The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
53
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
Blocking the gate to ligand entry in human hemoglobin.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
53
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-06-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2D5Z B; 3ZJI A; 3D1A B; 3PT7 A; 5D5R A; 1MNH A; 3PT8 A; 2ZS0 B; 1MYI A; 1QXE B; 4F69 A; 3M38 A; 1DKE A; 1TES A; 2O5S X; 3PEL B; 4F68 A; 2ZSP A; 5CN6 A; 1QPW A; 2ZT4 A; 1VXA A; 1HLB A; 1YEV A; 2DC3 A; 3OK5 A; 1LH7 A; 1YG5 A; 1YHR A; 3B75 B; 3BJ2 B; 1R1Y A; 1FSL A; 1XZV A; 1Y5F A; 2AUR A; 2GLN A; 1F65 A; 1Z8U B; 2QLS A; 4HRR A; 3QJD B; 3ODQ A; 2ZLU A; 2ZSO A; 1SPG A; 2ZLX B; 1A4F B; 2NRM A; 2ZWJ A; 3AQ5 A; 1FAW A; 1THB B; 1C40 A; 2V1G A; 1C7C B; 1CH3 A; 4MQH B; 4NI1 B; 4NXA A; 1ABS A; 1B86 A; 2XKI A; 3MOU A; 3NFE B; 1GLI A; 3WCT B; 1YIE A; 5JGG A; 2LH3 A; 1G0A A; 1G09 A; 2GDM A; 3UHK A; 1XQ5 B; 3UHH A; 1RQ4 B; 1J3Z B; 1HBR B; 4MQJ A; 2GL3 A; 3O7N A; 1HGA B; 3M3B A; 1PMB A; 3NMM B; 4N7P A; 4KMV A; 1YEQ A; 1LA6 A; 1SWM A; 4BJA A; 4ZVA A; 1X9F B; 4G1V A; 3BA2 A; 1MBA A; 2ZT3 A; 2ZT1 A; 1VXD A; 1I3D A; 2ZLV A; 2H35 B; 3WCU A; 2D60 B; 2KSC A; 3UH3 A; 3GQR A; 1YH9 A; 1J41 B; 2FRK X; 2W6X A; 1MGN A; 2VLY A; 3PT7 B; 2MHB A; 3PT8 B; 1Y4P A; 1UVX A; 1A3O A; 5MBA A; 4U8U A; 2ZFO C; 1YMB A; 1F5P A; 1GBV A; 3QJE A; 1ECN A; 2B7H A; 3UHN A; 2OH9 A; 1DKE B; 1RPS A; 1Y83 A; 4H0B A; 1QPW B; 2LHB A; 5HY8 A; 1IRC A; 2GNW A; 3HYU A; 1QSH A; 5CN4 A; 3WFU A; 1DM1 A; 2BWH A; 2V1J A; 1AJ9 A; 3D4X A; 1YG5 B; 1YHR B; 1C7B A; 1DTI A; 3QQR A; 1HV4 A; 3S65 A; 1ECA A; 1MYH A; 1R1Y B; 2HHD A; 1XZV B; 1Y5F B; 2GRZ A; 3A5G A; 2ZS0 D; 1FHJ A; 3G4V A; 2QLS B; 4HRR B; 3ODQ B; 2ZLU B; 4IRO A; 2R80 A; 1SPG B; 1LH2 A; 1C40 B; 3AQ8 A; 1MLQ A; 1B86 B; 2O5L X; 5CN8 A; 2BMM A; 1GLI B; 1SHR B; 1OUT A; 3OGB A; 2ZSR A; 1KD2 A; 1UT0 A; 5JGG B; 1G09 B; 1G0A B; 2ZLW A; 5E6E A; 1Y31 A; 2MBW A; 3MYM A; 2W6W A; 4DWU A; 3UHX A; 1F63 A; 106M A; 4MQJ B; 105M A; 1Y8K A; 3K3U A; 3G4U A; 5EE4 D; 2DXM A; 5KER A; 3MJP A; 1DO7 A; 4N7P B; 2AV3 A; 1YEQ B; 3PI4 A; 4F6D A; 1BUW A; 1LA6 B; 1LHT A; 3D17 B; 4H2L A; 1YHU D; 1BVD A; 2DN1 A; 1AZI A; 1Y09 A; 1J3Y A; 3EOK B; 4MBA A; 1IBE A; 2IG3 A; 1S0H A; 1UMO A; 2ZLV B; 3WCU B; 4F6J A; 4M4B A; 2WY4 A; 3GQR B; 1YH9 B; 1MYF A; 3LR9 A; 3WCT D; 2MHB B; 4N8T A; 3S1J A; 5HBI A; 1Y4P B; 3UHE A; 1Y4Q A; 3G4W A; 1A3O B; 3E4N A; 4U8U B; 1J40 A; 3UHD A; 1GBV B; 3QJE B; 1M6M A; 2B7H B; 3SDN A; 4PQC A; 1MLL A; 1HDB A; 2BNL A; 1RPS B; 4UUR A; 4C44 A; 4FWY A; 5F2A A; 1Y83 B; 2R4Y A; 4ROL A; 2MGK A; 5AZQ A; 5KDQ A; 2R4X A; 4XDI A; 5HY8 B; 1Y4V A; 3HYU B; 1QSH B; 1O16 A; 3UHI A; 1DLY A; 3PI1 A; 1AJ9 B; 3D4X B; 2D2N A; 1X9F D; 1C7B B; 1NZ5 A; 1HV4 B; 3S65 B; 1NGK A; 1G08 A; 2HHD B; 1A6M A; 1XZ2 A; 3M3A A; 1BIN A; 3CY5 A; 2GTL A; 1O1J A; 1S61 A; 4HRT A; 5JDO C; 1FHJ B; 2GNV A; 1Y0D A; 4IRO B; 2W72 C; 2R80 B; 1R1X A; 1U7S A; 3HEP A; 1DWT A; 2SPM A; 1NEJ A; 1OUT B; 1HLM A; 1KD2 B; 3WCW C; 1O1N A; 1Y31 B; 2QMB A; 1DWS A; 2YRS A; 2LH7 A; 2ZFO A; 1FLP A; 2GKN A; 1D8U A; 2ZT2 A; 1Y8K B; 2DXM B; 1WLA A; 5KER B; 1NPF A; 3MJP B; 2XKH A; 3R5I B; 3ECZ A; 1BUW B; 2WTG A; 3GYS B; 3UHS A; 4N7N A; 1HAB A; 4H2L B; 2DN1 B; 1Y09 B; 5CNE A; 2LH5 A; 2DN3 A; 1J3Y B; 1BVC A; 3ASE A; 1IBE B; 5EYJ A; 1S0H B; 3UHW A; 2ZSS A; 1HAC A; 3UHQ A; 1RTX A; 5HU6 A; 5JDO F; 1X46 A; 4M4B B; 1YVT A; 1Y0T A; 4MU5 A; 2HBF A; 4N8T B; 1BBB A; 1XZ4 A; 1HBS A; 1KFR A; 1HDA A; 1GJN A; 1M9P A; 1J40 B; 3AQ9 A; 1HDB B; 1MYJ A; 3E55 A; 5ILP A; 1CH9 A; 4ROL B; 5KDQ B; 3HF4 A; 4MPM A; 1Y4V B; 2ZSX A; 1LJW A; 1MNJ A; 2D2N B; 3FH9 A; 3ECX A; 3WCU D; 3A2G A; 1NS6 A; 1G08 B; 1XZ2 B; 3ZJR A; 1GCV A; 2GTL B; 1O1J B; 3TLD A; 4G1B A; 3ZHW A; 3PI8 A; 2Z8A A; 4HRT B; 4U8U D; 1JDO A; 1Y0D B; 1HHO A; 1IDR A; 3M39 A; 1URV A; 1R1X B; 4TWU A; 4MAX A; 1Y45 A; 1S6A A; 4M4A A; 2M6Z A; 1LFZ B; 2QRW A; 4IT8 A; 1NEJ B; 2PGH A; 3BJ1 A; 5EV5 A; 2Z6N A; 2MB5 A; 3VRF A; 1O1N B; 2QMB B; 2MGG A; 3ARK A; 1V75 A; 2ZFO B; 2NSS A; 2MGI A; 5CMV A; 2LH1 A; 4UZV A; 3KMF C; 3DUT A; 3SDH A; 2RAO A; 4VHB A; 1RTE A; 1GZX A; 4N7N B; 1HAB B; 2ZST A; 3ZJO A; 1DUK A; 4MQC A; 2DN3 B; 3NL7 A; 1VXF A; 1YFF A; 2VLX A; 1HAC B; 4FWX A; 5HU6 B; 2HZ3 A; 1YVT B; 3EU1 A; 5M3S A; 1CBL A; 3WCV C; 1MZ0 A; 1Y0T B; 1YZI A; 2HBF B; 3P5Q A; 2HHE A; 1U7R A; 1Y0W A; 1BBB B; 1XZ4 B; 3G52 A; 1HBS B; 2MGH A; 1BZR A; 1HDA B; 1CH5 A; 2ZSN A; 1M9P B; 1MNI A; 1JL7 A; 1O1K A; 4MQK A; 1RSE A; 1Y8H A; 2ZLT A; 5E83 A; 3ARJ A; 1DO3 A; 1V9Q A; 3HF4 B; 1K1K A; 1Y01 B; 1A0U B; 1LJW B; 3UH6 A; 1HBG A; 2Z6S A; 1WVP A; 1HBB A; 3FH9 B; 2HBS A; 1Y7Z A; 2NSR A; 4F6F A; 1NS6 B; 1MLJ A; 3QM6 A; 4DWT A; 3A5A A; 1GCV B; 1QSI A; 3ZJS A; 4GZG A; 3PI8 B; 1YGF A; 3OO5 B; 3GKT A; 1HHO B; 2ZS1 D; 3UI0 A; 1A00 A; 3KUN A; 1Y45 B; 1S56 A; 1CPW A; 1VXC A; 4M4A B; 2M6Z B; 3UHU A; 1UFJ A; 2BK9 A; 2ZSY A; 1Y5J A; 2PGH B; 3BJ1 B; 3UHB A; 2W6V A; 2Z6N B; 3VRF B; 3A59 A; 3PI3 A; 4HSX A; 1MCY A; 1MYT A; 5EOH A; 1VRF A; 2D2N D; 1GVH A; 1V75 B; 1NAZ A; 3QM8 A; 3DR9 A; 1O1P A; 110M A; 4F6I A; 1IWH A; 2ZT0 A; 5KKK A; 3DUT B; 3V2Z A; 1CH1 A; 2RAO B; 5SW7 A; 1VWT A; 2GTL D; 1CP5 A; 1GZX B; 2AA1 A; 1A3N A; 4MQC B; 3NL7 B; 1CP0 A; 4HHB A; 1NWN A; 3GDJ B; 1OFJ A; 1XY0 A; 1YFF B; 3ZH0 A; 2DN2 A; 1MWC A; 4NK1 A; 5CN5 A; 2EVK A; 3EU1 B; 3HC9 A; 1YZI B; 2HHE B; 3P5Q B; 1Y0W B; 3ZJN A; 3OO4 A; 1NWI A; 1BIJ A; 1O1K B; 4MQK B; 1ECD A; 3ONZ A; 3AT6 A; 2R50 A; 1Y8H B; 7HBI A; 3G53 A; 3UH5 A; 4NXC A; 2ZLT B; 1CG8 A; 5E83 B; 1YVQ A; 4YU4 A; 3ZJJ A; 3E5O A; 2ZSQ A; 1UIW A; 4L7Y A; 2SPO A; 2MYE A; 1K1K B; 1LH6 A; 1Y4G A; 1EBC A; 3QJC A; 1HBB B; 2HBS B; 1Y7Z B; 1YEV B; 1GBU A; 1Y7C A; 3WCP A; 3KMF A; 1QSI B; 1MBI A; 1YGF B; 3DHT A; 3QQQ A; 1A00 B; 1JZK A; 1ITH A; 4O4T A; 3UBV A; 1YE0 A; 2O5M X; 3VAU A; 3UGZ A; 3IXF A; 1FAW B; 1Y5J B; 1DWR A; 3WCV A; 1C7D A; 3GQG A; 1N9I A; 4L2M A; 3H58 A; 3HRW A; 3A59 B; 2O5B X; 2V1E A; 4F4O A; 2G14 A; 3ECL A; 1J7Y A; 1YIE B; 1GDJ A; 1VHB A; 2HHB A; 2MGB A; 4AVD A; 1YEO A; 2ZS0 C; 1O1P B; 1GDK A; 1IWH B; 1XXT A; 1LFV A; 1MTJ A; 2V1H A; 1ABW A; 5SW7 B; 1MYZ A; 3WFX A; 1B0B A; 1VWT B; 2AA1 B; 1YIH A; 2NX0 A; 1A3N B; 1MWD A; 1BZ0 A; 1PBX A; 3ZOM A; 5JOM A; 4HHB B; 3QM7 A; 3D1K A; 1CO8 A; 1XY0 B; 3WFW A; 2DN2 B; 2BKM A; 1EWA A; 2D2M C; 3IC0 A; 1MBC A; 1F5O A; 3WFT A; 1NZ3 A; 1SDK A; 1BZ1 A; 1IT3 A; 1A9W E; 1FDH A; 5EE4 C; 1HBI A; 3U3E A; 1YHE A; 3OO4 B; 1BIJ B; 1VXE A; 2ZFB A; 3LB1 A; 3ONZ B; 1BZP A; 3AT6 B; 1CG8 B; 1YHU C; 1JW8 A; 1YVQ B; 2R4Z A; 4YU4 B; 1UIW B; 1S5X A; 3G4Q A; 4L7Y B; 1N9H A; 3QZX A; 1YOI A; 1O1I A; 1Y4G B; 1NIH A; 2BLJ M; 2QFN A; 1A6N A; 3VRG A; 3MN0 A; 3QJC B; 1HRM A; 3LQD A; 104M A; 3AG0 A; 1GBU B; 2V1I A; 4F6G A; 1J7W A; 1GDL A; 1Y7C B; 3WCP B; 2ZSZ A; 1IRD A; 4SDH A; 3E5I A; 4X0L A; 2G12 A; 2XKG A; 3DHT B; 3VHB A; 2QU0 A; 2V1K A; 2GKM A; 4PQ6 A; 1YE0 B; 1JL6 A; 2XYK A; 1Y4R A; 3PI9 A; 1X9F C; 3GQP A; 2VEB A; 1L2K A; 1C7D B; 5B84 A; 3GQG B; 1JPB A; 3UHG A; 1RQA A; 1LH3 A; 3HRW B; 1LFT A; 3GLN A; 1Y4F A; 3QM9 A; 5CHQ A; 4F4O B; 2LH2 A; 3GKV A; 4KJT A; 1SI4 A; 1HGB A; 2ZLW B; 2HHB B; 5E6E B; 1YEO B; 6HBW A; 2D6C A; 3NG6 A; 1ABY A; 1XXT B; 1LFV B; 2G0R A; 1EBT A; 2MGJ A; 1ABW B; 2W6Y A; 4MQG A; 1YIH B; 1Y0C A; 1BZ0 B; 2R4W A; 1ASH A; 1PBX B; 3G4R A; 1LH1 A; 1MKO A; 3D1K B; 1JF3 A; 1J7S A; 3GOU A; 3IC0 B; 1OUU A; 4MXK A; 1DXD A; 1SDK B; 1BZ1 B; 5JDO E; 1IT2 A; 1VRE A; 1J52 A; 1YHE B; 2EKT A; 1Y4Q B; 2ZFB B; 5CND A; 1BZZ A; 2OHA A; 1KR7 A; 1A9W A; 2AV0 A; 1HBA A; 2MGC A; 1XYE A; 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1MLS A; 1BZZ B; 1CMY A; 1AJG A; 3QZZ A; 3OJ1 A; 4NZI A; 5AZR A; 1HBA B; 1XYE B; 2W72 A; 1V4U B; 1Y8I A; 1LFY B; 1X9F A; 3VRE B; 5CN7 A; 3BCQ B; 1HGC B; 2FAL A; 103M A; 1Y7G B; 1SDL B; 4ROM A; 2QSP B; 1MNO A; 1OBM A; 1QXD B; 2R1H B; 5B85 A; 3IC2 A; 2Z85 A; 1HCO A; 3FS4 A; 3WCW A; 1UC3 A; 3S66 B; 3S1I A; 3LHB A; 3MKB B; 5C6E A; 1DXT A; 3AT5 B; 3UHT A; 3HXN A; 5F0B A; 3D7O B; 4PNJ A; 2VEE A; 1YGD B; 1G9V A; 3BJ3 B; 1O1O B; 4HBI A; 1YEN A; 1MLR A; 2H8F A; 1HJT A; 2QSS A; 1JZM A; 1NXF A; 2G0V A; 1W92 A; 3WR1 B; 1UFP A; 1DXV A; 5EET A; 1J3F A; 4MQI A; 3UHR A; 1RVW B; 3A5B A; 1S5Y B; 2MGD A; 1UX8 A; 2D2M B; 3ZOL A; 2EB9 A; 3ZJP A; 4H07 A; 2HBE B; 1CG5 B; 2G0S A; 1GCW B; 1Y5K B; 1MTK A; 1Y22 B; 4FH6 A; 1MLO A; 1NZ2 A; 3OVU C; 2ZS1 C; 2NRL A; 1YHU B; 3RJN B; 1DUO A; 1A6G A; 1MLU A; 1YMC A; 2FRF A; 2FAM A; 3MJU B; 5EU2 A; 4KMW A; 1FN3 A; 1YEU B; 3ZJQ A; 1CQX A; 1HBH B; 5C6Y A; 3O89 A; 1CQ2 A; 1SHR A; 1LHS A; 3LB4 A; 3GK9 A; 4NK2 A; 2D2N C; 3HEN A; 3QMA A; 3OZU A; 1CH4 A; 2MGF A; 5CHR A; 1QI8 B; 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