3MN6A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 120
structure length 360
sequence length 371
chains with identical sequence F, K
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn6A03
5AZJB 5KPTA 1HPMA 3ENHA 4J8FA 1NGEA 4CBXA 4CZMA 4BC3A 1TYQB 5JMVA 3VEWA 1NGBA 3WEEA 3VF6A 5AFUA 5KPRA 4FOIA 3ZEUA 3WXIA 2VWBA 3VF2A 1DKGD 1NGFA 4MO5A 5AR0A 5TKYA 4BRAA 3L0QA 4CZKA 3VEOA 3KHYA 4ISGA 3O5BA 2I7NA 4FWLA 1SQKA 3FLCO 3LDPA 3LDOA 2D0PA 3ZETA 1J6ZA 3MMVA 4IXCA 3VEZA 3CJ7A 2A5XA 3CJ1A 3EKSA 5E26A 4BREA 1NGHA 3GDQA 1JCFA 1QQMA 5KPZA 4Z94A 4CBWA 3DXMA 3QBXA 2ASOA 2P9LB 3LDQA 1ZXOA 3D2EB 4XEIA 4BRFA 1V4SA 5AQNA 2CGLA 3FZKA 3CJAA 2CGKA 2V7ZA 2F9TA 3H3NO 2QWLA 3EO3A 4B1WB 5EVZA 4BRDA 3M1FA 3FZHA 3D2FB 2PBDA 3AAPA 2V7YA 1S3XA 3SMSA 3H3OB 5ADXA 2P9PB 4PL7A 1U2VA 3U9ZA 2NZTA 2QWOA 4NB4A 3S41A 4FWRA 3WXKA 2YCHA 4E1JA 2P9SB 3LM9A 4BR9A 1C0GA 3A8YA 3TU5A 3VEVA 1RDWX 4FWNA 3UKUA 3WQUA 4IJAA 2P9UA 3DXKB 3O80A 4I6MA 4BC2A 5AQKA 2ITMA 5AQFA 3IUCA 3CETA 4BQZA 3UE5A 5EX5A 2Q36A 5E84A 2V51B 3BEXA 4M63C 4FPAA 2ZF5O 2QW9A 2E2QA 3GE1A 2E2NA 5AZIA 3ATUA 3CJ9A 3MCPA 2HF3A 1Z6RA 2I7PA 3CQYA 5CE3A 4HWIA 4H03B 5BRFA 1BU6O 5AQSA 4JD2B 1T44A 4IZ9A 4CZLA 5AQRA 4O8KA 1GLEG 4ISFA 3WT0A 2UYTA 3SJHA 1MA9B 3R6MA 4QS7A 3FGUA 3D7EO 1GLJO 4WYBA 5AQZA 3OHRA 4BC4A 4A2BA 5AQOA 1YUWA 1K8KA 4CZJA 1NLVA 5BREA 3HI0A 2D1KA 3UKRB 2QWRA 4WQ4A 4AM7A 4B1VA 4BR5A 3FZMA 1BG3A 4K43A 3VPZA 3SK3A 4K41A 2P9NA 4K42A 1U6ZA 4NO7A 2NLXA 4DB3A 3A0IX 4JAXA 4FPBA 5AQHA 5BN9A 2KHOA 3QFUA 4BRQA 5AQLA 3VGMA 1NGGA 2Q97A 3W0LA 3VGLA 1JCEA 1GLLO 5AQXA 1BWFO 3CJBA 3M6GA 5AQUA 3VESA 4MLHA 5AQWA 1S22A 3L4IA 2E2PA 3H45C 4K25A 3MK6A 4H0VB 2A40A 2CH6A 5EY4A 2FSNA 5KQ8A 2GEMA 4CZFA 1GLFO 3H1VX 1GLAG 4H0YB 5BRHA 5AQGA 4CBUA 2QWQA 4XH5A 1X9JA 1IG8A 2A3ZA 2P9KB 3C0BA 4BC5A 3LDLA 2YJFA 2FLOA 3HZ6A 5AQJA 2YHXA 1ATSA 2E20A 3O4WA 3RSEB 2F9WA 1QZ6A 4H0PA 4O5FA 2D4WA 5I9EB 4XH1A 4JHDB 2GUPA 2IVPA 4YDUA 4M7YA 4WQ4C 3M3ZA 5B8HA 3WEEB 3A5LC 1GLDG 3ZEUB 3JXUA 4QS9A 3D2FA 4CZHA 1V4TA 1EQYA 5FPMA 2CGJA 5FPNA 4M7XA 3C7NA 3U4LA 1E4FT 2A41A 3LL3A 3HBTA 2V52B 5LY3A 3ZETB 1MWMA 4RWTA 2WUSA 2ASMA 4BRGA 1KAYA 3ZX0A 1XUPO 3ZX2A 1P8ZA 3O08A 3DXMB 3O1WA 4BRIA 1HKCA 1NWKA 4PL8A 3GOIA 3ATVA 3CIPA 4CD3A 3IDHA 1E4GT 5JLHA 5LJVA 1IJJA 3WQTA 2J4RA 2GWKA 3AARA 2A42A 2Q31A 4PKHA 4RTFD 1RGIA 4A2AA 3HM8A 2YJEA 3W3DA 1MDUB 2BUPA 4QS8A 1SAZA 2ZGZA 1R59O 2IVOA 1NGCA 5AFUH 3HTVA 5JLFA 1HKBA 4IJNA 2HF4A 3WXLA 4F9OA 3QFPA 3KZBA 4FO0A 1U2VB 3VF4A 4YDUC 4BR7A 5FPDA 4FWQA 1NGJA 4FL9A 4H0OA 4EIAA 3FZFA 3EN9A 4BR0A 4H5WA 2FSJA 1HJOA 1KXPA 2E1YA 4Y0WA 5JICA 2P9UB 2QWMA 1WUAA 3UKRA 3DWLA 3QMLA 5ELZA 4B9QA 4EHTA 2GTDA 3EKUA 1GLCG 3UB5A 3CERA 3CHWA 5EOYA 1ZBSA 1QQOA 4ISEA 5BPMA 2P9IA 4BRHA 2W40A 1Q18A 3ULEA 4B1XB 4BR2A 5KQDA 2FSKA 3BF1A 1QQNA 3QDKA 3G25A 5AZIB 3VEYA 4H5NA 3FE1A 4H0XB 2D0OA 2A6AA 4IO8A 2PAVA 4B1ZA 4BG8A 3H46O 5AQTA 4CZGA 3SLCA 5AZJA 3CQXA 4FWKA 4WQ5C 4BRKA 1ATNA 2GWJA 1TYQA 3SMPA 4KBOA 1BA1A 2QXLA 2BTFA 1BUPA 5ADXH 4H0TB 3B8AX 4BRLA 3MDQA 4MLEA 3WUHA 1ZC6A 2ZGYA 1Y64A 1ESVA 4EFHA 1K8KB 3I33A 5F1XA 5AQPA 3GG4A 2IIRA 3GBTA 4BRPA 4IWVA 1KAZA 2H3GX 3H6EA 4EAHD 3TPQA 2P9NB 2E88A 3J8AA 4BVOA 2HMPA 3FR0A 1NGIA 3HSCA 4EHUA 4JHDA 2ZWHA 1T6CA 4H5RA 2YHWA 2P9LA 1QZ5A 4DCHA 3D2EA 3R8EA 3O6WA 3EZWA 2AP1A 4BROA 2FF6A 1ATRA 5F2RA 5BN8A 4PKGA 5AQIA 3R9PA 2E8AA 1D4XA 3BP8A 3O1BA 3H1QA 3U9DA 4CJ7A 4BRNA 1HUXA 3LDNA 4CD1A 4FWMA 3ZX3A 4CZIA 2CH5A 1BDGA 3CI5A 3VEXA 4H5VA 1YXQA 2YHYA 4FWOA 2P9PA 3P4IA 5BR9A 3GL1A 4GNIA 1DEJA 4MO4A 3VERA 2QWNA 4HTLA 2P9SA 3AAQA 1X3MA 3A5OC 3IMXA 2DPNA 2EWSA 1WOQA 2E2OA 1KAXA 5F0XA 3DXKA 2HOEA 3EL2A 3CJCA 3QB0A 1X3NA 4FWSA 4AM6A 1YAGA 1LOTB 4WQ5A 2E1ZA 4PKIA 1MWKA 4BGBA 5AQVA 4XH4A 4GY2B 4BRCA 1NBWA 1XC3A 3C7NB 3ENOA 5AQYA 4C23A 3I8BA 1YVNA 2IVNA 1BO5O 1JCGA 2VYPA 2Q0RA 1TUUA 4BG9A 2QWPA 3U8XA 3QBWA 4JD2A 3VENA 3QICA 1HLUA 4JN4A 1HX1A 1GLBG 3ID8A 2AA4A 1CZAN 2QM1A 4FSVA 1BOTO 2VCPA 3LM2A 4FWPA 3FFKB 3UKUB 5EXWA 2YI1A 3MN5A 3DAWA 4I6MB 1Z05A 3O8MA 1QHAA 1TUYA 2W41A 3VETA 3VOVA 5LJWA 4RCHA 3A5MC 2Q1NA 5BPNA 2ASPA 1OKJA 2FXUA 1SZ2A 1NGDA 5FPEA 3F9MA 1NGAA 5AQQA 4A61A 4H5TA 4BQLA 4CI6A 5BPLA 3IFRA 4L3QA 3BF3A 4JNEA 1H1VA 3JS6A 3MN9A 4BR4A 2OANA 3AY9A 4BVPA 1NMDA 1T6DA 5BRDA 1C0FA 5AQMA 4LC9B 1HKGA 4DHYA 3MN7A 1DGKN 2NRHA 4BRMA 1NM1A 1G99A 2FF3B 3BUZB 3WXJA 1RFQA 4CZEA 2Q0UA 3VGKA 2P9IB 1LCUA 4DQ8A 3FZLA 1BA0A 3A5NC 3ULEB 2P9KA 3DJCA 3KVGA 4FOEA 2GELA 2Q2RA 4A62A 3MN6A 4B1YB 4B1UB 3RSEA 1XQSC 4BGAA 3L6QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HK2A 5AZJB 5KPTA 3ENHA 1NGEA 4CZMA 1WSFA 4BC3A 1RTIA 4E1NA 3VEWA 3OYGA 1NGBA 4JEPA 3K9KA 4R79A 3VQ9A 3MXJA 3AVAA 4CHQA 5AR0A 1S1WA 4CZKA 3VEOA 3E9LA 1SQKA 3KLGA 2BANA 3LDOA 2D0PA 3MMVA 3WNEA 1YJ9N 3DRRA 4YNQA 5E26A 3GDQA 3DXMA 4M3YA 2GX9A 1RBRA 4DS5A 1TVRA 3ALYA 5SWMA 3VQ8A 1VSKA 3LDQA 3D2EB 3QLHA 4XEIA 4E19A 3OYNA 1L5UA 2CGLA 5FRNA 4FYDA 2V7ZA 3H3NO 2HBKA 2QWLA 5J2MA 3EO3A 3G0ZA 3SCXA 2HNDA 3AAPA 3L8BA 1S3XA 4A5BA 4IOXA 4PL7A 1U2VA 3U9ZA 3QIPA 4C8OA 3RRHA 4KHNA 3S41A 1W2BM 1VAZA 3NVMA 1TK8A 4E1JA 3A8YA 3ZSYA 1T03A 3VEVA 1RDWX 3NH2A 2QTDA 5AQKA 2ITMA 3AA2A 2WONA 2E4LA 4DQRA 3HPOA 2HHVA 4BQZA 2Y1IA 3VQAA 3DLLL 2V51B 2ZJPL 1YITN 2ZF5O 5AZIA 4AHVA 3IS9A 1YHQN 4H4OA 2I7PA 5CE3A 4W5RA 3KK3A 4H03B 1D9DA 5BRFA 4NYFA 5AQSA 2P5OA 4DLEA 2Z1IA 1KVBA 3WT0A 2BE2A 4JLHA 1EETA 2FBTA 5JVHL 2GUIA 4J2AA 4LD0A 4DV3K 2KKZA 1NLVA 4IOAL 3UKRB 4CHZA 4IKFA 2OPSA 4AF1A 1RBTA 3FZMA 4I2QA 3SK3A 4CJTA 2FC0A 4K42A 4NO7A 2DY4A 4DB3A 3A0IX 2RN2A 4E3SA 4YY3K 2XO7A 1RTJA 2ETJA 4AHRA 3NDKA 4BRQA 1JCEA 3CJBA 1NKCA 4MLHA 4LFCK 1ASUA 3H45C 4K25A 4WFNL 4M42A 4H0VB 3ZSRA 2VG7A 3OBYA 4C8NA 3CCRN 2GEMA 1GLFO 4YORA 1G15A 1NK0A 1RDCA 4H0YB 1DTTA 1QHTA 3PX4A 1JLFA 3L3UA 4KRFA 1RDUA 1OH5A 1IG8A 3C0BA 4CIGA 2YJFA 1IKYA 4FLWA 5AQJA 1S9GA 1LWCA 2YHXA 3MEGA 1ATSA 2E20A 1VQMN 3RSEB 4HUFA 2VG6A 1ASVA 4A59A 1SKSA 5C15A 3BGRA 2D0CA 2D4WA 4XH1A 1ZBHA 3C94A 4JHDB 4YDUA 1JKHA 4E1MA 4FCYA 4JS5A 3PX0A 4CZHA 4CEQA 3RTVA 3VQQA 1BL3A 4CJKA 2CGJA 2JLEA 3I8DA 3ENBA 5FPNA 1UOCA 4M7XA 4FJGA 3L2UA 1E4FT 3LL3A 4H8KA 4ILHA 3O9RA 2RHKA 1NG9A 2PYJA 1RT2A 1MWMA 5C24A 2WUSA 2ASMA 3PO5A 2HHHK 5HBMA 2PY5A 4ID1A 3ZX2A 4Z4FA 3HOTA 1LAVA 3O08A 3DXMB 2G8VA 1J54A 4KHSA 1KCFA 1E4GT 4GKKK 3L2RA 1GOAA 1BQMA 3K0SA 1IJJA 5M1NA 3SQ4A 3HT3A 2WOMA 4F2SA 4RTFD 1RGIA 4A2AA 4JK9A 2YJEA 2O8BA 1TK5A 1SAZA 5I42A 3KD1E 4CGDA 2XY6A 4FLUA 4F9OA 3WXLA 4JKCA 4CJUA 1WSHA 3QFPA 2Y1JA 1U2VB 3ID6A 4YDUC 4BDYA 4M3UA 2B5JA 2QI2A 2B6AA 4CK2A 4EIAA 3EN9A 3CCMN 5J2NA 2FSJA 3OBWA 2QWMA 3ISNC 2HVIA 5M1PA 2GTDA 3EKUA 2HMIA 3UB5A 3I0SA 1HNZK 5EU7A 2W40A 3ULEA 5KQDA 4DSLA 2FSKA 5AZIB 4BACA 3NAEA 3WNFA 5C12A 3JYTA 3AA5X 4BG8A 1RBUA 2NRVA 3ZLJA 4FWKA 4BRKA 2YHBA 5GIOA 2GWJA 4DF4A 1C0UA 3SMPA 4KAZA 1BA1A 2QXLA 4ELVA 1OH7A 1BUPA 1RDDA 5ADXH 5DK5A 1ZC6A 3S3NA 4EFHA 3CQ8A 4IDKA 3KLHA 4O4GA 3PV8A 3GG4A 4BRPA 3H6EA 1JLQA 3KLIA 5J2PA 4BVOA 5FLXO 4PY5A 1U04A 5GINA 3HP9A 4M3XA 4I2PA 5K14A 2G8KA 5HLFA 3HSCA 3HP6A 4EHUA 1T6CA 4DCHA 1IG9A 4BROA 3VQDA 4PKGA 1IBLK 3HOSA 2XRIA 3AO3A 1D4XA 1YF5L 1EX4A 3QNOA 2YHAA 4EZ6A 3TTDA 1DT9A 4BRNA 4BE7B 2QK9A 1VQ7N 2C1GA 3K58A 5KGWA 3SUQA 1BDGA 3NF6A 1YXQA 5BR9A 1T7PA 2BH1A 1EP4A 4DUZK 3AVIA 1IV0A 4OVLA 3VERA 4XJXA 2QWNA 1C1CA 2P9SA 4B3OA 2HHWA 4DTPA 1QE1A 1OH8A 4KHUA 4Z4EA 1KAXA 3T1HK 3DXKA 4B08A 3TAGA 4FWSA 4FM2A 4WQ5A 2ZM6K 1QSLA 4DR4K 3L2VA 4PKIA 4BGBA 4XH4A 4DU4A 3E9OA 3AV9A 1IH7A 2X6SA 1XHZA 3ENOA 4C23A 3NHGA 1YVNA 1N5YA 4IO9L 1X1PA 5HL7L 4CHOA 3U8XA 3ZSVA 1HX1A 3J7AP 1ILYA 1XMQK 3ZT0A 3TARA 4L8RB 1X9WA 3ZT1A 1SL0A 2BDPA 1S5JA 1JXBA 1GOCA 4F2RA 5H1SQ 3O8MA 3V1OA 4CEAA 2X74A 4RCHA 3A5MC 2O8BB 1RILA 2VWJA 1NGDA 5AQQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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