3MN9A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
b'VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 119
structure length 360
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn9A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn9A03
4QS7A 2J4RA 1D4XA 3A5MC 3VESA 2KHOA 1NGBA 5AZIB 4BR7A 3CIPA 4WQ4C 4BGBA 1GLEG 2P9UB 3JXUA 3IMXA 3MCPA 4FWKA 3MN7A 3H3OB 3CJAA 3BUZB 2I7PA 5ADXA 5AQGA 1MWMA 4FWPA 1RGIA 2W41A 3DXKB 3VEVA 3LL3A 4BRPA 5BREA 4F9OA 4O5FA 1GLFO 2D4WA 3DWLA 3ENHA 4BRKA 4EHTA 1U2VA 2HF3A 3FZFA 4B1UB 2QWOA 1QQMA 3WXLA 3FZHA 4HTLA 5BRFA 3O1WA 4BG9A 5AQOA 1T6CA 4B9QA 1MWKA 4GNIA 1NMDA 4FWNA 4BR2A 5KQ8A 2E20A 2GEMA 1V4SA 2UYTA 3RSEB 1QHAA 1ATSA 3KZBA 3LDOA 3HSCA 2QWRA 3U8XA 4PL8A 5EVZA 3R6MA 4H0XB 1Z6RA 2NRHA 3FE1A 4IJNA 3WUHA 4J8FA 2FXUA 2YHWA 3L6QA 4XH5A 5JMVA 4I6MB 3ULEA 3CJCA 1DEJA 4ISEA 4IWVA 4K41A 3VETA 3R8EA 3I33A 4H0PA 2CH5A 1IG8A 4E1JA 3H6EA 4BRHA 1J6ZA 3LM2A 3QFUA 3H45C 1IJJA 1YVNA 3W0LA 4BRAA 3BEXA 5B8HA 4MLHA 2YHXA 2D1KA 5AQYA 4PKIA 3BP8A 4MLEA 4DCHA 3HM8A 4CZMA 4JNEA 3EL2A 4HWIA 3DXMB 3ID8A 3ZX3A 4A62A 3SMPA 2H3GX 1HX1A 3EN9A 1ATNA 1BOTO 4FOEA 1S22A 2E1YA 3ZETB 4B1VA 4BREA 5AFUH 2E2QA 3CJ7A 3WXIA 4PL7A 4QS8A 1T44A 3MN5A 4DHYA 3IDHA 3A5OC 4H5NA 2W40A 2Q97A 3GDQA 4BQZA 4H0VB 2ZWHA 1JCEA 2VCPA 3EKSA 1NWKA 4EFHA 1BU6O 3SLCA 5AQUA 3WXJA 2A6AA 1X3NA 2PAVA 3B8AX 2I7NA 1NM1A 3O5BA 4MO5A 5AQMA 4BG8A 1OKJA 1H1VA 3ATUA 1GLCG 1NGFA 1RDWX 4PKHA 5AQXA 4CZKA 4DB3A 3FZMA 3EZWA 1U2VB 5AQLA 5AQTA 3ZETA 4H5VA 3H3NO 3D2FB 3UE5A 5FPEA 4CZIA 1NGDA 2FSJA 2Q36A 1JCFA 1K8KB 2QWQA 4A2BA 1Q18A 3AY9A 3CQYA 2CGLA 4M7YA 4BR0A 1X3MA 2P9LB 1ZXOA 1ATRA 2Q0UA 1P8ZA 2AA4A 2A41A 5FPNA 5AQNA 3VF2A 3WQUA 4NB4A 1V4TA 1KAYA 5KPRA 2QWPA 5KPZA 1Z05A 2FLOA 3MN6A 2V7ZA 1BA0A 5BRDA 1QQOA 3QBWA 3CJBA 1GLBG 1HKGA 1HUXA 3O1BA 3ULEB 5TKYA 4H03B 2Q1NA 3WEEA 3A5LC 3EO3A 3O8MA 3QB0A 1NGCA 3DAWA 1Y64A 1NBWA 3D2FA 2GELA 3H1QA 4CZHA 3D2EA 4BRNA 1GLJO 4YDUA 3EKUA 4FO0A 1K8KA 5AQRA 1QQNA 3O08A 1TUYA 5AFUA 4LC9B 2P9LA 1QZ5A 2WUSA 5F2RA 1HKCA 2ASOA 4BVOA 1BWFO 2IIRA 4KBOA 3ZX0A 4WQ5C 4FL9A 3CETA 3VEOA 1LOTB 5BR9A 3VENA 2FF6A 4BRIA 5BPNA 2YCHA 3WT0A 5LJWA 2GUPA 4BC3A 4FPBA 2ZGZA 2V51B 4BRCA 4RTFD 3MMVA 1BUPA 4CBXA 5ELZA 1G99A 4XEIA 3KVGA 2ZF5O 5FPDA 1X9JA 2ASPA 3UKRA 5AQJA 4JD2B 4JAXA 3W3DA 3VGKA 4A2AA 2HMPA 3C7NA 4CI6A 3A0IX 5AQPA 2P9KA 4CZGA 3S41A 2YJEA 4IXCA 3TU5A 1BG3A 2A3ZA 3LDLA 3A5NC 4JN4A 3L0QA 2V7YA 3GBTA 3O6WA 3HI0A 3VGLA 3FGUA 4CZLA 3CI5A 4BC2A 2CH6A 3H46O 2VWBA 4ISGA 5AQQA 2ITMA 4AM7A 3FZLA 3HBTA 3I8BA 5E26A 4H5RA 4FWSA 2OANA 2FSNA 2QWMA 2YI1A 4EHUA 3LDPA 1BA1A 3H1VX 2E88A 2ZGYA 2DPNA 4O8KA 4RCHA 3BF1A 4JD2A 2HOEA 3WXKA 2A5XA 2IVNA 3UKUA 4BQLA 4CBWA 3O80A 3ATVA 1ZC6A 3GG4A 2E2NA 4IZ9A 3M3ZA 3VGMA 2Q0RA 2E1ZA 3GL1A 1BO5O 2BTFA 1NGEA 4Y0WA 3ZEUA 5F1XA 1KAZA 3MDQA 4BC4A 4XH1A 4Z94A 2D0OA 2QM1A 1JCGA 3WEEB 1TUUA 1TYQA 3U9DA 3ZX2A 2EWSA 4BRFA 5EX5A 3D2EB 1R59O 1SZ2A 1WUAA 3VF6A 3SJHA 5EY4A 3P4IA 3TPQA 2AP1A 4BRDA 3LDNA 4IO8A 3OHRA 3FZKA 4H0YB 4H0OA 5FPMA 3QBXA 3UB5A 1BDGA 2E2PA 3VEXA 2Q31A 5AZJA 4XH4A 5AQFA 5I9EB 4H0TB 4CZJA 1YUWA 4B1WB 3HZ6A 3O4WA 2QW9A 3AAQA 3L4IA 4FOIA 1HKBA 4FWQA 4BGAA 4B1XB 5BRHA 3VEYA 3LDQA 2P9NB 5JLFA 3VEWA 4JHDA 4GY2B 4CD1A 3F9MA 3UKRB 3GOIA 1S3XA 5KPTA 2FF3B 3U9ZA 3VF4A 3C7NB 1YAGA 2P9SA 2YHYA 2P9KB 4K43A 1KXPA 4FWMA 1MDUB 3VOVA 1QZ6A 3FR0A 1DKGD 1U6ZA 2P9IA 5E84A 5F0XA 5LY3A 1GLLO 1RFQA 4FWRA 5AQHA 1WOQA 3BF3A 3D7EO 4BR4A 5CE3A 1NGHA 1KAXA 3KHYA 1SQKA 3HTVA 4QS9A 3IUCA 1E4FT 3SMSA 2Q2RA 3DJCA 1C0FA 2P9PB 3GE1A 3CJ9A 1ESVA 2F9WA 2QXLA 4WQ4A 1DGKN 2P9NA 2A40A 5LJVA 3ENOA 3R9PA 4DQ8A 2HF4A 2NLXA 1NGIA 4CBUA 1HPMA 3AAPA 2GWJA 3CQXA 3CERA 3VERA 4C23A 5AZIA 3UKUB 3J8AA 2P9UA 2GWKA 3FFKB 1XUPO 5ADXH 1C0GA 3SK3A 2A42A 3AARA 3ZEUB 5BPMA 4BRQA 1GLDG 4IJAA 4H5TA 4NO7A 3DXKA 4ISFA 1LCUA 4BRGA 4A61A 2PBDA 5AQWA 2D0PA 4M7XA 4CD3A 4L3QA 5JLHA 1TYQB 2NZTA 5AQSA 5EXWA 2P9PA 4K42A 3LM9A 4BVPA 2QWNA 4FWOA 2CGJA 3C0BA 1YXQA 4WQ5A 1EQYA 4BRMA 4FPAA 4M63C 4CZEA 1NGAA 4B1ZA 2IVOA 3RSEA 3VEZA 3FLCO 4FWLA 5AZJB 1XQSC 3CHWA 4B1YB 3M6GA 1T6DA 2E2OA 4BC5A 1NLVA 4K25A 4BR5A 1SAZA 5AQVA 3U4LA 1HJOA 3VPZA 1NGJA 1CZAN 2IVPA 2FSKA 4I6MA 4CZFA 4BROA 4JHDB 4BRLA 3QDKA 2V52B 4PKGA 3JS6A 2BUPA 3WQTA 3QFPA 5AR0A 3MN9A 1MA9B 2F9TA 1HLUA 2P9SB 1XC3A 2CGKA 5JICA 3CJ1A 4MO4A 4RWTA 5AQKA 3QMLA 4AM6A 4FSVA 2P9IB 5AQIA 3MK6A 4WYBA 3DXMA 2ASMA 4CJ7A 5AQZA 4YDUC 4EAHD 4H5WA 1NGGA 5EOYA 5BPLA 1GLAG 1E4GT 5BN8A 5BN9A 3M1FA 2VYPA 3G25A 4BR9A 5KQDA 2GTDA 3IFRA 4EIAA 2YJFA 2E8AA 3QICA 2QWLA 3A8YA 1ZBSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1CXUA 4KFBA 1Q9XA 2A1RA 3NH1A 4BDZA 2KHOA 4BR7A 4WQ4C 4YOTA 3NMUA 2G8IA 2P9UB 5J2PA 4LF4K 4FWKA 4CGDA 4DR1K 4KHUA 3THVA 4C8KA 4RW8A 3BUZB 2I7PA 4PHTX 1MWMA 3R1XA 4KHSA 2IS3A 4FM1A 2D4WA 4I2QA 3DWLA 3NGZA 1NK0A 4N76A 3SUPA 2NNWA 1QQCA 1T6CA 4B8CA 1MWKA 4GNIA 1NMDA 4FWNA 5CR4A 3SAHA 2E20A 3HPOA 3DRRA 4DSKA 5GAGP 1SKWA 1ATSA 2IGIA 4ID5A 4GKJK 3T3FA 3HSCA 2KQ2A 2JGUA 3VTIA 2OA8A 3QEVA 4OLBA 2I5JA 4IJNA 3WUHA 3PO4A 2VWJA 5GAHP 4HHTA 4IWVA 1J5EK 2HW3A 3K58A 2RE2A 3R8EA 3S3OA 1JLFA 4E7HA 4H0PA 3H6EA 4CF0A 3H45C 4C1NI 4DTSA 1VQKN 3W0LA 3CC7N 3OBWA 2VQEK 3I0RA 4M45A 2D1KA 4DCHA 3BP8A 1RTIA 3TABA 3WNGA 3EL2A 1C1CA 4RW9A 1RDDA 1FK9A 1BQMA 2VGMA 1HX1A 4ICLA 3EN9A 1ATNA 2ZM6K 4FK2A 4FOEA 4JKCA 3E9LA 4DTOA 2E2QA 3VQQA 3C95A 3T19A 1NKCA 1Q81O 2UXCK 4PL7A 4KI6A 1C0UA 3WNFA 1LWCA 2W40A 2Q97A 3GDQA 3RR7A 2ZWHA 3HP9A 2UXDK 4JK9A 4JK7A 3LWLA 3LDSA 1NK8A 1NWKA 4EFHA 3RMCA 1HMVA 1BU6O 3ULDA 3VA3A 2HHHK 1VAZA 4EZ6A 4GVEA 1VSHA 2A6AA 3HJFA 4KHWA 3ZSZA 2VWKA 3V1QA 1EETA 4CCHA 3QEIA 3SQ0A 1HQEA 4N56A 1RDWX 3DLGA 3AA2A 1IBKK 4LSLA 4DTPA 3FZMA 1U2VB 5AQLA 4DSEA 4H5VA 4DSJA 4KV8A 3EZ5A 3ENBA 2WC9A 3O9RA 5JS2A 1KD1O 2KKZA 3UE5A 4CZIA 4CJQA 3QESA 2QWQA 4A2BA 1Q18A 4FJ9A 2VG6A 4H4MA 4YOYA 2HB5A 4RW7A 2FBYA 4IOXA 2XY6A 3QETA 1ZXOA 2Q0UA 3PX0A 1P8ZA 3HRGA 2A41A 3MCAB 3WNHA 4CVNE 4DKWA 1ASWA 5M1PA 5KPZA 2V7ZA 4DQQA 4O4GA 3M8RA 5BRDA 1QQOA 2KLAA 1TK5A 3O1BA 2YKMA 2Q1NA 1YTUA 3A5LC 4FCYA 3SPZA 4KHYA 1T3VA 2OPSA 3VA0A 3F73A 1U4BA 1YJ9N 4NCAA 3WXMB 4BRNA 4YDUA 3EKUA 3LP2A 4FO0A 4EP4A 3HYFA 1QQNA 3MEDA 3VMFB 5AFUA 3K5NA 4DMNA 3SYZA 2IIRA 4LH5A 4YORA 2FF6A 4BRIA 3LZIA 1SKRA 4GVMA 1BCMA 5J1EA 2YCHA 3WT0A 3CCVN 3SUNA 1ZBLA 3OS0A 1BIZA 1BHLA 4RTFD 3MMVA 3HOTA 1FJGK 4HCBA 1KC8O 3P83D 3KVGA 5CZ1A 3OYFA 3UKRA 1S9EA 1VQ8N 2C1IA 4YY3K 4BWMA 2HHSA 1WSIA 2P9KA 2KTQA 4IXCA 4JRPA 4QOZB 2FBVA 1BG3A 5HOOA 3SAGA 3HM9A 3LDLA 3HOSA 3O6WA 3VQ4A 1EX4A 5I42A 2BDPA 4CZLA 4M3XA 3FFIA 2CH6A 4IG3A 1O1WA 3VQDA 3OYAA 1RBTA 4Y1CA 5E26A 1FXXA 3CMEN 2NRTA 3OS1A 2OANA 1VK0A 4FLUA 2VQFK 4FW1A 4DV2K 4EHUA 3IG1A 1LWEA 2O8EA 3K59A 1WSHA 3DLHA 3P38A 4N5SA 3AO3A 1W0HA 4BQLA 4W5QA 3P5JA 1NNEA 4FYDA 1JL2A 5C24A 1DT9A 4LY7A 1YJWN 4HUFA 2O8CA 5C2FA 3GL1A 2BTFA 3H08A 3NF8A 2QKBA 1YHQN 2GUIA 3MDQA 3OYIA 3OYHA 2X78A 3PX6A 1RBUA 3K0SA 3Q7CA 1JLQA 3OJUA 1A5WA 1K9MO 3U9DA 3ZT4A 1C0MA 3B6OA 1WUAA 3P4IA 2AP1A 2HNDA 1JXBA 3OHRA 2KFZA 3QBXA 3UB5A 4CFCA 3VEXA 2Q31A 1RTHA 3CCRN 3B6PA 2Z1HA 3AAQA 3S3MA 2IC3A 3MEGA 1HPZA 3PIOL 5M1QA 1RT7A 1SL0A 4BGAA 4EP5A 4W5TA 1S6PA 3O9SA 4CD1A 4OKEA 4Z0UA 2QXFA 3VF4A 2QKKA 1KXPA 2PYLA 4DFMA 4CJPA 4FWMA 1MDUB 3VOVA 2W6KA 3T7ZA 2DTUA 1QZ6A 1SL1A 3U6FA 1LAVA 3CC4N 5LY3A 4Z4HA 4DU1A 4FWRA 2PY5A 3RTVA 4DU4A 2HHXA 4E1MA 2D5RA 1KAXA 3HTVA 2RF2A 3SUOA 3LALA 1C0FA 2P9PB 3E66A 1S6QA 1DGKN 2A40A 5LJVA 2C1GA 4XJXA 1HYVA 4CJ3A 4E19A 5AZIA 1UWBA 1OVQA 3J8AA 1ILYA 3SK3A 1YTAA 1QHTA 3U3GA 4BRQA 3KK1A 4ISFA 1HR0K 4BRGA 4C8NA 3QEPA 4ELVA 4A5AA 2PBDA 3QNOA 4M7XA 4CIGA 3C6HA 4JI1K 4NLCA 1KFSA 5JLHA 5HROA 3OYLA 5AQSA 2P9PA 4JKHA 4K42A 3LM9A 3PSFA 2QWNA 4FWOA 2CGJA 2Y1IA 4BRMA 3CF5L 1NGAA 4B1ZA 3HPGA 3RSEA 3AVIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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