3MN6A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 120
structure length 360
sequence length 371
chains with identical sequence F, K
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn6A03
3O8MA 4FWSA 4L3QA 4EHTA 4H5RA 2A5XA 4WQ5C 2P9IB 1V4TA 2A6AA 1NGFA 3TU5A 4BR7A 1EQYA 1LOTB 4K43A 2P9LA 4BREA 1RDWX 4HWIA 5AQQA 4XH1A 2Q97A 1JCEA 3I33A 3CI5A 4YDUC 3VEWA 1T6CA 3MMVA 3MK6A 3LDOA 2IVPA 1GLEG 1NGIA 3G25A 5FPNA 5F0XA 4O5FA 1GLCG 4IJNA 2VWBA 3MN6A 2FXUA 4JHDA 2ITMA 1K8KB 2DPNA 1QQOA 3BEXA 4WYBA 2E88A 1Y64A 3AAQA 3EZWA 3I8BA 4ISEA 2D1KA 2I7NA 1HKGA 4B1VA 1TYQB 2YHYA 3L0QA 4CJ7A 2NRHA 1XUPO 1TUUA 4DCHA 2QWLA 2Q2RA 1S22A 3O80A 3VEVA 1BG3A 3VF2A 1MWMA 3QBXA 2OANA 4FOEA 2CGKA 4CZMA 3A5NC 3DXKA 3HZ6A 1RFQA 4B1YB 4PKIA 1DKGD 4PKHA 3RSEB 3J8AA 3EKUA 4NB4A 4RTFD 5LJVA 3GG4A 2I7PA 3UKUA 2V7ZA 3F9MA 4FSVA 2HF4A 2P9SA 3R6MA 3VGMA 3L6QA 4DHYA 5AQNA 1NLVA 1J6ZA 2W41A 3S41A 1MA9B 1HKCA 3IMXA 4H0PA 2IVNA 4IWVA 2ZGYA 3CJBA 1HKBA 2P9UA 1BA0A 3QICA 5AR0A 2YJFA 4BRFA 4H03B 4B9QA 2P9NB 2GEMA 3A0IX 3MN7A 2CH6A 4B1ZA 2QWOA 1NGBA 3M6GA 3AARA 2YHWA 3VENA 2QM1A 2F9TA 3HBTA 3VF6A 5JLFA 3VF4A 3UB5A 1SAZA 4PKGA 1YAGA 1S3XA 2PAVA 3HM8A 4KBOA 1HX1A 3KHYA 3DXMA 4XEIA 2QXLA 3ZEUB 5AQHA 3BF1A 3ULEB 2CH5A 3SMSA 3A5LC 1GLAG 5BPNA 3D2FA 5AQSA 3C0BA 3QMLA 3RSEA 2NLXA 4QS8A 4I6MB 3IFRA 3UKRB 1OKJA 1T44A 2E1ZA 2Q0UA 4BRGA 1U2VB 1HJOA 4H0OA 3VEOA 5JMVA 1NGDA 2FF6A 2P9PA 2V52B 2CGLA 1Q18A 5TKYA 4EFHA 1P8ZA 2A3ZA 5JICA 2P9KA 3MDQA 2YCHA 3AAPA 1GLDG 2ZGZA 5E26A 1ATNA 3TPQA 1IJJA 1QZ6A 3M1FA 4CZHA 4PL7A 3CJ1A 4BRDA 1KAYA 3CJ7A 3ZX2A 3FLCO 3GL1A 1BO5O 4XH4A 5AQFA 3H3NO 3WQUA 3JXUA 2QW9A 3O5BA 5AZIA 3U9ZA 4B1UB 4CZLA 2ZWHA 4AM7A 4EAHD 3DJCA 1C0GA 4M7XA 4RCHA 2GUPA 1NGGA 4DQ8A 3R8EA 2GWKA 2GWJA 3L4IA 4JNEA 1NM1A 1MWKA 1NMDA 4BR9A 2J4RA 3MCPA 3A5OC 2ASMA 2HOEA 2E2QA 2Q1NA 3SLCA 3ULEA 3ENHA 2Q36A 2QWPA 2VCPA 3ID8A 5KPTA 3VEXA 4A61A 1X9JA 3WUHA 4BQZA 2EWSA 4Z94A 2Q31A 5ADXA 1KAZA 3A5MC 3CETA 3DAWA 3H1VX 3W0LA 2GTDA 2QWMA 1NGEA 1QQMA 3M3ZA 1BOTO 1JCFA 4K25A 4M7YA 3O6WA 2V51B 5E84A 3C7NA 3VESA 3EN9A 4O8KA 2E2PA 3SK3A 2BUPA 3GOIA 3FZLA 3R9PA 4BR2A 1GLFO 3U4LA 3QB0A 4CBXA 2P9IA 2FSJA 2FSKA 2UYTA 4E1JA 3CQXA 1SQKA 4H5WA 4CBUA 3CERA 3U9DA 4CZIA 4QS9A 1NBWA 4IXCA 3WT0A 3EKSA 2AP1A 3CJ9A 3LDNA 4FWOA 4XH5A 3P4IA 3D2EB 3H46O 1XC3A 2E8AA 4GY2B 4CI6A 3QBWA 2E20A 3GE1A 3ATUA 2PBDA 3IUCA 2NZTA 3WEEB 4BQLA 5AQUA 3VEZA 5AFUH 3LDQA 1GLJO 2HMPA 1MDUB 5EXWA 1K8KA 5EY4A 3WXIA 1RGIA 4BC5A 2ZF5O 4M63C 4CZKA 2D4WA 1TYQA 4ISFA 4CD1A 1BA1A 3ENOA 1HPMA 3CQYA 4K41A 4BR0A 4LC9B 1SZ2A 2Q0RA 3BP8A 3H1QA 4FWRA 2QWQA 4BR4A 1X3MA 3QDKA 1CZAN 1DEJA 5JLHA 3QFUA 3LM2A 4B1WB 4A2BA 4JHDB 1QZ5A 1YXQA 2E1YA 4FWKA 3ZETB 4BG8A 4BROA 2D0PA 1BU6O 3AY9A 4FWQA 4BG9A 1U6ZA 4WQ4A 4CD3A 1KXPA 5BPMA 3A8YA 3KZBA 3VGKA 2F9WA 4H5NA 2E2OA 3HSCA 5AQVA 4FWNA 3LDLA 4J8FA 4IJAA 2A40A 4FPBA 4H0TB 5AZJB 1HLUA 4IO8A 3OHRA 5LJWA 2W40A 4BRPA 1Z05A 3DXKB 3VOVA 3D7EO 4Y0WA 2QWRA 2VYPA 3UE5A 4BGBA 4GNIA 2P9NA 2CGJA 1G99A 1Z6RA 3UKUB 5BR9A 3CJAA 5AQTA 2YI1A 4H5TA 5ELZA 2P9SB 4FWPA 5AQLA 1HUXA 5AQPA 1ATRA 1ATSA 1T6DA 5BRHA 2A42A 5KPRA 1YVNA 4BR5A 1BDGA 1YUWA 3O1BA 4FWLA 4NO7A 4EHUA 4BRMA 4HTLA 4JAXA 3IDHA 4QS7A 4PL8A 3EL2A 2YJEA 4JD2B 5EOYA 3GBTA 4DB3A 2P9UB 3ZEUA 2FLOA 3FE1A 3WXJA 4BC4A 1BUPA 3WXKA 4BRNA 1X3NA 5ADXH 1GLLO 4ISGA 3GDQA 3VEYA 3O08A 4A62A 4I6MA 3VGLA 4BRHA 4EIAA 3UKRA 3HTVA 5AQYA 2KHOA 3ZETA 1U2VA 4CZJA 3H6EA 5AQJA 4BRIA 4BC3A 3JS6A 3VETA 3ATVA 3QFPA 4CZFA 5CE3A 3EO3A 1NGCA 3DXMB 5AQOA 5BPLA 3BF3A 3VPZA 5AQZA 4FWMA 2E2NA 3CJCA 3WQTA 3CIPA 1ESVA 5AZJA 1BWFO 5EX5A 2ASPA 4MLEA 3D2FB 3LM9A 5AQMA 4BRAA 1R59O 3MN5A 3SMPA 2QWNA 4BRKA 2IIRA 3WXLA 4BGAA 3BUZB 3MN9A 2D0OA 2ASOA 4BVOA 4FPAA 5FPEA 5F2RA 1D4XA 1KAXA 4BC2A 4MLHA 1WOQA 4BRCA 3FZHA 2P9PB 1ZC6A 5F1XA 1WUAA 2GELA 3FFKB 4H0XB 1E4GT 2P9KB 4BRLA 1ZXOA 3FZMA 1QQNA 1V4SA 4MO4A 5AQRA 5AQGA 2FF3B 3LL3A 2H3GX 1IG8A 4JD2A 4A2AA 2V7YA 1JCGA 1NGJA 4BRQA 3ZX0A 4H0YB 2P9LB 5BRDA 1NGHA 3HI0A 4C23A 5I9EB 1C0FA 5AQKA 1GLBG 5AZIB 1DGKN 4JN4A 2YHXA 2BTFA 3DWLA 4CZEA 4FO0A 5BREA 1E4FT 2A41A 3H3OB 5AFUA 4BVPA 3B8AX 1LCUA 3H45C 5AQXA 4CBWA 5AQIA 4AM6A 5KQDA 1ZBSA 1QHAA 4F9OA 4H5VA 4MO5A 5BRFA 4H0VB 3FZFA 3SJHA 1NWKA 1TUYA 3LDPA 3KVGA 4RWTA 5BN8A 1NGAA 3FR0A 5KQ8A 3FGUA 4WQ5A 5AQWA 2IVOA 4FL9A 5EVZA 1H1VA 4CZGA 3W3DA 5FPMA 5KPZA 5B8HA 4IZ9A 3D2EA 2AA4A 4B1XB 2HF3A 4FOIA 3U8XA 3VERA 4K42A 5LY3A 4YDUA 2FSNA 4WQ4C 3C7NB 3WEEA 3ZX3A 5FPDA 2WUSA 3CHWA 5BN9A 3O4WA 3O1WA 1XQSC 3FZKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LMNK 3RMAA 3HK2A 4H5RA 2E5LK 1BL3A 4WQ5C 5CYQA 1L5UA 5FRNA 3VQDA 2NRRA 4OGCA 2A6AA 1NGFA 3LP3A 3DM2A 1EQYA 1LOTB 4DSIA 1JCEA 3LZJA 3CI5A 3P38A 4DV6K 3KWIA 4DV1K 4ILGB 4Z4HA 3MAQA 3NF7A 5FPNA 3G25A 3VQBA 3SQ1A 4O5FA 5KGXA 4DFPA 2O8BA 4IJNA 4DS5A 4FJ8A 4WFAL 2ITMA 4FJIA 4CJKA 3NE6A 1S6PA 4ISEA 2P5OA 3ISNC 3KIOA 1XUPO 4DCHA 4LF7K 4LF5K 2KLAA 2FBYA 3AVKA 3T19A 3VEVA 3VF2A 3DI6A 1GOCA 4FJLA 3OYMA 3AO1A 1KCFA 3RSEB 4DTNA 1U04A 3KJVA 3J7ZO 4CIFA 1N34K 3F9MA 1RTHA 2HF4A 3R6MA 3VGMA 1A5XA 2E6LA 2B4JA 4IBNA 5LL6Z 4G9ZA 2OZMA 1J6ZA 2W41A 3S41A 4B3TK 1MA9B 3IRXA 3THXB 4I7FA 2IVNA 4IWVA 3I0RA 1GOBA 4YOXA 1KD1O 4YOUA 3CJBA 1WAFA 3H08A 5AR0A 3CMEN 3J81O 3LPTA 4JV5K 4B9QA 2GEMA 1HNXK 4PA1A 1EKEA 2QWOA 1K9MO 2VG6A 3ZSOA 3M8QA 3AARA 2YHWA 3VENA 3QEXA 1WB9A 2F9TA 4CJ5A 3PX6A 4JKDA 3HBTA 3VF6A 3TAPA 3PY8A 3UB5A 1J5OA 4U67L 3HM8A 2PAVA 5M1PA 3V1QA 5CZ1A 3DXMA 4DQSA 2O8EB 4XEIA 1QVFM 1B92A 3TWHA 5AQHA 5KI6A 3JAMO 2OYQA 5HROA 3OVNA 3SMSA 1GLAG 4CHNA 3D2FA 3KTQA 1VQKN 4QS8A 2X6SA 4I6MB 3IFRA 3UKRB 4OLBA 4B3OA 2Q0UA 3VEOA 4GV6A 3QO9A 4YOYA 3SZ2A 1JLBA 4EFHA 1BGXT 5JICA 1RDCA 4DR6K 1N8RO 3AAPA 1GLDG 2ZGZA 4CW7B 3RR8A 1C1AA 3OYDA 3I8DA 1IJJA 3HYFA 3NGIA 4DU1A 1KAYA 3HJFA 1QVGM 1BHLA 1BO5O 3SUPA 3O4NA 3V1RA 4FCYA 2UU9K 4M3ZA 3WQUA 1OVYA 1HNVA 2PZSA 3CMAN 3TAGA 5SWMA 1VAZA 2JGUA 5M1FA 4JNEA 1EETA 3DMJA 1TV6A 1NMDA 1Q7YO 2J4RA 4DTSA 2HHUA 3A5OC 2DFHA 2QEXN 3DLLL 4R5PA 1YTAA 2YKNA 3MX5A 4JKCA 5LMUK 3AO5A 2Q36A 4OKEA 5KPTA 4C8OA 4A61A 2O8CA 1ZBUA 1JLAA 1BCOA 4DTOA 3PUFA 4H8KA 3DAWA 3V4IA 2GTDA 1QQMA 4M7YA 3TSQA 5HOOA 4FM0A 5MLCQ 4ICLA 4DR4K 3AVJA 5JVHL 3EN9A 4DTUA 4FVUA 2FC0A 4E1JA 1VRUA 3CQXA 4AHRA 4CBUA 3B6PA 3C65A 4IXCA 3VQ7A 1XI1A 4IDHA 2BANA 4JI8K 4FW1A 4YOWA 3GE1A 3ATUA 3IUCA 1SUQA 4N56A 1L3UA 1CZ9A 2A1RA 4DU3A 5EY4A 1RBTA 1RDUA 3WXIA 4FJHA 1YI2N 2ZE2A 3OYKA 4ISFA 4KO0A 4O0IA 4GMJB 4CD1A 1BA1A 2DFFA 1HPMA 3VTIA 4BR0A 3E01A 3E1YA 5FRMA 4CESA 4BR4A 3ITHA 4B9VA 2OPQA 3J7YP 4X62K 4DV0K 2OCEA 4A2BA 1Z26A 3ZETB 4BG8A 4JKAA 2D0PA 2EHGA 4FWQA 4PY5A 4B9UA 3D45A 4DTJA 3DRPA 1VSFA 5BPMA 1KLNA 3AV9A 2F9WA 2HHWA 4ID5A 3P83D 4H5NA 3HSCA 1YIJN 3NH0A 4JRPA 3THXA 3AVHA 5AZJB 4KH6A 4ZTFA 2W00A 3OHRA 4CK3A 4FZXC 2D0AA 2UXDK 1Z05A 4X66K 3O9RA 4DWIA 4ZHRA 2QWRA 2VYPA 1RT3A 1N36K 4CVNE 2OZSA 1Q9XA 3VTHA 3MWPA 4CF8A 1G99A 3IAYA 5AQLA 4FWPA 2F8SA 3C95A 4JKBA 1ATRA 1HJRA 2A42A 3A2FA 4CGJA 3PIPL 1XMQK 3CC2N 1YVNA 4BE7B 2FBVA 1JKHA 2HB5A 3S3NA 1BDGA 4KHWA 3O1BA 2G8IA 5DMRA 4HTLA 4JAXA 3IDHA 4YHHK 2O8EA 3EL2A 3P39A 2YJEA 5EOYA 3P5JA 4XIUA 5ADXH 1VSLA 2WC9A 3SAHA 2WOMA 3PSFA 2VWKA 4I6MA 3VGLA 5EU7A 3UKRA 2YHAA 3SCXA 4FM2A 5AQJA 1EWQA 3HRGA 3NDKA 2QTDA 3HO1A 3OYNA 5CE3A 3VQCA 3EO3A 5AQOA 5BPLA 1VQNN 4YNQA 3G0ZA 4E3SA 3CJCA 1HYZA 3CIPA 4CCHA 3S9HA 4HUGA 5AQMA 1S9GA 4BRKA 2XHBA 3TARA 2VQEK 4Q5VA 3BUZB 1FXXA 2RKIA 4HUEA 5F2RA 3CCEN 2HMIA 5DM7L 4MLHA 4O5BA 4Z4GA 2P9PB 1ZC6A 4AILC 1WUAA 1OVQA 4N41A 4CEDA 2IDOA 4H0XB 3T1HK 3VMFB 5HBMA 2HHQA 5GADP 2HNDA 3L8BA 4WF9L 2HVHA 5AQGA 1NGJA 3TI0A 1ZBHA 4CGHA 3KLIA 3ZX0A 4H0YB 4OJRA 5M1OA 1U47A 3SPZA 3QLHA 2E6MA 4M3WA 3KK1A 1RBVA 4E89A 3DWLA 4HHTA 1BI4B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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