3MJNA

Crystal structure of the complex of c-lobe of lactoferrin with isopropylamino-3-(1-naphthyloxy)propan-2-ol at 2.38 a resolution
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of the complex of C-lobe of lactoferrin with isopropylamino-3-(1-naphthyloxy)propan-2-ol at 2.38 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
total genus 113
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2010-04-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mjnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3mjnA02
1B6HA 4NF8B 5FTHA 3KJTA 5I84A 1UTHA 4KPTA 3Q28A 4NF8A 3QUJA 1XC1A 4F1YA 1H45A 2X26A 1XT8A 3BBRA 2Y7RA 1II5A 4IO7A 4RNSA 4EF2A 3M8UA 3K6WA 4EF1A 1A8FA 3TFLA 5CM6A 1O64A 1NNFA 2REJA 1HSEA 2DYXA 1B3LA 4GRKA 5HPQA 4FORA 1P1WA 1DSNA 1GTKA 4U4SA 1Z7ME 4OZ9A 1O7TA 1JNFA 1POY1 1IXCA 1USYH 2O69A 4R72A 3TQLA 3TTMA 1Y4TA 1MDQA 2F97A 4KYEA 1FTOA 3CR9A 5I56B 1MXZA 1MY1A 1P1UA 5I56A 4KCCA 5LOMA 2ONSA 3UGWA 3CRBA 4GWOA 4OETA 2XD2A 4FE8A 1B9JA 2F7BA 1DTZA 2DE2A 1ANFA 1RYOA 2RC7A 3LSXA 4ZECA 1N0TA 1URSA 2DQVA 5CMKA 4G8HA 5ELVA 1A40A 2RC8A 1LB9A 4RY1A 1D3KA 1IXHA 2PBWA 3K1MA 1Y1ZA 2ZMBA 4QFLA 1SI1A 1PBQA 1B3HA 4ZS9A 1PB8A 3PUZE 2XXYA 4OHNA 4U22A 2R6GE 3SDFA 1YAEA 5K2XA 4DDDA 2Z8FA 2XXQA 3GZGA 3VDFA 3IO4A 2UYEA 4ZEBA 1Z7NE 5TP9B 2CZLA 2QS1A 4IO5A 2Y84A 3PPRA 1T0KA 1FW0A 5TP9A 5TU0A 3RTFB 5H8HB 2Q2AA 3Q25A 3IOVA 1OIBA 4UACA 5H8HA 4C0RA 1EZ9A 4R9GA 4KI0E 4NF4B 1M5CA 5DT6A 4ZEFA 3FXQA 2DE3A 4KD5A 2XD3A 4ONYA 4NF4A 4ISUA 3KOSA 2GFEA 3K4UA 5KZTA 4ELPA 3O6HA 1MG1A 4G77A 1B46A 2R9JA 2O68A 2ZYOA 5H8FB 5CI5A 1USYE 4DXCA 4U21A 5JTYB 5H8FA 1N7XA 2I49A 5DVIA 5JTYA 1H44A 3PMWA 3S9LC 4ESXA 5DTBA 4GL8A 2QRYA 3PMXA 3EHTA 2E0SA 3KJ7A 4I8CA 1ZLQA 1SDXA 2VD2A 4DZ1A 5A5XB 4H5FA 4FJPA 5A5XA 3ILUB 2PYYA 4TLMB 3HO7A 5ICTA 1Y20A 4F3SA 3D4GA 2VGQA 2HEUA 4EXLA 1ZU0A 1US5A 4LATA 2F5XA 4AB5A 1LBCA 4OVJA 3LBSA 5CMCA 3OXNA 4Z0IA 4OMBA 2ZNUA 4NEDA 2ZYKA 3H03A 1D4NA 4QSCA 1P1NA 4H6DA 4LP2B 3HHGA 1ZBMA 3OEKA 5ITOA 1HSLA 3UP9A 3OO6A 1A54A 1VE4A 3IO6A 3JZJA 1PEBA 4Q30B 4OFOA 3KZGA 3MPKA 2HCAA 1SW5A 2I0BA 1B5IA 1MPBA 3CFZA 4GVOA 4HS7A 1TWYA 2I58A 1DPPA 2RCBA 2DWJA 1SW1A 5IAIA 5AA2B 3RLFE 3K01A 3KN8A 2ESNA 5AA2A 4PFWA 2Q8JA 3PPNA 1NL5A 2GHBA 3T93B 2YPNA 3OELA 1SD3A 2Y7KA 3C9HA 5L9MA 1DMBA 2XXIA 4X1DA 2FYIA 2THIA 3RN8A 3EF7A 2AL4A 4G4PA 3P7IA 3I3VA 3FIRA 1LAHE 1S7YA 4F3PA 2ZNTA 4NWDA 3FVGA 2HZLA 4YMAA 3C34A 4KQPA 1J1NA 3WAFA 4BDNA 4HTGA 3O2AA 4I9DA 4JWXA 5H8SA 5AE4A 3TCFA 3QAXA 3T66A 5EYFA 1H43A 3N26A 4QSEA 3S9MC 1BTJA 2B3FA 1Y3QA 3BKIB 2V25A 2H9BA 3T9VA 3UORA 3PV0E 4MF3A 3MVYA 3TODA 3VLUA 3C35A 4THIA 3TKDA 1VSOA 3MZBA 4KYDA 4YKJA 3VVEA 3ILTB 4O3AA 2GH9A 5H8NB 1MM6A 4GXAA 1LFHA 1IXGA 1MXUA 5H8NA 4JWOA 3HN0A 3MW0A 2R71A 3LSLA 5EHMA 3TDJA 3OD7A 4DCXA 1XOCA 1ZJLA 2XXWA 3Q27A 4OTEA 3TZAA 4M4GA 2X7QA 3H6VA 3H6WA 1L5TA 2Q89A 3FJMA 3PD8A 4HCYA 3W9WA 1NFTA 4RJZA 1S9TA 2HAVA 5BUUA 3O97A 2PMSA 3TTNA 3PGFA 3OSRA 1M5FA 1S50A 1AMFA 2HXWA 3G3KA 4ELQA 3TMGA 2DWHA 1B5JA 4R73A 2DVCA 2QMXA 3VVDA 4XTCQ 3IORA 1B0LA 3TPAA 5BWJA 5K2YA 3U8QA 3EHUA 1QW0A 1ZTYA 4F29A 3IB0A 4FECA 3OEMA 1GV8A 3K1NA 3USDA 3U93A 1B3GA 2OK2A 3SKPA 3VVFA 2NXOA 4WXJA 1FQDA 1SQYA 1ZIUA 4JWYA 2OCUA 4G68C 4GL0A 4GXSB 3O6IA 2RINA 3TAJA 4YKIA 1D9YA 3FXUA 1UIVA 2REGA 2Z8EA 2P2AA 1QULA 5H8QB 2A5TB 3RUMA 5I2NB 5H8QA 1B05A 2A5TA 3RTWB 5I2NA 4AB6A 4R74A 1OLCA 3PPQA 1EZPA 1ATGA 2ZNSA 3CI8A 3O29A 4LQ5A 4LVQA 3KOTA 2HAUA 3VFJA 4KCDA 1NMUA 1UQWA 2UVJA 3M3LA 3MVZA 4C1UA 3OO9A 3IJXB 2E1SA 3ECRA 3CG3A 1SYHA 2F34A 4QFKA 4YAHX 4WKMA 3C31A 4GIZA 3B7DA 4IGTA 1JW1A 5CBRA 2XXVA 3R7XA 3VE1B 1MQHA 3I5OA 5J1DA 5I57B 4LONB 1LGBC 3O9PA 1UTBB 3HPIA 3VXCA 1GR2A 5I57A 1MPCA 3TTKA 4P0GA 1AIVA 1UTBA 4QFOA 3PMVA 1M5EA 2ONKE 1N3WA 3KG2A 4H8IA 2QS4A 4YU0A 3T22A 4LZ8A 4OEUA 3IL1B 2DP8A 4WEPA 2BJJX 4MLVA 3A09A 5CMBA 3A3UA 4C1TA 1MPDA 4ZEDA 1QJMA 1B1XA 1OLAA 3MJNA 3AXFA 4OFLA 1BLFA 4FIMA 3MUQA 4R6KA 3L6GA 4XXUA 3FZVA 4G68B 3FGSA 4E0WA 2YLNA 3B6QA 4IO2A 2OWSA 4G68A 3QIMA 3VLVA 1SYIA 3K02A 2V3QA 1B3EA 2XXHA 2O7IA 4N13A 1H3DA 3A3CA 2XXTA 5I2KB 3MZ1A 3WAEA 1LCFA 1N7WA 1TFAA 1R9QA 4DXBA 5I2KA 1LAGE 4EQ7A 3IOUA 1IEJA 4PETA 3C36A 1IXIA 1B4HA 1KWHA 4I62A 5CBSA 2Z23A 3BFUA 3W9VA 4H5GA 4QHQA 3PUVE 2OWTA 3OENA 3KEIA 3OOAA 4PQJA 1GVCA 2D5WA 4HW8A 4G8MA 3KBRA 1B1HA 3K1PA 3E9XA 3GLBA 3BFTA 4N07A 3DM0A 1FQCA 4G2ZA 4RPNA 5AA3A 2RC9A 4IY5A 3DLNA 1EH3A 2RF1A 1MM7A 2Y7PA 3HCQA 3CSGA 2F78A 2XXUA 4DXUA 2YJPA 3DP6A 1M5DA 1NKXA 4QFNA 4ZEIA 1QUJA 1DOTA 4EQ9A 1YCJA 1PB7A 4POWA 4XKNA 3RPWA 1N84A 3U1OA 2DE4A 1IZ1A 1N3XA 1FTMA 4KR5A 4ZE9A 3TUSA 3PPPA 3QXMA 1M5BA 4F39A 4F31B 2I4BA 3PUWE 2QMWA 1B3FA 1MQJA 5FHNA 4DCYA 2DWIA 4Q0CA 1RKMA 2QL3A 1OVTA 4DLDA 2O1MA 4PE5B 3MC2A 4K3FA 1B58A 3KN7A 2VP1A 2F6GA 4KFQA 4H65A 2XX8A 1OVBA 2DVZA 2F7AA 3IJOB 3TCHA 1P1OA 4FEDA 1JW5A 1Y3NA 2AIXA 3FV2A 1B32A 5I58B 4FATA 4FEBA 2D3IA 5I58A 1B52A 1MY4A 1MY2A 3H6TA 2NVUB 3S2VA 3W15C 4JDFA 4Z7EA 2OLBA 3MPLA 1A7LA 2Q88A 1JEUA 1XVXA 2GHAA 2OZZA 2B65A 1AL3A 3KGCA 4PP0A 3TCGA 2OBGA 1GGGA 1MH4A 1I6AA 4H8JA 3CSBA 4LUBA 4BDQA 1B0HA 1POTA 1AOVA 2XXXA 2V93A 3H3GA 3SEWA 5KDTB 1R1NA 1QVSA 4MFIA 5JEIA 4GOTA 4IO3A 1JEVA 2QS3A 1P99A 4EQBA 5KDTA 2XX7A 4F3GA 3LC8A 1WODA 2V3TA 5B70A 3K0VA 5DVFA 1FQEA 3RT6B 4OFJA 3H06B 4F1VA 3SEUA 1MDP1 5B7DA 2ABHA 1VFEA 1WDNA 3ZS6A 1JQFA 4OQOA 4R2FA 2LAOA 3S9NC 4U1OA 1JVXA 3HHFA 3MAMA 1MXYA 3Q26A 4F18A 1FTKA 4RPOA 5AA2D 3GXAA 5I59B 2Y7IA 2F6PA 4GQOA 5I59A 4IO4A 3DP4A 3SESA 3FVNA 3QUFA 4HCWA 3V89B 3SERA 2I3VA 1IITA 5ISUA 3M3KA 1HSJA 2AYSA 1FQBA 3CFXA 2F8DA 2QS2A 2IA4A 3O28A 3OO8A 2UYFA 3THIA 2GRVA 2I0CA 4OERA 3N5LA 4Q8RA 4PFYA 3PD9A 3OMBA 4ND9A 1SVXB 3ZKLA 3TTLA 3ZKKA 1LAFE 4JSDA 1JVYA 2VHAA 1B7HA 2ALUA 1Q1KA 2H5YA 3T9XB 2B3BA 3T9UA 2HQ0A 1R9LA 3B6TA 4U23A 3FVOA 4X9TA 5KCJB 4R6HA 3ODBA 1OQGA 4MLQA 1BKAA 4NTLA 5KCJA 2O7UA 4O3BA 1O63A 2DOJA 2I48A 1A55A 4GFRA 2Q9TA 4ELRA 2H25A 2VD3A 1MQGA 4JBZA 4DE8A 4Q5TA 4L17A 3S9EA 4EXKA 4LA9A 3R26A 2A5SA 3MBPA 2DXYA 4YB5A 3V5AA 1EZOA 3RGYA 4XKRA 3U94A 5L8DA 2DS9A 5HM4B 4NE4A 2UVHA 3MVWA 4LZ5A 4WEDA 4N6PA 1NNKA 3TYHA 1EU8A 1XVYA 2O6AA 1LB8A 4P0IA 1DTGA 3K00A 3UIFA 3DELB 3PPOA 1B2HA 1ZMGA 5HBCA 4ECFA 3VXBA 4GF8A 3MVXA 4KHZE 1VFDA 3SETA 2P1SA 1NNTA 1NH8A 3SEVA 1QUIA 3VLWA 3TQWA 4OESA 3B6WA 3PU5A 2XXPA 4IO6A 1ELJA 4H1XA 2NUVA 3MP6A 4YB7A 1ZKBA 4LQ2A 3N6UA 4OENA 2KLFA 3IOWA 1UIUA 3F11A 1FTLA 2ZXTA 5JK4A 4JB7A 3N94A 4BDMA 3QYTA 4ZDMA 3FXRA 2XXRA 2O1LA 3S4UA 4M1VA 4YB6A 5CRYA 4NF6B 1FQAA 2D21A 4QSDA 3IAZA 3N6TA 4NF6A 3I6VA 3IOTA 1BP5A 4F1UA 4TQUQ 4U1ZA 3H7MA 3UK4A 1TFDA 3D4CA 3CIJA 4QF9A 2I6EA 2NOOA 4TLLB 4EDPA 1I6QA 2M8CA 5DEXB 1LFGA 3LUYA 4R75A 2RKMA 2AL5A 1YTVA 5DEXA 2QPQA 2DWAA 4F22A 2H99A 2DXRA 4XKPA 2CMOA 3EQ1A 1F9BA 2F36A 4RA1A 3EN3A 3MZ9A 4EUOA 3TEPA 3KSJA 3E3KA 1MXVA 1OQHA 1WVJA 3V8XB 2PT1A 5DYHA 4XIGQ 4YKPA 2P0SA 1DPEA 1Y3PA 1TT1A 4I1DA 3O66A 4P11A 2I4CA 4YZZA 4GLIA 1PB9A 3U72A 1MH3A 1MXXA 4ESWA 4F2QA 4BLAA 1US4A 3FVKA 4E0XA 2Q2CA 1PBPA 3VV5A 3TELA 4NMYA 1B7UA 3V83A 4OEVA 4XKQA 4DIGA 3Q29A 5EHSA 2ZYNA 1FTJA 4GD5A 4F3BA 2DSFA 2PVUA 1Q35A 3MWBA 1YPNA 3QSLA 3KFMA 1PDAA 3ZSFA 4OYVA 3CVGA 3JYRA 2Z22A 3IR1A 1URGA 1P1QA 1QKBA 3LSWA 4YICA 2XX9A 1RYXA 4RK9A 1I6BA 1B40A 3H6UA 3RNNA 3K6XA 3JV9A 1H76A 2O51A 3LR1A 3UN6A 2QSXA 1MS7A 1LAXA 3FJ7A 3MQ9A 1TXFA 2UXAA 1B4ZA 2ZYMA 3G3GA 2H98A 5F1QA 2X7PA 4IY6A 4ZZAA 3TTRA 1IQ7A 2F35A 1NH7A 5TPAB 1FQFA 1CE2A 5ITPA 5TPAA 3RT8A 1OMPA 1MY3A 3LSFB 3FASA 5FHMA 1LSTA 3OO7A 3QK6A 3GBAA 1SBPA 1LBBA 4X48A 4YKKA 1QUKA 4R6YA 1CB6A 2V84A 4H67A 3EHSA 4OWDA 3DP8A 3CG1A 1BIYA 3IK6B 2W7YA 1Y4CA 5F7VA 2UVGA 3FATA 2G93A 4YMBA 5IKBA 3KSXA 1IUDA 5DVJA 3L6HA 3ONMA 4MBPA 1B51A 3FUZA 3K6VA 5L9OA 2G29A 2FNCA 1URDA 4JSOA 4IB2A 3G3IA 4MH5A 2QJEA 4BDOA 5FTIA 3FD3A 3PUYE 2HFBA 3MP8A 1LCTA 4O3CA 3K2DA 3UA8A 3G7WA 4F2OA 4H0WA 4NF5B 4RYAA 3RY3A 3O6GA 3RQTA 1I69A 1JETA 4NF5A 5M2VA 3FJGA 4ZZEA 1A99A 3T9HB 4ELOA 3OSQA 4IGRA 1AH5A 1XS5A 5ICQA 1IIWA 3R6UA 4QFPA 4R2BA 3KN3A 4QRZA 2V3UA 4ZE8A 2IEEA 2I3WA 5CMMA 3E4RA 4R9FA 2Z8DA 1VR5A 3G3JA 1Y9UA 4AQ4A 3HV1A 1MQDA 2PX1A 3H4ZA 2HZKA 2OJTA 1XHYA 2XHDA 2O84X 4UA8A 4KYSA 2WKYA 1MQIA 1MY0A 1N76A 2F7CA 5AA4B 3C33A 4NWCA 4U4XA 4RK2A 1B5HA 5AA4A 1MRPA 1SW4A 5L9SA 4ZEKA 2FA7A 5AA1A 3K6UA 5FHOA 1PC3A 4U2RA 3GBBA 1A8EA 4RXLA 4X1BA 3FV1A 3G3HA 3IB2A 4LZ7A 1D9VA 3HSTA 1N04A 3C32A 3SEYA 4BDLA 1SW2A 3U92A 3SEXA 4JXIA 1QKAA 4PFTA 4G8NA 1MXWA 2ANJA 2H4IA 1Y1MA 4BDRA 1JW4A 1LFIA 3IX1A 3PUXE 1R6ZA 4F19A 2NWJA 1NNPA 2PT2A 4FAJA 3EPEA 3C4MA 3IB1A 4PFUA 2UVIA 3T96B 1FCKA 2ONRA 2VOZA 3E13X 3MP1A 4POXA 2Y7WA 4OXVA 5CC2A 4TOZA 3M3FA 2RCAA 1LLSA 3CFLA 3G3FA 1B7ZA 1UTHB 1SI0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B6HA 4NF8B 5FTHA 3KJTA 5I84A 1UTHA 4KPTA 3Q28A 5IZ3B 4NF8A 3QUJA 1XC1A 5IZ3A 4F1YA 1H45A 2X26A 1XT8A 3BBRA 2Y7RA 1II5A 4IO7A 4RNSA 3SZPA 4P1LA 4EF2A 3M8UA 3K6WA 5LTCA 4EF1A 1A8FA 3TFLA 5CM6A 1O64A 5ESYA 1NNFA 2REJA 1HSEA 1FBFA 2DYXA 1B3LA 4GRKA 5HPQA 4FORA 1P1WA 1DSNA 1GTKA 3D1RA 4O94A 4U4SA 1Z7ME 4OZ9A 1O7TA 1JNFA 1POY1 1IXCA 1USYH 2O69A 4R72A 3TQLA 1VDWA 3MSTA 1FBDA 3TTMA 1Y4TA 1MDQA 4GX6A 2F97A 4KYEA 2OX3A 1FTOA 4PC9A 3CR9A 5I56B 1MXZA 1MY1A 1P1UA 3IFAA 5I56A 4KCCA 5LOMA 2ONSA 3UGWA 3CRBA 4GWOA 2DDKA 4OETA 2XD2A 4FE8A 1B9JA 2F7BA 4PDHA 1DTZA 2DE2A 1ANFA 1RYOA 2RC7A 3LSXA 4ZECA 1N0TA 1URSA 2DQVA 5CMKA 4G8HA 5ELVA 1A40A 2RC8A 3T1BA 1LB9A 4MNPA 4RY1A 1D3KA 1IXHA 2PBWA 3K1MA 1SPIA 1Y1ZA 2ZMBA 4QFLA 1SI1A 1PBQA 1B3HA 4ZS9A 1PB8A 3PUZE 2XXYA 4OHNA 4U22A 2R6GE 3SDFA 1DCUA 1YAEA 2CEXA 3IFCA 5K2XA 4DDDA 2Z8FA 2XXQA 3GZGA 3VDFA 4PDDA 2Q8MA 3IO4A 2UYEA 4ZEBA 1Z7NE 5TP9B 2CZLA 2QS1A 2HPGA 4GWSA 4IO5A 2Y84A 3PPRA 1T0KA 1FW0A 5TP9A 5TU0A 3RTFB 5H8HB 2Q2AA 3Q25A 3IOVA 1OIBA 4UACA 5H8HA 4C0RA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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