3MN5A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
354
structure length
347
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRVGDERTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Contractile protein/protein binding
source organism Drosophila melanogaster
total genus 119
structure length 347
sequence length 354
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn5A03
3VPZA 3SMSA 1WOQA 3QFUA 4IXCA 4BQZA 1S22A 3EZWA 3A0IX 5BR9A 1T44A 3GE1A 4A62A 5EVZA 3VESA 4PKGA 1CZAN 5AQHA 3LDQA 1Z6RA 3VEWA 3SK3A 5AQKA 3CERA 4H0PA 3VF6A 3ZX3A 4CZIA 5AR0A 1K8KB 2ASPA 1S3XA 5JMVA 4B1VA 3FZLA 4K43A 5LY3A 4BG8A 2ZGZA 2ASOA 3VGKA 2E2NA 5AZIA 4DQ8A 3KZBA 3MN6A 5B8HA 1KAZA 1NGIA 5E84A 1YUWA 2I7PA 3UKRA 4BRCA 5FPMA 3CJAA 3ATVA 5JICA 5BREA 2YHWA 4H03B 2GEMA 4H0YB 2HF4A 1DEJA 3ZEUB 4XH5A 4AM6A 3VEZA 3DAWA 2HF3A 3ZX0A 4B9QA 3BF1A 3HSCA 3GOIA 1T6DA 2E1YA 4LC9B 2A40A 4XEIA 1EQYA 3UKUA 2FXUA 5F0XA 4BRNA 5BPLA 4JN4A 1TUUA 3C7NA 1QQNA 3CJ9A 1NGFA 2P9KA 2NZTA 5EX5A 5F1XA 2V7ZA 4IWVA 4B1YB 4BRFA 3QMLA 4A61A 3VETA 1SZ2A 2Q0UA 3CIPA 3MMVA 3WXIA 2Q0RA 4E1JA 2GUPA 2HOEA 1KXPA 1LOTB 3A5NC 3O5BA 2Q2RA 1NGJA 2GTDA 3ID8A 3U4LA 1QHAA 1GLLO 4CZGA 1NLVA 2YHYA 5AQVA 1IG8A 3KHYA 3FZFA 3WEEA 4WQ5A 3WUHA 4RWTA 2NLXA 4F9OA 2QW9A 1SAZA 4BR4A 3FLCO 3L6QA 2GWJA 1V4SA 1JCGA 5AQOA 2IIRA 3CHWA 3SLCA 2KHOA 2E2PA 5AQIA 5AQMA 4EHTA 1NWKA 5BPNA 4NB4A 3A8YA 3D2FB 5ADXA 3VGLA 4HWIA 2E20A 2CGLA 1ZBSA 2P9UB 1MWKA 1DKGD 1X3MA 4FWRA 4WQ4C 4O8KA 1BUPA 1NGHA 1YAGA 3FFKB 1JCFA 2ASMA 4JD2A 3CJBA 3F9MA 3SMPA 4BG9A 4BVPA 1BWFO 3A5LC 3MDQA 3MCPA 2QWLA 3O1BA 1HPMA 1GLJO 3EO3A 1QQOA 3HTVA 5EY4A 2FLOA 1ESVA 1QQMA 3CQXA 2P9NB 4EAHD 5JLHA 3H3OB 3ULEB 5AQNA 1NBWA 4XH1A 3M3ZA 1E4FT 1XC3A 4CBUA 4JAXA 5AQJA 3D2EB 3WQUA 1MA9B 3S41A 3L0QA 2FF6A 3I33A 2FSKA 2D0OA 2E88A 3DXMB 4BR2A 2QXLA 2GWKA 2P9SB 3ZEUA 2YI1A 3OHRA 3CQYA 4FOEA 1X3NA 2Q36A 4CZLA 4A2BA 1GLEG 3LDLA 1C0GA 1RGIA 5AFUH 4JHDB 4H0VB 3O08A 3IUCA 3VEOA 4GY2B 3RSEB 2QWRA 3ZETB 5AQPA 3UB5A 1BU6O 1KAXA 5AQWA 4YDUA 1NGDA 2CGKA 4B1XB 5BRHA 2Q1NA 2P9LB 2QWQA 4MO4A 5LJWA 4XH4A 2FF3B 4IJNA 4IJAA 3VF2A 1BO5O 3WXLA 4KBOA 2QWMA 1JCEA 2Q97A 2A42A 2WUSA 3DXKA 1H1VA 3QB0A 2E2QA 3CJCA 1X9JA 4O5FA 1U2VB 2W41A 3JS6A 2QWPA 3QICA 4DB3A 2VCPA 3O4WA 1YXQA 4H0TB 2QM1A 4BR0A 2P9UA 2PAVA 3H46O 1V4TA 2E8AA 3QBXA 4MLHA 5AZJA 5LJVA 4PL8A 1ATSA 2Q31A 3R9PA 3FZHA 3DJCA 2CH5A 1Y64A 4EFHA 3FR0A 2YJEA 3R8EA 4H5VA 4BC3A 4FWMA 2NRHA 4CD3A 1BOTO 4CBXA 4QS9A 3QDKA 5BN9A 3LL3A 4K25A 4JNEA 3C0BA 5E26A 4MO5A 3LM2A 2V51B 1BA1A 4FO0A 4CZKA 3MN5A 1OKJA 1TYQA 4H0OA 1G99A 2P9PB 2PBDA 4FWKA 3GL1A 1D4XA 3DXMA 4IO8A 2A5XA 3O8MA 3A5OC 3H6EA 3JXUA 2ITMA 4WYBA 3EKUA 1HKGA 2P9SA 2I7NA 3CJ1A 4WQ5C 1NGGA 2H3GX 5AQFA 5BN8A 2HMPA 2QWOA 5KPZA 3UKUB 1E4GT 4BC2A 5FPDA 4FPBA 3D7EO 3ZX2A 3VERA 1ZXOA 1HKCA 3U9DA 3G25A 3GDQA 5AQSA 4H5TA 4JHDA 4BC4A 3H3NO 1K8KA 4I6MB 2P9KB 4FWOA 5EXWA 3CI5A 1NGBA 5KPTA 5AQQA 5FPEA 3ENOA 1U6ZA 1HJOA 3FZKA 4MLEA 3SJHA 5KPRA 2D1KA 2A41A 2W40A 2EWSA 3VEVA 2E1ZA 1WUAA 4FWQA 2FSNA 3H1VX 1LCUA 4ISGA 3LDNA 4BR9A 5EOYA 4BRHA 5BRDA 5ELZA 2V52B 4BRDA 3WQTA 3HM8A 1RDWX 2QWNA 2D0PA 3GBTA 4J8FA 3VGMA 1T6CA 2IVPA 5AQYA 3CETA 4DCHA 4CZJA 4EIAA 1R59O 2P9IB 4AM7A 4FWNA 4CZHA 1NGAA 4JD2B 3AY9A 4RTFD 5AQZA 1HUXA 3GG4A 3P4IA 1C0FA 1QZ5A 2ZWHA 3UE5A 4BRMA 4CZEA 3R6MA 3HBTA 3M6GA 2AP1A 4BRPA 3LDOA 2A6AA 4BREA 1NGEA 3AAPA 1GLCG 4BR7A 2E2OA 3HZ6A 2IVNA 2ZF5O 4B1UB 5AFUA 3EN9A 3A5MC 4ISEA 2V7YA 5AQTA 3LM9A 1IJJA 2GELA 5I9EB 4HTLA 1BA0A 3H45C 4CBWA 3KVGA 4PL7A 1MDUB 4FL9A 3ENHA 4BROA 4YDUC 4FPAA 1J6ZA 3ATUA 4CJ7A 1GLFO 1XQSC 2P9PA 3IFRA 4BRKA 4H5WA 3D2FA 5AQUA 3U8XA 4M63C 4FWPA 4CI6A 4H0XB 3WXJA 5TKYA 3MN7A 4BR5A 4BRLA 4GNIA 4M7XA 4IZ9A 4H5RA 3FZMA 3MK6A 3O1WA 2FSJA 3O80A 1YVNA 4PKHA 1SQKA 5CE3A 3W0LA 1QZ6A 2VWBA 1GLDG 3L4IA 3M1FA 2OANA 3BUZB 1HX1A 2IVOA 3J8AA 2P9NA 2YCHA 5KQDA 2J4RA 4I6MA 4FWLA 1NMDA 5AZIB 5AQGA 3DWLA 3ULEA 3LDPA 4CD1A 1BDGA 1P8ZA 3IDHA 3O6WA 3H1QA 3QBWA 1NM1A 3D2EA 4B1WB 3BF3A 1RFQA 5ADXH 1HLUA 4QS8A 4A2AA 5KQ8A 3UKRB 4BRQA 5AQLA 3BP8A 3HI0A 4WQ4A 3W3DA 4Y0WA 3AARA 3FGUA 3CJ7A 2YJFA 3DXKB 4BC5A 4BVOA 3TPQA 5BRFA 2BUPA 1TUYA 4FSVA 4ISFA 3VF4A 3QFPA 3WXKA 1Q18A 1XUPO 3B8AX 3VENA 2DPNA 4RCHA 4K42A 4PKIA 1ATNA 1GLBG 3VEYA 4CZMA 1HKBA 3C7NB 1BG3A 2AA4A 1GLAG 5FPNA 3RSEA 3VOVA 5AQRA 3ZETA 4C23A 4BRGA 1DGKN 2F9WA 4NO7A 4QS7A 4BGBA 1NGCA 2P9IA 5BPMA 1ATRA 3EL2A 4H5NA 5F2RA 5AQXA 4CZFA 5AZJB 3WT0A 2ZGYA 2D4WA 2P9LA 4BGAA 4M7YA 3U9ZA 3FE1A 4FOIA 4Z94A 1ZC6A 2YHXA 3WEEB 2CH6A 2UYTA 4BRAA 5JLFA 3VEXA 3MN9A 2F9TA 2CGJA 3EKSA 4FWSA 3TU5A 4EHUA 2VYPA 3BEXA 1MWMA 3AAQA 4DHYA 4K41A 3IMXA 1U2VA 1TYQB 3I8BA 1KAYA 1Z05A 2BTFA 2A3ZA 4BQLA 4BRIA 4L3QA 4B1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DFJA 1J54A 3A0IX 1HPZA 4ILHA 4M3RA 1LV5A 1NJIO 4XIUA 4JI8K 4CF1A 3VEWA 3VQEA 1RILA 4KB1A 3IRXA 3M8PA 4ELTA 5M1QA 3QERA 5C2FA 4E1MA 3LP1A 4CFCA 4LF9K 4B1VA 3JYTA 4WCEL 4K43A 1HNWK 2QA4N 2ASOA 2VGNA 3IS9A 4FZXC 3KZBA 5B8HA 5CY4A 2HNZA 1J5EK 2UXCK 5E84A 3IAYA 3P39A 3G0ZA 3SBTA 1Q81O 1OH8A 4HHTA 2O8DB 3CJAA 4FJ8A 5JICA 4FVUA 2YHWA 3LAMA 4BE7B 4M45A 4XH5A 5J2MA 3O4NA 2YNFA 4R5PA 3E66A 2HF3A 1VHXA 1B92A 4LY7A 3GOIA 2QEXN 1T6DA 4YNQA 2FXUA 5F0XA 4BDYA 3MX5A 4DTSA 1YJNN 3MEDA 4DUYK 3CJ9A 2WONA 3OJSA 1X1PA 3WXIA 3EEQA 3AA5X 2IOCA 3OYNA 3THVA 2GUPA 2HOEA 3SV4A 3B6OA 2Q2RA 4JEPA 1TKXA 3C6AA 1QHAA 3KTQA 1YHQN 2YHYA 1IKYA 5AQVA 2X78A 3KHYA 3OS0A 3NAEA 3L2VA 3L4QA 3WUHA 4K8ZA 3KD1E 4RWTA 2NLXA 4PA1A 4BR4A 2KQ2A 1JCGA 2IIRA 1LWFA 3CHWA 4JKBA 5AQIA 4EHTA 2OA8A 5BPNA 2P5OA 1SS6A 1W97L 1L5UA 2Z1HA 2Q3SA 1X3MA 2GBZA 1BUPA 1NGHA 3IKMA 1L3UA 3O9RA 1RT6A 4DU1A 1JCFA 2ASMA 4BG9A 4DU4A 3QNNA 4BVPA 1TL1A 3RMBA 4HTUA 1ZBFA 1BWFO 3K5OA 3SPYA 1K9MO 1XNRK 3KLHA 4CHYA 3NGYA 4DV1K 5EY4A 3TI0A 4DF4A 3BDPA 2P9NB 4Y1CA 3V9WA 1VRUA 2UU9K 4W5NA 1NBWA 4XH1A 4AQYK 1XC3A 2KFZA 4JAXA 5AQJA 3WQUA 1MA9B 5CR4A 3HO1A 4C1NK 3I33A 2GV9A 5HRSA 3Q7CA 4F2SA 4CEDA 3DXMB 3PX6A 1NJZA 2OZMA 4BR2A 2O8CB 1JL2A 1RBSA 2W6KA 3M8RA 4MFBA 3PY8A 4LF4K 2P9SB 4CECA 3QESA 3S3MA 3Q7BA 3VQ9A 3V9XA 1LWEA 3CQYA 2WBNA 3SZ2A 3V1QA 1C0GA 5AFUH 4JHDB 2XY7A 1VSIA 1YF5L 3IUCA 3VEOA 1OH5A 3ZETB 3AVJA 3L3VA 3UB5A 2RF2A 1QE1A 1RCHA 1NK5A 3HSTB 3DRPA 2P9LB 1VRTA 5LJWA 4FVMA 4XH4A 1N33K 3THYB 1S9EA 3OY9A 3WXLA 3MEEA 1OVYA 4KBOA 4B9UA 2Q97A 4FJLA 3K59A 1S9GA 1X9JA 2QTDA 3E9LA 2X6SA 4O4GA 3AVGA 2VCPA 3O4WA 1BHLA 4BR0A 2P9UA 4YOYA 5FRNA 4O5BA 3AVLA 3K5NA 2HHXA 3MX2A 1RDBA 2VG6A 1TKDA 4OX9K 5LJVA 3M8QA 4DV4K 2Q31A 2A1RA 2JGUA 3DJCA 1QQCA 1Y64A 4EFHA 3R8EA 1BQNA 4CD3A 3TSUA 1BOTO 4CBXA 3VMFB 5BN9A 5E26A 2V51B 2ATQA 4CZKA 1K73O 2P9PB 2NRTA 4FJJA 3AVMA 1HJRA 3GL1A 2YV0X 1XMOK 1KVBA 3AO2A 3MXJA 4KTZA 1CXUA 2HHTA 2HHUA 4DS5A 4LH4A 3EKUA 3OTOK 3LPTA 4LH5A 3RRGA 4WQ5C 1NGGA 2H3GX 5BN8A 1VQMN 1LW0A 4CK1A 4BC2A 3LPUA 3C65A 2O4IA 2HVIA 3ZX2A 1ZXOA 1HKCA 3G25A 3HOSA 2FC0A 2HSTA 4BC4A 2OPRA 3H3NO 1ZBUA 4YFUA 3CFPA 1KCFA 1WBBA 1NGBA 5AQQA 3NVMA 1QVFM 2QI2A 5FPEA 3VQ5A 3FZKA 3ZCMA 3NGIA 2D1KA 5GAHP 1KLMA 1WUAA 4FWQA 4B9LA 3AA4A 3QEXA 5EOYA 5ELZA 1VQ8N 4OGEA 2G8KA 2HHVA 4EZ9A 2QWNA 3VQAA 4J8FA 4DTUA 3HOTA 3AVIA 3CETA 1RBTA 4DCHA 1WSGA 4BE0A 4FJIA 4DQIA 3LANA 2P9IB 4AM7A 4JRPA 1NGAA 3RTVA 4RTFD 4GVEA 4E1NA 4N41A 1I94K 1C0FA 3ULDA 3R6MA 3CMEN 2QKBA 2XHBA 3TSPA 2VG5A 2LSNA 5DMRA 4BREA 4BEBA 1TAUA 3AAPA 1GLCG 1NG9A 2D0BA 4WE1A 3O3HA 3OYKA 1NKBA 2IVNA 2ZF5O 4B1UB 5LMNK 4ISEA 3LM9A 2D0AA 3L2UA 4HTLA 3CCLN 3H45C 4PL7A 4FL9A 3AA2A 3KWGA 4KKOA 4YDUC 4FPAA 3E01A 2VQEK 4M3XA 1XQSC 1T03A 2F8SA 1VQ7N 4M63C 5FROA 3ZT3A 4CI6A 2HW3A 4NCAA 4BR5A 3NFAA 5FLXO 4KHNA 5CYMA 4E19A 1N32K 3FZMA 1RTDA 1ASVA 1VQ9N 1S6PA 4B08A 2HVHA 4Z0UA 3OA9A 4J2EA 1IKXA 1S1UA 3O80A 1SQKA 3W0LA 2VWBA 2F8TA 3BUZB 4CIGA 1U49A 2P9NA 3MWPA 2J4RA 4DTRA 4FZYA 1VK0A 1N34K 3LDPA 1IH7A 3L2RA 1DT9A 1NOYA 3H1QA 3HM9A 4B9TA 5ADXH 3NVKA 3AVHA 3NF9A 2B6AA 2X6NA 4LD0A 4CHZA 3W3DA 4Y0WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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