3N7JA

Crystal structure of botulinum neurotoxin serotype d binding domain
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
415
structure length
405
Chain Sequence
NSINDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRVGDNVQLNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNILIYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIEQNSGWKLCIRNGNIEWILQDVNRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSQKIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYIINDNYIDRYIAPESNVLVLVQYPDRSKLYTGNPITIKSVSDKNPYSRILNGDNIILHMLYNSRKYMIIRDTDTIYAQNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVSKNKYCSQIFSSFRENTMLLADIYKPWRFSFKNAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Identification of a Unique Ganglioside Binding Loop within Botulinum Neurotoxins C and D-SA .
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type D
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 94
structure length 405
sequence length 415
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2010-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3n7jA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3n7jA02
4YW5A 2ZGKA 2DU1A 1W6QA 1DIWA 1Z0HA 4FQZA 4Y22A 2R1DA 2PHFA 2AAIB 1DFQA 3KM5A 1WLDA 2WSVA 5GZDA 1KRIA 4M00A 1G9FA 3IM0A 1P63A 3WMUA 4I4YA 1SCRA 2C5DA 5F8YA 2VW2A 3MW3A 5D62A 1CONA 1PUMB 2W52A 3KMVA 1MVQA 3B01A 3UD9A 4XE9A 4Q8KA 3ZYPA 3FJ8A 4JRAA 1V6WA 3O0VA 1LODA 3GALA 5EYXA 1LULA 4XZPA 5SV8A 3WNXA 3OYWA 4BMEA 1ISWA 2WKKA 4L4HA 1A3KA 4R6UB 3V0BB 2NZ9A 1H9PA 4BQ1A 3UJOA 3AJZA 1AXMA 2DVGA 1AZDA 2ARBA 4P0LA 2DVAA 1EVTA 1ISVA 1TTUA 2ZHKA 3AJYA 2DS0A 3BA7A 1IS5A 3GNEA 4OW4A 1SBEA 4ISRA 1YF8B 3W58A 4GKXA 4EFRA 3POWA 2C9AA 5KXCA 4LBQD 1Q03A 1BFGA 3H6RA 1BARA 1AVXB 2I1BA 3ZSMA 2M49A 4ZA3B 5T5LA 2EAKA 2R49A 4PQ9A 2VY0A 4ZFUB 1URXA 4YGBA 2JD4A 3N7MA 3MALA 4J2XA 3AP6A 3SISA 3FJCA 1W6OB 1LESA 3AYEA 1PZ7A 2WJSA 1Y7BA 5CBLA 4A7KA 3PJQA 1VLNA 4K21A 4QD2B 4P9YA 5T5PA 1JYCA 5GZFA 4AVSA 3V65A 5DZGA 1ULFA 3UD8A 4YG6A 1APNA 5D61A 1Q8QA 4Z8BA 4DQAA 1NZKA 4BMBA 1N1YA 3VWCA 1G9AA 1FV2A 3FUOA 5F8SA 4ZKTB 2EXHA 5T50A 2NMNA 4CZSA 1LJ7A 4M3CB 1QDCA 2AGSA 3WINA 1GICA 3JUTA 2YUGA 5DG2A 3HR9A 4LBNA 1GZWB 3VT0A 4LBQB 2E7TA 1EV2A 2Y9FA 5KXDA 2P23A 4JPZA 1IRPA 1DJSB 1DFCA 3PHZA 2RHPA 2XB6C 1DQ6A 1RINA 5T55A 1UAIA 2MC2A 3KQRA 3OBRA 5GLTA 1F9KA 1R8OA 4FPHA 4GAFA 3B69A 8I1BA 3PVEA 3O5WB 1WBCA 4OEFA 1AF9A 1J0SA 2A3WA 1OFSA 5JOWA 2KI4A 5DSSB 3ZXFA 1A78A 3W59A 4FVVA 1V6JA 3IPVA 1RMLA 3BX1C 1LGCA 3CNAA 1G86A 4PF5A 5BXRA 3R4SA 4JP0A 4Y24A 1IS3A 1UMZA 2GZBA 2ZGRA 5JOYA 1OQLB 1H9WA 3T1LA 3HBWA 2MLLB 2FDBM 2A6VA 2CWSA 4UW4A 1LHUA 3AKFA 4IZEA 4FPYA 1V6VA 1DGLA 4RL7A 1IILA 4LO2C 1SLLA 1YI7A 1BFCA 2RG9B 1R1ZA 1FMZA 2DVBA 4X38A 2D7RA 1PUUB 2A70A 3FJ9A 5KXBA 3CAHA 1QQKA 2PHUA 2R0HA 41BIA 1LOCA 1BASA 2NTDA 2D7FA 1A8DA 4Q2FA 1BFBA 3OJ2A 4IONA 1W6NA 3EF2A 1FWUA 2PHXA 1ULDA 4QALA 2BEAA 2L5XA 1SCSA 3CA5A 3SLIA 3WG3A 2Z48A 2ET2A 3OY8B 2UWAA 2WSUA 3FBYA 3NBNA 1W6MB 1W6PB 3FGMA 2VSEA 1DYKA 3ILAA 2QYIB 1YXWA 3BAVA 3PVNA 1KDMA 4D0TA 2G4IA 5L73A 4YG0A 1DBNA 5FREA 3CA6A 1PC8B 3IM5A 3VKMA 2QN4A 1BYHA 4OZXA 5F5QA 1LU2A 5DZEA 2ERFA 3T2TA 4YW2A 5T5OA 3QYDA 1DQ5A 3V79C 1RY7A 4QC4A 4Y1UA 3VSFA 4ZFYB 2EIGA 3UK9A 1V00A 2ERMA 3DUIA 2RQ9A 4AVTA 2A5ZA 4KEIA 1ENRA 1FNYA 3HALA 4NO4A 1BZWA 4H04A 2ENRA 2YROA 3BAOA 2D6OX 4AGRA 1QDOA 2E53A 4FPCA 1LEMA 1YO8A 3RMXA 4XJ8A 5DZUA 3FJEA 1NXD1 2NVHA 1ISZA 2YY1A 2AYHA 2ZGOA 2AUYA 3TC2A 4YFWA 4IHZA 5E88A 1JW6A 1S0GA 4WBCA 5D63A 2ZGUA 2X2TA 1JTCA 1XZZA 1SBDA 1MR5A 5BOWA 4YOLA 2DREA 4X37A 4A7YA 4UW3A 3LCPA 3UJQA 2AH2A 2J3PA 2NN8A 3CRHA 4YGDA 1V6XA 4PC4A 3WO2A 3AZXA 2HWMA 1HIBA 4Y1VA 2H0BA 3CRGA 3V64A 2OVUA 4W65A 1RIRA 2CWMA 3BA4A 1G9BA 3OJVA 3ZXDA 4I4PA 1JLYA 1IKQA 4H55A 4JCKA 1ONKB 2I2SA 2YXSA 1UZZA 1GANA 1ENSA 1GV9A 4R9BA 1DZQA 4YM1A 2ZGNA 4OWLA 4LO3C 1RG8A 2IWTB 4IQPA 4USPA 1MS3A 2ZGQA 1WBAA 2ZZJA 1FN0A 2F2FC 2DVDA 2UUSA 3QLQA 2AQZA 1KJLA 2UURA 1VALA 1QNWA 1IS6A 4BOWA 5JLVA 3O4DA 4YG3A 1G9DA 1N1SA 3V0BA 1SZ6B 4XFUA 5BQUA 2ZGSA 1FATA 5CNAA 1W0PA 5EWSA 3VV1A 3S8JA 1VCLA 1HCEA 4L4IA 3A22A 4M3CF 1OQ1A 4LBLA 4AN6A 3SNVA 1QF3A 3A23A 4PCRA 2KM2A 3TB0A 1W3AA 1UZYA 4KC3A 4FPOB 3HOMA 2RSTA 4IYBA 2D43A 1MS8A 3ZYRA 1IT0A 1YBIA 1G7YA 2A6ZA 3WCSA 1K5VA 3UJ0A 3Q7XA 4JKQA 1LU1A 1AJOA 4U36A 3BIWE 3BB2A 3RSJA 1I1EA 1V6OA 4A7ZA 5EYYA 3RG0A 3F62B 3WV6A 4XTPA 1Z2VA 1YIFA 3PG0A 3IAGC 1KDKA 3O12A 2GDFA 2A7AA 2YZ4A 3Q9OA 4XIOA 1JUIA 4YM0A 5DUYA 4LBJA 1MS1A 5GALA 1LENA 3ENRA 4M3CA 2A75A 1MZ5A 3ZXKA 4FOQA 2E7QA 1YYNA 3UD7A 5BP5C 3POYA 1GZWA 1LEDA 4KEKA 4LBQA 3ZX7A 1QKQA 1TFMB 3N7KA 4X39A 4I2SA 4LBKA 4EKXB 4FP3A 2VUAA 5FNXA 2LIQA 1N3OA 3NV3A 4USOA 3NBDA 3ASIA 4XFSA 2FO1A 4I4RA 1FX5A 4EEEB 4F34A 3B00A 4FOYA 3BA5A 1C1FA 3FLRA 3CA4A 3OJMA 1S0FA 2ZKNA 21BIA 4XOGA 1H30A 4II0A 1GGPB 1FWVA 1BKZA 3U4XA 2WRYA 1IHKA 1F5FA 1SLBA 3VKFC 4DFSA 3NBEA 3AP5A 2D3RA 2EXJA 3WINC 1DQ0A 4I4QA 1JHNA 2OW4A 2LTNA 3ILFA 2D20A 3OJBA 3BTAA 1IOAA 3CA1A 4I1EA 5DUWA 1Z78A 4P6AA 4OWKA 4XJ9A 2P3JA 3CQAA 4XXAA 3ILRA 3AYCA 4L8QA 1N4KA 3O4OA 1ABRB 2E51A 3SNMA 4Q91A 1CQ9A 4BLJA 1JN2P 4GP0A 3BRFA 2JECA 3PMEA 3OPZA 3BRGC 1O4YA 1LHNA 1GKBA 3POSA 3M3EA 1WW4A 3RRDA 2ZMKA 3WO3A 3RMYA 3O0WA 5JOZA 1ULEA 4CJMA 1JT5A 4FGFA 1PZ9A 1HLCA 4J2KA 2ZQNA 2LALA 1S0EA 3OY8A 5GLVA 3T1MA 1W6MA 1O4ZA 1W6PA 3PUBA 3MW2A 1HWOB 4ZLBB 5T5JA 3WVJA 1HQLA 4Q8LA 2ZACA 1WLWA 3FJJA 4G6MA 1GSLA 3LSDA 2GMEA 5FRAA 3I2AA 3ZPYA 3AFKA 2WNEA 2ZA9A 1Q56A 2W08A 4C1XA 5KXEA 4YGCA 2D6NA 3SH5A 4XKIA 1DQ1A 2VLCA 4OEGA 4YM3A 1W0OA 1YTOA 3UDAA 1MS4A 2DWRA 1C1LA 3P53A 3AZZA 3N7LA 5DUXA 4DPNA 2GNBA 4AVVA 1C4RA 1CPNA 1LOFA 4IY8A 4I30A 1WW7A 3AXEA 1WUVA 1GNZA 2P37A 2ZMLA 1FQ9A 5DZFA 1CN1A 2UWCA 3N35A 4J23B 3BAGA 2A3YA 4P0KA 1JT4A 1M2TB 5B2HA 2ESUA 9ILBA 1LGNA 4DRVA 1VAMA 2D23A 4QBVA 3BAHA 4TLPA 1GZCA 2B7YA 3M1HA 1LTEA 5E8AA 1XYFA 3WDXA 4GAIA 5BXPA 5E89A 3S8KA 4YLZA 3NBCA 2VW1A 3M3CA 2UWBA 1ISYA 3QCWA 3AJ5A 1J1TA 2GNMA 2ZGTA 1MVEA 1QOOA 4XYXA 2D44A 1EYLA 2FHRA 4P9WA 1FGAA 1S1AA 1Q04A 2XOAA 3Q7YA 3UL2A 4JQ0A 1B09A 1L2HA 4ZBVB 5JOXA 4Z8SB 4XMIA 1HWPB 2KKIA 4K20A 2PHWA 3BRDA 2K4AB 1CR7A 2K43A 4RA0A 1JBCA 5FZUA 5GZGA 5JDBA 5CAZA 1RITA 1HCDA 3FUQA 3N0KA 2E4MC 4ZXKA 4XIKA 4ASMB 1M16A 4LO1A 4J2YA 1DZCA 3WCRA 1WW6A 5GLZA 5BXTA 3VT1A 1N3QA 7I1BA 1LOGA 2VU9A 4DS0A 1AX1A 3NV4A 1Q8VA 3AX4A 1SR4A 4K1YA 1IKPA 4WZFA 1JQZA 2A6WA 3BOPA 1D0HA 2IHOA 3AZYA 1RZOB 2JE7A 5FZYA 1XQNA 1HWMB 1N1VA 4I3NA 2AFGA 2A71A 3N7JA 1ZA4A 1GYKA 4YM2A 4LO0C 3K1XA 1JY0A 1X50A 4Q9PA 3FLTA 4D0ZA 1CJPA 4ZGRB 3M2MA 4YZ2A 4K1ZA 1U0AA 1MS9A 3HSMA 1AFCA 4FPKA 5T52A 1AVUA 3B3QE 3DGTA 4AYUA 4GWMA 2VW0A 2ZGMA 1ILR1 1HWNB 1Q8SA 2FMDA 5JVVA 3AKGA 4Q1PA 3IM6A 2AXMA 3HMYA 3E8LC 2A6YA 1IRAX 2PHTA 1CVNA 4XFTA 3RS6A 1TOOA 1F31A 1V6UA 4WVVA 2KI6B 2D6LX 2R1BA 5IK8A 1DQOA 3V0AB 2ZBJA 4ZOTA 1HQWA 2P3KA 1AX0A 2FFUA 2JE9A 1WBLA 5H9SA 1W3GA 3CA0A 4ITCA 3AYAA 2TEPA 2CL2A 4I4SA 2HWAA 3WHTA 3AP9A 4Q1RA 1AXZA 2PHRA 2ZMNA 4KEJA 1GNHA 1BQPA 2LIEA 31BIA 3C2UA 5T54A 1NUNA 4R9DA 1UKGA 1V6NA 5F8WA 3Q7WA 3O4CA 3UJ4A 3VUOA 2ZQOA 1ENQA 4MYEA 1AVBA 1Q8PA 3APBA 2ZGLA 3AK0A 3NV2A 3BADA 1QMJA 3SITA 3WDTA 3C9ZA 2CTVA 2ZGPA 2HZ9A 4R9AA 2Y9WC 3NJ5A 3WOGA 4M3CE 5DVHA 5AVAA 3O44A 2DU0A 2D22A 1WLCA 2NYYA 4I6IA 1LOEA 2VXRA 4HL0A 3USUB 4WV8A 5BVPI 4LBMA 1QOSA 3BAUA 3WDUA 3ATGA 5H9QA 1VAVA 3A0NA 2MIBA 4U2AA 1R8NA 1ITBA 3ZXJA 3LSEA 5FNWA 4UW6A 2V73A 3O5SA 2VXTI 1MC9A 4LO3A 4P9XA 5HCAA 3FJKA 2WBCA 4FQ4A 3ILNA 3ZSKA 3O4BA 5EG6C 2GNDA 4I37A 4WVWA 2F2FA 3AYDA 4AN7B 1QOTA 5H9RA 4IY9A 4XHBA 4P0JA 4C1WA 3TAYA 2AENA 1TIEA 5CB7A 3N3HA 2DV9A 4TYSA 4FP2A 4GA9A 1OKQA 4I4UA 5IK7A 5EC5A 1V6IA 3A4UA 2BFHA 3AKIA 4XMAA 4DENA 4Y20B 2D6PA 1CPMA 1DQGA 1GBGA 2D24A 3VSZA 2Y9GA 2OUJA 3CRIA 3O0XA 4I4VA 3WLUA 1IS4A 4DEPA 2BEBA 3MPPG 5IK4A 2GN7A 4FOVA 1BXHA 1CVSA 1AXYA 1II4A 1HKDA 4I4OA 4YW1A 4OWJA 4NOTA 1S0LA 4JC1A 3AXDA 3M3QA 2DVFA 4OEEA 1SFYA 2ZHMA 2JJ6A 2NP0A 2VSAA 2DUOA 4ISQA 1S0CA 3ZVXA 2NMOA 4FPJA 3O49A 5GLUA 2DRZA 1PZZA 1S0IA 5GLWA 1SACA 3JUUA 2D7IA 1ZM1A 3N36A 2P2KA 2Q9XA 3IIRA 4G9NA 3ZXEA 1FYUA 4I7IA 3BODA 5BP5A 3T8SA 5HCBA 4XBNA 4PBOA 3NV1A 3O4AA 4BM8A 4FPGA 1WD4A 2ZABA 2F8XC 2EXKA 5I1BA 1DQ2A 1G9CA 4XBLA 4XJAA 3SH3A 1G82A 3A21A 3AJ6A 1BLDA 1BLAA 1DZDA 2W39A 6I1BA 1Q1UA 4XDQA 1V6KA 4I1BA 2EXIA 2A6XA 1SLAA 1KJRA 3AP4A 1LOFC 3FLPA 4CTEA 3OGFA 3ZXLA 2NM1A 4XHXA 1QGLA 1LHOA 1W6QB 3FJAA 3FJFA 1AJKA 4Y22B 1PWAA 1ULCA 4G1RA 3FJIA 1N3PA 3BAQA 4JKXB 4XXPA 1W3FA 5LK5A 4TZDA 2CNAA 4AGVA 4GOVA 4XJUA 4Y1XA 4LO7C 3OBTA 2D3SA 3FJHA 4XTMA 1BA7A 2ZHNA 4Y1YA 2R0FA 4ENDA 1KQRA 3LTQA 1AVWB 1ONAA 3INAA 2ARXA 2SBAA 4LBOA 5FZZA 3A07A 1GLHA 1JXNA 5IUQA 3A0KA 3ZXGA 5DXDA 1WW5A 2VH9A 4ATFA 3OYWB 2ZR1B 5HCFA 1I1BA 3H6QA 4I4XA 5GAQA 2W68A 3WG2A 3WHUA 2WT2A 3B9CA 1AVAC 4GP3A 1WCSA 1CESA 3VEQA 1JOJA 2Q3NB 4YW4A 4FPFA 2DURA 3LLPA 4EFPA 4F83A 5H9PA 4YFZA 4Q27A 3W9TA 4GOYA 4LO1C 4Z9WB 1HDKA 3FJBA 1SBFA 2R16A 1TP0A 3CA3A 4YGEA 3H6RB 3FJDA 1S0JA 3I2XA 1DHKB 3IN9A 3I4IA 1BJQA 1Q8OA 1KITA 2XG3A 2D6MA 3NWKA 1SR4C 1D2SA 1SLCA 4P14A 2WLQA 1LOBA 2AREA 1WD3A 1E0OA 4HANA 1AXKA 1LOAA 2K8RA 1NLSA 3V0AA 3VT2A 3AZWA 2GMMA 5GM0A 3P6JA 3AZVA 1EPWA 1LHWA 4BPZA 2HYKA 3WMVA 1S0BA 4DRRA 2V5YA 4FPEA 4UW5A 1VIWB 5F9TA 4YZ1A 4CRQA 4XJZA 3D6EA 3CU1B 4GXLA 1FMMS 5F90A 5G00A 5IT6A 4QKSA 1G8WA 1S0DA 1HKNA 2JKBA 4KBBA 2ES3A 3B9UA 1XHBA 3VKNA 2KLLA 1MZ6A 1WBFA 4PBPA 4SLIA 4GKYA 4GWNA 4YW3A 4HA2A 4FPLA 2ZAAA 4LO2A 4Y26A 3IM7A 1UPSA 2WT1A 1V6MA 3F1RA 2GN3A 1T4QA 3WZ1A 1AX2A 1LCLA 2DTYA 3D7WB 4QBCA 5DUUA 1TWEA 3H6SE 2WQZC 3AH2A 2EALA 1LGBA 2UU8A 3R05A 2HW9A 3L2YA 4ATEA 1JT7A 2P3IA 3USUA 4G9MA 3D5OA 4QKRA 3FFZA 1JT3A 2WT0A 5GZCA 3QR5A 1C57A 4R9CA 3VKLA 2SLIA 3VKOA 2Y9XE 3IPVB 4IZXA 1K5UA 4OUJA 4Q26A 2KH2A 3R4UA 1BFFA 1JLXA 2BQPA 2JDZA 5DUVA 2FFVA 3WDYA 1I3HA 5E24E 2E6VA 1DYPA 3WG1A 2A3XA 3ZSJA 2E4MA 4BLIA 1MS0A 1LHVA 5BQUC 3ZC9A 1GZ9A 4YZ5A 1ISXA 1PZ8A 2P34A 1UL9A 2YMZA 4LO7B 1JYIA 3MEPA 5DG1A 4M01A 2DUQA 4J2SA 3AH1A 4AGGA 2DUPA 3WUDA 2GO2A 3JU9A 1N1TA 3WUCA 2FGFA 2CYFA 3ZSLA 3WA1A 4EB2B 4Y20A 1QXMA 1DQ4A 2Z49A 2D3PA 1Z4SA 1W6NB 3ZC8A 5BYNA 2AR6A 4H9WA 4LO0A 1KNMA 5CA6A 3M3OA 5GZEA 3AH4A 3RQ0A 3I29B 3RTJB 1V6LA 3P6IA 5GJ6A 4Q9GA 4QD2C 3RTIB 4QO3A 2R9KB 4I8MA 1LECA 4FOWA 5IK5A 1CE7B 5HPZA 4X3AA 3I8TA 1QNYA 2DTWA 2P39A 2DYCA 3PVOA 2EF6A 1N47A 3WDWA 4JAWA 4G6JA 3POKA 4D8HA 1SLIA 1CIWA 1FV3A 4LO8B 1ULGA 2YV8A 4I0YA 2D1ZA 5BXSA 1MS5A 1UX6A 4YZ4A 2ZHLA 5EXOA 3AKHA 2Z42A 2Q5TA 2CY6A 2DRYA 2X2SA 2GMPA 1QQLA 1T9FA 3D4KA 1IOBA 3O3QA 1DLLA 4HR6C 5JMCA 3HN1A 3WDVA 4AWDA 4Y1ZA 1XG6A 4D69A 4DCKC 4XJWA 4YZ3A 3AP7A 4I96A 4XBQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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