3MNGA

Wild type human prxv with dtt bound as a competitive inhibitor
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
b'APIKVGDAIPAVEVFEGEPGNKVNLAELFKGKKGVLFGVPGAFTPGCSKTHLPGFVEQAEALKAKGVQVVACLSVNDAFVTGEWGRAHKAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNRRLKRFSMVVQDGIVKALNVEPDGTGLTCSLAPNIISQL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Evidence that Peroxiredoxin Catalytic Power Is Based on Transition-State Stabilization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-5, mitochondrial
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 47
structure length 161
sequence length 161
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3mngA00
2VL9A 5AGYA 5CAXA 2R5GA 4IBPA 4GXZA 4MJEA 2YN1A 2FUG2 4X1UA 3SWLA 1EV4A 4TW5A 2J23A 2HFDA 3UVHA 3H4KA 2DLXA 3IA1A 3UOMA 5DAKB 3O3TA 4IGJA 3UIWA 4IS0A 3EYTA 1YF1A 5KN3A 3QOUA 1SYXA 5EY6A 2G0FA 2H72A 2XBIA 2XBQA 2OE3A 1XW9A 4POKA 6GSTA 4DSQA 1R4WA 2C0DA 4V2NA 3UMAA 1TRUA 3LSZA 1A23A 1CQGA 1ERVA 2KOKA 1S3DA 3GA4A 3KJYA 5F06A 1CQHA 1HQOA 2H75A 3L9SA 3O76A 4E8EA 2GQLA 1GLPA 1AXDA 3VWUA 1Z6NA 3HXSA 4FYUA 1TK8B 3DMLA 3KD0A 1PL1A 2C8UA 1GP1A 3ME7A 4JU5A 4RQRA 4O32A 4PNGA 3LXTA 4ZIJA 3GRXA 1ILOA 2VD1A 5LNKe 5EL8A 1W89A 1BQ7A 3BCKA 4BWSA 4TN8A 2F51A 4AF2A 2A4VA 1A2LA 4TXVA 2O87A 2C3NA 4XHMA 2NDOA 4WKWA 1K0OA 4PQIA 5DVBA 3VFIA 2OE1A 2GQMA 4EL1A 3FHKA 5KN2A 4RQXA 2WGRA 2DJJA 5B6NA 3WT2A 1GSUA 2H1DA 1YEXA 2K9FA 1KEBA 2LNSA 4Q5QA 5FT3A 1K3LA 1URMA 3WGDA 4AGSA 1TXXA 5ECHB 2YNXA 1I5GA 5ECIB 16GSA 2VL2C 1OC9A 3DRNA 1S3AA 4ML1A 1U6TA 5ELAA 3FRCA 2V41A 3TRXA 2I81A 4E8HA 2PU9C 1GLQA 1YEPA 4YAPA 1UA5A 3G9BA 4LLRA 1WP0A 1WE0A 4ZXGA 4CDOA 1SD9A 3HHVA 4YQMA 1MD3A 4EC0A 5GSSA 1K0AA 2DBCA 5HR1A 3IBHA 5CRHA 1YF0A 2HI7A 2L6CA 5IO0A 5IIZA 1X9SB 7GSSA 1B9YC 4OD7A 2H73A 9GSSA 4G19A 1O6JA 2GT6A 1YY7A 1OYJA 3U6VA 2H1AA 2OBKA 1YQ1A 3MNGA 3DD3A 1ZL9A 1A0FA 4TXOB 1SL1B 2PMTA 3GURA 5H5QA 1QFNA 4I97A 3QCPA 2E2GA 5F07A 3U5RE 2GSTA 3TKSA 3HA9A 1U88A 3DIEA 1ABAA 1I9DA 1QGVA 1K0BA 2C4JA 2L4QA 1TK0B 1NW2A 4NWYA 1DE1A 4KCAA 3LJRA 1TJDA 3IR4A 4Q5NA 4PQ1A 2CX4A 1EWXA 3ED3A 3EURA 1TTZA 3HCZA 2YP6A 2PUKC 5EPFA 2CX3A 2VLUA 1NHYA 2VCTA 1OE7A 4N11A 4F03A 3ZLPA 2F8FA 1ZCPA 4KDXA 2KUCA 3VWVA 1PX6A 4PXOA 5D9TA 2X8CA 2DJ1A 3GMFA 2QGVA 2DSAA 2R6KA 2C80A 4QQ7A 2C1YA 1A2MA 5F8BA 4DEJA 2H70A 3KCMA 4HEA2 3F3QA 2M72A 1LBKA 3UJ1A 3KMOA 2V6OA 2VCQA 2VUPA 1LU4A 2WS2A 2FWFA 3F4RA 3F6FA 4KA0A 4I6XA 3LG6A 2DJ2A 2E0QA 3TKQA 1O8XA 1EOHA 1QK8A 2JZTA 4HZ4A 4NPBA 2WB9A 5IMAA 5J4UA 4PUFC 4PUAA 3CXGA 1PQNA 2CA8A 3APSA 2TRXA 3KEBA 3GYKA 4ECJA 3KH7A 3TJGA 2H76A 2H1BA 3GKXA 1EV9A 2J9HA 3C7MA 4PQHA 2R3XA 2ALBA 2LRTA 1T3BA 3P7XA 2FA4A 5GAPD 3KMNA 1PA3A 1S3CA 1QXHA 3CRUA 1DE2A 2O7KA 1O73A 4MP4A 1T8EB 1GUKA 4CHSA 3D4MA 1VF1A 2HRNA 5AIVA 1GTUA 2VCXA 4I2UA 4KGIA 2HRFA 1XBSA 3HZ4A 4I8BA 3M3MA 4ZBBA 2BMXA 1OAZA 1PX7A 2VLVA 3LORA 2L5LA 5IPGA 2X8GA 4MF5A 4F9ZA 1HNAA 4IELA 2D2ZA 3O6TA 5C04A 2CVKA 4IQ1A 4MH3A 2VL3A 1X0RA 1Z6MA 2B7KA 3LWAA 4XRDA 2YZHA 1RK4A 4MPGA 1SJ6A 3F3RA 3M8NA 4G10A 2R2JA 3F63A 1G0TA 3RPNA 4N10A 3M1GA 3TJBA 4TVEA 4G2EA 5F0GA 4LMVA 4OMVA 2LEGA 6GSVA 4TXOA 4N0ZA 3D6IA 4CW9A 2HXKA 2O85A 2H0IA 1SU9A 5D9WA 13GSA 2HLSA 3NIVA 2XC2A 3ZL5A 3LYKA 2RUFA 2H6ZA 3GTUB 4HQSA 4KW6A 2HSYA 2VAFA 3RHCA 3PINA 3ZIVA 3KP8A 2AV4A 2HZFA 3IAM2 3IAS2 2QSIA 4O5RA 1AQVA 4JBBA 5D93A 4H86A 1GTBA 3F8UA 4GWRA 2H74A 3A5WA 3Q18A 2CAQA 5AIXA 4F0BA 3LYPA 5IMVA 2HNLA 2N5AA 3FZ4A 1XZOA 3HJMA 3VI5A 2I4AA 3KGKA 3Q74A 2ON5A 1ACVA 4BVYA 2IL3A 2R37A 3CMIA 3LGCA 4IKHA 3IK9A 2FNOA 2V32A 1N8JA 4MA9A 4MK3A 1TKDB 1F37A 5IMZA 2LQOA 3ZFBA 1X9WB 1OKTA 6GSXA 2LQQA 1NSWA 4KB3A 4MJAA 1USBA 4ULXA 3GSTA 1WIKA 20GSA 2PGTA 2IIYA 2WFCA 1VRSD 4FYCA 2FCHA 1GTIA 1VF2A 1MD4A 4XTSA 3TKSC 5HFKA 1T4ZA 2GSQA 2QC7A 5DJMA 1Y25A 2VIMA 3TB2A 4HDEA 1TU7A 1XPVA 3GL5A 3ZITA 5H5RA 1B8XA 4JRRA 4MZCA 2LNTA 3HKRA 1B9XC 3L9VA 2HZEB 1G6YA 2YPMA 4BWQA 1FB0A 19GSA 1A2JA 2IMDA 2GZZA 4X0XA 3TKPA 3ERFA 1DUGA 3ZTLA 2P5QA 1HNCA 3GN3A 1ZYQB 4BVXA 3KM6A 4MABA 2MBTA 1XXUA 2TIRA 4K6XA 1ERWA 5CNWA 4OCEA 2L57A 1SJIA 3BBYA 3GL3A 4WF5A 1KBNA 4RUVA 3A2XA 4Z7XA 1WPIA 3EWLA 3I6AA 2LTKA 1Y6EA 2YANA 1X5CA 3IOSA 2H6XA 2LUSA 4O7HA 2RUEA 2MBSA 3KIJA 1JZDA 4X43A 4K0GA 2PWJA 4J2FA 4MJCA 4OWYA 3SBCA 2VCZA 3ERWA 3M9KA 1TP9A 2PVQA 5B7CA 3US3A 3QFAC 3GSSA 4XRAA 3EVIA 4ZBAA 2BJXA 2RIIA 4L0UA 4TR0A 3CTGA 14GSA 4ZB8A 1IYHA 1V40A 4OFNA 1PSQA 2H19A 4HU7A 1M99A 1G7EA 4F82A 1NHOA 3GTUA 2H30A 1AC1A 3IRAA 3P8WA 4KSMA 4HJ2A 4L5LA 4K7NA 3GUSA 4J56E 2VD0A 5H5SA 2IMIA 3EMXA 5AISA 3TRQA 4Q5FA 1FOVA 2YWIA 2JSZA 4NAXA 5CRWA 3EU3A 1B48A 2GTUA 3CSJA 1BAYA 4J57E 1GSSA 1TRSA 4K8MA 3RHBA 2KP2A 3GIXA 3J7Yk 2IPAA 2ZNMA 4WBRD 1PD21 1SJZA 3HVSA 5ECLB 3MWHA 4JR4A 1XFLA 4BA7A 4ID0A 1KNGA 1SKRB 1YKAA 5JWOB 5HR3A 1SK2A 5ENUA 1YJ6A 5ECKB 3UVTA 1SL2B 2H66A 5ECSA 3TKRA 2MYGA 3ZVJA 4YQVA 1YKCA 3BJ5A 5CO3A 5HFGA 4D73B 4GTUA 1XVWA 4IP6A 2FY6A 2TRCP 1F9MA 4YH2A 1BJXA 2P5RA 2HYXA 3EMPA 1GRXA 4JR6A 3QDNA 2V1MA 3FW2A 1JFUA 5HR0A 4OCFA 3FZ9A 5D8IA 5ECPB 1VF3A 3RPPA 4PX1A 4KSOA 2X64A 1QUWA 2EIRA 2B5YA 4TR3A 5G5FA 1OKDA 3IHQA 2HZEA 2VO4A 1BG5A 4GCIA 3DGQA 4K7IA 3TOUA 2GQKA 2YCDA 1R7HA 4GSNA 2YWOA 1Z3EA 5CYYA 2YV7A 2PPTA 1XWAA 3S9FA 1XWGA 2MMZA 1XOBA 4XS4B 2YWNA 2AAWA 1R26A 2GZYA 1A8YA 1MTCA 2QKEA 3GFKA 1F6MC 4I5QA 1V57A 3ZRDA 5JCUA 1EOGA 2CVBA 3M9JA 3QFBC 2B3SA 4OFTA 2E7PA 4MMMA 4POMA 1U3AA 3ZMKA 1HD2A 3TJKA 3FK8A 5G1LA 3W8SA 5DBQA 11GSA 3WT1A 2K8SA 2AB6A 1ML6A 3EU4A 4ECBA 1OC3A 2M80A 22GSA 4IW9A 2WULA 5LD0A 1JZRA 2YZUA 1GNEA 5IMFA 5CRDA 1E2YA 4KDYA 2PVOC 2NTOA 4V2LA 1XOAA 1QQ2A 2XPDA 3PGTA 1K3OA 4N0VA 1R5PA 3BOAA 3QAVA 3APQA 1K0CA 4EUYA 4ECCA 4QL9A 4IJ3A 1G6WA 1TRVA 2HT9A 4KCEA 3TRPA 4K7OA 2I1UA 5J41A 4HI7A 3ZZXA 4GQFA 3GNJA 2LJRA 3VWWA 6GSSA 1V2AA 1A0RP 1M2AA 5IOXA 2K6VA 3FR6A 3UARA 2JSYA 5G2ZA 1N2AA 2ON7A 3DXBA 2LJAA 3A3TA 1MDKA 4RI7A 1X5DA 2IMFA 4IQAA 3HVXA 1J0FA 3P2AA 3J7Yb 3Q19A 1AAZA 2V6KA 1TI1A 3KP9A 5G30A 2B1LA 1T1VA 1GSFA 3D4TA 2EIOA 1AW9A 1NM3A 4PURA 5GZZB 4Q5RA 2IMEA 5ECMB 4GRFA 4RI6A 3LXZA 4IHUA 1KTEA 2YWMA 4I2TA 4YQUA 5E4WA 5DCGA 5F05A 2NBSA 5IO2A 4D73A 5C00A 2H0HA 1JLVA 3PR8A 5KEJA 2P31A 3W6GA 5JCWA 1V98A 2VCWA 2AUVA 4WBJA 3EC3A 5GSTA 4WR5A 4ZB6A 4DSSA 1GUHA 2EC4A 4IP1A 3KTLA 2AJQB 2I3YA 3N9JA 4V1Ag 3DWVA 2YJ7A 3RAZA 3HZ8A 3GX0A 4QL7A 3QD9A 1FAAA 4F2IA 4V2MA 3L9UA 3ZMLA 5DDLA 4KNDA 4EDZA 2C3TA 5ECQB 3NZNA 3GKMA 1GTAA 1WRYA 2KP1A 3RDWA 5DQYA 1XWKA 3EE2A 1GSYA 1SK0A 2VM1A 5G1KA 1K3YA 3GH6A 2BTOT 4MLYA 1V9WA 2DMLA 3KTBA 3WD6A 1GL8A 3LFLA 3L0HA 1U87A 3UEMA 4L8EA 3MSZA 4KUNA 3L78A 4XS4A 4OO5A 4ILFA 4L5OA 1MDIA 2AHEA 3I9V2 3F0IA 3BD2A 3VPQA 3TJJA 2CAIA 2K8VA 2CT6A 4BPYA 2OACA 1ZYEA 4G9HA 3IXRA 2DC5A 1TI3A 2B1KA 1EEJA 1QMVA 1EGRA 6GSYA 4P3YB 3HVVA 1XVQA 1FO5A 5A5KA 2F3MA 1UC7A 1K0MA 1UN2A 3LEFA 4MPFA 3VK9A 2JL4A 5INYA 2GS3A 3D21A 2CZ2A 3C73A 4HS1A 1FVJA 3H79A 5IQYA 2JZSA 2B7JA 3E0UA 2R4VA 3HYPA 1PMTA 1J08A 3EINA 3FKFA 1Z9HA 3FYGA 3G7JA 4ISDA 1OE8A 2IWTA 4ZB9A 2X99A 5B8BA 4DVCA 1Z7RA 2OKAA 1FVKA 2YV9A 4KX4A 4GQCA 2KLXA 4TR1A 4HU9A 1YDKA 3ZYWA 2JZRA 4XS1A 2Z9SA 1PKZA 3DVXA 4ZL7A 1Q98A 2JADA 1H4OA 3QMXA 2NPBA 2LS5A 2H8LA 4XS6A 5E59A 3IE3A 2A2SA 2FHEA 4KAEA 4MF7A 2LKUA 1RQMA 2I9HA 2WDUA 1TOFA 3C1SA 5DJLA 1PGTA 4NV2A 1THOA 4FH8A 4LL1B 2GVPA 1R5AA 3ERGA 3QR6A 5ECNB 3VLNA 2FLSA 2OJLA 4FIWA 3LQ7A 1F2EA 1WJKA 2LRNA 2WJUA 1SENA 2RM6A 3TUEA 3IPZA 3TOTA 1BX9A 1VF4A 5G5EA 10GSA 2FWHA 2C0GA 3TKSE 2PN8A 1B4QA 4TKYA 2P0GA 4F0CA 2FGXA 2NVLA 3E9JB 3IV4A 3FR9A 2DJKA 1XWBA 4GSSA 3HDCA 4DSRA 3ZVJD 3TJFA 3RBTA 4TRXA 3F4SA 5IM9A 4OFMA 3I69A 4V1Ap 3APOA 2L59A 3ZFLA 4EKZA 3TCOA 1MDJA 2C0FA 5D9VA 2LRCA 4ACSA 3VPTA 1V58A 3FR3A 4AJ6A 5L71A 3N5OA 2H71A 1FW1A 1XW5A 4NXIA 1FB6A 8GSSA 2CV4A 3F9UA 3G7YA 3KZQA 4KDUA 1SKSB 1GNWA 3VWXA 5DALA 1GUMA 2FD3A 3UL3A 4MF6A 5B8AA 2REMA 2VOCA 2JACA 1O7UA 3H93A 3ZIJA 1ZMAA 3F4TA 1AQXA 1TRWA 2L5OA 2V2GA 5IOWA 2HE3A 5JWRB 2XHFA 5CP1A 5CRGA 1YZXA 2KHPA 17GSA 3A2VA 1JLWA 4N30A 1GULA 3IK7A 4GSTA 3F6DA 5ID2B 1T00A 3WGXA 5ELGA 3C71A 4DSSB 3PH9A 1VGLA 2ES7A 3KXOA 1F3BA 1HNBA 2YJHA 5JWQB 2GLRA 3FEUA 1O81A 2VLTA 3ME8A 2VM2A 2HSHA 2FWGA 5IMDA 1JHBA 1M2DA 1IYIA 1FHEA 4TOPA 1GH2A 5KN1A 3NOFA 3WGEA 3GV1A 3UAPA 3DVWA 4FYBA 1ON4A 4K1FA 1XCCA 1XWCA 1THXA 1TDIA 4POBA 1AUCA 4XIHA 5J9CA 3C8EA 2H6YA 1O8WA 12GSA 4ZL9A 1OVNA 4ZL8A 3HY2A 2B6MA 1WMJA 3IC4A 5KN0A 1AIUA 3QAWA 1TU8A 1M0UA 2B5XA 4EO3A 2B5EA 1G7OA 1TK5B 5DAKA 2F9SA 5HFIA 1DSBA 1K0NA 2H0GA 2GDRA 3CYNA 5EVOA 4MDCA 2ZUPA 2AYTA 1XIYA 1ZGNA 4FO5A 5A4WA 1BEDA 1E6BA 2GT5A 1ERUA 3A2WA 3G7IA 1ERTA 6GSUA 4ECIA 4HJMA 1PKWA 3FY7A 3P90A 2M46A 2G2QA 4NHWA 4AJ8A 4EF0A 1A24A 4WF4A 2X8HA 1RW1A 2A2RA 4HZ2A 2O89A 1J9BA 1PL2A 5J9BA 4PGTA 2IFQB 1EEMA 5CREA 2DIYA 5A4VA 2GGTA 2YOIA 4EVMA 1W4VA 1UVZA 2LSTA 1SD8A 3IDVA 1M2BA 1M9AA 3GHAA 3UBKA 1JZOA 3CTFA 2L4CA 2VCVA 4AJ7A 1GWCA 2O8VB 3JCML 1EP7A 3DYRA 3Q6OA 5ECOB 2ZCTA 4TR1B 5GAND 1HYUA 4NV5A 4WR4A 3GH9A 1GSEA 2GSSA 2MMOA 3KH9A 4ZBDA 2DJ3A 5DQSA 2DJ0A 5G31A 1WWJA 2RM5A 1SYRA 2CZ3A 4WEYA 2C0EA 5D96A 3D5JA 4LA1A 5D9XA 3H8QA 18GSA 3GX8A 3TGZA 2GSRA 1LJRA 1FG4A 2N5BA 3HJOA 2WZ9A 5J5NA 4MJBA 2IJYA 2RLIA 4POLA 2MMAA 2MZCA 4K0NA 4PNFA 4MCUA 2PERA 3VURA 5J3RA 3CSIA 3D0ZA 1SK1A 1T4YA 4ZILA 1O85A 5HQPA 4JE1A 3E3EA 5ID2A 1C72A 1EZKA 5B6MA 1H75A 3QAGA 3FZ5A 2FA8A 3DKSA 1B4PA 2WRTA 3CBUA 5D73A 3BCIA 4YAVA 4WETA 1Z7PA 3ISOA 1DBYA 2LV3A 2H1GA 1MEKA 1EGOA 4GF0A 5DCHA 3TDGA 3H1NA 4LL4B 1A8LA 1SKWB 3R2QA 4EE0A 5LCZA 4KH7A 2VL2A 4BL7A 5A4UA 4IVFA 3UBLA 1EP8A 2PBJA 2OA7A 1JZWA 2XPEA 3AY8A 5IMCA 1SL0B 4EDYA 1X5EA 1Z5YE 3V1WA 1ZOFA 4L0WA 2F8AA 2L6DA 4O92A 5JCGA 2FWEA 4LMWA 4MZBA 4ML6A 3D22A 5ECRB 1GSQA 4HOJA 1ST9A 4GLTA 5HR2A 3GKNA 1PRXA 2K18A 1F3AA 3CRTA 3MAKA 1M7TA 5FHIA 4OO4A 3DEXA 2IMKA 2EIQA 3OR5A 4JEDA 4XCSA 4KE3A 2DIZA 3QPMA 1M9BA 1XW6A 4K2DA 1AQWA 6GSWA 2N5FA 5DALB 3L4NA 2DMMA 1X9MB 1TW9A 3I43A 4NMUA 1OC8A 2H01A 5IPHA 4NHZA 2GZPA 2C3QA 4EXJA 2CQ9A 4TR4A 3M0FA 3HD5A 4HQZA 2WCIA 4IJIA 3CSHA 2MMNA 3FZAA 4K9ZA 2IFQA 2E2MA 5FWGA 5ABRA 4HUAA 2OBIA 1ZZYA 3MDKA 3WYWA 1K0DA 1U3IA 4MZWA 2LJKA 2JU5A 1OC9B 2IN3A 3K8NA 3W8JA 4IN0A 4WXTA 4JZQA 1T7PB 1GSDA 3C1RA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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