The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
82
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structure length |
82
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Chain Sequence |
ACQEANYGALLRELCLTQFQVDMEAVGETLWCDWGRTIRSYRELADCTWHMAEKLGCFWPNAEVDRFFLAVHGRYFRSCPIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of the Ectodomain Complex of the CGRP Receptor, a Class-B GPCR, Reveals the Site of Drug Antagonism.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Membrane protein
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| total genus |
29
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| structure length |
82
|
| sequence length |
82
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-05-27 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3N7P D; 3AQF A; 3N7S C; 3AQE A; 2YX8 A; 3N7R C; 2XVT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3C21 A; 4RQ5 A; 2OEH A; 9ICP A; 4E0D A; 8ICR A; 4I2E A; 2ZG6 A; 3TQ1 A; 2XID A; 5ALY A; 4F4K A; 3WK9 A; 4F71 A; 3NS1 A; 2W9C A; 2JV3 A; 2GLE A; 3Q8M A; 1IG6 A; 2K89 A; 2F2A B; 5DQH A; 4O5C A; 2F76 X; 3M9O B; 1QCK A; 3SV3 A; 4NWI A; 2ASL A; 2DL0 A; 2OYY A; 5AI9 A; 4RPX A; 9ICG A; 1ZD5 A; 1N61 A; 4Y2J A; 4DS4 A; 4K4I A; 4KX3 A; 3H0L B; 5ALP A; 2KKV A; 5AM0 A; 2FE9 A; 2JZB B; 2WFA A; 5HMM A; 4KLE A; 5DG7 A; 3TAP A; 1XS9 D; 1BPB A; 4QWD A; 5KFS A; 3M7D A; 2J6U A; 3L4P A; 9ICV A; 2Y0S C; 3ZI4 A; 5KFE A; 2HOI A; 4RQ3 A; 5AKL A; 4LZG A; 5AM4 A; 3MR6 A; 8ICV A; 3Q8R B; 4DSF A; 3O0F A; 2KVC A; 1PVR A; 4B9V A; 4UAW A; 2NRX A; 4R65 A; 2M9N A; 3ZDC A; 4I2H A; 3I1Y A; 5AKK A; 2KE7 A; 2Y1I A; 1SXE A; 1S0V A; 1C20 A; 1X40 A; 2P66 A; 4RPZ A; 3KTQ A; 4EZ9 A; 2NV3 A; 2ZJ8 A; 5J0R A; 3BDP A; 3HKZ F; 2WAQ C; 4KLI A; 1KL9 A; 3PW5 A; 4RPY A; 3UMB A; 4R63 A; 3QE9 Y; 4J9O A; 3PR5 B; 1QQ7 A; 3ONN A; 5AHX A; 3EZ5 A; 3T5H A; 2HBL A; 5KFN A; 1NOM A; 3M8R A; 5AKY A; 1F44 A; 2IHN A; 1V9P A; 1T8E A; 2DGZ A; 3V7J A; 4DSE A; 1L7O A; 2KIC A; 4O0I A; 1OW5 A; 3BQT A; 7ICL A; 3RBD A; 1NZB A; 4Q8F A; 4F5R A; 7ICR A; 1UT5 A; 1ARO P; 4UBB A; 1A0P A; 4QZA A; 1KEJ A; 3WK4 A; 3M9M B; 2RDJ A; 4M6W B; 5B5E U; 2K8B B; 2BPC A; 3QUB A; 4P0Q B; 4J03 A; 5KFA A; 2L5Y A; 5KT2 A; 5DG9 A; 3JPN A; 1Z19 A; 3BS5 A; 1BNO A; 4IQT A; 2FJ6 A; 3WKB A; 5DBB A; 3ZD8 A; 5FP0 A; 8ICJ A; 5KL8 B; 4Z6C A; 4NJ8 A; 5AK3 A; 4ECR A; 2W3S A; 2H3Z A; 3G6X A; 2ZIV A; 1MQ3 A; 3CP8 A; 3HW8 A; 3Q8K A; 4FBT A; 5L1I A; 1QTM A; 2RLT A; 3OTQ A; 4C0Z A; 9ICA A; 5AKG A; 2HBJ A; 1JXE A; 4GFJ A; 2ISP A; 2ASD A; 1RZT A; 5AM2 A; 3GIK A; 2F77 X; 3C23 A; 2PXI A; 4QW9 A; 1TVA A; 3KHH A; 1PVQ A; 3AMZ A; 5KG7 A; 2XVT A; 3ZDD A; 2N1R A; 5KG2 A; 2ZUB A; 2QKQ A; 5CP2 A; 5T14 A; 1NKC A; 4YR2 A; 5JUM A; 1U48 A; 1CUK A; 2XI9 A; 3EWA A; 1ZQL A; 4EYI B; 1CEZ A; 1Q46 A; 2Q4T A; 4KLD A; 2A1J B; 5J0Y A; 2YN4 A; 2Y9U A; 2ZIW A; 2GOL A; 2CN1 A; 4NY8 A; 5ALJ A; 1KDH A; 5F3X B; 1LKY B; 2PI4 A; 3V6H A; 3C2L A; 5J0P A; 1SZP A; 3HKZ C; 3K75 D; 1FFU A; 3CNH A; 3Q8L A; 4KLH A; 3MAB A; 5AKZ A; 3SD7 A; 3CYM A; 1ZQF A; 2MUT B; 5L1J A; 4DFP A; 2JH7 A; 3NVY A; 2G08 A; 1IM4 A; 3M8S A; 4QZE A; 4C7Y A; 1Z4O A; 4QWB A; 8ICN A; 5HML A; 2W9B B; 5CEH A; 3G6Y A; 2VJ5 A; 3ZD9 A; 3RJK A; 2BKE A; 4UAR A; 4UB6 U; 2I9G A; 3QUQ A; 4DL5 A; 9ICJ A; 1J2N A; 2LI6 A; 3IDW A; 3MDC A; 5ALD A; 1U9L A; 1S0N A; 5IIJ A; 2JZB A; 4DFM A; 9ICC A; 4CCH A; 4I2G A; 2OXO A; 8ICG A; 4XQ8 A; 4ED0 A; 4F4Y A; 1Z00 B; 4ZH4 A; 1Q3U A; 1S9F A; 2K60 A; 3BQ7 A; 3ICX A; 1ZQA A; 3IV6 A; 2YB4 A; 1LV5 A; 1L8O A; 4GXI A; 1T4G A; 5EE9 A; 2KV2 A; 4YMO A; 4CE6 A; 2CRX A; 2ZIU B; 2YML A; 4YN4 A; 1CRX A; 1AQ6 A; 2HBK A; 4EBE A; 2PKE A; 3CW2 C; 4RT3 A; 4YR3 A; 1WCL A; 3HPO A; 4YQW A; 5J2B A; 3QXG A; 4UAV A; 9ICX A; 2RQ5 A; 4BJQ A; 4RQ6 A; 4UW9 A; 2AQ4 A; 4IRK A; 3PR4 A; 5KT4 A; 1ZQV A; 2C22 A; 1ZJM A; 3IN5 A; 3IHQ B; 2W8L A; 1X9X A; 3SI8 A; 2ES6 A; 4M9L A; 5DDM A; 2EDU A; 8ICC A; 3T5K A; 3EW9 A; 3FDS A; 3EPG A; 4P0P A; 5KFK A; 1NK7 A; 3THV A; 2HHU A; 1MA7 A; 5J0X A; 2JEG A; 2HSZ A; 8ICT A; 3TAD A; 1BPD A; 3WK6 A; 1L3V A; 5HR6 A; 3RTV A; 3ISB A; 5HNK A; 3N7P D; 2E8N A; 2G09 A; 2E1E A; 4I28 A; 2DF4 B; 1TK5 A; 1RPL A; 4PGQ A; 4I27 A; 4X5V A; 1WUD A; 4P0Q A; 5KFH A; 5KFM A; 4F4X A; 4O3P A; 4KLU A; 3PVX A; 2OH2 A; 8ICI A; 3JPO A; 4QZH A; 2WHE A; 4QZD A; 4ACO A; 1U49 A; 4RQ0 A; 7ICE A; 5EE3 A; 2OWO A; 4QZ8 A; 3F5A A; 5L1K A; 4RQN A; 4QZC A; 1L6N A; 2KIV A; 2KZ3 A; 2BGW A; 3OJS A; 4DO9 A; 1URJ A; 4PJ0 U; 1N48 A; 2G07 A; 3K1R B; 3E2E A; 5AI5 A; 7ICN A; 1N56 A; 2LPE A; 3IP4 B; 4PL2 A; 5DLF A; 1QQ6 A; 1FO4 A; 1LB2 B; 1CI4 A; 3MR2 A; 2HMX A; 2W43 A; 2IMW P; 5ALR A; 1H38 A; 4F5Q A; 3EUB 2; 4NL9 C; 1NK6 A; 3TAN A; 2ZJ5 A; 4C8N A; 5DG8 A; 4RNM A; 1N5X A; 2QAR A; 4OO1 J; 1VLB A; 3QUC A; 4OJ6 A; 4O3M A; 3D2S A; 3PX4 A; 1ZYQ A; 1NK0 A; 8ICK A; 5J2K A; 4QZI A; 4DL3 A; 2Q0Z X; 4BXO B; 2W8K A; 3GU3 A; 3MR5 A; 2BPG A; 8ICX A; 4DF8 A; 4FZL A; 2XY5 A; 5AM5 A; 4KLM A; 4F50 A; 2DQN B; 1T3N A; 3F5E A; 5K4L A; 5D4B A; 4C8K A; 5J2I A; 1JRO A; 2NRW A; 3HX0 A; 4KLS A; 2LBO A; 4R8U B; 2KJ8 A; 1BNP A; 1NKB A; 1PVP A; 4YXM A; 3RH6 A; 3UXP A; 4FZM A; 4PPX A; 3H8S A; 3RB6 A; 1SL0 A; 1UT8 A; 4B6J A; 4M2Y A; 3PO5 A; 4RQ4 A; 2WTF A; 4CF3 A; 1L5U A; 1F0M A; 5AK4 A; 2KSO B; 4UAS A; 2ATL A; 4FS1 A; 3WK7 A; 2UVU A; 8ICB A; 1S10 A; 4FFD A; 2GO7 A; 2W55 A; 2H5X A; 3R9K A; 2YMQ A; 3RFA A; 2M0N A; 3OPX A; 3HJE A; 4QJF B; 2B0C A; 2NRT A; 2W3R A; 5ALW A; 2KHV A; 1K1Q A; 1Q8K A; 2K4H A; 2FPM A; 7ICH A; 2IHM A; 4KMO B; 3T5J A; 1RM6 C; 2KOB A; 5ALT A; 3N7S C; 4RQ1 A; 1ZQK A; 2FLP A; 5HHI A; 4U6P A; 4ELT A; 1U4B A; 1TAQ A; 2WF8 A; 3BJY A; 5HP4 A; 2ZIX A; 8ICQ A; 2JHD A; 2IOH A; 3FM9 A; 5AI0 A; 2V4R A; 1NJY A; 2AGP A; 2O6K A; 1L3U A; 2W11 A; 1RG6 A; 1TFR A; 5D49 A; 5CB1 A; 4ECY A; 1F5S A; 3BQ2 A; 3OJU A; 2B21 A; 2UVW A; 3NUQ A; 5BOM A; 2H3F A; 2J6T A; 4UB8 U; 4UAY A; 3JPT A; 3TFS A; 3LVW A; 1V85 A; 4QNL A; 9ICL A; 4DSJ A; 2LM1 A; 2MRL A; 4AP9 A; 1TAU A; 2H3V A; 2LMR A; 3UMG A; 3LWL A; 2PFN A; 2EZY A; 3WKD A; 5J0S A; 3SV4 A; 1SIJ A; 1ZRM A; 5DBA A; 3KKA A; 5DBC A; 1MC8 A; 4F5N A; 1X9S A; 3OGU A; 3RH4 A; 4RUA A; 2AH5 A; 3AQF A; 3PW7 A; 3JPS A; 5L9X A; 4CNQ A; 3K1Z A; 1N2X A; 1RDF A; 4LJX A; 4P4M A; 1ZQX A; 3SAF A; 4EZ6 A; 3SAG A; 4U7C A; 3BS7 A; 1DGJ A; 3AUO A; 3LDA A; 5KT7 A; 3RB0 A; 2BR0 A; 4DQR A; 4DL6 A; 2NO4 A; 3PST A; 3KBB A; 2ISO A; 4ED3 A; 1ZQO A; 5KFW A; 4F2S A; 2DUY A; 1QLN A; 4C8M A; 3V7L A; 1S5L U; 8ICM A; 3OSN A; 3C1Z A; 4I2A A; 4UB2 A; 3JPR A; 2RP5 A; 4O5K A; 4O3R A; 3N97 B; 2H3Q A; 4NM1 A; 2WF7 A; 3SEI A; 4Q45 A; 3PX0 A; 5J0W A; 1ZQS A; 4KMU A; 3BZC A; 2E8O A; 3RB3 A; 1S0O A; 2KEY A; 5JRT A; 4MFA A; 4J9N A; 4RQ2 A; 5EE0 A; 1JX4 A; 1XU4 A; 5AIB A; 4Y2V A; 3VC8 A; 3OHB A; 4DEZ A; 2XO7 A; 1N5W A; 2NRZ A; 2BCU A; 5ALN A; 3H7I A; 2A19 A; 4UAU A; 5H2F U; 4ELV A; 1SXD A; 7ICI A; 2KZZ A; 4PHA A; 4NLZ A; 3TI0 A; 1D8Y A; 4DFK A; 4EX7 A; 3QU5 A; 1BPY A; 3RJG A; 1HJP A; 1SWW A; 1L8L A; 2HCF A; 4KX5 A; 5KFD A; 4OCZ A; 5J0Q A; 3ISC A; 2XY7 A; 7ICS A; 1D9D A; 4AYB F; 2Y1J A; 3PY8 A; 1KFD A; 1RQL A; 3ZDE A; 4F72 A; 4PL1 A; 1WWV A; 2GH1 A; 4NV0 A; 1COK A; 2F44 A; 4B9T A; 5AI8 A; 2W7O A; 3A0H U; 4I2B A; 5DGB A; 3C5G A; 1WG8 A; 5DB7 A; 3C28 A; 2KFZ A; 2ASJ A; 5J0T A; 3NRZ A; 1HIW A; 4F4W A; 8ICH A; 4B9L A; 3NVW A; 5EE1 A; 1SV0 C; 4Y2Y A; 3F2D A; 4ECS A; 2MAX A; 4TUS A; 5J2G A; 2ZJA A; 2F3N A; 5KG4 A; 4XA5 A; 1ZXI A; 1WWU A; 2RRD A; 1Q3V A; 2PI5 A; 1QH9 A; 5AIA A; 4OJ5 A; 2W9A A; 4JV0 A; 2UVV A; 2EZZ A; 3EPI A; 4DOB A; 1ZQC A; 5KT5 A; 4Y2X A; 4JV1 A; 2AGQ A; 1DOQ A; 1HUO A; 2K4E A; 1ZQT A; 3F2B A; 1L3S A; 1X6I A; 3ETL A; 4M04 A; 1D9F A; 2B6G A; 1ZQR A; 3PSI A; 2NYV A; 3PZP A; 4O3S A; 2KNJ A; 4UB4 A; 2HW3 A; 5CRX A; 1PK1 A; 2W54 A; 3S6J A; 4J9M A; 5D46 A; 1Z1V A; 4QZB A; 3KD3 A; 4BWM A; 2FDR A; 1IV8 A; 5J8Y C; 5J0O A; 2W03 A; 4RT2 A; 1JIH A; 2FLL A; 3IG5 A; 1OUQ A; 2ESE A; 4M0A A; 2LKY A; 3KZI U; 3PMN A; 4ED2 A; 2FI1 A; 2NO5 A; 4GC7 A; 4FZN A; 5J29 A; 3I76 A; 1JN3 A; 1ZQM A; 1U45 A; 3RJF A; 1JXL A; 2EZX A; 4F2R A; 4ECZ A; 5ALU A; 3NGD A; 4US8 A; 2HI0 A; 3C29 A; 1ZQW A; 5G5G A; 4I2D A; 1C7Y A; 1OXJ A; 5GTH U; 3Q8S B; 4MHV A; 3UXN A; 3OHA A; 4J9Q A; 3H8M A; 5KG0 A; 4TUQ A; 4UAT A; 4KLL A; 4C4T A; 4PGX A; 1YT3 A; 3M6K A; 2J6S A; 4O3Q A; 1ZET A; 2UVR A; 2LYH A; 4AYB C; 2Z7J A; 5J0U A; 1KQQ A; 3QU2 A; 1FEZ A; 1BGX T; 4GLX A; 2OM6 A; 4YXJ A; 2HHT A; 3AEV A; 3MGH A; 2FPL A; 1XO1 A; 2RHF A; 9ICQ A; 3TFR A; 1BVS A; 3E0F A; 4DQQ A; 1Z1B A; 3KFU F; 5ALL A; 4Y2R A; 1SB3 C; 2KKP A; 1GO3 F; 1VDV A; 3KZX A; 5AI6 A; 5DGA A; 2F1H A; 2FMS A; 4KIT B; 3PW4 A; 2ZTD A; 3OSP A; 4F92 B; 2DWQ A; 1SKR A; 2F8L A; 3H0R B; 4Y2S A; 1X66 A; 4MEX A; 4UAZ A; 5TIS U; 3AN1 A; 1K5O A; 2YMM A; 2YMP A; 4DL2 A; 5KL1 B; 3GV8 B; 1ZOL A; 4QZG A; 3T79 A; 4IR9 A; 5KFL A; 1O08 A; 1SKW A; 3UQ0 A; 1ZJN A; 4YMM A; 9ICE A; 5J2C A; 4PH5 A; 5KTQ A; 1NZP A; 4CRX A; 4G9B A; 2CPR A; 1V38 A; 2DKX A; 2AQ0 A; 9ICS A; 3HIL A; 5KG1 A; 2EAN A; 4GC6 A; 3QEA Z; 7ICT A; 1ZQI A; 5L1M A; 4B9M A; 4M47 A; 5J2E A; 5JTI A; 1M6Y A; 3MGI A; 4M6W A; 4M9G A; 3NTU A; 2JGA A; 2LHT A; 3UPQ A; 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3T5L A; 2OHF A; 4O3O A; 1Z00 A; 3BQ0 A; 8ICE A; 3MR3 A; 3IG8 A; 2E1F A; 5AIC A; 9ICU A; 3KHL A; 7ICF A; 3PX6 A; 1ZQD A; 1UA0 A; 1MQ2 A; 2YX8 A; 1Z3E B; 1PZN A; 2HOF A; 2ZIU A; 1NJW A; 2XGQ A; 4KLG A; 3DDH A; 5CHG A; 5KFP A; 4CF4 A; 4B9N A; 4RQ7 A; 2JMG A; 2R8I A; 3M1Y A; 4NM2 A; 3RAX A; 4KLQ A; 3QZ8 A; 3QUT A; 4NL9 A; 1J97 A; 4GXK A; 4ED8 A; 2BCS A; 9ICK A; 5ALF A; 5AM1 A; 2KTQ A; 5IIO A; 1O03 A; 1QSS A; 3QU9 A; 5ALZ A; 7ICQ A; 1KW4 A; 3WK5 A; 4BGD A; 1KBU A; 3RR8 A; 2C2R A; 3SZ2 A; 1NI3 A; 1TE2 A; 4KLT A; 2C2D A; 4UB1 A; 3LK9 A; 8ICO A; 3D2Q A; 3NRW A; 3H0M B; 3C1Y A; 2JXJ A; 5EWG A; 3SYZ A; 4M9J A; 5ALI A; 5KT3 A; 3C5F A; 4Z6F A; 5TZV A; 2H3I A; 3QU4 A; 3UM9 A; 2BQ3 A; 1PUZ A; 2ZIW B; 4F3O A; 4HAI A; 2AHO B; 1UHU A; 9ICH A; 1BPZ A; 4K4H A; 1IIP A; 5AKH A; 5DQG A; 1KFS A; 4J9L A; 4IS7 A; 2DPI A; 5DKW A; 9ICT A; 2I1Q A; 1EXN A; 5DQI A; 7ICM A; 2KJ9 A; 3V72 A; 4QZ9 A; 5KFC A; 4QWC A; 4KN4 A; 4C8L A; 4ED7 A; 2XIC A; 7ICG A; 4I29 A; 2IOF K; 2V9W A; 3KHR A; 1ZQY A; 4YMN A; 2HVI A; 4R64 A; 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