3MN5A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
354
structure length
347
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRVGDERTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 119
structure length 347
sequence length 354
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn5A03
5ELZA 4B1YB 1HPMA 5AQKA 4WYBA 1E4GT 5AQVA 4BG8A 3L4IA 2V7ZA 5CE3A 3VEVA 3ZX2A 4IJNA 2CH5A 1WUAA 3QB0A 2QWLA 1K8KB 1NGAA 1NGEA 4BRQA 5BRFA 2Q0RA 1Q18A 2FSJA 3QBXA 3VF4A 4I6MA 5JLHA 3FZKA 5AQNA 1U6ZA 1YUWA 3D2EB 4ISEA 2P9NB 5AQZA 1DGKN 3O4WA 2E2NA 4WQ5A 3VPZA 5BRDA 4FWRA 2A41A 1NGIA 4EHUA 2IVOA 2V7YA 3CJ9A 5BPLA 3AAPA 1ZXOA 3GBTA 4H0VB 1SQKA 2I7PA 2E1ZA 4Y0WA 1NLVA 2YJEA 4HTLA 4BREA 4RCHA 1BA0A 4H5WA 5AQFA 1DEJA 3C7NA 3CJCA 4M7XA 3HBTA 5EY4A 1X9JA 3KZBA 3W3DA 4YDUC 4CBXA 4H5NA 1T6DA 5BRHA 3CETA 3IMXA 2ASPA 3GL1A 5EOYA 1YVNA 4FL9A 4H0OA 1T44A 5BREA 4M63C 2CGKA 3IDHA 3SK3A 5ADXH 5AQTA 1MWKA 3RSEA 3U8XA 4EIAA 4BRMA 4BC4A 3GDQA 3WXIA 5ADXA 4CZGA 5FPMA 1X3MA 2IVNA 3H1QA 2FF6A 5JMVA 3I8BA 3U4LA 5AZIA 4H03B 4BRAA 4C23A 2P9PA 4JD2A 4JHDA 4QS8A 3H46O 3B8AX 1QZ5A 3WT0A 3ENOA 2CGJA 4I6MB 2H3GX 1CZAN 4H0YB 3VEZA 3SJHA 3ZX3A 3M6GA 3VEOA 5EX5A 4FOEA 2P9IA 1XQSC 4FWNA 3UKUA 4FWLA 2J4RA 4XH5A 2E2OA 3FZFA 5AQXA 2PBDA 4BGAA 3VEWA 3DWLA 3H45C 3QBWA 3A0IX 4JAXA 2P9KA 4MLHA 2YJFA 2IVPA 2EWSA 1NGJA 3LDOA 1V4SA 3O1BA 3LM9A 1TUYA 5AR0A 1BDGA 2DPNA 3UB5A 1NGCA 4K25A 1NGFA 3C7NB 1QQOA 3DXKA 4CBUA 5AQLA 3UE5A 5KQ8A 4PKHA 4L3QA 3JS6A 3WXKA 1MA9B 1Z6RA 3EL2A 5FPNA 3VGLA 1QQNA 3UKRA 1ESVA 3AAQA 4FWOA 1NGGA 3HM8A 4H0PA 2YHXA 1GLJO 1BA1A 4FWMA 2F9TA 3RSEB 3O5BA 5AQHA 4QS9A 4PL7A 1HUXA 1OKJA 2QWRA 1D4XA 4FO0A 5AQWA 3BF1A 4O5FA 5AFUH 1ATRA 1KAXA 1IG8A 5AZIB 3SLCA 2P9PB 4JD2B 4JHDB 2QWPA 3FZMA 5AFUA 1GLDG 4RWTA 3MN6A 3WUHA 4FPAA 3CI5A 3DAWA 4YDUA 4H5TA 2V51B 2VYPA 5LJWA 5LJVA 3LDPA 3IUCA 4CZEA 2P9IB 4K43A 3VGMA 1HX1A 2CH6A 3UKUB 1U2VA 2VCPA 4IO8A 3ID8A 4WQ4C 5B8HA 4BRLA 2Q31A 4CZIA 4CZFA 1BG3A 2HOEA 3O1WA 5AQYA 2P9KB 2D4WA 3R9PA 3QDKA 1YXQA 5BN8A 5JLFA 1BU6O 1XUPO 3TU5A 1QHAA 5AQGA 2ZGYA 4BRPA 3ATUA 3DXKB 3H1VX 3HZ6A 4CZKA 2OANA 2HF3A 1MWMA 1LOTB 4JN4A 2HMPA 4BQLA 2E88A 2GTDA 3UKRB 4CD3A 1H1VA 4A2AA 4CZHA 2D0PA 1BUPA 4JNEA 4FWPA 3D2FA 2ASOA 2D1KA 2NZTA 3P4IA 3LDNA 4CD1A 3A5OC 1C0FA 3JXUA 3MDQA 4IJAA 3CJ1A 3F9MA 2E2PA 3A5MC 4DCHA 3VERA 3VENA 4K41A 3VGKA 1IJJA 4ISGA 5BR9A 2W41A 3FE1A 3A8YA 2Q1NA 4BR0A 4MO5A 4CZJA 1WOQA 3CHWA 3EO3A 2NLXA 5AQRA 3I33A 2FLOA 1U2VB 4RTFD 1XC3A 2ASMA 1G99A 2E1YA 1HJOA 1RGIA 1Y64A 1C0GA 4K42A 4FWSA 5AQMA 2NRHA 2QWQA 2YHYA 4MLEA 4WQ5C 2PAVA 3SMSA 3VEXA 1ATNA 3DXMA 1JCFA 1JCEA 3CJBA 2Q36A 4CJ7A 5AQIA 5FPEA 4BC2A 2KHOA 3ATVA 2QWOA 4J8FA 4EHTA 4FPBA 3HI0A 4NB4A 3CJ7A 4XH1A 3BF3A 3ZEUA 3CQXA 2FXUA 3C0BA 4PL8A 3O80A 4QS7A 2V52B 4B1ZA 3MMVA 1GLAG 4CBWA 3U9ZA 3WQTA 4EAHD 2GEMA 4A62A 4B1WB 3D2FB 1S3XA 2ZGZA 4BR7A 5BN9A 4B9QA 4B1VA 3M3ZA 4GY2B 5I9EB 2BUPA 3WXLA 4BRNA 2FSNA 2YCHA 1X3NA 4XH4A 4IXCA 3L0QA 5KPTA 3QICA 2UYTA 3WEEA 2AP1A 3BEXA 4Z94A 5AQOA 5LY3A 1JCGA 4BRDA 1MDUB 2FSKA 2QXLA 2WUSA 4FOIA 3FZLA 2VWBA 1NM1A 3BUZB 3EN9A 2A42A 2P9SA 3R8EA 1S22A 3FFKB 3KVGA 2IIRA 3R6MA 2CGLA 2GUPA 3HSCA 5F2RA 2P9UA 5BPNA 4H5RA 3EZWA 1T6CA 3O08A 4CZMA 5AQJA 1TYQA 3L6QA 3MN7A 3ULEA 3VF6A 2QM1A 4BROA 2QWNA 4PKIA 4DQ8A 3DXMB 2QWMA 1DKGD 1RDWX 1GLLO 4BR4A 3MK6A 2FF3B 3MN9A 4MO4A 1Z05A 3AY9A 3LDLA 3ZEUB 1ZC6A 2AA4A 2E8AA 1NMDA 3MN5A 3VEYA 4FSVA 5BPMA 2E2QA 4AM6A 4BG9A 3GOIA 5AQSA 3SMPA 4BC3A 1GLEG 4IZ9A 3QFPA 4IWVA 4EFHA 5E84A 4BRGA 3QMLA 2D0OA 5KPZA 2BTFA 3CERA 4BR9A 5JICA 4GNIA 3ZETA 2A3ZA 1BOTO 3A5NC 1GLFO 2YI1A 3LL3A 1ZBSA 2A40A 3MCPA 1V4TA 5F1XA 4H0XB 4BGBA 3A5LC 3U9DA 3WEEB 5AZJA 3GG4A 4B1XB 5FPDA 3HTVA 1TUUA 2P9SB 1NGDA 4BC5A 4F9OA 3FGUA 1LCUA 4M7YA 2P9UB 2F9WA 3ENHA 4A61A 2QW9A 3IFRA 4B1UB 1TYQB 4A2BA 4LC9B 3FLCO 3ULEB 4BRKA 3EKUA 4H5VA 1BO5O 3D7EO 2Q97A 4BR5A 5AQUA 2ZF5O 4BRHA 1KAZA 1QQMA 2ITMA 2GWKA 4CI6A 3DJCA 3H3OB 2P9LA 3CQYA 3EKSA 4XEIA 5E26A 5AQQA 4BRFA 1KXPA 3H3NO 1SAZA 1KAYA 3ZX0A 1NGHA 1R59O 1HLUA 1J6ZA 3BP8A 2Q2RA 3VOVA 2HF4A 3O8MA 4ISFA 3VESA 3WQUA 3O6WA 4NO7A 1ATSA 1SZ2A 1E4FT 1K8KA 2W40A 4E1JA 1GLBG 1HKCA 1QZ6A 4HWIA 3FR0A 3ZETB 4BRCA 4PKGA 5KQDA 3CIPA 3KHYA 4WQ4A 3D2EA 3GE1A 3VETA 2P9NA 5EXWA 1BWFO 3CJAA 3OHRA 5AQPA 5AZJB 1NGBA 4H0TB 4AM7A 5F0XA 5KPRA 3FZHA 2YHWA 4BR2A 1HKBA 3M1FA 3S41A 4BVPA 2I7NA 3H6EA 4BVOA 4DB3A 3W0LA 3WXJA 3G25A 5EVZA 4FWKA 4FWQA 2ZWHA 3LM2A 2Q0UA 3AARA 3QFUA 4CZLA 2A6AA 4BRIA 2GELA 1P8ZA 1GLCG 3LDQA 1RFQA 2GWJA 4KBOA 1YAGA 1NBWA 2A5XA 1HKGA 2E20A 5TKYA 3VF2A 1EQYA 1NWKA 3J8AA 4BQZA 4DHYA 4O8KA 2P9LB 3TPQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G4SN 5AQKA 4WYBA 3AVCA 3L4IA 4BE2A 3O9TA 2KLAA 1BCOA 1T05A 4YOYA 3CCQN 3PX4A 1D8YA 2CH5A 1CZ9A 4AILC 3NFAA 1NGEA 4GKJK 1OH5A 3SQ4A 5AQNA 2O8CA 3D2EB 4ISEA 3PIOL 4DWIA 1U4BA 3NF8A 4M3TA 2WC9A 3BGRA 4JKGB 4B9UA 5BRDA 3VPZA 4NXNK 4FVMA 1HYZA 3JYTA 3O3GA 3HXMA 2V7YA 3JAMO 2O4IA 1VQLN 1ZXOA 2EX3A 4DSLA 4Y0WA 1NLVA 3LDSA 2YJEA 4E19A 4O44A 3L2QA 1BA0A 1DEJA 3C7NA 5EY4A 1X9JA 3W3DA 4B8CA 4YDUC 3DRPA 1RBTA 1RTDA 1HNIA 1VK0A 5BRHA 4CJRA 3IMXA 3T7ZA 1GOAA 1EX4A 3GL1A 3K2PA 5HP1A 4M63C 2CGKA 3SK3A 3AO5A 3VQ5A 2YNIA 3AVIA 1K9MO 4BRMA 4BC4A 1IKVA 1X3MA 2IVNA 5FPMA 2FF6A 5JMVA 4E7IA 3Q7CA 3LAMA 2IOCA 5AZIA 4H03B 4YOUA 4C23A 4B08A 3ENOA 1VSJA 4I6MB 3PIPL 5M1KA 3ZX3A 4C1NK 3PV8A 3VQ6A 2OYQA 1XQSC 4LH4A 3UKUA 3TWHA 5HL7L 3CCEN 2YKNA 1TKXA 2WFBA 1EP4A 1BISA 4BGAA 3NGIA 3VEWA 3DWLA 3H45C 3QBWA 1NG9A 2P9KA 3J7ZO 3VQQA 1TV6A 1U47A 2XY6A 1NGJA 3F73A 2DPNA 2NRZA 1NGFA 2DFFA 1X1PA 3DXKA 3DLHA 4LFCK 2QTDA 4B3TK 5KQ8A 3JS6A 3WXKA 2G8IA 4ID5A 3UKRA 4KV8A 1ESVA 1NGGA 1BA1A 1BHLA 4FWMA 3QNOA 4LSNA 4CIGA 5H1SQ 3SV4A 5AQHA 3V9UA 3T1YK 4FW1A 1OKJA 3BF1A 1HYVA 1IG8A 1J54A 3KKRA 3SLCA 3HJFA 2P9PB 4JHDB 4OKJA 4DTJA 4O8UA 3RWUA 2QWPA 1OH6A 4JI6K 4RWTA 2O8FB 3MN6A 2OPQA 1RDCA 2PZSA 3THWA 2C1GA 3HP9A 4JI8K 4BE7B 3VGMA 4BDPA 2VCPA 3U3YA 2IC3A 3NF6A 4WFBL 3AO3A 4CJ5A 2Q31A 4CZFA 4B9TA 2HOEA 4E1NA 2PYLA 3C6HA 3WNGA 1DLOA 2X6NA 1EWRA 4JS4A 5JLFA 1E3MA 1BU6O 2FBXA 4KHSA 4BRPA 3F9KA 4YHHK 3ATUA 3ENBA 2OANA 3S3OA 1VQKN 3C6TA 4W5RA 3RMBA 1N8RO 4OJRA 1H1VA 3AVKA 4ELVA 2D0PA 4EZ6A 1EO1A 1BUPA 5GADP 4JKHA 4FWPA 4GMJB 1YIJN 1VSMA 1REVA 3DRSA 2D1KA 3P4IA 3A5OC 3ISNC 3MDQA 2RHKA 4IJAA 3CJ1A 2E2PA 3NGZA 3SNNA 4DCHA 2O8BB 4XJXA 1NK0A 3VENA 1T3VA 4K41A 1DTQA 1J5OA 3LZJA 4ISGA 1U48A 2VWJA 3SYZA 1S9EA 4CF2A 1U2VB 4RTFD 4KI4A 4DR5K 1XC3A 1G99A 4AQYK 4DTRA 1IV0A 4DU1A 5SWMA 3RTVA 1FKPA 1HJOA 1RGIA 2BDPA 4RW9A 4FWSA 2QA4N 3KK2A 3P1GA 2QWQA 1KVCA 4WQ5C 4FLYA 3VEXA 2O8DB 2E5LK 3DXMA 1L3TA 2Q36A 4CJ7A 5FPEA 2KHOA 4IG3A 4DLGA 4J8FA 4NCBA 3BY5A 3HI0A 3DLRA 3ALYA 4NB4A 3VQDA 3ZEUA 3CQXA 2F96A 2QKKA 5HRRA 4DMNA 3DLLL 4B1WB 3V1QA 3D2FB 4GVEA 3MXIA 3MXJA 1VSFA 2RN2A 4KAZA 3D45A 3S3NA 1JLBA 4B9QA 3SQ1A 4KH4A 4CEDA 3G0ZA 4GY2B 4BRNA 2YCHA 1X3NA 4XH4A 3L0QA 3BEXA 5AQOA 3O9UA 4DUZK 4BRDA 4KB0A 4FOIA 4IEEA 1D9FA 3VQ7A 2A42A 4FM2A 3QETA 1S22A 1WNSA 3O9SA 3ZSRA 4FLTA 1R0AA 5F2RA 5BPNA 3LP2A 4NCAA 4JKAA 1IO2A 3O08A 1WSIA 4JEPA 1TYQA 1WN7A 3L6QA 3MN7A 3SPYA 1Q9YA 4X66K 1U45A 4DV1K 1RDWX 3SPZA 2G8UA 4JK8A 5KI6A 4FJLA 1C0TA 3DLKA 3LDLA 3RMDA 3MWTA 3IAYA 3CFRA 4RW4A 4CIEA 1IKWA 3E9LA 2E8AA 1F21A 3PX0A 4FSVA 5BPMA 1WBBA 3OW2M 2UXCK 4BG9A 1VSEA 2D0BA 5AJ3K 4BC3A 1VSIA 3K5LA 4GV9A 4M3XA 3QEPA 5KPZA 2HHHK 2BTFA 1S1TA 4OO1J 2DY4A 1KLMA 3PUFA 3ZETA 1J53A 3VQ8A 4U7BA 1GLFO 1RILA 4CERA 3VA3A 2BE2A 3V1OA 3CCSN 4HUEA 3U6FA 2A1SA 4KFBA 4TSXA 1X9SA 1TK5A 4JI3K 3QEXA 4C8MA 3TI0A 3KWGA 4CF8A 1FK9A 4DFJA 3FGUA 3P83D 1RT1A 4WFNL 2P9UB 2F9WA 4CE9A 5J2NA 3QNNA 4LC9B 1RBVA 4BRKA 3EKUA 3EE9A 5C0YA 4DV4K 2E6MA 1BO5O 3D7EO 4FYDA 1RT7A 3OS2A 2HW3A 5C10A 3KJVA 2ITMA 3NH1A 4CI6A 3S9HA 1VQ6N 1O13A 1WLJA 5E26A 2W6KA 4FCYA 4M3WA 1SAZA 3K5MA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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