3NS9A

Crystal structure of cdk2 in complex with inhibitor bs-194
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
296
structure length
289
Chain Sequence
NFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title A Novel Pyrazolo[1,5-a]pyrimidine Is a Potent Inhibitor of Cyclin-Dependent Protein Kinases 1, 2, and 9, Which Demonstrates Antitumor Effects in Human Tumor Xenografts Following Oral Administration.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cell division protein kinase 2
total genus 77
structure length 289
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2010-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3ns9A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3ns9A01
4U43A 4MBJA 3RWPA 1I44A 4BDHA 3F3WA 5M06A 2ITTA 3CXWA 4XG4A 1TQIA 4LRMA 1RE8A 3SRVB 1H0WA 1OVEA 2IZTA 4AT3A 2CGXA 3FE3A 3FUPA 4O21A 2CSNA 3CQEA 5GJDA 4FEXA 1UNLA 3PXYA 3OTUA 2VWVA 4MD9E 4E4LA 4N57A 2C6DA 3CTJA 4XMOA 2WMUA 5K3YA 3UC4A 4D2RA 4EH9A 5L2IA 2VTTA 3TNQB 3ORIA 3OZ6A 1ZWSA 3QFVA 2VTHA 4F6UA 2QOBA 3BCEA 2HW6A 3ZTXA 4AA5A 5JH6A 2ETMA 3HAVA 5FGKA 5LMAA 5CLPA 4Y85A 3ORNA 3Q4UA 2WQOA 4GL9A 3BE9A 4L46A 5M53A 5FP5A 5HG5A 2PY3A 2J4ZA 1H26A 3DJ6A 3JYAA 3BBTB 3PLSA 4J71A 4WIHA 3ZSGA 3F7WA 2WHBA 2W1DA 4QNYA 3C1XA 3LMGA 4MXAA 1S9JA 2RL5A 3MPTA 4OGRA 2XM9A 5CX9A 5I9WA 4TPTA 5IISA 5IPJA 5AUTA 4U6RA 4CFVA 3OP5A 3UZPA 4O7NA 2XM8A 2BRGA 4FODA 5FP6A 4FGRA 1Y91A 4BF2A 3VUTA 5HLWA 4XBUA 4AOTA 4O7YA 1YHSA 3R71A 2XBAA 4O27B 5KMOA 3KQ7A 3AQVA 4ID7A 4EOSA 5BX0A 4XCUA 5LWNA 5A4TA 2VWBA 1XH8A 1PMNA 5EYCA 4EH2A 3F3VA 4YBJA 4DT8A 3TTJA 4GIHA 4NYEA 5DRDA 3WF9A 3QBNA 4FTJA 2IG7A 4RJ7A 5J95A 3IDCA 4RRVA 4OAUC 3ZCLA 2VWZA 4IB0A 3MH2A 4I6BA 3TWJA 4DITA 4B0GA 2YM5A 4AN3A 4GFOA 4U7ZA 4AOIA 3A7GA 2RFDA 4EOKA 4LL5A 2QO9A 3WILA 2V62A 5IA4A 2PYWA 3ALNA 1GIIA 2QU5A 2V55A 4JBQA 5HE3A 5AA9A 2WMQA 4RLLA 3NDMA 2C6TA 4RBLA 4X2JA 3KRJA 4HOKA 3PY1A 2E9NA 3TL8A 4EUTA 5BMSA 5GJFA 2R3FA 3W2CA 4IDVA 5FXSA 4GT5A 2J6MA 3PP1A 1YWRA 2CKQA 5GJGA 3UNJA 4RIWA 4TNBA 3NUYA 3CSVA 2R3RA 3IGOA 3O7LB 1UV5A 2H34A 1OPJA 2IZUA 3RGFA 3PIYA 4GS6A 1J3HA 3QKKA 1JQHA 2IVVA 2W5BA 3E64A 4HGLA 3VUGA 4DA5A 2F57A 3AT4A 4S33A 4S34A 2OKRA 4RWIA 4PP7A 5KMLA 1TVOA 4OT5A 4R5YA 3IW7A 2XZSA 3A7IA 4YTCA 4FG7A 2ONLA 2ITUA 3KMUA 1X8BA 2VX0A 4NM0A 2QOFA 4V01A 3VUDA 4UN0C 3FKNA 1M7NA 3C50A 1FINA 4TYIA 3G6GA 1ZZ2A 5CAVA 3PG1A 4ANMA 4BKZA 2YJSA 5CNOA 4G2FA 3THBA 3OD6X 5ANIA 3TTIA 4AS0A 4IAZA 4RJ6A 4PPAA 4F09A 2EUFB 2PMLX 4CG8A 1Y57A 4G6LA 5ETFA 5KMKA 4EQMA 3FKOA 4YJNA 3MFRA 5CVGA 4BDCA 4FKLA 3RAWA 3BV2A 2VTSA 5HEZA 3FHRA 4RX7A 3ZRMA 5A4LA 4PDOA 4X0MA 4EJNA 2CNQA 2R0UA 4FA2A 3GCQA 3VC4A 4D28A 3MY0A 3PUPA 1RDQE 3G0EA 4ZTLA 2R7BA 3ET7A 4RWKA 4E93A 4CKJA 2UZNA 3I6WA 4KBAA 3V6RA 3GOKA 3NVMB 4D0XA 3H0YA 4KKEA 5D12A 3KREA 4IW0A 4FKTA 4C61A 1F3MC 3S95A 3C0HA 4QT1A 4FZAB 3E93A 2HZNA 3PG3A 1IR3A 4QOXA 5AWMA 3ZZEA 4O86A 3KN6A 3NUUA 5FM3A 3UJGA 3ZSHA 4BDGA 4O0YA 3DNDA 3TKUA 2WTIA 2IW8A 1YDSE 4PDSA 2X8EA 4FNWA 1H24A 3VS7A 4P5QA 3SW7A 2VWWA 2Y4IC 3PWYA 3UNZA 1FMKA 4FV5A 3NAYA 4G16A 4ASZA 5L2TA 2CGWA 1H01A 4B4LA 3CC6A 2Q0NA 4I5CA 1URCA 3A7JA 4JG8A 4G3EA 5HG8A 3DBDA 3CPCA 5I9UA 5BQ0A 3QRKA 4QPSA 1YDRE 2R2PA 4L52A 5L3AA 2J0MB 1DAWA 2JEDA 3KKVA 3MVLA 3WZKA 4MQ1A 5HTCA 1UKHA 3DZQA 2HOGA 2Z7QA 3AC3A 1BI7A 4FKSA 4BYIA 2CLQA 4CFFA 4DG0E 4ZSAA 3O17A 3EN7A 3E92A 5IA3A 3HZTA 4DFLA 2FH9A 4GVJA 4U40A 5E8VA 3MB6A 5E7RA 5KBQA 3FSKA 3TNHA 3H9FA 2IWIA 2XK6A 1WAKA 2HZ0A 3FMHA 3KK9A 1OUYA 4JBPA 3KCKA 4TYHB 4OTFA 4UEUA 3VJOA 4A4LA 3LQ5A 2UW9A 4BGHA 1ZYJA 1SVGA 5A6NA 5I9ZA 4YHFA 4FSNA 1NXKA 4FV3A 1U4DA 5H2UA 5JKGA 4XV1A 2C6KA 1OMWA 4IVCA 2W1ZA 5KBRA 2XK8A 1M14A 2BHEA 3KF4A 3TIYA 3EKKA 5DNRA 3Q5ZA 5FXQA 3EWHA 4GUBA 2UW4A 2HENA 2I40A 3CEKA 4ZSGA 2F2UA 3CE3A 4MF1A 3VO3A 5LMKA 1ZYLA 4NCTA 4O0RA 4ANBA 2F4JA 4F08A 3AD4A 4BN1A 5KUPA 2RFEA 4AP7A 3CY2A 2VTLA 4D4VA 4PF4A 4RVLA 1L8TA 2XEYA 5J7BA 4U8ZA 4UMPA 4YZCA 2B9FA 4OTDA 3OWPA 3U6IA 3QQKA 4TYJA 2RF9A 2ZB1A 4X6QC 4IFCA 5HD7A 1XJDA 5CANA 4ASXA 3DAJA 3QZHA 3GBZA 3IDBA 4N6YA 4CQGA 5BVNA 2GMXA 1K9AA 4HGEA 3TI1A 4XBRA 3EQPA 2QO7A 3GB2A 3ZC5A 2OH0E 3AC5A 3BHYA 4NK9A 4GU6A 4MXXA 4WNPA 3V04A 3FEGA 4GMYA 5E8TA 1UU7A 3CGOA 1YI4A 2OJGA 3QTWA 4R7IA 5D1JA 3OBGA 3PXRA 4JQ8A 3C7QA 4RFMA 4J98A 3Q60A 3R9NA 4FV4A 4FK6A 3R9OA 3DJ5A 2HY0A 2RG5A 1YI6A 4XG2A 5DT0A 1SVEA 2E9VA 1TQPA 5C4KA 5K4JA 4H3BA 3FI4A 4IVDA 2C0TA 5EH0A 3FC1X 5B2LA 2UW3A 4CZTA 1JVPP 4LV8A 3V8SA 3HRCA 3LKMA 3FPQA 4P4CA 5DG5A 2R3QA 3ERKA 2GS6A 1PXLA 3NGAA 3RTPA 5DYJA 3R8LA 4F4PA 3I5ZA 2GNJA 3RK9A 2BDWA 5CI7A 1UNGA 3SV0A 3RZBA 4HVSA 2HXLA 4QNAA 4OAVB 2UZTA 4AN2A 1YXVA 4ACGA 3P0MA 2QONA 3GCUA 2R3KA 3PJ2A 4FIFA 2F49A 4X3FC 2OH4A 5KHXA 4YHJA 3A4OX 5DR6A 4U97A 3AC1A 5JGAA 3FWQA 2X9EA 2AC5A 2PUUA 4YC3A 3SW4A 2J51A 4EWHA 3ID6C 1NW1A 4IAAA 3PA5A 2PZ5A 4PMTA 4WG3A 5DE2A 4BWPA 4FR4A 5L2QA 3EQGA 5TKDA 1MQ4A 3QX4A 4QTDA 4GG7A 4M8TA 5AR8A 5CXHA 3E88A 4NJDA 2NNWB 3ZLXA 4RT7A 5LVLA 2CPKE 3FI2A 4IQ6A 4TN6A 4Z7HA 2XB7A 3Q4TA 4D5KA 4IAIA 4KIKB 5CZHA 3BYMA 1JOWB 3A8WA 4R3RA 3U9NA 3SVVA 2XIXA 4XG6A 2E9PA 2PUNA 3SXRA 3VBQA 5AP2A 2XK4A 4BIEA 1PYEA 1WVYA 1PW2A 5AP0A 2PTKA 4QD6A 1OIUA 3NNXA 3PIXA 4HCUA 3MB7A 2O64A 3RAIA 2PU8A 4YZDA 1REKA 2VAGA 1YDTE 3E63A 1P4OA 4BVUA 3BZ3A 3QTRA 4HYHA 5JGBA 3EHAA 1PMVA 1BX6A 3ORMA 4K8AA 4LGDA 3VF9A 5HICA 3OEZA 2GNIA 4I93A 5C27A 2C3LA 4O2PA 4DEGA 3SOAA 5A4CA 5K0KA 4F70A 2H6DA 3RHXA 1SNXA 4YNOA 1OKWA 1YVJA 4RPVA 3GUBA 2O63A 3FMKA 3QD0A 3R9RA 1OL6A 3DKFA 4QTAA 4IADA 4HNIA 2IVSA 4USFA 1JKLA 1YW2A 2ERKA 3JVSA 3Q9WA 1OUKA 4RC2A 4BIBA 4QMUA 2BZIB 5E92A 4P2KA 3P86A 4ZMFA 3RNYA 3E8CA 4FSWA 2B53A 5C01A 4KWPA 5LWMA 4D2WA 3HV5A 2GS2A 1M2QA 4JDKA 4L3PA 5HBHA 3UYSA 4MK0A 4CMTA 5AX3A 4C38A 5K4IA 2P2IA 4FZ7A 5CSXA 4HVHA 5GIOE 3EH9A 3ORKA 3QGYA 4AGWA 3G15A 4NM7A 4QP7A 3I60A 4BKYA 2ITYA 3PXZA 4LGHA 3SKCA 1YRPA 4BL1A 2QG7A 2O5KA 1RJBA 2H9VA 3FQHA 5G1XA 5JZNA 3U8WA 3FMDA 4BBFA 3WYXA 3PVGA 4EUUA 2ITWA 2PULA 3UZTA 4UALA 3ZRLA 1W0XC 1V0PA 2BAJA 3A62A 3WYYA 3T3UA 3ZUTA 5CQUA 1OIYA 4AN9A 4EZ3A 5A14A 4FTNA 5K0XA 3C5UA 4BRXA 1ERKA 1LEWA 5DEYA 4M67A 3GCPA 3NX8A 3FZSA 4DGNA 1FVVA 2VX1A 2UZEA 3SDJA 4F9WA 4W4VA 4QP6A 3JS2A 3I1AA 3BLHA 2ETRA 4UY9A 4ANSA 4O0UA 2C3JA 4I5MA 5HVKA 5M4CA 3QTQA 4CV8A 5IQGA 2W9ZB 3PA3A 4KRDA 5DR2A 2XJ0A 5HIDA 2HZ4A 3OMVA 5DRBA 2JDRA 3HUCA 3P7CA 1MUOA 3ELJA 1OL5A 3AGLA 3OHTA 4JVGA 5IUIA 3A99A 3LCOA 4PX6A 3FYKX 4FTAA 3PSBA 1VYZA 4BI1A 5HCXA 3BQCA 4FVPA 2XNMA 4G1WA 4G3CA 2GFSA 5EKOA 4EOMA 3R8VA 3ZXZA 4A9SA 2C47A 3DDQA 3DBQA 1XR1A 4FTRA 3UIUA 3HNGA 3KXXA 5BNJA 3WF5A 3GNIB 3ZUVA 2WQBA 4OTIA 5L2WA 4PP9A 4DLIA 2PWLA 5CU0A 5M08A 4U9AA 3JY0A 3KL8A 4E4XA 3FZOA 4FICA 3CCNA 3QXOA 1KE9A 2X4ZA 3KULA 2BDJA 2YZAA 4N4SA 3UMWA 1M7QA 4L00A 5CT0A 2XBJA 2BFYA 2XNNA 4I3ZA 5K5NA 4EL9A 4LRKA 3COHA 4JNWA 2OBJA 2YISA 4AUAA 4JT3A 3R7EA 2AUHA 2R4BA 3D7ZA 4YZBA 4JDJA 1IAHA 2VTIA 4FYOA 4UZDA 4BCFA 4I20A 3C9WA 3DT1A 5I9XA 4H3QA 2GNHA 5BUJA 4J96A 5HCZA 4UBAA 1WBPA 4FKWA 4XG7A 4X3JA 4PPCA 3GFWA 4FV8A 2XNBA 2PL0A 1HCLA 1OIQA 1H25A 2PVFA 3F2AA 4AZTA 3E7VA 3RPOA 2W5AA 5IH4A 3PRFA 4M13A 4QP1A 5BYYA 5FM2A 4FSZA 4MHAA 4QP3A 4L7SA 5AV4A 5CALA 3D7TA 2XP2A 5D41A 4IFGA 1E1VA 4WG5A 1ATPE 4L45A 5FTQA 3UO4A 4S30A 4AG8A 4C36A 4XEYA 5CS6A 3HP5A 4X7QA 5HVJA 3VS5A 3D2KA 4FT5A 4N0SA 2YJRA 3VW8A 1P5EA 5IA5A 3JXWA 2BALA 3DDPA 3Q6UA 1YHVA 4JDHA 4O2ZA 3R83A 2ZYBA 3RPYA 4C2WA 4EOPA 3E3BX 3NIEA 1CDKA 5BVKA 4R8QA 4OBQA 4G6OA 3QTSA 3F5XA 1H08A 4A07A 1OITA 4BDJA 1KV2A 4NTSA 3ZO1A 3IS5A 3HYHA 4PRJA 3UO5A 2XK3A 4U5JA 4EK3A 2B9HA 3DK3A 3OT8A 3LQ3A 3VVHA 5J9YA 4TWCA 2J5FA 5HBJA 2PZRA 3AT3A 1T45A 3FV8A 3UPZA 2JBPA 3LFCA 3D5WA 1Q41A 5K9IA 4PL5A 4NFNA 5LVNA 4YZ9A 5CYIA 3LE6A 1JBPE 4X3FA 4XP3A 3O51A 4UWYA 2XMYA 4X2GA 5CNNA 2RFSA 1KWPA 5JMSA 3ZFYA 4CVAA 3QC9A 3UGCA 3ZS5A 2CKPA 1MRVA 3BKBA 4R3CA 5AP1A 5L6OA 3EN9A 3R8ZA 4MNFA 1E1XA 3V6SA 1PMUA 3HVCA 2ZV8A 3M11A 3P79A 4L7FA 4IMYA 4JI9A 4B99A 4USEA 4O83A 2IN6A 3Q9YA 3ZHPC 1ZY4A 4EHZA 4EOQA 2O2UA 4MXYA 2AC3A 4EEVA 3BV3A 3BGPA 3NZ0A 2CMWA 3D5VA 4U79A 5HESA 2VWUA 2EXCX 4F6SA 1CKJA 2ZB0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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