3MNGA

Wild type human prxv with dtt bound as a competitive inhibitor
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
APIKVGDAIPAVEVFEGEPGNKVNLAELFKGKKGVLFGVPGAFTPGCSKTHLPGFVEQAEALKAKGVQVVACLSVNDAFVTGEWGRAHKAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNRRLKRFSMVVQDGIVKALNVEPDGTGLTCSLAPNIISQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Evidence that Peroxiredoxin Catalytic Power Is Based on Transition-State Stabilization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-5, mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 47
structure length 161
sequence length 161
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3mngA00
1Z6NA 3P2AA 2CAQA 4KB3A 2PMTA 3UEMA 1USBA 3NOFA 1BG5A 4H86A 3EE2A 1XVQA 1Y6EA 2R37A 4O92A 5CRGA 4GQCA 4WR5A 2KP2A 4ZB8A 4EDYA 1FG4A 4MLYA 2H6YA 1XPVA 2WZ9A 2VL9A 1VF2A 4O5RA 2A2SA 3RDWA 2QC7A 5A4UA 2RM5A 18GSA 2YOIA 4WEYA 4KX4A 3UIWA 1TW9A 3P90A 4MPGA 3ZRDA 4X43A 2YV9A 3DKSA 3QAWA 6GSYA 5CRWA 4WETA 2DJ3A 2CV4A 2JADA 4MJBA 4I97A 1S3AA 1GTBA 1XWCA 3VLNA 1R4WA 3GA4A 3LFLA 3F4SA 3LXTA 3H4KA 2EIOA 1TP9A 2K18A 5CREA 1PKZA 2WULA 1E6BA 1BQ7A 4MJAA 3TKPA 2PU9C 1TRVA 4AJ6A 4MJCA 2VL2C 4BVYA 1X5DA 1JHBA 3FY7A 3ZITA 2L5LA 5CP1A 3O3TA 1VF1A 1X5CA 3GH6A 3HY2A 1V58A 1S3DA 4MK3A 1O73A 2EC4A 4I2TA 3CBUA 1GL8A 1DBYA 1BYEA 3F8UA 2LJKA 3LG6A 1PMTA 4BPYA 1OVNA 2YP6A 2HT9A 2M46A 4V2NA 20GSA 4I8BA 5JCWA 17GSA 3Q19A 3VFIA 6GSSA 1T7PB 2FWGA 3LYKA 5IM9A 2ES7A 3GN3A 4IELA 5JCUA 1JLWA 4JR6A 1DE2A 3CSIA 3KP9A 3GKXA 1URMA 2HE3A 4IJ3A 3MWHA 3MDKA 1BX9A 3EVIA 4GSNA 4EE0A 3DXBA 2OE0A 5GAPD 4TW5A 3FYGA 4DSQA 4MZWA 1JZRA 4N10A 3CYNA 3VWXA 1M2BA 2FWHA 1J9BA 1J08A 2TRXA 5D8IA 2DJ1A 3TRPA 4EVMA 1YKAA 2FGXA 1HD2A 1ZZYA 2YV7A 3FRCA 2L5OA 2PN8A 1NM3A 2REMA 4RI7A 2FWFA 2FLSA 2L6DA 2MMNA 1TXXA 2CZ3A 3M9KA 4G10A 1Z3EA 4HOJA 3ZFBA 2HLSA 5ECHB 1ZYQB 4MDCA 1K3LA 4KH7A 2YWIA 4ZB6A 1TI1A 3QR6A 2YNXA 5LD0A 2HFDA 1GWCA 2H1DA 3FZAA 1TDIA 4DSSB 4V1Ap 10GSA 5DAKB 5DQSA 4IQAA 1GSYA 3F6FA 2PUKC 3EWLA 16GSA 2VLTA 2C4JA 3KZQA 2H75A 4BVXA 1YJ6A 2IN3A 4I5QA 3A2XA 2YPMA 3KEBA 4IS0A 1WP0A 1QQ2A 3E0UA 4QQ7A 4X1UA 4MA9A 4Q5QA 1UN2A 5GSTA 3F0IA 3UBKA 4NAXA 3RPPA 2GSTA 4MF6A 3GKKA 4MP4A 5IMFA 1ZMAA 1SL0B 3D21A 3EURA 2PGTA 4TN8A 1X9MB 3ISOA 4KA0A 4Q5NA 4LA1A 1ZOFA 2HSYA 3L9UA 2IIYA 2V32A 3FR9A 4KDUA 1Q4JA 4KDYA 1QUWA 1G6YA 1Q98A 1YY7A 3RPNA 2RLIA 3TJGA 4KE3A 2IL3A 2OJLA 1EEJA 2K9FA 5DVBA 2H72A 3W8SA 2WCIA 1TK8B 3IBHA 2BMXA 2DLXA 1B9XC 3F6DA 4ZBBA 3P7XA 4MF5A 4MPFA 2GZYA 1V98A 1BJXA 3IOSA 4BL7A 1EZKA 2V6KA 5ENUA 3SWLA 4WXTA 3ZREA 3O76A 4TXVA 4WR4A 2CVKA 4MH2A 1SD8A 3V1WA 2H19A 2N5FA 2WS2A 5LCZA 1HYUA 3UOMA 2XBQA 1Z7PA 2WB9A 1A2JA 2V2GA 1JZOA 3IHQA 3ZL5A 1A0FA 4XS1A 1JFUA 4TKYA 2VO4A 3KTLA 11GSA 1SYRA 4XCSA 4ZL7A 1EWXA 3GKNA 3HJMA 1DE1A 4MMMA 3FK8A 2H01A 4CHSA 1PN9A 3DVWA 3US3A 1PA3A 4ZL8A 2H76A 4ACSA 1S3CA 3UL3A 2YWMA 4KW6A 1YF0A 4K0NA 1ACVA 4JBBA 2GZPA 1OYJA 3WYWA 1PL2A 3Q18A 1M2AA 3FEUA 3HKRA 2CT6A 1GSDA 1XWKA 3G9BA 4MH3A 3D5JA 4XS6A 2WJUA 3RHBA 3CSJA 1XW5A 2LRCA 2A4VA 3HVXA 12GSA 4HQSA 2FD3A 4EF0A 4ULXA 3LGCA 3VWVA 1GH2A 1SL1B 4F9ZA 3VPQA 3ED3A 3KCMA 1G0TA 5FHIA 2IPAA 4G9HA 2I4AA 3DGQA 1SKSB 5ECRB 3DD3A 2CX4A 1PKWA 1GSFA 2K8VA 1K0DA 5B7CA 1M2DA 3C1SA 3RHCA 3NIVA 3GTUB 3QAVA 4IW9A 4DSRA 1A2LA 6GSTA 2JL4A 2GSQA 5ID2B 1NSWA 4ID0A 4EDZA 2VCVA 1LJRA 5FWGA 2NDOA 2P5QA 3P8WA 3ZFLA 2HNLA 4ECIA 1XFLA 1XOBA 4NWYA 2XC2A 3AY8A 3F4TA 3CRTA 1B48A 4JE1A 5D9VA 3M1GA 2K6VA 1RK4A 2F9SA 1U3AA 3ZVJA 3CSHA 4NHWA 4PUFC 4L8EA 1BEDA 3C8EA 1GUMA 3IAM2 4I2UA 3TOUA 3L4NA 1XBSA 2ALBA 2P5RA 2F51A 1XIYA 1Z9HA 3ZTLA 8GSSA 1UC7A 2MZCA 3N5OA 1YEPA 5CO3A 1B9YC 2X8HA 1DUGA 5F06A 5DDLA 2OA7A 1MEKA 3TDGA 4CDOA 1XW6A 3TKQA 1XOAA 2I9HA 1WMJA 5ABRA 2LJRA 2HRNA 1BAYA 3I9V2 1OC9A 1OKTA 2DIZA 3EINA 3MNGA 2JZSA 5J5NA 5ECSA 5IPHA 1TRSA 2FA8A 2H0GA 4DSSA 1K0AA 1TK5B 4PQHA 4ZILA 2GS3A 2VL2A 3G7IA 1VF4A 1W4VA 2HSHA 1NW2A 1K0CA 4Q5FA 3W6GA 3HYPA 3VI7A 1V2AA 4NV5A 1Z5YE 3KH7A 4FYBA 2H0HA 2RUEA 1U6TA 2C3QA 2LUSA 2QSIA 4XS4A 2MMZA 2AYTA 3C1RA 1TRUA 5J3RA 2FNOA 3HHVA 4HS1A 4BA7A 4HU9A 3APSA 3IV4A 1CQGA 3Q74A 5ELAA 1JZDA 1XZOA 4GWRA 4LL1B 5JWOB 2E7PA 1FHEA 1U87A 5GZZB 1FVJA 1ON4A 1AQXA 5LNKe 3VWWA 3DVXA 2JZTA 4ZB9A 1VGLA 2JSZA 1QFNA 4N0VA 2XPEA 3DRNA 4O7HA 2O87A 3A5WA 5AIXA 4TR1B 3WGXA 3FZ9A 3D4MA 2IMIA 3HD5A 3TKSE 2PWJA 5E4WA 5J9CA 2O8VB 3QOUA 1WPIA 5HFIA 3GFKA 19GSA 1ERVA 1SL2B 3D4TA 4GXZA 3GX8A 1PX7A 1TJDA 2WFCA 2KOKA 5DALA 3MSZA 3IXRA 1RW1A 3R2QA 2FY6A 4WBRD 4KCEA 5GSSA 3O6TA 1M9AA 2I1UA 3IA1A 4MZBA 3TRQA 3ZIVA 1XVWA 2V1MA 1AXDA 3KD0A 2G2QA 4OD7A 3MAKA 1AW9A 1FO5A 1GNEA 4XRAA 1SJIA 3KM6A 2PERA 3WGDA 4ZBAA 3RBTA 1TI3A 2EIQA 1THXA 4TXOB 4IJIA 2R2JA 2H1AA 1JLVA 1O8XA 1OKDA 4OO5A 4ML1A 3LORA 4JR4A 2JU5A 2HZFA 2VD0A 3APOA 1EP8A 2VCXA 2VCTA 2R6KA 3HA9A 2WRTA 1HNAA 2YN1A 3GYKA 3I6AA 5CRHA 2L59A 4ZXGA 5IO0A 4MZCA 3DWVA 4GRFA 4G2EA 1T1VA 1K0BA 1PQNA 3PINA 4GLTA 2GDRA 2XBIA 3I69A 4K1FA 2OBIA 2H1GA 4I6XA 2AB6A 1TTZA 3M8NA 1OC3A 2HRFA 3I43A 2GT5A 3FKFA 1YF1A 4WBJA 4K2DA 3GTUA 4EL1A 5H5RA 1QMVA 1OC8A 3TB2A 4GQFA 3TGZA 1EV4A 4ECJA 2ON5A 2OKAA 5ECKB 4YH2A 2MBSA 2R3XA 2HZEA 4YQUA 1SJ6A 1PSQA 4WF4A 4HJMA 5AGYA 1M7TA 2TRCP 5G30A 4XTSA 1WIKA 3IR4A 1YQ1A 1KNGA 3QPMA 3NZNA 3CXGA 5G5EA 5EL8A 1EEMA 5DJMA 4EXJA 4ILFA 3U5RE 1Z6MA 4N0ZA 5J9BA 4HUAA 2AV4A 1K0OA 2QGVA 5C04A 3QMXA 5EPFA 3DMLA 6GSUA 2O85A 5H5QA 1I9DA 5B6NA 1QXHA 4J56E 3GKMA 4OFTA 2AHEA 1GLQA 4V1Ag 3WT2A 4L0WA 2E2GA 5JCGA 2VIMA 2YZUA 2B5EA 4HI7A 5EY6A 4TRXA 4XHMA 3HXSA 3ZYWA 4OWYA 4POMA 2A2RA 5CRDA 1T8EB 1PD21 3ME8A 1GTIA 2WGRA 4ISDA 4KAEA 2CQ9A 1CQHA 3HJOA 1OE7A 2GSSA 3H79A 1SYXA 4QL9A 4D73B 3DYRA 2E0QA 4ECCA 2VCWA 3C71A 4Q5RA 2G0FA 3IDVA 3LYPA 1ZCPA 2X8CA 2H30A 3BD2A 4RQXA 3UJ1A 3CTGA 2QKEA 1GTAA 2C3TA 2B7JA 4AF2A 3GMFA 5IQYA 1O81A 4AJ8A 3A2WA 3F9UA 3A2VA 5H5SA 3IC4A 4IGJA 4CW9A 4KCAA 1VF3A 1Z7RA 5E59A 2H66A 3FHKA 4TR3A 1R7HA 2C0GA 4ZL9A 3FW2A 5F8BA 1NHOA 3EMPA 1ERTA 2IFQB 2LRTA 3TKSC 4TR1A 4K7NA 1ERWA 1X0RA 4TR0A 1OE8A 3GL5A 2X8GA 1SKRB 1A8YA 3ERFA 3TJJA 2F8AA 1U88A 3C73A 3GNJA 4FH8A 4PNFA 7GSSA 1SK1A 3GSSA 1HNCA 3VPTA 1T00A 3DEXA 2LJAA 2R5GA 1ZYEA 3KGKA 3UBLA 5COHA 1FVKA 2CZ2A 2ON7A 1A2MA 3BOAA 4RQRA 5A4WA 2M80A 1G6WA 5ECLB 5F0GA 5KN1A 2EIRA 4L5OA 5IMAA 2LRNA 1FW1A 3KH9A 5B8AA 3M3MA 2AUVA 2DMMA 1WJKA 2H73A 2IMDA 1MD4A 2DJ0A 5G5FA 2DJKA 4XRDA 4WF5A 1GNWA 3BBYA 3DIEA 1LU4A 1WRYA 2CAIA 2VLVA 2OACA 3F63A 3H1NA 3TKRA 1THOA 4IN0A 1ML6A 2LKUA 2TIRA 9GSSA 1ILOA 4POLA 5GAND 3UAPA 4EUYA 1ZGNA 3HCZA 4K7OA 4LMVA 3UVTA 2H1BA 1PL1A 1EP7A 2J9HA 4AGSA 2PVOC 3ZIJA 3HJPA 2OBKA 1WE0A 5CYYA 5ECNB 1SK0A 1G7EA 3TRXA 5KN0A 4ZBDA 2CX3A 1H4OA 5F05A 2RUFA 1B8XA 4EKZA 3F3QA 2LS5A 2L4QA 3HZ8A 1A23A 3APQA 3KTBA 2B6MA 3H93A 2HXKA 4OCFA 5ECMB 1K3YA 2YWOA 5G2ZA 4HQZA 3VWUA 6GSWA 1T3BA 5B8BA 2D2ZA 1W89A 4OO4A 4J2FA 4JEDA 1DSBA 4GF0A 2YWNA 2AJQB 1SENA 1TRWA 2J23A 3GIXA 4TOPA 2B1KA 5ECPB 1GRXA 4E8EA 1O85A 1XWBA 3L78A 5DAKA 2CVDA 4F03A 1V40A 5D9XA 4KDXA 1B4PA 3CRUA 2GT6A 4NMUA 1FB0A 3TJKA 4FYUA 2LNTA 2H0IA 1VRSD 3KP8A 2C0FA 5D96A 3EU4A 4GTUA 3GH9A 2IMFA 2KP1A 3TJFA 4OMVA 6GSXA 4FIWA 2NVLA 2P0GA 4PXOA 3VI5A 4KSOA 2B5YA 2OE3A 1B4QA 2H74A 2YCDA 1R5AA 4N11A 3QFBC 3F3RA 2B1LA 2B3SA 1ZL9A 1M0UA 1TK0B 2JSYA 2OADA 3TOTA 2LQOA 4F2IA 3SBCA 4PQ1A 1J0FA 3IK9A 1AQVA 4TVEA 2DMLA 1TU8A 5KN2A 1AQWA 4HZ4A 4ZIJA 2GQKA 2C8UA 5J4UA 5EVOA 2VL3A 4D73A 1SKWB 2L57A 2NTOA 2XHFA 5DQYA 1EOGA 4YQVA 1YEXA 3QAGA 5A5KA 1MDJA 2FUG2 3G7YA 1UVZA 3M9JA 1AIUA 3QDNA 4K6XA 2VD1A 2IMKA 1GSUA 4IBPA 4J57E 2C3NA 1R26A 4LLRA 4O32A 4PURA 2P31A 3IE3A 2CA8A 1QK8A 1F3BA 2DJJA 5F07A 2CVBA 3W8JA 2DC5A 4PX1A 4TR4A 3CTFA 3KMNA 3VURA 2M72A 2HYXA 1K0NA 2IFQA 2KHPA 3UVHA 1K3OA 2WDUA 4YAPA 3D0ZA 1C72A 1H75A 5KEJA 2GVPA 1TU7A 1FOVA 4F0BA 2E2MA 1GP1A 3H8QA 1WWJA 3E9JB 1A24A 1ABAA 4YQMA 4HJ2A 4WKWA 5AIVA 5IMVA 4IHUA 3LQ7A 3ZLPA 4L0UA 3ZZXA 4BWSA 4HEA2 2I81A 2L4CA 2V6OA 2C80A 4MABA 3QD9A 3RAZA 1O8WA 2FCHA 3JCML 1N8JA 2OE1A 1YKCA 5JWQB 3L0HA 1NHYA 4DVCA 4KGIA 4FYCA 4K8MA 3IK7A 3KMOA 1PGTA 2V41A 1EV9A 2VUPA 3GHAA 1KEBA 2GZZA 3F4RA 3J7Yk 2H8LA 1EGOA 5G31A 5HR1A 4POKA 2VCQA 3WT1A 2X64A 4QL7A 3S9FA 3E3EA 1X9SB 5HR3A 3LEFA 3HVVA 4N30A 4P3YB 5ID2A 4F0CA 2IMEA 4OFNA 3G7JA 5DCGA 4RUVA 1FB6A 4L5LA 4G19A 2JACA 5JWRB 1XCCA 2ZNMA 2H6ZA 6GSVA 1YDKA 5A4VA 1OC9B 3IAS2 4V2LA 1HNBA 3GL3A 4MCUA 1GUKA 3KJYA 1F3AA 1MTCA 5AISA 1TOFA 4FO5A 22GSA 4IKHA 4HZ2A 4IP6A 1AAZA 3BJ5A 2MYGA 2GLRA 1GSSA 2AAWA 2MMOA 5B6MA 4X0XA 3WD6A 2PBJA 3KXOA 2GTUA 3WGEA 3TKSA 4HDEA 4KUNA 4DEJA 2LQQA 3D6IA 2GQLA 1LBKA 1ERUA 3J7Yb 4EO3A 2FA4A 2L6CA 2X99A 2BTOT 2NBSA 2JZRA 4XS4B 5D93A 3CMIA 4K7IA 4OCEA 4K9ZA 4KSMA 1T4ZA 2B5XA 5IMZA 2VM2A 3D22A 3BCKA 2Z9SA 3C7MA 1GSQA 1V57A 3GX0A 2VLUA 3EMXA 1SK2A 1SD9A 1K0MA 3FZ4A 3TCOA 4XIHA 1A8LA 3HDCA 1I5GA 5IOWA 3GRXA 1O6JA 1XXUA 5HFKA 4GSSA 4YAVA 4IP1A 2LNSA 3GURA 3M0FA 4JU5A 1GTUA 2YJHA 4POBA 3TJBA 3KIJA 5ECOB 1SJZA 3ZMLA 1ST9A 5DCHA 2C0EA 1A0RP 5D9WA 2R4VA 5D73A 1GUHA 2DSAA 2KLXA 4MJEA 1IYIA 1EOHA 1G7OA 1JZWA 5DALB 2ZCTA 4F82A 2BJXA 2RIIA 3L9VA 2N5AA 4IQ1A 4LL4B 5C00A 4GSTA 1XWAA 2B7KA 5IIZA 4RI6A 5CNWA 1RQMA 3FR3A 3Q6OA 4ECBA 14GSA 2MMAA 1F6MC 5D9TA 3QFAC 4ML6A 1KTEA 3ERWA 1SU9A 3VK9A 1GLPA 5DBQA 3A3TA 1PRXA 4PNGA 3GSTA 5J41A 2IWTA 4PUAA 4E8HA 1F2EA 2DBCA 3LJRA 3GV1A 2F8FA 2FWEA 3GUSA 2GSRA 1AUCA 1QGVA 4OFMA 3LXZA 4JRRA 2YJ7A 3HVSA 4Z7XA 1OAZA 4AJ7A 5FT3A 2DJ2A 3LWAA 4EC0A 2O7KA 4TXOA 3UARA 2C1YA 1X9WB 1M9BA 1MDKA 2I3YA 2PVQA 4PQIA 5HR0A 1R5PA 1Y25A 1XW9A 2K8SA 2N5BA 3OR5A 1U3IA 2F3MA 3UMAA 5CAXA 1N2AA 4NPBA 5IO2A 5DJLA 2NPBA 2YZHA 5G1KA 5IOXA 4NHZA 3QCPA 13GSA 4HU7A 3ME7A 2LEGA 2GQMA 1M99A 4LMWA 1V9WA 2VCZA 5ECQB 5G1LA 3PGTA 2IJYA 1XWGA 1T4YA 2LSTA 3BCIA 3L9SA 2YANA 2HZEB 2KUCA 5HQPA 2HI7A 1GSEA 2LTKA 4IVFA 1MD3A 3PR8A 2H71A 4K0GA 3EC3A 3ERGA 5ECIB 1MDIA 4KNDA 5HFGA 1KBNA 1F9MA 1IYHA 5HR2A 2FHEA 1EGRA 3ZVJD 2MBTA 5AN1A 1YZXA 3LSZA 1X5EA 3IPZA 1FAAA 2VM1A 2DIYA 3EU3A 3ZMKA 2LV3A 5IPGA 4NV2A 3PH9A 3K8NA 1O7UA 1UA5A 4V2MA 2VAFA 5KN3A 4NXIA 3FR6A 3IRAA 4JZQA 5ELGA 4PGTA 2XPDA 5L71A 1E2YA 4MF7A 1TKDB 2VOCA 2RM6A 5IMDA 3HZ4A 3N9JA 1HQOA 2H6XA 3TUEA 1F37A 2H70A 3FZ5A 1PX6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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