3N19B

Xena - reduced
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
359
structure length
359
Chain Sequence
SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas putida
publication title Determinants of substrate binding and protonation in the flavoenzyme xenobiotic reductase A
pubmed doi rcsb
molecule keywords Xenobiotic reductase A
total genus 120
structure length 359
sequence length 359
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2010-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3n19B00
3P80A 4Q33A 5HJLA 1AW5A 4RXGA 5D2VA 1TPWA 1LOQA 4J9JA 3W1MA 3UQNA 4KWVA 4XKYB 3O6YX 4O10A 1OABA 3FOKA 4ONVA 1H1ZA 3NAVA 1O4UA 4NNAA 3TA6A 1GVOA 4E0CA 1OK6A 3NPWA 3O07A 1PCWA 4M7TA 2OT0A 4BI5A 4E2DA 1RZMA 3M7WA 2GPTA 4OHQA 4A3UA 1WXJA 3CWOX 4WX2A 4NQ1A 1CW2A 2E6AA 4UXDA 3TJLA 2G96A 2W79A 3ZFHA 1SW7A 1Z41A 1OX5A 1XBXA 3AO0A 5EY5A 3LCGA 4BFAA 1PVNA 3L5LA 2TPSA 3GXNA 2A85A 5D2WA 3IGSA 3AJXA 4NVTA 3NA8A 3RFAA 3WK1A 2NV1A 2ZQ0A 4UFJA 3LTYA 5LNRA 2V2DA 1QDSA 3W7KA 4O28A 3C4UA 1NSJA 4MZ1A 1MZHA 2WV8A 2FJKA 3NPXA 1KM2A 4GC4A 4JS3A 4O11A 5K7JA 1WBJA 2C1HA 5SWUA 1DJQA 1UB3A 3W2MA 4O1CA 3S5YA 1FDJA 3W7QA 3W74A 1KLZA 4GUGA 3TROA 5HWMA 3L0KA 4IWWA 1ZJIA 5T26A 5ABTA 6ALDA 4X2RA 4FNUA 4ZQRA 2VFGA 3N2XA 3NQVA 3UWWA 3HOJA 1VHNA 3E0IA 3TH6A 1A50A 5LGZA 3IRDA 4AWUA 3STGA 1H7RA 3RMJA 2YZRA 1QMLA 2F7FA 1AL8A 2E1DA 1UUOA 3IGXA 4WOZA 3N9RA 3BPWA 3PUOA 3W71A 3SGZA 5H2ZA 4FX6M 1M7PA 4JXCA 1G4PA 3M6YA 3W2LA 3FA5A 3LCHA 5G2WA 2LLEA 3KRZA 3P7YA 3T78A 1QPRA 1K8ZA 2QCDA 2QUVA 1GG0A 3QPYA 4CLMA 1F6PA 2WPBA 4LTSA 1DOSA 1GT8A 2ZBTA 4LUJA 3PUDA 3L21A 2DJXA 3R8RA 3I65A 3W73A 1VRDA 1I8JA 1VZWA 5C55A 1W3IA 2A0NA 4DEFA 2R14A 4N02A 3LRLA 4UFHA 3VFLA 3ZWSA 4DXVA 3T44A 5A5WA 4Z1CA 1LBMA 2XN0A 4Z08A 3HPXA 1FWNA 1G67A 3UWVA 4XBSA 2CZFA 3GLCA 2DORA 3FEMA 3HF3A 2F84A 4UNKA 3V75A 2Q8LA 3C8FA 4JDYA 3ZWTA 1Y0EA 5HMSA 5K9XA 3PBUA 3EXSA 3LDVA 5G4EA 3BLFA 1LRNA 3O63A 2H3BA 1EX5A 3ABRA 1S3HA 4Y6GA 1OVDA 3QRHA 4YMZA 1VYSX 4JGDA 5F4SA 2Q8ZA 3TSMA 1OX4B 1VR6A 2I14A 1QOPA 3CT7A 5AHNA 3SW6A 5LNWA 3P5ZA 2YFNA 1ZHAA 3L65A 3E49A 2YFOA 1VCFA 2V9DA 1YTEA 4JTUA 4R7JA 4NT0A 3W1RA 1UBSA 1TREA 1F05A 1SPQA 1M7OA 4LT9A 2VENA 4JY9A 2WSRA 4Z0SA 4RX0A 3MP5A 5FF4A 5KMYA 2FPTA 2VFHA 4BK9A 3CM4A 3G1AA 3NEVA 1QR7A 4O4WA 2B7QA 1A5BA 2FQIA 3IVUA 3LXCA 1VCVA 1K02A 3LHZA 5K2ZA 3M5XA 3B4UA 4I7UA 2PCQA 1TJPA 4UR8A 3GX9A 3GXPA 4LS0A 1K7XA 3BW4A 3EX2A 2Z1BA 2TRSA 4MY1A 1B3OA 3NQAA 4RKAA 2I1OA 3HG2A 3A24A 2BWGA 4OV9A 4GWEA 4Z1DA 3THQA 3NQCA 4RV8A 1CX9A 1XDLA 3FYPA 1FWRA 3PB0A 5F4WA 4GJ1A 1KM4A 4O1AA 3RNDA 1SZFA 3CPRA 3S6DA 3DH7A 3PSWA 4O50A 2CLFA 1JCXA 2D73A 5D09A 2CLKA 4ADSA 3NQ6A 3L0NA 1EP3A 4CCEA 1SW3A 4UTJA 4M5PA 3HGOA 1LOSA 1C29A 1XBYA 2GQ8A 5BOOA 3H55A 1XC4A 2ZZ3A 4AEOA 3MJYA 3PG9A 5CSRA 3CIWA 5F2IA 1A5CA 5G2HA 1NFBA 4WD0A 1EEPA 3KVJA 3S5ZA 4LU0A 1J2WA 2RDUA 1SR9A 5IM51 3THAA 5LNUA 4RZ4A 5CZ0A 3PY2A 4JX4A 3DU0A 1JVNA 5K9CA 1G69A 4FNSA 4QJ1A 8TIMA 2RHGA 3GNNA 3U6WA 3CLMA 1K03A 4JDBA 5DY2A 1DJNA 3WJYA 1R2SA 4E2BA 2BZNA 3M41A 1X7FA 2X1SA 1ZFJA 5HULA 1TPDA 5DY3A 3TKFA 4AWSA 3EKZA 4JTFA 4AAJA 1HTIA 1Q6RA 2J9YA 3W70A 3TDFA 5G2IA 3OA3A 1VYRA 3T4CA 5L9FA 2ZZ5A 3NGJA 3NM1A 1BWKA 1FXQA 1Z44A 3INPA 2FPYA 3BGJA 3C0JA 1ZNNA 4NJGA 4I7VA 3NYZA 1HFBA 3MYPA 1O94A 1FQ0A 3IIVA 2ZRZA 5KTLA 5HR6A 3CQ0A 1QNVA 1DORA 3UXDA 2A7PA 5CZSA 3G0XA 1XUZA 4HSNA 4O8RA 2WJZA 3QMSA 4IX0A 5G5IA 3VE9A 1THFD 1QO2A 2ABAA 2WO5A 1T8XA 5FF3A 4BWLC 1ME9A 1H7OA 3BO9A 2JKAA 2ZRXA 2A6NA 2QCGA 3W87A 4DBDA 3KHJA 3W2JA 3B05A 2A2IA 3NNTA 4K37A 4MZYA 3LTSA 2Y70A 4EOUA 3EB2A 4WY0F 3P82A 4LRSA 4WJEA 1HG3A 3KXQA 5D03A 1TPEA 1TPFA 2QAPA 3SECA 1YADA 1JUBA 1GYNA 3NL2A 3OVPA 5K3VA 3NL5A 1G6CA 1LROA 1F7BA 1Q6QA 2E5BA 1G7VA 1WOAA 3OIXA 3W9ZA 3LHWA 3G1FA 4GNJA 5DBUA 4OU1A 2P0OA 1SSGA 4JTIA 1SZGA 4PODA 3L67A 3NZRA 4PH6A 3QSRA 4JTTA 1JRCA 1VQTA 4NZJA 4BWLA 3HO8A 4NUWA 3DENA 4L4LA 3W76A 1R30A 1H62A 3S1UA 1U83A 2B4GA 3S9YA 3UY8A 3DFOA 1FWWA 1GQNA 1F73A 2UV8G 2FLIA 1KTNA 4O1BA 1SO3A 3A9IA 5DCEA 2ZRWA 4QISA 3TXZA 1LBLA 3N3MA 3UY7A 3QJAA 3G1XA 3G1SA 4JTGA 2NLIA 4AHQA 4GUJA 3UWQA 3MI6A 2BLEA 2OMAA 5LHFA 1DHPA 5HUOA 3MMTA 3TE9A 4KWWA 5HWNA 5F1VA 2NXIA 3VE7A 3O16A 4OGZA 7TIMA 3B0PA 4FIRA 3NQ7A 4UMBA 3UYCA 4PEKA 1FX6A 4U4MA 3JS3A 2BX7A 4UR7A 2NX1A 5EA9A 1KFLA 1GWJA 2CLMA 5D2YA 1GOXA 1QPQA 1WV2A 3GDRA 3M44A 1G7UA 2C14A 2GQ9A 4Y90A 5BW6A 1IXOA 3GDLA 3S5OA 2Y89A 3OVQA 2OZ0A 1XM3A 4OE7A 5LHEA 1SSDA 1GPWA 2VEIA 2YDAA 1A5SA 4IMDA 4ZQNA 3L9CA 4NNBA 5DN1A 2J24A 3G1YA 3M1ZA 1W5NA 5FF7A 2ISSA 1SU5A 4FNTA 3G8RA 3LB0A 1RQBA 2G97A 5C6MA 1VCGA 3O6DA 2KZHA 2GJNA 1XI3A 4L4MA 3BLIA 4IUOA 1EP2A 4AHPA 4K6AA 3NXFA 4WZHA 3R89A 1XCFA 3C6CA 2ZZ4A 1EB3A 4FB7A 1XUUA 3O1NA 5C2XA 4IMFA 3W1LA 4HNUA 3TR2A 3NOEA 1Q6LA 3NO5A 2VXNA 2Y6ZA 3C61A 3STFA 4CCCA 5FEPA 1VGAA 4LVDA 2OCZA 5LZLA 1NF7A 4JYEA 2CLEA 4OQVA 2H90A 3FJLA 2X1TA 1OFPA 1TO3A 4RR4A 2G5WA 3DHDA 3N2MA 3LCLA 5I3JA 1J5TA 3IIXA 2JGQA 1ALDA 3WJZA 1QAPA 1LBFA 2E09A 4MFDA 1EP1A 1KM5A 1TPC1 3S0CA 3NQDA 2Y7GA 1OF6A 1N8FA 3QH2A 3W7DA 4AMAA 3EWZA 2QCMA 4S1FA 3TQ0A 3TXVA 1JCMP 1F74A 2A5HA 2JKPA 5G1TA 1JRBA 4JTKA 2NUYA 1OFOA 3TFXA 2ZTKA 1F5ZA 2W0UA 4UMAA 3BW3A 4FO4A 1RPXA 3DKJA 3MI2A 3UNDA 4LC8A 3LV5A 2CZEA 3S1XA 3S42A 5E93A 4YCPA 1WQ5A 3BW2A 1KTBA 2PRMA 4LS1A 3W3OA 4UTMA 1W56A 4C1KA 3W7LA 4HNTA 4LS2A 1VC4A 4O16A 5MHBA 1G4SA 4LWWA 1PV8A 2P10A 3CIXA 2Z0IA 3WK0A 2ABBA 2B7PA 1H7NA 2C19A 3MHUA 5C54A 2YW4A 2QCEA 1FBAA 4DQWA 2VFIA 4DO6A 5DCBA 3MHGA 1DV7A 4HNNA 1M6JA 4FXSA 3RLVA 4O15A 3VCRA 1KFBA 1KFCA 2QCCA 1K8XA 4AH7A 5K4XA 2YXGA 1ICPA 3EX3A 5LSMA 2BTMA 1K7FA 3EXRA 2ISVA 1FUYA 4GUHA 4QNEA 3QMRA 2XN1A 3E9AA 1XFBA 2QUUA 3CEUA 3KOFA 3ATYA 2TMDA 5KITA 1TV5A 1P1XA 4HPJA 1HO1A 1VS1A 3OG3A 4FF7A 4UCGA 2VEMA 3BK0A 4POCA 4YWIA 3NQGA 1GVFA 3DI1A 3QSTA 2TYSA 4QSHA 1DBTA 4OV4A 3TK7A 4RLIA 5EMUA 4ORIA 4AF0B 2Q3OA 1VLWA 3STEA 5FEWA 5AC7A 2VFDA 3G0SA 1YTKA 1YDVA 3R13A 3DFPA 2PURA 4NJJA 4GFSA 3LCFA 3W1TA 2E5DA 4EIVA 1H7XA 3LBMA 5FEZA 3NL6A 2E77A 4K8EA 1W3NA 3M47A 1P0NA 5CGQA 4TMCA 2GUUA 3TW6A 5D30A 2J27A 4K7YA 1ML1A 1WBHA 2FPVA 3USBA 5D05A 3W88A 2HS8A 3C3NA 3BG5A 3LXBA 4K38A 3TU9A 3Q2DA 2NWRA 1SW0A 4MJZA 4BF9A 4Z1AA 5HINA 3DGRA 4UTWC 4IGHA 3MBFA 3NQ8A 1IXNA 3L5MA 1ADOA 4N4PA 2GJLA 3HGSA 4O14A 5DELA 1YTDA 3LHTA 1W5MA 2V30A 3W2NA 4O53A 1TRIA 1ME7A 2NX9A 2QJGA 3UZJA 4W9TA 3G24A 2DZSA 1H5YA 4O4VA 6TIMA 3EX6A 1YYAA 5HQEA 4KFPA 5K4ZA 4MYXA 3LERA 1XL9A 3FYOA 5GVJA 5AYZA 4WXZA 2NX3A 3CHVA 3GDTA 5EBUA 2R8WA 3QF0A 4JIPA 4N6FA 4O1DA 1YDOA 1AMKA 1ONRA 1TPUA 1TV8A 2R94A 2X30A 4JR5A 2Y88A 4O18A 3LI1A 4ZMGA 4MIMA 3IVSA 1CI1A 1XXXA 4HKPA 3QFEA 5K9DA 5EL1A 3TNOA 1P0KA 3G22A 2Y85A 4UTWA 4DF1A 4CQ9A 3WFAA 1ZCOA 2V81A 5CKSA 2OX1A 3W7EA 1FDZA 4JX5A 1T99A 1OFEA 4K36A 4IPIA 1ICSA 2CLHA 1OG0A 1RVGA 1S5VA 3NQ2A 4YXGA 3ELFA 4MVAA 3LHYA 3S5NA 3G0UA 4QITA 2Z6IA 3G1VA 3W7GA 5D33A 3A23A 2RDTA 2H8XA 1SZNA 1B57A 2XFWA 1VJIA 3PM6A 5AN7A 2C3ZA 3L66A 4NJHA 3EKLA 3KRSA 4PFMA 5EYWA 3GYEA 4P2VA 4JTJA 1KFEA 3JRKA 4LNYA 3B0VC 3HBLA 3LHVA 1L9WA 5AYYA 1GVRA 3HG5A 3GDKA 3PSVA 4U28A 3W07A 2CU0A 3EWYA 4MLRA 2NXHA 2Y61A 3F4NA 1OHLA 2YGYA 5KINA 1LM1A 1TCDA 3E12A 1OF8A 1AL7A 1IXPA 4H6KA 3P62A 3MBDA 4LVBA 2AGKA 2JK2A 2WQPA 4AVFA 4MUZA 4OBTA 1GTHA 2V0TA 4TU1A 1EUAA 1KBJA 3G3MA 2EHHA 3PBYA 1AG1O 3M0ZA 5G4WA 1SO4A 1OK4A 3FIGA 1KTCA 2WSYA 2DU2A 2J9ZA 2YX0A 4GUIA 1KW1A 1JULA 4DO5A 2GVGA 1P5BA 5DBTA 4MFEA 4XTIA 2C18A 4DBEA 2A6LA 4N6EA 3UPWA 3OBKA 3WJWA 4Y96A 3A21A 3CTLA 3U2OA 2AAMA 3TIMA 1DVJA 3W2UA 3PB2A 1IIHA 4GXMA 1W5PA 2BXVA 2EF9A 1EWDA 1VLIA 1Q6OA 1I2QA 3HJZA 1GYLA 4UFKA 5L6UA 4R33A 1X1ZA 1AW2A 4FIQA 3TFCA 3OEXA 1W8SA 1KM0A 4O19A 3GXTA 3NQEA 1ME8A 3UXAA 3WJSA 4H3DA 3S8HA 3GNDA 1OFDA 1QOQA 3PBWA 1KFKA 4UUIA 1JCNA 1GZGA 1IXQA 3L2IA 2E6FA 1JCJA 1R46A 3GVGA 3DAQA 4AHOA 1K8YA 1RR2A 3I7SA 5I3FA 3TAOA 3GK0A 2VKZG 3BV4A 1H7WA 5TBOA 1MEHA 3EWWA 1KM1A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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