3MSZA

Crystal structure of glutaredoxin 1 from francisella tularensis complexed with cacodylate
Total Genus 23
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
23
sequence length
86
structure length
86
Chain Sequence
AMKVKIYTRNGCPYCVWAKQWFEENNIAFDETIIDDYAQRSKFYDEMNQSGKVIFPISTVPQIFIDDEHIGGFTELKANADKILNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Glutaredoxin 1
publication title Crystal Structure of Glutaredoxin 1 from Francisella tularensis Complexed with Cacodylate
rcsb
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 23
structure length 86
sequence length 86
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3mszA00
1A8YA 3Q19A 1WPIA 2FWEA 2BJXA 4POKA 4HU9A 2B1KA 4IBPA 1K0DA 1GULA 5HR0A 3APOA 3GUSA 4QL9A 1K3OA 2YV7A 3DRNA 4JR4A 2YP6A 1TKDB 1T4YA 1QFNA 1ABAA 2YWMA 3D21A 3HKRA 2OKAA 6GSYA 1EZKA 3FW2A 1A2MA 1MDJA 2DJ0A 1X5CA 1KBNA 3GIXA 3GX8A 3GX0A 4YH2A 5F0GA 4PNFA 3DEXA 2LEGA 4TR0A 3D22A 2VL2C 2L57A 5DCHA 1GLPA 2GSRA 2H71A 4BVXA 2GQLA 3LYPA 5DDLA 1TRSA 1U3AA 3NZNA 2CV4A 3GMFA 3KD0A 1GSUA 4TW5A 3A2VA 4GCIA 1W4VA 3L9SA 3V1WA 3Q74A 5CRWA 4G10A 5COHA 1FVJA 3RPNA 1YY7A 3UMAA 1F3AA 4KH7A 4GSSA 4EDYA 2IJYA 4KGIA 4KSMA 5EVOA 4ZL8A 4GWRA 2H75A 2JADA 1EP8A 5J9CA 1T4ZA 3QAWA 1BG5A 4F82A 2H0IA 5IPGA 2NDOA 1AAZA 4DSSA 4CHSA 4Q5RA 5J5NA 5IIZA 1XVQA 1PX7A 4HEA2 4ZL9A 4MZCA 2WJUA 1ML6A 2LQOA 2H1AA 2DJ3A 2J9HA 2AB6A 4IJ3A 3D4TA 1WJKA 3TKSE 4ZB6A 3IC4A 4MP4A 3TKRA 2NPBA 3TJBA 1R7HA 1T1VA 3W8JA 1GSQA 4LLRA 1E2YA 4Z7XA 3FZ4A 5D96A 3GH9A 4NPBA 2R2JA 2FWFA 3MWHA 1DE1A 2TRCP 2MMAA 3I6AA 3ZVJA 3ZRDA 4L0WA 1SKRB 2KP1A 2V41A 1T8EB 3FR6A 4DSSB 3HHVA 4XRAA 3ME8A 2FY6A 1QMVA 1GTAA 3LSZA 4LMVA 2KOKA 1MEKA 4FO5A 2PGTA 2WULA 4K0GA 4ECJA 2RIIA 3F9UA 1X0RA 1XPVA 2OJLA 2FCHA 1A2JA 3CBUA 3RAZA 1VF2A 3HYPA 2O8VB 2L4QA 1WE0A 2M80A 5FHIA 2ZCTA 2VAFA 4OWYA 3UBKA 4PQ1A 1KTEA 3HA9A 4EE0A 5G2ZA 2KP2A 3E9JB 3KCMA 3TKPA 1TRWA 4ZB9A 2GZPA 4PUFC 1B48A 2FA4A 1XWCA 2PUKC 4ILFA 3IAM2 4MA9A 2I1UA 3ZREA 4PXOA 2XPEA 5ECNB 1QXHA 4GF0A 2RUFA 2FWGA 3DYRA 6GSVA 3QR6A 1PX6A 4V2MA 1JLWA 3UBLA 4ECBA 1PA3A 3VWWA 3ZFLA 4L5LA 1K3LA 3MSZA 4WEYA 2IIYA 1XW5A 3WGDA 4POMA 4ZBAA 3TRQA 2YOIA 5E4WA 3ZYWA 2EIRA 2F8AA 1GUKA 2IN3A 3HDCA 2PBJA 2YZUA 4GSTA 1O85A 2V6OA 3HZ8A 1HNBA 1VF4A 4TOPA 4PUAA 3DVXA 1OYJA 5HR3A 4WBRD 1FO5A 1K0MA 1YEXA 1ILOA 1TTZA 2HT9A 1EEMA 3MNGA 1SJIA 1O81A 1URMA 5IMDA 5IMZA 1XOBA 3FK8A 4V1Ag 2AAWA 3KMNA 4RUVA 3UL3A 4IQ1A 1WIKA 2ON5A 3KM6A 5J41A 2R6KA 10GSA 3TOTA 1GH2A 2H1GA 4XTSA 1W89A 1SL0B 2XPDA 1K3YA 2RM5A 1GUHA 3G7YA 1WMJA 1JHBA 1GTIA 2TRXA 3FR9A 3QAGA 1AC1A 2YPMA 7GSSA 14GSA 4FYCA 4FYBA 1UC7A 2WB9A 4ACSA 3F3RA 1ZYEA 2GLRA 4N0VA 4EO3A 1K0NA 3GSTA 1JZRA 3DXBA 5ID2B 2CX3A 4O92A 2GVPA 2C8UA 4IP6A 2K8SA 4K9ZA 3EU3A 2FNOA 5D9XA 1PMTA 1XWGA 3LGCA 2FA8A 3LXTA 1B9YC 3FKFA 4IELA 2VIMA 4N0ZA 5A4UA 1NW2A 5LD0A 2GQMA 3KH7A 5A5KA 1F6MC 2DJJA 4K7OA 3EINA 1T7PB 1ZYQB 5CRDA 3BD2A 1TDIA 3GKMA 2LNTA 1AUCA 4K8MA 4OD7A 3BCKA 2ON7A 4Q5NA 1R5AA 3GYKA 4MDCA 5HQPA 2C0EA 3CSJA 4TR1A 1TRUA 3MAKA 1TI3A 4EC0A 1EOGA 3UAPA 2H6XA 4GQCA 4CW9A 5GAND 5GAPD 2WDUA 3GKNA 3IV4A 1G6WA 5LNKe 3VPQA 1N2AA 5L71A 1YEPA 1ERTA 2DJ2A 2LUSA 1ZOFA 1Z3EA 3U6VA 4EL1A 4MF7A 5JWOB 2MYGA 5GZZB 2XBIA 2H70A 3KIJA 1A2LA 2WCIA 4PNGA 1RW1A 4WBJA 3RBTA 5JWQB 2YWIA 1M9AA 4O7HA 5F05A 3WT1A 2VCVA 1I5GA 2VL9A 1B4PA 2I81A 5G5FA 1BX9A 5JCUA 4V2NA 2IFQA 4IQAA 2HSHA 4HOJA 1TK5B 2VM2A 4MZWA 4NWYA 2A2SA 4J2FA 5AN1A 20GSA 5EPFA 5IM9A 4XS4A 2LRNA 3GA4A 4WETA 4TR1B 1TXXA 1YKCA 2PERA 2HFDA 1K0OA 3CTGA 2HZFA 3J7Yk 2HYXA 5AIXA 2H6YA 2H30A 3VURA 3C7MA 4KX4A 4GSNA 3GH6A 4F0BA 4KW6A 2R3XA 1YF0A 3BCIA 2WGRA 3M3MA 4PURA 5A4VA 3H8QA 1YQ1A 1M9BA 2C80A 4IS0A 4XIHA 4L8EA 4F2IA 4ML1A 2EC4A 1ERUA 4YQMA 1NM3A 3VWUA 1ZZYA 2H66A 2IFQB 5D93A 2WS2A 4O5RA 2LJKA 4OFTA 1YDKA 18GSA 2HNLA 3EURA 3JCML 4XS4B 3KJYA 3M8NA 1MDKA 1ZCPA 1X9SB 1WOUA 4PX1A 4G9HA 2AHEA 1A23A 2L59A 3KMOA 2CVDA 1M2DA 3QPMA 4D73A 5E59A 4L5OA 5DVBA 2VCXA 5DQYA 3ZFBA 2IMEA 2YZHA 1FOVA 2X8GA 2H1DA 1B8XA 2VD0A 1G6YA 2DIYA 2E7PA 3UEMA 2GZZA 4MJAA 1JFUA 3VI5A 1XVWA 1PL1A 4NV5A 5ECRB 2E0QA 3D5JA 3TJGA 4AF2A 2AJQB 1V40A 4F03A 1Z7PA 4WR5A 1K0CA 3VPTA 4K7NA 4D73B 1TOFA 1FW1A 5CRHA 4ZL7A 1EOHA 3ZLPA 4XRDA 3TB2A 2X8CA 2VO4A 3TJKA 4WXTA 4AGSA 3ZVJD 1CQGA 1TU8A 2OE1A 2CZ3A 3CRUA 3U5RE 5JCGA 3L9VA 3H1NA 1V57A 2RLIA 2MBTA 4XS6A 3RPPA 2F8FA 2IMFA 2B7KA 1GSFA 1OKDA 3C71A 1S3CA 3P7XA 4TR3A 5HR2A 6GSXA 4EXJA 3L78A 2A2RA 4F0CA 3ZMLA 1DBYA 4YQVA 2H8LA 3QOUA 1Q98A 2KLXA 3IA1A 1J08A 1XXUA 3I43A 4I2TA 4KDUA 3UOMA 3ZITA 3A3TA 4GRFA 3K8NA 1U88A 2O7KA 3GNJA 3J7Yb 3BJ5A 4YAPA 1SK2A 3IDVA 2H74A 4ZBDA 1FVKA 2GSTA 1XIYA 3N9JA 5H5QA 1BEDA 2GSSA 5DAKA 1XBSA 4TRXA 3F0IA 3IK7A 1GTUA 3QFBC 4HS1A 2H72A 3QFAC 1F2EA 1AW9A 3ERGA 3WT2A 2OE0A 4NMUA 2A4VA 2HRFA 1TK8B 2VCQA 4I8BA 4DSQA 1OVNA 1M0UA 2HLSA 3F4RA 4MK3A 4O32A 4JRRA 1MD4A 1DSBA 1EV9A 2H01A 2H19A 1R5PA 2HRNA 5B7CA 1Z5YE 5DQSA 1B4QA 2VLVA 3UIWA 4KAEA 2JL4A 1CQHA 3BOAA 3APQA 1ON4A 1XWAA 2L5OA 4IHUA 5J3RA 1TI1A 3QD9A 4WF5A 4EDZA 5IOXA 2LJAA 4ML6A 3FZ5A 2C4JA 5DAKB 1BJXA 2ZUPA 2RUEA 3O6TA 5CNWA 5KN1A 1AQXA 4GLTA 3TKSA 3Q6OA 4ZBBA 3HVSA 1WRYA 2FUG2 2G2QA 5HFKA 5ABRA 3EU4A 3TRPA 2E2GA 1EV4A 1SL1B 2I9HA 4I6XA 4KCEA 1EGOA 2YN1A 4L0UA 3KH9A 3I9V2 1FB0A 4HUAA 5ECHB 4XHMA 3C73A 1E6BA 1KEBA 4OFNA 3UJ1A 2N5AA 3G7IA 1EGRA 3APSA 4WKWA 4RI7A 3RHCA 1H4OA 3DD3A 2RM6A 2X99A 3OR5A 1QK8A 4BVYA 2H0GA 2F51A 3GV1A 4ISDA 2ZNMA 3C1RA 3GRXA 1V2AA 1SKWB 1UN2A 2HZEA 2HE3A 2H6ZA 4Q5FA 1A8LA 2J23A 1U6TA 4HQZA 2DSAA 5ECQB 5ECKB 4QL7A 4X1UA 2V6KA 4TKYA 3IAS2 3NOFA 3HD5A 5ID2A 4QQ7A 4MH2A 3GFKA 1BAYA 2Z9SA 3ZMKA 1K0BA 3IPZA 3UVHA 3HXSA 1PGTA 4OFMA 1AXDA 2I4AA 9GSSA 3LFLA 4K1FA 2AYTA 2REMA 3KP8A 4DSRA 4MMMA 3C8EA 2HZEB 6GSWA 2PVOC 4JZQA 1OE7A 1GWCA 2F3MA 2G0FA 3PINA 1IYIA 1OKTA 2DLXA 5G1LA 3GHAA 1V58A 2ES7A 3TDGA 2L6CA 2XBQA 3CRTA 4IP1A 1OC9A 3TGZA 3CSIA 2VD1A 2GSQA 1QUWA 2HXKA 2YJHA 4G2EA 4MF5A 2AUVA 2B5XA 4KDYA 1EP7A 1ERVA 3E3EA 3WGXA 3MDKA 1SD8A 2K9FA 5ENUA 3KTLA 2B3SA 5JWRB 3VWXA 2VL2A 3LORA 2O85A 2IPAA 1SU9A 1U3IA 1C72A 4BWSA 3CTFA 4EKZA 3KEBA 3WYWA 4H86A 1YKAA 5DBQA 2HSYA 3P90A 4JE1A 1XWKA 5H5RA 3KGKA 3O3TA 1OC9B 3QCPA 4HI7A 1NHYA 1IYHA 1XOAA 4I5QA 3RHBA 3F6FA 4POBA 2DMMA 1WP0A 3F4SA 3GL5A 2CA8A 5GSSA 3WD6A 1MDIA 2QGVA 3F63A 1S3AA 5C04A 2P5QA 4I97A 2O87A 16GSA 5CO3A 2LQQA 3DKSA 1XFLA 4GXZA 2GGTA 4OCEA 3BBYA 1GRXA 4F9ZA 3US3A 2LJRA 1G0TA 1GSYA 4ZXGA 3IOSA 2R37A 2DC5A 4KE3A 3TOUA 2C0GA 1ZMAA 1FG4A 2IL3A 2QSIA 3VI7A 2NVLA 3FHKA 3AY8A 1GLQA 4AJ7A 4I2UA 1PKWA 2FWHA 4HZ4A 2PPTA 1ACVA 3ZTLA 5ECMB 1JLVA 3HCZA 1LBKA 1EEJA 2IMKA 2LRCA 1GP1A 3PR8A 3WGEA 1GL8A 3TJFA 4KCAA 4N10A 2QKEA 1QGVA 3F3QA 3M0FA 4TXVA 1JZOA 1F37A 3IK9A 2DJ1A 1SENA 3VLNA 4LL4B 4AJ8A 3TCOA 5C00A 1SL2B 1HNAA 13GSA 2X8HA 3KXOA 1SK0A 5G31A 4RI6A 5LCZA 3ERWA 3ZZXA 2GTUA 3IHQA 2OA7A 1OAZA 4NHWA 3ZIVA 3GKKA 4TR4A 1GTBA 2GT6A 4IW9A 1TP9A 4LA1A 2VLUA 3QAVA 2PN8A 3PH9A 4MPGA 4HJMA 5EL8A 3H93A 5HR1A 5JCWA 3Q18A 3G7JA 3DIEA 3R2QA 3HY2A 3GN3A 4YAVA 1V9WA 2DIZA 1LU4A 3EWLA 1XCCA 2JZRA 4KNDA 4K7IA 4IJIA 2B1LA 5DJLA 4ZILA 1EWXA 5D8IA 1F3BA 1A0RP 4NAXA 5ECOB 1Q4JA 1WWJA 4HQSA 1K0AA 5G30A 5D73A 1TRVA 4N30A 2BTOT 2IWTA 1YJ6A 4HU7A 4MLYA 4POLA 4X43A 2BMXA 2L5LA 1GSDA 1H75A 4MJEA 4MZBA 5KN3A 5CREA 22GSA 2WZ9A 1S3DA 2YWNA 3GTUA 1N8JA 2R5GA 5IOWA 2EIOA 4YQUA 2CVKA 4HZ2A 4OO4A 1ZL9A 5ELGA 1HNCA 1ERWA 3C1SA 3IBHA 2P31A 3EYTA 4IGJA 2IMDA 2VLTA 2FHEA 3TJJA 2KHPA 2YWOA 2DMLA 4ZB8A 1ST9A 3LQ7A 4XS1A 4EVMA 3CSHA 2LNSA 1Z6NA 1LJRA 1HYUA 3W6GA 3ERFA 2KUCA 1TU7A 1KNGA 3CYNA 3GTUB 2GDRA 1V98A 4IN0A 2MBSA 3DWVA 3M1GA 4V1Ap 3IE3A 2CAIA 4J57E 6GSSA 4RQXA 2B6MA 1XZOA 4NV2A 1GNEA 1X5DA 4V2LA 4P3YB 1YF1A 2L6DA 3ISOA 1DUGA 1VF3A 2LSTA 2C3NA 4K6XA 3M9KA 2FGXA 4MCUA 2CQ9A 1HQOA 3O76A 4BWQA 1Y6EA 4NHZA 4WF4A 3EMPA 1UA5A 3FEUA 1O8XA 3A2XA 4TXOA 5ELAA 3GURA 2P0GA 2XC2A 5HFGA 4GQFA 1YZXA 1MTCA 3GSSA 5CP1A 5F07A 3NIVA 3M9JA 4ZIJA 4KB3A 4E8EA 3HVVA 3FR3A 1F9MA 2LTKA 1SYXA 3FZ9A 5AGYA 2PMTA 2B5YA 4FIWA 1SKSB 2CVBA 3L9UA 3IRAA 1FB6A 2OADA 4MABA 4JEDA 1OE8A 4G19A 3P2AA 2OBKA 1T3BA 1USBA 5CRGA 5EY6A 4FYUA 3QDNA 3CMIA 1Z7RA 5ECSA 3ED3A 3SBCA 4TXOB 3A5WA 2VM1A 3HZ4A 1THOA 1B9XC 2CZ2A 3FRCA 2ALBA 5DJMA 1AQVA 1NSWA 4DVCA 5DALA 4BPYA 2PVQA 3D4MA 5KN2A 1M7TA 1RK4A 5D9TA 5F06A 2VOCA 4JR6A 3S9FA 5B8AA 1UVZA 4WR4A 5KEJA 4K0NA 2TIRA 1XW6A 4MPFA 1J0FA 1BQ7A 5HFIA 3LJRA 3HJMA 2K6VA 3FZAA 2FLSA 1R26A 5D9WA 4OCFA 2MMNA 4E8HA 1R4WA 3LWAA 4KUNA 2OBIA 2V1MA 5B6MA 3I69A 2LRTA 2YV9A 1THXA 5J9BA 2C0DA 2H73A 5FWGA 3UVTA 3F4TA 3EC3A 2GZYA 2VCWA 2H1BA 1G7EA 2FD3A 4PQIA 3L0HA 1GNWA 1XW9A 1X9MB 1Z6MA 5IQYA 1FAAA 4MF6A 5IO0A 2DBCA 1O8WA 2YCDA 5ECIB 2JSYA 5IMCA 1FHEA 5DALB 2EIQA 1PN9A 4FH8A 5D9VA 5A4WA 3TRXA 3HJOA 3ZIJA 2O89A 3FYGA 1PSQA 2NBSA 2GS3A 3L4NA 2NTOA 1O73A 1PRXA 3EE2A 1T00A 5FT3A 2N5FA 4PQHA 4MJCA 3H4KA 2YNXA 1OC8A 1JZWA 2LKUA 3TKQA 1G7OA 1SJZA 3TUEA 2B5EA 3LG6A 8GSSA 1VGLA 1U87A 4N11A 1M99A 2JSZA 5J4UA 2N5BA 1PQNA 2B7JA 2M46A 2V2GA 2XHFA 4OMVA 5ECLB 3H79A 17GSA 1SYRA 4TN8A 4HJ2A 4DEJA 5GSTA 3HJPA 1MD3A 3D6IA 1O7UA 4GTUA 4LMWA 4KDXA 2MZCA 1J9BA 3E0UA 1RQMA 4NXIA 5IO2A 4IVFA 4KA0A 3G9BA 3VWVA 5IMAA 3DVWA 19GSA 5IPHA 5G5EA 2DJKA 1NHOA 5AISA 3DMLA 2OE3A 1A0FA 4CDOA 2D2ZA 2E2MA 4ULXA 3HVXA 4X0XA 2LS5A 3KTBA 2L4CA 4MJBA 2JU5A 4J56E 4JBBA 2F9SA 4PGTA 5IMFA 2VCTA 3IXRA 3FY7A 3F6DA 2WFCA 4AJ6A 2CT6A 2QC7A 1VRSD 4JU5A 5ECPB 2HI7A 3EMXA 4MH3A 3PGTA 1VF1A 1XWBA 1M2BA 3VFIA 1PD21 2C1YA 2VCZA 2WRTA 1DE2A 1TW9A 3IR4A 1HD2A 2YANA 4HDEA 3LEFA 1O6JA 3SWLA 1SK1A 3RDWA 3GL3A 1ZGNA 2AV4A 3ME7A 3P8WA 1TK0B 2VL3A 1GSSA 2C0FA 4KSOA 3LXZA 1X5EA 5B6NA 1SJ6A 2V32A 2LV3A 3D0ZA 1GSEA 2H0HA 3TKSC 3EVIA 3ZL5A 4BL7A 3W8SA 2IMIA 4IKHA 2P5RA 5CAXA 4TVEA 5H5SA 1M2AA 1Y25A 2MMOA 4EUYA 2VUPA 4Q5QA 1BYEA 11GSA 1X9WB 1PKZA 1JZDA 4ID0A 2CX4A 4OO5A 3CXGA 1AIUA 5AIVA 2MMZA 6GSTA 2JZSA 2R4VA 4BA7A 5G1KA 1PL2A 1Z9HA 2YJ7A 4XCSA 3GKXA 3KZQA 2CAQA 4LL1B 3QMXA 2PU9C 2M72A 2JACA 1GUMA 4K2DA 1QQ2A 2GT5A 2I3YA 5CYYA 3N5OA 3VK9A 5DCGA 1SD9A 2PWJA 3LYKA 2K8VA 3UARA 5F8BA 1OC3A 4ECCA 4EF0A 4ECIA 2GQKA 2H76A 3F8UA 5B8BA 1I9DA 3A2WA 3KP9A 5INYA 4RQRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite