3MXMA

Trex1 3' exonuclease v201d aicardi-goutieres syndrome mutant
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
229
structure length
226
Chain Sequence
b'LPHGHMQTLIFLDLEATGLPSSRPEVTELCLLAVHRRALENTSISQGHPPPVPRPPRVVDKLSLCIAPGKACSPGASEITGLSKAELEVQGRQRFDDNLAILLRAFLQRQPQPCCLVAHNGDRYDFPLLQTELARLSTPSPLDGTFCVDSIAALKALEQASSPGSRKSYSLGSIYTRLYWQAPTDSHTAEGDDLTLLSICQWKPQALLQWVDEHARPFSTVKPMYG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Three prime repair exonuclease 1
publication title X-ray Crystal Structures of TREX1 3' Exonuclease Autoimmune Disease Mutants
rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Hydrolase/dna
total genus 77
structure length 226
sequence length 229
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.11.2: Exodeoxyribonuclease III.
pdb deposition date 2010-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3mxmA01
3IS9A 1YT3A 2D0BA 4C8NA 2HHUA 1Q8IA 4HUFA 2XO7A 1RT4A 2OZSA 4M42A 1S1TA 2IGIA 4GMJB 3THVA 4BE1A 4FJXA 1BI4B 3SI6A 2G8IA 1HQEA 4FLTA 4CEOA 3SQ1A 5HLFA 3HXMA 2YNGA 3P1GA 3AO3A 1KRPA 4O4GA 4OJRA 3OYMA 4KHQA 1NK8A 1QTMA 4CJSA 3QLHA 2QKBA 2O4GA 2P51A 2YKNA 5D3GA 3RMCA 4FJ5A 4CHPA 5SZTA 4DU3A 3QEXA 3DRPA 2GV9A 1IKYA 1ITGA 3TWHA 3V9WA 4ZTJA 1SL2A 3KTQA 4RG8A 4DFKA 1VSJA 1C1AA 1KVAA 3WNEA 1LW2A 1YTAA 4CECA 3TAFA 3K5MA 1HJRA 4O44A 3ZSRA 1WAJA 3OYJA 4LH4A 4RW9A 3K59A 4OKKA 4AHUA 1ZBLA 5I3UA 2RKIA 2D0AA 4AHRA 2E6LA 2ZE2A 4ID1A 5CYQA 1RBSA 3VQPA 3MXJA 4E7KA 5HRSA 1B92A 1RDAA 1U49A 4CEEA 1HRHA 3D0PA 5J2PA 5I42A 5HROA 1KLMA 4HUGA 3LWLA 3SQ2A 1JL1A 1XC9A 4IBNA 1HPZA 4B8AB 4FJHA 4FLVA 4W5TA 4BACA 4E7HA 1RDBA 3VQDA 4DSFA 4KI4A 3OJSA 5CZ2A 3ISNC 3AO1A 4B9NA 3RWUA 1LWCA 4I9QA 3NCIA 1EXQA 1JXBA 4E89A 2DY4A 1ZBUA 4H8KA 4CHOA 4EP4A 3NGZA 3CYMA 3EYZA 3TANA 1S6PA 1W0HA 2ZQBA 3K5OA 5KGWA 4CJUA 1QSYA 3VA0A 4FLZA 2YNFA 4DSIA 4CFDA 3ZSZA 4J2EA 3C94A 4ID5A 4DMNA 4C8MA 1JLAA 1BIUA 1I3AA 4N47A 1FK9A 4CJLA 3OYAA 1WAFA 3S9HA 4BE2A 3NF7A 1U47A 4ELTA 1RTJA 4N56A 1J54A 3SUQA 1T03A 4CJ5A 1WSEA 3L2UA 3CFPA 3V9SA 2PY5A 4M3WA 3LWMA 2XHBA 4OKJA 1ZYQA 2LSNA 2YKMA 1IKVA 3I0RA 4CEAA 4YFUA 1SKSA 1NKEA 4FYDA 2VG5A 2VG7A 3H08A 4Z4HA 3KD5E 1YVUA 2DTUA 1ASUA 4GW6A 5JS1A 1TAUA 1HQUA 1HYZA 4FM0A 4FLUA 1TK5A 4KHYA 3DOLA 4E7IA 4J2DA 3VQ7A 1NK6A 3DYAA 4DU1A 3RR8A 1RBTA 4BDYA 3K58A 2HVIA 3OYKA 3HPGA 4E7JA 4J2AA 4M3UA 1QHTA 4LSLA 4KHNA 1Z26A 4Y1DA 3V1QA 3WNHA 1C1BA 1NOYA 2BANA 1UWBA 1U04A 1RTDA 4E3SA 4B9VA 5DK5A 1BI4A 3M8QA 1T8EA 3IG1A 3VQBA 3SUNA 2HMIA 4M3TA 3OYEA 3AVJA 2KZZA 4CGGA 3AA5X 3MAQA 1KFSA 1C1CA 3DMJA 1YTUA 4JS5A 4DS5A 4CGHA 3DRSA 3PY8A 1XHXA 3PUFA 3PO4A 5FRNA 4FZZA 4FK2A 1L3UA 1RDDA 1HMVA 1RT7A 1C0MA 4Z4EA 4HUEA 5E41A 2WOMA 4CIEA 1L3SA 1A5XA 2XRIA 4DSJA 4I2QA 4M3ZA 3B6PA 5FDLA 3CQ8A 1XI1A 2ATQA 4H4OA 4O55A 1J5OA 3RMDA 3PO5A 4OLAA 1NKBA 2HB5A 3AVGA 2XY5A 4FJLA 1TL1A 3OYCA 4KO0A 3HM9A 2HW3A 3DRRA 4I9LA 3V9ZA 3NF8A 3KLEA 4KI6A 2BGGA 2HNYA 4IG3A 4KV8A 4NYFA 3LP0A 4CK1A 1SL0A 2O4IA 2JLEA 4OGCA 3KKSA 3NBPA 3KLFA 3DI6A 4KRFA 4YNQA 1BGXT 4M45A 3VA3A 3S3OA 3TAMA 4Z4CA 2R7YA 1IKXA 3CG7A 4TSXA 3LZJA 1RT2A 3HP9A 2WONA 2ETJA 3ZT2A 4DFMA 4DLGA 3NAEA 1BL3A 3C6UA 3LP1A 2A1RA 3VN5A 1RT3A 3ZSQA 1RBRA 4HHTA 3SPZA 2D0CA 1O1WA 3ZT1A 4E0DA 1I39A 4OKEA 4F3TA 3AVNA 4FJ7A 4C8KA 3AV9A 1JLFA 3DLHA 2DFEA 1UA1A 4O5BA 2QK9A 3T19A 4OVLA 4CJFA 2BDPA 1KTQA 1HYVA 3TAQA 4Y1CA 4CGFA 4DSKA 3OYBA 5KTQA 3SCXA 1JL2A 4KAZA 4LSNA 2P1JA 1U45A 4AHVA 4RW4A 5J2QA 3BGRA 1HNIA 4NCAA 4KHWA 3SZ2A 4N5SA 2Z1IA 1UAXA 4B8CA 1NK4A 3HYFA 3NE6A 3L2WA 4ZHRA 4DTNA 5KGXA 4DQQA 1BCOA 1Q9XA 3OYFA 3CFRA 1KVBA 3DM2A 1LAWA 4W5QA 4N76A 1FXXA 1L5UA 1VSHA 4CCHA 5HRPA 2GUIA 3AVHA 4JRPA 1WSFA 5KRTA 3V4IA 1QSLA 3RMBA 1JLEA 1VK0A 1VSLA 3K57A 4AHSA 1C0TA 4FJGA 4Z4FA 1VSEA 1DTTA 2IOCA 4CERA 3QEVA 3LAMA 3ZT4A 4H4MA 3DLRA 4CF0A 3O3FA 5J2NA 4FJMA 3MEEA 4CJTA 4OGEA 3EZ5A 3V9UA 2XY6A 1SKWA 1J53A 4FXDA 3U3GA 5CZ1A 4I7FA 4G1QA 2KTQA 1TAQA 4ELUA 1KFDA 3L2VA 1WSIA 3LZIA 2F8SA 4IFVA 5C25A 1IO2A 4BWMA 4DTXA 3MXMA 3SUPA 4RW6A 3I8DA 3K5LA 3SQ4A 4PY5A 1NOZA 4MFBA 5C42A 4CEDA 3T3FA 1BISA 1S1WA 2Y1IA 1WLJA 1BQNA 2PYJA 4KB0A 3NGYA 3V81A 1FKPA 4DQIA 3OYLA 4CJQA 4J2BA 4M3XA 2HNZA 4CJKA 4DS4A 3QEWA 3HVTA 3HVRA 1KCFA 2HHWA 4CE9A 3TABA 1RT5A 4BWJA 4HVJA 3HPOA 4BE0A 3VQ6A 3O4QA 2B5JA 4O0IA 4AILC 1X9SA 4IKFA 1WSGA 1XWLA 3VQ9A 2DFFA 2OPRA 3NDKA 4RW8A 3LP3A 1TGOA 4Q5VA 3OYDA 2EHGA 2G8WA 1TK8A 4OLBA 2G8HA 4E19A 1VSKA 2YV0X 3I0SA 3NH0A 4FCYA 1CLQA 1SV5A 1VSDA 4KKOA 3RRGA 3VQ4A 1Y97A 3PX6A 1L3TA 4FJNA 4KREA 1L3VA 3HL8A 3K5NA 4JRQA 1SUQA 3VQ5A 2W42A 1VSFA 5SWMA 3RMAA 2BE2A 2EX3A 4M41A 1LAVA 4F3OA 4DQRA 1BHLA 3ZSXA 3C6TA 4BDPA 5KRSA 4DQSA 4NYNA 1S1XA 2QXFA 4FM1A 1NJZA 3AVBA 3EY1A 5J2MA 1VRUA 4ICLA 1JLGA 1RILA 3QNNA 1DLOA 3ZSVA 3AO4A 4DF8A 3WNFA 2PYLA 1K6YA 1VSIA 1T05A 1EETA 4CJ3A 2ITGA 3IAYA 2G8KA 4KPYA 2VWJA 4AHTA 1SKRA 3M8PA 3E01A 3HJFA 3LAKA 2DFHA 1FKOA 4F2SA 3ASMA 3TAEA 2Z1JA 2F8TA 3NH2A 4CJVA 1ZBHA 1RT6A 3LP2A 3ZSYA 4QOZB 4XIUA 4QCLA 4C8LA 4JLHA 4CEFA 2P5OA 2KZMA 3L3UA 3CFOA 2RN2A 4E7LA 4KFBA 3T1AA 3SUOA 2OA8A 4B9SA 3UIQA 2HHSA 3CM6A 3ZSWA 3VQAA 2Y1JA 4Z0UA 1T7PA 4UQGA 5HRRA 4FJ8A 5HP1A 3OYNA 3SV3A 4DTRA 4CF8A 4DWIA 3MEGA 1D9DA 4CF1A 1EX4A 3TR8A 2P5GA 4PUOA 2OPSA 5FRMA 1ASVA 4FK0A 4M3YA 5C24A 3VQCA 4CIGA 4K8ZA 4CEZA 2AJQA 2RPIA 3B6OA 2G8FA 2G8UA 1S5JA 4R5PA 5EU7A 1Z25A 1NK0A 1ZBFA 3G10A 1G15A 1BQMA 3KK3A 4CJRA 3HO1A 4IFYA 4DG1A 3HT3A 3V9XA 3AO2A 4DTSA 3MEDA 4EP5A 2XY8A 4DTUA 3JSMA 4EZ6A 3KJVA 2FBYA 3JYTA 1DTQA 2VWKA 4DTJA 1KSPA 4CK3A 4DTPA 4FVMA 3OYGA 1TK0A 5CY4A 4FM2A 1TKDA 2YNHA 4F4KA 2E4LA 3AVCA 1S9EA 3KIOA 4AH9A 3ULDA 3AVLA 4FJJA 2OPQA 4DLEA 1REVA 1QE1A 5HRNA 4B9UA 3S3MA 1NK5A 1EP4A 1JKHA 4FW1A 3KK2A 4CHYA 3L8BA 4IDKA 3M8RA 1LV5A 4HCCA 3QERA 3DLEA 4DSEA 1JXEA 1VSMA 4CESA 4B9LA 1QSSA 4PWDA 4CEBA 4WE1A 5CYMA 4DTMA 2QKKA 1TKZA 3D45A 3C95A 3S3NA 4JS4A 2Z1GA 4Z4GA 1N6QA 4FJ9A 5JS2A 3OYHA 3U6FA 4CHQA 3OS1A 3SV4A 3HSTB 1LW0A 2A1SA 3AA3A 3QO9A 3OY9A 1CXQA 3SJJA 2XY7A 3NFAA 1D5AA 1WNSA 2NUBA 3ZT0A 3HK2A 2B4JA 4BDZA 4CGDA 1TVRA 2KFNA 1NJYA 3RR7A 4CFBA 3CM5A 4NCGA 1ZBIA 1A5VA 1BIZA 3FFIA 4CGJA 3IRXA 1GOAA 2YHAA 4B9TA 3NHGA 4DSLA 2KW4A 3QETA 3DLBA 1S9GA 1D9FA 3RTVA 4O0JA 3P83D 3SNNA 4KHSA 1KVCA 3RRHA 4L8RB 4LY7A 2Z1HA 3AA2A 2YNIA 4DFJA 1UA0A 5KI6A 4EZ9A 3VQ8A 1QS4A 2X6SA 3F73A 1C0UA 3KKRA 4OPJA 4KHUA 1CZ9A 1X1PA 3K2PA 4IG0A 1N5YA 2IC3A 3AO5A 3ZCMA 2D5RA 4B9MA 3OS0A 3ZSOA 2ZD1A 1UOCA 1NJXA 4CHZA 1GOCA 4HCBA 4FLYA 4FLXA 3HPHA 4W5OA 2HHVA 1QQCA 3OVNA 4E1NA 2OYQA 1B9DA 3SPYA 4W5NA 5J1EA 1VRTA 1RCHA 4DU4A 2X78A 2YHBA 1X9WA 3TI0A 3DOKA 4F8RA 1A5WA 4LH5A 2HVHA 3ITHA 3PX4A 1W9HA 3DLGA 3KK1A 3LDSA 3MXIA 4CJWA 1ASWA 2OPPA 3QIOA 4PQUA 2IDOA 3KLIA 5DMRA 3LANA 5FROA 2IAJA 4CF9A 4CFCA 3OJUA 4AHCA 4FJKA 3BDPA 4GVMA 3NF9A 4E1MA 3OS2A 1CZBA 3MECA 4DTOA 4Q0BA 4HTUA 1WSHA 1C6VA 2B6AA 2G8VA 3PV8A 3QESA 2IS3A 2HHXA 1MU2A 3SYZA 5HBMA 1TKXA 3AA4A 2PZSA 3O4NA 1GOBA 1HYSA 3QEPA 3O3GA 4KTZA 1RT1A 3NF6A 4CK2A 4KTWA 4NCBA 3L2RA 3LALA 4N41A 4PA1A 2KFZA 1JLBA 3QEIA 2E6MA 1NK9A 3VQEA 1U4BA 4ELVA 1HNVA 3LPUA 3HP6A 1EKEA 1F21A 4I2PA 4Z4IA 4CEQA 4CGIA 1S6QA 5T7BA 5K14A 1LWEA 1BCMA 2I5JA 4CJEA 4OPKA 1SL1A 4ZTFA 1RBVA 2OZMA 3NH1A 2HNDA 1WN7A 1JLQA 3KLGA 2HHTA 2Q3SA 2X74A 4CFAA 4DF4A 1U48A 1X9MA 1TL3A 3AVFA 3F9KA 3V1RA 1S1VA 3TARA 3KLHA 1NKCA 4FK4A 1IH7A 1TKTA 2VG6A 2X6NA 1J9AA 2GBZA 1JLCA 2FBXA 3WNGA 3V1OA 3G0ZA 4CIFA 4B08A 3O3HA 2FBVA 4CJ4A 3TAPA 4KTQA 4FJIA 3AVAA 3AVKA 3KD1E 4RW7A 3AVMA 4FLWA 3SQ0A 1NJWA 4QAGA 3OYIA 2FC0A 1RTHA 3L2QA 1B9FA 1LWFA 1RDCA 4DFPA 4KB1A 3QIPA 3QNOA 3A2FA 3AVIA 4M3RA 1RNHA 2HHQA 4W5RA 3M8SA 1Q9YA 2JGUA 3ZT3A 3TAGA 1RTIA 3NGIA 4DQPA 3LPTA 1NK7A 1IKWA 2FBTA 4K8XA 1IG9A 3PX0A 3L3VA 1S1UA 1TV6A 3DLKA 1CXUA 4FW2A 4FZXC 1KLNA 4C8OA 4F2RA 1RBUA 3P5JA 1D8YA 4B3OA 3ALYA 4CHNA 3U3YA 1R0AA 2F96A 1XHZA 1WSJA 4CJPA 3QINA 3V6DA 2RF2A 2KQ2A 4LD0A 4MQ3A 4FZYA 3VQQA 4CF2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MDUB 2ZF5O 1YT3A 4H5VA 3P38A 4HUFA 2XO7A 1RT4A 2OZSA 3SMSA 2IGIA 4GMJB 1BI4B 3CJ9A 2O8CA 1KRPA 4FO0A 4FOEA 3OYMA 1NK8A 4NLCA 3QLHA 1VQLN 2HOEA 3RMCA 1T44A 1SAZA 4DV3K 1ITGA 1IBLK 1ATRA 1SL2A 3KTQA 4RG8A 4O8KA 4CECA 1YTAA 1IBMK 1BUPA 4LH4A 4RW9A 4FWRA 4AHUA 4FWOA 1S22A 2YJFA 4ID1A 1RBSA 3VQPA 4B3TK 4E7KA 4HWIA 1B92A 2JWLA 4CEEA 4A57A 1K8KA 3D0PA 2P9NA 5HROA 2QWMA 1JL1A 1QZ6A 4IBNA 4E7HA 4B1XB 2Q0UA 4BQLA 5F1XA 4WQ5C 4B9NA 1XMQK 2OCEA 4E89A 2DY4A 4BG8A 3KWIA 2FF6A 3NGZA 1S6PA 1W0HA 3K5OA 3CJCA 4BG9A 1QSYA 4CZIA 4JKEA 4DSIA 3ZSZA 4C8MA 3OYAA 2GX9A 4ELTA 4BR9A 1RTJA 1J54A 2P9SA 3V9SA 3L2UA 4IFEA 4OKJA 3MWTA 4CEAA 1NKEA 4FYDA 3U8XA 1O13A 1GLLO 2YHXA 2VG5A 4H0OA 3H08A 1NGBA 3KD5E 1ASUA 4MLHA 4BRNA 3ZEUB 4J2DA 4I6MA 3G71N 4BRLA 2P9KA 1OH8A 3I8BA 4JI5K 3OYKA 1QHTA 1RTDA 2UXCK 4E3SA 5DK5A 3KK7A 3IG1A 3AVJA 2KZZA 5C12A 4DUYK 3DRSA 3PO4A 3TPQA 1L3UA 1RDDA 3M1FA 1C0MA 3OBWA 4HUEA 5E41A 2O8DB 3MK6A 4CIEA 5F2RA 4DSJA 5FDLA 5AZIB 2I7NA 2QWQA 4H4OA 3MMVA 1NKBA 2HB5A 4KO0A 3HM9A 3W0LA 4AM6A 4I9LA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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