3NOFA

Mycobacterium tuberculosis thioredoxin c c40s mutant
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
b'SATIKVTDASFATDVLSSNKPVLVDFWATWCGPSKMVAPVLEEIATERATDLTVAKLDVDTNPETARNFQVVSIPTLILFKDGQPVKRIVGAKGKAALLRELSDVV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin TrxC
publication title Structure of Mycobacterium tuberculosis thioredoxin in complex with quinol inhibitor PMX464
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule tags Electron transport
total genus 31
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3nofA00
4WBRD 4DSSA 3F4TA 3HVVA 1YF1A 4MZBA 1TRWA 3F0IA 4KX4A 3I43A 5ID2A 1I5GA 1XPVA 1TRVA 3KTLA 5IM9A 2IMFA 5LNKe 5DAKA 4LL4B 1X5CA 2MBTA 1T8EB 2A2RA 1TOFA 4OFMA 4HJ2A 2JZTA 4IELA 1FG4A 2XC2A 1Z7RA 2H0GA 4J2FA 4K7IA 3TCOA 1SYXA 3ZITA 2X8CA 3TB2A 1TK0B 2PU9C 4ULXA 2P5QA 3MDKA 2YV9A 3CRTA 4KDYA 1URMA 4KCEA 1O81A 2WJUA 3GURA 1OC9B 2VUPA 2FUG2 4V1Ag 3DRNA 4AGSA 3KP8A 1F3BA 3VWWA 1GLPA 2I9HA 4OCFA 1BYEA 1GUHA 4POKA 2AB6A 3FHKA 5LD0A 3IXRA 4OMVA 1WWJA 5CRDA 1PRXA 2DJ3A 1WPIA 2LTKA 2WCIA 3FZAA 6GSTA 3H1NA 2NPBA 1WOUA 5IMVA 2E2MA 2IMDA 2TRCP 4EE0A 1A2LA 1NHOA 3KM6A 5LCZA 2H66A 3IR4A 5GAND 3UBKA 4HOJA 22GSA 4ZB8A 4EO3A 3KD0A 2V6OA 1M2BA 2XBIA 2CX4A 1Z3EA 2ZUPA 3GKNA 5HR1A 3GUSA 2OADA 2KP1A 2OJLA 4QQ7A 3FZ4A 4KB3A 3QAWA 3NIVA 3CYNA 3QFAC 5C04A 1KEBA 3VI5A 1TKDB 2IMEA 1X5DA 3AY8A 4CDOA 1VF1A 4ZIJA 4NPBA 2M80A 3DGQA 3TDGA 4FYUA 1O8WA 1W89A 2VCXA 1XWGA 3WGDA 2OACA 2GLRA 4TR4A 2AJQB 5ECHB 4XS1A 1GLQA 3F8UA 3HZ8A 1UC7A 5A5KA 3FW2A 3ZL5A 4WBJA 3EURA 2VD1A 3D22A 2L6DA 1S3DA 1T7PB 1TDIA 1JZDA 3HJPA 1PN9A 4FIWA 2H30A 2QC7A 1QFNA 1GH2A 2VO4A 2DMLA 5D8IA 1Y25A 4WKWA 2HNLA 3Q18A 1AAZA 2ZNMA 2FWFA 3IHQA 2IMKA 2E0QA 2VL2A 1FHEA 1PQNA 3KCMA 1PKWA 1ILOA 2B7JA 1TK8B 2YWIA 1AQXA 2OBKA 1Z6NA 3ZMKA 3UJ1A 3OR5A 1PKZA 3L0HA 1QXHA 4N0VA 2P0GA 1Z7PA 4IVFA 4MJCA 5GAPD 3TJBA 5AIXA 2I3YA 1GSUA 4YQVA 4HDEA 5H5SA 4G2EA 5ID2B 1V57A 1XBSA 3A2XA 1QUWA 3TJGA 1MEKA 5DAKB 3PGTA 3DKSA 3VK9A 4JU5A 1HNBA 3TRPA 2KOKA 3APQA 4XS6A 5J4UA 3QFBC 3HVSA 1KNGA 1QMVA 3IBHA 5COHA 1JZOA 1M2DA 1GRXA 3ZVJD 4PGTA 6GSXA 3ZIJA 2HXKA 3EMXA 4L0WA 5CAXA 1JLVA 1T4YA 3M3MA 5DCHA 1JFUA 1GUMA 3ERWA 3ZRDA 4ZL9A 1TU8A 3LQ7A 2CA8A 3LWAA 1JZRA 2P5RA 3APOA 5GSTA 1OE8A 3F4RA 4DVCA 4GSTA 3ZZXA 3CXGA 5HFGA 1T1VA 3FR6A 4N10A 2KHPA 1GL8A 1MD4A 6GSWA 3HVXA 5IO0A 1GTAA 1XW9A 2MMNA 1FB6A 4AJ8A 4WXTA 1OVNA 4LLRA 5D9XA 5KEJA 3HDCA 4MK3A 1B4PA 2ON5A 4V2NA 4ZL8A 4O7HA 1GSYA 1EOGA 2CVDA 2H73A 4TR3A 5IQYA 1CQGA 4GCIA 4IP6A 5KN0A 2L6CA 4MJAA 1V58A 3LG6A 1KBNA 4IGJA 1T4ZA 3WT1A 1TI3A 4KNDA 3FYGA 4AJ7A 2DJKA 4IHUA 3UIWA 1R7HA 1SJIA 3DMLA 2O8VB 2EIQA 2GVPA 2YANA 4RI7A 2R37A 2M46A 19GSA 2H75A 2CT6A 1N8JA 4EF0A 1M0UA 3CBUA 3BOAA 4EUYA 4EXJA 4FO5A 1YF0A 1FOVA 5B7CA 1OAZA 1K3OA 3L78A 2E7PA 2YWOA 3GIXA 1GSSA 2HRFA 4XRDA 1X9WB 1R5PA 2Z9SA 3A2VA 2CAIA 1XWCA 4D73B 2VLUA 2A4VA 3ZVJA 4ID0A 2C0GA 1PSQA 3APSA 3A2WA 2AYTA 5IOWA 4F03A 3KH9A 4Z7XA 1EV9A 3IA1A 2X64A 4MH2A 1ZYEA 3HKRA 4OFNA 4IJ3A 1YY7A 1K3YA 2B6MA 3L9SA 2OE3A 4JZQA 3GSSA 1TXXA 4HUAA 3HXSA 4KDXA 4K0NA 4LA1A 1EOHA 3P8WA 5KN1A 2BJXA 2L4QA 5CO3A 4EDYA 3FRCA 3LFLA 2H76A 4G10A 2I1UA 2O89A 4GLTA 2YP6A 4POBA 2GZYA 3O3TA 3Q74A 1SL1B 5D9WA 2IWTA 1SK0A 4L0UA 20GSA 1BX9A 3RHCA 2DJJA 3BCIA 4AF2A 2GSTA 3QOUA 4BPYA 2GT6A 4GTUA 1DUGA 5G5FA 1HQOA 2JL4A 3S9FA 3D6IA 4RQXA 3GTUA 3ZIVA 3L9UA 5JCGA 1M9AA 2H72A 3JCML 4MF5A 3RPPA 3LGCA 1EP8A 2PBJA 1EWXA 1EEMA 4ZXGA 2LUSA 2RLIA 14GSA 3E0UA 3M9KA 1EZKA 18GSA 3IK9A 2YJ7A 1ERUA 3A5WA 4TW5A 4IS0A 1YEXA 1XWAA 2MBSA 5J5NA 1ZCPA 3SWLA 1AIUA 2EIRA 3D0ZA 2F8AA 4KW6A 1A23A 2NVLA 2G0FA 1CQHA 3UOMA 2R2JA 5ELAA 7GSSA 1MD3A 2PVQA 3TRQA 5FWGA 4K7NA 4L5LA 1MDIA 2OE0A 4G19A 2C3QA 3UVHA 4ZBDA 1DBYA 1XWBA 1ST9A 1SJZA 4YQUA 1E6BA 4O32A 3CSHA 4JE1A 4P3YB 5ENUA 5DBQA 4HEA2 2E2GA 1Z6MA 4X43A 2KUCA 4NAXA 2DJ0A 2HZEA 1X9MB 2DJ2A 2B7KA 4F0BA 2VAFA 4MF7A 3HZ4A 1Z5YE 4L5OA 2I81A 1FAAA 1FB0A 5KN2A 5J41A 3QPMA 3EMPA 1NSWA 2QKEA 5IMFA 4MF6A 4NMUA 3W8JA 2C1YA 3GX8A 3TKQA 2GQMA 2WDUA 5H5RA 2OBIA 2F8FA 3G7IA 2GT5A 5J9BA 4MDCA 4MA9A 2FA8A 4KSMA 1B9YC 4JR6A 3CTFA 1O85A 1RW1A 3DIEA 3ME7A 2G2QA 2H6ZA 3FR9A 3DEXA 2H1DA 3ZMLA 4EC0A 1F3AA 2LQQA 2CX3A 11GSA 2VCTA 2DIYA 2HSHA 3UAPA 5AN1A 3E9JB 2FNOA 4TOPA 4F2IA 5IMZA 5JWRB 5DDLA 1K0OA 2P31A 4IP1A 3V1WA 3KMNA 1K0CA 5AISA 5DALA 2X8HA 4N0ZA 3ZREA 2VIMA 2IN3A 5JWOB 2PN8A 4GXZA 2GQKA 2V1MA 4O5RA 5ECPB 4BWQA 1UN2A 9GSSA 3RBTA 5CRGA 2F3MA 4DEJA 5ABRA 4GSNA 1YKAA 4HQSA 3MAKA 2FY6A 2VLTA 4JEDA 4CW9A 5HQPA 5CREA 3ERFA 1TRUA 3LEFA 3J7Yb 4WR4A 1ON4A 3DD3A 3H79A 2MMZA 3ZFLA 1PMTA 3ISOA 3R2QA 4X1UA 1O6JA 4IKHA 2VM2A 3HA9A 2ALBA 1DSBA 3GTUB 4CHSA 2C4JA 5F8BA 1ZMAA 1G7EA 2XHFA 2YPMA 4D73A 2PPTA 3UEMA 3IC4A 2K6VA 1X9SB 5AIVA 2J23A 4ML1A 4TVEA 2LJKA 4GQFA 4KAEA 2C80A 4ML6A 3LYKA 1QK8A 1THOA 1F2EA 3IK7A 4K6XA 2LRCA 3WGEA 1DE2A 1SD9A 4J56E 4YAPA 2I4AA 1M2AA 1X5EA 1K3LA 1XW5A 1OE7A 4MP4A 2C0FA 4Q5NA 3UBLA 2OKAA 5A4WA 3LYPA 2QSIA 2B1KA 4ZB6A 3GMFA 4IJIA 3F3RA 3KEBA 5DVBA 4I97A 1JLWA 4GSSA 1WRYA 4WF5A 3HHVA 1GP1A 3F4SA 1MDKA 1VGLA 2GZZA 2IL3A 2GZPA 2XBQA 4HU7A 2WZ9A 4K2DA 1R5AA 2HFDA 3KZQA 1HD2A 2LKUA 5F0GA 2HZEB 2GS3A 2HZFA 2J9HA 1GTIA 2GSSA 5IPHA 2VL9A 4KA0A 5FHIA 1SKWB 4GQCA 3CTGA 1FO5A 3BJ5A 5INYA 1J9BA 1G6YA 3VWXA 2MMAA 2BTOT 3HCZA 1YKCA 2PUKC 3GKXA 1XOBA 3TJKA 2ZCTA 2H8LA 3UMAA 1YDKA 4I2UA 2EIOA 1BJXA 4MPFA 3ZLPA 4E8HA 3N9JA 5D96A 1DE1A 4V1Ap 5ECOB 2PERA 3TRXA 1R4WA 5CP1A 5B8BA 4IN0A 4YQMA 3DXBA 1TI1A 1XXUA 2FD3A 4NWYA 5JCWA 4PX1A 1F37A 2VCQA 3L4NA 3GH6A 3EWLA 1OKDA 2PMTA 4ZB9A 3GFKA 1V2AA 3PH9A 4LMWA 1ABAA 4EDZA 5DALB 2LJRA 1E2YA 1KTEA 3GL3A 3ME8A 4DSRA 1U88A 4BVXA 1BEDA 4WETA 2ES7A 1PX6A 1EEJA 2IMIA 5DQSA 2N5AA 4Q5QA 4OWYA 1MTCA 2YCDA 5ECSA 3D4MA 3O76A 1GNEA 2HT9A 5HR2A 1EP7A 4HI7A 1S3CA 3O6TA 2H19A 3PR8A 1C72A 3VFIA 2LRNA 3UARA 3VWVA 3VWUA 1A8LA 4BA7A 5IOXA 4TN8A 1YJ6A 3GA4A 3BCKA 2LSTA 3A3TA 2WS2A 3WGXA 2YZUA 3EC3A 5A4VA 2AHEA 3QCPA 2YNXA 5CRWA 2EC4A 5ECMB 2H70A 5IMAA 1ZL9A 2JSYA 1B9XC 1K0BA 3GHAA 1XIYA 4MCUA 5A4UA 4ECJA 1TJDA 3WD6A 2DMMA 1HNAA 2HLSA 2VCVA 3ED3A 3PINA 1S3AA 4PQ1A 2YWNA 4KE3A 5EVOA 16GSA 4MABA 1NW2A 1SKSB 1Q4JA 3C73A 3TKSC 2DC5A 1XW6A 2H1BA 4LL1B 1TU7A 1U3AA 1ZYQB 4ZILA 1EV4A 4TR0A 3F3QA 4LMVA 3HYPA 1WMJA 2X99A 1VF2A 1WP0A 3CMIA 1SENA 2DSAA 4G9HA 4PQIA 3W8SA 5J3RA 1A2MA 2VLVA 1USBA 3C8EA 3U6VA 5AGYA 2HYXA 5G30A 3GKMA 1K0DA 4JBBA 1O73A 1WE0A 2JU5A 4ILFA 2FWEA 1J0FA 5IO2A 4ZBAA 5EPFA 5D93A 1AQWA 1ML6A 1AC1A 1ACVA 4RUVA 3QD9A 4FYCA 12GSA 5F05A 1SK1A 4JRRA 2FWGA 2MMOA 6GSVA 4NV5A 2GGTA 2N5BA 4POMA 1NM3A 1Q98A 1N2AA 1BAYA 2KLXA 3M0FA 4XS4B 2GSQA 3DVXA 1GUKA 3IAS2 2LRTA 2H74A 2TRXA 3US3A 1EGOA 4BWSA 1A2JA 5D9TA 4Q5RA 4HZ4A 2GTUA 1FVKA 4F0CA 5HFKA 2VOCA 5EY6A 3TUEA 5ECNB 4GWRA 4TXOA 4K9ZA 5CNWA 2CZ3A 2O87A 4EKZA 1ERWA 3NZNA 4L8EA 1UVZA 3IV4A 1YZXA 3C1SA 4IW9A 2YJHA 4PUFC 3GN3A 1GSDA 3RHBA 2H0IA 4GRFA 3HJOA 2H1AA 3D4TA 4ZBBA 5IMDA 3DWVA 4MJEA 4TR1A 3J7Yk 4HU9A 4MH3A 2CQ9A 3GX0A 3KGKA 4WR5A 3RDWA 1SYRA 1A0RP 4POLA 2B5YA 2K9FA 4H86A 5F06A 2VD0A 1QQ2A 4IQAA 1J08A 1JHBA 3H4KA 1HNCA 1A0FA 3EYTA 1MDJA 3ZYWA 3VLNA 5GSSA 1O7UA 3IE3A 4MLYA 4QL9A 3EE2A 4X0XA 3EU4A 1FVJA 4PNFA 4OD7A 1GSEA 1XVQA 1OYJA 2RIIA 4XRAA 4XIHA 2D2ZA 4MZWA 3ERGA 5B6MA 2JADA 3VPQA 2DIZA 5F07A 4KCAA 4I8BA 1Z9HA 5L71A 1B48A 4HS1A 5J9CA 3FK8A 2GDRA 2NBSA 1XFLA 2VCWA 4GF0A 3HY2A 2CAQA 1IYIA 3FZ9A 5DCGA 4ISDA 4FYBA 2L59A 1BQ7A 1XOAA 5ELGA 1TTZA 3TOUA 2B1LA 2K8SA 2K8VA 3MWHA 1WJKA 4HZ2A 3U5RE 2B5XA 1PD21 5JWQB 3P2AA 3LXTA 3G9BA 2RM6A 1B8XA 1R26A 1VF3A 3TOTA 2N5FA 10GSA 3I9V2 1K0NA 1ZZYA 2R6KA 2YWMA 2AV4A 4K7OA 3UVTA 5JCUA 1TP9A 2X8GA 2VL3A 3I69A 3GRXA 2IFQB 1VRSD 4F9ZA 3C71A 1GSFA 2AUVA 1ZOFA 4OO4A 1LU4A 2CVKA 3GKKA 3D5JA 2CZ2A 1WIKA 3GH9A 1GSQA 3GV1A 4IQ1A 3QR6A 2LJAA 1BG5A 2O85A 3KXOA 5ECLB 4V2MA 4JR4A 2DJ1A 1ERVA 1JZWA 1LJRA 5B6NA 4PXOA 3TKPA 1F9MA 2WULA 3M1GA 3IRAA 2L4CA 3FY7A 1EGRA 3E3EA 4TXOB 2YZHA 4F82A 2HSYA 3EU3A 2FLSA 3FZ5A 3LXZA 1YQ1A 2WFCA 3H8QA 4TKYA 4ZL7A 4K8MA 1THXA 3KIJA 4PURA 8GSSA 2XPEA 3EINA 2MZCA 2C3TA 3M8NA 2RUEA 3RAZA 3TJFA 4KSOA 5ECQB 2AAWA 3VURA 6GSSA 3Q6OA 4TR1B 5CYYA 4KUNA 3VI7A 2PGTA 3WYWA 4E8EA 4PNGA 2IIYA 5KN3A 4OO5A 3TKSE 3TGZA 1A8YA 4V2LA 1XCCA 4ECCA 4NHZA 1M9BA 4NV2A 3D21A 1SL2B 4XHMA 1IYHA 1UA5A 1SU9A 1OC8A 2V41A 4O92A 2LNSA 3F6DA 3N5OA 4DSSB 2PWJA 2TIRA 4HQZA 1TK5B 4XS4A 2MYGA 5G2ZA 3GL5A 5G1KA 1XVWA 5ECRB 2JZRA 4K0GA 4PUAA 3TJJA 4BVYA 3UL3A 3MNGA 1SKRB 2F9SA 3CSIA 2H0HA 1V40A 3ZFBA 1U6TA 2R3XA 4KDUA 2H71A 3QMXA 3VPTA 1ZGNA 2OE1A 2QGVA 3LJRA 4K1FA 2PVOC 4EL1A 1ERTA 1T3BA 2H1GA 2RM5A 3ZTLA 5DQYA 2R4VA 2VL2C 3QAVA 1FW1A 3F6FA 4N30A 3KJYA 1GTUA 4NXIA 5HR3A 3TKSA 4QL7A 2B3SA 1PL1A 4FH8A 2C3NA 5CRHA 3H93A 1M99A 2L5OA 3P7XA 2K18A 3GNJA 2F51A 5D9VA 4YH2A 5B8AA 2LNTA 5E4WA 1V9WA 1V98A 3F9UA 2C8UA 2FWHA 2FGXA 3G7JA 2FHEA 3QAGA 3DVWA 1F6MC 4J57E 3F63A 3IOSA 2YV7A 1SL0B 4YAVA 4OCEA 1H75A 2R5GA 3I6AA 17GSA 4DSQA 4ECIA 3GYKA 3IAM2 3GSTA 3MSZA 2KP2A 4RQRA 2A2SA 3Q19A 1AW9A 1RQMA 2WB9A 4TXVA 4EVMA 2V2GA 3NOFA 3C7MA 3L9VA 1U3IA 2V32A 1X0RA 5G31A 4ECBA 3TKRA 1AXDA 5G1LA 2LV3A 2H01A 1XZOA 1PA3A 5IIZA 1OC9A 1PL2A 1SJ6A 1VF4A 5HR0A 4NHWA 5IMCA 2DBCA 5H5QA 3FKFA 1M7TA 3KMOA 2JACA 2LS5A 2JSZA 1XWKA 3W6GA 3WT2A 3KP9A 6GSUA 2H6YA 2VM1A 4I6XA 5HFIA 1AUCA 4KGIA 1TW9A 3IPZA 2BMXA 2HE3A 3P90A 1NHYA 2OA7A 3KH7A 1I9DA 4I2TA 5G5EA 1LBKA 1PGTA 3EVIA 2REMA 1GWCA 2WGRA 2XPDA 3IDVA 1W4VA 5EL8A 3HJMA 4TRXA 5ECIB 4AJ6A 4WF4A 1OC3A 3LSZA 2GQLA 3FEUA 1O8XA 4BL7A 2IFQA 13GSA 5IPGA 3M9JA 2FA4A 1SD8A 1GNWA 1Y6EA 1GTBA 3G7YA 4HJMA 3FR3A 1G0TA 2M72A 3KTBA 4RI6A 2NDOA 2DLXA 4I5QA 4XTSA 1GULA 1TRSA 2ON7A 2HI7A 2RUFA 5ECKB 4PQHA 3CRUA 2IPAA 1G7OA 1YEPA 2H6XA 5E59A 2V6KA 2C0DA 3HD5A 3C1RA 4WEYA 2LQOA 5C00A 1A24A 1B4QA 2FCHA 1K0MA 2HRNA 1T00A 3LORA 3SBCA 4MPGA 4XCSA 4MMMA 2JZSA 4MZCA 2LEGA 2IJYA 6GSYA 2YN1A 3BD2A 2L57A 2NTOA 2CV4A 2B5EA 2O7KA 3CSJA 4OFTA 1QGVA 2C0EA 3RPNA 2YOIA 2VCZA 3QDNA 3K8NA 4Q5FA 1H4OA 2GSRA 4MJBA 1HYUA 1SK2A 2CVBA 5GZZB 3DYRA 1AQVA 4IBPA 4KH7A 5D73A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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