3NY8A

Crystal structure of the human beta2 adrenergic receptor in complex with the inverse agonist ici 118,551
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
publication title Conserved Binding Mode of Human beta(2) Adrenergic Receptor Inverse Agonists and Antagonist Revealed by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor, Lysozyme
total genus 167
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ny8A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3ny8A01
4MD2A 164LA 1CUQA 1WTHA 2O7AA 137LA 1H2SA 5AWZA 4I7RA 5AZDA 243LA 232LA 1R84A 110LA 1C6NA 1C6CA 2B75A 2RB2X 5B6WA 4L35A 4PK0A 129LA 1TLAA 4HYXA 209LA 3EH5B 3HT7A 1G0LA 1P46A 1X0K1 3HT9A 1KNIA 1L64A 3QJQB 3UZCA 1SWZA 1L39A 1IXFA 5G28A 1L34A 3ZEVA 1AP9A 1DYGA 4I7KA 3VG9A 1L84A 5LZMA 4EKPA 3UTYA 2LZMA 1L09A 1UCQA 177LA 1L70A 1E0PA 4XXJA 197LA 2R4SA 2QARC 152LA 4Y9HA 1JGJA 192LA 2LNLA 1KS3A 1G1VA 178LA 235LA 5AX0A 4BVNA 1C6DA 3MBVA 1QUOA 1SX7A 253LA 3DDLA 1P64A 2OTYX 4GP5B 2O4WA 1QTCA 1L43A 1C61A 1CU6A 1L81A 1CV5A 3SB8A 4ZPUA 1L98A 1CU3A 3C7YA 3QAKA 3X3BA 4J4QA 1C6AA 3RFMA 4MQTA 1L65A 2JAFA 3HAQA 3QBIA 5A45A 1LGUA 2OU9A 1S52A 1L53A 1L57A 2RBSA 3A7KA 2JAGA 239LA 2RH1A 3EH4B 1L95A 3LZMA 3EMLA 1T8GA 1JV7A 5H2MA 1C67A 158LA 4JR8A 220LA 4DKLA 219LA 1L28A 4EJ4A 3S3BB 1L44A 254LA 214LA 229LA 1JQUA 257LA 3OE0A 1L66A 4YXAC 3SB7A 2I1XA 163LA 3DN2A 3HUAA 1PQJA 1JFPA 1LN6A 2Y04A 3DN1A 3PDSA 4NC3A 1XEPA 4MBSA 2BRDA 3SN6R 3ZPRA 5B0WA 1D3FA 1L08A 1SWYA 1EPYA 168LA 3HH4A 107LA 2B6ZA 1FBKA 4QRYA 5H2KA 1D3JA 3GUKA 5TGZA 3UZAA 227LA 3SBAA 3QBKA 213LA 3HH5A 1L58A 1L88A 1QM8A 1L73A 196LA 1L97A 199LA 1C6PA 157LA 3F8VA 3GUPA 1HZXA 1Q5JA 3L2XA 2KSAA 1L05A 1L37A 3CDQA 1L20A 1L62A 3G3WA 3HTDA 3RUNA 4A4MA 1L14A 3CODA 4FPDA 5JJEA 1L45A 4I7PA 5LWEA 4I7OA 4GP8B 5H2OA 1C6LA 1L22A 250LA 4YXCA 2HUKA 2RBQA 3NYAA 2ZZLA 5ITEA 1L32A 1Q5IA 1L67A 2OEAX 3L64A 4LDOA 4G7SB 1L03A 256LA 3C7ZA 1C8SA 217LA 139LA 2YCYA 1QSQA 4ARQB 5F8UA 212LA 4G71B 3DN4A 5AX1A 2B70A 246LA 1C6HA 1G0MA 5A8EA 1C6MA 3NY9A 1QHJA 3RZEA 1L35A 222LA 1L33A 2R4RA 3S3CB 1C6EA 1OV5A 4PJZA 1L02A 5DHHA 1L38A 1L18A 1S8LA 148LE 1NHBA 140LA 249LA 5C1MA 4IB4A 1KY1A 126LA 1L40A 1P2RA 1XJIA 1KW7A 1L61A 3C81A 3FADA 1MGYA 3C82A 1KW5A 3HDEA 1L76A 4I7NA 174LA 1G07A 2RB0X 2L6XA 3HT8A 1L07A 3HWLA 4L6RA 1C63A 2B6TA 130LA 1L91A 2Z6BA 3ABWA 1E12A 4W53A 1CV3A 218LA 3HH3A 4XTLA 3UTVA 123LA 1QUDA 1L0JA 2RAZX 233LA 2X72A 4OV0A 1P56A 111LA 182LA 1L16A 3V2WA 4WAVA 5B6XA 4OO9A 1P8UA 1L85A 1LYGA 1P36A 4PXKA 169LA 1LYDA 4X32A 4I7QA 5ITCA 255LA 3GULA 3COCA 237LA 2PEDA 1G0PA 3OE9A 1JV6A 4TL3A 1GZMA 3OE6A 2YCXA 1M0KA 131LA 1G0QA 1L15A 120LA 1OVHA 2HPYA 3QJRB 2QPDB 1L48A 1C6JA 1PQOA 4HYJA 4EA3A 159LA 2B6XA 4GPOA 1L51A 4S0WA 3SB5A 1T8AA 1T97A 3SBBC 144LA 223LA 1QT4A 2M3GA 127LA 260LA 1IW6A 4EPIA 5G2AA 3VGAA 102LA 4XTOA 1LI3A 112LA 176LA 1X0I1 185LA 1L92A 2Q9EA 1L19A 1L93A 1OWZA 3GUNA 1F4ZA 1PY6A 5A44A 1G1WA 1LI2A 4IARA 3HH6A 3HT6A 109LA 3PQRA 261LA 3QJVB 2B72A 1L87A 1D3NA 4GYCA 5JJJA 1L30A 1L90A 1KG8A 1LYEA 4UHRA 1C69A 1L23A 5KKHA 187LA 1L72A 3C8QA 4HWLA 1BRRA 167LA 1QTHA 3C8RA 3FI5A 3V2YA 5DHGA 2I20A 3REYA 216LA 5G53A 5G54A 240LA 2QPEB 2OTZX 2Y03A 3NS0A 1L74A 2RBOA 3CDRA 1L11A 4IAPA 1L42A 1G0GA 1LLHA 252LA 1M0MA 5B34A 4DAJA 1L00A 244LA 4I7SA 2O79A 1CU5A 1P2LA 1L01A 1L06A 1ZWNA 2NTWA 3K2RA 3QAPA 4W59A 1OYUA 1VGOA 241LA 1CU2A 1QTDA 2OE7X 3HTGA 224LA 2B6YA 184LA 1DYCA 3QBLA 1C66A 6LZMA 5J7AA 3GUIA 1EHKB 1QTBA 4QIDA 5I14A 3NY8A 4E97A 3P0GA 113LA 3EH3B 1QUHA 3HDFA 3HTBA 4AMJA 160LA 1QT3A 4EKQA 1L46A 1TN5A 1F88A 3HU8A 2Z55A 4BV0A 1L68A 1L47A 5G36A 5BR2A 3CDOA 3HANA 5H2IA 1L21A 3HUQA 5BR5A 4W56A 1B6IA 1L59A 3WQJA 162LA 2OE9X 1QT7A 4ARQA 1PQMA 5B35A 1M0LA 1K28A 4AQNA 4ARLA 5B6YA 3C80A 1C62A 3HAOA 226LA 4I7JA 1U19A 4AMIA 3QJSB 3OAXA 259LA 3D4SA 4I7TA 2KS9A 1QS5A 206LA 1X0SA 4MD1A 4QI1A 3VVKA 231LA 151LA 2YCWA 3HTFA 1JTNA 2WJKA 183LA 4EXMA 258LA 2LC9A 1DYBA 5AHZA 1TN0A 3CDTA 4I7LA 1PXRA 1L04A 4N4WA 150LA 2WJLA 145LA 1S51A 2YDVA 5G2DA 2AT9A 3UG9A 3JR6A 1XJTA 3PBLA 2RB1X 1KMEA 1LWKA 1DYDA 1C6QA 2RBNA 3UTXA 1XMEB 4X31A 4G7QB 1C6KA 198LA 3DMVA 2A4TA 1G06A 4MQSA 4ARPA 1LGXA 1P3NA 4N4YB 1L17A 4BUOA 4EIYA 1GUEA 1QKOA 142LA 1P7SA 1VJMA 2L78A 4XTNA 1T8FA 2I35A 1R2NA 3HU9A 2J4YA 1DZEA 3C9LA 3S3DB 3QBGA 201LA 2ZIYA 1FBBA 4W51A 122LA 166LA 1CU0A 2ANXA 4FA7B 2Q9DA 1L55A 1C6IA 1OVJA 103LA 3AYMA 3DKEX 4ARMB 189LA 2NTUA 1C6FA 4G72B 4IAQA 3CAPA 1CV6A 5H2JA 1C64A 2Y02A 1L54A 1OWYA 143LA 3FA0A 3VW7A 1L24A 119LA 1PQIA 1L77A 2F32A 4X1HA 4ARJA 1UAZA 1L52A 1ZYTA 2RAYX 1QT6A 1L56A 1C6GA 1P37A 2EI4A 251LA 3C9MA 1IW9A 1L50A 1L29A 1QUGA 1XJUA 4KLYA 4BEZA 173LA 125LA 1QTVA 245LA 3GUMA 1L60A 1CV1A 1L75A 1LYFA 4XT3A 1L96A 3G3XA 1P5CA 1CTWA 1QTZA 3GUOA 4W54A 3HUKA 3PWHA 1P8HA 5B6VA 1G0JA 3DN8A 1L63A 1L99A 1L94A 2LCBA 5EN0A 1BRXA 138LA 221LA 2CUUA 1D2WA 3DMZA 2NTGA 3S8FB 3QDCA 4JKVA 3VHZA 1KG9A 2OU8A 1C3WA 4G70B 1LPYA 215LA 3SB9A 1CV0A 3HASA 3VI0A 4FAAB 2B73A 2QB0B 1L0KA 1QT5A 4W55A 2G87A 1P6YA 4BWBA 1L10A 2B6WA 1L71A 4LZMA 247LA 1H68A 2Y00A 1L26A 205LA 4W52A 3BVDB 1GU8A 2OE4X 3PXOA 242LA 3C83A 1KGBA 3X3CA 4BEYA 3DNAA 155LA 1L13A 4LDEA 115LA 181LA 1OV7A 1D9WA 1LI6A 1T6HA 4XT1A 1F50A 5ETZA 3QJUB 3S8GB 1L82A 180LA 4PXFA 4DJHA 3DN3A 4K5YA 175LA 228LA 3HAPA 2Y01A 3SB6A 1LWGA 146LA 1BM1A 3OE8A 4EPFA 4KNFA 2F93A 5FJGA 1L89A 1CVKA 2ANVA 5H2NA 2ZFEA 156LA 225LA 1L80A 165LA 4LDLA 1QSBA 1PQDA 4G7RB 191LA 3DN0A 3DQBA 1C68A 3T45A 2RBPA 1D3MA 1L0MA 5AHYA 5B2NA 1L49A 3DMXA 236LA 1O0AA 2YCZA 1P8IA 4YX7C 2RBRA 2KSYA 1CUPA 1KY0A 248LA 3C7WA 4EKRA 1S54A 1JTMA 3AYNA 3KJ6A 3F9LA 1L83A 1S8JA 5H2PA 3QJTB 5H2HA 1D2YA 1L27A 2HUMA 234LA 1C6TA 3HARA 1L36A 104LA 1L86A 1QT8A 3UTWA 1SX2A 4W58A 149LA 1G0KA 1LYHA 1PQKA 1LGWA 2I21A 4FBZA 210LA 2IGCA 7LZMA 3GUJA 3NSBA 1DYAA 1OVKA 1QS9A 3CDVA 1DYFA 3DN6A 1PXSA 2F2QA 4JQ6A 2Z73A 4N6HA 211LA 3ZPQA 2OU0X 4I7MA 1L41A 1XIOA 190LA 1ZURA 1AT9A 3ODUA 188LA 1C8RA 170LA 161LA 4GP4B 108LA 1C6BA 1L25A 5JJNA 128LA 1LYJA 1CX6A 2B7XA 1CX7A 1BRDA 5DYSA 141LA 1LW9A 1LYIA 2KSBA 1SSWA 5G2CA 118LA 1L9HA 1S53A 186LA 1QKPA 1L69A 3UONA 1L31A 4UG2A 1L79A 1I6SA 4W57A 4ARMA 3C8SA 1C65A 238LA 3AM6A 195LA 4EKSA 4GBRA 5H2LA 2HULA 2NTHA 1SSYA 200LA 147LA 2B74A 2F47A 4WW3A 172LA 2F95A 2YDOA 1DYEA 171LA 1L12A 1C60A 4GRVA 1CWQA 2VT4A 262LA 4GBRB 230LA 5B6ZA 1CV4A 114LA 3G3VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZV5L 4MD2A 1J1PY 1KIRC 1LHMA 1H2SA 4I7RA 5AZDA 1DPWA 243LA 1R84A 5B6WA 1IR9A 1GXV2 209LA 3QJQB 1IXFA 1IWZA 1AP9A 4I7KA 3TXGA 4DC4A 1B7LA 1L70A 1E0PA 4G49A 4Y9HA 2Z39A 1KS3A 4I8SA 178LA 1LHKA 4NGJA 2Z18A 5F16A 1QUOA 1SX7A 1P64A 4N9RA 1UC0A 4LZTA 3CSQA 3B0KA 3QAKA 3C7YA 1C6AA 5LVGA 5A45A 4P2EA 4GCBA 1L53A 2RBSA 1GF9A 3IJVA 4CJ2A 4JR8A 158LA 229LA 4YXAC 3DN2A 3HUAA 1JFPA 1LJHA 4MBSA 4HJYA 4NGVA 3HH4A 2B6ZA 3GUKA 3QBKA 2NWDX 1GAZA 213LA 3OK0A 5I53A 1L73A 1L97A 3GUPA 1HZXA 1L05A 3HTDA 5C6LA 3WPJA 5B59A 1GFRA 1GBOA 5JJEA 4GP8B 1C6LA 4BADA 2FBDA 3NYAA 2EQLA 4W94A 1Q5IA 3L64A 194LA 4HV2A 256LA 2BQOA 2ZQ4A 1P2CC 1CJ8A 139LA 1C10A 5F8UA 4G71B 3A92A 1LJIA 2LHMA 2B70A 1C6HA 4LT2A 1C6MA 1QHJA 1UCOA 1REZA 2Z12A 2YBHA 4Z46A 3D9AC 4PJZA 5DHHA 1L18A 1HFYA 140LA 1KY1A 1L40A 1JKCA 1XJIA 2XTHA 1L61A 3C81A 2LZ2A 3FADA 4N5RA 3RU5A 1HEWA 1IO5A 1VDPA 1JISA 1KW5A 1VATA 3A3RX 5KXNA 1L07A 1JKBA 1LHJA 1N4FA 4L6RA 2B6TA 1BHZA 1LMTA 3HH3A 4TSBA 1IP4A 1L0JA 2RAZX 233LA 1LSCA 2X72A 4OV0A 4H9AA 1L16A 1P8UA 1LHIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4LDL A;  1QSB A;  1PQD A;  4G7R B;  191L A;  3DN0 A;  3DQB A;  1C68 A;  3T45 A;  2RBP A;  1D3M A;  1L0M A;  5AHY A;  5B2N A;  1L49 A;  3DMX A;  236L A;  1O0A A;  2YCZ A;  1P8I A;  4YX7 C;  2RBR A;  2KSY A;  1CUP A;  1KY0 A;  248L A;  3C7W A;  4EKR A;  1S54 A;  1JTM A;  3AYN A;  3KJ6 A;  3F9L A;  1L83 A;  1S8J A;  5H2P A;  3QJT B;  5H2H A;  1D2Y A;  1L27 A;  2HUM A;  234L A;  1C6T A;  3HAR A;  1L36 A;  104L A;  1L86 A;  1QT8 A;  3UTW A;  1SX2 A;  4W58 A;  149L A;  1G0K A;  1LYH A;  1PQK A;  1LGW A;  2I21 A;  4FBZ A;  210L A;  2IGC A;  7LZM A;  3GUJ A;  3NSB A;  1DYA A;  1OVK A;  1QS9 A;  3CDV A;  1DYF A;  3DN6 A;  1PXS A;  2F2Q A;  4JQ6 A;  2Z73 A;  4N6H A;  211L A;  3ZPQ A;  2OU0 X;  4I7M A;  1L41 A;  1XIO A;  190L A;  1ZUR A;  1AT9 A;  3ODU A;  188L A;  1C8R A;  170L A;  161L A;  4GP4 B;  108L A;  1C6B A;  1L25 A;  5JJN A;  128L A;  1LYJ A;  1CX6 A;  2B7X A;  1CX7 A;  1BRD A;  5DYS A;  141L A;  1LW9 A;  1LYI A;  2KSB A;  1SSW A;  5G2C A;  118L A;  1L9H A;  1S53 A;  186L A;  1QKP A;  1L69 A;  3UON A;  1L31 A;  4UG2 A;  1L79 A;  1I6S A;  4W57 A;  4ARM A;  3C8S A;  1C65 A;  238L A;  3AM6 A;  195L A;  4EKS A;  4GBR A;  5H2L A;  2HUL A;  2NTH A;  1SSY A;  200L A;  147L A;  2B74 A;  2F47 A;  4WW3 A;  172L A;  2F95 A;  2YDO A;  1DYE A;  171L A;  1L12 A;  1C60 A;  4GRV A;  1CWQ A;  2VT4 A;  262L A;  4GBR B;  230L A;  5B6Z A;  1CV4 A;  114L A;  3G3V A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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