3MXMA

Trex1 3' exonuclease v201d aicardi-goutieres syndrome mutant
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
229
structure length
226
Chain Sequence
LPHGHMQTLIFLDLEATGLPSSRPEVTELCLLAVHRRALENTSISQGHPPPVPRPPRVVDKLSLCIAPGKACSPGASEITGLSKAELEVQGRQRFDDNLAILLRAFLQRQPQPCCLVAHNGDRYDFPLLQTELARLSTPSPLDGTFCVDSIAALKALEQASSPGSRKSYSLGSIYTRLYWQAPTDSHTAEGDDLTLLSICQWKPQALLQWVDEHARPFSTVKPMYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Three prime repair exonuclease 1
publication title X-ray Crystal Structures of TREX1 3' Exonuclease Autoimmune Disease Mutants
rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Hydrolase/dna
total genus 77
structure length 226
sequence length 229
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.11.2: Exodeoxyribonuclease III.
pdb deposition date 2010-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3mxmA01
3LPUA 1SL2A 3MEGA 4NYFA 4AHUA 4H4OA 1VSFA 1NOZA 3MECA 1D5AA 3K57A 3L8BA 4CJRA 4M3UA 4B8AB 3IS9A 2IS3A 1IKXA 1BHLA 2D5RA 4Z4CA 5C25A 4BDZA 2OZSA 4H4MA 4KV8A 3SJJA 2HMIA 3RWUA 3HYFA 3AO1A 3S3NA 3TANA 2B5JA 3HSTB 1C0TA 4KKOA 1TKXA 2VWJA 1BCMA 4F3OA 2HHVA 4KAZA 1VSIA 1KCFA 3LP3A 3L2VA 4DU4A 1Z25A 2ZD1A 3SQ2A 3QEXA 4DMNA 4RW7A 4HTUA 1NJZA 1TK0A 1TGOA 3AVMA 2G8FA 4AHCA 4EP5A 3VQ8A 1IO2A 3HK2A 4OPKA 1HYZA 3RMDA 4OKKA 2EHGA 3DOLA 4EP4A 1VRTA 4N5SA 1IKWA 3DRSA 2P5OA 3AVGA 4LD0A 4FXDA 1NJWA 2HHTA 3EZ5A 1L3UA 3AVNA 3NF7A 1WSGA 5J2MA 4LY7A 1CLQA 1D9FA 4HCCA 3FFIA 4Y1DA 3HVTA 3OS0A 1NJYA 4DF4A 3TAMA 1S1VA 3OVNA 4O0JA 4CJTA 5J1EA 1BQNA 4E7HA 3RMCA 2QKBA 1ASVA 3HP6A 1IKVA 1CXUA 2FBXA 2YHAA 3WNHA 4DSEA 3TABA 1SV5A 1WSJA 1SKRA 1ZBIA 1JLQA 3PX6A 4OLAA 4PA1A 5CYMA 4I9LA 1X1PA 2P1JA 3L2WA 3NF6A 4F8RA 1RBTA 3ZSZA 4E3SA 3K5NA 1RT6A 3KK1A 2PZSA 4B9UA 4Q0BA 2HHUA 3KKRA 4JS5A 5DMRA 3RMAA 1SL0A 4L8RB 1LW2A 3KLGA 1WLJA 4KB1A 3O3HA 2Z1IA 1S5JA 4CFCA 4FJLA 5FROA 4NCGA 3T19A 1N5YA 3O3FA 4W5OA 4CF9A 4Y1CA 4CF8A 2OPPA 4FK4A 4FLZA 1J54A 1FK9A 5FDLA 1HQEA 1RTDA 1IG9A 1UA0A 1U45A 4JLHA 4OGEA 4FYDA 4DTOA 1VSMA 3HPHA 3T1AA 3AVJA 4GVMA 4FK2A 5SZTA 1RTIA 4BWMA 4M3ZA 1N6QA 4CEQA 4YNQA 1KVBA 3HPOA 4CEEA 3KJVA 2RKIA 4RG8A 3TAGA 1RTHA 3DRRA 4NYNA 2KQ2A 4CHQA 4J2DA 1DTQA 4C8KA 4Z4FA 4Z0UA 4B9TA 1LAVA 3ZSXA 1C0MA 4FJIA 4DTNA 2DTUA 4CJEA 1BISA 3L2RA 4O0IA 3SZ2A 3P83D 4O4GA 4JRQA 2XY8A 3AVIA 4FJ8A 3LP0A 3NFAA 4FW2A 1RDDA 4M45A 1WAJA 4I2PA 4Q5VA 3PX0A 2BDPA 4CEBA 3QEVA 1HPZA 4DLEA 4GW6A 4CJQA 4KHWA 3SI6A 4RW8A 2XHBA 1ZBHA 3KKSA 3ZSQA 1GOBA 3TAFA 2WOMA 3TAQA 4E7KA 1WSEA 3ISNC 3VQ7A 3M8QA 4KFBA 1S9GA 1G15A 4CJFA 1XHXA 4KPYA 2YKNA 2G8HA 3D0PA 3IRXA 4HHTA 4IFYA 3OS1A 3V1RA 3PO4A 1WSIA 4C8MA 1BIUA 3TR8A 3TI0A 2PYLA 4OGCA 1O1WA 1BL3A 1U04A 2BANA 3O4QA 4FM2A 3V9WA 1KVAA 2GV9A 5J2PA 3I0RA 2ZE2A 4OKEA 3SQ0A 4QCLA 4BWJA 1ASWA 3DLBA 5KGXA 1NKBA 2O4IA 1TL1A 3CFOA 4LSLA 3KK3A 4FM1A 4FLUA 3V9UA 3QNOA 2X74A 1KLNA 1BCOA 1T7PA 4FLWA 1J5OA 1EKEA 1CZBA 2VG7A 4DU1A 3VQQA 4B9MA 1BI4B 1S6QA 4CHZA 1YVUA 4TSXA 3NH0A 4GMJB 4Z4HA 2OPRA 2RN2A 1VSKA 2YKMA 3CFRA 4Z4GA 3LAMA 3NGIA 1LW0A 3VQAA 2XY5A 1S1UA 3OYBA 4KHYA 2HVIA 1NJXA 4CGGA 4W5QA 1HMVA 3CQ8A 3K5LA 4K8ZA 4FJNA 3QEWA 4DTJA 1LWCA 3K5MA 4KREA 1BQMA 3HP9A 4KB0A 1NOYA 3M8PA 4KTWA 1R0AA 1CXQA 4LH5A 3NH2A 4CEAA 1TK5A 4FJJA 4DFJA 1X9SA 3NAEA 2ITGA 4CHPA 2HHSA 3HJFA 5JS1A 2VWKA 2G8IA 1C1BA 4FW1A 4DSKA 1I3AA 3OYMA 1TAUA 2O4GA 3F9KA 3LWLA 1XWLA 4B9VA 5T7BA 1B92A 3MEDA 2RPIA 1F21A 2BE2A 1RCHA 4R5PA 4HUFA 3HL8A 4WE1A 4AHSA 4JRPA 1UAXA 4DTUA 4FZYA 3IG1A 5CYQA 3K5OA 4IBNA 4RW4A 4AHRA 1RDBA 4CGDA 3THVA 4CCHA 2OPQA 2BGGA 1RDAA 3NE6A 4I9QA 4DFKA 1Q8IA 1SL1A 4KHNA 5HBMA 2YNHA 1D8YA 3KLHA 1ZBLA 2X6SA 3ZT1A 3MXJA 1ZBFA 2Y1JA 3ZSRA 4CIEA 3OYKA 3V81A 1RNHA 3DRPA 1EX4A 2WONA 3K2PA 4KRFA 1C1AA 5HRSA 3SUNA 3V6DA 3RR8A 4LH4A 1RT4A 3AVBA 3OYDA 4C8NA 3HXMA 2E4LA 4F2SA 4CK2A 1I39A 4J2BA 3RMBA 4FZZA 1QE1A 2Z1GA 4ICLA 2G8UA 2D0CA 2E6LA 4CK3A 4LSNA 4CGHA 4JS4A 2Y1IA 2PYJA 3KLIA 4N56A 1U47A 4CJVA 2KFNA 3NDKA 1RBVA 4IG3A 3AVLA 1LWEA 3ULDA 1S1TA 4FM0A 4DSFA 1EETA 1WAFA 4FLVA 4BDPA 3HM9A 3DLRA 5JS2A 5KRTA 4KHSA 2B4JA 4KI4A 3F73A 3LZIA 4KO0A 4CJ5A 4OKJA 3QEPA 3OYGA 4RW6A 3DM2A 3LANA 3DOKA 3DMJA 1KFSA 4F3TA 3C6TA 4CHOA 4CJKA 4FLYA 3RRHA 2FC0A 3LAKA 3SUOA 1YTAA 3CM6A 1QSSA 4C8OA 1JLEA 2HNDA 3ZT0A 2AJQA 2IGIA 3HVRA 3ZT2A 4B08A 3DLGA 4N41A 1TKZA 2I5JA 2F8TA 4M3WA 1IKYA 1NK4A 2Q3SA 2YV0X 3ZT3A 4E7LA 4DQSA 2OZMA 4MQ3A 3SYZA 3O3GA 2IAJA 1T03A 4IDKA 4B3OA 4DQIA 4HUEA 4FJ9A 3C94A 1S9EA 4IFVA 5CZ1A 2W42A 1U49A 2KZZA 1DTTA 3ZSWA 2XRIA 3OYNA 3S3OA 3KTQA 4F4KA 3NHGA 3C95A 1KTQA 3G10A 4CJSA 3OYJA 3AA4A 3S9HA 1RILA 4XIUA 1RT1A 4CEZA 1KSPA 4DSLA 3AO5A 4CGFA 3SPYA 5HRPA 5HROA 3SCXA 4FJKA 4RW9A 4W5RA 4BE2A 3TARA 1JKHA 2ATQA 4NCBA 1KRPA 3O4NA 4E0DA 3PX4A 4KI6A 1VRUA 1WSFA 2X78A 3IAYA 3QNNA 4CGIA 1X9WA 1X9MA 1YT3A 1A5XA 2KTQA 3A2FA 4DU3A 3VQ6A 4KTZA 3QLHA 3K58A 2HW3A 3KK2A 3NH1A 3BDPA 3V1QA 4CEDA 3TAEA 4G1QA 1HRHA 3I8DA 1JLBA 2D0BA 3UIQA 1BGXT 1TKDA 4E7IA 4CK1A 4FZXC 4DQPA 4FJXA 3CG7A 2NUBA 4DF8A 3P1GA 4HUGA 3U6FA 3I0SA 4H8KA 1VK0A 3ASMA 3VQCA 4DQQA 4M42A 4CERA 3DI6A 1W0HA 1FXXA 3AO2A 4FJ7A 4F2RA 2E6MA 3SV4A 4DTRA 3ZCMA 3AA3A 3LALA 2IC3A 3AO4A 3H08A 3ZSVA 2DFHA 3AVCA 4DTXA 5C24A 1BIZA 2JLEA 4M3YA 1GOAA 3DYAA 4CHNA 4ID5A 4M3RA 4NCAA 3PUFA 4ZTJA 1ZYQA 4OJRA 3AA5X 3VQEA 3QEIA 4CFBA 5J2QA 2PY5A 4I2QA 5CY4A 4E1NA 1TK8A 3LP1A 1C6VA 1VSLA 3NGYA 3V1OA 3OJSA 3KLEA 1BI4A 2G8WA 3LWMA 3KIOA 2YNFA 3CYMA 4UQGA 3V4IA 1VSDA 4N76A 4ZHRA 4QAGA 3S3MA 3MEEA 1A5VA 3NF9A 2X6NA 3DLHA 3U3GA 3VQ5A 3C6UA 3ALYA 1XHZA 2HHQA 1J9AA 1NKEA 2LSNA 4CECA 5KTQA 1JLGA 3M8SA 2HNYA 4MFBA 4FJ5A 2KZMA 4OPJA 3QO9A 3VQBA 1QQCA 4QOZB 3AVKA 1L5UA 2FBVA 3MXIA 1C0UA 1U48A 1KLMA 3OJUA 1HQUA 1TL3A 1TAQA 4CE9A 4YFUA 1EP4A 3NF8A 1RT2A 3L3VA 3L2QA 1SKSA 3E01A 4BE1A 4B9LA 3QINA 4DG1A 4DS5A 3VA0A 4B8CA 1QSYA 2G8KA 5HRRA 3QESA 1SKWA 3LZJA 3WNFA 4CFDA 2P5GA 2EX3A 1YTUA 4E89A 1RT3A 4CF2A 1KVCA 4O5BA 1W9HA 3ZT4A 1QSLA 1A5WA 4CF1A 5HRNA 5I42A 4DS4A 3MAQA 4ELVA 3B6PA 3CM5A 4CJ3A 2XY7A 2P51A 2IDOA 4FLXA 2JGUA 4AHTA 3QIOA 2FBYA 3EY1A 2HVHA 2Z1JA 1NK8A 2OA8A 1RBRA 3VQ9A 3OS2A 4W5TA 1JL2A 4CEFA 3OYAA 1QS4A 4DLGA 3U3YA 1SUQA 5I3UA 4J2EA 5FRNA 2DFEA 4Z4EA 3RRGA 2D0AA 3NBPA 1ASUA 2YNGA 4KTQA 4HCBA 1NK6A 4KHUA 5C42A 4BACA 1JLFA 4K8XA 3AVHA 3V9ZA 4EZ6A 3WNGA 1Q9YA 2VG5A 3OYCA 3VQDA 4ID1A 4CJLA 4O55A 4Z4IA 3TWHA 3HO1A 3NCIA 2Z1HA 1LWFA 1HNVA 2FBTA 1ZBUA 2YHBA 4FK0A 3P5JA 3PV8A 5HLFA 4CJUA 4J2AA 4PQUA 5DK5A 1J53A 1L3VA 3KD1E 2KW4A 4M41A 4O44A 4CJPA 5E41A 3TAPA 2IOCA 2XO7A 3LDSA 1D9DA 3L2UA 4CIFA 1JL1A 3KLFA 3V9SA 1ITGA 1VSHA 4OVLA 3VQ4A 3VQPA 4B9SA 1NK0A 1EXQA 1L3TA 4DTSA 1L3SA 3SQ4A 1XC9A 5HP1A 3PY8A 2G8VA 1B9DA 4CGJA 1UWBA 3T3FA 3DLKA 1RTJA 4CJWA 1JXEA 4FCYA 1WNSA 4FVMA 4DSIA 1HNIA 2DY4A 1RBSA 5CZ2A 5SWMA 1B9FA 3SUQA 4DWIA 1RT5A 2F96A 1Q9XA 2QKKA 1WSHA 1S1WA 1TV6A 4W5NA 3AVAA 4M3XA 1KFDA 4ZTFA 2YNIA 4DTMA 3MXMA 4FJGA 4OLBA 2DFFA 1FKOA 1CZ9A 4FJMA 3QERA 4BE0A 1LAWA 4PWDA 2ZQBA 3DLEA 4I7FA 3EYZA 3OYFA 4IG0A 4N47A 1REVA 2GUIA 4DQRA 1U4BA 3RR7A 1WN7A 3AA2A 3SV3A 2HB5A 3KD5E 1GOCA 3D45A 2ETJA 2QK9A 1K6YA 5KRSA 3JSMA 1LV5A 5EU7A 3OYHA 3AV9A 1RBUA 1QTMA 3VA3A 4B9NA 1HYVA 3RTVA 3CFPA 3VN5A 3G0ZA 4C8LA 3LPTA 3WNEA 4FJHA 5KGWA 3SUPA 2KFZA 4DFPA 1MU2A 4CESA 5KI6A 5J2NA 2OYQA 1Y97A 3SPZA 1FKPA 3OYEA 1NK5A 2QXFA 1NKCA 4ELTA 3LP2A 4E1MA 4ELUA 4CHYA 4DFMA 2HNZA 4AHVA 4CF0A 1JLAA 1JLCA 4EZ9A 4AH9A 2A1RA 3M8RA 4E19A 4DSJA 3PO5A 1VSJA 3HT3A 1S1XA 3ZSOA 1NK7A 4IKFA 1C1CA 1IH7A 1RDCA 2RF2A 3SNNA 2HHXA 4BDYA 3BGRA 3SQ1A 4CFAA 4AILC 1NK9A 1T8EA 1S6PA 4CIGA 5D3GA 2B6AA 3OY9A 5K14A 1UA1A 1XI1A 1DLOA 4HVJA 1JXBA 3JYTA 1QHTA 2OPSA 3QETA 3ITHA 3OYIA 4KHQA 4CJ4A 1VSEA 3L3UA 2R7YA 3AO3A 1HYSA 3HPGA 3QIPA 1RT7A 3V9XA 2XY6A 2F8SA 2A1SA 2VG6A 3ZSYA 3NGZA 4DTPA 4PUOA 3OYLA 3K59A 1T05A 5FRMA 3B6OA 1UOCA 4CEOA 1TKTA 2HHWA 4M3TA 1TVRA 4PY5A 4FLTA 4E7JA 1HJRA 3AVFA 1Z26A 2GBZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LPUA 2ZGYA 3MEGA 3PLAA 4AHUA 1YUWA 4H0PA 3IS9A 5C25A 3RWUA 1EWQA 1OH6A 4BY9C 2ZJQL 4KKOA 3C7NA 1BCMA 5B8HA 2HHVA 4KAZA 5BPLA 3LP3A 3ENHA 3CI5A 4XH4A 2ZD1A 4DMNA 4HTUA 2EWSA 1GLCG 4BRIA 3WXLA 4DR3K 2JWLA 2G8FA 4EP5A 3HOSA 5M1QA 4NXNK 1HYZA 1VRTA 1IKWA 4LD0A 1NJWA 3CETA 3EZ5A 3AVNA 4A5AA 3CC7N 4JKGB 3OS0A 5CE3A 5FPEA 3TAMA 2E2OA 1N32K 3OVNA 4O0JA 5J1EA 1YJNN 5EOYA 1CXUA 3WNHA 3J7ZO 1SV5A 3O9SA 4BREA 3PX6A 3C0BA 3D2EB 3L2WA 3NF6A 2WTUA 3ZSZA 2HHUA 5TKWA 2Z1IA 2GWKA 2P9KA 4JN4A 3M6GA 4BQZA 5LJVA 4Y1CA 5FDLA 1HNZK 3A5LC 3HPHA 3VENA 5KPRA 4YNQA 3T1HK 4CEEA 5C2FA 2RKIA 3MDQA 5AQMA 3H1VX 4NYNA 4J2DA 2IIRA 1C0MA 2HOEA 4CJEA 1BISA 1SQKA 3P83D 4JRQA 2XY8A 2QWPA 5AZJB 1RDDA 3R8EA 4I2PA 4Q5VA 4FVUA 4DLEA 1QQOA 4A61A 4A2AA 4BC3A 5BN8A 1QHAA 3TAQA 1XUPO 2P9SB 4KFBA 1G15A 4KPYA 1XHXA 3QFPA 4IFYA 3OS1A 4KH6A 3PO4A 1BIUA 2PYLA 5JMVA 3O4QA 3V9WA 1NJYA 5BN9A 1VAZA 3GDQA 4QCLA 3A5MC 1NKBA 1TL1A 4LSLA 3KK3A 4YHHK 3VF4A 1BCOA 1T7PA 3A5OC 4FLWA 3A5NC 1EKEA 3O08A 3OW2M 1V4TA 1BI4B 3E9LA 4OPAA 4TSXA 1SZ2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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