3MN5A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
354
structure length
347
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRVGDERTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 119
structure length 347
sequence length 354
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn5A03
5AQZA 2V51B 4BC2A 4EAHD 3M3ZA 5AQRA 2DPNA 4YDUA 4A2BA 4B1VA 4B1WB 4BR4A 1MWMA 2D1KA 4H5RA 1ATRA 1NGEA 4HWIA 2W41A 1YUWA 4PKIA 3QBXA 2P9LB 5AQSA 5AFUH 3UKRA 1G99A 4O5FA 3KVGA 4BC5A 4H5TA 3MN9A 3CJ1A 5BRDA 3D2FA 3VETA 5JLHA 4CZHA 3GBTA 5ELZA 3DJCA 5BRHA 3O8MA 2HMPA 1XUPO 3ZX2A 2P9KB 3SMPA 3VGMA 4IXCA 3ZEUB 3QMLA 2E2QA 3VGKA 3R6MA 4GY2B 3FR0A 5AZIB 4CZIA 5BPNA 4BRQA 4H0TB 3RSEA 2QM1A 4DHYA 2CGKA 3A5LC 3L4IA 1WUAA 4WYBA 3SLCA 4BREA 4MLEA 1GLFO 3MCPA 1Z6RA 3U9ZA 5I9EB 2IVPA 3R9PA 2FF6A 2VYPA 5FPNA 2D0OA 4FWPA 3UKUA 4CZKA 1MA9B 4JHDA 3LM9A 1ATNA 2VWBA 4F9OA 3O5BA 2PAVA 3IUCA 4AM6A 5ADXA 4AM7A 4CBWA 2E2NA 3FZMA 4WQ4C 3IDHA 4O8KA 4A2AA 4IWVA 4CI6A 2GUPA 4L3QA 5AQQA 3BEXA 4LC9B 3F9MA 4ISGA 1GLLO 4WQ5C 3TPQA 4WQ5A 5KQDA 5AFUA 3BUZB 4IZ9A 4A61A 3GOIA 2CGJA 2W40A 1X9JA 1TYQB 4PKHA 5AQWA 4M7XA 3C0BA 3SK3A 1HKBA 1GLEG 5AZJA 3MN6A 3M6GA 4CZFA 4CBUA 4HTLA 1YXQA 3VGLA 4XEIA 2I7PA 2QWOA 5LY3A 3OHRA 4CJ7A 4QS8A 5KPZA 4IO8A 4JN4A 3UKRB 1BU6O 1RDWX 3A0IX 2NZTA 5AQNA 2F9TA 3FZKA 5JLFA 3SJHA 5AQHA 4BQLA 4FWRA 1T6CA 3D2FB 1GLBG 3VESA 3VOVA 2VCPA 1ZBSA 5AQJA 1NGFA 3CJ9A 1JCEA 3CERA 3CJCA 3GL1A 4K42A 3QDKA 1NBWA 2E1YA 3FZLA 3O80A 1NWKA 1MWKA 3RSEB 3VF6A 3BP8A 3QBWA 3W0LA 3U9DA 3DXMA 4BRMA 1NMDA 2GWKA 4BR0A 2ASOA 3H46O 3JXUA 2FXUA 4DQ8A 1NGAA 3IMXA 4CZLA 2NRHA 3ATUA 4M7YA 3UKUB 2YHWA 4JHDB 3CQYA 3KHYA 3WXKA 2QWNA 3WEEA 4FSVA 1XC3A 4FWSA 1HKCA 2CGLA 3EN9A 5FPDA 1KXPA 2ZGYA 4C23A 4YDUC 3WXIA 1BA0A 3CQXA 3M1FA 1XQSC 1IJJA 3IFRA 1P8ZA 2IIRA 5BPMA 3S41A 1GLJO 2YHXA 3BF1A 4FOEA 1NGBA 4Z94A 4XH5A 2IVOA 2GTDA 5AZJB 1D4XA 1BG3A 1X3MA 2YHYA 2ZGZA 4QS9A 4BRIA 4H5VA 4CD3A 2Q1NA 2OANA 1JCFA 2EWSA 3C7NA 4BGAA 4BC4A 1V4SA 1Z05A 4FPAA 2ZF5O 3GG4A 2E88A 4JNEA 4DB3A 3O1BA 3MN7A 5AQTA 4PL7A 4RWTA 3U8XA 1NGIA 3QFUA 3CIPA 2P9UA 3MN5A 3A5NC 4MLHA 5BRFA 5EVZA 2A5XA 4BR9A 4H0PA 2Q0RA 3LDLA 4KBOA 3ENOA 1H1VA 1NGJA 2P9SA 2HOEA 1KAXA 1ZXOA 3ULEA 3WUHA 2ZWHA 3UB5A 3AAPA 3DXMB 3HSCA 4JD2A 4A62A 3LDQA 2BTFA 3VPZA 3H3OB 3MMVA 2E2PA 3A5OC 1WOQA 4EFHA 1C0GA 4EIAA 4H03B 1E4GT 2QWPA 5AR0A 3WEEB 3UE5A 3BF3A 3HZ6A 4XH4A 2V7ZA 5KPTA 1TUYA 4RTFD 1NM1A 4CZMA 3CJBA 3I33A 4MO4A 2Q31A 3D2EB 2QW9A 3P4IA 3A8YA 1NGHA 2GELA 2A3ZA 3VF2A 5TKYA 5FPEA 1K8KA 3CI5A 4GNIA 2CH5A 1V4TA 3HI0A 3DXKA 2A6AA 3VEYA 4ISEA 1JCGA 2I7NA 3FGUA 4BR5A 3J8AA 2YJEA 2KHOA 3L0QA 5KPRA 5CE3A 1HPMA 2ITMA 1DKGD 2A41A 2GWJA 3DAWA 4PKGA 4QS7A 3C7NB 3WXLA 1NGCA 2P9NA 2HF3A 1SQKA 3KZBA 2BUPA 2AA4A 3H1VX 1U2VA 5EXWA 5EX5A 4BRPA 4B1ZA 5JICA 2P9IA 1Y64A 2HF4A 4FWOA 2ASPA 3GE1A 1NLVA 1DEJA 1BDGA 3DWLA 3R8EA 2NLXA 3VEZA 5KQ8A 1QQOA 2P9UB 3FZHA 4BR7A 2H3GX 5BPLA 5AQPA 1MDUB 4H0XB 2FSNA 3GDQA 2QWLA 5F2RA 5AQFA 2UYTA 1KAZA 4H5NA 2Q97A 3CHWA 3LL3A 3O4WA 1X3NA 2P9SB 3EO3A 4DCHA 4NO7A 5AQUA 2E8AA 3ULEB 1BOTO 4CZEA 3EKSA 4JD2B 1NGDA 2V7YA 2E1ZA 3D2EA 3MK6A 4ISFA 4RCHA 3O08A 3ZETA 1LCUA 4BRFA 4B1XB 5E26A 5FPMA 3W3DA 4BVPA 4FOIA 4K41A 1QQNA 1RGIA 1BWFO 1HLUA 4BRGA 1IG8A 1T6DA 1HUXA 4BRDA 5F0XA 1DGKN 5ADXH 3VEOA 1TUUA 2A42A 4I6MA 4B9QA 2F9WA 4K43A 1CZAN 1K8KB 5JMVA 5F1XA 1BA1A 2FLOA 1LOTB 4H0OA 3DXKB 1OKJA 5AQVA 2PBDA 4B1UB 3LM2A 4NB4A 4FWKA 2FF3B 3ZX0A 1TYQA 4J8FA 4BRNA 1BUPA 3FFKB 2P9NB 3AY9A 4BRKA 4Y0WA 1U2VB 4FWQA 4BRHA 4BQZA 5B8HA 5BN8A 2P9IB 4XH1A 4FL9A 3VF4A 1QQMA 5AQYA 2YI1A 1HX1A 4EHUA 2A40A 5AQGA 5BR9A 3VEWA 3WQTA 2QWQA 4M63C 5EY4A 1BO5O 5AQKA 2E2OA 1J6ZA 2P9PA 4IJAA 3ID8A 4CBXA 4H5WA 3VEXA 3EZWA 3MDQA 5AQOA 3HTVA 4BRLA 3HM8A 1Q18A 3B8AX 1GLDG 3FE1A 1U6ZA 3EKUA 3LDOA 1ESVA 3H1QA 4IJNA 3QICA 2YJFA 4WQ4A 4FO0A 5E84A 5BN9A 3VENA 3ZETB 2CH6A 3H45C 5AQMA 3ATVA 1HKGA 3VEVA 4MO5A 4BG8A 4BROA 4FPBA 3CJ7A 2ASMA 3WT0A 4BGBA 3G25A 4E1JA 4H0VB 3WQUA 5LJWA 2P9LA 5BREA 4BG9A 3EL2A 2Q36A 1SAZA 2D0PA 2GEMA 4H0YB 2Q0UA 4I6MB 1RFQA 5EOYA 3ZX3A 4BR2A 3O6WA 3ENHA 4BC3A 4CD1A 2P9KA 3LDPA 2AP1A 3TU5A 3ZEUA 1ZC6A 3H6EA 4PL8A 5AZIA 1R59O 2WUSA 4CZJA 5AQIA 1SZ2A 3SMSA 3JS6A 4K25A 3WXJA 2J4RA 2V52B 4BRAA 3U4LA 2QWMA 1S22A 3CETA 1NGGA 3O1WA 4FWMA 3QB0A 4B1YB 4FWLA 1YVNA 1S3XA 2FSJA 1C0FA 2D4WA 3HBTA 4EHTA 5LJVA 2E20A 4CZGA 1QZ6A 1YAGA 3D7EO 1HJOA 3FZFA 3AAQA 3L6QA 3CJAA 4BVOA 2QWRA 1GLCG 3A5MC 5AQXA 3I8BA 2YCHA 3H3NO 3LDNA 1EQYA 1E4FT 4JAXA 1T44A 4BRCA 2P9PB 2IVNA 3FLCO 1ATSA 3AARA 2Q2RA 2QXLA 3QFPA 1QHAA 1KAYA 4FWNA 1QZ5A 1GLAG 5AQLA 2FSKA 3VERA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JI6K 4JRQA 4EAHD 3HP9A 3MX2A 4JEPA 3F2KA 4B1WB 3PX0A 4HWIA 3MECA 3CCVN 3P83D 2GV9A 5HRRA 3QO9A 5AQSA 3UIQA 3UKRA 3C65A 4YFUA 4E72A 1G99A 3KVGA 4FK2A 3MWPA 5GADP 3TAMA 3CJ1A 4EP5A 5JLHA 1REVA 2W6KA 4BE1A 2VGMA 3GBTA 5ELZA 3RMDA 5BRHA 4KHYA 4DV7K 3OS1A 2HMPA 3K59A 3SMPA 5I3UA 3VGMA 4EP4A 4KHSA 3CCRN 3QMLA 2ETJA 3VGKA 5AZIB 4FZZA 3T69A 2CGKA 3OYCA 3L4IA 4WYBA 3SLCA 3SUQA 4DQPA 4MLEA 1GLFO 1Z6RA 2B4JA 4BE0A 4DTXA 2VYPA 3OJSA 2D0OA 3SAFA 4M42A 4FWPA 2E4LA 1MA9B 4F9OA 3LZJA 4GMJB 5ADXA 3FZMA 1RDDA 4IWVA 2Y1JA 4NCBA 3O3GA 5AQQA 3VTIA 4ISGA 4C8NA 5KQDA 4IZ9A 4WE1A 5FROA 1D8YA 1X9JA 4DV0K 3TI0A 1TYQB 1NKCA 4C1NK 5AQWA 4JI3K 4M7XA 1JLBA 3C0BA 3ZCMA 3MX5A 4KREA 4HTLA 1RTHA 2XY7A 4DLEA 1RILA 2I7PA 4DMNA 3OHRA 1VSFA 4CEAA 3UKRB 1S1TA 2B6AA 3A0IX 5JLFA 2VQEK 4AHRA 3VESA 1LAWA 4BDPA 3VOVA 1ZBSA 3KK1A 3CJ9A 4Z4IA 2KW4A 3SQ2A 3CERA 1M90O 2ATQA 3GL1A 2UUBK 3VQQA 3F73A 4LF6K 3QDKA 4JK9A 2G8UA 4OPAA 3DXMA 5IT9O 4IG3A 4BRMA 4DQIA 3JXUA 2FXUA 3HP6A 3H08A 3EY1A 5J2NA 3OW2M 3T1YK 4M7YA 1W0HA 1DTTA 3KHYA 3HO1A 2UXBK 3WEEA 4FWSA 2IC3A 3THVA 2WC9A 1L3SA 3EN9A 1QQCA 1ILYA 1EX4A 2FBYA 3J7AP 5AJ3K 4OPHA 3ZYYX 1SS6A 3QEWA 1P8ZA 3CC4N 4DQRA 3S3NA 1GLJO 1VQMN 4FOEA 4KKOA 3SJJA 4Z94A 4DLGA 2IVOA 2FC0A 4X62K 4DTUA 1LWFA 1X3MA 1RBVA 4BRIA 4B9VA 3NMUA 3K0SA 1JCFA 3D6RA 4DTNA 3AV9A 1KSPA 3L2VA 1N6QA 1Z05A 4FPAA 5FRMA 2ZF5O 3BZCA 2KFNA 3OJUA 4RWTA 3QETA 1N32K 1HR0K 4LF9K 5EU7A 3QFUA 3DM2A 3CIPA 3MN5A 3SQ1A 4DR1K 1KLNA 2X6NA 3RR8A 1EKEA 1ZBUA 4QOZB 2A5XA 2G8HA 2Q3SA 2PFUA 3CCMN 3JAMO 4KBOA 3VTHA 1VQNN 4MDAA 1X9SA 1KAXA 1ZXOA 4BDYA 2RF2A 3DXMB 1LW0A 3AVKA 1RBTA 4A62A 1QE1A 2BTFA 5GAEP 1KQSM 3CC2N 3PIOL 5C12A 1KVCA 4FZXC 3K5NA 3WEEB 4XH4A 1TUYA 4E1MA 4DG1A 4IDKA 5I42A 5HLFA 1GOAA 3P4IA 3A8YA 4CEEA 1NGHA 5C0YA 5TKYA 5FPEA 4LF7K 3RRHA 4CGHA 3NHGA 2G8VA 1IO2A 1SL0A 4O5BA 2G8FA 4M3ZA 3RWUA 4OPJA 2GWJA 3OYAA 1N8RO 2D0BA 3T1AA 3KZBA 2C1GA 1U2VA 2YKNA 4MFBA 4CW7B 5JICA 4CF2A 4B3RK 3GE1A 2WONA 1NLVA 1DEJA 1WSHA 4W5OA 1RBSA 4E3SA 3BGRA 4BR7A 4KH5A 5BPLA 3DLLL 5C2FA 2O8EA 1G15A 2QWLA 4DV1K 2Q97A 3O4WA 1DLOA 1CZBA 4DCHA 4DUZK 3S9HA 2E8AA 1O13A 4DSJA 2E1ZA 3D2EA 1SL2A 4RCHA 2F4VK 4BRFA 4DSFA 4CJUA 3AVGA 3CQ8A 4NCAA 5FPMA 4FYDA 3I8DA 3SUPA 5DM7L 1T7PA 5C15A 1Z25A 4N56A 4BRGA 1IG8A 1T6DA 2W42A 1HUXA 1D9DA 1TUUA 1CLQA 4M41A 1NMNA 2A42A 2NRWA 4EZ9A 1RT7A 1CZAN 5JMVA 4OLBA 2HW3A 1VQ7N 3LP3A 3OYFA 1LOTB 4H0OA 3PX6A 1R0AA 1B9DA 3LM2A 4NB4A 3V9XA 2FF3B 3ALYA 2GX9A 3ZX0A 3V9SA 1TKZA 3SAHA 4BRNA 1IBLK 4KHUA 3FFKB 3AA4A 3WNEA 1RT5A 1U2VB 4GKKK 2Z1HA 3CCUN 5C2DA 1RT2A 4F8RA 4KAZA 1QQMA 4JKHA 5AQGA 1L3TA 1JLGA 1D9FA 3OYIA 2NRXA 2E2OA 2O8EB 1HNZK 4IJAA 4QAGA 4WCEL 3PO5A 1RTJA 3MDQA 4KFBA 2KZMA 3DLHA 1Q7YO 4LFCK 3H1QA 3TTDA 3QICA 4JKDA 4WQ4A 2HVHA 4CK3A 3H45C 1HKGA 4FPBA 4IBNA 1VK0A 1YTUA 1VQ6N 3LWLA 3U6FA 3HOSA 3WQUA 4LFBK 3EL2A 2HHVA 3M8RA 3DLKA 3VQAA 4CGDA 1B92A 2HBKA 4BE7B 2LSNA 1YHQN 4I2PA 4F2RA 1S1UA 4M3YA 2X74A 4CEQA 4BC3A 3THXA 4UQGA 3MEGA 3ZEUA 1RT6A 3H6EA 3ZSZA 4IOCL 4CZJA 4OX9K 4K25A 2J4RA 4BRAA 4FLXA 2QWMA 1S72N 4LFAK 4B1YB 4FWLA 1S3XA 1C0FA 3HBTA 5LJVA 3U3YA 2E20A 2D0CA 4PY5A 4KTWA 3VA0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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