3MN5A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
354
structure length
347
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRVGDERTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 119
structure length 347
sequence length 354
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn5A03
4B1WB 4YDUC 2YI1A 3VF2A 2CH5A 3WUHA 4K25A 3L6QA 4PKHA 3VEZA 1MA9B 1S3XA 4FWRA 4BQZA 1ESVA 4CBWA 2CGKA 1DKGD 2YJEA 2YJFA 3O1WA 5BPMA 3ZETB 3JS6A 5AQOA 2PBDA 5KPRA 5F2RA 2GUPA 5F0XA 4JHDB 4BRGA 1TUYA 5JICA 5AQFA 1BU6O 3MN7A 3MCPA 4JAXA 5BR9A 2IVOA 3A5MC 1OKJA 4JHDA 5AFUA 2W41A 3IDHA 1LCUA 3WXJA 4PKIA 4JD2B 4CI6A 4PL7A 3U9ZA 1ATSA 3IFRA 4A2AA 4DB3A 4BC3A 2YCHA 4CD1A 4XH4A 2Q1NA 4BR4A 5AQIA 3WQUA 4MLEA 5BRDA 3QFPA 3SJHA 5KPTA 4M7YA 1HKBA 4ISGA 5AQMA 1V4SA 3VESA 3H3NO 3O4WA 4O8KA 4BR2A 4E1JA 4EFHA 1GLDG 2IVPA 1NGDA 3DXKB 3MN9A 4I6MA 3EL2A 4BRNA 4K41A 4BRHA 2PAVA 4GY2B 3QMLA 3DXKA 2EWSA 1BOTO 2W40A 5AQRA 3FFKB 3R6MA 5BRHA 1P8ZA 2YHYA 4HWIA 4Y0WA 1QZ6A 5AQUA 1J6ZA 5AQGA 4H0OA 1HKCA 2V52B 3GE1A 2IIRA 1MWKA 2NRHA 2P9PB 1QQOA 3CJCA 4BQLA 2E2PA 3GOIA 2GWJA 4BR7A 4JNEA 4F9OA 5AQKA 5AQQA 5AQSA 3C7NB 1D4XA 5BN9A 3U4LA 2Q31A 4FOEA 1SAZA 4H0TB 4BC2A 4AM7A 5BRFA 3FR0A 1QQMA 4MLHA 2QWLA 4FL9A 5AQVA 2I7PA 4ISFA 3ATUA 2J4RA 2NZTA 3C7NA 3CHWA 4BR9A 1NMDA 3O80A 2D0PA 1Z6RA 2D4WA 2HMPA 4CZMA 4CZEA 2QWNA 5E84A 1RGIA 2P9IB 3AAQA 3LDLA 3HM8A 5I9EB 2ZGZA 4EIAA 4O5FA 3ZX2A 3UKUB 4CZGA 2NLXA 4L3QA 2P9IA 1EQYA 2BTFA 4K42A 1Z05A 2FSKA 5ADXH 3I8BA 3GBTA 3L0QA 2A6AA 2F9WA 1SZ2A 4K43A 4BREA 5JLFA 4CZHA 2A41A 4BC5A 4B1ZA 1C0GA 3ULEA 2P9LB 3VEOA 5AZJB 3AY9A 4DCHA 3VERA 2QWRA 2QW9A 1BO5O 3A5LC 4CZJA 4FWMA 2YHWA 1CZAN 3WXLA 4LC9B 3VGKA 2P9NB 2P9LA 3FZKA 3SMPA 1G99A 4AM6A 2OANA 3WEEB 4WQ5C 5ELZA 3FZMA 3ZX3A 5KPZA 2GTDA 2ASMA 1S22A 3H6EA 1T44A 3DJCA 3QDKA 5AQHA 4B1XB 5FPNA 2P9NA 2UYTA 3H45C 4EAHD 2YHXA 3M3ZA 3WEEA 4WYBA 3UKRB 2AA4A 1JCFA 3ZETA 4BGBA 3HTVA 4CBXA 1KAZA 4FWNA 3LDNA 2QM1A 1R59O 4BRIA 4B1UB 4NB4A 2FSJA 2GWKA 2QWOA 3IMXA 5BREA 5ADXA 5FPDA 4H5VA 3JXUA 2E2NA 2V7ZA 3VEVA 1MWMA 3R8EA 4IJNA 3W3DA 4FSVA 2KHOA 3ZEUB 2HF3A 2Q0RA 1DEJA 1U2VB 4JD2A 4H0PA 5EOYA 4QS7A 2QWPA 4QS9A 4HTLA 1DGKN 5AQZA 4WQ5A 1YUWA 4BRLA 3HZ6A 4H5WA 1XQSC 3EN9A 1NGBA 1WUAA 3CI5A 3ZEUA 2E88A 3CERA 3I33A 1U2VA 3CQXA 3FE1A 4FO0A 4H5TA 3LM9A 2VCPA 2ZGYA 3TU5A 4FPAA 4RWTA 2V7YA 3OHRA 1KAXA 2FSNA 2D1KA 1QHAA 2ASPA 4C23A 3QFUA 2E1YA 2QWMA 3D2EB 3FZFA 1NGEA 3QB0A 2A3ZA 4XEIA 3HSCA 3EZWA 3VF6A 3VOVA 4BRMA 3WQTA 3EKSA 5AQLA 2Q97A 2A42A 3CIPA 2A5XA 2P9SB 4CZLA 3D2EA 2FF6A 2DPNA 4A2BA 1GLBG 3DAWA 2P9PA 3O5BA 4BRQA 2E2OA 3VGLA 3BF1A 3SMSA 1JCGA 1WOQA 2FXUA 3VENA 1TUUA 4IJAA 3MN6A 5AQYA 3VPZA 2ZWHA 3CJ9A 3EO3A 1NBWA 1NGFA 1H1VA 3QBWA 3FGUA 4BRFA 3VF4A 4BRKA 5AQXA 1E4GT 4FWQA 1YXQA 3SK3A 4RCHA 3SLCA 1NGCA 4J8FA 4B1YB 5EVZA 4BG9A 3A8YA 1X3MA 3R9PA 3QICA 5F1XA 3FLCO 4WQ4A 1NM1A 3WT0A 4DHYA 4CZIA 4H03B 3LL3A 4BROA 4H0YB 1GLFO 1NGGA 5AZIB 3UKUA 4IO8A 2P9KB 3P4IA 4CZKA 1QZ5A 5AQPA 4CZFA 1BA0A 3CJ7A 4B1VA 1HKGA 3BUZB 1GLJO 4BRDA 2F9TA 3L4IA 4BVOA 1IJJA 2P9KA 1YVNA 5AZJA 3VEWA 4Z94A 4H0XB 1V4TA 3VEXA 4BR5A 1ATRA 3ZX0A 3J8AA 3BP8A 3F9MA 2V51B 5E26A 4FWOA 3MN5A 3VGMA 3WXKA 3WXIA 5BPNA 2VYPA 1YAGA 4EHTA 5EXWA 3B8AX 1LOTB 3VETA 3DXMB 4FWPA 3UKRA 5CE3A 3CJ1A 3DWLA 4MO4A 5AQTA 1QQNA 1HJOA 3G25A 1E4FT 3CQYA 1NGJA 3GDQA 4RTFD 3AAPA 3D7EO 2ASOA 4IXCA 4BGAA 4BG8A 3DXMA 3MK6A 3BF3A 4GNIA 4H5RA 1NGIA 4BRPA 1BUPA 5BN8A 1Y64A 1C0FA 2Q0UA 2Q36A 2CGLA 4PL8A 3A5OC 1X3NA 5AR0A 3M1FA 2CGJA 2VWBA 4IWVA 4XH1A 2I7NA 1KXPA 3GG4A 1IG8A 3CETA 3KHYA 3MDQA 1KAYA 3HI0A 3S41A 2HOEA 2WUSA 1ATNA 1K8KB 1NGAA 1HLUA 4YDUA 5KQ8A 3H3OB 1HX1A 2D0OA 1XUPO 5EY4A 2E8AA 4CJ7A 3EKUA 1BWFO 1GLAG 3A5NC 1ZC6A 1GLLO 2E20A 4FPBA 2A40A 3TPQA 1K8KA 3FZLA 5AQWA 2BUPA 4I6MB 5JMVA 3VEYA 2E1ZA 3IUCA 5AQNA 3ENOA 4WQ4C 3MMVA 1HPMA 4MO5A 5EX5A 1SQKA 3O6WA 3M6GA 2FLOA 3A0IX 4EHUA 4CD3A 4BVPA 2P9UB 5BPLA 2Q2RA 2QXLA 3H1VX 2E2QA 4FWKA 3LDQA 3O8MA 1JCEA 5KQDA 5FPMA 1ZBSA 2P9SA 2P9UA 4A61A 1MDUB 3ID8A 1TYQB 3FZHA 5TKYA 4ISEA 2ZF5O 1T6DA 1BDGA 2FF3B 4A62A 1NWKA 1RDWX 5LJVA 2AP1A 1TYQA 3AARA 3ATVA 3O1BA 4QS8A 2GEMA 3U9DA 4DQ8A 3GL1A 5FPEA 1T6CA 4FOIA 4CBUA 5B8HA 3UB5A 4FWLA 2HF4A 4BRAA 3QBXA 3D2FB 2CH6A 1RFQA 2IVNA 3RSEB 4M7XA 4BR0A 4KBOA 4XH5A 3LDPA 4BRCA 3LM2A 5JLHA 3C0BA 3LDOA 1XC3A 4H0VB 3D2FA 5AQJA 5LJWA 1GLCG 5LY3A 3ENHA 3RSEA 2ITMA 3HBTA 3H46O 4JN4A 2QWQA 3CJAA 3CJBA 4B9QA 2GELA 1X9JA 3H1QA 1HUXA 5AZIA 5AFUH 1NGHA 3KZBA 1BA1A 3ULEB 1BG3A 4FWSA 4H5NA 4PKGA 1NLVA 3O08A 4BC4A 3KVGA 1ZXOA 1Q18A 3W0LA 3BEXA 1U6ZA 4M63C 2H3GX 4NO7A 4IZ9A 3UE5A 3U8XA 1GLEG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CZ1A 4B1WB 4B08A 2YI1A 2PZSA 4JK9A 4B3TK 2G8HA 1S3XA 4TSXA 1WSIA 5BPMA 3ZETB 3MXMA 4LF9K 1FKPA 4B8CA 3ITHA 1QSSA 3TSPA 4XJXA 4KO0A 3TTFA 3OYLA 3MCPA 4JAXA 3LP1A 3S3MA 4LY7A 2YKNA 2O8CA 1CZBA 5BR9A 3MEEA 3K5LA 4CEOA 4JHDA 4CJLA 5AFUA 4OX9K 1LCUA 4YORA 3V1OA 4PKIA 5C25A 3SAHA 1X9WA 1FK9A 3U9ZA 3PX0A 3K59A 3T1YK 4GVMA 1T05A 3E66A 4A2AA 4CECA 3TABA 1VQ7N 1CXUA 3A2FA 4CD1A 5AQIA 1IKVA 1RTJA 4B9VA 3LWLA 4Y1CA 3SAFA 3SJHA 1ASUA 5KPTA 1TK0A 1HKBA 4ISGA 4FLWA 3QERA 4CEEA 4BR2A 1NNEA 4F3OA 2QKKA 2I5JA 4EFHA 1NGDA 4I6MA 4HUEA 3SZ2A 4DUZK 4IFEA 1EWQA 5JENA 2BANA 3QMLA 1HPZA 1BOTO 3KJVA 1P8ZA 4HWIA 3FFIA 1TK8A 4I9LA 3CC2N 2QA4N 4LSLA 3AV9A 3KLHA 4LFAK 5TKWA 4NCGA 4CF8A 4DV1K 4FJ5A 4A5AA 2UXBK 2GWJA 1A5WA 5CR4A 4BR7A 1EX4A 4KHWA 3DMJA 1A5VA 1NK7A 3NFAA 4HTUA 3JYTA 2FBXA 1RCHA 4BC2A 4CFBA 1QE1A 2GV9A 3RR8A 3ZT3A 5IT9O 4CK2A 3OYJA 3ATUA 3C7NA 4OLAA 4BR9A 1NMDA 1Z6RA 4CZMA 1RT3A 4CGDA 4CZEA 1RGIA 3AAQA 1NJIO 3NDKA 3LDLA 3HM8A 5I9EB 3UKUB 3NH2A 3TAFA 3NH0A 4L3QA 2P9IA 1ILYA 1XWLA 2FSKA 3C94A 4C8KA 3I8BA 2A6AA 3HL8A 4BC5A 3WXMB 4B1ZA 3ULEA 2YHAA 3VERA 1RBRA 1N32K 2R7YA 1UAXA 4CJ4A 1CZAN 3VGKA 2P9NB 3OYEA 4CHNA 3FZKA 1G99A 1CLQA 3LALA 3L4QA 2WOMA 4IEIA 4B1XB 3H6EA 3DJCA 1YITN 1P90A 4CJ3A 4DFKA 3F9KA 3H45C 1K6YA 3M3ZA 4WYBA 1NMNA 3V1QA 4FJNA 3ZETA 5KI6A 3PLAA 1D5AA 1KAZA 3O9QA 3G0ZA 1NJYA 2UUCK 4N56A 4JK8A 4A5BA 4KHUA 4B1UB 2YKMA 3PUFA 2OZMA 3QEVA 3SCXA 3HPHA 3LPTA 2E2NA 4AHSA 4KHYA 2F8TA 2O8DB 3DM2A 1YTAA 4JK7A 1UA1A 2HF3A 5GAEP 1U2VB 1SKSA 4H0PA 4QS7A 4RG8A 4DUYK 1KLMA 1JXEA 4WQ5A 4HUGA 1YUWA 2G8IA 3HZ6A 3MECA 4LF6K 1NGBA 1WUAA 3CI5A 3ZEUA 3NGYA 4OGEA 3I33A 1ITGA 4RW4A 3J7YP 4H5TA 1IBKK 4A59A 1N8RO 5C24A 3MX2A 3OHRA 4CFCA 3OYMA 1G15A 3AO2A 4OKKA 3F5TA 2ZJRL 1VQ4N 1W97L 1BIZA 3VTHA 1RT6A 3AVGA 4CJUA 5GAHP 1CXQA 3FZFA 2WFBA 4DQRA 1NGEA 2A3ZA 3EZWA 3WQTA 3EKSA 3CCUN 3CIPA 4CZLA 4E3SA 3WNFA 4DV2K 2FF6A 2Y1IA 3DAWA 1YF5L 3O5BA 4ILGB 4GV3A 3M8PA 3VGLA 3QESA 3HYFA 3SMSA 1RT1A 3J81O 3VENA 1HYSA 3PIPL 1RDAA 4JKEA 1SL1A 4MQ3A 3NHGA 4DV6K 1U4BA 1NBWA 3C6UA 4KH6A 4DR1K 2Z1IA 1E4GT 5CYMA 4RCHA 2IGIA 3SLCA 2OTJN 1KCFA 3THXB 3QICA 4JI0K 4FLZA 4BROA 1S1TA 4CVNE 4BE7B 2O8BB 1QHTA 4FVUA 3UKUA 3V9ZA 4Z4EA 4JI5K 1JLFA 3BZKA 1N33K 1NKBA 1NK9A 3BUZB 1GLJO 4FLTA 4BRDA 3L4IA 1B92A 4DTUA 4Z94A 4H4MA 4CJEA 4DTJA 5M1NA 3ZX0A 3J8AA 5CZ2A 3O9TA 1SKWA 4NCAA 2HHSA 3F9MA 2V51B 1YI2N 4JEPA 2QEXN 3SUNA 4W5TA 4B9SA 4QOZB 3NMUA 5IWAK 4CW7B 5EXWA 2O8FA 4DR4K 1LOTB 3VETA 3DXMB 5CE3A 3I0SA 4MO4A 3G25A 1NGJA 4OPKA 3GDQA 4IEEA 2ZD1A 4CF0A 1U49A 3JAMO 1XHZA 2HVHA 3CM6A 4BRPA 2Q0UA 2CGLA 1M1KO 4HCBA 4Z0UA 1EO1A 2NRZA 2O8DA 4AH9A 3AA5X 1VQON 4DKWA 3HO1A 2HHWA 2I7NA 1TL3A 3GG4A 3DOKA 3CETA 1KAYA 3L2QA 3OBWA 1K8KB 3IG1A 2HSTA 2ATQA 1HX1A 1VQMN 3RTVA 2OPQA 1TKTA 2RHKA 4W5QA 1XUPO 3TARA 3EKUA 4CGJA 1ZC6A 1XMQK 4JI7K 3AA4A 2GX9A 1QSLA 3ENOA 3MMVA 1HPMA 3CM5A 4DU4A 4FJKA 1S6QA 2FLOA 4EZ9A 4BVPA 4N41A 4O0IA 1LW0A 1WAFA 3P1GA 3ZSWA 3CMEN 3NVKA 4KHNA 4KTWA 4BWMA 2YNIA 4LD0A 5C10A 3U6FA 4DS4A 1RNHA 3OA9A 4YOUA 3FZHA 4CJPA 2IOCA 1T6DA 1RBSA 3ID6A 3KWGA 1Z25A 4JI1K 2IS3A 1NWKA 4JI6K 4A62A 5HRSA 4DF4A 4KB0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4YHH K;  4BG9 A;  1X3M A;  4YOY A;  4WQ4 A;  4DHY A;  3CYG A;  5KTQ A;  4CZI A;  4DU1 A;  3LP2 A;  4B9N A;  1YVU A;  4L8R B;  4JKB A;  3THX A;  1NGG A;  5AZI B;  3L3V A;  3RR7 A;  2P9K B;  3EE9 A;  5AQP A;  1BA0 A;  3SNN A;  3J7A P;  3VQQ A;  3NF7 A;  5LMN K;  1HR0 K;  2FBY A;  2O8B A;  4BVO A;  1IJJ A;  2HMI A;  2IDO A;  3VEW A;  4DFP A;  4H0X B;  1V4T A;  3QIP A;  3KTQ A;  5C0Y A;  3AGR A;  3MN5 A;  5SZT A;  1VHX A;  4DR6 K;  3VA0 A;  3HP9 A;  2DY4 A;  2X6N A;  3KK7 A;  4FWP A;  3CJ1 A;  4FLY A;  4BE2 A;  1QQN A;  3F2K A;  2YHB A;  4ICL A;  1VAZ A;  2Z1H A;  3AVN A;  3DYA A;  2HBK A;  2ASO A;  4IXC A;  4BG8 A;  3DXM A;  2UUA K;  3MK6 A;  4GNI A;  1NGI A;  4DQI A;  4B3S K;  1BUP A;  3LDS A;  1Y64 A;  3SBG A;  4CGI A;  3ZSX A;  3A5O C;  1X3N A;  2VQF K;  1U04 A;  1T3V A;  3OYB A;  4IWV A;  3M1F A;  4CEB A;  4CEA A;  3ASM A;  4Z4H A;  4ELU A;  3DLK A;  1LWC A;  1NK8 A;  2BGG A;  1ATN A;  3TAP A;  4Q5V A;  4CJW A;  1T03 A;  3K57 A;  1BWF O;  1GLA G;  3A5N C;  2E20 A;  4PA1 A;  3RMB A;  1K8K A;  3FZL A;  2ZE2 A;  4I6M B;  4X64 K;  3VEY A;  3IUC A;  5AQN A;  4WQ4 C;  4UQG A;  1WBB A;  2B5J A;  4MO5 A;  4DSE A;  1SQK A;  4FZZ A;  1J53 A;  3O6W A;  3A0I X;  2P9U B;  5M1P A;  3ZYY X;  5BPL A;  2DFH A;  2Q2R A;  4CE9 A;  2E2Q A;  4EP4 A;  3CC4 N;  4B3R K;  4FW1 A;  3CCJ N;  1ZBS A;  3O9U A;  4E7K A;  3DOL A;  4ID1 A;  1XNQ K;  1QVF M;  1C6V A;  2ITG A;  5HBM A;  1RDU A;  3ATV A;  3AGK A;  4DQ8 A;  2EHG A;  2GEM A;  3THV A;  1T7P A;  1BCO A;  4FOI A;  1IV0 A;  1RTH A;  4FWL A;  3NAE A;  4AF1 A;  4PQU A;  2HF4 A;  4GV6 A;  4KTZ A;  5M1Q A;  5C15 A;  3MED A;  4K0K K;  1RFQ A;  3RSE B;  3ZSZ A;  3E9P A;  3I8D A;  4KBO A;  3TI0 A;  3NBP A;  3C0B A;  1XC3 A;  1LW2 A;  3D2F A;  4GKK K;  5LJW A;  1B9D A;  5LY3 A;  3V9W A;  2F8S A;  2ITM A;  3HVT A;  3MXJ A;  3S5T A;  3B6P A;  5AZI A;  1HUX A;  1RT4 A;  2KKZ A;  1L3S A;  3KZB A;  1KFS A;  3OS2 A;  3ULE B;  3NGZ A;  3HOS A;  4DU3 A;  1S5J A;  1Q18 A;  3QLH A;  3W0L A;  3BEX A;  3CCL N;  4M63 C;  2H3G X;  5DM7 L; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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