3MN9A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 119
structure length 360
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn9A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn9A03
4BR2A 4BGBA 4RTFD 1ATNA 4WQ5C 5LJVA 3DXKB 1HX1A 4A62A 2DPNA 4O5FA 2EWSA 4BGAA 4B1XB 4BG8A 4BRHA 4F9OA 2P9PA 4ISFA 3ZETA 4FWRA 3CETA 1HKBA 2QXLA 2D1KA 3ID8A 2GTDA 3LDLA 2VCPA 3G25A 2AP1A 4EHUA 3GL1A 1YAGA 3O5BA 5KPTA 5AQFA 1RDWX 2CGJA 1BWFO 2A3ZA 5KQ8A 5AQRA 1H1VA 1SAZA 5BRHA 5FPDA 1XUPO 3VGKA 1RFQA 4BQZA 3EO3A 4CJ7A 1U2VA 3ZX0A 5AQXA 3U9DA 4H5WA 2VYPA 3FZFA 5AQIA 5F1XA 1BA0A 2CH6A 3ENHA 2ZF5O 2V7ZA 3MCPA 4PL8A 2CGKA 4FWPA 4CZMA 5AFUA 3H46O 3GG4A 4CBXA 3CJ9A 3ENOA 5EX5A 1Z6RA 3VEZA 4H5TA 4JHDB 2ASOA 2QWOA 4BRDA 4BRNA 2FSJA 2FSKA 4BRAA 2NLXA 4CZJA 1HPMA 4FWMA 5AQTA 2PAVA 1S22A 1JCGA 4BROA 3VOVA 2Q0RA 3BF1A 3SJHA 3FR0A 4QS7A 1NGAA 4EFHA 1HJOA 3CJCA 3L0QA 2FXUA 2P9UB 4CD3A 1RGIA 2GWJA 3P4IA 1QQOA 1XQSC 3MMVA 3U4LA 5ELZA 1V4SA 3QBXA 4AM6A 2QWRA 1ATRA 3OHRA 3TPQA 2HF3A 4EIAA 3SLCA 4Y0WA 4EHTA 1SQKA 5AQSA 4FWLA 1HLUA 2E20A 2QW9A 2KHOA 4IJNA 1X3MA 1T6CA 3FZKA 3IUCA 2QWPA 4H03B 4H0TB 3DXKA 4B1UB 5BRFA 3S41A 1QHAA 2W41A 3M1FA 1YUWA 1WUAA 5BPLA 4H0PA 4GNIA 1BO5O 5JICA 1KAYA 4DQ8A 3DXMB 4PKHA 3D2FA 4IO8A 3UKUB 3CJBA 4MLEA 1KAXA 4CZFA 3HSCA 3WQTA 3H6EA 3EL2A 2ASPA 4HTLA 3VEXA 3LDQA 1GLEG 1ZC6A 3FZHA 2ZWHA 3KVGA 1NGDA 3LDOA 3A5LC 3R6MA 3O4WA 1GLCG 2IVOA 4XEIA 1DEJA 4BRGA 1ZBSA 3QICA 4B1ZA 4B1YB 1EQYA 1ESVA 3CJ7A 2F9WA 3C7NB 3ZEUB 2IVPA 2E2NA 1K8KA 4I6MB 4JD2A 2NZTA 2ZGZA 5BPNA 3BUZB 5ADXH 2E2QA 3LDPA 4J8FA 2P9LB 3F9MA 2QWMA 1LOTB 2P9KB 1J6ZA 1GLAG 3UKRA 5CE3A 3O6WA 1Z05A 4FWOA 3AAPA 2ASMA 4K43A 3R9PA 4BC2A 4FOEA 5AZJA 4NO7A 3L6QA 4BC4A 3WXJA 5LY3A 1U6ZA 2V51B 2YJEA 5AZIB 2YJFA 2V7YA 1NWKA 4WYBA 3HTVA 3FFKB 1BU6O 1MA9B 3A8YA 3AARA 3H3NO 5AQHA 3QMLA 2A40A 2IIRA 3O1WA 4K41A 4IWVA 1E4GT 2I7NA 3H1QA 5FPNA 2GUPA 1NM1A 2P9SB 3GDQA 3DWLA 4FPBA 5AQJA 5BPMA 2QWQA 3BEXA 4GY2B 4BC5A 5E26A 2YHXA 2E1YA 3VETA 3GOIA 1WOQA 4C23A 1NGJA 1QZ5A 4FPAA 3VEVA 4BC3A 1Q18A 3TU5A 4B1VA 5EVZA 3H3OB 2NRHA 1KAZA 4H5VA 1TUUA 1GLFO 3RSEA 2FLOA 3HBTA 3WQUA 2YCHA 2A5XA 4FOIA 4Z94A 1T44A 4FWSA 4KBOA 3SMPA 3I8BA 3LM2A 5BREA 4H5NA 3VEYA 2Q1NA 2GWKA 3CIPA 3MN6A 1ATSA 3FLCO 2QM1A 3O8MA 3QFPA 4BRPA 4BR4A 4MO4A 3M6GA 5AFUH 5AQOA 3VENA 4A61A 1G99A 4K25A 5AQPA 1C0FA 2QWNA 3EZWA 2Q2RA 5KQDA 2A41A 4QS9A 2E2OA 1X3NA 3LDNA 1TYQB 3IFRA 4BR5A 2A42A 3O08A 2P9IB 1LCUA 3CI5A 1V4TA 3CERA 3C7NA 4WQ4C 3DAWA 3M3ZA 3W3DA 4XH1A 1HUXA 1NGIA 2V52B 4DCHA 2P9LA 1YXQA 2UYTA 3W0LA 2GEMA 1T6DA 3ATVA 3MN7A 4YDUA 3HI0A 4A2AA 2Q36A 5TKYA 1JCEA 2HMPA 5EXWA 1GLDG 3U9ZA 3CQYA 2W40A 3WUHA 2YHWA 1P8ZA 2BUPA 3KHYA 2AA4A 3ATUA 3BF3A 3VESA 5AZIA 1IG8A 4HWIA 3VEWA 3A5OC 1HKCA 5F2RA 3VF2A 1Y64A 1GLLO 4BQLA 3SMSA 4BVPA 1GLJO 1MDUB 2OANA 2GELA 3EKSA 3DJCA 3LM9A 1QQMA 4IXCA 5JLFA 3FZLA 1S3XA 3VEOA 3WEEB 3O1BA 5I9EB 2I7PA 3WXKA 4BVOA 1MWMA 1NGCA 5KPZA 3VF6A 4WQ5A 4AM7A 3WT0A 1DKGD 4JHDA 2P9NB 5AR0A 1IJJA 2D0OA 4B1WB 4ISGA 4CBWA 3QFUA 2Q0UA 1QZ6A 2J4RA 3D7EO 5FPEA 3JXUA 4PL7A 5AQLA 3A5MC 4BRMA 4BR7A 1BG3A 4K42A 4M7YA 3U8XA 3WXIA 5BR9A 5B8HA 4FWQA 4NB4A 2FF6A 5AQMA 2Q97A 1KXPA 2P9UA 2VWBA 2E2PA 3D2FB 3ZX3A 3CQXA 4M7XA 4JNEA 4FWKA 2A6AA 3ULEB 1OKJA 4EAHD 5LJWA 5AQGA 1JCFA 1C0GA 3ZX2A 4BR0A 1XC3A 4XH4A 3QBWA 5EOYA 4M63C 2E1ZA 3R8EA 1TYQA 4CZKA 2QWLA 4JAXA 4BG9A 4BRKA 1NGBA 1SZ2A 4CD1A 2D0PA 3D2EB 2P9IA 4E1JA 1BUPA 3QDKA 3MDQA 4DB3A 1DGKN 5EY4A 4BRCA 5AQQA 3O80A 1MWKA 4BRFA 3LL3A 5FPMA 3BP8A 3DXMA 4JD2B 1K8KB 1NGFA 2IVNA 3H45C 4CZEA 4A2BA 5BN8A 2FF3B 3UKUA 3EN9A 4H0XB 2P9PB 2H3GX 3ZETB 2HF4A 3I33A 2E8AA 4H0OA 3B8AX 4MO5A 3UKRB 4H5RA 1BDGA 1HKGA 1NMDA 4BR9A 5JLHA 5AZJB 3CJ1A 3A5NC 3HZ6A 5AQVA 1QQNA 4MLHA 1NBWA 2BTFA 4PKIA 3HM8A 2YI1A 1CZAN 4FL9A 4CZHA 4IJAA 5JMVA 3FE1A 3WXLA 4L3QA 4CZLA 1NLVA 4JN4A 3ZEUA 4I6MA 3IDHA 5BN9A 3WEEA 1U2VB 4DHYA 2FSNA 3IMXA 1TUYA 3L4IA 2P9KA 3CHWA 1D4XA 3JS6A 3C0BA 4FWNA 2CGLA 3MN5A 4ISEA 4XH5A 3VGMA 5AQNA 1X9JA 2WUSA 4RWTA 4WQ4A 2ITMA 1NGHA 2P9NA 3GBTA 3VERA 4H0YB 3VF4A 2E88A 2ZGYA 4LC9B 3MK6A 1NGEA 4BRIA 3FGUA 4QS8A 2HOEA 3UE5A 4B9QA 4FSVA 3EKUA 4O8KA 2D4WA 1YVNA 1BOTO 1BA1A 4YDUC 3FZMA 5E84A 3RSEB 3J8AA 3UB5A 1E4FT 2Q31A 2YHYA 3A0IX 1ZXOA 2F9TA 4CZIA 5F0XA 1NGGA 5ADXA 2CH5A 4CBUA 4CI6A 3ULEA 5KPRA 1GLBG 5AQWA 4RCHA 2P9SA 3GE1A 4CZGA 1R59O 5AQUA 5AQZA 3MN9A 4IZ9A 4BREA 4BRLA 3H1VX 5BRDA 4FO0A 4H0VB 5AQKA 5AQYA 3D2EA 4BRQA 3AAQA 4PKGA 3AY9A 3KZBA 3VPZA 3SK3A 3CJAA 3QB0A 2PBDA 3VGLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ATNA 3KD1E 4WQ5C 3ZSOA 4DTRA 4WFAL 4KI6A 3LWMA 2E5LK 2EWSA 4BRHA 2Z1GA 4ISFA 4B3SK 3ZETA 3MEEA 3CETA 2XHBA 1HKBA 4DU4A 2F96A 2O4IA 3N4PA 3THYA 2GTDA 3E9LA 4KHNA 2O8DB 2P5OA 3ULDA 3AVFA 1OVQA 4FJ7A 1A5VA 2CGJA 2A3ZA 3P31A 3VQEA 5BRHA 4HCBA 1JXEA 2HBKA 1YTAA 5AQXA 4CVNE 2B5JA 1QSYA 2VYPA 4ELTA 3FZFA 5JVGL 1N34K 1HMVA 2CH6A 4KHQA 2ZF5O 3MCPA 2X6NA 4BDPA 4M45A 3QNNA 2HHTA 4CBXA 2FBYA 3CJ9A 3ENOA 3ZSZA 4BY9C 1S72N 2QWOA 4BRAA 4Q5VA 5C0YA 1HPMA 4FWMA 4CGIA 1S22A 3SAHA 1EO1A 5HROA 4W5RA 4F4KA 3KK3A 4LFAK 4JRQA 1MU2A 4EFHA 3ZT2A 4DTUA 1JLQA 3NH2A 4L8RB 2F8TA 3CJCA 1RGIA 3P4IA 1NNEA 4FZYA 4CEZA 3MMVA 3QEWA 3O9SA 3U4LA 3T1HK 5ELZA 4LD0A 4F3OA 5HBMA 3T7ZA 1ATRA 2NRRA 3KLFA 4DTNA 3LWLA 1SKRA 4Y0WA 1NK4A 4EHTA 2HW3A 1JL1A 4DV1K 4FWLA 2KHOA 4IJNA 1RBVA 4KH5A 4H0TB 5BRFA 3S41A 1S1TA 5DMRA 4E7JA 2W41A 5BPLA 1UAXA 5IT9O 5HRPA 1WBDA 4OPAA 4DQ8A 3DXMB 4AQYK 3HVRA 4ZTJA 4DV3K 2W6KA 4MLEA 3ZSXA 3MCAB 4JI2K 2IDOA 3CG7A 4JI4K 1XC9A 1NU0A 3H6EA 3QERA 4GMJB 3EL2A 2ASPA 4M3TA 1GLEG 2IGIA 3FZHA 2QKBA 2YNIA 4ILHA 3LDOA 3PX4A 2OZMA 4BRGA 4IDHA 4YHHK 1B9FA 3QICA 2E6MA 4ELVA 3TANA 1EQYA 4HUFA 4WE1A 4A5AA 4JD2A 2ZGZA 4CFBA 3LDPA 1TKXA 4JS5A 2KZZA 4OPHA 3NF6A 2XY7A 3RMAA 1DTQA 4IFEA 5J2MA 3DMJA 4FCYA 1Z05A 5CZ1A 3MXMA 4CJUA 4W5QA 4FWOA 2ASMA 4BC2A 5AZJA 4NO7A 3L6QA 3LP0A 3OYDA 3CCRN 2V51B 2YJEA 3PO4A 1CXQA 2V7YA 1NWKA 2F8SA 4JRPA 1C0UA 4M3ZA 3A2FA 4JKGA 2VG5A 3QMLA 1JLFA 3E1YA 3VQCA 3O1WA 4FM0A 1E4GT 3M8RA 2VQEK 3GDQA 3T3FA 5JS1A 4FPBA 4JI1K 4RW6A 5AQJA 4M3XA 3BEXA 5GAHP 2G8KA 1J5EK 2E1YA 1VQMN 3C95A 3LAKA 3ZSWA 1QZ5A 4O0IA 4Z4GA 2KLAA 3BDPA 4H5VA 1GOBA 1TUUA 2FLOA 2A5XA 3B6PA 4FOIA 4FWSA 4KBOA 4KHPK 4F2SA 4CIFA 4DV0K 1EETA 1NK9A 4V19S 4H5NA 4ID5A 3IRXA 2Q1NA 2O8CA 1Y97A 2FBTA 4BRPA 4BR4A 4XIUA 3PSIA 1NK8A 3THYB 1G99A 1WSHA 2QWNA 2GUIA 1RBUA 1XNQK 1IO2A 4I2PA 4RW4A 2P1JA 4CE9A 4DV7K 4FVUA 5JENA 1TYQB 4BE1A 4BR5A 1F21A 2A42A 1IG9A 1R0AA 4YOTA 4CEOA 4O55A 3CERA 4Z4IA 1VSFA 1BIZA 3TTCA 3ZT3A 4DCHA 2P9LA 1YXQA 5K14A 4KH4A 4LF6K 3W0LA 1T6DA 3THXA 3K5OA 3K5NA 2HMPA 1KLNA 3SQ1A 3OYEA 2W40A 4B9VA 2YHWA 1P8ZA 4C8LA 1L3VA 2QI2A 2D5RA 4LF5K 3S3NA 2RF2A 2Z1JA 4QAGA 3ZYYX 3PO5A 3I0RA 1GLJO 4IXCA 3UIQA 1QQMA 3HL8A 4CEEA 1NKEA 3WEEB 2C1IA 2RN2A 3M8SA 4BVOA 1MWMA 4EP4A 4BWMA 5KI6A 2OTLN 2P9NB 1S1UA 3MWTA 4O5BA 3AVNA 1IJJA 2D0OA 1TV6A 1YVUA 1ZYQA 3QFUA 4A57A 1QZ6A 4H4MA 4NCAA 1HYSA 4BRMA 3U8XA 2UUBK 2NRZA 3KK7A 3QIOA 2IOCA 4NB4A 2FF6A 4CJTA 1KXPA 2VWBA 4X66K 2P51A 4FJ8A 1EWRA 1HNWK 3VQDA 5LJWA 4FXDA 1YITN 4BR0A 4U7BA 3E9PA 1XC3A 4XH4A 4H8KA 4CZKA 4JAXA 4BG9A 1NJXA 4E89A 1NGBA 1SZ2A 3PX0A 3D2EB 2VWJA 5I42A 3TABA 2P9IA 3TSQA 1VQLN 3K58A 1BUPA 2PZSA 4CJ3A 4FJMA 1C0MA 3IAYA 5AQQA 5GINA 4JD2B 4DS5A 3THWA 2IVNA 4CZEA 3OYGA 4A2BA 5BN8A 1LWEA 2FF3B 4DR7K 2B6AA 4GVMA 4H0XB 2HF4A 1SS6A 2E8AA 3DI6A 1WN7A 3B8AX 1U4BA 1UWBA 4H5RA 4KB0A 4FVMA 4QOZB 1NMDA 2NRWA 5AZJB 2GX9A 4LY7A 3WNGA 1LWFA 1ILYA 2BTFA 4CESA 3OYBA 1BGXT 3WXLA 2QXFA 4L3QA 1NLVA 3ZEUA 5BN9A 4JKGB 1U2VB 4DF4A 4B9MA 1VSKA 3IMXA 3CHWA 4FWNA 3RRHA 2OPSA 3OA9A 5AQNA 4RWTA 2YNGA 1NGHA 2NUBA 5CZ2A 4GVEA 3AA5X 3K9JA 4CF8A 2HBJA 1BA1A 4AHVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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