3MN5A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
354
structure length
347
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRVGDERTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 119
structure length 347
sequence length 354
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn5A03
2VWBA 3CETA 1GLAG 3MN5A 3JS6A 1Z6RA 2GTDA 4GNIA 4O8KA 2P9IB 2Q2RA 4IWVA 4PKIA 2IVOA 1GLEG 3A5OC 4IJAA 4JHDA 2HF3A 5EXWA 2V7YA 2P9NA 2QXLA 3JXUA 3VGLA 1NGCA 1QZ5A 4Y0WA 3MN9A 2F9TA 1GLBG 1NGIA 1H1VA 3CERA 2PBDA 4PL8A 3O1BA 5ADXA 3HSCA 4BRKA 5AQGA 4BRGA 1ESVA 4BVOA 2FLOA 4I6MB 3ZX0A 3VESA 1BDGA 4BRAA 4PKGA 2W41A 4CZGA 3WXKA 3A8YA 4JAXA 3VENA 3WUHA 5FPMA 3H46O 1NGFA 4BGAA 1YAGA 4BC3A 2YHYA 1DGKN 1NBWA 4FPBA 3O8MA 4BROA 2GWJA 3HZ6A 3EN9A 4CZEA 3DJCA 5AQUA 5CE3A 2HF4A 2VCPA 1BU6O 2QWPA 4BRPA 3EZWA 5BN9A 1K8KA 3VF2A 5ADXH 1ZBSA 3EKUA 3H6EA 4JNEA 4YDUA 3VEZA 4EHTA 3A0IX 1IJJA 1HPMA 3VEOA 3FGUA 4FWMA 1BO5O 3DAWA 2BTFA 4QS7A 3CJ7A 3DXKA 4B1UB 3WEEB 5JLHA 4JHDB 4MO5A 4FL9A 3BF1A 2FF6A 3WXJA 3TPQA 3VEWA 3ZEUB 3B8AX 4A2BA 1HLUA 5JLFA 2D0OA 1BG3A 2P9UB 3ULEA 4FOEA 4H5RA 3L6QA 4QS8A 2F9WA 3U9DA 4BQZA 1ZC6A 4EIAA 3M6GA 2V51B 3BEXA 4CZIA 5AQOA 4BRIA 1D4XA 2A42A 3H1QA 2A41A 4JD2A 4DCHA 1GLJO 2YJEA 4FWPA 4CZJA 3O4WA 4FSVA 2E1YA 4F9OA 3D2FA 2CGJA 4FWLA 1X3MA 1S3XA 1E4FT 2J4RA 3VETA 3U8XA 3LDNA 4MO4A 4BR0A 3QDKA 4FO0A 3ATVA 5AQSA 3O1WA 1K8KB 3FFKB 4CJ7A 3M3ZA 4A61A 3VEYA 5BRHA 4WQ4C 3CQXA 2ITMA 4CD3A 1YUWA 5AQJA 3HTVA 1GLDG 1NLVA 1NMDA 3VERA 5AQIA 1NGHA 5EX5A 2V7ZA 3CJCA 4Z94A 2QWMA 1XUPO 3A5MC 3TU5A 2YHWA 1G99A 4HTLA 3ATUA 1KAYA 4FWKA 3D2EA 4H5TA 4HWIA 2IVNA 2CH6A 1GLFO 5F1XA 2DPNA 4H0VB 1NGEA 1ATSA 4NO7A 3QMLA 2AP1A 5AQRA 5B8HA 1HKBA 2D4WA 4FWQA 1YXQA 3W0LA 2Q0RA 4H0OA 4BRQA 2YI1A 2Q97A 5AZJA 1KAXA 4E1JA 4K41A 4JD2B 3EL2A 3I8BA 3L4IA 5AQLA 2FSNA 2A40A 1GLCG 3MMVA 3LM9A 3O08A 2P9LA 1WUAA 1RGIA 3IDHA 4WQ5A 1MWKA 2ASOA 5FPDA 3VOVA 5AQZA 3I33A 3H1VX 3FE1A 1X9JA 3LDPA 1TYQB 2PAVA 2P9KB 1E4GT 3R8EA 1BA1A 3KVGA 4EHUA 1DKGD 2D0PA 3WQTA 3FZKA 2ASMA 2E88A 1HUXA 1HKCA 2E8AA 2E1ZA 3UKRB 4PL7A 5BRFA 3VGKA 3LDLA 3RSEB 3BP8A 2ZGYA 5AZIA 3KZBA 5TKYA 4BRCA 5LJVA 3D2EB 3MCPA 5I9EB 5E26A 3R9PA 2P9PA 1JCEA 2HOEA 5AQTA 4QS9A 1KAZA 3F9MA 3QBXA 5BN8A 4DB3A 3O5BA 4MLEA 4DQ8A 3EO3A 4BRDA 1V4TA 3OHRA 3CQYA 3BUZB 2H3GX 1HJOA 2QWLA 4FOIA 3H3OB 4WYBA 1C0GA 2ZGZA 5KPRA 5LY3A 2FXUA 2P9NB 3CI5A 4BRNA 5KQDA 4BREA 3CIPA 3GOIA 4DHYA 4BR5A 3ENHA 4B9QA 3VEXA 3UKUA 1BOTO 1MDUB 2GUPA 5F0XA 1U2VA 3GE1A 4FWSA 4B1VA 4H0PA 4M7YA 5AQKA 2P9SA 3C0BA 1J6ZA 1QHAA 2FF3B 4IZ9A 5BR9A 4YDUC 4BRHA 1SZ2A 1U6ZA 2FSKA 3LDOA 4K42A 3S41A 3GDQA 3IUCA 5JMVA 1BWFO 4ISGA 2W40A 2GEMA 3VGMA 1XQSC 1NWKA 3IMXA 1QQOA 4CBWA 5BPLA 5EVZA 4BRFA 4CD1A 4KBOA 4XEIA 1T44A 2EWSA 5AZIB 3WXIA 3DXMA 2P9IA 4ISFA 3CJAA 3SLCA 4RTFD 3VF4A 2GWKA 5AQVA 4BC2A 2P9PB 2A6AA 3EKSA 3U4LA 4BVPA 4CZMA 2YHXA 1ZXOA 2AA4A 4H0TB 2VYPA 3GG4A 1Z05A 2CH5A 3DXKB 1CZAN 1KXPA 3MN6A 3FZHA 1QZ6A 3M1FA 4BC4A 1GLLO 3D7EO 4ISEA 3U9ZA 4H5VA 3ID8A 3FR0A 3FZLA 1S22A 3LDQA 1IG8A 1Q18A 1HKGA 3SK3A 3WQUA 3SJHA 1NM1A 3ULEB 4CZKA 1TUYA 5ELZA 1U2VB 4BRMA 5AQXA 1NGAA 2E2OA 3ZETA 2E2NA 4MLHA 3QICA 3UB5A 4O5FA 4GY2B 4H5WA 4CZHA 3W3DA 1DEJA 3D2FB 3QFUA 4M7XA 2OANA 1SAZA 3ZX3A 3MK6A 4B1ZA 5AFUA 3DXMB 3QBWA 3ENOA 3P4IA 5AR0A 2QWQA 1MWMA 4CBUA 3WEEA 1RFQA 3AARA 4M63C 4CI6A 1XC3A 2QWRA 4H5NA 2WUSA 3HM8A 4BR2A 5KQ8A 2NLXA 3IFRA 2E2PA 5EOYA 3H3NO 3ZEUA 1BUPA 4BR7A 5LJWA 2YCHA 1WOQA 2A5XA 3A5LC 2P9UA 4CZFA 5JICA 2NZTA 4C23A 5BRDA 1ATNA 2I7PA 1MA9B 4BQLA 2ASPA 1P8ZA 3FZMA 3H45C 4AM7A 1SQKA 5AFUH 4WQ5C 5AQFA 4H0XB 4K25A 4BC5A 2FSJA 2QWOA 4PKHA 2QM1A 4K43A 1RDWX 4FPAA 4EFHA 3AAPA 5AQHA 3ZETB 3CJBA 5AZJB 1X3NA 4A2AA 4BR4A 2CGLA 1EQYA 4JN4A 4XH4A 4EAHD 2QW9A 4AM6A 3SMSA 3AAQA 3L0QA 2P9LB 2QWNA 3C7NA 4BG9A 3QFPA 5FPNA 4BG8A 3CJ9A 3SMPA 4H0YB 1V4SA 3HI0A 4IO8A 4RCHA 1HX1A 3FLCO 3G25A 3HBTA 3R6MA 2Q1NA 2NRHA 5BPNA 1R59O 3AY9A 3GL1A 2Q31A 2UYTA 3QB0A 1T6DA 5KPZA 5F2RA 2E2QA 1BA0A 5AQNA 5AQWA 4B1XB 2BUPA 2YJFA 3LM2A 4BGBA 1ATRA 2Q36A 4WQ4A 5BREA 4BR9A 4XH1A 1C0FA 4NB4A 4B1YB 3MDQA 5EY4A 3KHYA 5AQQA 5AQMA 1QQMA 4CBXA 3BF3A 2IVPA 5KPTA 2A3ZA 3MN7A 3WT0A 2KHOA 2D1KA 2Q0UA 1LOTB 5FPEA 4XH5A 4A62A 3VPZA 1T6CA 3ZX2A 4RWTA 3UE5A 1NGBA 1NGDA 3WXLA 2IIRA 1LCUA 1JCFA 3A5NC 3J8AA 3LL3A 2V52B 1NGJA 3O80A 3CJ1A 5AQPA 4L3QA 1JCGA 1QQNA 4H03B 4I6MA 1TYQA 2P9KA 1OKJA 3C7NB 2ZWHA 3CHWA 1NGGA 1TUUA 3UKUB 2ZF5O 4LC9B 2CGKA 2E20A 3FZFA 5BPMA 3DWLA 4J8FA 2P9SB 3GBTA 4B1WB 1Y64A 5AQYA 3UKRA 3O6WA 4CZLA 1YVNA 4FWRA 3RSEA 2GELA 5E84A 2I7NA 4BRLA 3VEVA 4FWNA 4FWOA 4IJNA 2HMPA 3VF6A 4IXCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MN5A 3L2VA 2KTQA 4B3RK 1B9DA 1KFSA 2GTDA 3IG1A 1YF5L 4A57A 4O8KA 1XMQK 2IGIA 2Q2RA 4KH6A 1U48A 5JENA 2YKNA 4YHHK 3AGKA 4CJKA 2DY4A 2FC0A 1NGCA 1QZ5A 4A5BA 3E9PA 3AGRA 1H1VA 1CXQA 4LF4K 1CZBA 4CF0A 3HSCA 5AQGA 1SS6A 4BVOA 4BRAA 1P90A 2O8CB 4OPKA 4DU1A 4JAXA 3OYLA 2B6AA 5FPMA 2QA4N 3H46O 1NGFA 3C94A 4H4OA 4CJ5A 1M1KO 3CC2N 1NBWA 4CF9A 4JI0K 2GWJA 4GW6A 4U67L 2VCPA 4BRPA 2NRXA 3AV9A 3TAPA 1Q86O 3VF2A 3H6EA 5M1KA 1NJZA 1FKPA 2HBJA 4QCLA 3AO1A 1IJJA 3QINA 3VQPA 4DSEA 4QS7A 4I9LA 3DXKA 3TAEA 3WEEB 3L3UA 5JLHA 3TABA 4DTSA 1X1PA 4Z4FA 4HVJA 4MO5A 2RHKA 4DV6K 4DFKA 4PQUA 2D0BA 2XRIA 4B8CA 3V1OA 4A2BA 1HLUA 4DFPA 1OH6A 1YHQN 4JK7A 4H5RA 4KB1A 3V1QA 1JKHA 1ZC6A 4EIAA 1D8YA 2G8VA 3LZIA 2V51B 5M1PA 3J81O 1YIJN 4YOTA 4DCHA 4CZJA 3O4WA 4FSVA 3BY5A 4E7JA 2IC3A 2CGJA 4DR7K 4FWLA 3OBYA 4F2SA 1YTAA 3U8XA 3LDNA 1N8RO 1XNRK 3TARA 3K5MA 4AHUA 3RVCA 3BGRA 1K8KB 1QVGM 2YKMA 4DG1A 3M3ZA 3VEYA 5HP1A 1WNSA 3HTVA 4JKBA 1NGHA 1RBUA 3KKSA 5SZTA 3CJCA 4Z94A 2NRVA 4CESA 4B3SK 3AVCA 2HNZA 5KI6A 5HBMA 4HTLA 2F4VK 3ATUA 4FWKA 3D2EA 2OPPA 2VWKA 3M8SA 3G0ZA 3NVMA 3AVLA 2HBKA 4HUEA 3L2UA 2DPNA 2DFEA 4H0VB 3MXIA 1ATSA 4NO7A 4LF6K 3NH2A 3PIOL 2RE2A 1YXQA 4X64K 2ZD1A 3KJVA 1IKWA 1KQSM 2YI1A 3VQBA 4CFCA 1SL1A 4E1JA 1KTQA 3NF9A 1SL2A 4FJ7A 2P5OA 3MMVA 3LPUA 3IDHA 4E1MA 1D5AA 3B6OA 5HRRA 3CCSN 1JL1A 1HQEA 2HNYA 1VRTA 2PAVA 4R79A 4WF9L 2XHBA 1VHXA 2G8IA 2NRTA 1VQLN 4EHUA 2D0PA 2VG5A 3ZT4A 2F96A 4CJ3A 4LF5K 4DV1K 5C15A 3OYIA 5C25A 2RF2A 2E1ZA 1C0UA 1Q9YA 3J7YP 3AA5X 3FFIA 2P51A 1RDCA 4BRCA 4DSJA 5CR4A 4JEPA 5I9EB 1NK4A 4BY9C 4C8OA 1JLGA 2P9PA 2HOEA 5KRSA 3SYZA 4LFCK 3QBXA 4GKJK 3NDKA 4CJWA 4DQ8A 3PX4A 3LAMA 1V4TA 3OHRA 3CQYA 5C10A 2H3GX 2QWLA 4FOIA 5LY3A 3HSTB 3SQ4A 1E3MA 2W00A 2P9NB 3CI5A 3HT3A 4BRNA 4BREA 4DTPA 3OA9A 1HNXK 3GOIA 1S1UA 3OJSA 1N5YA 4E7KA 1Z25A 3UKUA 1MDUB 3AA4A 5F0XA 3GE1A 1IKVA 5FROA 1RT1A 4KHPK 4LH4A 1J6ZA 2QKKA 4IZ9A 1KVCA 2AJQA 4IOCL 2OA8A 1WSIA 1OVYA 4MDBA 1YJWN 4BE2A 1FKOA 1BWFO 3HRGA 3KK2A 4CBWA 3HVTA 4CJSA 5AZIB 2XY7A 3CM6A 3SLCA 4QOZB 2F8SA 3QIOA 1GOAA 3F5TA 4CZMA 1ZXOA 4H0TB 4H4MA 1B92A 3GG4A 4IO9L 3K2PA 1CZAN 3HM9A 3MN6A 2Q3SA 1WAFA 4BC4A 4JRPA 2D0AA 4DLEA 3U9ZA 2HW3A 4KFBA 3CMAN 4DQIA 2LSNA 1BGXT 2YNFA 1ZBUA 1S22A 4YOVA 3OS2A 4KTQA 1VQPN 4DV2K 1NM1A 2W6LA 1QVFM 1U2VB 3F2KA 1R0AA 3DI6A 3ZETA 5J2NA 1SKSA 2E2NA 4MLHA 3QICA 4I7FA 4E7HA 4LY7A 3E1YA 4GY2B 4CZHA 3HOTA 4LSNA 2P5GA 3W3DA 4W5QA 1GOCA 2FBXA 1KCFA 5HROA 4B1ZA 2XY8A 5AFUA 1S72N 1T7PA 3R1XA 5AR0A 1MWMA 4CBUA 3WEEA 3RR8A 4JRQA 2X78A 4CI6A 3V4IA 1XC3A 2WUSA 3DLHA 2EHGA 3HPHA 3ISNC 5GADP 2E2PA 3H3NO 4JK8A 5LJWA 4JLHA 3MX5A 3DRPA 3CCVN 1UAXA 3TTFA 2A1RA 1WSGA 3DLBA 3PX6A 3K9JA 3H45C 3FZMA 3C6HA 3SV3A 5AFUH 5AQFA 3VQ4A 3B6PA 4DFMA 3JAMO 3J7AP 2W6KA 2KW4A 4KHUA 2OPSA 4RW4A 4KRFA 4YOXA 1VQ8N 4FM0A 3TAQA 1JLCA 4A2AA 4BR4A 2CGLA 4XH4A 4JN4A 3HVRA 4EAHD 4JYAK 4IDHA 3AVJA 4AM6A 3TR8A 4DR3K 1T3VA 2QWNA 2KLAA 2YNHA 4PUOA 4LF8K 4BG8A 1V4SA 3QERA 4B9NA 1S6PA 1HX1A 3R6MA 1Q81O 2UUAK 4CFBA 1R59O 4K8XA 1T6DA 1A5VA 1BA0A 3TTCA 1J5EK 3I55N 1W7AA 1RTJA 2OTLN 2Z1GA 2PY5A 3S9HA 1VQ4N 4RW7A 1EWRA 1ATRA 1WB9A 1HYZA 2HVHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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