3MMW | Genus

Total Genus 130

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	130
sequence length	309
structure length	309
Chain Sequence	VDPFERNKILGRGINIGNALEAPNEGDWGVVIKDEFFDIIKEAGFSHVRIPIRWSTHAYAFPPYKIMDRFFKRVDEVINGALKRGLAVVINIHHYEELMNDPEEHKERFLALWKQIADRYKDYPETLFFEILNEPHGNLTPEKWNELLEEALKVIRSIDKKHTIIIGTAEWGGISALEKLSVPKWEKNSIVTIHYYNPFEFTHQGAEWVEGSEKWLGRKWGSPDDQKHLIEEFNFIEEWSKKNKRPIYIGEFGAYRKADLESRIKWTSFVVREMEKRRWSWAYWEFCSGFGVYDTLRKTWNKDLLEALI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Thermotoga maritima
publication title	Biochemical characterization and crystal structure of endoglucanase Cel5A from the hyperthermophilic Thermotoga maritima. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Endoglucanase
total genus	130
structure length	309
sequence length	309
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date	2010-04-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3mmwA00

4HPGA 3U5YA 4AIUA 3CUJA 3WMSA 4AZ5A 1E6XM 1V03A 3CHDA 4V28A 4JFTA 1HKKA 3PZNA 1GCYA 3PTMA 3RCNA 2CIPA 4W88A 4U3CA 2CESA 2YKKA 4GINA 2JF6A 1U30A 1CZ1A 2WCSA 3ARUA 1ISYA 4TVUA 1JYNA 4TX8A 3CH9A 3AZTA 4GO9A 1MXGA 2DT3A 1EO5A 1I75A 1CNVA 1LG2A 3AHXA 1R8LA 4CKQA 3K8LA 2XM1A 2DSZA 2Z1SA 4F9DA 1G5AA 4GI8A 5HOSA 1HJWA 4CU7A 1TFVA 1CXKA 2BV9A 1EA9C 2PI6A 3KEHA 4P8WA 1VRXA 2OYMA 1UWSA 3AMKA 4PTVA 5CJ5A 3GNOA 1FH8A 3WH8A 4BQ3A 2BVDA 3L4XA 3MKKA 1VENA 2WCGA 3SCQA 1GOMA 2CHNA 2J4GA 3WL1A 1XCXA 1CWYA 1KR0A 4MB5A 3WUGA 1U33A 1VFFA 2E8ZA 3APGA 3F5KA 2ZUNA 3ZJ8A 2O9TA 3M7SA 5A6MA 1OIMA 1KXQA 1DTUA 1JNEA 3NJ3A 3E1F1 1B1YA 2YDSA 3UESA 3WH9A 1MYRA 3W25A 2F8QA 1NOFA 5BXTA 2BHZA 5I23A 3BAYA 3NIYA 3BMWA 3SCOA 1C93A 4PMYA 1VEOA 3MMWA 1E0XA 4M56A 2OLHA 3VIOA 4J3TA 3WF1A 1FHLA 3VD7A 3BLPX 2WZHA 4PMRA 3ARVA 1UWTA 1PX3A 3UERA 1JG9A 2Y5EA 1UKQA 3OLGA 3SUWA 3LPOA 5HPCA 3SEPA 1E70M 3VMOA 2A3CA 4M24A 3T2OA 1ZBWA 4HZ8A 3PZ9A 4ATWA 3CUIA 3KWXA 2VZTA 3VD9A 2XFYA 3GXMA 2CCRA 1V3HA 4R5EA 2YL8A 3FHQA 2J8FA 2WNWA 3VINA 1I1WA 1G94A 2VR5A 1BYBA 3WBAA 2OYKA 4LGXA 3KL0A 3OGRA 3DECA 5E9AA 3AMGA 4KGLA 2PF0A 4CD6A 4UFKA 4AZHA 2XFFA 4HU8A 4D6EA 1HJXA 4WSKA 4UFHA 3ZT5A 2EQDA 4JHOA 4JCMA 3VD3A 3VUPA 5A8NA 2TAAA 3WEMA 1ECEA 2CBUA 2CBJA 4Y7EA 2YL9A 1ZBCA 2ZXDA 4OOZA 4MNMA 1KGXA 5ABEA 5A6BD 2J77A 1HJSA 4JIEA 2O92A 4Z2LA 2C0HA 5CG0A 1B3VA 2Z1KA 4W5ZA 2J7CA 4LYPA 1WNOA 3ARZA 5E09A 1VIWA 3WD4A 1HP5A 2EPOA 3PZMA 5DO8A 3TOPA 5LA1A 4AD5A 3K1DA 4YN5A 5A6BA 1BYDA 5CLWA 1WE5A 3WQ8A 1J9YA 4FLSA 2DSVA 1H2JA 3B9DA 3AHTA 3NCOA 1WDQA 4WIWA 3U7VA 2W91A 1UZ1A 1GUVA 1WPCA 3L4YA 3QOKA 4BCEA 1J0ZA 5D9PA 5BROA 1E4MM 4W93A 3WEOA 4GXPA 1GVIA 2J7HA 3EDJA 1O7AA 5A69A 2G8ZA 4DWSB 4HZ7A 3W53A 4AY1A 1UKPA 3VNYA 3WSUA 3AYSA 2WHJA 3WD1A 3CIVA 2CBIA 3MUY1 3A6OA 1GOKA 1QOXA 2DIEA 2WXDM 4CD8A 3VNZA 2EPKX 2D0HA 1UQZA 1BVNP 1UA3A 2EO7A 1B3WA 4AMCA 2JF7A 1BGAA 4AISA 1UHVA 1VBUA 4B3LA 5M3WA 3W38A 5JBFA 3K4DA 2DIJA 4DWSD 4TVCA 4HTYA 2WMKA 1JDDA 1ZBVA 2YOCA 3UG4A 5CLTA 2DT0A 3II1A 1J0HA 1GQLA 1EO7A 4PMXA 1PIFA 5I5RA 1E4IA 2ESCA 1B3ZA 4UNIA 2X0YA 2WHKA 1JF5A 3FW6A 1EDGA 4D6IA 3WDJA 2BHUA 2GDUA 1DHKA 5CSYA 4DWSA 1S46A 3DC0A 2D0FA 3A3HA 3MUZ1 3IJ9A 1AMYA 3ARWA 1OM0A 3VGGA 1Q6EA 5C8BB 2FDMA 3OIHA 5D8WA 1W1VA 5EMYA 2AMGA 4XV0A 1W1PA 2CPUA 2G41A 4GI9A 1QHOA 1F4HA 4W8BA 3CBWA 4JKKA 1FH9A 2PWFA 3LPFA 1KR1A 3IAQA 3KZSA 4UTFA 2IXUA 3A4XA 4GI6A 3CMGA 3VIKA 3CZLA 2EPNA 4H7VA 3T0AA 4J3WA 2RGMA 1V6UA 2MANA 1BPLB 5E70A 4ZXOA 1BHGA 4PUDA 4OOUA 1OGGA 3VPLA 2WSKA 5D9OA 4BZYA 1CBGA 4HPHA 1CYGA 4YHEA 1R7AA 2NSXA 5CQ1A 1VAHA 3SCTA 3AIWA 1KB3A 4DUXA 1NH6A 3T09A 4H8VA 4P7RA 2OSYA 3ZQ9A 2W61A 5EB8A 3VO0A 5AC5A 4CN4A 1RPKA 1J0JA 2G3IA 1H11A 2D22A 1RP9A 3AIUA 3GYCA 1HL8A 1TA3B 1H1NA 4GIAA 3RPMA 2XSAA 5A94A 3TONA 4CD7A 3MU7A 2ZX7A 1HKJA 4UOZA 1OB0A 2C7FA 4MAVA 5A6JA 1WP6A 3QHMA 1KQYA 1HJUA 2W63A 2BY1A 5I6SA 3RILA 2Y8VA 3W6MA 1MXDA 2FHCA 2W62A 1KCLA 2WK2A 2XTKA 5I78A 3AIQA 2YDRA 3WF2A 2X8RA 2EJ1A 2YL5A 2FH6A 1XSJA 2D20A 4ZE4A 5JIPA 3SCWA 4CD5A 2ZUWA 4XZWA 1M04A 4OJYA 1QI2A 1ISZA 1QHPA 2CHOA 1ITXA 1BGGA 1JD9A 3OGVA 1XYZA 1BG4A 1EOMA 1NWRA 1UWIA 2YBTA 4LPCA 4PMOA 4C7DA 1D3CA 1E3ZA 3GBDA 1NP0A 3CO4A 3PZUA 1OBAA 4AD4A 2ZXQA 1GOQA 1Q6FA 4JKMA 4JKLA 4PMZA 1UD6A 2WW5A 4A3HA 1NARA 2XVLA 1LG1A 3AFBA 4DM2A 3VDHA 1LF1A 4EE9A 1TG7A 2JALA 3SCSA 2VVSA 1ISVA 2ZE0A 4NF7A 3POCA 1R85A 4P7LA 1M7XA 3TTSA 4M29A 2VRQA 1G9HA 3BC9A 4QAWA 3MMDA 2J7GA 2E4TA 2BXYA 4P7OA 2Y8KA 2FGLA 1R87A 4ZFMA 4J28A 3CHEA 1VEMA 3ZM8A 3CUHA 2BY0A 1QNQA 2A3EA 1WDPA 2A3HA 2IXVA 2V3EA 3MSDA 3WL0A 1NOWA 1C7SA 3VX0A 5KZ6A 3WQ5A 4KH2A 2ZICA 1V0KA 4S3KA 1EDTA 1H41A 5D8ZA 3I3BA 5IHSA 3N13A 1M03A 1MQRA 5DT5A 1SMDA 2XVGA 4K68A 4U5KA 3DYOA 1CXHA 2WPGA 4J3SA 4X9YA 4BS0A 2Y24A 1W9XA 1E6RA 1BYAA 3ARQA 1J01A 3MV11 3NSXA 4M82A 2E9LA 1VJZA 4BQ5A 2EBNA 2QMJA 3FHAA 5A95A 1W9BM 3WN6A 4EANA 4YHGA 1HKIA 3AHVA 4FF5A 1WZKA 2VI0A 5AYIA 3W6LA 2J78A 1JI1A 2VQTA 1HVXA 1BQCA 1DWJM 1MW3A 1QPKA 3PZIA 4CCDA 3T0BA 3SUUA 5BYWA 3MS8A 1KGUA 3NSMA 1IV8A 1KGWA 1UD4A 1XC6A 2WVSA 5ECUA 1B3YA 3WD0A 1JZ6A 5A2CA 1XH2A 2NT1A 1JFXA 1WCGA 2CKRA 1BYCA 2VTFA 1J11A 2FHBA 5JBDA 2B31A 3VMPA 1XH0A 1G01A 4HOZA 1HT6A 1PIGA 3WFZA 3WUEA 3L2MA 4D6FA 1W91A 3L4TA 1HX0A 2DT2A 3THCA 3CZJA 4Q22A 2XG9A 5JIWA 1KBBA 2C8NA 3N18A 1GOWA 1HN1A 4PUEA 1CENA 1JZ3A 4AYSA 2BS9A 4F79A 4H8HA 5M5DA 3AI0A 1BLIA 2WYSA 2Y4SA 4PTXA 2DGAA 3RM9A 1XD0A 4ACZB 1QNPA 3W81A 2E0PA 4JL2A 5FCZA 3VGBA 1G0CA 2D2OA 4IUGA 3WDRA 4XB3A 5CPQA 4D1IA 5FD0A 3VIPA 1C8XA 3U7BA 3WUBA 2OWCA 4UR9A 3ZJ6A 5BXPA 5KEZA 4GQQA 3WUFA 3ZMRA 5A6AA 4B9YA 1XV8A 4CUCA 5E6ZA 2WC4A 3WEZA 1CGWA 3SCNA 5LYRA 5IFTA 1KBKA 3UETA 1HJVA 1UH2A 2XVNA 1B3XA 1KFWA 1O6IA 1U2YA 2ZX6A 3TTOA 4ML4A 3WQ4A 4KRTA 1W2VA 3VMNA 2HVMA 3L4UA 1W9VA 3CUGA 4ACZA 3T08A 4U2ZA 3WQVA 4CU6A 4Q7NA 4LYQA 2ZUSA 4XX6A 1JXJA 1BAGA 3VM7A 1DP0A 2XPKA 4OBSA 2XFRA 3SCUA 2PC8A 2V38A 1ODZA 3D3AA 1NWUA 3ARPA 3WELA 1FH7A 3W26A 4V27A 4AC1X 1VEPA 5HBFA 4X0NA 1AQHA 3L4ZA 1YQ2A 1W3KA 3FXYA 5BCAA 2HISA 2X05A 5M03A 3ALFA 3ARXA 3IK2A 1OD0A 4RE2A 3U57A 2DSWA 4Z2IA 3CTTA 1KCKA 5A6KA 1E1FA 3AICA 8CGTA 1V3IA 1UOKA 1GHSA 2YA2A 1H3GA 2XGIA 1IT0A 1XHGA 2YLAA 3FY1A 2VT0A 4GZEA 3CGTA 3NSNA 2BY3A 4X0VA 1H09A 1W3JA 3SUTA 1DWGM 1BF2A 1FA2A 2JEPA 4UZSA 2V3FA 4JFUA 4JFSA 4MNLA 1E73M 1X6LA 4BF7A 3AROA 3WNNA 2YJQA 3VD4A 1W1YA 2WLYA 1UD2A 1CGYA 1UR0A 1V3LA 3W0KA 2V5DA 4PMQA 1GJUA 3EDKA 3JUGA 3WF4A 4NRRA 3WF0A 1R86A 3EDEA 1ISWA 3VIMA 1V08A 1V3KA 3SCPA 3D5HA 4AWEA 1MVYA 2VURA 1UR8A 5A8QA 5CGTA 3PZTA 3AIRA 1V6XA 1K6AA 5BXSA 2WC3A 4MB3A 3AMCA 2VX4A 1E15A 1F4AA 3ZT6A 4P7QA 2JIEA 3K8KA 4WSJA 4XUYA 5F7UA 2JE8A 3EMCA 3PZQA 2GDVA 1HXJA 2YBUA 1GONA 4J3UA 3ECQA 2QLYA 2ZX9A 1UYQA 3A4WA 4PBGA 3RMEA 2D1ZA 4S3JA 4RE4A 1QI3A 4AW7A 1L0PA 4NSBA 4M80A 3VKKA 2VRJA 1CLVA 4MAZA 6TAAA 3RIKA 1GQIA 4CVWA 1XSKA 4HMCA 2XYLA 1QI5A 2O9PA 1E6QM 2F2HA 3QHNA 3W37A 4H2CA 1RH9A 3N1AA 5IDIA 2W4XA 2G3JA 1V3MA 1QI0A 5AC4A 2XHYA 1W9PA 1J0KA 2DH3A 2BY2A 2X09A 2VMFA 3OG2A 4F9JA 4UQCA 3OLEA 1CECA 5D9NA 1PJ9A 3WKZA 1W9DM 4F66A 1JD7A 2Q8XA 4PYSA 4RL3A 1WB0A 1HIZA 4U5IA 3AOFA 5CPTA 1UG6A 2ZUTA 4E8DA 1WDSA 4WKFA 3VDBA 1I1XA 3PBGA 2CYGA 3AIVA 3M46A 1OT1A 4TUFA 5M17A 1JZ2A 2WANA 1H0IA 2VCBA 1TE1A 4KGJA 3G6LA 1JYXA 1C3FA 2DEPA 1E6SM 3M07A 2WC7A 1H49A 3MO4A 4DWSC 3RO8A 2VR4A 4MADA 4DM1A 3HU7A 2VX6A 1GQKA 2GJRA 1FOBA 1XRVA 4AXNA 3AS1A 4W7WA 4J3XA 2GSJA 1IZJA 1EH9A 2D3NA 4Z2HA 2E9MA 2WVUA 1WZAA 1OGSA 4W5UA 4ZXLA 1UZ4A 1RD6A 2E9BA 1EOKA 2EPMX 3KL5A 4D6JA 4HOXA 1UUQA 1MW0A 2BNJA 4LYRA 5EFDA 4UFLA 1OSEA 2G4FA 4UQDA 4HMDA 1X6NA 3W4RA 4UCFA 2DQXA 4R27A 1MW2A 3SUVA 4D71A 4H8UA 4PSRA 2FH8A 1JZ7A 1J12A 1DWHM 1US2A 1Z32X 3AQUA 1JZ8A 1M53A 4QCFA 4UFMA 3A4AA 1EXPA 1TZ7A 3FAXA 1E55A 1KXVA 1QBAA 3WQ6A 1E43A 1B0IA 1C8YA 2DSKA 3UCQA 2YDQA 5C70A 1VF8A 4WJXA 3WY1A 2QPSA 1HNYA 1HL9A 2VRKA 2E8YA 2A3BA 1KXTA 2ZX5A 5GNYA 5DF0A 4N42A 2BHYA 7CGTA 4WF7A 1QW8A 3GH4A 1LJYA 2X2YA 4CCCA 2BXZA 3BSGA 1WAWA 3VIIA 1TVNA 3BMVA 5EFFA 2XSBA 4D6HA 1E5NA 2CBVA 1GPFA 4U33A 3VM5A 2UY5A 2XWEA 4MJ2A 4B9ZA 2OYLA 1D7FA 4J27A 3CZGA 3GBEA 1MQPA 3NDZA 1HJQA 3BXWA 1CEOA 2PB1A 3AXHA 2VZOA 4KMQA 4IM4A 3QGVA 4QLJA 1PX8A 4GZIA 1XSIA 3ARRA 4H41A 4MNJA 4PRWA 1FFRA 4AD2A 1ZBKA 2J74A 2XIBA 4HA3A 3RDKA 3VIHA 4OZOA 3O6AA 1FHDA 2XVKA 1CXIA 1BVZA 4U2YA 5I24A 1P6WA 3VILA 3MMUA 2J7FA 5A2AA 5ABFB 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1PEZ A;  3RM4 A;  4B16 A;  1TA3 A;  5E0F A;  1Y7V A;  3ZIZ A;  4AZG A;  3WFL A;  2JFE X;  5FL1 A;  1DWI M;  3CZE A;  1C90 A;  2VOT A;  3W29 A;  3NYD A;  5I77 A;  3IAN A;  3OLD A;  1GW1 A;  4MB4 A;  3ALG A;  1V0M A;  2VUY A;  4P8V A;  1C91 A;  3ARS A;  4M8U A;  1W9U A;  1PX4 A;  1PPI A;  1B30 A;  1C8Q A;  3AIE A;  3ZST A;  1FP9 A;  5CXP A;  1V0N A;  4RE3 A;  4GKL A;  5A8O A;  3ZT7 A;  4Z2G A;  4CVU A;  4C7F A;  3POH A;  4YPJ A;  2GK1 A;  1JZ4 A;  3TP4 A;  3ZJK A;  1EIB A;  3AZR A;  2VO5 A;  1NQ6 A;  1OIF A;  4FK9 A;  1QVB A;  3AIS A;  1WO2 A;  3GDB A;  4CN1 A;  3GH7 A;  5C71 A;  1RP8 A;  4PMD A;  2ZID A;  4W7V A;  3DYM A;  4W86 A;  1K9F A;  4JFW A;  1DED A;  2WMF A;  2OSX A;  4B3K A;  2NW0 A;  4W85 A;  2BVT A;  1JDC A;  3QOM A;  1NOU A;  3VX1 A;  1JAE A;  1W3H A;  5BRQ A;  1B31 A;  3GXD A;  2A3A A;  2WSP A;  4QFU A;  1LQ0 A;  1E5J A;  3WQW A;  2G3M A;  3ZOA A;  3VTR A;  3B9A A;  4ATL A;  3GXF A;  3PN8 A;  3AJ7 A;  5DMY A;  2GVY A;  3SUS A;  1BG9 A;  3CZK A;  2WM0 A;  3N9K A;  3EYP A;  1JDA A;  1CGX A;  4ATD A;  1OD8 A;  3HN3 A;  4TVD A;  2WBK A;  1H4P A;  4PTW A;  4OBR A;  4W8A A;  1J18 A;  5I2U A;  1MWO A;  3UEQ A;  2WMG A;  2XJ7 A;  2WHM A;  4E4P A;  1VBR A;  4GPN A;  5GNX A;  1CGV A;  3CHC A;  1JIB A;  4NZC A;  4W8L A;  3G6M A;  4OKD A;  2YIH A;  5CZK A;  1EHA A;  4UFJ A;  1E72 M;  3B9E A;  1XH1 A;  3CHF A;  5GNZ A;  5BRP A;  2VL4 A;  1UR4 A;  1QNR A;  3NDY A;  3OLI A;  5LA0 A;  2D23 A;  4ZE5 A;  3W27 A;  1SR0 A;  1FP8 A;  4L4P A;  3ZR5 A;  5A1A A;  1JGI A;  3AS2 A;  5BWF A;  5JUV A;  4NRS A;  2YLL A;  2ZUV A;  3LMY A;  1KWG A;  3WD2 A;  3WMC A;  4WKA A;  3ZR6 A;  5A6S A;  4NI3 A;  4Z2K A;  2X0H A;  2W67 A;  1ESW A;  4E2O A;  2YL6 A;  1BTC A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3LPO A;  3U2O A;  4ZOA A;  1JPI A;  4UR8 A;  2A3C A;  3KUM A;  1Y8B A;  3T2O A;  4HZ8 A;  3KWX A;  3B0P A;  2HRW A;  2VZT A;  3A5F A;  5B7Z A;  3LZ3 A;  3W2U A;  5E93 A;  2WNW A;  1I1W A;  1PV8 A;  5G2W A;  1R5Y A;  2CZV A;  1BYB A;  1H61 A;  4DPQ A;  1UZD A;  4LGX A;  1N55 A;  5E9A A;  4KGL A;  4JX6 A;  2HNE A;  5EU9 A;  2AMX A;  3QZA A;  3QMS A;  1HJX A;  4WSK A;  3ZT5 A;  2QGY A;  3UJF A;  3VD3 A;  5D32 A;  1V8E A;  2J27 A;  4UMA A;  3UY8 A;  3LZ5 A;  1ZBC A;  4KW2 A;  2B7N A;  1KGX A;  1AD4 A;  1HJS A;  3TNB A;  2C0H A;  9RUB A;  2Z1K A;  3JRK A;  4AFY A;  4W5Z A;  2C1G A;  4JGD A;  5E09 A;  3CH0 A;  3MI3 A;  3T55 A;  3LQG A;  4IFR A;  3MP5 A;  3PZM A;  5LA1 A;  4GUH A;  4YN5 A;  1BYD A;  4H00 A;  3WLS A;  1WE5 A;  3WQ8 A;  4NYY A;  4YS1 A;  1A5S A;  3B9D A;  3NA8 A;  3DN5 A;  2X0S A;  4WIW A;  4EIV A;  1UZ1 A;  4QS5 A;  4DJF A;  3QOK A;  5BRO A;  1E4M M;  4EPD C;  4W93 A;  4O54 A;  4Z1C A;  1RJR A;  2DJL A;  4DWS B;  3W53 A;  1Z44 A;  4AY1 A;  5CEW A;  3LER A;  4UUI A;  3VNY A;  3TCS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3MMWA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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