3MXFA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with the inhibitor jq1
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Cell cycle
source organism Homo sapiens
publication title Selective inhibition of BET bromodomains.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3mxfA01
2L5EA 4O7BA 5ENHA 4YBTA 5DX4A 5IGLA 4O78A 4KV1A 3S92A 5FE9A 2OSSA 5D3SA 5DKHA 5CUEA 4QB3A 5A83A 4KCXA 5LKZA 2DATA 1JSPB 5KTXA 5KTUA 2L84A 3SVHA 4BHWA 5DBMA 3P1CA 2DVVA 3S91A 3AQAA 4LC2A 4IR6A 3LQIA 3LXJA 4IR5A 3UV4A 2DWWA 4NYWA 4QNSA 4XYAA 4J3IA 1X0JA 4A9KA 4QEUA 5DKDA 5EISA 4LZRA 3P1DA 5D7XA 4ZW1A 4XUAA 4PKLA 4CUTA 4CURA 4CLBA 5DYUA 5E3DA 4YYDA 5TCMA 3JVMA 4YYIA 4QUTA 5D3TA 4LYWA 5CFWA 3U5OA 4BW1A 4WIVA 5EV9A 4ALGA 4MR5A 3IU6A 4BW2A 5DYCA 5EICA 4QSXA 2DKWA 5BT4A 5IBNA 3U5PA 5HM0A 2YDWA 5CU8A 4LZSA 4YK0A 4YY6A 3MB4A 3MQMA 4IOOA 5DW2A 5CPEA 5FE1A 2L85A 2NXBA 4UIYA 2YYNA 4J0SA 4MR3A 5KO4A 3LQHA 4YAXA 5IIDA 5DYAA 2G4AA 2I7KA 4E96A 4LDFA 5EA1A 4F3IA 2WP2A 5L8UA 3HMEA 5A85A 5CQ3A 3U5MA 5AD3A 5D0CA 3IU5A 5C7NA 4PTBA 3LQJA 4QSSA 4NR4A 5E9YA 4J1PA 5CUBA 5CUCA 4Z1QA 5CQ5A 3I3JA 5F63A 4YYHA 4O7FA 4TU6A 4C66A 4UYGA 5KHMA 5ENBA 5H1UA 2WP1A 2RO1A 5F60A 5HQ6A 5LJ2A 4MR6A 5D3HA 4A9EA 4DONA 5DLZA 4YYJA 5HQ5A 5IGKA 4UIXA 4ALHA 3U5NA 4Y03A 4ZQLA 4LR6A 5CRMA 5FBXA 4TT2A 5I7XA 5A5PA 5LVRA 2E7NA 2MJVB 4PCEA 4QC1A 4QSQA 5BT5A 4O7AA 4YY4A 5C85A 5II1A 4QSRA 3FKMX 5LKUA 2DVSA 5G4SA 5FB1A 5F1HA 5A5RA 4YYKA 3MULA 4YBMA 1WUGA 2N9GA 4YYGA 5EWWA 4WHWA 5CY9A 5HLSA 2E7OA 4BW4A 2DVRA 4UYDA 5D3RA 4CFLA 5CQ6A 5DFBA 5I1QA 3K2JA 4N4IA 5HRWA 5F3AA 5E74A 4YH3A 4HXPA 5HRXA 5EPBA 5F62A 5DFCA 4A9IA 2D9EA 4QR4A 4UYFA 2KTBB 2RNWA 5L98A 3P1EA 5EM3A 3O34A 2YEKA 5C8GA 4TYLA 5ETDA 4NS5A 5HRVA 4O72A 5CUGA 3JVLA 4O71A 4HBXA 5EWVA 4PS5A 4QSVA 4J0RA 4YYMA 5I86A 5DY7A 5F25A 4Z1SA 4PCIA 4A9NA 5FH7A 3UV2A 5E9MA 5I88A 4Z93A 5EU1A 4Z6HA 5FFWA 5FB0A 4HXNA 5CQ4A 1WUMA 5FH8A 3SVGA 2R0YA 3QZTA 4XY8A 4LRGA 5EPSA 5ENFA 3UVXA 5AMFA 4NR8A 4NUCA 4RVRA 4XY9A 4YC9A 3G0JA 2I8NA 5LKTA 4QUUA 5HFQA 4A9HA 5EP7A 4A9OA 4N4FA 4X2IA 2R10A 5HEMA 4QR3A 4N4GA 5EQ1A 4QR5A 5I29A 3ZYUA 4XUBA 2FSAA 4QSWA 4NYXA 4OUFA 4YH4A 1E6IA 4O77A 3UV5A 4LYIA 4TS8A 5CS8A 4NRBA 4O76A 2OO1A 4UIVA 4CL9A 5I80A 4N3WA 5A82A 4NRCA 4TQNA 5A5QA 5FE8A 4CUUA 4HBVA 5D25A 4A9FA 5ENCA 3O33A 5FE6A 4O7EA 5FDZA 3O37A 4QSTA 2DVQA 2RFJA 5D3JA 4Q0OA 3JVJA 4MEOA 3MUKA 4HXSA 4FLPA 5IG6A 4HXLA 5D24A 5EI4A 4O70A 4QBMA 5L99A 4PY6A 5IGMA 4TT6A 5G4RA 3TLPA 2YELA 5EWDA 5AMEA 4QSUA 5I89A 3GG3A 5D26A 5F36A 3HMFA 4QYLA 2YEMA 4NXJA 4QY4A 2F6JA 4HXRA 5D3LA 2YW5A 5FH6A 5H85A 4O75A 4IR4A 5DYXA 3SVFA 5DW1A 5L97A 1F68A 3DWYA 3UW9A 5II2A 5ENGA 5EPRA 5CUAA 4NQMA 5CP5A 4UYEA 5LJ0A 2E3KA 5E9KA 5EGUA 5TB6A 2R0SA 5E9VA 5C4QA 3P5OA 5CGPA 4QYDA 5F61A 4UIWA 4YADA 3QZSA 4CUSA 4QEWA 4WHUA 5EK9A 5FE0A 5E0RA 4HBWA 4OGIA 4YYNA 5I83A 4MEQA 4C67A 5ENJA 5L8TA 4HBYA 5D3PA 5ETBA 2RNYA 5LJ1A 4TTEA 5CQ8A 3UVDA 5CQAA 2D82A 4NR5A 5JWMA 3LJWA 4NYVA 4QEVA 5I40A 3JVKA 5HCLA 4NR9A 4HXOA 4NR6A 5FE4A 3G0LA 5DKCA 4O7CA 5CQTA 2YQDA 5E73A 3Q2FA 4Z6IA 3UVWA 5F1LA 3UVYA 5FG4A 3U5JA 4A9JA 3MXFA 5E9LA 5CZGA 5F5ZA 4LZ2A 5H1TA 5KU3A 4Q0NA 4GPJA 4KV4A 5EWHA 5FG5A 5DFDA 5HQ7A 3MB3A 4A9LA 4TT4A 2GRCA 4TU4A 4MEPA 4HXMA 4AKNA 4MENA 4A9MA 5FFYA 4BW3A 5J0DA 3Q2EA 2H60A 4ZC9A 3AADA 5A5NA 4TZ2A 2R0VA 5A5OA 5HELA 5CQ7A 3RCWA 4MR4A 3O36A 4OGJA 5FG6A 1EQFA 5BT3A 4YBSA 5HENA 3D7CA 5IGNA 5EWCA 4CFKA 1ZS5A 4NUEA 5F2PA 5KTWA 5LUUA 5CUDA 5DLXA 5LVQA 5K29A 2OUOA 5E7DA 5C87A 5FE3A 1N72A 3DAIA 4IR3A 5ENEA 5EVAA 4YATA 4QC3A 5CTLA 5FE5A 5C89A 4NQNA 4UITA 4O74A 4N4HA 4CUPA 5FE2A 5L96A 5HJCA 3HMHA 4CUQA 3U5LA 3ONIA 5A7CA 1JM4B 5HFRA 3QZVA 5E3GA 5FE7A 4IOQA 4QZSA 4TZ8A 5ENIA 5D3NA 2RI7A 5COIA 4YABA 3P1FA 4NR7A 2LSPB 5AD2A 5I7YA 3O35A 4UYHA 2F6NA 4QSPA 4UIZA 4HXKA 5FFVA 4IORA 5ACYA 5A5SA 4UIUA 5H1VA 4LYSA 4NRAA 2RNXA 5E9IA 2RS9B 4NUDA 5A81A 4BJXA 3U5KA 3NXBA 5JI8A 4UYFB 5LKXA 5CRZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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