The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
78
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structure length |
73
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Chain Sequence |
KNADNINKLKSSIESTNEAVVKLQETAEKTVYVLTALQDYGIDISIELNKAKSDLEESKEWIRRSNQKLDSIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Molecular Basis of the Inhibition of Henipa Viruses
rcsb |
| molecule keywords |
Fusion glycoprotein F0, linker, Fusion glycoprotein F0
|
| molecule tags |
Viral protein
|
| source organism |
Nipah virus
|
| total genus |
34
|
| structure length |
73
|
| sequence length |
78
|
| chains with identical sequence |
B, C
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-05-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | YojJ-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4FZ0 A; 1WP7 A; 2QTS A; 3S3W A; 3S3X A; 4NTX A; 4FZ1 A; 4NTW A; 1WP8 A; 2FB5 A; 3N27 A; 4NTY A; 4NYK A; 2L35 A; 3IJ4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4QIW F; 4JI1 O; 1KEC A; 1Q81 W; 3C3T A; 2ZDI C; 5F2V O; 1VQ7 V; 4GZR B; 3ZBH A; 4X1K A; 2EIM C; 3FB5 C; 3CJH A; 4YJ3 B; 1W0K G; 2EIN C; 5EBM C; 1NH2 D; 1OCR B; 1HNX O; 4EB6 A; 3A2F A; 3SPH A; 1MMM A; 1TUB B; 4TT3 G; 2QEX V; 1F23 A; 4FLT A; 1MSD A; 1TGO A; 3T4D A; 2A06 H; 2Q7E A; 1EN4 A; 4IIJ A; 4TQD A; 1VQ6 V; 4UB6 Z; 5LP6 C; 1VAR A; 3OTF A; 3M7M X; 4O2A B; 2PI4 A; 3KKY A; 1L1F A; 5CA1 B; 2CAZ C; 5FPO A; 4TQF A; 1K33 A; 5LOV B; 2MK3 A; 3H1J H; 3ABL B; 1QVG U; 3JAR A; 2ILM A; 3D8C A; 4O4H A; 4B3R B; 1XOU A; 2LFS A; 4JI8 O; 5BY1 A; 1NVP D; 4FM2 A; 2GDS A; 4JGS A; 4WFE A; 2VRZ A; 3CRM A; 4NXN B; 1Z2G A; 3CXC U; 4GKJ B; 2IH3 C; 2Q69 A; 4IGG A; 1XMQ O; 4PA9 A; 2DYR B; 2LW7 A; 3AG4 B; 3BA9 A; 3ICX A; 2BSK A; 2PZS A; 4J42 A; 4BIZ A; 5B66 Z; 5LHH A; 2F66 C; 3AK1 A; 4MTG A; 2LJ2 A; 5J2T B; 5GON A; 4LF4 B; 3DC6 A; 4W4K A; 1TUE B; 1LR1 A; 3CCV V; 4JI2 B; 3SJC C; 3M8A A; 2LO1 A; 5E79 Z; 3CYO A; 4N23 A; 1FXK B; 4UUJ C; 1R6T A; 3OGC C; 2ZM6 B; 1QR9 A; 5KA5 A; 2JGD A; 1GM8 A; 3GB7 C; 4FVM A; 4OX9 O; 3ZRX A; 1HNZ O; 1R6K A; 5CBF A; 1Q6H A; 4TUY B; 1YXB A; 3OTO B; 3CMA V; 1HR0 B; 2KG7 A; 2HKO A; 1N32 B; 1MG1 A; 3QVN A; 1DLB A; 4X65 O; 3E22 B; 4DV2 B; 2QWP B; 5JCO A; 4YY3 O; 2E76 B; 1Q6U A; 2ZNJ A; 1VQK V; 2JDI G; 4O4J B; 4KL1 A; 2CTQ A; 2B1I A; 3BHP A; 1OCO B; 2EBO A; 3WU2 Z; 3ASN B; 5EIB D; 1QLE B; 1FYJ A; 4DRX B; 4Q6G A; 5KMG A; 3SJB C; 4UVA A; 3B8N A; 4RWU A; 1KQS U; 2XUM A; 4X88 A; 4JI0 B; 3H9V A; 4NR1 A; 5KAI Z; 5TIS Z; 2Q9L A; 1JCH A; 3JAM N; 1ROP A; 4B7K A; 2KSD A; 1SQB H; 4MVU A; 4JTA B; 4B3T B; 1NTK H; 5IYC O; 5H6R A; 2DQ3 A; 3FYI B; 4X62 O; 1GAX A; 3IJ4 A; 4UXN A; 2XAQ A; 4DV0 O; 2ZIM A; 1KBH A; 2ARH A; 2F4V B; 1M5I A; 3ZRW A; 1L8D A; 1N0N A; 3SYO A; 3JSL A; 4MT8 A; 3BCC H; 3QTC A; 5LXT A; 2FL4 A; 1SES A; 5ITZ B; 4CS2 A; 4K8X A; 2Q7G A; 4RUF A; 1WB8 A; 4QJF B; 3F7Y C; 4LBE C; 1JQ0 A; 4DR7 O; 4AHC A; 4ICG A; 2IM9 A; 2W0F C; 2YDE A; 1VIB A; 1SZX A; 1N36 B; 4L87 A; 2EIL C; 4DUY O; 4FJC C; 3ZX6 A; 2DMX A; 3I55 V; 5CB4 B; 2OCC C; 4TV9 B; 2LGW A; 4HNA B; 3RVY A; 5IJ9 A; 3LDC A; 5EIB C; 3B4S A; 4WCE V; 2UXN A; 5KHH A; 3PJS K; 1QR8 A; 3T1H O; 2XND G; 4KHP O; 1I5Y A; 2EIK C; 2DWD C; 5CA0 B; 3WB1 A; 1YJN V; 3ETE A; 3TCU A; 1AI4 A; 3QO5 A; 1XDC A; 4KFM A; 4BIU A; 5EYP A; 1BZK A; 1RM1 B; 1UJW B; 2Q7H A; 1P49 A; 5LHI A; 3B40 A; 4B7E A; 3UO2 A; 4PHZ A; 1N33 O; 4X64 O; 1JFF A; 1A32 A; 5LP6 A; 4O4L B; 2B1G A; 4EFE A; 2QM7 A; 2EIJ B; 3N2G A; 1WPB A; 4U7O A; 4DV0 B; 3AG3 C; 5DN6 G; 2ZR3 A; 3A0B Z; 4PV1 B; 4X1K B; 5LA6 A; 3CCR V; 3CJH B; 1GN6 A; 3VQV A; 1P7G A; 1H2S B; 1QQC A; 4EB6 B; 4DW1 A; 5LMN O; 2W6J G; 1KD1 W; 2UUC O; 1NR1 A; 3U10 A; 2KQX A; 1TA8 A; 3AK3 A; 1SQQ H; 1YJW V; 2DYS C; 4ZOL A; 4LF8 B; 3G4S V; 2BTQ A; 3E8B A; 1YTF B; 3CCS V; 1M90 W; 2YXL A; 4PA3 A; 4CS4 A; 2UXD O; 4IIJ B; 1Q6I A; 1VQL V; 1D5N A; 4JI5 B; 1OCZ B; 4P9O A; 1Q3E A; 3BRC A; 3FYE B; 4QE9 A; 4JYB A; 1WAZ A; 5KHI A; 4O2B A; 2CGO A; 1V55 C; 3B09 A; 3D3I A; 4NYK A; 4EKW A; 4U7N A; 3JAR B; 4O4H B; 2N05 A; 4WF9 V; 2P7T C; 5EZY A; 5GTI Z; 4DUZ O; 3NXS A; 4KHP B; 1XEQ A; 1GM9 A; 3LUT B; 2ZKO A; 2Y4T A; 1N4C A; 3B2E E; 1VQO V; 3CRR A; 2R70 A; 4DV5 B; 1N34 B; 5IYB O; 3CEI A; 1U96 A; 4NTX A; 4KP4 A; 2N74 A; 2BSK B; 2UUA O; 1PL0 A; 4JI4 B; 2Y4U A; 4UCU A; 5GON B; 4YIP A; 2NNU A; 2H94 A; 3DTU B; 2DOS A; 3F5W C; 4F6R A; 4I50 A; 1RPO A; 4I4T A; 1PNM A; 4E4E A; 4OPA A; 2JGD B; 2FYU H; 1FFX A; 4LCU C; 3O65 A; 3K79 A; 4H0L B; 1K73 W; 2DQ0 A; 3O9O A; 3ZHQ A; 1OJH A; 4E2L A; 2KG7 B; 4JAU A; 1VF7 A; 2ADP A; 3LDD A; 3L70 H; 4JV5 B; 5IYZ A; 2PYJ A; 3HKD A; 1H8E G; 1NTZ H; 4MW8 A; 4FLY A; 2RQ6 A; 4FLU A; 1CEZ A; 2JK5 C; 4N21 A; 4K0K B; 3VQW A; 1CPY A; 4QPK A; 5LGU A; 4OPH A; 1UFI A; 5BXZ A; 2ZXW C; 1AI5 A; 5KMG B; 1BSM A; 2A3Q A; 2YI8 A; 1MZF A; 2ZE8 A; 3BA8 A; 3ZIA G; 3P3P A; 1XL4 A; 2QJ1 A; 5LMU O; 5BR8 B; 1NQT A; 2FTK A; 1GTO A; 2VQF O; 3CC7 V; 5CN0 A; 3CSX A; 1ZAU A; 5EBW C; 2AHZ A; 2JRI A; 5B1O A; 4ZI7 A; 1KYO F; 4LF9 B; 3EHB B; 5IYD O; 2ZD9 A; 1AJP A; 1R3J C; 3ZJZ A; 3DGE A; 3T2M A; 1H38 A; 3CCQ V; 3ABM B; 3K57 A; 5B1N A; 1OCC C; 2ZE7 A; 4DO2 A; 2V4D A; 2XOK G; 4K8Z A; 3ZRW B; 1S77 D; 3MAQ A; 1HWY A; 4FMT A; 4TV8 A; 1FPO A; 3ABK B; 1SQP H; 3P30 A; 1CP9 A; 1Z5V A; 4FLW A; 1ZLZ A; 4DV1 O; 4EFB A; 2Q73 A; 3WG7 B; 5LXT B; 1WA8 A; 4PI2 A; 1IBL O; 3X2Q C; 1SQV H; 5B5E Z; 1SA0 A; 3THO A; 3CCL V; 3HKB A; 4LH7 A; 4DW0 A; 2JS5 A; 1K34 A; 4LFA O; 2BE3 A; 5CA3 A; 2ZE6 A; 3SYC A; 4X66 B; 1F7Y A; 4IHJ A; 1JVM A; 3HB3 B; 5K1X A; 1VQM V; 1SRY A; 4PDM A; 5L3G A; 3UKM A; 3OMN B; 1K9M W; 4B3M O; 4IT5 A; 3OEH G; 4CH3 A; 3CME V; 5IJ9 B; 2EIN B; 1DF4 A; 1XNQ O; 4B08 A; 4LH6 A; 4JYY A; 1GN4 A; 4DR1 B; 3RYC A; 1Y74 A; 1PV0 A; 1JX9 A; 2EZO A; 2HHH B; 1K3E A; 1EN6 A; 5EYP B; 1NZ6 A; 1GMG A; 5B1B C; 2QKC A; 1RFY A; 3CC2 V; 1JFF B; 5LP6 B; 3JD1 A; 1XMO O; 1VF6 C; 4MVS A; 1NU1 H; 2GTA A; 4TSF G; 3N2G B; 3P32 A; 2NR5 A; 2UXC B; 4MVQ A; 1AIL A; 1P4R A; 2HEP A; 4GUN A; 1EZV H; 5LA6 B; 4D7S A; 2WLK A; 2WLL A; 5IY5 C; 1AP5 A; 2X0L A; 5DEC A; 4UCS A; 4GT1 A; 1KB9 F; 3JAW A; 2VS0 A; 2UUB B; 4JTC B; 2R9A A; 3CWB H; 4J9Y B; 2E75 B; 4ZOL B; 1VP7 A; 2Y69 C; 2BTQ B; 1IXM A; 1XNR O; 1IDS A; 4BAY A; 3ZMZ A; 4DV7 O; 2H3O A; 1JPX A; 1FS0 G; 1AJN A; 1JOY A; 4JI6 O; 2YIB D; 2RNB A; 1THZ A; 2CUG A; 2QTO A; 3F5T A; 5IJ0 A; 2R9R B; 3AEI A; 1U97 A; 4LR3 A; 2AW9 A; 4JYA B; 2G38 A; 2QKS A; 1GN2 A; 2W0X A; 3IGA C; 1B6Q A; 4O2B B; 1IBM O; 3K0G A; 2ZR2 A; 3APO A; 4MTF A; 4J7K A; 2UXB O; 1GN3 A; 5DM6 V; 5EZY B; 5KHJ A; 1KP3 A; 4FFB A; 4NXM O; 3OR7 C; 4YIO A; 2X6A A; 2WLJ A; 3FKS G; 1Q8I A; 1NKD A; 4MVO A; 1Q5O A; 4JZG A; 1EBO A; 1OCR C; 5LGT A; 5CBG A; 4XDK A; 3ASO C; 1COW G; 3BPZ A; 4Z2W A; 4DR6 B; 3ZHU A; 3UM7 A; 1QVF U; 3ZS8 C; 3QO8 A; 2P06 A; 4JI1 B; 1Y66 A; 5D5P A; 1XHZ A; 1M1K W; 3G6B A; 4F6R B; 4I50 B; 1FFT B; 4I4T B; 1AI6 A; 3JD3 A; 3UQ8 A; 2FKX A; 4FLV A; 4BW9 A; 2Q67 A; 2RMK B; 1FFX B; 5B1A B; 1HNX B; 2XTA A; 3SJA C; 4DV6 O; 1OHH G; 3U0Z A; 4DR3 O; 3KZI Z; 3D36 C; 3GWO A; 1PKX A; 4LF7 O; 1E1Q G; 2JGU A; 1Y76 A; 1GO3 F; 2KB1 A; 4H37 A; 1LUV A; 1BQZ A; 5A2Q N; 1K5S A; 2ITD C; 2PUS A; 5IYZ B; 4WFH A; 4JZ2 A; 3WB2 A; 3HKD B; 4I55 A; 1EZJ A; 1WJZ A; 1ENV A; 5JQG A; 1WP7 A; 1IXB A; 3LNM B; 4DV4 O; 3WFV A; 5E1A C; 2DYR C; 5L3D A; 4DR5 O; 1Z5W A; 4IYI A; 1E1R G; 3K08 A; 1M56 B; 4X1I A; 2CTW A; 4CH5 A; 4LF5 O; 1MOF A; 4GCZ A; 2UXB B; 4NB5 A; 1K8A W; 4JI8 B; 3MHH C; 1FXK C; 4PD4 F; 1PD3 A; 1YHQ V; 4I0X A; 4JF3 A; 1XMQ B; 4LWS A; 3ZHS A; 2YEV A; 1RSO A; 2QE7 G; 4ZI7 B; 4NVP A; 1QNM A; 4Z1V A; 2VQE O; 2P4V A; 1WP8 A; 3E35 A; 2ATK C; 1S5L Z; 3KCX A; 3OMI B; 1SER A; 5JJJ B; 1K7D A; 3AG1 B; 3VOU A; 3CCU V; 4TV8 B; 3ABU A; 4OX9 B; 4MVR A; 1PNL A; 3J81 N; 1HNZ B; 1WA8 B; 1OCO C; 1FKA O; 4JI7 O; 1J5E O; 4MVZ A; 2IH1 C; 5FPR A; 1SA0 B; 3HKC A; 3HKB B; 3SGI A; 2ODM A; 3UT5 A; 4X65 B; 3DC5 A; 1MNG A; 1E79 G; 4CZZ A; 4XDL A; 2BOB C; 2HVK C; 3FB8 C; 1VF5 B; 2QSA A; 3W7T A; 4YY3 B; 4GX1 A; 4IHJ B; 2E5L O; 4GKK O; 4R7C A; 4JAV A; 3UO3 A; 1XUQ A; 3G80 A; 4G2K A; 1X4T A; 2ZDI A; 4YJ2 A; 4DR2 O; 4FIP C; 3AG3 B; 3E8G A; 1IBK O; 2CK3 G; 2VWK A; 1SQX H; 3ZMT A; 3ETD A; 1KP2 A; 1AR5 A; 2A79 B; 2L35 A; 5KAF Z; 2YS8 A; 3RYC B; 1Y74 B; 3A0H Z; 2FB5 A; 5B3S C; 1KUQ A; 1XQ8 A; 2RCV A; 1HNW O; 2OCH A; 2LW1 A; 1YSC A; 3K58 A; 3EXA A; 3SYP A; 1YTF D; 4NKG B; 2D2C B; 1SS3 A; 1XI1 A; 4LFC O; 3VQX A; 4X62 B; 3OT7 A; 1B3Q A; 4DXW A; 2ZIO A; 4P9P A; 4C7U A; 1K5Q A; 1QU7 A; 3E83 A; 3R66 A; 3P3N A; 2WLL B; 3RFR A; 2YC0 A; 1NBM G; 1OV9 A; 3OEE G; 2XAS A; 3CRA A; 3L9D A; 3GVM A; 2IJH A; 2QWN B; 1H2M A; 3JAW B; 2HJD A; 2O57 A; 3OAA G; 4FZ1 A; 3Q4H A; 2EX3 A; 3I56 V; 5IT9 N; 5J2U A; 5H2F Z; 3N27 A; 1EM1 A; 4XDJ A; 2IBZ H; 4LFB O; 4DR7 B; 4I9W A; 4U3J A; 3BY6 A; 1J95 A; 5IJ0 B; 3RYI A; 4ZIB A; 5KHG A; 4DUY B; 3E89 A; 3G67 A; 4GKK B; 2JS3 A; 5LHG A; 2WA3 A; 3ETQ A; 2HG5 C; 5KLV H; 4WFA V; 2F43 G; 3RYF A; 4RQE A; 1I94 O; 4UV8 A; 1BHA A; 4FFB B; 1KU9 A; 1NS1 A; 3T1H B; 3HKE A; 5FL7 G; 5GTH Z; 4CC6 A; 3D36 A; 3GWK C; 4CS3 A; 3CE2 A; 4BIO A; 1W2B U; 1N33 B; 4X64 B; 5C93 A; 4UVB A; 1NR7 A; 1NT2 B; 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2P67 A; 3WB0 A; 1KC8 W; 2JJ1 G; 4JAA A; 2Z0A A; 3OUF A; 2DN9 A; 3HKC B; 1KKD A; 1BE3 H; 2F95 B; 1YZB A; 1B06 A; 3FD9 A; 1RP3 B; 2CGN A; 3RVZ A; 3SPG A; 3UT5 B; 4ASU G; 3CPW U; 1SQF A; 1PPJ H; 1Q90 D; 3AG7 A; 2AZ0 A; 3W7X A; 1JR9 A; 1PL4 A; 4GX0 A; 2WSS G; 1VQP V; 3TXS A; 4YJ2 B; 2P22 C; 1R3L C; 2EIM B; 4X20 A; 2EUL A; 1K92 A; 4J41 A; 3SYA A; 1F51 A; 3ABM C; 3OE7 G; 4F4L A; 3W7S A; 1TVK A; 2XAF A; 1Y67 A; 2Y0I A; 2GHY A; 3FX7 A; 2IU0 A; 2YUA A; 1ZL8 A; 5LMU B; 3ABK C; 2HP8 A; 1YIJ V; 2VQF B; 1YDX A; 3TXQ A; 1DK1 A; 1XRE A; 2Y69 B; 1BCC H; 1YEW A; 3QNE A; 5JVD A; 2BTO A; 2EJR A; 3K5M A; 4NXN O; 1YCI A; 3AK2 A; 3NR7 A; 3S3X A; 3K3W A; 1YJ9 V; 4JTD B; 2R9I A; 1V54 C; 3W7U A; 4MSW C; 2X7R B; 5IDJ A; 5H5N A; 4DR4 O; 1JJO A; 1MAB G; 1Q82 W; 3QF7 A; 4DV1 B; 1M93 A; 4LF4 O; 1B04 A; 3K59 A; 1OZ0 A; 3Q4H B; 1IBL B; 4JI2 O; 3ZRV A; 5BZB A; 1GH6 A; 5J2U B; 4KXR A; 4ZHQ A; 1K97 A; 2X6C A; 2ZM6 O; 1AR4 A; 2B5U A; 2CH7 A; 1JMK C; 1XBL A; 4U3J B; 1H2L A; 3OTO O; 3STZ C; 3ASO B; 3SDL A; 4JYC A; 1D2D A; 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