3MSZA

Crystal structure of glutaredoxin 1 from francisella tularensis complexed with cacodylate
Total Genus 23
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
23
sequence length
86
structure length
86
Chain Sequence
AMKVKIYTRNGCPYCVWAKQWFEENNIAFDETIIDDYAQRSKFYDEMNQSGKVIFPISTVPQIFIDDEHIGGFTELKANADKILNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Glutaredoxin 1 from Francisella tularensis Complexed with Cacodylate
rcsb
molecule keywords Glutaredoxin 1
molecule tags Oxidoreductase
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
total genus 23
structure length 86
sequence length 86
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3mszA00
4OFMA 5LCZA 5GAND 1NHOA 2H6XA 5J4UA 5J41A 4JRRA 2NPBA 2MMAA 3ZRDA 1WWJA 5D93A 2R2JA 5F07A 5IPHA 5H5RA 2P5QA 4ISDA 3D21A 3IE3A 4NV5A 3GIXA 14GSA 3RAZA 1AQVA 5B8BA 3KP8A 4V2LA 3L78A 2LNTA 4LL1B 2FA4A 2NBSA 3GTUB 1SD8A 1UA5A 4XS4B 3A3TA 1TRVA 5EY6A 1SKRB 4FYBA 3MSZA 2YJHA 4NXIA 1K0BA 2NVLA 2C0FA 4V1Ag 4XCSA 1XPVA 2HNLA 5L71A 3K8NA 2ZCTA 2K8VA 4XIHA 1PSQA 5HR2A 2OJLA 2YWIA 3UIWA 4ZL9A 3PH9A 5GAPD 1ZZYA 5IOWA 4LLRA 2CX3A 1WOUA 2FCHA 1I9DA 2H8LA 2E2MA 2EIOA 3GH9A 5IMVA 4RQXA 1TKDB 1GTUA 4ULXA 3N5OA 1U3IA 3WGEA 5INYA 3IV4A 2WS2A 5JCWA 2PU9C 2GT5A 3HCZA 1A0FA 2JZTA 3UL3A 4TR1B 1YKCA 5A4VA 1RW1A 4KX4A 3I43A 2PUKC 2LQOA 3EMXA 4QQ7A 3ZITA 3M8NA 3TOTA 2AAWA 5IO0A 1XW9A 1JZRA 5ECSA 1A24A 5LD0A 3QPMA 1BAYA 1TK8B 3DYRA 2DIZA 3Q18A 3I9V2 2RUFA 1NHYA 3DRNA 3LWAA 4GTUA 2IL3A 5B6NA 3GMFA 2DJ1A 3UBLA 3UVHA 3HZ4A 1GH2A 4POMA 5G1LA 3A2WA 2QC7A 5G5FA 1N2AA 7GSSA 2JSYA 5CO3A 4ZB6A 3WGXA 1TP9A 4F82A 2HT9A 2IJYA 1U6TA 1A2LA 1GUHA 1SJIA 4TW5A 1O8WA 1TW9A 3D22A 2R37A 3Q19A 4WEYA 1LU4A 2LJKA 4FYCA 4HZ2A 3CSJA 4MMMA 1GSYA 5ECQB 3HJMA 1VGLA 1B9YC 4MLYA 3RHBA 4ECBA 2V41A 4GQCA 1HQOA 3C8EA 2V1MA 4HDEA 2C0EA 1M2DA 3ZLPA 3GKKA 4IQ1A 3VK9A 5D9WA 1J08A 4GQFA 1K0NA 2C8UA 1J9BA 1K3LA 5HR3A 1DE1A 3ZYWA 2N5BA 3TKRA 5CNWA 1ABAA 1BEDA 1SYRA 2ZNMA 1TDIA 5EPFA 3F4RA 2AUVA 5ECLB 2VLUA 3I6AA 2WJUA 1TI3A 4ZILA 3DIEA 4AJ7A 2EIQA 2FGXA 3HD5A 1HYUA 4JEDA 3Q6OA 1PKWA 4MPFA 4AGSA 1A8YA 2XC2A 3GKNA 3EURA 1EZKA 4MJAA 4J2FA 5CRWA 3O3TA 5ECNB 4PXOA 1XW5A 2M72A 2MMZA 1K0MA 1PN9A 2H1GA 3ZIJA 4EUYA 2AJQB 5LNKe 1TI1A 2H74A 3FEUA 1XWBA 3NZNA 5JCUA 2LV3A 2E2GA 3L9UA 3HDCA 3TB2A 3GSTA 2XPDA 3GA4A 1MDIA 1GP1A 2CA8A 2O8VB 3IXRA 4OD7A 3QOUA 2H0HA 1YF1A 5C04A 2KP1A 1X5CA 1U3AA 2HI7A 5AIVA 3D6IA 3O6TA 1IYHA 2GZZA 1GTBA 2L6CA 4LMWA 5F8BA 2GSSA 3VWXA 2R3XA 4JR6A 1N8JA 1ERWA 2VAFA 4K2DA 1JLVA 2R5GA 3ZVJA 3ZTLA 4ZB9A 3IDVA 2QGVA 3CTFA 5A4WA 3H8QA 3HXSA 3TKSC 3CXGA 1JLWA 4IGJA 4V2MA 1O85A 4TR4A 3EINA 5KN2A 4MCUA 3IHQA 4WKWA 5EL8A 1QK8A 3H79A 2MMNA 6GSYA 4IN0A 2IFQA 2PPTA 4J56E 2DIYA 1URMA 2OE1A 3ZMKA 2GQMA 5DALA 3DD3A 1OAZA 1PX7A 3HHVA 2EIRA 2CX4A 1SKWB 1F2EA 5AIXA 5AN1A 2XPEA 2P31A 2CAQA 5D8IA 3CBUA 4ZBDA 4KE3A 4PQHA 4X43A 1XCCA 2CVDA 4O5RA 4V1Ap 2EC4A 1WIKA 1KBNA 4AF2A 4H86A 3TJKA 1WPIA 3LYKA 5J3RA 3FY7A 1H75A 4MP4A 5DAKB 2B5YA 2H71A 2KOKA 2IN3A 1F6MC 1UVZA 1VRSD 2GVPA 1VF1A 2YCDA 2B3SA 2IFQB 3H4KA 4N0VA 3G7JA 3ZL5A 4K1FA 1GLQA 2IMKA 2MBTA 3RDWA 3ME7A 1BJXA 4KDUA 3HY2A 1MTCA 1B9XC 3IR4A 1B8XA 5DALB 5FT3A 2DC5A 2DMMA 3LEFA 2YN1A 5KEJA 5AGYA 22GSA 4HQZA 4D73B 4IP1A 2JU5A 2X64A 4I5QA 1OKTA 1PX6A 5A5KA 2P5RA 4RUVA 1HNCA 3ZMLA 2KUCA 3ZZXA 4NMUA 2K8SA 16GSA 3NIVA 3KTBA 1Z9HA 4TR3A 4TXOA 4DEJA 1AAZA 2BTOT 1AQXA 2XBIA 4F03A 1YY7A 5G31A 2M80A 3G7YA 1GSDA 5C00A 3ISOA 2PVQA 2YZUA 4KAEA 1M7TA 1XXUA 2RM5A 4WF4A 5CREA 1NSWA 2G0FA 3UAPA 1X5EA 2B5EA 3GNJA 3C1SA 1AUCA 4RQRA 4K0GA 3VWWA 4WR4A 1ZOFA 3ERFA 5CRDA 2RM6A 2DJ3A 4OO5A 2WFCA 4GLTA 2K6VA 1ZYQB 3P2AA 4EDZA 4OCFA 4Q5QA 3GYKA 4ML1A 4K7OA 1QQ2A 4TOPA 3IA1A 1AW9A 3KD0A 3GTUA 4TXOB 2GDRA 2N5AA 1E6BA 5IMZA 2KP2A 4XS6A 4ECCA 2H72A 4TN8A 3M0FA 1O8XA 4KSOA 3AY8A 1SKSB 4MABA 2I81A 1K3OA 2B1KA 2LUSA 4MJCA 4ML6A 3VWVA 4IS0A 2LKUA 5CRGA 3LG6A 5JWQB 1V9WA 2H66A 1ZYEA 3LXZA 2YOIA 3APOA 2B7KA 3H1NA 1AQWA 1OYJA 3RBTA 4NAXA 4MK3A 3G9BA 4F0BA 2TRCP 2LRTA 4TR1A 2LNSA 2OA7A 2LTKA 2X8HA 1XOBA 2F8FA 3QAVA 2P0GA 1GSFA 4GRFA 1EV4A 2OE3A 3HJOA 2DLXA 3LYPA 3EYTA 2AB6A 3WYWA 2PBJA 3RHCA 3QFBC 2C3TA 2C4JA 1U88A 2ZUPA 3EC3A 4HOJA 3KCMA 3ME8A 1MDKA 5IMDA 2O85A 3FW2A 5GZZB 2NTOA 8GSSA 3CSIA 12GSA 1RK4A 3EU3A 5FHIA 1R5PA 5CP1A 1ON4A 3GKXA 2J9HA 5ECOB 2WCIA 2PVOC 4PQIA 2H1DA 4ZBAA 2IPAA 2DJ2A 2IMEA 4ZBBA 1GTIA 1FAAA 4E8HA 1TRSA 3TJBA 1YF0A 2QKEA 2PERA 1YJ6A 3CRTA 1G0TA 2JSZA 2RLIA 5CAXA 1ERTA 4ID0A 2KLXA 6GSSA 1GWCA 4JR4A 1EOGA 4QL9A 4ECJA 2RUEA 1ML6A 4MF5A 2OADA 1FVKA 3P90A 4ZB8A 2F9SA 3GHAA 2G2QA 4G9HA 4WBJA 4OFTA 3HZ8A 4HJ2A 3PR8A 4JZQA 3DEXA 2VD0A 4GWRA 2I1UA 1G7OA 2FY6A 4CW9A 2K18A 3CSHA 5GSTA 4KA0A 2H30A 3U5RE 4KDXA 1X0RA 4ECIA 4YQVA 2BMXA 4FYUA 1C72A 5G30A 4F2IA 1F37A 4JBBA 4IW9A 3SBCA 1EP7A 3ERGA 3IOSA 4HZ4A 4N10A 3EMPA 1EWXA 3QMXA 3KXOA 2C80A 5F06A 3EU4A 4XS1A 1GNWA 2LJAA 4O92A 4HU7A 5B8AA 3TKPA 2V6OA 3O76A 3LSZA 2VLVA 2WGRA 1FHEA 5DJLA 2KHPA 1Z5YE 4L5OA 3MNGA 2F3MA 1JZOA 2J23A 4ZXGA 3VI5A 2A4VA 4EXJA 3TUEA 2MYGA 1XW6A 2GZPA 1I5GA 1SL0B 1B48A 3MDKA 5IIZA 1QFNA 2H76A 2HYXA 4I2UA 5CYYA 5A4UA 2C0GA 1SL1B 3BBYA 4BWSA 5G1KA 3EE2A 1Z3EA 4DSSA 1FOVA 3LXTA 3A2VA 4MH2A 3J7Yb 1PMTA 1QMVA 1BG5A 2AV4A 2DJJA 4OMVA 2PMTA 1E2YA 3F9UA 4IJIA 3GL3A 2F51A 3FK8A 2VCVA 3QD9A 3VPTA 4IVFA 1TRUA 4BA7A 5D9XA 2H73A 2OBKA 1A0RP 2VCZA 2XBQA 3UVTA 4NHZA 3D0ZA 3BOAA 2L4QA 1GLPA 2YWMA 1BQ7A 2VCXA 3F4TA 4KNDA 3TCOA 3FHKA 1AIUA 2OACA 1W4VA 4DSSB 2BJXA 1FVJA 1SU9A 1UN2A 5IOXA 1Z7RA 4BL7A 1QXHA 2GSQA 2C0DA 3QFAC 3TKQA 3VURA 2JACA 3TJJA 2YP6A 2L59A 3D5JA 3VPQA 5B6MA 1JZWA 1TXXA 2FHEA 4N0ZA 1GSUA 2B5XA 3GH6A 3I69A 2FWGA 2VL2A 3FR9A 1OKDA 3TKSE 1DSBA 4KH7A 1V98A 4IP6A 3FZ5A 5HR0A 3GN3A 3L0HA 4EDYA 3OR5A 1NM3A 3VWUA 2FLSA 5JWOB 5DAKA 13GSA 2LS5A 5H5SA 1YZXA 2C3QA 5D96A 1LJRA 1SL2B 4I97A 3MAKA 4QL7A 1PRXA 1OC9A 3D4TA 5J9BA 2CZ3A 1YDKA 18GSA 3HJPA 3US3A 2CVBA 4N30A 5ECHB 2L6DA 3TOUA 4WF5A 4KDYA 3F3QA 1TJDA 3FRCA 4PGTA 1ST9A 2IWTA 2HFDA 3DMLA 4D73A 4P3YB 1TOFA 4MJEA 4TR0A 1S3DA 4YQMA 3H93A 3WD6A 2V32A 3CYNA 1K0CA 2IMDA 2H1AA 6GSXA 1F3BA 1VF4A 2CV4A 4K7NA 4Q5FA 4ILFA 3FYGA 1GRXA 1EV9A 4POBA 2X99A 1IYIA 5IMFA 1OC9B 2E0QA 1H4OA 2LRCA 4OO4A 4KCEA 1FG4A 1SJZA 1K0AA 5DVBA 1OE7A 5J9CA 3GX0A 2ON5A 2K9FA 4OFNA 1MD3A 5F0GA 2HSYA 2FD3A 1VF3A 1V57A 2WRTA 5DDLA 4F0CA 1XFLA 5F05A 4GSSA 4GSTA 4K7IA 1YQ1A 3M9KA 2C1YA 1T1VA 4YQUA 3DGQA 4WR5A 3FZ4A 4PUFC 2V6KA 3JCML 4DVCA 2C3NA 3GFKA 4RI6A 1V2AA 2FNOA 1S3CA 1MEKA 3GV1A 2FWFA 1O81A 3UBKA 1TTZA 3UEMA 2IMIA 3ZFBA 3IAM2 2FA8A 3F0IA 4MPGA 2H19A 2HSHA 3LFLA 3F6FA 3E3EA 1GSSA 1F3AA 3E9JB 3KH9A 4X0XA 6GSUA 1T4YA 9GSSA 3PINA 4BVYA 4BVXA 4GXZA 1XZOA 2F8AA 1XWGA 2OE0A 2FWEA 2D2ZA 3IK9A 1PA3A 4G19A 1QGVA 1CQHA 4MZBA 4YAPA 4EC0A 2PWJA 1M9AA 4OWYA 1O6JA 3M3MA 1HD2A 1PKZA 1PL1A 2I3YA 3HA9A 3KIJA 4GF0A 1GULA 2HZEB 4PNGA 2B6MA 2H6ZA 3F63A 1AC1A 1T8EB 3DVXA 1X9WB 4TKYA 5B7CA 5KN0A 1LBKA 4NPBA 4LL4B 2GLRA 3DXBA 3M9JA 4WBRD 4IJ3A 1O7UA 3GSSA 2RIIA 1PQNA 3ED3A 1XVWA 1OC8A 1SJ6A 2HZFA 1GSEA 4YH2A 2LRNA 2CAIA 1HNBA 1K3YA 2I9HA 1S3AA 1R4WA 3W8JA 3IK7A 3FZAA 5CRHA 3N9JA 4MZWA 1O73A 1UC7A 1MD4A 3HVVA 2H70A 2GS3A 1F9MA 3ERWA 1BYEA 3BJ5A 2VD1A 3FR6A 4KGIA 1KTEA 3WT2A 4XTSA 4FO5A 4X1UA 3F4SA 4MF6A 2VLTA 4KB3A 1V40A 2YV7A 4XHMA 3KEBA 5HQPA 3EWLA 3HKRA 5IM9A 2O7KA 2R4VA 2ON7A 4CDOA 4TRXA 2DJ0A 4POKA 4PUAA 1ZGNA 3QDNA 3L4NA 3BD2A 20GSA 3S9FA 3U6VA 3D4MA 3FKFA 1JZDA 2L4CA 2GZYA 1XIYA 2MMOA 4KW6A 1WJKA 1V58A 2JZSA 3IC4A 4F9ZA 2YWOA 5ID2A 2GSRA 1G6YA 1WRYA 1ILOA 1SYXA 5DQSA 2A2RA 5IPGA 4K9ZA 3VI7A 2REMA 1XBSA 3APQA 4XRDA 1SD9A 3A2XA 2A2SA 5COHA 2YJ7A 3PGTA 1EGOA 1FO5A 5IO2A 5HFIA 1GSQA 2IMFA 2GTUA 4WXTA 3QCPA 4CHSA 5ECRB 3TRPA 3VFIA 5ECKB 2VL3A 4G2EA 2DSAA 2OBIA 5GSSA 3KGKA 2MZCA 2YNXA 4PQ1A 5HFKA 1AXDA 5DCGA 4GCIA 1USBA 3A5WA 1X5DA 3ZVJD 3TJGA 3M1GA 5ID2B 2GGTA 3TRXA 3CTGA 4WETA 3HYPA 3UOMA 4MA9A 3DVWA 4MF7A 3GRXA 1MDJA 2H1BA 3FR3A 2FWHA 5JCGA 2AYTA 4G10A 1THXA 1XWKA 3KTLA 3MWHA 1A8LA 2JADA 2WB9A 3TRQA 1BX9A 5IQYA 1YEPA 2M46A 2HRNA 3KJYA 4LMVA 1NW2A 1PGTA 5DJMA 3DWVA 2ES7A 2O87A 4HJMA 2VL2C 4NHWA 2LEGA 3IAS2 4HQSA 4Z7XA 4FH8A 2X8CA 2H01A 1CQGA 5D9TA 2B1LA 2VM1A 1GL8A 3C1RA 3P8WA 3L9VA 3QAWA 4OCEA 3W8SA 1X9SB 2Z9SA 4EO3A 2DJKA 1EEJA 4LA1A 3APSA 2QSIA 2YV9A 2PGTA 3ZFLA 5J5NA 1Z6MA 1TK0B 4NWYA 3ZREA 1K0DA 5ECPB 4NV2A 3G7IA 5HFGA 2V2GA 3WT1A 3QAGA 1EOHA 1GUKA 2WZ9A 5DBQA 4O7HA 2AHEA 3R2QA 1M99A 4Q5RA 1DUGA 1ZMAA 1Q98A 4K8MA 2YANA 1R5AA 4PX1A 3KMOA 4MH3A 1TRWA 4E8EA 1ACVA 2LJRA 4XRAA 5ABRA 1HNAA 5EVOA 3IBHA 4HU9A 2H0GA 3TJFA 2LSTA 1FB0A 1DBYA 4EE0A 2HXKA 3J7Yk 3GL5A 3GUSA 1YEXA 1YKAA 2H6YA 3UMAA 4PURA 5IMAA 2TIRA 5E4WA 2VM2A 17GSA 3KP9A 5DQYA 4DSRA 1JFUA 3IRAA 5DCHA 1GUMA 3IPZA 4GSNA 5ECMB 1TK5B 3F8UA 5ELAA 1X9MB 4IHUA 4HEA2 1FB6A 3GKMA 4L5LA 3BCKA 3UJ1A 4EL1A 2CZ2A 1Q4JA 1R26A 4O32A 3F3RA 2OKAA 4MJBA 2N5FA 4ZL8A 4L0UA 1B4QA 1RQMA 4L0WA 1OVNA 6GSWA 3HVXA 4IKHA 1XVQA 1TU7A 3CRUA 5IMCA 4DSQA 1ERVA 1M2BA 1PD21 1PL2A 4EVMA 6GSTA 1W89A 2FUG2 3KMNA 4AJ6A 1T4ZA 4JU5A 2HRFA 3GURA 2GQLA 1G6WA 5HR1A 3ZIVA 1WE0A 1B4PA 2IIYA 3L9SA 4N11A 3NOFA 2WULA 3C7MA 3RPPA 1GTAA 2VL9A 2CVKA 2L5OA 3FZ9A 4MDCA 11GSA 1DE2A 2E7PA 4KSMA 2MBSA 2DBCA 1Z7PA 1Y6EA 2L57A 2WDUA 2VIMA 2I4AA 1U87A 1WMJA 2JZRA 2VUPA 2LQQA 5ENUA 3Q74A 3TGZA 1J0FA 5D9VA 2YPMA 3LJRA 5KN3A 2GQKA 3HVSA 4KCAA 1SK0A 4K6XA 1K0OA 5G2ZA 1Z6NA 1QUWA 2PN8A 5AISA 4HI7A 4I8BA 1EGRA 4BWQA 4IELA 1TU8A 1A23A 4EKZA 2H0IA 2L5LA 3KH7A 1ZCPA 2R6KA 3TDGA 1M0UA 2YZHA 19GSA 1XWAA 1KEBA 1XOAA 3KM6A 5ELGA 1T00A 1WP0A 2VCTA 3LORA 4RI7A 2XHFA 2GT6A 5JWRB 3GX8A 5G5EA 5FWGA 2VO4A 2NDOA 4J57E 4HS1A 3VLNA 3F6DA 4K0NA 3BCIA 3KZQA 6GSVA 4HUAA 2X8GA 2HE3A 1A2JA 1G7EA 1SK1A 5ECIB 3SWLA 3C73A 3WGDA 3LGCA 3DKSA 1T7PB 1M9BA 3E0UA 4MZCA 4JE1A 1GNEA 10GSA 2HZEA 3V1WA 1FW1A 1ZL9A 1JHBA 3P7XA 3CMIA 3EVIA 2YWNA 4ZL7A 4POLA 3QR6A 1R7HA 2VCQA 3LQ7A 2H75A 4V2NA 4I2TA 2B7JA 3RPNA 4IBPA 2HLSA 4FIWA 4BPYA 1SENA 3TKSA 5E59A 2GSTA 4Q5NA 2VCWA 4YAVA 4L8EA 5KN1A 1A2MA 1XWCA 1THOA 5D73A 4I6XA 4ZIJA 3W6GA 1M2AA 4EF0A 3C71A 1Y25A 4AJ8A 5H5QA 2TRXA 1OE8A 4IQAA 2JL4A 4ACSA 2ALBA 1T3BA 2CT6A 1OC3A 4PNFA 4XS4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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