3MN6A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein/protein binding
source organism Drosophila melanogaster
molecule keywords Actin-5C
total genus 120
structure length 360
sequence length 371
chains with identical sequence F, K
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn6A03
1QQNA 2P9NA 5ADXA 3FE1A 3FZFA 4BREA 1MDUB 4XH1A 1SZ2A 3M6GA 4A61A 3WXIA 1HKBA 3D2EA 2GEMA 3A5MC 3BEXA 3UKUA 4BRDA 4FPAA 3HI0A 1NGCA 3FLCO 5BRFA 3S41A 4A2AA 4EAHD 3O80A 2QM1A 2Q97A 5AQVA 2E1YA 4PKGA 5E84A 3FZMA 3GG4A 4FWQA 5KPTA 1TYQA 3ULEB 4CZIA 3G25A 3CJBA 4H0TB 4BROA 3WXJA 2GWKA 3MN5A 1BOTO 3WXKA 3VF4A 1QQOA 3MN6A 5BR9A 4I6MB 1GLCG 3DXKB 3H1QA 2W40A 3QFPA 3BP8A 4H0OA 5ELZA 2YJEA 3H3NO 4WYBA 3ZX3A 2CGLA 4KBOA 4CZHA 2P9NB 2YHXA 1TUUA 5AQYA 3CQXA 4BR0A 2HF3A 1JCEA 1TUYA 3D2EB 4K25A 3UKUB 2GELA 4JD2A 3H46O 3LM2A 3TPQA 5AZIA 5AQOA 1WOQA 1XQSC 3QBXA 1ESVA 4BC5A 5AQTA 1ZC6A 4H0YB 3EKUA 2I7NA 4A2BA 1TYQB 3UKRB 2A6AA 3KZBA 3BF3A 1BO5O 1GLDG 1Z6RA 2D0PA 4C23A 1RFQA 3O5BA 4QS9A 1G99A 5JLHA 2CH6A 3LDOA 4CZLA 3GOIA 1RGIA 3LDNA 3VGKA 1C0GA 3AY9A 3LDLA 2FSNA 4BR4A 1NGBA 3L0QA 2PBDA 2GTDA 3VPZA 5BN9A 4CI6A 3CERA 1XC3A 4WQ5A 5F1XA 4PL7A 4JD2B 3ZETB 1HX1A 1ZXOA 2A40A 4XH4A 3CETA 3LL3A 5KPRA 2ASPA 4CJ7A 1J6ZA 1DEJA 3KHYA 2V7YA 1NGHA 3QFUA 4M7XA 5KPZA 5FPMA 2P9IA 1HJOA 5AFUH 1EQYA 5EXWA 4DQ8A 1HPMA 2FLOA 1GLEG 3LDQA 4MO5A 4QS8A 3ZX0A 2AA4A 2CGKA 3IUCA 4Z94A 3O4WA 3AAPA 2FSJA 2D1KA 3M1FA 1V4TA 4B1XB 2VWBA 3HBTA 1JCGA 1NGEA 2P9LA 4BG8A 2YI1A 4DCHA 3L4IA 4IXCA 3ULEA 2E1ZA 3MN9A 4B1VA 1NGJA 2QWPA 2VCPA 4NO7A 4ISFA 4CZJA 4BGBA 4WQ5C 4FOEA 4FOIA 4I6MA 3DXKA 3VEOA 1T44A 4YDUA 2BUPA 2YCHA 3SLCA 4CZFA 3R9PA 2E20A 4EHTA 4BR9A 3GBTA 3CJ9A 3FGUA 2P9IB 4ISEA 4PKHA 3RSEA 2D0OA 2QXLA 3O08A 3TU5A 5JLFA 5AZJA 1GLFO 2Q36A 2GUPA 1BA0A 4BRKA 5AQLA 1ZBSA 1YVNA 4JN4A 3JS6A 4EHUA 2P9LB 3ID8A 4K43A 1C0FA 4FWLA 4QS7A 3I33A 3UKRA 2P9UB 4MO4A 3EZWA 3LM9A 5BN8A 4BQLA 5AQGA 1BDGA 4CZGA 2ZWHA 3R8EA 5BREA 1HUXA 1D4XA 1U6ZA 4BQZA 1ATRA 5AQFA 4BG9A 2Q0RA 3RSEB 4EFHA 4RWTA 5TKYA 4FPBA 1Q18A 3L6QA 4XEIA 4IO8A 4BRCA 2UYTA 5AZJB 3FZHA 2BTFA 4FWNA 5AQWA 2QWLA 4IZ9A 3CJAA 3ZETA 4AM6A 3VEYA 2QWRA 3WUHA 4BVPA 4CZMA 1NWKA 1H1VA 1MA9B 3C7NA 3U8XA 4LC9B 1YXQA 4Y0WA 5AQIA 2A5XA 2F9WA 4WQ4A 1QZ6A 3P4IA 4GNIA 2IVPA 5FPDA 3H6EA 2E2PA 4HTLA 1YAGA 1ATNA 1DKGD 3VESA 3OHRA 3CHWA 1S3XA 2HF4A 4JNEA 4BRFA 1E4FT 3HZ6A 4BRMA 5BPNA 4EIAA 5AQJA 5BPLA 4BRIA 1QHAA 1HKCA 5JICA 2YJFA 3EO3A 4FWKA 1NBWA 2ZF5O 3MDQA 4BR7A 2I7PA 5AQNA 3SK3A 3DAWA 3ATVA 4FO0A 4JAXA 4GY2B 5AQUA 1HLUA 5EY4A 4PL8A 3U4LA 2Q0UA 2WUSA 1BWFO 4CD3A 4H5VA 4BRGA 1GLLO 3WEEA 1Z05A 2DPNA 4MLHA 2A3ZA 2GWJA 5AQZA 2P9KA 2AP1A 4IJNA 2YHYA 3VERA 3C7NB 5AQMA 3O1BA 3SMSA 4BRLA 3ENOA 1S22A 3W3DA 3UB5A 1YUWA 5BPMA 4BGAA 5EX5A 4M7YA 2A42A 5AQQA 4CZEA 1IG8A 1QQMA 5AQXA 4MLEA 4DHYA 2VYPA 4H5RA 2OANA 5AQRA 3LDPA 4BRNA 4BC2A 5FPEA 4FWSA 5ADXH 5JMVA 4B1WB 1LCUA 2P9SB 4BRAA 2F9TA 2P9UA 3H1VX 4H5TA 4AM7A 2E2NA 5LJWA 3WEEB 3M3ZA 3U9DA 2A41A 3VEWA 3VF6A 4RTFD 2P9KB 5EVZA 2D4WA 4BRPA 2ITMA 3SJHA 4BVOA 4CZKA 4M63C 3WQUA 3O1WA 1NGIA 1CZAN 3BF1A 5AFUA 3VENA 4FL9A 1KAXA 5FPNA 4O5FA 3I8BA 3A5LC 3VEVA 1NGDA 1MWMA 2ZGZA 3DXMB 5AQKA 2E2QA 3QBWA 3FZKA 1BG3A 3HSCA 1ATSA 1NGFA 3ZEUA 2FSKA 3CJ7A 5BRHA 3VGLA 3QICA 4L3QA 1JCFA 1BA1A 3MN7A 3F9MA 4IJAA 1NMDA 4A62A 2V51B 2NRHA 5F2RA 4YDUC 4BC3A 2ASOA 3CI5A 3CJ1A 4K42A 5BRDA 4FWOA 3AARA 3MK6A 2QWQA 4FWRA 1GLJO 3QDKA 2Q2RA 3JXUA 4H0XB 2ASMA 3IMXA 1X3MA 3DWLA 2FF6A 1E4GT 2Q1NA 3HTVA 5F0XA 2FF3B 1MWKA 3VEXA 3A0IX 3BUZB 5AQPA 3KVGA 3R6MA 3HM8A 3QB0A 1KAZA 1Y64A 3J8AA 2E8AA 4CBUA 4JHDA 3B8AX 1T6DA 3CJCA 5AR0A 3ATUA 4H0VB 3EKSA 2PAVA 3FFKB 3VF2A 3VOVA 4K41A 5CE3A 3ZEUB 1K8KA 4H5WA 5LY3A 4F9OA 1NLVA 2CGJA 2QWNA 3W0LA 5B8HA 1U2VA 3C0BA 5KQDA 1NGGA 2IIRA 4BR2A 1T6CA 5EOYA 2E2OA 5E26A 1X3NA 2P9SA 2FXUA 4B1UB 3H3OB 1NM1A 4CBWA 4IWVA 4FSVA 2QW9A 4FWPA 4BC4A 3A8YA 4BR5A 3ZX2A 4B1ZA 2J4RA 2P9PA 3IDHA 4JHDB 3WXLA 4BRQA 4WQ4C 2HOEA 3FR0A 2QWOA 3CIPA 3MCPA 3O6WA 1WUAA 3O8MA 1K8KB 5AQHA 3VGMA 2E88A 2IVOA 1IJJA 3EN9A 1LOTB 2CH5A 3ENHA 3D2FA 4RCHA 4O8KA 1U2VB 3DXMA 2W41A 1SAZA 1SQKA 3D7EO 5AZIB 2NLXA 4PKIA 3A5OC 1DGKN 1XUPO 2Q31A 2V7ZA 1R59O 3WQTA 1P8ZA 3SMPA 3H45C 4CBXA 3GL1A 3A5NC 3UE5A 1BUPA 4H03B 2H3GX 3CQYA 4NB4A 1QZ5A 4CD1A 1GLAG 4B9QA 5LJVA 2KHOA 3QMLA 2HMPA 1KAYA 5AQSA 3GE1A 3AAQA 4J8FA 2P9PB 4H0PA 1HKGA 2QWMA 1X9JA 2NZTA 4FWMA 4HWIA 2ZGYA 3WT0A 2EWSA 3EL2A 3FZLA 4BRHA 2V52B 3DJCA 4DB3A 5I9EB 4B1YB 1BU6O 4ISGA 1V4SA 3GDQA 1GLBG 1OKJA 4E1JA 1NGAA 1KXPA 2IVNA 5KQ8A 3D2FB 3VETA 2YHWA 1RDWX 3MMVA 3VEZA 4XH5A 4H5NA 3IFRA 3U9ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P9NA 2WTUA 3EZ5A 1SL0A 2X78A 1NOYA 2BDPA 4FJMA 1MDUB 1SZ2A 3M6GA 4OPJA 2A1RA 1BIUA 4M3RA 3A5MC 4FPAA 2HHWA 5BRFA 4CK1A 4EAHD 5M1NA 3O80A 1NNEA 3QEPA 2D5RA 3SBGA 1M90O 4E72A 5E84A 1LWCA 4FWQA 2XHBA 3ULEB 3CJBA 3WXJA 1OH6A 2UXBK 4CJUA 2G8VA 1HYZA 1QQOA 3OTOK 3SV3A 1WLJA 3BP8A 5IWAK 3H3NO 5KI6A 2CGLA 3K5NA 3QEXA 3HP9A 2YHXA 3RVCA 5HLFA 4DUZK 1JCEA 3PX4A 1NK9A 2Q3SA 3MWPA 1OH8A 1WOQA 3QBXA 4FLWA 3E9PA 3V1RA 3EKUA 4BDYA 1UA1A 1XHZA 2F8TA 1TYQB 4X64K 4DTOA 1QVFM 2VGNA 4OGEA 1Z6RA 4IDKA 4ZTJA 3SPYA 3CF5L 4QS9A 4IEIA 4DR5K 1KFSA 3V1QA 3GOIA 4HCBA 3LDNA 4DLEA 1VSHA 3LDLA 1C0MA 1IO2A 4BR4A 1NGBA 4JI1K 4B8AB 4K8ZA 1XC3A 3TTCA 4ELVA 4JI6K 3NH2A 3E9LA 1EWRA 1HNZK 1QSSA 2ASPA 4LFBK 3QFUA 3R3LA 2YV0X 5AFUH 4FM1A 3TSPA 4DTMA 1HPMA 4IG3A 1C1AA 3ZX0A 1ZBIA 3SUQA 3O4WA 3AAPA 3NAEA 1TV6A 2YNFA 4RW9A 3HM9A 4BG8A 3ULEA 2E1ZA 3MN9A 4PUOA 3CFPA 4ISFA 4CZJA 4BGBA 4WQ5C 3QNNA 3U3GA 1IG9A 3VEOA 3O9UA 1T44A 4ILHA 4YDUA 2YCHA 4CZFA 3VMFB 2ATQA 3P39A 1S1VA 3CJ9A 4OX9K 2P9IB 1WNSA 2O8EB 1A5VA 1VSJA 4GVMA 3RSEA 4J2DA 2QXLA 4CJPA 3OYAA 1TGOA 2D0AA 2UUAK 5FRMA 1GLFO 3VQ4A 2HNDA 3VQAA 4NCGA 4CEAA 5SZTA 4BRKA 5M1PA 4EHUA 2P9LB 3ITHA 2FBVA 1HNWK 4FWLA 1HQUA 2P9UB 4OPKA 1ASUA 3SQ0A 1KFDA 1VQMN 3OA9A 3OYHA 4BQLA 3TAGA 5AQGA 5M1KA 4DV7K 3D0PA 1RBUA 4CZGA 1Q8IA 3SV4A 5J2MA 2Z1IA 3VQ5A 4FJKA 3T19A 4GKKK 4CJQA 2Q0RA 2VWJA 4RWTA 5TKYA 4BRCA 2UYTA 5AZJB 4AHUA 3DLLL 2QWRA 4NXNK 4BVPA 3AVBA 1MA9B 4RW8A 4DR1K 3C7NA 3OYEA 1HYSA 2F9WA 2NRZA 2VG7A 1O13A 2IVPA 3QINA 4K8XA 3VESA 2DFEA 3VTIA 4M3ZA 4FJHA 3RR8A 4BRFA 3LP0A 3QERA 1REVA 5AQJA 1T8EA 1HKCA 5JICA 4EZ9A 4YOYA 2YJFA 3VQPA 3AO1A 4KHWA 4FJ7A 2I7PA 5AQNA 3ATVA 4JAXA 1YJWN 1HLUA 1N36K 4PL8A 4QOZB 3U4LA 4AHRA 4CD3A 4WFNL 3SAGA 4FK2A 3FFIA 1DTTA 2GWJA 1W9HA 2P9KA 2O8BB 1BCMA 1WSEA 2E6LA 1XNQK 1C1BA 1YI2N 4KTZA 3KD1E 2O8EA 5J1EA 4X65K 5T7BA 5EX5A 1CZ9A 4C1NI 4FZZA 4I2PA 4DV4K 5AQQA 4CZEA 5AQXA 2Z1JA 4DSIA 2VYPA 4H5RA 4BRNA 4B3SK 4CHOA 2QI2A 2QA4N 4DWIA 4BY9C 1S1TA 2P9UA 2KQ2A 3HOTA 2E2NA 1RT6A 3AA5X 3WEEB 4A59A 1WBDA 4DF8A 3VEWA 5GIPA 2RN2A 4CGHA 3AVFA 2NRVA 3O9TA 4HVJA 1FKOA 4CZKA 3O1WA 1RT2A 5E41A 5AFUA 1RDBA 5HRSA 3PY8A 1KC8O 1KAXA 3I8BA 4KH4A 3A5LC 3VEVA 1NGDA 4KAZA 2F4VK 3QEWA 2JWLA 1BCOA 3DXMB 1KRPA 1T7PA 3QBWA 5J2NA 1YVUA 1YHQN 3OYNA 3KWGA 3TABA 3T1AA 3MX2A 3AO5A 4AILC 2XO7A 4IJAA 3J81O 4LF6K 5F2RA 4B9VA 5TKWA 3THYB 2QWQA 1TKDA 3JXUA 4Y1DA 3L2QA 2RE2A 1MWKA 3BUZB 3NGYA 5AQPA 1U04A 2O8BA 4N56A 4Z4GA 3T1HK 4JHDA 5HOOA 4KPYA 3LP3A 4B9TA 4AQYK 2EX3A 3THVA 4NLBA 4XIUA 2PAVA 4K41A 3VQ6A 2QTDA 3OYCA 3L3VA 4IFVA 4KB1A 3KLFA 3Q7CA 2GUIA 4OKKA 3NGZA 3W0LA 5B8HA 1U2VA 5KQDA 1NGGA 1T6CA 1VQON 4JK7A 4FM0A 1RDAA 3L4QA 3WNHA 4C1NK 3M8SA 4IWVA 3G4SN 4FSVA 4FWPA 1KVBA 4BC4A 3EY1A 4LH4A 3A8YA 4RG8A 3R1XA 3ALYA 3VA0A 2J4RA 4KO0A 3CYGA 3IDHA 3E01A 3NH0A 4BRQA 4WQ4C 4KHUA 3THXB 4KFBA 3VGMA 3CCJN 1X9WA 3SPZA 4O8KA 4OLBA 5FDLA 3DXMA 4KH6A 1L5UA 3D7EO 2OYQA 3A5OC 1P8ZA 4E89A 4KHSA 4IOCL 4H03B 4FLUA 2JGUA 3CQYA 5KGWA 3KKRA 1TK5A 4WF9L 4CD1A 3D6RA 4C8OA 1GOCA 4B9QA 5LJVA 3QMLA 2G8IA 4LY7A 3AAQA 4J8FA 1HKGA 1VSDA 2HNZA 3THYA 3WT0A 3OS1A 4BRHA 2V52B 3ISNC 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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