3NOFA

Mycobacterium tuberculosis thioredoxin c c40s mutant
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
SATIKVTDASFATDVLSSNKPVLVDFWATWCGPSKMVAPVLEEIATERATDLTVAKLDVDTNPETARNFQVVSIPTLILFKDGQPVKRIVGAKGKAALLRELSDVV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Mycobacterium tuberculosis thioredoxin in complex with quinol inhibitor PMX464
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin TrxC
molecule tags Electron transport
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 31
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3nofA00
1J08A 1DUGA 3DEXA 4HI7A 1ERVA 3HCZA 4F0CA 4V2NA 3A5WA 3QMXA 4XIHA 3G9BA 3L4NA 9GSSA 4P3YB 3GX0A 4IJ3A 1EOGA 4PNGA 2K6VA 4HUAA 3MDKA 1M2AA 2R37A 4TR1B 1XIYA 1U3AA 2FUG2 3HVSA 1O7UA 3QPMA 4IELA 4Q5RA 4MZWA 1BJXA 1TRUA 2HLSA 3DIEA 2HRFA 4Q5QA 1GUMA 2TRXA 2TIRA 3EINA 4HOJA 3V1WA 2ON5A 1VGLA 1ST9A 4JEDA 5ECPB 2IPAA 4F9ZA 2H6XA 1GH2A 5D8IA 17GSA 4KUNA 5DBQA 1MDIA 3EU4A 19GSA 1JLVA 1FOVA 3WD6A 3UVTA 5IMAA 1RW1A 1WOUA 1B48A 2H73A 1N8JA 3CSHA 2I1UA 2LJRA 2B1KA 4FO5A 1K0AA 2CAIA 5KN2A 3KCMA 4WETA 5F07A 5DALA 4KH7A 5KN0A 1GSUA 2ZUPA 2IL3A 1XW9A 5IIZA 1GLQA 3KGKA 5B6NA 1HD2A 1O81A 3I69A 2LNSA 4MF5A 2XHFA 1Y25A 3ZYWA 3ERGA 4TR0A 3KEBA 1K3OA 3P90A 4GWRA 4HQZA 2H66A 4JE1A 4XTSA 4L8EA 3Q19A 20GSA 2I81A 3QOUA 3HYPA 1TTZA 1K0DA 1PMTA 4ULXA 1G7EA 4I2UA 1C72A 2VM2A 1ZGNA 2VCXA 5GAND 2KP2A 1X5EA 4TXOA 6GSUA 2G0FA 5DQYA 4TVEA 4AGSA 5ECRB 3HJOA 3GUSA 1EZKA 2I4AA 4DSSA 5ELAA 3TJGA 2E0QA 4LA1A 4F0BA 2O85A 1LJRA 1JHBA 1K3LA 3FR6A 4NXIA 1F37A 1O6JA 5CRGA 3GSSA 3TRQA 2VLVA 4MK3A 2YPMA 5A4UA 2PBJA 1X9MB 1THXA 1QMVA 2KHPA 1M99A 2YANA 3VURA 2AHEA 4ZBBA 4PUAA 4WBJA 5F8BA 3GURA 1Q4JA 4OCFA 1OC9B 3KP9A 4TN8A 1FAAA 3MSZA 4KDXA 1GSDA 4FH8A 2ES7A 3M9JA 2O7KA 2K18A 3APQA 2RUFA 2C0GA 2YWMA 3LXTA 5HQPA 3IXRA 3CMIA 2DSAA 3ZMLA 1B4QA 2F51A 1I5GA 1R7HA 4TR3A 2X64A 1FO5A 1NHOA 2H74A 1V98A 2WRTA 3H93A 5DAKA 4KDUA 4IBPA 4L5LA 3TJFA 2KOKA 4ZBAA 2P5QA 2TRCP 5G1LA 4J2FA 1G0TA 2GZPA 4ML1A 1J9BA 4FYBA 5CRDA 3GKKA 1GSEA 3QFAC 2L4QA 5IMCA 2J9HA 2N5FA 5HFGA 2NDOA 3GX8A 1A24A 2R2JA 2EIRA 4MF7A 2BJXA 4GSNA 3Q18A 5B8AA 1V40A 3IV4A 2OE3A 4PGTA 3L9UA 4QL9A 2HSHA 5EL8A 4GCIA 3FY7A 3TKRA 1WE0A 3W8SA 1NM3A 1GSSA 1Q98A 5EVOA 2PWJA 2WS2A 4BL7A 2L4CA 1BG5A 2K8VA 2B5YA 5DCHA 3F3RA 3EMXA 1Z9HA 1PD21 2AB6A 3MNGA 1ACVA 1TRWA 2YOIA 3ZIJA 4QL7A 3LSZA 4OWYA 3D4MA 3KMOA 4G19A 3IRAA 2NTOA 4IN0A 1YQ1A 4L5OA 3A2VA 1FB0A 5L71A 3JCML 1AIUA 3GL5A 3ZFBA 2V2GA 3M8NA 1CQHA 1QK8A 2FCHA 4K7NA 1A2JA 3D0ZA 1ERWA 4CHSA 3DXBA 1SD8A 4IGJA 4NHZA 1LBKA 4MJAA 4TW5A 3FHKA 2XPDA 5HR0A 1AQVA 1KNGA 3D5JA 2CQ9A 2EIOA 2LJKA 2GSRA 3AY8A 2CZ2A 4MCUA 4N10A 6GSTA 1WJKA 3L0HA 1T00A 2XBIA 1QUWA 3DGQA 1H75A 4XS4A 2PMTA 4OFTA 2MMZA 1GULA 3IAM2 1M7TA 5ENUA 1PQNA 3IA1A 3P2AA 1KTEA 4EO3A 1Z7PA 2B1LA 1U3IA 3FYGA 3IAS2 3ED3A 4WF5A 1DBYA 3C8EA 4ZL7A 3J7Yb 1OVNA 1FHEA 1X9WB 1ZYEA 2V6OA 4BA7A 4E8EA 1PGTA 4IP1A 3H1NA 1YY7A 5AN1A 2LRCA 5J3RA 3J7Yk 5DALB 4HU7A 4MJCA 3TB2A 2E7PA 3EC3A 3S9FA 2R3XA 1ON4A 2PUKC 5JWRB 4ZL9A 1ABAA 3UIWA 3C73A 3C1RA 3IBHA 4FIWA 1BX9A 4X0XA 2ZCTA 4MZCA 3BBYA 4I97A 1Y6EA 1BEDA 1GSFA 2VUPA 3RAZA 5CP1A 2LQOA 2LRTA 2H75A 2IJYA 4KSOA 2HE3A 4LLRA 3TJBA 1ZZYA 2K8SA 2YJ7A 5H5RA 2IMEA 4QQ7A 2H70A 5J4UA 3TRXA 2BTOT 5JWQB 4KGIA 1R26A 5F0GA 2GT6A 4F03A 4WR5A 2JACA 1YZXA 1OC8A 3N5OA 4EKZA 2DIYA 4TXOB 2DJKA 2IWTA 2H1DA 2FWGA 5JCWA 1JZRA 3GIXA 5A5KA 2IMFA 2H0IA 3L9VA 1Z5YE 4NWYA 22GSA 5G31A 3FR9A 3QAWA 5C00A 4DSSB 3M9KA 4XRAA 2YWNA 5ECHB 2LS5A 4WEYA 1A23A 4ML6A 3ME7A 3O76A 2GT5A 3TKSE 4KNDA 3WGDA 1K3YA 5IO2A 2YCDA 2DBCA 8GSSA 2OKAA 2YNXA 1GTIA 3WGXA 3HKRA 3LORA 4KA0A 2GQLA 5H5QA 2DMLA 3ME8A 4IP6A 5HR3A 2PN8A 2HZFA 2VAFA 1XFLA 3CRTA 3ZITA 4G2EA 5DJMA 1K0NA 3GYKA 3UEMA 4FYCA 2FD3A 5FWGA 2K9FA 1EEJA 1A2LA 3GA4A 13GSA 1EOHA 1U87A 3GKXA 1KEBA 2RIIA 2M46A 2PPTA 1TU7A 4ZB9A 5FT3A 1EGOA 4K2DA 1GTAA 5DAKB 1S3AA 4POKA 4ECJA 4KB3A 4OD7A 3CRUA 2MBSA 1TDIA 1XWGA 2O87A 5IM9A 4GQCA 1VF2A 5F05A 2DJ2A 3MWHA 1G6WA 3WYWA 4V1Ag 5AIXA 5INYA 1HNBA 1SK0A 1O8WA 4O32A 5ID2B 1PKWA 1QFNA 1X0RA 2VLTA 4ZIJA 3GL3A 3FEUA 1O73A 1JZDA 5A4VA 2JSYA 2L5LA 5JWOB 4KDYA 4ILFA 5ECSA 4OO4A 10GSA 2NBSA 3F4TA 2DJ1A 1Z6MA 4OFNA 4IQ1A 1YF1A 2QC7A 5J5NA 4PNFA 2FNOA 2LQQA 5AISA 3VFIA 1F9MA 2N5AA 2VCQA 12GSA 5ECMB 2ALBA 1GSQA 1QQ2A 3FZ9A 1F3AA 2CX4A 2GDRA 1SU9A 2H1AA 2GGTA 4N0VA 3GTUA 3IR4A 5GSTA 1XOBA 4BVYA 3GH9A 3F63A 3CXGA 4F82A 2B7KA 1R4WA 1MDJA 1TW9A 3A3TA 4CW9A 1XCCA 3VI5A 5LCZA 1ZMAA 4LMWA 5FHIA 1UN2A 4MLYA 4MH3A 4V1Ap 2C0FA 4L0WA 2YV7A 5G30A 3UBKA 2GTUA 3F4RA 4XS4B 4ZILA 1SYXA 4JR4A 1K0BA 3TRPA 4MA9A 2F3MA 3LQ7A 5ECLB 16GSA 6GSVA 1ZL9A 2GQMA 1FW1A 1OKTA 3FRCA 1VF3A 1V57A 2PVQA 4PX1A 3D22A 5CNWA 2GVPA 5A4WA 1IYIA 5KN1A 2VOCA 1OKDA 1TJDA 4TKYA 1FVJA 1WIKA 2WULA 2GZZA 1GNEA 2P0GA 2VIMA 4WF4A 1J0FA 4BPYA 1A8YA 4KCAA 1PX7A 3UVHA 4GQFA 1YF0A 5IMZA 3F4SA 1SYRA 2CV4A 3FK8A 2CX3A 3SWLA 3ZFLA 1HNCA 1W89A 2WFCA 3CYNA 2AYTA 3ISOA 1MD4A 2X99A 4KCEA 3KMNA 1JZWA 4DSQA 2KP1A 5ECIB 7GSSA 3LEFA 2HT9A 2CT6A 2H30A 1XWKA 3LG6A 3HJPA 5HFKA 4XCSA 2X8HA 1U6TA 1AW9A 2VM1A 3N9JA 1A0RP 2JU5A 2R5GA 1UC7A 1XXUA 1S3DA 1HNAA 3KH9A 5D9XA 4G9HA 1PN9A 1XWBA 5ECKB 1SL1B 2HSYA 5ECNB 3HZ4A 3I9V2 5DDLA 2WJUA 5ID2A 3C1SA 2V1MA 3HVXA 4EF0A 2DJ3A 4K6XA 4WBRD 3KIJA 5CYYA 2C3QA 2MMAA 1Z7RA 3FR3A 1UA5A 3GKNA 2D2ZA 1F2EA 3BJ5A 4BWQA 4HDEA 5J41A 4DSRA 5G2ZA 2HRNA 5IOWA 1B4PA 4KAEA 2VCVA 2YP6A 3IK7A 3BCKA 1B8XA 2KUCA 2LJAA 2DC5A 2VL3A 5CO3A 2H6ZA 2V32A 3TKPA 4OCEA 4MPFA 2H76A 2M80A 4HQSA 3TJJA 1SK1A 2CA8A 1CQGA 1AAZA 5IMFA 3R2QA 3SBCA 1TK5B 3FZ4A 1JFUA 4NMUA 1ZCPA 2OE0A 4ACSA 3K8NA 2FA4A 2NPBA 5IO0A 4OO5A 4TXVA 2FA8A 3CTFA 5DCGA 3GHAA 4PQHA 2A4VA 1K0OA 3VI7A 3I43A 4EDZA 1O8XA 2RM6A 4AJ8A 4N30A 2FWEA 2AV4A 4E8HA 5DQSA 4EE0A 1NSWA 4HU9A 3HA9A 4XS6A 4WKWA 2JZTA 1BQ7A 2GSQA 1V9WA 2LKUA 4I5QA 4ZB6A 4KSMA 2KLXA 3CSJA 2H8LA 4JBBA 2FGXA 4RUVA 2C0DA 3KZQA 3Q74A 3FZ5A 5KEJA 14GSA 2YWIA 3F6FA 2QSIA 3U6VA 3GMFA 1A2MA 1AQXA 2LUSA 1GP1A 4YH2A 3KTBA 4DEJA 4LL4B 1YEXA 1WP0A 1YEPA 4O5RA 3BD2A 1OAZA 4MP4A 5G5FA 1PL1A 2HNLA 4YQUA 3GTUB 3WT1A 3EE2A 2DIZA 4HZ4A 5GZZB 3IE3A 2AJQB 1LU4A 4GLTA 5J9CA 4NV2A 1H4OA 5D73A 1MD3A 4ZL8A 2IMKA 3IK9A 1SKRB 2L6CA 4IS0A 2FWHA 3BOAA 4TRXA 1XVQA 2VCWA 3KP8A 3TKQA 3EU3A 4G10A 2I9HA 3KTLA 3VLNA 2Z9SA 3RHCA 1M9BA 4DVCA 1EV4A 3EMPA 4K7IA 1G7OA 2V41A 2LEGA 4HJMA 1T4ZA 4JU5A 1T7PB 4Z7XA 1FVKA 1PL2A 1F6MC 3GN3A 5COHA 4TOPA 5IPHA 1EP8A 1YJ6A 5B7CA 4V2LA 5ABRA 4GTUA 2RM5A 2L6DA 5D93A 2M72A 5CRHA 5LNKe 1BYEA 3A2XA 5J9BA 2HXKA 2F8AA 5HFIA 3FKFA 3KJYA 1T8EB 1TKDB 3U5RE 1YKCA 2FY6A 1VRSD 4EDYA 1YDKA 1Z6NA 4MMMA 2RLIA 4Q5NA 2JADA 4XHMA 2OACA 2F9SA 1AC1A 1W4VA 3F3QA 5DJLA 2F8FA 1URMA 1SKWB 4F2IA 4RI6A 5E4WA 2DJ0A 2H01A 2XBQA 3WT2A 1SL0B 3QR6A 5H5SA 3HVVA 1M9AA 1GWCA 4V2MA 3F9UA 3TCOA 1PKZA 2CVDA 3EWLA 3KH7A 3P7XA 3QDNA 4EVMA 1TXXA 1ZOFA 3TDGA 2LRNA 2B3SA 1VF4A 4IW9A 2PGTA 3GV1A 2YZHA 4KX4A 2C4JA 3GFKA 4ID0A 1JLWA 2RUEA 2E2MA 2VL2A 3P8WA 2E2GA 5AIVA 2IFQB 3TJKA 1NHYA 4H86A 5LD0A 1TU8A 4EUYA 4IKHA 1NW2A 5E59A 2H0GA 2OADA 2MZCA 5C04A 1TK8B 2X8CA 3GRXA 1YKAA 4YQVA 4K0NA 4KW6A 2VCTA 1ERTA 3GNJA 5DVBA 3TGZA 5JCGA 5D9VA 5KN3A 4JR6A 4POBA 1U88A 1TRSA 3PGTA 3PH9A 6GSSA 2C3TA 2XPEA 3ZVJD 2MYGA 2WZ9A 4PQ1A 3TKSA 5G1KA 1E6BA 3LWAA 4MZBA 3QFBC 3ZMKA 4RI7A 1EEMA 2HYXA 1SJIA 3QCPA 1EP7A 3F6DA 4N0ZA 4J57E 3DVXA 3W8JA 3UL3A 2LV3A 3G7JA 2VLUA 3VPTA 1M2DA 2H1GA 4OFMA 1FB6A 5EY6A 2GQKA 11GSA 2GS3A 4RQXA 4AF2A 2WDUA 2GSTA 1SJZA 4HJ2A 4EL1A 4POLA 2GSSA 1WMJA 4MDCA 4AJ6A 2HZEA 1V2AA 4JZQA 2C0EA 4O7HA 2ON7A 3DD3A 3RPPA 2YV9A 2JZRA 1PSQA 2JL4A 1HYUA 4EC0A 1ZYQB 4TR4A 2CZ3A 1XWCA 1T4YA 5CRWA 3DRNA 3C71A 1R5PA 1TP9A 5IMDA 5F06A 1JZOA 2V6KA 2LTKA 1AQWA 3ZLPA 4WXTA 3O3TA 3RHBA 3HDCA 3M3MA 4OMVA 4IHUA 1A0FA 5D9WA 4L0UA 3E0UA 3DKSA 2C80A 3ZRDA 1EGRA 2L5OA 3HY2A 1BAYA 4I6XA 5IPGA 1T1VA 2WGRA 4BWSA 4K8MA 4YQMA 2VD1A 3QAVA 1XZOA 18GSA 3F8UA 3ERFA 1K0CA 1ERUA 2QGVA 2JSZA 3QD9A 4MF6A 3NIVA 3DVWA 4LMVA 2VCZA 5ECOB 1EWXA 2YN1A 1IYHA 4O92A 2B5XA 4HZ2A 4NAXA 1GUKA 3HJMA 2R6KA 4MJEA 3ERWA 4YAVA 1OE8A 1EV9A 2VO4A 4AJ7A 5IQYA 1DE1A 5IOXA 3CBUA 3M0FA 3TOTA 4BVXA 2L59A 2X8GA 5ECQB 3IHQA 4ECIA 2YZUA 2O89A 4I8BA 1GLPA 4N11A 2H0HA 4J56E 3LXZA 2C3NA 1S3CA 3ZIVA 2A2SA 1I9DA 3OR5A 3PR8A 1TI1A 2EC4A 1XBSA 5D9TA 2CVBA 3VPQA 2B5EA 3EURA 3I6AA 2VL9A 1AXDA 1GSYA 2O8VB 1R5AA 1GRXA 2IFQA 4GSTA 1QXHA 1X9SB 4D73A 2FLSA 3VWVA 4K9ZA 4JRRA 4PUFC 3DWVA 3RBTA 3HHVA 1OYJA 1G6YA 3LYKA 1B9YC 4KE3A 4GSSA 3DMLA 4POMA 3VWUA 4TR1A 1GTUA 1DE2A 4XS1A 2CVKA 3ZREA 3LGCA 1SK2A 3FW2A 3IPZA 3H4KA 1XPVA 4LL1B 1MTCA 2G2QA 3D4TA 1Z3EA 6GSYA 1XVWA 4NHWA 2C8UA 2R4VA 1DSBA 1SD9A 4I2TA 1VF1A 1THOA 2N5BA 2MMOA 3EYTA 1TI3A 5ELGA 3UOMA 3UBLA 1RK4A 3KXOA 2JZSA 5GAPD 2VD0A 5G5EA 1WWJA 2DJJA 1MEKA 4ZBDA 1A8LA 1XWAA 4GF0A 1QGVA 2H72A 5EPFA 1X5DA 1F3BA 4IJIA 3E9JB 4K1FA 2AAWA 3EVIA 2BMXA 4K0GA 3W6GA 3H79A 1FG4A 4YAPA 3ZL5A 2PU9C 4Q5FA 1PX6A 2P5RA 5D96A 3CTGA 4EXJA 4GXZA 3G7YA 1B9XC 3LJRA 3FZAA 1SKSB 3IOSA 2A2RA 2MBTA 1SL2B 3BCIA 1RQMA 2HFDA 1WRYA 1WPIA 4PXOA 3US3A 3KD0A 3KM6A 3G7IA 1TOFA 4FYUA 3WGEA 2GZYA 4ISDA 3VWWA 2PVOC 4RQRA 3GH6A 3TOUA 4IQAA 4HS1A 4MPGA 3RDWA 2YWOA 2YJHA 6GSXA 1GUHA 2CAQA 1T3BA 3CSIA 3H8QA 1GNWA 2HZEB 3APOA 3DYRA 2IMDA 3A2WA 2OA7A 3HZ8A 2P31A 2LSTA 4K7OA 4ECCA 2OBKA 2H1BA 3HD5A 3L78A 3QAGA 2ZNMA 5CREA 2FHEA 1HQOA 2OBIA 3D21A 4NV5A 1K0MA 4PQIA 3F0IA 2IN3A 2H6YA 4MH2A 3APSA 5B8BA 3PINA 2B6MA 3NOFA 2WB9A 1M2BA 4MABA 3RPNA 2OJLA 2XC2A 1ML6A 5CAXA 2GLRA 1XW6A 3VWXA 4ECBA 4ZXGA 1OC9A 3HXSA 1AUCA 5IMVA 2NVLA 1GTBA 1PA3A 2H71A 3GSTA 3E3EA 1SENA 3M1GA 1OE7A 5B6MA 4NPBA 2FWFA 3LYPA 2DMMA 3UAPA 2MMNA 4PURA 3LFLA 3IC4A 2EIQA 1N2AA 4X1UA 2B7JA 3ZTLA 1GL8A 1TRVA 3UARA 2WCIA 4CDOA 1SJ6A 4MJBA 1M0UA 2IIYA 3L9SA 2OE1A 4IVFA 2VL2C 1MDKA 2C1YA 1XOAA 2PERA 1XW5A 3IDVA 1PRXA 2HI7A 2AUVA 4ZB8A 1USBA 3ZZXA 3UJ1A 2REMA 3D6IA 3C7MA 3Q6OA 3MAKA 6GSWA 5HR2A 2IMIA 4GRFA 1TK0B 4X43A 1V58A 2LNTA 2DLXA 3NZNA 5AGYA 1X5CA 2H19A 3UMAA 1O85A 5GSSA 3GKMA 1UVZA 4WR4A 4XRDA 1E2YA 3TKSC 3TUEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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