The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
SEALKILNNIRTLRAQARESTLETLEEMLEKLEVVVNERREEESAAAAEVEERTRKLQQYREMLIADGIDPNELLNSMAAA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
H-NS forms a superhelical protein scaffold for DNA condensation.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
DNA-binding protein H-NS
|
| molecule tags |
Dna binding protein
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| source organism |
Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
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| total genus |
29
|
| structure length |
81
|
| sequence length |
81
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-06-30 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | H-NS histone-like proteins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4ICG A; 1LR1 A; 1OV9 A; 3NR7 A; 2MW2 B; 1NI8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3SYQ A; 1YEW A; 3RYC B; 4LWS B; 4DV3 B; 1MAB G; 4CH5 A; 4NXN B; 5K1X A; 1AR4 A; 3N2G B; 2BSK B; 4MS2 A; 1W2B U; 4YJ2 B; 4CH3 A; 1S77 D; 4I4T B; 3D8C A; 1UPG A; 2DMX A; 2B5U A; 4NTX A; 1WJZ A; 3DC5 A; 3TCU A; 4U3J B; 4JI5 B; 3A2F A; 2OIG A; 4X62 B; 2QKA A; 1AJP A; 2UXD O; 1NVP B; 1XEQ A; 3DSQ A; 4GKJ B; 2XAJ A; 4RAI A; 2VQF B; 1R3J C; 4GX0 A; 3FX7 A; 1KU9 A; 4Q6G A; 3THO A; 3K5M A; 3L9D A; 4X88 A; 1GN6 A; 2KB1 A; 4MVZ A; 4QNH B; 4HNA B; 4QJF B; 4BW9 A; 2P67 A; 1HR0 O; 2F43 G; 2XOK G; 3LSS A; 2Q0A A; 2WLI A; 4P2Z A; 2ZM6 B; 1AI5 A; 1LUV A; 4B7K A; 2IJI A; 5EIB C; 4DR5 B; 1VQ4 V; 4K0K B; 4DRX A; 1FXK C; 4X8A A; 1EN6 A; 1Q6U A; 3CEI A; 4KL1 A; 4O4L B; 1I0H A; 4NXM O; 2OIE A; 3T1H O; 3L70 H; 3ZMV A; 5C93 A; 2UUA B; 3A0H Z; 4RQE A; 1F4M A; 5BMV B; 1K97 A; 5K1P A; 2WSS G; 4JI1 B; 2ADP A; 2AHY A; 4LFB B; 2AHZ A; 4GLX A; 5EK0 A; 1THZ A; 3N2K A; 1N32 O; 5IYD O; 5GW7 A; 1TUB A; 2YSU B; 3QTC A; 2GSM B; 4FLZ A; 1FAF A; 4NVP A; 2WLL A; 4I0X A; 4B3T B; 4J9Y B; 5H2F Z; 2W0X A; 2CTR A; 1RFY A; 4DR4 B; 3HKC B; 3ZCC A; 5JQG B; 1Y74 B; 2UUB B; 4YHH O; 2E76 B; 4EEQ A; 3ZIA G; 1Q81 W; 5BZB A; 4F4L A; 3LDD A; 2LP7 A; 3RYI B; 2WLN A; 4JI7 O; 1U97 A; 4FLV A; 1V54 C; 5KAF Z; 1ENV A; 5JCO C; 2OCC B; 2UXN A; 1RSO B; 4EFB A; 5CA1 B; 4DUY O; 4TUY A; 1J5E B; 2IH1 C; 4JPR A; 5B3S C; 4DV3 O; 4RQF A; 3BAB A; 3LUT B; 4X1Y A; 3APO A; 4NXN O; 2BE3 A; 2WA4 A; 2W6J G; 2IW5 A; 3BEH A; 1FD9 A; 4I5S A; 2R72 A; 1M56 B; 3EHB B; 2JS3 A; 4N21 A; 4ZOL B; 1NJI W; 1NQT A; 4JYY A; 3L75 H; 3P32 A; 2FB5 A; 3ABL C; 2ZE5 A; 1H2G A; 2Y48 A; 3TXS A; 4X62 O; 4WFB V; 1DF5 A; 1ARO P; 4GKJ O; 3JAW B; 3E2E A; 1IZ3 A; 2VQF O; 4LH7 A; 1NVP D; 3TET A; 5CB4 A; 2QA4 V; 2QM7 A; 1XMQ B; 1XNQ B; 5EYP B; 4DK0 A; 2EIK B; 3QO5 A; 2ILM A; 2CGN A; 4TWK A; 2ZM6 O; 4IL6 Z; 1SES A; 2GV9 A; 2ZIO A; 4DR5 O; 4GT1 A; 4K0K O; 1R6K A; 1BCC H; 2RQ6 A; 1ZX3 A; 1N34 B; 2BTQ A; 2EUL A; 2WWW A; 1MZF A; 1KC8 W; 2ZE8 A; 4OXS A; 1DGS A; 1NBM G; 2IU0 A; 2UUA O; 3HKB B; 1PNM A; 3KCY A; 1WPX A; 3AG4 C; 5EC1 C; 2Z3Y A; 4O2B B; 2ZR3 A; 4JI1 O; 3C3S A; 2PI5 A; 2JS5 A; 4LFB O; 4X1K B; 3P3P A; 3RYF B; 1EBO A; 3UO3 A; 4XDL A; 3E22 A; 5J2U A; 1FFX A; 5GON A; 1KMI Z; 4B3T O; 1CXZ B; 2EX3 A; 4NB5 A; 3OTO B; 4DR4 O; 1HNX B; 2UUB O; 1SQV H; 2P7T C; 2XAQ A; 3H1L H; 3CSX A; 4J7Z A; 4FPP A; 3W7U A; 4FM0 A; 4PDL A; 5GTI Z; 1XNR B; 2Y0I A; 2JJ1 G; 2KKW A; 3F7Y C; 4QIW F; 4CS4 A; 2E75 B; 3AG7 A; 3FD9 A; 1XMO B; 4UUJ C; 4WFE A; 2QM8 A; 1S72 V; 1SQB H; 5CBF A; 3QNE A; 2QSA A; 1J5E O; 1NTZ H; 5EBW C; 4B3S B; 4FLU A; 1QVG U; 3SJA C; 3BFR A; 1AP5 A; 2EBO A; 4XDK A; 2WLI B; 1EFR G; 1Q3E A; 4PDR A; 1XL4 A; 4MVM A; 4DRX B; 4PA7 A; 4U7O A; 4J41 A; 1GAX A; 3ABU A; 2IH3 C; 3UM7 A; 4W4K A; 3ZRX A; 2Q8V A; 3I5D A; 4AI8 A; 2E3C A; 1NS1 A; 2Q6A A; 5L3E A; 1SA0 A; 3CE2 A; 3OTF A; 2PI4 A; 4MVO A; 3CJH A; 4LF7 B; 1S5J A; 4CH4 A; 1XMQ O; 1XNQ O; 4NYK A; 4LFC O; 4MW3 A; 3UO2 A; 3N2K B; 5A2Q N; 4YY3 O; 5H5N A; 3ZHT A; 1TUB B; 2PF4 E; 3D3Q A; 2AZ2 A; 2WLL B; 1EN4 A; 3CRQ A; 1S3J A; 4I0X B; 3ML0 A; 1I5X A; 1N34 O; 2A3Q A; 1NZ6 A; 3UCS C; 1PD3 A; 2ATK C; 2UXX A; 4UFZ A; 4LF9 B; 5J2T A; 3JAT A; 2ZDI C; 4RUF A; 4EB6 A; 3O65 A; 2LGW A; 2OCC C; 1BGY H; 1M9N A; 1XHX A; 2NNU A; 3F5W C; 4WF9 V; 2YC0 A; 3QO7 A; 2CUG A; 4MT8 A; 3CMA V; 4TV9 A; 1GO3 F; 1CEZ A; 2YIC A; 1AR5 A; 2EJ7 A; 3K06 A; 2YXL A; 3KG2 A; 2BTO A; 2Y4T A; 1K73 W; 4H0L B; 3QVN A; 1Y4M A; 1R3L C; 4X1Y B; 4KUM A; 1M56 C; 4RO2 A; 4LCU C; 4KXR A; 2ZD9 A; 3JAM N; 4KHP B; 3OTO O; 1K4D C; 2EIN B; 1HNX O; 2QWN B; 4J10 A; 4LR3 A; 3E35 A; 3PN1 A; 1XNR O; 3NXS A; 3OUS A; 1BQ0 A; 1FJG O; 1FXV A; 3RN4 A; 4H33 A; 4L87 A; 5D5Q A; 3LDC A; 1XMO O; 1Y76 A; 1ZLZ A; 4LF8 B; 3CRM A; 3Q4H A; 1R3K C; 3WB0 A; 5CB4 B; 2EIK C; 2XAF A; 4B3S O; 3ABM B; 1NTM H; 2W6I G; 4UVA A; 1D5N A; 2VWK A; 4PJ0 Z; 1T5E A; 2YEV A; 1NR1 A; 1IBL B; 1JQ0 A; 3SYP A; 3SPI A; 4DW1 A; 5L3G A; 4WBN A; 1VF6 A; 2FKX A; 3PJS K; 1N36 B; 1JOY A; 5ITZ A; 1GTO A; 2G38 A; 2DW4 A; 2BTQ B; 1VEW A; 3ASN B; 1SQP H; 4FK5 C; 4RWU A; 2YI8 A; 5KUK A; 2YIB A; 2HG5 C; 4IHJ A; 2DYR B; 4LF7 O; 1WA8 A; 4H13 B; 1R6T A; 2RJZ A; 3AG1 B; 5DEC A; 2OYQ A; 1XIL A; 2YIA A; 1VMG A; 4J11 A; 1MOF A; 4NTW A; 2Q9L A; 3K5N A; 2V4D A; 3ZED A; 2R70 A; 3OR7 C; 1SS3 A; 3E22 B; 5J2U B; 1E79 G; 2XAH A; 1FFX B; 2KQX A; 2DWE C; 2IU3 A; 1ROP A; 3OMI B; 5GON B; 4P9O A; 5IYB O; 5E79 Z; 5IYZ A; 4PA4 A; 4BIO A; 2PUS A; 1K5Q A; 2ZIN A; 3CRC A; 4NR1 A; 2N04 A; 4F6E A; 1P4R A; 3ZMZ A; 1MG1 A; 3NR7 A; 1Q86 W; 1BSM A; 1RP3 B; 4ZKI A; 3AG3 B; 1RPO A; 2Q7H A; 4DO2 A; 3B40 A; 3OW2 U; 5H6Q A; 4R50 A; 1XI1 A; 2JEU A; 3ETQ A; 2CTP A; 4J80 A; 1OCO B; 2UXB B; 1IUR A; 4B7E A; 1VQ6 V; 4KHP O; 3EXA A; 2QR4 A; 2PTM A; 3J80 N; 1N4C A; 2IJH A; 1OCC B; 1SA0 B; 3X2Q C; 1K3E A; 2CAZ C; 3IC9 A; 2M7W A; 1XDC A; 3FB5 C; 3WU2 Z; 1H2M A; 2F23 A; 5LP6 C; 4LF8 O; 4J7J A; 3W7T A; 5D5P A; 1TA8 A; 3ZRV A; 5BR8 B; 1PV0 A; 3VOU A; 1IBL O; 3ABK B; 2D2C B; 2W0F C; 1URF A; 3SYC A; 3CHX A; 2RNB A; 3ZRW A; 1N36 O; 4MW8 A; 3SDL A; 5FNV A; 1YCI A; 1S5H C; 2B1G A; 4LNU B; 4TOI A; 1B06 A; 3CRA A; 3G6B A; 1ZL8 A; 2PY5 A; 4XDJ A; 3DTU B; 5EC2 C; 3ASO B; 5J2T B; 1AR1 B; 3JAT B; 3SYA A; 1OCZ B; 3ETD A; 3FB6 C; 4EB6 B; 3WB1 A; 4FM2 A; 3SPJ A; 4DV0 B; 5TIS Z; 3D3I A; 3LNN A; 3HKE B; 1AJQ A; 3OEH G; 4TV9 B; 1PNL A; 2GHY A; 3F7V C; 3ZHS A; 1OV9 A; 3K5O A; 2V1D A; 3VQW A; 4PV1 B; 1YVW A; 4W4L A; 4FFB A; 5KHJ A; 2EIN C; 1K33 A; 4O4H A; 3BAA A; 4JAS A; 2L35 A; 4PA9 A; 3OMA B; 3JAR A; 3GVM A; 5CBH A; 4ASU G; 1S0V A; 2A9H A; 5C8Y B; 3UQ8 A; 3SJB C; 5B1A B; 2GBO A; 3MHS C; 1GN3 A; 5A9G A; 1Y76 B; 3ZMU A; 1S5L Z; 4UCT A; 3ABM C; 3D36 C; 3Q4H B; 1QLE C; 4OPH A; 2ZNI A; 2P22 C; 5KA5 A; 4DR2 B; 3BCC H; 3CB2 A; 2YEV B; 1QR9 A; 3HKD A; 4WBN B; 3ZN0 A; 2YDE A; 2UXB O; 3ASN C; 3JD3 A; 3GWK C; 3VQX A; 2VWJ A; 4Q20 A; 3F5T A; 2QGN A; 2DYR C; 4TSF G; 3IFX A; 1QLN A; 4IHJ B; 3AG1 C; 2Q4P A; 1Z2G A; 3SJC C; 1AI4 A; 2F4V B; 1WA8 B; 5IY5 B; 2P5O A; 2YXH A; 4K3A A; 5BR8 O; 3H1H H; 4MTF A; 1F51 A; 2R9A A; 3UT5 A; 1Q82 W; 4J9Z B; 1JJ2 U; 3JAK A; 2XND G; 2PYL A; 5IDJ A; 4GX2 A; 3APQ A; 2HFE C; 2FML A; 3K9A A; 5IYZ B; 1MSD A; 3ZHU A; 3W7W A; 4I55 A; 4NTY A; 3M8A A; 4JTA B; 1XBL A; 3T2M A; 3JCZ A; 4KFM A; 4X65 B; 1D5A A; 4X89 A; 1AP6 A; 3DC6 A; 3SPH A; 4DV0 O; 1DTO A; 2B1I A; 4QE9 A; 3H1K H; 2IJK A; 4JI8 O; 1PM9 A; 4R6Z A; 3U11 A; 3AG3 C; 3MDS A; 5CBG A; 2B9Z A; 2AGA A; 1L1F A; 3SGI A; 4FLW A; 1ZAU A; 1OCO C; 2OTJ V; 5L3C A; 2VQE B; 4ZHQ A; 3H01 A; 1ZSP A; 1EZV H; 2AZ0 A; 2WLM A; 1M57 B; 1OCC C; 2Q0O C; 1K5S A; 5LYJ A; 4GCZ A; 1YHQ V; 4BW5 A; 2FTK A; 3RW0 A; 5HFM A; 2UXC B; 1FS0 G; 3CP1 A; 3RYH B; 2RMK B; 5KMG A; 3R66 A; 1XRE A; 2DOS A; 4IT5 A; 3L71 H; 2MW2 B; 3ETE A; 3SPC A; 3ABK C; 1PKX A; 4PI2 A; 4YJ3 A; 2Q5Z A; 4DR2 O; 1QR8 A; 3T4Z A; 4LFC B; 1PNK A; 4UVC A; 3K03 A; 4H37 A; 3AK2 A; 4YY3 B; 3ZRW B; 1YJW V; 1HNW O; 1K4C C; 1L0L H; 2H3O A; 3UKM A; 1TGO A; 3E8B A; 4IYH A; 5BY1 A; 2DQ3 A; 3ASO C; 2EIM B; 1DK1 A; 2JJ2 G; 2DN9 A; 1OCZ C; 1ZL8 B; 5JVD A; 2RDC A; 2X7R B; 3MHH C; 2OWO A; 2YIB D; 2F4V O; 4IIJ B; 2KG7 A; 2HKO A; 1VIB A; 2WA3 A; 3ZHV A; 3QG5 A; 4AQY B; 2DQ0 A; 1QHT A; 2AXT Z; 1RM1 B; 4PHZ A; 4Z2W A; 1MNG A; 3OM3 B; 4PI0 A; 4FFB B; 3RBZ A; 2JVD A; 3L73 H; 4O4H B; 3ZMS A; 3CME V; 2K1E A; 1E1Q G; 2Q7G A; 3JAR B; 2QM4 A; 2AW9 A; 1I7F A; 3JSL A; 5B1A C; 1JPX A; 1FXH A; 1LNQ A; 2ZE7 A; 2FYU H; 1MSW D; 1P7B A; 3LSU A; 3B2E E; 2NLJ C; 2ODM A; 1SF9 A; 2CH7 A; 1GN2 A; 4ZBM A; 4X65 O; 1FJG B; 3J81 N; 4P9P A; 2Q73 A; 3ZMT A; 5IJ9 A; 1R73 A; 4FJC C; 1OHH G; 5IWA B; 1GH6 A; 1BL8 A; 4JF3 A; 2QWO B; 1GMG A; 3MD0 A; 2A06 H; 2ZQM A; 4BIZ A; 1VF6 C; 4JI2 B; 4PDM A; 1B04 A; 3CCR V; 4UB6 Z; 3QO8 A; 3HKD B; 2VQE O; 4FLY A; 5BXZ A; 4FM1 A; 2PZS A; 4JYA B; 3OAA G; 2F93 B; 5DM6 V; 4D7S A; 4TV8 A; 3OMN B; 5LGU A; 2H94 A; 1IBM B; 3O9O A; 1WNS A; 1QCE A; 2GUZ A; 2UXC O; 4QPK A; 2GTS A; 1KKD A; 3KKY A; 5IY5 C; 5JCO A; 2PYJ A; 1YJ9 V; 2VS0 A; 1NKD A; 3ETG A; 1G1X B; 4BWA A; 3W7X A; 2Q7E A; 3CPW U; 3BA9 A; 2QJ1 A; 1G4Y B; 1Y6X A; 3LDE A; 3BHP A; 1E1R G; 5F2V O; 4CS3 A; 3STL C; 5B1B B; 3UT5 B; 3ZHR A; 4C7U A; 3JAK B; 1W0K G; 1N0N A; 2ITC C; 1B6Q A; 3G4S V; 1VQ7 V; 2XHB A; 5KUM A; 2P6J A; 4OGQ B; 1VF7 A; 2CTQ A; 4AHC A; 5KLV H; 2YID A; 4I55 B; 4X1I A; 4DW0 A; 3R65 A; 3OE7 G; 1IVS A; 5IJ0 A; 4X20 A; 4I9Q A; 1V55 B; 1X4T A; 2D3O W; 1YF2 A; 2ZNJ A; 4DR6 B; 5LMU O; 3K0G A; 4AQY O; 2CE4 A; 2EIJ B; 2VRZ A; 2A0L A; 4TUY B; 1YJN V; 4LFA B; 4GYC B; 2XT9 A; 1NI8 A; 3RT3 C; 5LHH A; 1M57 C; 2P4K A; 4ZHQ B; 4LF5 B; 3WB2 A; 3CCQ V; 1P49 A; 1B3Q A; 3CCS V; 1G8M A; 5LYJ B; 1K34 A; 5LMN B; 1JR9 A; 4DXW A; 1AVM A; 4P30 A; 5KMG B; 3OEE G; 4CZZ A; 2BOC C; 5IWA O; 3K3W A; 4JI4 B; 4F6R A; 4PDV A; 4UCU A; 4YJ3 B; 4I50 A; 2XAS A; 1M1K W; 4JI2 O; 1AIL A; 2QWQ B; 1H2K A; 1YDX A; 2ZXW B; 2GTA A; 3H9V A; 4I4T A; 3P3N A; 4JYA O; 2EZO A; 2LFR A; 2EIL B; 1PL4 A; 3MAQ A; 1Y66 A; 1YTF D; 1IBM O; 5JVD B; 1P84 F; 2DYS B; 3M99 B; 1K9M W; 1KBH A; 1H2S B; 2KG7 B; 1H2L A; 1RM1 C; 1KKC A; 3CWB H; 3BY6 A; 3K5L A; 3EVK A; 3DXR A; 5JJN B; 4RUE A; 1TVK A; 4WFG A; 4UCV A; 1HNZ B; 3JCU Z; 5KHG A; 2E5L B; 4UCO A; 2NR5 A; 3ZRS A; 3WG7 B; 5EZY A; 3G6E V; 1TUE B; 4DV4 B; 5L3B A; 2LGQ A; 2LO1 A; 2CH7 B; 4O2A A; 3JAL A; 4LC1 A; 3B09 A; 5IJ9 B; 1GK9 A; 4DR6 O; 4BAY A; 3KCX A; 1AJN A; 3CC7 V; 3OGI B; 4I7Z B; 4MSW C; 3BPZ A; 1F23 A; 1QQC A; 3BA8 A; 5E1A C; 4LFA O; 4DK1 A; 4HBN A; 2DJV A; 3ZX6 A; 2GDS A; 4D7T A; 1M90 W; 4LF5 O; 1H38 A; 4J7K A; 4LF6 B; 4TV8 B; 1BQZ A; 4YXW G; 4DV1 B; 4LF4 B; 1TAE A; 3RVZ A; 5LMN O; 2GUZ B; 4CS2 A; 4L8J A; 4H44 B; 1VQL V; 2ZKO A; 2ZT9 B; 1SZT A; 4JI4 O; 2ADQ B; 3CJH B; 1JCH A; 1Q7Y W; 4MVU A; 3I55 V; 5EBM C; 5B3S B; 5B1B C; 1N33 B; 4I9W A; 4JV5 B; 5DN6 G; 3CC2 V; 3K79 A; 1XUQ A; 2V7Q G; 4GKK B; 1H8E G; 4HZ3 A; 3E8H A; 3BVO A; 1Z5W A; 4FZ1 A; 3AK3 A; 1XQ8 A; 1G6U A; 3L74 H; 3GB7 C; 2P4V A; 1VAR A; 1SET A; 4X1I B; 2O57 A; 4ICG A; 3FB8 C; 1ZUQ A; 1SKV A; 4UCR A; 2P06 A; 4X20 B; 2X6A A; 3N27 A; 3G67 A; 2EZP A; 4NKG B; 4JYB A; 2EIJ C; 4X66 B; 2WLH A; 3U0Z A; 4WCE V; 1AB3 A; 2K9P A; 4DR1 B; 4JI8 B; 3FAV A; 2CK3 G; 3IAY A; 3E8G A; 2QKS A; 4LBE C; 4CC5 A; 1J95 A; 1HNZ O; 2JIZ G; 5KA6 A; 3T4D A; 1US6 A; 1CPY A; 4MVQ A; 5LBQ A; 1GKF A; 2E5L O; 4DYL A; 3FYE B; 2WAM A; 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