3MN6A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
b'VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 120
structure length 360
sequence length 371
chains with identical sequence F, K
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn6A03
2QWLA 4H0YB 3EKUA 3O6WA 3RSEA 3LM9A 4A2BA 1IJJA 5EX5A 3KZBA 1U2VB 3H1VX 1K8KB 1HKBA 3C7NB 3CQXA 3HSCA 4BGAA 5KPTA 3SLCA 1QZ5A 3AAQA 3QBXA 4JAXA 3VENA 1HX1A 3GDQA 4H5WA 3ZEUA 1Y64A 5FPDA 4B1UB 2BUPA 5AQNA 5ELZA 3ZX0A 4CZHA 4CZFA 1KAZA 1KXPA 4H5NA 5AQPA 2E1YA 3HZ6A 5F1XA 2FSJA 3QB0A 4IXCA 1U2VA 1K8KA 2D0PA 4A62A 3WEEA 4CBUA 2HOEA 3R9PA 3SJHA 1MWMA 5AQOA 2E20A 5LJWA 5ADXH 4M63C 2A5XA 1RFQA 3GOIA 5AQYA 1ATRA 2F9WA 2I7PA 3ZX3A 3FE1A 3M3ZA 3P4IA 4WQ5A 2V7YA 3IUCA 4BQZA 4CJ7A 2GWKA 2HMPA 3VERA 1C0GA 3UKRB 2D4WA 2P9PB 5F2RA 2PBDA 3FZKA 5E84A 3ENOA 4BVPA 2PAVA 5BR9A 2GWJA 1QZ6A 1CZAN 1BA0A 3VGLA 3FZHA 5JLHA 1BWFO 3LDPA 2ZGZA 3A5LC 4CI6A 3EL2A 3LDOA 4K42A 3ULEB 3D2FB 2AA4A 4WQ5C 4MO4A 4ISFA 5KPRA 3CI5A 4CZLA 4IWVA 3D7EO 5AQRA 5AQUA 4RWTA 4WYBA 2CGJA 3WT0A 2Q97A 4H0OA 1XUPO 3HM8A 4BC2A 4CBXA 3CJ1A 1T44A 2D0OA 2A40A 1BUPA 4BROA 2KHOA 4JD2B 3FR0A 1BG3A 1X3NA 3UKRA 2CGLA 1YAGA 2P9PA 2E2QA 1R59O 3LL3A 4O8KA 5AQSA 1Q18A 4AM7A 1QQMA 3R8EA 3VEXA 4XEIA 4YDUC 4GNIA 5AQLA 3BUZB 3CJCA 4BGBA 5AZIB 3D2FA 2FF6A 2Q1NA 1X3MA 2QM1A 3L0QA 2FF3B 3ATUA 2FSKA 2P9KB 1NGCA 4XH1A 1JCEA 2FSNA 2YJEA 5BRDA 4BR0A 3VOVA 2CH5A 3ZX2A 5BPNA 1Z6RA 2IVOA 4FWMA 5BRHA 2E1ZA 1YUWA 3WXLA 3U9ZA 4CZGA 5AQIA 4A2AA 2AP1A 2V51B 4MLEA 3MN6A 2ZGYA 3A5OC 2FXUA 3CQYA 3U9DA 4EIAA 1D4XA 2ASPA 2QWPA 4H0PA 4CBWA 3MN9A 1NGIA 3HI0A 3IMXA 4FWPA 3VESA 4BRKA 2A41A 4LC9B 5AZIA 3VEYA 3B8AX 4XH4A 3HBTA 2J4RA 4HTLA 2P9KA 3DXKA 4CZKA 4IJAA 3GL1A 5AZJB 5FPMA 3U4LA 3H3NO 1QQNA 3O1WA 4DCHA 5JICA 3D2EB 4FL9A 3WEEB 4BRGA 1JCGA 1RGIA 1IG8A 5AQFA 4BRNA 1BO5O 1E4FT 4FWKA 3W3DA 4BR9A 5EXWA 1WOQA 4CZEA 4XH5A 1SAZA 1U6ZA 1ZC6A 4B1ZA 4BRPA 3AARA 4H0XB 3QDKA 3A5MC 4H03B 4BG9A 2VWBA 4B1YB 3MK6A 1P8ZA 3VF4A 2I7NA 1NGBA 1NGHA 4K25A 3A0IX 4FWOA 5AZJA 3SMPA 3G25A 3UKUA 4FWSA 3EZWA 4BVOA 1EQYA 5EVZA 4C23A 1NGFA 2IIRA 4F9OA 3D2EA 1MA9B 1GLAG 2A6AA 1BU6O 2YJFA 3W0LA 1LCUA 2A42A 3A8YA 2GEMA 4H5TA 2QWQA 2OANA 4BRCA 3DWLA 5BN9A 3VGKA 1GLLO 4B1VA 3EN9A 2CGKA 2QW9A 4FWNA 3GBTA 2V7ZA 4FWRA 3BF3A 2YCHA 3H45C 2P9NA 3CETA 3O8MA 2Q36A 3KVGA 2HF4A 3MN7A 5AQTA 1E4GT 1S22A 3CHWA 3VPZA 3S41A 5I9EB 3C0BA 4AM6A 2ASMA 5AR0A 4H0VB 2W40A 3L4IA 4IZ9A 2VYPA 4YDUA 5AQWA 3WXKA 2DPNA 3FZLA 2BTFA 4A61A 2E2NA 3H46O 4PL8A 1JCFA 5FPEA 1TYQB 3ENHA 3EKSA 2CH6A 4FSVA 1NGAA 3IDHA 4EAHD 2GUPA 1HPMA 4ISEA 2IVPA 2P9LA 5AQZA 1YVNA 5FPNA 5LJVA 4M7YA 3AY9A 3MDQA 3FGUA 1H1VA 4QS8A 3FLCO 4CZIA 3UB5A 2E8AA 4CZJA 2QXLA 4KBOA 3M6GA 3FZMA 1NGDA 2GTDA 3DXKB 4FWLA 4BC5A 4BRMA 4H5VA 5KQ8A 1S3XA 1SQKA 2FLOA 4DHYA 2ITMA 4J8FA 3LDQA 4BC3A 1TYQA 2UYTA 1GLCG 2YHWA 2E88A 2ASOA 4FOIA 2NZTA 1RDWX 1GLFO 3VGMA 4PL7A 5B8HA 5CE3A 4BRAA 4BRHA 1NM1A 1XC3A 1G99A 2EWSA 2H3GX 2Q0RA 2P9SB 5JMVA 1NMDA 3QFUA 4B1XB 1HKGA 1BDGA 3VF2A 4M7XA 1ESVA 5BPLA 5AFUA 4BR4A 3QMLA 1T6CA 3CJBA 3WQUA 2P9IA 2F9TA 4IJNA 4BR2A 4BQLA 2QWNA 1NLVA 3VEZA 3GG4A 3H3OB 3UKUB 4JHDA 3GE1A 4JNEA 1YXQA 3VETA 2D1KA 1GLDG 4IO8A 2NLXA 3TPQA 3CJAA 4EHUA 2YHXA 3OHRA 2NRHA 4K41A 1NGJA 1Z05A 4BRDA 2GELA 3DXMA 2P9SA 4PKGA 3JXUA 4FO0A 3O4WA 5TKYA 1NGGA 4I6MA 2P9NB 3KHYA 3H6EA 4JN4A 2YI1A 3J8AA 3ATVA 1NBWA 3I33A 5KPZA 4RTFD 3AAPA 4O5FA 4BR5A 3DAWA 3MMVA 3CIPA 4FWQA 4EHTA 4CZMA 3MCPA 2A3ZA 1LOTB 4B9QA 1ATNA 1C0FA 3VEOA 5AQQA 3VEWA 2ZF5O 1KAYA 1TUUA 3LDLA 2W41A 1ZXOA 4BREA 1MWKA 4EFHA 3HTVA 2P9UB 3VEVA 4MO5A 3C7NA 1NWKA 2P9LB 1DEJA 5AQGA 4CD1A 4WQ4A 4H5RA 3MN5A 3CJ9A 4NB4A 5ADXA 4Y0WA 1ZBSA 4NO7A 2ZWHA 3VF6A 5KQDA 4ISGA 3WQTA 1X9JA 3I8BA 4PKIA 5LY3A 5AQXA 3DJCA 4BRIA 1HJOA 4WQ4C 1J6ZA 2P9UA 5AQJA 1V4TA 4FOEA 4PKHA 3BF1A 1KAXA 5E26A 1DKGD 1BOTO 1DGKN 5JLFA 3SMSA 3L6QA 3CERA 5F0XA 3O5BA 2E2PA 3H1QA 4BG8A 3M1FA 1T6DA 4FPBA 4MLHA 5EY4A 4Z94A 1GLJO 4BC4A 1V4SA 2VCPA 2P9IB 3O08A 5AQMA 1NGEA 4RCHA 4B1WB 2QWRA 1QHAA 2E2OA 4BRFA 4JHDB 4FPAA 3BP8A 3WUHA 3QBWA 2IVNA 2Q0UA 1GLEG 1MDUB 3ZETB 4DB3A 2Q31A 2QWOA 5BRFA 3UE5A 5BPMA 4BRQA 4DQ8A 1BA1A 1ATSA 1TUYA 3ULEA 4QS7A 3CJ7A 5EOYA 1XQSC 3R6MA 1HUXA 2Q2RA 3TU5A 3DXMB 4GY2B 1OKJA 4L3QA 4BR7A 3RSEB 5AFUH 2V52B 2YHYA 3FFKB 4I6MB 3BEXA 5AQHA 1HLUA 4HWIA 3U8XA 3WXIA 5BREA 3O1BA 1SZ2A 4E1JA 4CD3A 5AQKA 3F9MA 3SK3A 3EO3A 3QFPA 2WUSA 2QWMA 4K43A 3LDNA 4JD2A 3ID8A 4QS9A 3A5NC 3QICA 3FZFA 3ZETA 3LM2A 4H0TB 3WXJA 4BRLA 3ZEUB 1WUAA 3O80A 1QQOA 1GLBG 5BN8A 5AQVA 3IFRA 1HKCA 2HF3A 3JS6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z1HA 1EX4A 2QWLA 3OA9A 3BGRA 4FW2A 4GW6A 3S5TA 2FBVA 1YJNN 3S3NA 1VSLA 3CPEA 3CQXA 1HKBA 4BGAA 4B8AB 4OKKA 4LH5A 3AAQA 3QBXA 1RT4A 1UA1A 4FLZA 4FLVA 1A5VA 4DSEA 4KB0A 2OPSA 4CJUA 2DFEA 5KTQA 1RILA 1VSJA 3ZSQA 3O3HA 3ZX0A 2JGUA 1NU0A 2BANA 5J2PA 3ENBA 3RR7A 3LPTA 1KXPA 3CFPA 2FSJA 1RBVA 2HHWA 3ASMA 1U2VA 2D0PA 4A62A 3HOTA 1N36K 2HOEA 3R9PA 5M1KA 4AHTA 4CCHA 4DR1K 2E20A 3TABA 2ZJRL 3L2VA 3L3VA 1BHLA 5M1FA 1BI4B 4ILHA 3IS9A 5AQYA 1ATRA 1TKZA 3IUCA 4BQZA 4CJ7A 3MXIA 3UKRB 4FJ8A 5F2RA 3VQCA 2GUIA 1QTMA 4CVNE 4KTQA 4WCEL 3OYCA 2HNYA 3VTHA 1TAQA 1C0MA 4I2PA 4CI6A 1NK4A 1RT7A 3EL2A 4K42A 3ULEB 4NCGA 2HHTA 5SWMA 4ELTA 4WQ5C 4CZLA 4IWVA 4CJPA 3SPYA 1O1WA 5AQRA 1RT6A 4DQRA 2Q97A 4H0OA 1S1VA 3TR8A 2HBMA 4BC2A 2A40A 1J9AA 4M41A 3AO5A 4JD2B 1BG3A 3OYAA 2HHQA 1JLQA 1VQNN 3HSTB 3TAMA 4B9NA 5AQLA 3CJCA 4GMJB 5TKWA 4AHRA 2OCEA 3DLHA 3TAQA 1VQON 1X3MA 2UXCK 5HRRA 1HNXK 4WF9L 4DWIA 1C0TA 2FSNA 3PLAA 4BR0A 4GKJK 1Z6RA 3NF6A 5C15A 3E1YA 3UIQA 4LY7A 5AQIA 3MN6A 3O9RA 3U9DA 4FVUA 2VG5A 1WSGA 4B8CA 4J2BA 1C6VA 4ICLA 3PV8A 3O4QA 4IKFA 3PX0A 3HI0A 4BRKA 1RNHA 2A41A 3TTDA 5C0YA 2O4IA 4DSJA 2P9KA 1ASWA 4YY3K 5FPMA 1N32K 1KRPA 3IKMA 4JKEA 4LF8K 3THWA 1QQNA 4DTNA 2P5OA 5JICA 4I9LA 3K5NA 1RGIA 4C1NI 3D6RA 4NLBA 2YNGA 1Y97A 2D0AA 4FWKA 4EP5A 1Q8IA 1SAZA 1NK5A 4DTPA 1RDAA 4BRPA 1JL1A 2HNDA 4H0XB 3QNNA 3A5MC 4CJQA 4AILC 3SI6A 4B1YB 3O3FA 3KTQA 3NVKA 4ZTJA 4Z4FA 1NGBA 4K25A 1N34K 3P5JA 3DOLA 4FWOA 3NF8A 4BVOA 3ZYYX 3NE6A 2YJFA 4YOWA 3VTIA 4JK9A 3G6EN 2OANA 4B9MA 4BRCA 3R1XA 5BN9A 3OYBA 4DV0K 4CW7B 5LL6Z 3KD5E 2DTUA 2X78A 3BF3A 1EWQA 4IDHA 1T05A 3O8MA 2HF4A 1SL2A 3MN7A 1OH6A 4FJ9A 4JK8A 4BDZA 1E4GT 5KI6A 3VQ5A 2IOCA 2FBTA 4JI2K 2ASMA 1XNRK 4CIFA 4KHYA 5CZ2A 5AQWA 4A61A 3Q7BA 3H46O 4PL8A 2PY5A 1JCFA 4DFKA 1IKYA 1NGAA 3IDHA 4O44A 4M3XA 4KTZA 5AQZA 2F8TA 5FPNA 5LJVA 2VWKA 4CK1A 4WFNL 3RTVA 1BISA 1KCFA 3FGUA 1H1VA 3UB5A 4M3ZA 4X65K 3I55N 5HRNA 3U3YA 1SKRA 2YNFA 1BQNA 2YHBA 1NGDA 5KQ8A 1UAXA 2E5LK 4J8FA 3K5LA 4C1NK 4EZ6A 2XRIA 4BC3A 3M8SA 2ASOA 2Z1JA 2UXBK 4DR6K 1GLFO 3PSFA 4B9VA 5CE3A 3TI0A 2EX3A 5HRSA 1XC3A 3VQEA 4CHPA 4DS5A 2G8VA 4BDPA 2P9SB 2G8HA 1NMDA 1BDGA 3EE9A 5CHIA 4BR4A 4Q5VA 2DFFA 2F9TA 4IJNA 3AVJA 3VEZA 4FJ7A 4KHQA 4JI0K 2Z1GA 1A5WA 1Z26A 3DRSA 2NLXA 2WFBA 4E72A 4EHUA 2YHXA 3SQ0A 4N41A 1NGJA 1NK9A 4HTUA 1Z05A 3HXMA 4BRDA 1ZBLA 3WNGA 4CEQA 5TKYA 3VQ6A 4J2DA 1S1TA 3QINA 3H6EA 4JN4A 2YI1A 3M8PA 2AJQA 2G8KA 3ATVA 2YHAA 4QOZB 4RTFD 3RRGA 3PUFA 4FVMA 4BR5A 3DAWA 4HCBA 4EHTA 1NOYA 3L8BA 2VWJA 1ATNA 1C0FA 4CJ4A 5J1EA 3K5OA 3VEWA 2ZF5O 3P83D 4CE9A 3CC7N 1MWKA 2P9UB 3VEVA 4MO5A 3NH0A 5JENA 4CF1A 3TTCA 5AQGA 4H5RA 1B92A 3MN5A 5C2FA 4CK3A 4BACA 1ZBSA 4GVEA 4LSNA 4FJGA 2RHKA 1NKBA 3V9XA 1RTJA 1JLGA 3MXMA 2YX6A 5AQXA 1LWEA 3DJCA 4M45A 1FKPA 4WQ4C 4FCYA 5AQJA 1LV5A 4FOEA 4M3RA 4CF9A 2RF2A 3K0SA 1YT3A 1WAFA 3SMSA 4J2EA 3O5BA 3H1QA 4BG8A 4MQ3A 3HJFA 2D5RA 4Z94A 1EP4A 2WC9A 3MEDA 5AQMA 2Y1JA 4IG0A 3ZSZA 1QHAA 1KC8O 2QA4N 4CFDA 1YHQN 2P5GA 3WUHA 1A5XA 2IVNA 3QIOA 4CHYA 4C8OA 3AO3A 1GLEG 1MDUB 2UUBK 1FW6A 4DB3A 1RDUA 2HBKA 4DV2K 2QWOA 1D8YA 5BPMA 4BRQA 4DQ8A 1ATSA 1TV6A 4YOVA 3QLHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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