 3H06B 4BDLA 4OFOA 1MS7A 1IEJA 1R9LA 3EHUA 1GR2A 3E9XA 3CG1A 1JETA 1URDA 4KYSA 4LATA 3O6IA 2DOJA 3MVXA 1IITA 1ZMGA 2PVUA 3PD8A 3DP8A 3M3KA 3QUFA 2XXTA 1MPBA 2FA7A 2KLFA 5EHMA 2XD3A 2DE2A 4OEUA 1D9VA 1LAXA 4O3AA 4ZEIA 1BKAA 3TQLA 3HN0A 1MG1A 5ELVA 4NE4A 3TZAA 1YPNA 5EHSA 4JDFA 5LOMA 4U2RA 4EQ9A 1Y3NA 2O7IA 3LR1A 4YMAA 4JWXA 4QHQA 4ELRA 4H8IA 1M5BA 2M8CA 3VVEA 2XXQA 1B7ZA 1VSOA 2RINA 4NF8B 2ALUA 4F2OA 2QS3A 3VDFA 3T93B 1UQWA 1Y9UA 3PPQA 4P11A 3USDA 3ILTB 4FE8A 3Q25A 3U93A 1A54A 2DQVA 3AXFA 1MXVA 2REJA 3FZVA 2V84A 3S9MC 3E3KA 4OYVA 4LA9A 3JYRA 3TCFA 2CMOA 4ESXA 4F3PA 3E13X 2Y7RA 2G93A 4ZEBA 1XS5A 3I3VA 5F7VA 5I58B 3PPNA 5DYHA 2O6AA 2VOZA 3CI8A 4OESA 4QFNA 3SDFA 1NNFA 3K00A 2RCBA 1OVTA 4ECFA 3KN3A 2H5YA 4F39A 5H8SA 5DVJA 3RGYA 5ITPA 1QUIA 5I57B 3K02A 2B65A 2V3TA 1II5A 4F2QA 5I56B 3K4UA 4C1UA 4KYDA 3EPEA 5ITOA 1NFTA 2Q89A 4KQPA 3OSQA 3ZKLA 2X7PA 5EYFA 3TDJA 3L6HA 1VFEA 1UTBA 2DS9A 4XKRA 1USYH 4EF2A 4DIGA 3IJXB 3KSJA 5CMBA 1OQGA 4QSEA 3MP6A 3IOVA 1Y1MA 3QK6A 3N6UA 1S9TA 1B58A 5JTYA 3FATA 1BTJA 2R9JA 5TPAA 2GH9A 1B0LA 1VR5A 2OJTA 4KR5A 1FQDA 2AIXA 5H8NA 5BWJA 3T9HB 2ONRA 2F36A 2NUVA 1POTA 1ZTYA 2F5XA 3W15C 4BDQA 3IOWA 1DPEA 2YJPA 5M2VA 3P7IA 3S9NC 4N6PA 4U1OA 4XKQA 1N04A 1WDNA 4GIZA 1Y4TA 3K6VA 4ISUA 3KZGA 1AL3A 3TAJA 3LUYA 2RCAA 1XVXA 1H76A 4YMBA 4THIA 3TTNA 5IKBA 2XXIA 2O51A 3QYTA 3MVYA 4WKMA 4GL8A 1DMBA 4F1YA 2RF1A 1FQAA 3HV1A 4EQBA 4G68B 5B7DA 1MPCA 3TTKA 3N6TA 3OD7A 1MPDA 5JEIA 4H5GA 1JVXA 1Y20A 4X1DA 1Q35A 5DEXB 3CIJA 2XX9A 2F34A 1B5JA 1UIVA 4NMYA 3N26A 4KFQA 4OWDA 3LC8A 2DXYA 4POWA 1P99A 4OXVA 2DWHA 4R9FA 1US4A 1MXZA 1P1NA 2DWIA 1PB9A 2R71A 4I8CA 4OENA 2UXAA 3HHGA 4ELQA 3OMBA 4NF6B 2PX1A 4G8HA 3OO8A 3LSWA 4YZZA 4JSOA 1MQHA 4F1UA 1UTHA 1YCJA 3O29A 4GWOA 1P1QA 2Z8EA 1CE2A 3Q29A 4QFLA 1TWYA 3EHTA 4G8MA 3THIA 5L9OA 1D9YA 3IJOB 3SETA 4EF1A 4GVOA 4POXA 1POY1 2ONKE 1ZU0A 3PU5A 2HEUA 1H3DA 4U23A 4H0WA 1IXIA 3FV2A 3PPOA 2HXWA 3BKIB 1SW1A 5FHNA 4GXAA 1QULA 4LP2B 4NF5A 2UVJA 1B7HA 4U4XA 1NNPA 3CG3A 5I2KB 4OFJA 1XC1A 3RTFB 4R73A 4G4PA 1AMFA 5JTYB 4XIGQ 1B4ZA 3UN6A 3PUWE 4U22A 3U1OA 3GBBA 3ZKKA 2G29A 4ZDMA 1HSLA 2YLNA 3I5OA 5H8NB 2HFBA 3ONMA 1Q1KA 2XXHA 2PYYA 3QIMA 3R6UA 4OERA 3UIFA 3GZGA 5AA2B 1LLSA 2XX8A 3HPIA 4NF8A 4AB6A 5HPQA 2PT2A 1N84A 3V8XB 2NXOA 3U72A 1JEVA 1GTKA 1WVJA 3B6QA 5CI5A 3SKPA 1URGA 4KI0E 5H8QA 3TYHA 1FTMA 2A5TA 2I4CA 5L8DA 2REGA 4GF8A 2I49A 5AA3A 3MPKA 2I6EA 1MQGA 4FECA 5CM6A 1B3LA 4EUOA 4IO4A 5I58A 1MY1A 1M5FA 1QUJA 1HSJA 2Q88A 2IA4A 1PB8A 1H45A 2XXWA 4QFOA 3CFZA 3MBPA 3DLNA 4QSCA 1LFHA 2D21A 3O28A 3IK6B 3K1NA 1Z7ME 3CSGA 3MWBA 1Y3PA 3OEKA 5I57A 4YB7A 1R9QA 3FJGA 2F97A 4JBZA 1VE4A 5I56A 4U1ZA 1FTLA 2H9BA 2I3VA 1B5HA 3HCQA 1RKMA 3TMGA 4LQ5A 5J1DA 3C9HA 1LSTA 1XHYA 2FNCA 3S9EA 1EZPA 1B2HA 3K01A 3C33A 4H65A 4FIMA 1IXCA 2DVZA 3BFUA 1PBPA 5KZTA 1JQFA 3IX1A 4ZEDA 1B40A 1MY4A 3C35A 3K1MA 4YB6A 4H6DA 4TLLB 1UTHB 4HW8A 4BDMA 1B3FA 4IO6A 2UYFA 2ZYMA 3SEVA 2I0CA 3VXCA 1A8FA 1I6BA 5AA2D 3LBSA 2O1MA 4E0WA 3IOUA 4FORA 1A40A 3DELB 1QW0A 4P0GA 3T9VA 2QRYA 2OWTA 4NF5B 4BDNA 2P1SA 1BP5A 3TKDA 4PETA 2FYIA 4F1VA 2I0BA 1NMUA 2GHBA 4GD5A 2X26A 3H6UA 5I59B 1B0HA 2Y7WA 4OQOA 3VLUA 5A5XB 3CRBA 2F7AA 2F78A 4IO2A 1GVCA 5H8FA 2PMSA 1ZIUA 3KOSA 4G68A 4PE5B 1QKAA 4NWDA 4ELOA 2ABHA 3RUMA 4DE8A 2D3IA 3QUJA 3VLVA 4G2ZA 3VXBA 3UGWA 4Z0IA 5TU0A 2B3FA 4AB5A 3IR1A 4RXLA 3TFLA 3JV9A 1Y1ZA 2Q2AA 2V3QA 4IB2A 5H8QB 5DEXA 4F3BA 2QMWA 2A5TB 5DVFA 3RY3A 2OWSA 3S2VA 3EQ1A 3SEXA 1SW4A 1OVBA 1H43A 2RC9A 3FJMA 3DM0A 4IO5A 3T9UA 3B6TA 3G3HA 4GXSB 3RLFE 1B9JA 3IB2A 2QS1A 3K1PA 2VD3A 1P1UA 4G8NA 4WEDA 1LCTA 1O63A 2THIA 2HAVA 1US5A 4H8JA 4R2BA 4C0RA 4IY5A 3R26A 2XXXA 4NF6A 4ZZAA 3IB0A 2Z8DA 3FXQA 4R72A 4RA1A 4RY1A 1Y4CA 2DE3A 4BLAA 5KCJA 3KSXA 1WODA 1MQDA 1SBPA 4MLQA 4NF4A 3K0VA 1OMPA 3PUZE 3B6WA 4JB7A 3U92A 1QUKA 3DP6A 5FTHA 5ICQA 1IXHA 1B4HA 5I2KA 1S7YA 1MH4A 1CB6A 1PEBA 4I62A 3EHSA 2UVHA 1MXYA 1LGBC 1DTZA 4I1DA 3B7DA 4ZE9A 4LZ7A 2YPNA 1N7WA 1B46A 2H25A 4BDRA 4DZ1A 3TEPA 3C4MA 4BDOA 5AA2A 2XXRA 4F18A 2O7UA 5B70A 5BUUA 2LAOA 4R9GA 1M5EA 2DVCA 1SYHA 1FCKA 1IXGA 1ELJA 4H1XA 1SI0A 3MAMA 5CBSA 1MY2A 1PB7A 4RPOA 4P0IA 5H8FB 1NH7A 3WAFA 1ZBMA 3TELA 3GBAA 4KCCA 4PP0A 2B3BA 1XT8A 1B32A 3IORA 1FW0A 3KBRA 3KGCA 3G3KA 1SD3A 3A3UA 4YKJA 4X1BA 1AIVA 1B5IA 1I6AA 1MM7A 2F6PA 3OELA 2F8DA 4RNSA 3TUSA 4M1VA 3SEWA 1MH3A 3LSXA 4ZEKA 4DXUA 1DPPA 4KYEA 2H99A 3MC2A 4PFWA 3MZ1A 3PUXE 2Z23A 3Q26A 3PMXA 3O66A 5JK4A 4DXBA 3OOAA 1QVSA 4L17A 4RYAA 1LBBA 3TQWA 2WKYA 2ZNSA 1LB9A 4F22A 1Z7NE 4RK2A 2OCUA 1LAHE 3FUZA 3FD3A 3A3CA 1Y3QA 3CFXA 4DDDA 5KCJB 3PUVE 4TQUQ 4OETA 2PT1A 1MXUA 1SYIA 1ZJLA 1MXXA 1EZ9A 4NF4B 5CMMA 2HAUA 3RNNA 4MLVA 2QS4A 1O7TA 1OQHA 1LBCA 5FTIA 3PD9A 2AYSA 3H4ZA 4HS7A 1TT1A 3FASA 2DXRA 3VV5A 3TTRA 2GRVA 2RC7A 2ZYKA 2H98A 3KEIA 3FGSA 3LSLA 2HZKA 4OZ9A 3FXUA 5I59A 2VD2A 1URSA 4U21A 5A5XA 4RJZA 3ZS6A 3SESA 4MBPA 1B52A 4PQJA 4FAJA 3FVOA 1D4NA 1AH5A 1JW5A 3S9LC 4OMBA 3VLWA 4MH5A 3Q28A 3FVGA 3HO7A 3RQTA 4EXKA 4ONYA 3QAXA 2ZMBA 3M8UA 4YAHX 2RKMA 5TP9A 4LZ5A 2W7YA 2QJEA 3KOTA 4YKPA 4JWYA 3S4UA 3KG2A 2CZLA 4R6HA 3IO6A 3G3FA 3MZBA 2Y7IA 3K6WA 2VHAA 1YTVA 3SEUA 2ZNTA 4KCDA 1XVYA 2XXYA 3K6UA 2DWJA 3MVWA 4N13A 3KN8A 3CFLA 5H8HB 4FEBA 4GOTA 2Q2CA 2QMXA 4FEDA 4UACA 1ATGA 1N76A 4N07A 4JXIA 2Y84A 3U94A 4I9DA 3MUQA 2E1SA 2VGQA 2HQ0A 4MF3A 3BBRA 4IO7A 1MDQA 3PMVA 3PPPA 3A09A 2F35A 3H03A 3ECRA 1D3KA 3OSRA 4KPTA 2QL3A 3H7MA 3SERA 1J1NA 5AA1A 4IGRA 3OENA 1F9BA 1B6HA 4MFIA 2DWAA 4HTGA 4LQ2A 4OVJA 5AA4B 1I69A 1FQFA 3V83A 5DVIA 3PMWA 4IY6A 1HSEA 1MRPA 1IUDA 4OHNA 1NKXA 3H6WA 1JVYA 1FTJA 2A5SA 3MVZA 2Z8FA 2Q8JA 4DXCA 2OK2A 4PFUA 4WEPA 2ESNA 4R75A 4R74A 2NWJA 5KDTA 4ZECA 3W9VA 1BIYA 3I6VA 3LSFB 2DSFA 2E0SA 4QSDA 1PDAA 3KFMA 2V93A 3O6GA 3BFTA 4LVQA 3HSTA 2ONSA 4PFYA 1IIWA 2IEEA 5HBCA 4ZE8A 1PC3A 1QJMA 4OFLA 2XD2A 3RPWA 3TPAA 3O9PA 4G77A 3FIRA 4EDPA 3FVKA 4F3SA 4IO3A 4XTCQ 3N5LA 2ZYOA 4C1TA 1DOTA 3C36A 3H3GA 3O6HA 4DLDA 4Q30B 3ZSFA 1JW4A 4NTLA 5CC2A 1N3XA 1JW1A 5TP9B 2NOOA 4H67A 4JWOA 4HCWA 4QF9A 1IQ7A 3MZ9A 2DYXA 3T66A 1KWHA 1YAEA 1NNKA 4M4GA 4K3FA 4G68C 1GV8A 3HHFA 3H6TA 2O1LA 1DTGA 4UA8A 4LONB 1A7LA 2ZYNA 4R6KA 2ANJA 1JEUA 1B7UA 2HZLA 1TFAA 4RPNA 1MQJA 1NL5A 3L6GA 2I58A 3VVDA 3VE1B 2I48A 4R6YA 3CVGA 1L5TA 3GXAA 3T22A 1A55A 4YU0A 1LAFE 1SW2A 4U4SA 1PBQA 3OO7A 3KJTA 4AQ4A 4DCYA 2GHAA 1LFGA 3OEMA 1LB8A 2VP1A 1BLFA 4ELPA 5I2NB 1H44A 4JSDA 2D5WA 1B05A 2NVUB 3UORA 2AL5A 2V3UA 3PUYE 1XOCA 3OXNA 1FTKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QFKA 3OO6A 3IL1B 3C32A 1FQEA 2XX7A 1LFIA 1P1OA 3GLBA 4OVRA 1TFDA 4O3CA 1ANFA 5I7IA 5KDTB 1I6QA 4N8YA 3V89B 3E4RA 1SI1A 3GYYA 1T0KA 5F1QA 1S50A 1QKBA 4TLMB 3T9XB 5IAIA 3JZJA 3KJ7A 4Z7EA 3IFCA 2F7CA 3BIHA 4GFRA 5CMCA 2PBWA 4GWUA 1OLAA 1AOVA 2XWIA 1ZKBA 4XKNA 4ND9A 4GWSA 4F3GA 2VT5A 2BJJX 3ODBA 5L9SA 1FBDA 3SEYA 3KN7A 4DI4B 3G7WA 1B3GA 5H8HA 3EN3A 4LZ8A 4F29A 2FVZA 3N94A 2O68A 3UP9A 1LCFA 4OTEA 2AL4A 2ZNUA 2OBGA 4Q5TA 2O69A 4YKKA 1SW5A 2ZXTA 3FV1A 1N3WA 1G0HA 1MQIA 1OIBA 1FBGA 3TTLA 4FJPA 2DE4A 3TCGA 3MQ9A 1LAGE 4X9TA 2XXUA 4PTKA 3QXMA 2I3WA 1O64A 4GLIA 2X7QA 2PFYA 2JJKA 4F31B 1TXFA 3D4CA 3T96B 3TTMA 1R1NA 4HE2A 4PFBA 3MP1A 2RC8A 5HM4B 4FBPA 1FBCA 2Y5KA 2V25A 4GX6A 5ICTA 4O3BA 1RYOA 5AA4A 4LUBA 1FPGA 1A8EA 4QBAA 3MP8A 4I40A 5DT6A 3RT8A 3OO9A 3K2DA 4GX4A 3PGFA 5K2YA 1GGGA 4KD5A 1FBHA 5IZ3A 5FHMA 3MW0A 1EZOA 3IB1A 2Z22A 3K6XA 4WXJA 5CMKA 1SQYA 1DCUA 4KHZE 1FQCA 5AE4A 2OZZA 4H45A 2QSXA 1UIUA 1USYE 2OLBA 2GQ1A 4GX3A 3O2AA 4FATA 1M5DA 3QSLA 5CBRA 5CRYA 1FTOA 3D4GA 4MAGA 4ZEFA 1MDP1 1B1XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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